FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1380, 658 aa 1>>>pF1KE1380 658 - 658 aa - 658 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0206+/-0.000346; mu= 15.5377+/- 0.022 mean_var=72.2435+/-15.106, 0's: 0 Z-trim(114.8): 24 B-trim: 955 in 2/56 Lambda= 0.150895 statistics sampled from 24832 (24855) to 24832 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16 Scan time: 12.150 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001108225 (OMIM: 131195,187300) endoglin isofor ( 658) 4340 954.2 0 NP_000109 (OMIM: 131195,187300) endoglin isoform 2 ( 625) 4093 900.5 0 NP_001265067 (OMIM: 131195,187300) endoglin isofor ( 476) 3163 698.0 2.1e-200 NP_001182612 (OMIM: 600742) transforming growth fa ( 850) 271 68.5 1.2e-10 NP_001182613 (OMIM: 600742) transforming growth fa ( 850) 271 68.5 1.2e-10 NP_003234 (OMIM: 600742) transforming growth facto ( 851) 271 68.5 1.2e-10 XP_006710930 (OMIM: 600742) PREDICTED: transformin ( 851) 271 68.5 1.2e-10 XP_006710931 (OMIM: 600742) PREDICTED: transformin ( 851) 271 68.5 1.2e-10 >>NP_001108225 (OMIM: 131195,187300) endoglin isoform 1 (658 aa) initn: 4340 init1: 4340 opt: 4340 Z-score: 5101.5 bits: 954.2 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4340; 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