Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4567
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4567, 719 aa
  1>>>pF1KE4567 719 - 719 aa - 719 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1636+/-0.000973; mu= 15.9657+/- 0.059
 mean_var=85.6510+/-17.877, 0's: 0 Z-trim(106.4): 21  B-trim: 173 in 2/47
 Lambda= 0.138582
 statistics sampled from 8970 (8984) to 8970 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.276), width:  16
 Scan time:  3.860

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31493.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11         ( 719) 4855 981.0       0
CCDS53627.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11         ( 704) 4585 927.1       0
CCDS7946.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11          ( 750) 4457 901.5       0
CCDS53628.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11         ( 735) 4187 847.5       0
CCDS8288.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11       ( 740) 3102 630.6 2.6e-180
CCDS53626.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11         ( 442) 2350 480.1 3.1e-135
CCDS73364.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11      ( 707) 1564 323.1 9.3e-88
CCDS31604.1 NAALADL1 gene_id:10004|Hs108|chr11     ( 740) 1506 311.5   3e-84
CCDS34707.1 TFR2 gene_id:7036|Hs108|chr7           ( 801)  596 129.6 1.9e-29
CCDS82891.1 TFRC gene_id:7037|Hs108|chr3           ( 679)  427 95.7 2.4e-19
CCDS3312.1 TFRC gene_id:7037|Hs108|chr3            ( 760)  427 95.8 2.7e-19
CCDS46960.1 NAALADL2 gene_id:254827|Hs108|chr3     ( 795)  333 77.0 1.3e-13


>>CCDS31493.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11              (719 aa)
 initn: 4855 init1: 4855 opt: 4855  Z-score: 5244.9  bits: 981.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4855; 100.0% identity (100.0% similar) in 719 aa overlap (1-719:1-719)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 FLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 NKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 RTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 SYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 DAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 TLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFAS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 WDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 LKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 WETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 AVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710         
pF1KE4 YAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
              670       680       690       700       710         

>>CCDS53627.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11              (704 aa)
 initn: 4585 init1: 4585 opt: 4585  Z-score: 4953.3  bits: 927.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4585; 99.9% identity (100.0% similar) in 681 aa overlap (39-719:24-704)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KE4 DSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAE
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53        MTAGSSYPLFLAAYACTGCLAERLGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAE
                      10        20        30        40        50   

       70        80        90       100       110       120        
pF1KE4 NIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYI
            60        70        80        90       100       110   

      130       140       150       160       170       180        
pF1KE4 SIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKL
           120       130       140       150       160       170   

      190       200       210       220       230       240        
pF1KE4 ERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNL
           180       190       200       210       220       230   

      250       260       270       280       290       300        
pF1KE4 PGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEK
           240       250       260       270       280       290   

      310       320       330       340       350       360        
pF1KE4 MGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEP
           300       310       320       330       340       350   

      370       380       390       400       410       420        
pF1KE4 DRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGL
           360       370       380       390       400       410   

      430       440       450       460       470       480        
pF1KE4 LGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGF
           420       430       440       450       460       470   

      490       500       510       520       530       540        
pF1KE4 EGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSG
           480       490       500       510       520       530   

      550       560       570       580       590       600        
pF1KE4 YPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYA
           540       550       560       570       580       590   

      610       620       630       640       650       660        
pF1KE4 DKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVIYAPSSHNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVIYAPSSHNK
           600       610       620       630       640       650   

      670       680       690       700       710         
pF1KE4 YAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
           660       670       680       690       700    

>>CCDS7946.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11               (750 aa)
 initn: 4844 init1: 4454 opt: 4457  Z-score: 4814.6  bits: 901.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4780; 95.7% identity (95.9% similar) in 750 aa overlap (1-719:1-750)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 FLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 FLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 NKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 NKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 RTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 RTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 SYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 SYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 DAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 DAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 TLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 TLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFAS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 WDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 WDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 LKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 LKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 WETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 WETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650          
pF1KE4 AVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKS----
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    
CCDS79 AVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSNPIV
              610       620       630       640       650       660

                                   660       670       680         
pF1KE4 ---------------------------KHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVD
                                  .::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 LRMMNDQLMFLERAFIDPLGLPDRPFYRHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVD
              670       680       690       700       710       720

