Result of FASTA (omim) for pFN21AE1380
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1380, 658 aa
  1>>>pF1KE1380 658 - 658 aa - 658 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0206+/-0.000346; mu= 15.5377+/- 0.022
 mean_var=72.2435+/-15.106, 0's: 0 Z-trim(114.8): 24  B-trim: 955 in 2/56
 Lambda= 0.150895
 statistics sampled from 24832 (24855) to 24832 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.291), width:  16
 Scan time: 12.150

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001108225 (OMIM: 131195,187300) endoglin isofor ( 658) 4340 954.2       0
NP_000109 (OMIM: 131195,187300) endoglin isoform 2 ( 625) 4093 900.5       0
NP_001265067 (OMIM: 131195,187300) endoglin isofor ( 476) 3163 698.0 2.1e-200
NP_001182612 (OMIM: 600742) transforming growth fa ( 850)  271 68.5 1.2e-10
NP_001182613 (OMIM: 600742) transforming growth fa ( 850)  271 68.5 1.2e-10
NP_003234 (OMIM: 600742) transforming growth facto ( 851)  271 68.5 1.2e-10
XP_006710930 (OMIM: 600742) PREDICTED: transformin ( 851)  271 68.5 1.2e-10
XP_006710931 (OMIM: 600742) PREDICTED: transformin ( 851)  271 68.5 1.2e-10


>>NP_001108225 (OMIM: 131195,187300) endoglin isoform 1   (658 aa)
 initn: 4340 init1: 4340 opt: 4340  Z-score: 5101.5  bits: 954.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4340; 99.8% identity (99.8% similar) in 658 aa overlap (1-658:1-658)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MDRGTLPLAVALLLASCSLSPTSLAETVHCDLQPVGPERDEVTYTTSQVSKGCVAQAPNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 MDRGTLPLAVALLLASCSLSPTSLAETVHCDLQPVGPERGEVTYTTSQVSKGCVAQAPNA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 ILEVHVLFLEFPTGPSQLELTLQASKQNGTWPREVLLVLSVNSSVFLHLQALGIPLHLAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILEVHVLFLEFPTGPSQLELTLQASKQNGTWPREVLLVLSVNSSVFLHLQALGIPLHLAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 NSSLVTFQEPPGVNTTELPSFPKTQILEWAAERGPITSAAELNDPQSILLRLGQAQGSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSSLVTFQEPPGVNTTELPSFPKTQILEWAAERGPITSAAELNDPQSILLRLGQAQGSLS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 FCMLEASQDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGVAGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTVKVEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FCMLEASQDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGVAGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTVKVEL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 SCAPGDLDAVLILQGPPYVSWLIDANHNMQIWTTGEYSFKIFPEKNIRGFKLPDTPQGLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCAPGDLDAVLILQGPPYVSWLIDANHNMQIWTTGEYSFKIFPEKNIRGFKLPDTPQGLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 GEARMLNASIVASFVELPLASIVSLHASSCGGRLQTSPAPIQTTPPKDTCSPELLMSLIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEARMLNASIVASFVELPLASIVSLHASSCGGRLQTSPAPIQTTPPKDTCSPELLMSLIQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 TKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDPSCEAEDRGDKFVLRSAYSSCGMQVSASM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDPSCEAEDRGDKFVLRSAYSSCGMQVSASM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 ISNEAVVNILSSSSPQRKKVHCLNMDSLSFQLGLYLSPHFLQASNTIEPGQQSFVQVRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISNEAVVNILSSSSPQRKKVHCLNMDSLSFQLGLYLSPHFLQASNTIEPGQQSFVQVRVS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 PSVSEFLLQLDSCHLDLGPEGGTVELIQGRAAKGNCVSLLSPSPEGDPRFSFLLHFYTVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSVSEFLLQLDSCHLDLGPEGGTVELIQGRAAKGNCVSLLSPSPEGDPRFSFLLHFYTVP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 IPKTGTLSCTVALRPKTGSQDQEVHRTVFMRLNIISPDLSGCTSKGLVLPAVLGITFGAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPKTGTLSCTVALRPKTGSQDQEVHRTVFMRLNIISPDLSGCTSKGLVLPAVLGITFGAF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650        
pF1KE1 LIGALLTAALWYIYSHTRSPSKREPVVAVAAPASSESSSTNHSIGSTQSTPCSTSSMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIGALLTAALWYIYSHTRSPSKREPVVAVAAPASSESSSTNHSIGSTQSTPCSTSSMA
              610       620       630       640       650        

