FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5505, 420 aa 1>>>pF1KE5505 420 - 420 aa - 420 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8908+/-0.000407; mu= 19.6775+/- 0.025 mean_var=71.7410+/-14.541, 0's: 0 Z-trim(111.6): 79 B-trim: 33 in 1/52 Lambda= 0.151423 statistics sampled from 20128 (20215) to 20128 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16 Scan time: 7.340 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006623 (OMIM: 611034,612671) sodium-dependent p ( 420) 2776 616.0 5.5e-176 NP_001091956 (OMIM: 611034,612671) sodium-dependen ( 498) 2143 477.8 2.6e-134 XP_011512515 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 419) 1409 317.4 4.3e-86 XP_016865648 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 455) 1275 288.1 3e-77 XP_006715013 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 455) 1275 288.1 3e-77 XP_006715012 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 478) 1275 288.2 3.1e-77 XP_005248841 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 478) 1275 288.2 3.1e-77 NP_001273052 (OMIM: 611049) sodium-dependent phosp ( 478) 1275 288.2 3.1e-77 XP_011512513 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 443) 1230 278.3 2.6e-74 NP_001273050 (OMIM: 604216) probable small intesti ( 443) 1230 278.3 2.6e-74 NP_005486 (OMIM: 604216) probable small intestine ( 497) 1230 278.4 2.9e-74 XP_011512520 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 289) 1105 250.8 3.2e-66 XP_011513123 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 396) 1085 246.6 8.3e-65 NP_005065 (OMIM: 182308) sodium-dependent phosphat ( 467) 1085 246.7 9.4e-65 XP_016866691 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 489) 1085 246.7 9.7e-65 XP_016866689 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 517) 1085 246.7 1e-64 XP_016866690 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 517) 1085 246.7 1e-64 XP_016866688 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 517) 1085 246.7 1e-64 XP_011513121 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 488) 863 198.2 3.9e-50 XP_011513120 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 499) 859 197.3 7.2e-50 XP_016865649 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 356) 801 184.5 3.7e-46 XP_016865639 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 388) 801 184.5 3.9e-46 NP_001273054 (OMIM: 611049) sodium-dependent phosp ( 398) 795 183.2 9.9e-46 XP_006715014 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 398) 795 183.2 9.9e-46 NP_005826 (OMIM: 611049) sodium-dependent phosphat ( 436) 795 183.3 1.1e-45 XP_011512519 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 321) 784 180.8 4.4e-45 XP_005248768 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTE ( 429) 768 177.4 6.2e-44 XP_005248767 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTE ( 478) 768 177.4 6.7e-44 NP_036566 (OMIM: 269920,604322,604369) sialin [Hom ( 495) 768 177.4 6.9e-44 XP_016866220 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTE ( 364) 679 157.9 3.9e-38 XP_016866219 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTE ( 364) 679 157.9 3.9e-38 NP_647480 (OMIM: 605583,607557) vesicular glutamat ( 589) 654 152.6 2.5e-36 XP_011512516 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 375) 639 149.1 1.7e-35 XP_011512517 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 333) 636 148.4 2.5e-35 NP_065079 (OMIM: 607563) vesicular glutamate trans ( 582) 636 148.6 3.7e-35 NP_064705 (OMIM: 605208) vesicular glutamate trans ( 560) 630 147.3 9e-35 XP_011512521 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 267) 594 139.2 1.2e-32 XP_011534052 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTE ( 397) 526 124.5 4.8e-28 XP_011513122 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 463) 414 100.1 1.3e-20 NP_001138760 (OMIM: 605583,607557) vesicular gluta ( 539) 348 85.7 3.1e-16 XP_011527280 (OMIM: 