Result of FASTA (omim) for pFN21AE3641
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3641, 503 aa
  1>>>pF1KE3641 503 - 503 aa - 503 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8928+/-0.00035; mu= 16.0645+/- 0.022
 mean_var=94.5691+/-19.109, 0's: 0 Z-trim(116.4): 10  B-trim: 171 in 1/55
 Lambda= 0.131886
 statistics sampled from 27551 (27560) to 27551 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.323), width:  16
 Scan time: 10.300

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001136027 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-con ( 503) 3458 668.3 1.4e-191
NP_079152 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-contai ( 544) 2587 502.6 1.1e-141
XP_016857341 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
XP_011542543 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
XP_011542541 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
NP_064632 (OMIM: 606980,612016) atypical kinase AD ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
XP_011542542 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
XP_011542540 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80
XP_005273258 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80


>>NP_001136027 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-contain  (503 aa)
 initn: 3458 init1: 3458 opt: 3458  Z-score: 3560.5  bits: 668.3 E(85289): 1.4e-191
Smith-Waterman score: 3458; 100.0% identity (100.0% similar) in 503 aa overlap (1-503:1-503)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQKFYQDGPGRGLGEEDIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQKFYQDGPGRGLGEEDIR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 RAREARPRKTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLAVGLGLGVLAEMAKKSMPGGRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAREARPRKTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLAVGLGLGVLAEMAKKSMPGGRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 QSDNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSDNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASIG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 QVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQEL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 AWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 LRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDHY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 IEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSGE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 TARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYWA
              430       440       450       460       470       480

              490       500   
pF1KE3 SRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
       :::::::::::::::::::::::
NP_001 SRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
              490       500   

>>NP_079152 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-containing  (544 aa)
 initn: 2586 init1: 2586 opt: 2587  Z-score: 2664.4  bits: 502.6 E(85289): 1.1e-141
Smith-Waterman score: 3302; 92.3% identity (92.3% similar) in 535 aa overlap (10-503:10-544)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQKFYQDGPGRGLGEEDIR
                :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQKFYQDGPGRGLGEEDIR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 RAREARPRKTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLAVGLGLGVLAEMAKKSMPGGRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 RAREARPRKTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLAVGLGLGVLAEMAKKSMPGGRL
               70        80        90       100       110       120

                                                       130         
pF1KE3 QS-----------------------------------------DNSFISPQLQHIFERVR
       ::                                         :::::::::::::::::
NP_079 QSEGGSGLDSSPFLSEANAERIVQTLCTVRGAALKVGQMLSIQDNSFISPQLQHIFERVR
              130       140       150       160       170       180

     140       150       160       170       180       190         
pF1KE3 QSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASIGQVHQGLLRDGTEVAVKIQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 QSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASIGQVHQGLLRDGTEVAVKIQY
              190       200       210       220       230       240

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE3 PGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQELAWECDYRREAACAQNFRQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQELAWECDYRREAACAQNFRQL
              250       260       270       280       290       300

     260       270       280       290       300       310         
pF1KE3 LANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQDLRNQICFQLLTLCLRELFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQDLRNQICFQLLTLCLRELFE
              310       320       330       340       350       360

     320       330       340       350       360       370         
pF1KE3 FRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDHYIEVVKAAADGDRDCVLQKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 FRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDHYIEVVKAAADGDRDCVLQKS
              370       380       390       400       410       420

     380       390       400       410       420       430         
pF1KE3 RDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSGETARRIQDLIPVLLRHRLCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 RDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSGETARRIQDLIPVLLRHRLCP
              430       440       450       460       470       480

     440       450       460       470       480       490         
pF1KE3 PPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYWASRQPDAATAGSLPTKGDSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYWASRQPDAATAGSLPTKGDSW
              490       500       510       520       530       540

     500   
pF1KE3 VDPS
       ::::
NP_079 VDPS
           

>>XP_016857341 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atypical  (647 aa)
 initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518  Z-score: 1564.0  bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 1718; 52.3% identity (76.1% similar) in 514 aa overlap (14-483:132-644)