>>NP_000109 (OMIM: 131195,187300) endoglin isoform 2 pre  (625 aa)
 initn: 4093 init1: 4093 opt: 4093  Z-score: 4811.2  bits: 900.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4093; 99.8% identity (99.8% similar) in 618 aa overlap (1-618:1-618)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MDRGTLPLAVALLLASCSLSPTSLAETVHCDLQPVGPERDEVTYTTSQVSKGCVAQAPNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_000 MDRGTLPLAVALLLASCSLSPTSLAETVHCDLQPVGPERGEVTYTTSQVSKGCVAQAPNA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 ILEVHVLFLEFPTGPSQLELTLQASKQNGTWPREVLLVLSVNSSVFLHLQALGIPLHLAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ILEVHVLFLEFPTGPSQLELTLQASKQNGTWPREVLLVLSVNSSVFLHLQALGIPLHLAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 NSSLVTFQEPPGVNTTELPSFPKTQILEWAAERGPITSAAELNDPQSILLRLGQAQGSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NSSLVTFQEPPGVNTTELPSFPKTQILEWAAERGPITSAAELNDPQSILLRLGQAQGSLS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 FCMLEASQDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGVAGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTVKVEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FCMLEASQDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGVAGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTVKVEL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 SCAPGDLDAVLILQGPPYVSWLIDANHNMQIWTTGEYSFKIFPEKNIRGFKLPDTPQGLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SCAPGDLDAVLILQGPPYVSWLIDANHNMQIWTTGEYSFKIFPEKNIRGFKLPDTPQGLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 GEARMLNASIVASFVELPLASIVSLHASSCGGRLQTSPAPIQTTPPKDTCSPELLMSLIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GEARMLNASIVASFVELPLASIVSLHASSCGGRLQTSPAPIQTTPPKDTCSPELLMSLIQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 TKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDPSCEAEDRGDKFVLRSAYSSCGMQVSASM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDPSCEAEDRGDKFVLRSAYSSCGMQVSASM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 ISNEAVVNILSSSSPQRKKVHCLNMDSLSFQLGLYLSPHFLQASNTIEPGQQSFVQVRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ISNEAVVNILSSSSPQRKKVHCLNMDSLSFQLGLYLSPHFLQASNTIEPGQQSFVQVRVS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 PSVSEFLLQLDSCHLDLGPEGGTVELIQGRAAKGNCVSLLSPSPEGDPRFSFLLHFYTVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PSVSEFLLQLDSCHLDLGPEGGTVELIQGRAAKGNCVSLLSPSPEGDPRFSFLLHFYTVP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 IPKTGTLSCTVALRPKTGSQDQEVHRTVFMRLNIISPDLSGCTSKGLVLPAVLGITFGAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IPKTGTLSCTVALRPKTGSQDQEVHRTVFMRLNIISPDLSGCTSKGLVLPAVLGITFGAF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650        
pF1KE1 LIGALLTAALWYIYSHTRSPSKREPVVAVAAPASSESSSTNHSIGSTQSTPCSTSSMA
       ::::::::::::::::::                                        
NP_000 LIGALLTAALWYIYSHTREYPRPPQ                                 
              610       620                                      

>>NP_001265067 (OMIM: 131195,187300) endoglin isoform 3   (476 aa)
 initn: 3163 init1: 3163 opt: 3163  Z-score: 3719.0  bits: 698.0 E(85289): 2.1e-200
Smith-Waterman score: 3163; 100.0% identity (100.0% similar) in 476 aa overlap (183-658:1-476)

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE1 RGPITSAAELNDPQSILLRLGQAQGSLSFCMLEASQDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGV
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                               MLEASQDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGV
                                             10        20        30

            220       230       240       250       260       270  
pF1KE1 AGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTVKVELSCAPGDLDAVLILQGPPYVSWLIDANHNMQIW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTVKVELSCAPGDLDAVLILQGPPYVSWLIDANHNMQIW
               40        50        60        70        80        90

