FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5505, 420 aa 1>>>pF1KE5505 420 - 420 aa - 420 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2742+/-0.000918; mu= 17.6412+/- 0.055 mean_var=70.4558+/-14.595, 0's: 0 Z-trim(105.3): 30 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.152797 statistics sampled from 8330 (8357) to 8330 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.257), width: 16 Scan time: 2.980 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4566.2 SLC17A3 gene_id:10786|Hs108|chr6 ( 420) 2776 621.3 5.5e-178 CCDS47385.1 SLC17A3 gene_id:10786|Hs108|chr6 ( 498) 2143 481.8 6.4e-136 CCDS69060.1 SLC17A2 gene_id:10246|Hs108|chr6 ( 478) 1275 290.4 2.5e-78 CCDS75411.1 SLC17A4 gene_id:10050|Hs108|chr6 ( 443) 1230 280.5 2.3e-75 CCDS4564.1 SLC17A4 gene_id:10050|Hs108|chr6 ( 497) 1230 280.5 2.5e-75 CCDS4565.1 SLC17A1 gene_id:6568|Hs108|chr6 ( 467) 1085 248.5 9.9e-66 CCDS4567.1 SLC17A2 gene_id:10246|Hs108|chr6 ( 436) 795 184.6 1.6e-46 CCDS4981.1 SLC17A5 gene_id:26503|Hs108|chr6 ( 495) 768 178.7 1.1e-44 CCDS9077.1 SLC17A8 gene_id:246213|Hs108|chr12 ( 589) 654 153.6 4.7e-37 CCDS7856.1 SLC17A6 gene_id:57084|Hs108|chr11 ( 582) 636 149.6 7.3e-36 CCDS12764.1 SLC17A7 gene_id:57030|Hs108|chr19 ( 560) 630 148.3 1.8e-35 CCDS44957.1 SLC17A8 gene_id:246213|Hs108|chr12 ( 539) 348 86.1 8.9e-17 CCDS77600.1 SLC17A9 gene_id:63910|Hs108|chr20 ( 430) 312 78.1 1.8e-14 CCDS42901.1 SLC17A9 gene_id:63910|Hs108|chr20 ( 436) 312 78.1 1.8e-14 >>CCDS4566.2 SLC17A3 gene_id:10786|Hs108|chr6 (420 aa) initn: 2776 init1: 2776 opt: 2776 Z-score: 3308.8 bits: 621.3 E(32554): 5.5e-178 Smith-Waterman score: 2776; 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CCDS69 AQQPSSPGRAVPIKAMVTCLPLWAIFLGFFSHFWLCTIILTYLPTYISTLLHVNIRDSGV 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 LSALPFIVAWVIGMVGGYLADFLLTKKF-RLITVRKIATILGSLPSSALIVSLPYLNSGY ::.::::.: ..:: ::::::.... :::::::. . :: : : :.::.. :.: CCDS69 LSSLPFIAAASCTILGGQLADFLLSRNLLRLITVRKLFSSLGLLLPSICAVALPFVASSY 320 330 340 350 360 370 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 ITATALLTLSCGLSTLCQSGIYINVLDIAPRYSSFLMGASRGFSSIAPVIVPTVSGFLLS . . :: : : :.::.::. ::.:::::::.::::: ::::. :: .: :..:::.: CCDS69 VITIILLILIPGTSNLCDSGFIINTLDIAPRYASFLMGISRGFGLIAGIISSTATGFLIS 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 pF1KE5 QDPEFGWRNVFFLLFAVNLLGLLFYLIFGEADVQEWAKERKLTRL :: : :::::::: :::..::.::: ::.:..:.::::: :::: CCDS69 QDFESGWRNVFFLSAAVNMFGLVFYLTFGQAELQDWAKERTLTRL 440 450 460 470 >>CCDS75411.1 SLC17A4 gene_id:10050|Hs108|chr6 (443 aa) initn: 1296 init1: 752 opt: 1230 Z-score: 1466.7 bits: 280.5 E(32554): 2.3e-75 Smith-Waterman score: 1230; 55.0% identity (81.8% similar) in 318 aa overlap (104-420:126-443) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 SQLNDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQERSRLCSIALSGML .: ::..:: ::.:: :::.: .:: :: . 