                                10        20        30        40   
pF1KE3                  MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQ
                                     :: .. .:   : :  .:.      :   .
XP_016 SAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRR
             110       120       130       140       150       160 

             50        60           70        80        90         
pF1KE3 KFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLA
        :.:: .:  ::  :::..::.:. :   :  .  ::...::::::..::.:::::::::
XP_016 FFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLA
             170       180       190       200       210       220 

     100       110              120                                
pF1KE3 VGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS------------------------------
       ::::.:.:::.::::.    :.:.   : :                              
XP_016 VGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQML
             230       240       250       260       270       280 

               130       140       150       160       170         
pF1KE3 ---DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASI
          :..::.:.: .:::::::::::::  ::...:...:: .:. :.  .:: :::::::
XP_016 SIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASI
             290       300       310       320       330       340 

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 GQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQE
       :::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.::  :: ::: :. ...:..:
XP_016 GQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRE
             350       360       370       380       390       400 

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 LAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQ
       :: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .::  ::..: :::: .::::
XP_016 LALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQ
             410       420       430       440       450       460 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE3 DLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDH
       ..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::.   ::: 
XP_016 EIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDL
             470       480       490       500       510       520 

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE3 YIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSG
       ::....:::: ::. :  :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.:::. 
XP_016 YIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQ
             530       540       550       560       570       580 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE3 ETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYW
        :...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...:  : 
XP_016 STTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY-
             590       600       610       620       630       640 

     480       490       500   
pF1KE3 ASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
        .::                    
XP_016 CKRQAQQ                 
                               

>>XP_011542543 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atypical  (647 aa)
 initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518  Z-score: 1564.0  bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 1718; 52.3% identity (76.1% similar) in 514 aa overlap (14-483:132-644)

                                10        20        30        40   
pF1KE3                  MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQ
                                     :: .. .:   : :  .:.      :   .
XP_011 SAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRR
             110       120       130       140       150       160 

             50        60           70        80        90         
pF1KE3 KFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLA
        :.:: .:  ::  :::..::.:. :   :  .  ::...::::::..::.:::::::::
XP_011 FFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLA
             170       180       190       200       210       220 

     100       110              120                                
pF1KE3 VGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS------------------------------
       ::::.:.:::.::::.    :.:.   : :                              
XP_011 VGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQML
             230       240       250       260       270       280 

               130       140       150       160       170         
pF1KE3 ---DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASI
          :..::.:.: .:::::::::::::  ::...:...:: .:. :.  .:: :::::::
XP_011 SIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASI
             290       300       310       320       330       340 

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 GQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQE
       :::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.::  :: ::: :. ...:..:
XP_011 GQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRE
             350       360       370       380       390       400 

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 LAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQ
       :: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .::  ::..: :::: .::::
XP_011 LALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQ
             410       420       430       440       450       460 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE3 DLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDH
       ..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::.   ::: 
XP_011 EIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDL
             470       480       490       500       510       520 

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE3 YIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSG
       ::....:::: ::. :  :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.:::. 
XP_011 YIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQ
             530       540       550       560       570       580 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE3 ETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYW
        :...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...:  : 
XP_011 STTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY-
             590       600       610       620       630       640 

     480       490       500   
pF1KE3 ASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
        .::                    
XP_011 CKRQAQQ                 
                               

>>XP_011542541 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atypical  (647 aa)
 initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518  Z-score: 1564.0  bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 1718; 52.3% identity (76.1% similar) in 514 aa overlap (14-483:132-644)

                                10        20        30        40   
pF1KE3                  MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQ
                                     :: .. .:   : :  .:.      :   .
XP_011 SAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRR
             110       120       130       140       150       160 

             50        60           70        80        90         
pF1KE3 KFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLA
        :.:: .:  ::  :::..::.:. :   :  .  ::...::::::..::.:::::::::
XP_011 FFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLA
             170       180       190       200       210       220 

     100       110              120                                
pF1KE3 VGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS------------------------------
       ::::.:.:::.::::.    :.:.   : :                              
XP_011 VGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQML
             230       240       250       260       270       280 