            280       290       300       310       320       330  
pF1KE1 TTGEYSFKIFPEKNIRGFKLPDTPQGLLGEARMLNASIVASFVELPLASIVSLHASSCGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTGEYSFKIFPEKNIRGFKLPDTPQGLLGEARMLNASIVASFVELPLASIVSLHASSCGG
              100       110       120       130       140       150

            340       350       360       370       380       390  
pF1KE1 RLQTSPAPIQTTPPKDTCSPELLMSLIQTKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLQTSPAPIQTTPPKDTCSPELLMSLIQTKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDP
              160       170       180       190       200       210

            400       410       420       430       440       450  
pF1KE1 SCEAEDRGDKFVLRSAYSSCGMQVSASMISNEAVVNILSSSSPQRKKVHCLNMDSLSFQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCEAEDRGDKFVLRSAYSSCGMQVSASMISNEAVVNILSSSSPQRKKVHCLNMDSLSFQL
              220       230       240       250       260       270

            460       470       480       490       500       510  
pF1KE1 GLYLSPHFLQASNTIEPGQQSFVQVRVSPSVSEFLLQLDSCHLDLGPEGGTVELIQGRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLYLSPHFLQASNTIEPGQQSFVQVRVSPSVSEFLLQLDSCHLDLGPEGGTVELIQGRAA
              280       290       300       310       320       330

            520       530       540       550       560       570  
pF1KE1 KGNCVSLLSPSPEGDPRFSFLLHFYTVPIPKTGTLSCTVALRPKTGSQDQEVHRTVFMRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGNCVSLLSPSPEGDPRFSFLLHFYTVPIPKTGTLSCTVALRPKTGSQDQEVHRTVFMRL
              340       350       360       370       380       390

            580       590       600       610       620       630  
pF1KE1 NIISPDLSGCTSKGLVLPAVLGITFGAFLIGALLTAALWYIYSHTRSPSKREPVVAVAAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NIISPDLSGCTSKGLVLPAVLGITFGAFLIGALLTAALWYIYSHTRSPSKREPVVAVAAP
              400       410       420       430       440       450

            640       650        
pF1KE1 ASSESSSTNHSIGSTQSTPCSTSSMA
       ::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASSESSSTNHSIGSTQSTPCSTSSMA
              460       470      

>>NP_001182612 (OMIM: 600742) transforming growth factor  (850 aa)
 initn: 379 init1: 146 opt: 271  Z-score: 312.4  bits: 68.5 E(85289): 1.2e-10
Smith-Waterman score: 308; 23.7% identity (48.1% similar) in 697 aa overlap (149-658:163-850)

      120       130       140       150        160       170       
pF1KE1 AYNSSLVTFQEPPGVNTTELPSFPKTQILEWA-AERGPITSAAELNDPQSILLRLGQAQG
                                     ::  : : .:: .::.  ..: ...:. : 
NP_001 SVVQFSSANFSLTAETEERNFPHGNEHLLNWARKEYGAVTSFTELKIARNIYIKVGEDQV
            140       150       160       170       180       190  

       180        190       200       210       220       230      
pF1KE1 SLSFCMLEAS-QDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGVAGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTV
           : .  .  ...   :.    :  ..:: . .   ..:.::....  .:    .  :
NP_001 FPPKCNIGKNFLSLNYLAEYL--QPKAAEGCVMSSQPQNEEVHIIELITPNSNPYSAFQV
            200       210         220       230       240       250

        240         250           260          270       280       
pF1KE1 KVELSCAPG--DLDAV----LILQGPPYVSWLI---DANHNMQIWTTGEYSFKIFPEKNI
        . ..  :.  ::..:    :::.    :.:.:   :.. ...: . .  .:    :...
NP_001 DITIDIRPSQEDLEVVKNLILILKCKKSVNWVIKSFDVKGSLKIIAPNSIGFGKESERSM
              260       270       280       290       300       310

       290            300        310       320                     
pF1KE1 RGFK-----LPDTPQGLLGEARMLNA-SIVASFVELPLASIVSL-------------HAS
          :     .:.: :: : .  . :. : ..:..  :.:.   :             :. 
NP_001 TMTKSIRDDIPST-QGNLVKWALDNGYSPITSYTMAPVANRFHLRLENNEEMGDEEVHTI
              320        330       340       350       360         