     690       700       710         
pF1KE4 PSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 PSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
              730       740       750

>>CCDS53628.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11              (735 aa)
 initn: 4573 init1: 4183 opt: 4187  Z-score: 4523.0  bits: 847.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4510; 95.4% identity (95.6% similar) in 712 aa overlap (39-719:24-735)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KE4 DSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAE
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53        MTAGSSYPLFLAAYACTGCLAERLGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAE
                      10        20        30        40        50   

       70        80        90       100       110       120        
pF1KE4 NIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYI
            60        70        80        90       100       110   

      130       140       150       160       170       180        
pF1KE4 SIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKL
           120       130       140       150       160       170   

      190       200       210       220       230       240        
pF1KE4 ERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNL
           180       190       200       210       220       230   

      250       260       270       280       290       300        
pF1KE4 PGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEK
           240       250       260       270       280       290   

      310       320       330       340       350       360        
pF1KE4 MGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEP
           300       310       320       330       340       350   

      370       380       390       400       410       420        
pF1KE4 DRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGL
           360       370       380       390       400       410   

      430       440       450       460       470       480        
pF1KE4 LGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGF
           420       430       440       450       460       470   

      490       500       510       520       530       540        
pF1KE4 EGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSG
           480       490       500       510       520       530   

      550       560       570       580       590       600        
pF1KE4 YPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYA
           540       550       560       570       580       590   

      610       620       630       640       650                  
pF1KE4 DKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKS------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            
CCDS53 DKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSNPIVLRMMNDQL
           600       610       620       630       640       650   

                           660       670       680       690       
pF1KE4 -------------------KHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEV
                          .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MFLERAFIDPLGLPDRPFYRHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEV
           660       670       680       690       700       710   

       700       710         
pF1KE4 KRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
       ::::::::::::::::::::::
CCDS53 KRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
           720       730     

>>CCDS8288.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11            (740 aa)
 initn: 3362 init1: 3001 opt: 3102  Z-score: 3350.6  bits: 630.6 E(32554): 2.6e-180
Smith-Waterman score: 3326; 66.1% identity (86.3% similar) in 732 aa overlap (20-718:11-739)

               10        20        30        40        50          
pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKH-NMK
                          :.: .: .::.  ::.::. :::::  .:.:. .  : ...
CCDS82          MAESRGRLYLWMCLAA-ALAS--FLMGFMVGWFIKPLKETTTSVRYHQSIR
                        10         20          30        40        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE4 -AFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLS
         ...:.::::::.:: .::..:::::::::: :::.::.:::.:::::..:.:::::::
CCDS82 WKLVSEMKAENIKSFLRSFTKLPHLAGTEQNFLLAKKIQTQWKKFGLDSAKLVHYDVLLS
       50        60        70        80        90       100        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE4 YPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVN
       :::.:. :::::..:  .:::.:: .:::: :::::..::::..::: ::::::::::::
CCDS82 YPNETNANYISIVDEHETEIFKTSYLEPPPDGYENVTNIVPPYNAFSAQGMPEGDLVYVN
      110       120       130       140       150       160        

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE4 YARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPG
       ::::::::::::.: :::.::::::::::.:::::::::.:::: :.:::::::::::: 
CCDS82 YARTEDFFKLEREMGINCTGKIVIARYGKIFRGNKVKNAMLAGAIGIILYSDPADYFAPE
      170       180       190       200       210       220        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE4 VKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIG
       :. :: :::::: ..::::.::::::::::::::::.::..:  . :.::.: :::::::
CCDS82 VQPYPKGWNLPGTAAQRGNVLNLNGAGDPLTPGYPAKEYTFRLDVEEGVGIPRIPVHPIG
      230       240       250       260       270       280        

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE4 YYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNV
       : ::. ::. .:: ::::.::.:.:.: :..::::::. : .::.::... :..::::::
CCDS82 YNDAEILLRYLGGIAPPDKSWKGALNVSYSIGPGFTGSDSFRKVRMHVYNINKITRIYNV
      290       300       310       320       330       340        