               130       140       150       160       170         
pF1KE3 ---DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASI
          :..::.:.: .:::::::::::::  ::...:...:: .:. :.  .:: :::::::
XP_011 SIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASI
             290       300       310       320       330       340 

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 GQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQE
       :::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.::  :: ::: :. ...:..:
XP_011 GQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRE
             350       360       370       380       390       400 

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 LAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQ
       :: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .::  ::..: :::: .::::
XP_011 LALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQ
             410       420       430       440       450       460 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE3 DLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDH
       ..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::.   ::: 
XP_011 EIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDL
             470       480       490       500       510       520 

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE3 YIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSG
       ::....:::: ::. :  :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.:::. 
XP_011 YIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQ
             530       540       550       560       570       580 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE3 ETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYW
        :...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...:  : 
XP_011 STTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY-
             590       600       610       620       630       640 

     480       490       500   
pF1KE3 ASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
        .::                    
XP_011 CKRQAQQ                 
                               

>>NP_064632 (OMIM: 606980,612016) atypical kinase ADCK3,  (647 aa)
 initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518  Z-score: 1564.0  bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 1718; 52.3% identity (76.1% similar) in 514 aa overlap (14-483:132-644)

                                10        20        30        40   
pF1KE3                  MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQ
                                     :: .. .:   : :  .:.      :   .
NP_064 SAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRR
             110       120       130       140       150       160 

             50        60           70        80        90         
pF1KE3 KFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLA
        :.:: .:  ::  :::..::.:. :   :  .  ::...::::::..::.:::::::::
NP_064 FFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLA
             170       180       190       200       210       220 

     100       110              120                                
pF1KE3 VGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS------------------------------
       ::::.:.:::.::::.    :.:.   : :                              
NP_064 VGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQML
             230       240       250       260       270       280 

               130       140       150       160       170         
pF1KE3 ---DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASI
          :..::.:.: .:::::::::::::  ::...:...:: .:. :.  .:: :::::::
NP_064 SIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASI
             290       300       310       320       330       340 

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 GQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQE
       :::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.::  :: ::: :. ...:..:
NP_064 GQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRE
             350       360       370       380       390       400 

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 LAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQ
       :: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .::  ::..: :::: .::::
NP_064 LALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQ
             410       420       430       440       450       460 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE3 DLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDH
       ..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::.   ::: 
NP_064 EIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDL
             470       480       490       500       510       520 

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE3 YIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSG
       ::....:::: ::. :  :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.:::. 
NP_064 YIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQ
             530       540       550       560       570       580 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE3 ETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYW
        :...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...:  : 
NP_064 STTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY-
             590       600       610       620       630       640 

     480       490       500   
pF1KE3 ASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
        .::                    
NP_064 CKRQAQQ                 
                               

>>XP_011542542 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atypical  (647 aa)
 initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518  Z-score: 1564.0  bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 1718; 52.3% identity (76.1% similar) in 514 aa overlap (14-483:132-644)

                                10        20        30        40   
pF1KE3                  MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQ
                                     :: .. .:   : :  .:.      :   .
XP_011 SAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRR
             110       120       130       140       150       160 

             50        60           70        80        90         
pF1KE3 KFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLA
        :.:: .:  ::  :::..::.:. :   :  .  ::...::::::..::.:::::::::
XP_011 FFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLA
             170       180       190       200       210       220 

     100       110              120                                
pF1KE3 VGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS------------------------------
       ::::.:.:::.::::.    :.:.   : :                              
XP_011 VGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQML
             230       240       250       260       270       280 

               130       140       150       160       170         
pF1KE3 ---DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASI
          :..::.:.: .:::::::::::::  ::...:...:: .:. :.  .:: :::::::
XP_011 SIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASI
             290       300       310       320       330       340 

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 GQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQE
       :::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.::  :: ::: :. ...:..:
XP_011 GQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRE
             350       360       370       380       390       400 

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 LAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQ
       :: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .::  ::..: :::: .::::
XP_011 LALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQ
             410       420       430       440       450       460 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE3 DLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDH
       ..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::.   ::: 
XP_011 EIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDL
             470       480       490       500       510       520 