      330         340                                         350  
pF1KE1 SCGGRLQTSPA--P-IQTTP---------------------------------PKDTCSP
           :.  .:.  : .:. :                                 :::   :
NP_001 PPELRILLDPGALPALQNPPIRGGEGQNGGLPFPFPDISRRVWNEEGEDGLPRPKDPVIP
     370       380       390       400       410       420         

                           360       370       380       390       
pF1KE1 --ELLMSL-------------IQTKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDPSCEAE
         .:. .:             ...:: .. : ....:.       .   .:. ::.:.:.
NP_001 SIQLFPGLREPEEVQGSVDIALSVKCDNEKMIVAVEKDSFQASGYSGMDVTLLDPTCKAK
     430       440       450       460       470       480         

       400       410       420              430                    
pF1KE1 DRGDKFVLRSAYSSCGMQVSASMIS-----NEAVVNI--LSSSS--PQ------------
         : .:::.:  ..:: .   : ..     :  :...  :..::  :.            
NP_001 MNGTHFVLESPLNGCGTRPRWSALDGVVYYNSIVIQVPALGDSSGWPDGYEDLESGDNGF
     490       500       510       520       530       540         

                     440                       450       460       
pF1KE1 -------------RKKVHCLNMD----------------SLSFQLGLYLSPHFLQASN--
                    : ..  .: .                ...:.. :: .  ::  :.  
NP_001 PGDMDEGDASLFTRPEIVVFNCSLQQVRNPSSFQEQPHGNITFNMELYNTDLFLVPSQGV
     550       560       570       580       590       600         

          470       480       490         500        510       520 
pF1KE1 -TIEPGQQSFVQVRVSPSVSEFLLQLDSCHLD--LGPEGGT-VELIQGRAAKGNCVSLLS
        ..  . . .:.: :. . .:. . ...: ..   .:.  .   .:..   : . :.. :
NP_001 FSVPENGHVYVEVSVTKAEQELGFAIQTCFISPYSNPDRMSHYTIIENICPKDESVKFYS
     610       620       630       640       650       660         

                      530       540         550       560          
pF1KE1 PS------PEGD---PRFSFLLHFYTVPIPKTGTL--SCTVALRPKTGSQDQEVHRTV--
       :.      :..:    ::::...    :. .:. :  .: ..:  :  .. :.. . :  
NP_001 PKRVHFPIPQADMDKKRFSFVFK----PVFNTSLLFLQCELTLCTKMEKHPQKLPKCVPP
     670       680       690           700       710       720     

                           570                       580       590 
pF1KE1 ---------------------FMR-LNII---------SPDL------SGCTSKGLVLPA
                            : . : .:         .:..      :    .::   .
NP_001 DEACTSLDASIIWAMMQNKKTFTKPLAVIHHEAESKEKGPSMKEPNPISPPIFHGLDTLT
         730       740       750       760       770       780     

             600       610       620       630       640       650 
pF1KE1 VLGITFGAFLIGALLTAALWYIYSHTRSPSKREPVVAVAAPASSESSSTNHSIGSTQSTP
       :.::.:.::.::::::.:::::::::   . :. : .  .: .::.::. ::::::::::
NP_001 VMGIAFAAFVIGALLTGALWYIYSHTGETAGRQQVPT--SPPASENSSAAHSIGSTQSTP
         790       800       810       820         830       840   

              
pF1KE1 CSTSSMA
       ::.:: :
NP_001 CSSSSTA
           850

>>NP_001182613 (OMIM: 600742) transforming growth factor  (850 aa)
 initn: 379 init1: 146 opt: 271  Z-score: 312.4  bits: 68.5 E(85289): 1.2e-10
Smith-Waterman score: 308; 23.7% identity (48.1% similar) in 697 aa overlap (149-658:163-850)

      120       130       140       150        160       170       
pF1KE1 AYNSSLVTFQEPPGVNTTELPSFPKTQILEWA-AERGPITSAAELNDPQSILLRLGQAQG
                                     ::  : : .:: .::.  ..: ...:. : 
NP_001 SVVQFSSANFSLTAETEERNFPHGNEHLLNWARKEYGAVTSFTELKIARNIYIKVGEDQV
            140       150       160       170       180       190  

