FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3641, 503 aa 1>>>pF1KE3641 503 - 503 aa - 503 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8928+/-0.00035; mu= 16.0645+/- 0.022 mean_var=94.5691+/-19.109, 0's: 0 Z-trim(116.4): 10 B-trim: 171 in 1/55 Lambda= 0.131886 statistics sampled from 27551 (27560) to 27551 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16 Scan time: 10.300 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001136027 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-con ( 503) 3458 668.3 1.4e-191 NP_079152 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-contai ( 544) 2587 502.6 1.1e-141 XP_016857341 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80 XP_011542543 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80 XP_011542541 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80 NP_064632 (OMIM: 606980,612016) atypical kinase AD ( 647) 1518 299.3 2.2e-80 XP_011542542 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80 XP_011542540 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80 XP_005273258 (OMIM: 606980,612016) PREDICTED: atyp ( 647) 1518 299.3 2.2e-80 >>NP_001136027 (OMIM: 615567,615573) aarF domain-contain (503 aa) initn: 3458 init1: 3458 opt: 3458 Z-score: 3560.5 bits: 668.3 E(85289): 1.4e-191 Smith-Waterman score: 3458; 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