612107,616063) PREDICTED: solu ( 316) 312 77.6 4.8e-14 NP_001289572 (OMIM: 612107,616063) solute carrier ( 430) 313 78.0 5.2e-14 NP_071365 (OMIM: 612107,616063) solute carrier fam ( 436) 313 78.0 5.3e-14 XP_016865640 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 250) 259 66.0 1.2e-10 XP_016883871 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 507) 154 43.3 0.0017 XP_016883866 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 154 43.3 0.0017 XP_016883869 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 154 43.3 0.0017 XP_016883868 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 154 43.3 0.0017 NP_061837 (OMIM: 608094) glucose-6-phosphate excha ( 533) 154 43.3 0.0017 NP_001307466 (OMIM: 608094) glucose-6-phosphate ex ( 533) 154 43.3 0.0017 >>NP_006623 (OMIM: 611034,612671) sodium-dependent phosp (420 aa) initn: 2776 init1: 2776 opt: 2776 Z-score: 3280.6 bits: 616.0 E(85289): 5.5e-176 Smith-Waterman score: 2776; 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XP_011 MSTGPDVKATVGDISSDGNLNVAQEECSRK--GFCSVRHGLALILQLCNFSIYTQQMNLS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ITMVAMVNSTSPQSQLNDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQE :.. ::::.:.: :: : :.: .:: : ... : . . .: ::..:: ::.:: : XP_011 IAIPAMVNNTAPPSQPNASTERPSTDSQGYWNETLKEFKAMVMVLTGQYSIWVKWAPPLE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RSRLCSIALSGMLLGCFTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDPVS ::.: .:: :: .:: : ..: ::.. .:.:::.:::::::.::.:: ::: .::::::. XP_011 RSQLTTIAGSGSMLGSFIVLLAGGLLCQTIGWPYVFYIFGGIGCACCPLWFPLIYDDPVN 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 YPWISTSEKEYIISSLKQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIP .:.::..::.::. :: :: : :::.::..:::.:.: .. : . :: :...: : XP_011 HPFISAGEKRYIVCSLAQQDCSPGWSLPIRAMIKSLPLWAILVSYFCEYWLFYTIMAYTP 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE5 TYISSVYHVNIRDNGLLSALPFIVAWVIGMVGGYLADFLLTKK-FRLITVRKIATILGSL :::::: ..:.::.:.::::::.:. . ..:: ::::::..: .::::.::. : .: : XP_011 TYISSVLQANLRDSGILSALPFVVGCICIILGGLLADFLLSRKILRLITIRKLFTAIGVL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 PSSALIVSLPYLNSGYITATALLTLSCGLSTLCQSGIYINVLDIAPRYSSFLMGASRGFS :...::::.. :.. . ..:.:: ..:..:.:: .: :::::::..:: : . :. XP_011 FPSVILVSLPWVRSSHSMTMTFLVLSSAISSFCESGALVNFLDIAPRYTGFLKGLLQVFA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 SIAPVIVPTVSGFLLSQDPEFGWRNVFFLLFAVNLLGLLFYLIFGEADVQEWAKERKLTR :: .: ::..::..::: ::::::::.: :::. ::.::::::.::::.::::. .:. XP_011 HIAGAISPTAAGFFISQDSEFGWRNVFLLSAAVNISGLVFYLIFGRADVQDWAKEQTFTH 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 L : XP_011 L >>XP_016865648 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-dependen (455 aa) initn: 1406 init1: 762 opt: 1275 Z-score: 1508.0 bits: 288.1 E(85289): 3e-77 Smith-Waterman score: 1275; 59.4% identity (81.0% similar) in 315 aa overlap (107-420:141-455) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 NDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQERSRLCSIALSGMLLGC :::.:: ::.:: :::.: .:: :: .: XP_016 LFTPLAADFGVILVIMVRTVQGMAQGMAWTGQFTIWAKWAPPLERSKLTTIAGSGSAFGS 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 FTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDPVSYPWISTSEKEYIISSL : . .::.::..:.:::.:::::..:::::::::.::::::. .: ::. :::.:.::: XP_016 FIILCVGGLISQALSWPFIFYIFGSTGCVCCLLWFTVIYDDPMHHPCISVREKEHILSSL 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 KQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIPTYISSVYHVNIRDNGL :: .: . .:::::. ::.:.: :: ::: :: . ...:.:::::.. ::::::.:. XP_016 AQQPSSPGRAVPIKAMVTCLPLWAIFLGFFSHFWLCTIILTYLPTYISTLLHVNIRDSGV 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 LSALPFIVAWVIGMVGGYLADFLLTKKF-RLITVRKIATILGSLPSSALIVSLPYLNSGY ::.::::.: ..:: ::::::.... :::::::. . :: : : :.::.. :.: XP_016 LSSLPFIAAASCTILGGQLADFLLSRNLLRLITVRKLFSSLGLLLPSICAVALPFVASSY 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 