       180        190       200       210       220       230      
pF1KE1 SLSFCMLEAS-QDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGVAGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTV
           : .  .  ...   :.    :  ..:: . .   ..:.::....  .:    .  :
NP_001 FPPKCNIGKNFLSLNYLAEYL--QPKAAEGCVMSSQPQNEEVHIIELITPNSNPYSAFQV
            200       210         220       230       240       250

        240         250           260          270       280       
pF1KE1 KVELSCAPG--DLDAV----LILQGPPYVSWLI---DANHNMQIWTTGEYSFKIFPEKNI
        . ..  :.  ::..:    :::.    :.:.:   :.. ...: . .  .:    :...
NP_001 DITIDIRPSQEDLEVVKNLILILKCKKSVNWVIKSFDVKGSLKIIAPNSIGFGKESERSM
              260       270       280       290       300       310

       290            300        310       320                     
pF1KE1 RGFK-----LPDTPQGLLGEARMLNA-SIVASFVELPLASIVSL-------------HAS
          :     .:.: :: : .  . :. : ..:..  :.:.   :             :. 
NP_001 TMTKSIRDDIPST-QGNLVKWALDNGYSPITSYTMAPVANRFHLRLENNEEMGDEEVHTI
              320        330       340       350       360         

      330         340                                         350  
pF1KE1 SCGGRLQTSPA--P-IQTTP---------------------------------PKDTCSP
           :.  .:.  : .:. :                                 :::   :
NP_001 PPELRILLDPGALPALQNPPIRGGEGQNGGLPFPFPDISRRVWNEEGEDGLPRPKDPVIP
     370       380       390       400       410       420         

                           360       370       380       390       
pF1KE1 --ELLMSL-------------IQTKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDPSCEAE
         .:. .:             ...:: .. : ....:.       .   .:. ::.:.:.
NP_001 SIQLFPGLREPEEVQGSVDIALSVKCDNEKMIVAVEKDSFQASGYSGMDVTLLDPTCKAK
     430       440       450       460       470       480         

       400       410       420              430                    
pF1KE1 DRGDKFVLRSAYSSCGMQVSASMIS-----NEAVVNI--LSSSS--PQ------------
         : .:::.:  ..:: .   : ..     :  :...  :..::  :.            
NP_001 MNGTHFVLESPLNGCGTRPRWSALDGVVYYNSIVIQVPALGDSSGWPDGYEDLESGDNGF
     490       500       510       520       530       540         

                     440                       450       460       
pF1KE1 -------------RKKVHCLNMD----------------SLSFQLGLYLSPHFLQASN--
                    : ..  .: .                ...:.. :: .  ::  :.  
NP_001 PGDMDEGDASLFTRPEIVVFNCSLQQVRNPSSFQEQPHGNITFNMELYNTDLFLVPSQGV
     550       560       570       580       590       600         

          470       480       490         500        510       520 
pF1KE1 -TIEPGQQSFVQVRVSPSVSEFLLQLDSCHLD--LGPEGGT-VELIQGRAAKGNCVSLLS
        ..  . . .:.: :. . .:. . ...: ..   .:.  .   .:..   : . :.. :
NP_001 FSVPENGHVYVEVSVTKAEQELGFAIQTCFISPYSNPDRMSHYTIIENICPKDESVKFYS
     610       620       630       640       650       660         

                      530       540         550       560          
pF1KE1 PS------PEGD---PRFSFLLHFYTVPIPKTGTL--SCTVALRPKTGSQDQEVHRTV--
       :.      :..:    ::::...    :. .:. :  .: ..:  :  .. :.. . :  
NP_001 PKRVHFPIPQADMDKKRFSFVFK----PVFNTSLLFLQCELTLCTKMEKHPQKLPKCVPP
     670       680       690           700       710       720     

                           570                       580       590 
pF1KE1 ---------------------FMR-LNII---------SPDL------SGCTSKGLVLPA
                            : . : .:         .:..      :    .::   .
NP_001 DEACTSLDASIIWAMMQNKKTFTKPLAVIHHEAESKEKGPSMKEPNPISPPIFHGLDTLT
         730       740       750       760       770       780     