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE4 IGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILF
       .::.::.:::::::::::::::::::.::: ::.::..::.:::: : ..::::::::.:
CCDS82 VGTIRGSVEPDRYVILGGHRDSWVFGAIDPTSGVAVLQEIARSFGKLMSKGWRPRRTIIF
      350       360       370       380       390       400        

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE4 ASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLT
       :::::::::::::::::::: ..::::..::::.:::::::::::::::::.:.::..::
CCDS82 ASWDAEEFGLLGSTEWAEENVKILQERSIAYINSDSSIEGNYTLRVDCTPLLYQLVYKLT
      410       420       430       440       450       460        

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE4 KELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYT
       ::. :::.:::.::::::: .:.:::: ...:::.:::::.:::..::::::::::::::
CCDS82 KEIPSPDDGFESKSLYESWLEKDPSPENKNLPRINKLGSGSDFEAYFQRLGIASGRARYT
      470       480       490       500       510       520        

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE4 KNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCR
       :: .:.:.:.::.::..:::.::::::::: :: .:.:::.::..:.::..: ..::. .
CCDS82 KNKKTDKYSSYPVYHTIYETFELVEKFYDPTFKKQLSVAQLRGALVYELVDSKIIPFNIQ
      530       540       550       560       570       580        

      600       610       620       630       640       650        
pF1KE4 DYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKS--
       ::: .:..:: .::..: :: :..  ..:::::::::::::.: :: : .:: . : .  
CCDS82 DYAEALKNYAASIYNLSKKHDQQLTDHGVSFDSLFSAVKNFSEAASDFHKRLIQVDLNNP
      590       600       610       620       630       640        

                                     660       670       680       
pF1KE4 -----------------------------KHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESK
                                    .:.:.:::::::::::::::::::.::::.:
CCDS82 IAVRMMNDQLMLLERAFIDPLGLPGKLFYRHIIFAPSSHNKYAGESFPGIYDAIFDIENK
      650       660       670       680       690       700        

       690       700       710         
pF1KE4 VDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
       ..   :: :::..: .::::.:::: ::.:: 
CCDS82 ANSRLAWKEVKKHISIAAFTIQAAAGTLKEVL
      710       720       730       740

>>CCDS53626.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11              (442 aa)
 initn: 2737 init1: 2347 opt: 2350  Z-score: 2541.4  bits: 480.1 E(32554): 3.1e-135
Smith-Waterman score: 2673; 92.8% identity (93.0% similar) in 442 aa overlap (309-719:1-442)

      280       290       300       310       320       330        
pF1KE4 YRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53                               MGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFS
                                             10        20        30

      340       350       360       370       380       390        
pF1KE4 TQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEI
               40        50        60        70        80        90

      400       410       420       430       440       450        
pF1KE4 VRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEG
              100       110       120       130       140       150

      460       470       480       490       500       510        
pF1KE4 NYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSG
              160       170       180       190       200       210

      520       530       540       550       560       570        
pF1KE4 NDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQ
              220       230       240       250       260       270

      580       590       600       610       620       630        
pF1KE4 VRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKN
              280       290       300       310       320       330

      640       650                                      660       
pF1KE4 FTEIASKFSERLQDFDKS-------------------------------KHVIYAPSSHN
       ::::::::::::::::::                               .::::::::::
CCDS53 FTEIASKFSERLQDFDKSNPIVLRMMNDQLMFLERAFIDPLGLPDRPFYRHVIYAPSSHN
              340       350       360       370       380       390

       670       680       690       700       710         
pF1KE4 KYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
              400       410       420       430       440  

>>CCDS73364.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11           (707 aa)
 initn: 3218 init1: 1556 opt: 1564  Z-score: 1689.0  bits: 323.1 E(32554): 9.3e-88
Smith-Waterman score: 3103; 63.5% identity (82.5% similar) in 732 aa overlap (20-718:11-706)