ITATALLTLSCGLSTLCQSGIYINVLDIAPRYSSFLMGASRGFSSIAPVIVPTVSGFLLS . . :: : : :.::.::. ::.:::::::.::::: ::::. :: .: :..:::.: XP_016 VITIILLILIPGTSNLCDSGFIINTLDIAPRYASFLMGISRGFGLIAGIISSTATGFLIS 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 pF1KE5 QDPEFGWRNVFFLLFAVNLLGLLFYLIFGEADVQEWAKERKLTRL :: : :::::::: :::..::.::: ::.:..:.::::: :::: XP_016 QDFESGWRNVFFLSAAVNMFGLVFYLTFGQAELQDWAKERTLTRL 420 430 440 450 >>XP_006715013 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-dependen (455 aa) initn: 1406 init1: 762 opt: 1275 Z-score: 1508.0 bits: 288.1 E(85289): 3e-77 Smith-Waterman score: 1275; 59.4% identity (81.0% similar) in 315 aa overlap (107-420:141-455) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 NDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQERSRLCSIALSGMLLGC :::.:: ::.:: :::.: .:: :: .: XP_006 LFTPLAADFGVILVIMVRTVQGMAQGMAWTGQFTIWAKWAPPLERSKLTTIAGSGSAFGS 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 FTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDPVSYPWISTSEKEYIISSL : . .::.::..:.:::.:::::..:::::::::.::::::. .: ::. :::.:.::: XP_006 FIILCVGGLISQALSWPFIFYIFGSTGCVCCLLWFTVIYDDPMHHPCISVREKEHILSSL 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 KQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIPTYISSVYHVNIRDNGL :: .: . .:::::. ::.:.: :: ::: :: . ...:.:::::.. ::::::.:. 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XP_006 IAIIAMVNTTQQQGLSNASTEGPVADAFNNSSISIKEFDTKASVY--------QWSPETQ 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RSRLCSIALSGMLLGCFTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDPVS .: .:.. : . ... .:... .: XP_006 -----GIIFSSINYGIILTLIPSGYLAGIFGAKKMLGAGLLISSLLTLFTPLAADFGVIL 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 YPWISTSEKEYIISSLKQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIP XP_006 VIMVRTVQGMAQGMAWTGQFTIWAKWAPPLERSKLTTIAGSGSAFGSFIILCVGGLISQA 150 160 170 180 190 200 >>XP_005248841 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-dependen (478 aa) initn: 1481 init1: 762 opt: 1275 Z-score: 1507.7 bits: 288.2 E(85289): 3.1e-77 Smith-Waterman score: 1275; 59.4% identity (81.0% similar) in 315 aa overlap (107-420:164-478) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 NDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQERSRLCSIALSGMLLGC :::.:: ::.:: :::.: .:: :: .: XP_005 LFTPLAADFGVILVIMVRTVQGMAQGMAWTGQFTIWAKWAPPLERSKLTTIAGSGSAFGS 140 150 160 170 180 190 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 FTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDPVSYPWISTSEKEYIISSL : . .::.::..:.:::.:::::..:::::::::.::::::. .: ::. :::.:.::: XP_005 FIILCVGGLISQALSWPFIFYIFGSTGCVCCLLWFTVIYDDPMHHPCISVREKEHILSSL 200 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 KQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIPTYISSVYHVNIRDNGL :: .: . .:::::. ::.:.: :: ::: :: . ...:.:::::.. ::::::.:. XP_005 AQQPSSPGRAVPIKAMVTCLPLWAIFLGFFSHFWLCTIILTYLPTYISTLLHVNIRDSGV 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 LSALPFIVAWVIGMVGGYLADFLLTKKF-RLITVRKIATILGSLPSSALIVSLPYLNSGY ::.::::.: ..:: ::::::.... :::::::. . :: : : :.::.. :.: XP_005 LSSLPFIAAASCTILGGQLADFLLSRNLLRLITVRKLFSSLGLLLPSICAVALPFVASSY 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 ITATALLTLSCGLSTLCQSGIYINVLDIAPRYSSFLMGASRGFSSIAPVIVPTVSGFLLS . . :: : : :.::.::. ::.:::::::.::::: ::::. :: .: :..:::.: XP_005 VITIILLILIPGTSNLCDSGFIINTLDIAPRYASFLMGISRGFGLIAGIISSTATGFLIS 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 pF1KE5 QDPEFGWRNVFFLLFAVNLLGLLFYLIFGEADVQEWAKERKLTRL :: : :::::::: :::..::.::: ::.:..:.::::: :::: XP_005 QDFESGWRNVFFLSAAVNMFGLVFYLTFGQAELQDWAKERTLTRL 440 450 460 470 >-- initn: 251 init1: 221 opt: 234 Z-score: 278.6 bits: 60.8 E(85289): 8.8e-09 Smith-Waterman score: 234; 34.1% identity (65.9% similar) in 123 aa overlap (29-151:8-117) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MATKTELSPTARESKNAQDMQVDETLIPRKVPSLCSARYGIALVLHFCNFTTIAQNVIMN :: :..:: :::.::..:: ::: :.: : .. XP_005 MDGKPATRKGPDFCSLRYGLALIMHFSNFTMITQRVSLS 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ITMVAMVNSTSPQSQLNDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQE :...::::.:. :. : :.: .:.:.. : . : . ::.:. .:.: . XP_005 IAIIAMVNTTQQQGLSNASTEGPVADAFNNSSISIKEFDTKASVY--------QWSPETQ 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RSRLCSIALSGMLLGCFTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDPVS .: .:.. : . ... .:... .: XP_005 -----GIIFSSINYGIILTLIPSGYLAGIFGAKKMLGAGLLISSLLTLFTPLAADFGVIL 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 YPWISTSEKEYIISSLKQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIP XP_005 VIMVRTVQGMAQGMAWTGQFTIWAKWAPPLERSKLTTIAGSGSAFGSFIILCVGGLISQA 150 160 170 180 190 200 >>NP_001273052 (OMIM: 611049) sodium-dependent phosphate (478 aa) initn: 1481 init1: 762 opt: 1275 Z-score: 1507.7 bits: 288.2 E(85289): 3.1e-77 Smith-Waterman score: 1275; 59.4% identity (81.0% similar) in 315 aa overlap (107-420:164-478) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 NDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQERSRLCSIALSGMLLGC :::.:: ::.:: :::.: .:: :: .: NP_001 LFTPLAADFGVILVIMVRTVQGMAQGMAWTGQFTIWAKWAPPLERSKLTTIAGSGSAFGS 140 150 160 170 180 190 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 FTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDPVSYPWISTSEKEYIISSL : . .::.::..:.:::.:::::..:::::::::.::::::. .: ::. :::.:.::: NP_001 FIILCVGGLISQALSWPFIFYIFGSTGCVCCLLWFTVIYDDPMHHPCISVREKEHILSSL 200 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 KQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIPTYISSVYHVNIRDNGL :: .: . .:::::. ::.:.: :: ::: :: . ...:.:::::.. ::::::.:. 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NP_001 MDGKPATRKGPDFCSLRYGLALIMHFSNFTMITQRVSLS 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ITMVAMVNSTSPQSQLNDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQE :...::::.:. :. : :.: .:.:.. : . : . ::.:. .:.: . NP_001 IAIIAMVNTTQQQGLSNASTEGPVADAFNNSSISIKEFDTKASVY--------QWSPETQ 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RSRLCSIALSGMLLGCFTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDPVS .: .:.. : . ... .:... .: NP_001 -----GIIFSSINYGIILTLIPSGYLAGIFGAKKMLGAGLLISSLLTLFTPLAADFGVIL 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 YPWISTSEKEYIISSLKQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIP NP_001 VIMVRTVQGMAQGMAWTGQFTIWAKWAPPLERSKLTTIAGSGSAFGSFIILCVGGLISQA 150 160 170 180 190 200 >>XP_011512513 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable small (443 aa) initn: 1296 init1: 752 opt: 1230 Z-score: 1455.0 bits: 278.3 E(85289): 2.6e-74 Smith-Waterman score: 1230; 55.0% identity (81.8% similar) in 318 aa overlap (104-420:126-443) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 SQLNDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQERSRLCSIALSGML .: ::..:: ::.:: :::.: .:: :: . 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XP_011 SGILSALPFVVGCICIILGGLLADFLLSRKILRLITIRKLFTAIGVLFPSVILVSLPWVR 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 SGYITATALLTLSCGLSTLCQSGIYINVLDIAPRYSSFLMGASRGFSSIAPVIVPTVSGF :.. . ..:.:: ..:..:.:: .: :::::::..:: : . :. :: .: ::..:: XP_011 SSHSMTMTFLVLSSAISSFCESGALVNFLDIAPRYTGFLKGLLQVFAHIAGAISPTAAGF 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 pF1KE5 LLSQDPEFGWRNVFFLLFAVNLLGLLFYLIFGEADVQEWAKERKLTRL ..::: ::::::::.: :::. ::.::::::.::::.::::. .:.: XP_011 FISQDSEFGWRNVFLLSAAVNISGLVFYLIFGRADVQDWAKEQTFTHL 400 410 420 430 440 >>NP_001273050 (OMIM: 604216) probable small intestine u (443 aa) initn: 1296 init1: 752 opt: 1230 Z-score: 1455.0 bits: 278.3 E(85289): 2.6e-74 Smith-Waterman score: 1230; 55.0% identity (81.8% similar) in 318 aa overlap (104-420:126-443) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 SQLNDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQERSRLCSIALSGML .: ::..:: ::.:: :::.: .:: :: . 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