             600       610       620       630       640       650 
pF1KE1 VLGITFGAFLIGALLTAALWYIYSHTRSPSKREPVVAVAAPASSESSSTNHSIGSTQSTP
       :.::.:.::.::::::.:::::::::   . :. : .  .: .::.::. ::::::::::
NP_001 VMGIAFAAFVIGALLTGALWYIYSHTGETAGRQQVPT--SPPASENSSAAHSIGSTQSTP
         790       800       810       820         830       840   

              
pF1KE1 CSTSSMA
       ::.:: :
NP_001 CSSSSTA
           850

>>NP_003234 (OMIM: 600742) transforming growth factor be  (851 aa)
 initn: 379 init1: 146 opt: 271  Z-score: 312.4  bits: 68.5 E(85289): 1.2e-10
Smith-Waterman score: 303; 23.7% identity (47.9% similar) in 693 aa overlap (152-658:167-851)

             130       140       150       160       170       180 
pF1KE1 SSLVTFQEPPGVNTTELPSFPKTQILEWAAERGPITSAAELNDPQSILLRLGQAQGSLSF
                                     : : .:: .::.  ..: ...:. :     
NP_003 FSSANFSLTAETEERNFPHGNEHLLNWARKEYGAVTSFTELKIARNIYIKVGEDQVFPPK
        140       150       160       170       180       190      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 CMLEAS-QDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGVAGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTVKVEL
       : .  .  ...   :.    :  ..:: . .   ..:.::....  .:    .  : . .
NP_003 CNIGKNFLSLNYLAEYLQ--PKAAEGCVMSSQPQNEEVHIIELITPNSNPYSAFQVDITI
        200       210         220       230       240       250    

                250           260          270       280       290 
pF1KE1 SCAPG--DLDAV----LILQGPPYVSWLI---DANHNMQIWTTGEYSFKIFPEKNIRGFK
       .  :.  ::..:    :::.    :.:.:   :.. ...: . .  .:    :...   :
NP_003 DIRPSQEDLEVVKNLILILKCKKSVNWVIKSFDVKGSLKIIAPNSIGFGKESERSMTMTK
          260       270       280       290       300       310    

                 300        310       320           330            
pF1KE1 L--PDTP--QGLLGEARMLNA-SIVASFVELPLASIVSL----HASSCGG----------
           : :  :: : .  . :. : ..:..  :.:.   :    .:   :           
NP_003 SIRDDIPSTQGNLVKWALDNGYSPITSYTMAPVANRFHLRLENNAEEMGDEEVHTIPPEL
          320       330       340       350       360       370    

              340                                         350      
pF1KE1 RLQTSPA--P-IQTTP---------------------------------PKDTCSP--EL
       :.  .:.  : .:. :                                 :::   :  .:
NP_003 RILLDPGALPALQNPPIRGGEGQNGGLPFPFPDISRRVWNEEGEDGLPRPKDPVIPSIQL
          380       390       400       410       420       430    

                       360       370       380       390       400 
pF1KE1 LMSL-------------IQTKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDPSCEAEDRGD
       . .:             ...:: .. : ....:.       .   .:. ::.:.:.  : 
NP_003 FPGLREPEEVQGSVDIALSVKCDNEKMIVAVEKDSFQASGYSGMDVTLLDPTCKAKMNGT
          440       450       460       470       480       490    

             410       420              430                        
pF1KE1 KFVLRSAYSSCGMQVSASMIS-----NEAVVNI--LSSSS--PQ----------------
       .:::.:  ..:: .   : ..     :  :...  :..::  :.                
NP_003 HFVLESPLNGCGTRPRWSALDGVVYYNSIVIQVPALGDSSGWPDGYEDLESGDNGFPGDM
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pF1KE1 ---------RKKVHCLNMD----------------SLSFQLGLYLSPHFLQASN---TIE
                : ..  .: .                ...:.. :: .  ::  :.   .. 
NP_003 DEGDASLFTRPEIVVFNCSLQQVRNPSSFQEQPHGNITFNMELYNTDLFLVPSQGVFSVP
          560       570       580       590       600       610    

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pF1KE1 PGQQSFVQVRVSPSVSEFLLQLDSCHLD--LGPEGGT-VELIQGRAAKGNCVSLLSPS--
        . . .:.: :. . .:. . ...: ..   .:.  .   .:..   : . :.. ::.  
NP_003 ENGHVYVEVSVTKAEQELGFAIQTCFISPYSNPDRMSHYTIIENICPKDESVKFYSPKRV
          620       630       640       650       660       670    