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CCDS45 FLTLFIPLAANAGVALLIVLRIVQGIAQVMVLTGQYSIWVKWAPPLERSQLTTIAGSGSM 150 160 170 180 190 200 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 LGCFTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDPVSYPWISTSEKEYII :: : ..: ::.. .:.:::.:::::::.::.:: ::: .::::::..:.::..::.::. CCDS45 LGSFIVLLAGGLLCQTIGWPYVFYIFGGIGCACCPLWFPLIYDDPVNHPFISAGEKRYIV 210 220 230 240 250 260 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 SSLKQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIPTYISSVYHVNIRD :: :: : :::.::..:::.:.: .. : . :: :...: ::::::: ..:.:: CCDS45 CSLAQQDCSPGWSLPIRAMIKSLPLWAILVSYFCEYWLFYTIMAYTPTYISSVLQANLRD 270 280 290 300 310 320 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 NGLLSALPFIVAWVIGMVGGYLADFLLTKK-FRLITVRKIATILGSLPSSALIVSLPYLN .:.::::::.:. . ..:: ::::::..: .::::.::. : .: : :...::::.. CCDS45 SGILSALPFVVGCICIILGGLLADFLLSRKILRLITIRKLFTAIGVLFPSVILVSLPWVR 330 340 350 360 370 380 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 SGYITATALLTLSCGLSTLCQSGIYINVLDIAPRYSSFLMGASRGFSSIAPVIVPTVSGF :.. . ..:.:: ..:..:.:: .: :::::::..:: : . :. :: .: ::..:: CCDS45 SSHSMTMTFLVLSSAISSFCESGALVNFLDIAPRYTGFLKGLLQVFAHIAGAISPTAAGF 390 400 410 420 430 440 380 390 400 410 420 pF1KE5 LLSQDPEFGWRNVFFLLFAVNLLGLLFYLIFGEADVQEWAKERKLTRL ..::: ::::::::.: :::. ::.::::::.::::.::::. .:.: CCDS45 FISQDSEFGWRNVFLLSAAVNISGLVFYLIFGRADVQDWAKEQTFTHL 450 460 470 480 490 >>CCDS4565.1 SLC17A1 gene_id:6568|Hs108|chr6 (467 aa) initn: 918 init1: 727 opt: 1085 Z-score: 1293.6 bits: 248.5 E(32554): 9.9e-66 Smith-Waterman score: 1129; 41.5% identity (66.0% similar) in 453 aa overlap (34-420:15-467) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 KTELSPTARESKNAQDMQVDETLIPRKVPSLCSARYGIALVLHFCNFTTIAQNVIMNITM .:: :::.....: :: :: . .:.:: CCDS45 MQMDNRLPPKKVPGFCSFRYGLSFLVHCCNVIITAQRACLNLTM 10 20 30 40 70 80 90 pF1KE5 VAMVNSTSPQSQLNDSSEVL--------------------------------PVDSFGGL :.:::::.:.. : :.. : :: :.:. CCDS45 VVMVNSTDPHGLPNTSTKKLLDNIKNPMYNWSPDIQGIILSSTSYGVIIIQVPVGYFSGI 50 60 70 80 90 100 100 110 pF1KE5 SKAPKSLPTK---SSILG------------------------------GQFAIWEKWGPP .. : . ::.:. .:: :. ::.:: CCDS45 YSTKKMIGFALCLSSVLSLLIPPAAGIGVAWVVVCRAVQGAAQGIVATAQFEIYVKWAPP 110 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 QERSRLCSIALSGMLLGCFTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDP ::.:: :.. ::.::: : ..:. : : :.::::.::::::. ::. ::::::..:::: CCDS45 LERGRLTSMSTSGFLLGPFIVLLVTGVICESLGWPMVFYIFGACGCAVCLLWFVLFYDDP 170 180 190 200 210 220 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 VSYPWISTSEKEYIISSLKQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVY ..: :: :::::: ::: :::.::.: :::::.:.:::.:.: : :. : . :..: CCDS45 KDHPCISISEKEYITSSLVQQVSSSRQSLPIKAILKSLPVWAISTGSFTFFWSHNIMTLY 230 240 250 260 270 280 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 IPTYISSVYHVNIRDNGLLSALPFIVAWVIGMVGGYLADFLLTKK-FRLITVRKIATILG : .:.:. ::::..::.::.::.. ::. : ..: :.::.::.. . .:.:::. : : CCDS45 TPMFINSMLHVNIKENGFLSSLPYLFAWICGNLAGQLSDFFLTRNILSVIAVRKLFTAAG 290 300 310 320 330 340 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 SLPSSALIVSLPYLNSGYITATALLTLSCGLSTLCQSGIYINVLDIAPRYSSFLMGASRG : . . : ::::.: . . . .: :. . ...: .:..:: ::::::: .:. . : CCDS45 FLLPAIFGVCLPYLSSTFYSIVIFLILAGATGSFCLGGVFINGLDIAPRYFGFIKACSTL 350 360 370 380 390 400 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 FSSIAPVIVPTVSGFLLSQDPEFGWRNVFFLLFAVNLLGLLFYLIFGEADVQEWAKERKL . :. .:. :..:..:.:::: .: ..:.:. :.:. ::.:::: . :..:.::::.. CCDS45 TGMIGGLIASTLTGLILKQDPESAWFKTFILMAAINVTGLIFYLIVATAEIQDWAKEKQH 410 420 430 440 450 460 420 pF1KE5 TRL ::: CCDS45 TRL >>CCDS4567.1 SLC17A2 gene_id:10246|Hs108|chr6 (436 aa) initn: 1048 init1: 762 opt: 795 Z-score: 948.5 bits: 184.6 E(32554): 1.6e-46 Smith-Waterman score: 827; 49.6% identity (72.6% similar) in 266 aa overlap (107-357:164-424) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 NDSSEVLPVDSFGGLSKAPKSLPTKSSILGGQFAIWEKWGPPQERSRLCSIALSGMLLGC :::.:: ::.:: :::.: .:: :: .: CCDS45 LFTPLAADFGVILVIMVRTVQGMAQGMAWTGQFTIWAKWAPPLERSKLTTIAGSGSAFGS 140 150 160 170 180 190 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 FTAILIGGFISETLGWPFVFYIFGGVGCVCCLLWFVVIYDDPVSYPWISTSEKEYIISSL : . .::.::..:.:::.:::::..:::::::::.::::::. .: ::. :::.:.::: CCDS45 FIILCVGGLISQALSWPFIFYIFGSTGCVCCLLWFTVIYDDPMHHPCISVREKEHILSSL 200 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 KQQVGSSKQPLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIPTYISSVYHVNIRDNGL :: .: . .:::::. ::.:.: :: ::: :: . ...:.:::::.. ::::::.:. 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CCDS78 PLAGILVQYTGWSSVFYVYGSFGMVWYMFWLLVSYESPAKHPTITDEERRYIEESIGESA 240 250 260 270 280 290 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 --VGSSKQ-PLPIKAMLRSLPIWSICLGCFSHQWLVSTMVVYIPTYISSVYHVNIRDNGL .:. .. : . .. :.:...: .. : ..: ... :.:. :. .: :. CCDS78 NLLGAMEKFKTPWRKFFTSMPVYAIIVANFCRSWTFYLLLISQPAYFEEVFGFEISKVGM 300 310 320 330 340 350 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 LSALPFIVAWVIGMVGGYLADFLLTKK-FRLITVRKIATILGSLPSSALIVSLPYLNSGY :::.: .: .: .:: .:::: .:. . ::::: . : ..:.. . : .. CCDS78 LSAVPHLVMTIIVPIGGQIADFLRSKQILSTTTVRKIMNCGGFGMEATLLLVVGYSHTRG 360 370 380 390 400 410 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 ITATALLTLSCGLSTLCQSGIYINVLDIAPRYSSFLMGASRGFSSIAPVIVPTVSGFLLS . : ..:.:. :.: . ::. .: :::::::.:.::: : : .... .. : . : . . 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