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE3 YIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSG
       ::....:::: ::. :  :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.:::. 
XP_011 YIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQ
             530       540       550       560       570       580 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE3 ETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYW
        :...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...:  : 
XP_011 STTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY-
             590       600       610       620       630       640 

     480       490       500   
pF1KE3 ASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
        .::                    
XP_011 CKRQAQQ                 
                               

>>XP_011542540 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atypical  (647 aa)
 initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518  Z-score: 1564.0  bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 1718; 52.3% identity (76.1% similar) in 514 aa overlap (14-483:132-644)

                                10        20        30        40   
pF1KE3                  MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQ
                                     :: .. .:   : :  .:.      :   .
XP_011 SAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRR
             110       120       130       140       150       160 

             50        60           70        80        90         
pF1KE3 KFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLA
        :.:: .:  ::  :::..::.:. :   :  .  ::...::::::..::.:::::::::
XP_011 FFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLA
             170       180       190       200       210       220 

     100       110              120                                
pF1KE3 VGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS------------------------------
       ::::.:.:::.::::.    :.:.   : :                              
XP_011 VGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQML
             230       240       250       260       270       280 

               130       140       150       160       170         
pF1KE3 ---DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASI
          :..::.:.: .:::::::::::::  ::...:...:: .:. :.  .:: :::::::
XP_011 SIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASI
             290       300       310       320       330       340 

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 GQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQE
       :::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.::  :: ::: :. ...:..:
XP_011 GQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRE
             350       360       370       380       390       400 

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 LAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQ
       :: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .::  ::..: :::: .::::
XP_011 LALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQ
             410       420       430       440       450       460 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE3 DLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDH
       ..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::.   ::: 
XP_011 EIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDL
             470       480       490       500       510       520 

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE3 YIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSG
       ::....:::: ::. :  :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.:::. 
XP_011 YIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQ
             530       540       550       560       570       580 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE3 ETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYW
        :...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...:  : 
XP_011 STTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY-
             590       600       610       620       630       640 

     480       490       500   
pF1KE3 ASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
        .::                    
XP_011 CKRQAQQ                 
                               

>>XP_005273258 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atypical  (647 aa)
 initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518  Z-score: 1564.0  bits: 299.3 E(85289): 2.2e-80
Smith-Waterman score: 1718; 52.3% identity (76.1% similar) in 514 aa overlap (14-483:132-644)

                                10        20        30        40   
pF1KE3                  MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGSWAQ
                                     :: .. .:   : :  .:.      :   .
XP_005 SAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRR
             110       120       130       140       150       160 

             50        60           70        80        90         
pF1KE3 KFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFGGLA
        :.:: .:  ::  :::..::.:. :   :  .  ::...::::::..::.:::::::::
XP_005 FFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLA
             170       180       190       200       210       220 

     100       110              120                                
pF1KE3 VGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS------------------------------
       ::::.:.:::.::::.    :.:.   : :                              
XP_005 VGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQML
             230       240       250       260       270       280 

               130       140       150       160       170         
pF1KE3 ---DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAAASI
          :..::.:.: .:::::::::::::  ::...:...:: .:. :.  .:: :::::::
XP_005 SIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASI
             290       300       310       320       330       340 

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 GQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQALQQE
       :::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.::  :: ::: :. ...:..:
XP_005 GQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRE
             350       360       370       380       390       400 

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 LAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQGLSQ
       :: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .::  ::..: :::: .::::
XP_005 LALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQ
             410       420       430       440       450       460 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE3 DLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEFTDH
       ..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::.   ::: 
XP_005 EIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDL
             470       480       490       500       510       520 

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE3 YIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDFGSG
       ::....:::: ::. :  :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.:::. 
XP_005 YIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQ
             530       540       550       560       570       580 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE3 ETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYHRYW
        :...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...:  : 
XP_005 STTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY-
             590       600       610       620       630       640 

     480       490       500   
pF1KE3 ASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
        .::                    
XP_005 CKRQAQQ                 
                               




503 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Mon Nov  7 00:26:37 2016 done: Mon Nov  7 00:26:39 2016
 Total Scan time: 10.300 Total Display time:  0.100

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com