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pF1KE1 ----PEGD---PRFSFLLHFYTVPIPKTGTL--SCTVALRPKTGSQDQEVHRTV------
           :..:    ::::...    :. .:. :  .: ..:  :  .. :.. . :      
NP_003 HFPIPQADMDKKRFSFVFK----PVFNTSLLFLQCELTLCTKMEKHPQKLPKCVPPDEAC
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pF1KE1 -----------------FMR-LNII---------SPDL------SGCTSKGLVLPAVLGI
                        : . : .:         .:..      :    .::   .:.::
NP_003 TSLDASIIWAMMQNKKTFTKPLAVIHHEAESKEKGPSMKEPNPISPPIFHGLDTLTVMGI
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pF1KE1 TFGAFLIGALLTAALWYIYSHTRSPSKREPVVAVAAPASSESSSTNHSIGSTQSTPCSTS
       .:.::.::::::.:::::::::   . :. : .  .: .::.::. ::::::::::::.:
NP_003 AFAAFVIGALLTGALWYIYSHTGETAGRQQVPT--SPPASENSSAAHSIGSTQSTPCSSS
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pF1KE1 SMA
       : :
NP_003 STA
      850 

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pF1KE1 SSLVTFQEPPGVNTTELPSFPKTQILEWAAERGPITSAAELNDPQSILLRLGQAQGSLSF
                                     : : .:: .::.  ..: ...:. :     
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pF1KE1 CMLEAS-QDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGVAGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTVKVEL
       : .  .  ...   :.    :  ..:: . .   ..:.::....  .:    .  : . .
XP_006 CNIGKNFLSLNYLAEYLQ--PKAAEGCVMSSQPQNEEVHIIELITPNSNPYSAFQVDITI
        200       210         220       230       240       250    

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pF1KE1 SCAPG--DLDAV----LILQGPPYVSWLI---DANHNMQIWTTGEYSFKIFPEKNIRGFK
       .  :.  ::..:    :::.    :.:.:   :.. ...: . .  .:    :...   :
XP_006 DIRPSQEDLEVVKNLILILKCKKSVNWVIKSFDVKGSLKIIAPNSIGFGKESERSMTMTK
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pF1KE1 L--PDTP--QGLLGEARMLNA-SIVASFVELPLASIVSL----HASSCGG----------
           : :  :: : .  . :. : ..:..  :.:.   :    .:   :           
XP_006 SIRDDIPSTQGNLVKWALDNGYSPITSYTMAPVANRFHLRLENNAEEMGDEEVHTIPPEL
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pF1KE1 RLQTSPA--P-IQTTP---------------------------------PKDTCSP--EL
       :.  .:.  : .:. :                                 :::   :  .:
XP_006 RILLDPGALPALQNPPIRGGEGQNGGLPFPFPDISRRVWNEEGEDGLPRPKDPVIPSIQL
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pF1KE1 LMSL-------------IQTKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDPSCEAEDRGD
       . .:             ...:: .. : ....:.       .   .:. ::.:.:.  : 
XP_006 FPGLREPEEVQGSVDIALSVKCDNEKMIVAVEKDSFQASGYSGMDVTLLDPTCKAKMNGT
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pF1KE1 KFVLRSAYSSCGMQVSASMIS-----NEAVVNI--LSSSS--PQ----------------
       .:::.:  ..:: .   : ..     :  :...  :..::  :.                
XP_006 HFVLESPLNGCGTRPRWSALDGVVYYNSIVIQVPALGDSSGWPDGYEDLESGDNGFPGDM
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pF1KE1 ---------RKKVHCLNMD----------------SLSFQLGLYLSPHFLQASN---TIE
                : ..  .: .                ...:.. :: .  ::  :.   .. 
XP_006 DEGDASLFTRPEIVVFNCSLQQVRNPSSFQEQPHGNITFNMELYNTDLFLVPSQGVFSVP
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pF1KE1 PGQQSFVQVRVSPSVSEFLLQLDSCHLD--LGPEGGT-VELIQGRAAKGNCVSLLSPS--
        . . .:.: :. . .:. . ...: ..   .:.  .   .:..   : . :.. ::.  
XP_006 ENGHVYVEVSVTKAEQELGFAIQTCFISPYSNPDRMSHYTIIENICPKDESVKFYSPKRV
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pF1KE1 ----PEGD---PRFSFLLHFYTVPIPKTGTL--SCTVALRPKTGSQDQEVHRTV------
           :..:    ::::...    :. .:. :  .: ..:  :  .. :.. . :      
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pF1KE1 -----------------FMR-LNII---------SPDL------SGCTSKGLVLPAVLGI
                        : . : .:         .:..      :    .::   .:.::
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pF1KE1 TFGAFLIGALLTAALWYIYSHTRSPSKREPVVAVAAPASSESSSTNHSIGSTQSTPCSTS
       .:.::.::::::.:::::::::   . :. : .  .: .::.::. ::::::::::::.:
XP_006 AFAAFVIGALLTGALWYIYSHTGETAGRQQVPT--SPPASENSSAAHSIGSTQSTPCSSS
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pF1KE1 SMA
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XP_006 STA
      850 