               10        20        30        40        50          
pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKH-NMK
                          :.: .: .::.  ::.::. :::::  .:.:. .  : ...
CCDS73          MAESRGRLYLWMCLAA-ALAS--FLMGFMVGWFIKPLKETTTSVRYHQSIR
                        10         20          30        40        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE4 -AFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLS
         ...:.::::::.:: .::..:::::::::: :::.::.:::.:::::..:.:::::::
CCDS73 WKLVSEMKAENIKSFLRSFTKLPHLAGTEQNFLLAKKIQTQWKKFGLDSAKLVHYDVLLS
       50        60        70        80        90       100        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE4 YPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVN
       :::.:. :::::..:  .:::.:: .:::: :::::..::::..::: ::::::::::::
CCDS73 YPNETNANYISIVDEHETEIFKTSYLEPPPDGYENVTNIVPPYNAFSAQGMPEGDLVYVN
      110       120       130       140       150       160        

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE4 YARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPG
       ::::::::::::.: :::.::::::::::.:::::::::.:::: :.:::::::::::: 
CCDS73 YARTEDFFKLEREMGINCTGKIVIARYGKIFRGNKVKNAMLAGAIGIILYSDPADYFAPE
      170       180       190       200       210       220        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE4 VKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIG
       :. :: :::::: ..::::.::::::::::::::::.::..:  . :.::.: :::::::
CCDS73 VQPYPKGWNLPGTAAQRGNVLNLNGAGDPLTPGYPAKEYTFRLDVEEGVGIPRIPVHPIG
      230       240       250       260       270       280        

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE4 YYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNV
       : ::. ::                                 .::.::... :..::::::
CCDS73 YNDAEILL---------------------------------RKVRMHVYNINKITRIYNV
      290                                        300       310     

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE4 IGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILF
       .::.::.:::::::::::::::::::.::: ::.::..::.:::: : ..::::::::.:
CCDS73 VGTIRGSVEPDRYVILGGHRDSWVFGAIDPTSGVAVLQEIARSFGKLMSKGWRPRRTIIF
         320       330       340       350       360       370     

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE4 ASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLT
       :::::::::::::::::::: ..::::..::::.:::::::::::::::::.:.::..::
CCDS73 ASWDAEEFGLLGSTEWAEENVKILQERSIAYINSDSSIEGNYTLRVDCTPLLYQLVYKLT
         380       390       400       410       420       430     

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE4 KELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYT
       ::. :::.:::.::::::: .:.:::: ...:::.:::::.:::..::::::::::::::
CCDS73 KEIPSPDDGFESKSLYESWLEKDPSPENKNLPRINKLGSGSDFEAYFQRLGIASGRARYT
         440       450       460       470       480       490     

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE4 KNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCR
       :: .:.:.:.::.::..:::.::::::::: :: .:.:::.::..:.::..: ..::. .
CCDS73 KNKKTDKYSSYPVYHTIYETFELVEKFYDPTFKKQLSVAQLRGALVYELVDSKIIPFNIQ
         500       510       520       530       540       550     

      600       610       620       630       640       650        
pF1KE4 DYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKS--
       ::: .:..:: .::..: :: :..  ..:::::::::::::.: :: : .:: . : .  
CCDS73 DYAEALKNYAASIYNLSKKHDQQLTDHGVSFDSLFSAVKNFSEAASDFHKRLIQVDLNNP
         560       570       580       590       600       610     

                                     660       670       680       
pF1KE4 -----------------------------KHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESK
                                    .:.:.:::::::::::::::::::.::::.:
CCDS73 IAVRMMNDQLMLLERAFIDPLGLPGKLFYRHIIFAPSSHNKYAGESFPGIYDAIFDIENK
         620       630       640       650       660       670     

       690       700       710         
pF1KE4 VDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA
       ..   :: :::..: .::::.:::: ::.:: 
CCDS73 ANSRLAWKEVKKHISIAAFTIQAAAGTLKEVL
         680       690       700       

>>CCDS31604.1 NAALADL1 gene_id:10004|Hs108|chr11          (740 aa)
 initn: 952 init1: 535 opt: 1506  Z-score: 1626.1  bits: 311.5 E(32554): 3e-84
Smith-Waterman score: 1556; 36.4% identity (66.7% similar) in 751 aa overlap (19-719:2-738)

               10        20        30         40        50         
pF1KE4 MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFL-LGFLFGWFIKSSNEATNITPK----
                         .:  . .: :... .: ::...: :   . .:....:.    
CCDS31                  MQWTKVLGLGLGAAALLGLGIILGHFAIPK-KANSLAPQDLDL
                                10        20        30         40  

          60        70        80        90       100         110   
pF1KE4 HNMKAFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWK--EFGLDSVELAHY
       . ... . .: :. :.. : .... ::::.. .. .:.. . ..::  : ::::.: . :
CCDS31 EILETVMGQLDAHRIRENLRELSREPHLASSPRDEDLVQLLLQRWKDPESGLDSAEASTY
             50        60        70        80        90       100  

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE4 DVLLSYPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGD
       .::::.:.. .:: ..:..  :. : .    :    : ..  :.: :..:..:.: :.: 
CCDS31 EVLLSFPSQEQPNVVDIVGPTGGIIHSCHRTEENVTGEQGGPDVVQPYAAYAPSGTPQGL
            110       120       130       140       150       160  

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE4 LVYVNYARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPAD
       :::.: .  ::: .:. .  :.  : :...::: : :: :. ::   :. ::..:.::::
CCDS31 LVYANRGAEEDFKELQTQ-GIKLEGTIALTRYGGVGRGAKAVNAAKHGVAGVLVYTDPAD
            170       180        190       200       210       220 

           240           250       260       270       280         
pF1KE4 YFAPGVKS----YPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGL
        .  :..:    .:..: :: .::.::.  .    ::::::  ::   ..:  .:.. :.
CCDS31 -INDGLSSPDETFPNSWYLPPSGVERGSYYEY--FGDPLTPYLPAVPSSFRVDLANVSGF
              230       240       250         260       270        

     290       300       310       320       330          340      
pF1KE4 PSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFT--GNF-STQKVKMHI
       : ::..:::. ::. :: ...:.  : ..:.:.:   : .::::   :.: . ..:.. .
CCDS31 PPIPTQPIGFQDARDLLCNLNGTLAP-ATWQGALGCHYRLGPGFRPDGDFPADSQVNVSV
      280       290       300        310       320       330       

        350       360       370       380       390       400      
pF1KE4 HSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLK
       ..  :.    ::.: .::::::::::. :.:::::: :..::.::.::. :. : .::: 
CCDS31 YNRLELRNSSNVLGIIRGAVEPDRYVLYGNHRDSWVHGAVDPSSGTAVLLELSRVLGTLL
       340       350       360       370       380       390       

         410       420       430       440       450       460     
pF1KE4 KEG-WRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVD
       :.: :::::.:.:::: ::::::.::::..::    :::: :::::.: :. .: ::::.
CCDS31 KKGTWRPRRSIVFASWGAEEFGLIGSTEFTEEFFNKLQERTVAYINVDISVFANATLRVQ
       400       410       420       430       440       450       

         470       480       490         500       510       520   
pF1KE4 CTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTK--KSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEV
        :: . :.: . :::..::  :    :.:..: .  .  :: .. .: ...::.:.:.  
CCDS31 GTPPVQSVVFSATKEIRSPGPG--DLSIYDNWIRYFNRSSPVYGLVPSLGSLGAGSDYAP
       460       470         480       490       500       510     

           530       540       550       560       570       580   
pF1KE4 FFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGM
       : . :::.:    :: .   ..   :: ::....:.. :.:: :: :. : .::.. :..
CCDS31 FVHFLGISSMDIAYTYDRSKTSARIYPTYHTAFDTFDYVDKFLDPGFSSHQAVARTAGSV
         520       530       540       550       560       570     

           590       600       610       620       630       640   
pF1KE4 VFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIA
       ...:..:. ::.   ::. .::..   . . ..     .. .:.:.  : .::..:   :
CCDS31 ILRLSDSFFLPLKVSDYSETLRSF---LQAAQQDLGALLEQHSISLGPLVTAVEKFEAEA
         580       590          600       610       620       630  

           650                                        660       670
pF1KE4 SKFSERLQDFDKSK---------------------------------HVIYAPSSHNKYA
       . ...:.. ..:..                                 ::..:: . .   
CCDS31 AALGQRISTLQKGSPDPLQVRMLNDQLMLLERTFLNPRAFPEERYYSHVLWAPRTGSVV-
            640       650       660       670       680       690  