>>XP_006710931 (OMIM: 600742) PREDICTED: transforming gr  (851 aa)
 initn: 379 init1: 146 opt: 271  Z-score: 312.4  bits: 68.5 E(85289): 1.2e-10
Smith-Waterman score: 303; 23.7% identity (47.9% similar) in 693 aa overlap (152-658:167-851)

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pF1KE1 SSLVTFQEPPGVNTTELPSFPKTQILEWAAERGPITSAAELNDPQSILLRLGQAQGSLSF
                                     : : .:: .::.  ..: ...:. :     
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pF1KE1 CMLEAS-QDMGRTLEWRPRTPALVRGCHLEGVAGHKEAHILRVLPGHSAGPRTVTVKVEL
       : .  .  ...   :.    :  ..:: . .   ..:.::....  .:    .  : . .
XP_006 CNIGKNFLSLNYLAEYLQ--PKAAEGCVMSSQPQNEEVHIIELITPNSNPYSAFQVDITI
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pF1KE1 SCAPG--DLDAV----LILQGPPYVSWLI---DANHNMQIWTTGEYSFKIFPEKNIRGFK
       .  :.  ::..:    :::.    :.:.:   :.. ...: . .  .:    :...   :
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pF1KE1 L--PDTP--QGLLGEARMLNA-SIVASFVELPLASIVSL----HASSCGG----------
           : :  :: : .  . :. : ..:..  :.:.   :    .:   :           
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pF1KE1 RLQTSPA--P-IQTTP---------------------------------PKDTCSP--EL
       :.  .:.  : .:. :                                 :::   :  .:
XP_006 RILLDPGALPALQNPPIRGGEGQNGGLPFPFPDISRRVWNEEGEDGLPRPKDPVIPSIQL
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pF1KE1 LMSL-------------IQTKCADDAMTLVLKKELVAHLKCTITGLTFWDPSCEAEDRGD
       . .:             ...:: .. : ....:.       .   .:. ::.:.:.  : 
XP_006 FPGLREPEEVQGSVDIALSVKCDNEKMIVAVEKDSFQASGYSGMDVTLLDPTCKAKMNGT
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pF1KE1 KFVLRSAYSSCGMQVSASMIS-----NEAVVNI--LSSSS--PQ----------------
       .:::.:  ..:: .   : ..     :  :...  :..::  :.                
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pF1KE1 ---------RKKVHCLNMD----------------SLSFQLGLYLSPHFLQASN---TIE
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pF1KE1 PGQQSFVQVRVSPSVSEFLLQLDSCHLD--LGPEGGT-VELIQGRAAKGNCVSLLSPS--
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pF1KE1 ----PEGD---PRFSFLLHFYTVPIPKTGTL--SCTVALRPKTGSQDQEVHRTV------
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pF1KE1 -----------------FMR-LNII---------SPDL------SGCTSKGLVLPAVLGI
                        : . : .:         .:..      :    .::   .:.::
XP_006 TSLDASIIWAMMQNKKTFTKPLAVIHHEAESKEKGPSMKEPNPISPPIFHGLDTLTVMGI
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       : :
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      850 




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