              680       690       700       710           
pF1KE4 GESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA  
         .:::. .:    .. .. :.::.::.::. ... ....:: ::  ::  
CCDS31 --TFPGLSNACSRARDTASGSEAWAEVQRQLSIVVTALEGAAATLRPVADL
               700       710       720       730       740

>>CCDS34707.1 TFR2 gene_id:7036|Hs108|chr7                (801 aa)
 initn: 669 init1: 352 opt: 596  Z-score: 642.3  bits: 129.6 E(32554): 1.9e-29
Smith-Waterman score: 880; 28.3% identity (60.5% similar) in 661 aa overlap (11-650:75-692)

                                   10        20        30          
pF1KE4                     MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFL-F
                                     :.:  :   .:   ::..  : ::::.. :
CCDS34 AETLAHFCPMELRGPEPLGSRPRQPNLIPWAAAGRRAAPYLVLTALLIFTGAFLLGYVAF
           50        60        70        80        90       100    

             40        50           60                70        80 
pF1KE4 -------GWFIKSSNEATNITPK---HNMKAFLDELKAE--------NIKKFLYNFTQIP
              :  .   .: .:  :    :. . . ..:.:          ..  . . .   
CCDS34 RGSCQACGDSVLVVSEDVNYEPDLDFHQGRLYWSDLQAMFLQFLGEGRLEDTIRQTSLRE
          110       120       130       140       150       160    

              90       100       110       120       130       140 
pF1KE4 HLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYISIINEDGNEIFNT
       ..::.     :...:..  ..  :: :    . : :..:. .::: .  ..: :.   . 
CCDS34 RVAGSAGMAALTQDIRAALSRQKLDHVWTDTHYVGLQFPDPAHPNTLHWVDEAGKVGEQL
          170       180       190       200       210       220    

             150       160       170       180       190       200 
pF1KE4 SLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDMKINCSGKIV
        : .:         :.  :.::.   :   :.:::..:.: ::.  : :   ..  :...
CCDS34 PLEDP---------DVYCPYSAI---GNVTGELVYAHYGRPEDLQDL-RARGVDPVGRLL
                   230          240       250        260       270 

             210       220       230       240       250       260 
pF1KE4 IARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNL
       ..: : .  ..:: :::  ::.::..: .:::.     .. :   .: .  .  :.. .:
CCDS34 LVRVGVISFAQKVTNAQDFGAQGVLIYPEPADF-----SQDPPKPSLSSQQAVYGHV-HL
             280       290       300            310       320      

             270       280       290       300       310       320 
pF1KE4 NGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRG
        :.::: :::.:. . .    .: . ::::::..::.   :..::.:. : . :.  :.:
CCDS34 -GTGDPYTPGFPSFNQTQFPPVASS-GLPSIPAQPISADIASRLLRKLKGPVAPQE-WQG
          330       340        350       360       370        380  

              330       340       350       360       370       380
pF1KE4 SL-KVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDS
       ::   ::..:::        .... ...    : : :..: ..:  :::.::..:..::.
CCDS34 SLLGSPYHLGPG-------PRLRLVVNNHRTSTPINNIFGCIEGRSEPDHYVVIGAQRDA
            390              400       410       420       430     

              390       400       410       420       430       440
pF1KE4 WVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSR
       :  :.     :.:.. :.::.:... ..:.::::..:: :::. .:: .::::: :    
CCDS34 WGPGAAKSAVGTAILLELVRTFSSMVSNGFRPRRSLLFISWDGGDFGSVGSTEWLEGYLS
         440       450       460       470       480       490     

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pF1KE4 LLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTKK
       .:. ..:.:.. :... :.  ...  .::. ::.... :.. ::...  :..:::. .  
CCDS34 VLHLKAVVYVSLDNAVLGDDKFHAKTSPLLTSLIESVLKQVDSPNHS--GQTLYEQVVFT
         500       510       520       530       540         550   

              510       520       530       540       550       560
pF1KE4 SPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYE
       .:: .   .  .   .:. .: .:   .:. . .  . .. ..     ::. :.  .:::
CCDS34 NPSWDAEVIRPLPMDSSAYSFTAF---VGVPAVEFSFMEDDQA-----YPFLHTKEDTYE
           560       570          580       590            600     

              570        580       590       600       610         
pF1KE4 LVEKFYDPMFK-YHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHP
        ..:  .  .     .:::. : ....:... .::.:   :. :. ..  ..  .:    
CCDS34 NLHKVLQGRLPAVAQAVAQLAGQLLIRLSHDRLLPLDFGRYGDVVLRHIGNLNEFS----
         610       620       630       640       650       660     

     620       630       640       650       660       670         
pF1KE4 QEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYD
        ..:. ..... ..::  .. . : :. ...                             
CCDS34 GDLKARGLTLQWVYSARGDYIRAAEKLRQEIYSSEERDERLTRMYNVRIMRVEFYFLSQY
             670       680       690       700       710       720 

     680       690       700       710                             
pF1KE4 ALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA                    
                                                                   
CCDS34 VSPADSPFRHIFMGRGDHTLGALLDHLRLLRSNSSGTPGATSSTGFQESRFRRQLALLTW
             730       740       750       760       770       780 

>>CCDS82891.1 TFRC gene_id:7037|Hs108|chr3                (679 aa)
 initn: 568 init1: 180 opt: 427  Z-score: 460.7  bits: 95.7 E(32554): 2.4e-19
Smith-Waterman score: 705; 26.6% identity (60.3% similar) in 610 aa overlap (55-660:47-589)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KE4 ALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLA
                                     :....  ::     .  :.: . . .:. :
CCDS82 CERLAGTESPVREEPGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREA
         20        30        40        50        60        70      

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pF1KE4 GTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLF
       :.... .::  ...:..:: :..:   .. : ..  .... : . :....:  ..   : 
CCDS82 GSQKDENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQ-NSVIIVDKNGRLVY---LV
         80        90       100       110        120       130     

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pF1KE4 EPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIAR
       : :  ::           :.:  .   : ::..:..  .::    .:.    .:.:::.:
CCDS82 ENPG-GY----------VAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDF----EDLYTPVNGSIVIVR
                       140       150       160           170       

          210       220       230       240       250       260    
pF1KE4 YGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGA
        ::.  ..:: ::.  .: ::..: : . .  : :..     .:   :  ....    :.
CCDS82 AGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKF--PIVNA-----ELSFFG--HAHL----GT
       180       190       200         210              220        

          270       280       290       300       310       320    
pF1KE4 GDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLK
       ::: :::.:. ... .   ... :::.:::. :.   :.::. .: :. : :  :. .  
CCDS82 GDPYTPGFPSFNHT-QFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSD--WKTDST
          230        240       250       260       270         280 

          330       340       350       360       370       380    
pF1KE4 VPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFG
         . ..        ...::. . .. .  .: :..:...: ::::.::..:..::.:  :
CCDS82 CRMVTSE-------SKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPG
                    290       300       310       320       330    

          390       400        410       420       430       440   
pF1KE4 GIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLK-KEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQ
       .     :.:.. .... :. .  :.:..: :.:.::::.: .:: .:.::: :     :.
CCDS82 AAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLH
          340       350       360       370       380       390    

           450       460       470       480       490         500 
pF1KE4 ERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYE--SWTKKS
        .. .::: :... :. ...:. .::.:.:...  ...: :     :. ::.  .:..: 
CCDS82 LKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHP---VTGQFLYQDSNWASK-
          400       410       420       430          440       450 

             510       520       530       540       550        560
pF1KE4 PSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETY-E
                 . ::   :    :.   :: .    . ..      . ::   ....:: :
CCDS82 ----------VEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCED------TDYPYLGTTMDTYKE
                        460       470             480       490    

              570       580       590       600       610       620
pF1KE4 LVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQ
       :.:.. . . :   ..:.: : .:..:.... : .: . :   : ...  .     ..  
CCDS82 LIERIPE-LNKVARAAAEVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLN----QYRA
          500        510       520       530       540             

              630       640       650       660       670       680
pF1KE4 EMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDA
       ..: ...:.. :.::  .: . .:...  . . .:. . .                    
CCDS82 DIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYV
     550       560       570       580       590       600         

              690       700       710                              
pF1KE4 LFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA                     
                                                                   
CCDS82 SPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRKQNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALS
     610       620       630       640       650       660         




719 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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