FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1417, 586 aa 1>>>pF1KE1417 586 - 586 aa - 586 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8265+/-0.00125; mu= -3.0544+/- 0.075 mean_var=450.9778+/-94.433, 0's: 0 Z-trim(112.6): 102 B-trim: 130 in 1/52 Lambda= 0.060394 statistics sampled from 13214 (13302) to 13214 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.409), width: 16 Scan time: 4.050 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5258.1 EZR gene_id:7430|Hs108|chr6 ( 586) 3848 350.0 4.7e-96 CCDS8343.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 583) 3048 280.3 4.5e-75 CCDS58174.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 604) 3048 280.4 4.6e-75 CCDS14382.1 MSN gene_id:4478|Hs108|chrX ( 577) 2484 231.2 2.8e-60 CCDS58172.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 447) 2133 200.5 3.8e-51 CCDS13861.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 595) 1680 161.2 3.5e-39 CCDS13862.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 590) 1653 158.8 1.8e-38 CCDS13863.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 548) 1431 139.4 1.1e-32 CCDS13865.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 507) 1266 125.0 2.3e-28 CCDS13864.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 549) 1262 124.7 3e-28 CCDS58171.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 257) 976 99.4 5.9e-21 CCDS58173.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 200) 587 65.4 8e-11 >>CCDS5258.1 EZR gene_id:7430|Hs108|chr6 (586 aa) initn: 3848 init1: 3848 opt: 3848 Z-score: 1837.9 bits: 350.0 E(32554): 4.7e-96 Smith-Waterman score: 3848; 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CCDS83 ARDETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM 540 550 560 570 580 >>CCDS58174.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 (604 aa) initn: 3083 init1: 2643 opt: 3048 Z-score: 1461.1 bits: 280.4 E(32554): 4.6e-75 Smith-Waterman score: 3048; 76.3% identity (92.8% similar) in 586 aa overlap (1-586:1-583) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLHYVDNKGFPTWLK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::.:::.::. :::: CCDS58 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 LDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQVKEGILSDEIYCPPE :.:::. :.:.:::::::::::::.::::.:::::.:::.::::::::.::.:::::::: CCDS58 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 TAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHR :::::.:::::::.::::::.:: :::...::.::::..:::::..:::.::: :: ::: CCDS58 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 GMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGF :::....:.:::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::.:::::::::: CCDS58 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::: CCDS58 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 EVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKK :::::::::::::::::::: :::.:::.:: .:.:::.. ::::::: ::.. ::.: : CCDS58 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 AERELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRMAALRAKEELERQAVDQIKSQEQLAAE :..:: :: ..::.:..:::::.::::::: .: :: .:: . .::.::.:.::::::: CCDS58 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 LAEYTAKIALLEEARRRKEDEVEEWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPPPVYEP :::.::::::::::...::.:. ::::.: ::.:: ::::::. ::.:::::::: : CCDS58 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 VSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQ . . .. ....:: :::::.::. . :.::.:.::..:::::..:: .:::::.: CCDS58 PTENEHDEHDENNAEA---SAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQ 490 500 510 520 530 550 560 570 580 pF1KE1 ARDENKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAL ::::.:.:.::..: ::.. :::::::::::::::::::::::::. CCDS58 ARDETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAMWGPKLYALFQMRSC 540 550 560 570 580 590 CCDS58 QSSIKQM 600 >>CCDS14382.1 MSN gene_id:4478|Hs108|chrX (577 aa) initn: 3001 init1: 2457 opt: 2484 Z-score: 1195.7 bits: 231.2 E(32554): 2.8e-60 Smith-Waterman score: 2852; 73.6% identity (90.1% similar) in 587 aa overlap (1-586:1-577) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLHYVDNKGFPTWLK ::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: :.::: :::: CCDS14 MPKTISVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 LDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQVKEGILSDEIYCPPE :.:::.::.::::.:: ::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.:.:::::: CCDS14 LNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 TAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHR :::::.:::::.:.::.::::::::::....:.::::..::::..::::.:::::: ::: CCDS14 TAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 GMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGF :::...:.::::::::::::::.::: ::::::..::::::::::::::..:.::::::: CCDS14 GMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::: CCDS14 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 EVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKK :::::::::::::::::.:: .::.:::.:: .:.:::.. ::::::: ::.. ::.::: CCDS14 EVQQMKAQAREEKHQKQMERAMLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 AERELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRMAALRAKEELERQAVDQIKSQEQLAAE :..:: :: .:::.::.:::::: :::.: .:. : .::: : . . :: :.::::: : CCDS14 AQQELEEQTRRALELEQERKRAQSEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASRDQKKTQEQLALE 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 LAEYTAKIALLEEARRRKEDEVEEWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPPPVYEP .:: ::.:. :: ::..::.:. :::..:. .:.:: ::. ::. .:..: : :: CCDS14 MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTP-----HVAEP 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 pF1KE1 VSYHVQESLQDE-GAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELS . . .: ::: ::: ::.: .... ::.::.: ::::::::::..: .:.:::. CCDS14 AENEQDE--QDENGAEA---SADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELA 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE1 QARDENKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAL .::::.:.: ::.:: :::: ::::::::::::::::::::::::.. CCDS14 NARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM 540 550 560 570 >>CCDS58172.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 (447 aa) initn: 2168 init1: 1728 opt: 2133 Z-score: 1031.7 bits: 200.5 E(32554): 3.8e-51 Smith-Waterman score: 2133; 73.5% identity (90.9% similar) in 430 aa overlap (157-586:21-447) 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 SYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLKDN :..:::::..:::.::: :: ::::::... CCDS58 MLSWNLPFSPIQLANNFLTSVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHRGMLRED 10 20 30 40 50 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 AMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIR .:.:::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::: CCDS58 SMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGFPWSEIR 60 70 80 90 100 110 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 NISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMK ::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::: CCDS58 NISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMK 120 130 140 150 160 170 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 AQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKKAERELS :::::::::::::: :::.:::.:: .:.:::.. ::::::: ::.. ::.: ::..:: CCDS58 AQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIKAQKELE 180 190 200 210 220 230 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 EQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRMAALRAKEELERQAVDQIKSQEQLAAELAEYTA :: ..::.:..:::::.::::::: .: :: .:: . .::.::.:.::::::::::.:: CCDS58 EQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAELAEFTA 240 250 260 270 280 290 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 KIALLEEARRRKEDEVEEWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPPPVYEPVSYHVQ ::::::::...::.:. ::::.: ::.:: ::::::. ::.:::::::: : . . . CCDS58 KIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIPPTENEH 300 310 320 330 340 350 490 500 510 520 530 540 pF1KE1 ESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENK . ....:: :::::.::. . :.::.:.::..:::::..:: .:::::.:::::.: CCDS58 DEHDENNAEA---SAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARDETK 360 370 380 390 400 550 560 570 580 pF1KE1 RTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAL .:.::..: ::.. :::::::::::::::::::::::::. CCDS58 KTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM 410 420 430 440 >>CCDS13861.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 (595 aa) initn: 1604 init1: 1302 opt: 1680 Z-score: 816.9 bits: 161.2 E(32554): 3.5e-39 Smith-Waterman score: 1680; 46.4% identity (73.7% similar) in 593 aa overlap (2-586:19-595) 10 20 30 40 pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVW :: ..::..:::::.:: . . ::.::: : .:.::::.: CCDS13 MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEMKWKGKDLFDLVCRTLGLRETW 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 YFGLHYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFF .:::.:. : .:::.:::: ..: ::.:. :.: ::::::.. :::.:.:::.::: CCDS13 FFGLQYT-IKDTVAWLKMDKKVLDHDVSKEEPVTFHFLAKFYPENAEEELVQEITQHLFF 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 LQVKEGILSDEIYCPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKL ::::. ::...::::::..:::.:::::::.:::. ::: :.:..:.:.:.::.. ... CCDS13 LQVKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLAQEELLPKRVINLYQM 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 TRDQWEDRIQVWHAEHRGMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDAL : ..::.:: .:.::::: .:.: .:::::::::::::.::: :.:::::.: :::::: CCDS13 TPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDAL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 GLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQL ::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : : . .::.:: :::: CCDS13 GLHIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFKFNSSKLRVNKLILQL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 CMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMRE :.:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:::.: ::. :: .:: .... :. CCDS13 CIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERR 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 KEELMLRLQDYEEKTKKAERELSEQIQRALQLEEERKR-AQEEAE-RLEADRMAALRAKE .. . .: ..:. . ..: ::: : ::. :: . : .:. : . CCDS13 LLQMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIKATAIRT 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KE1 ELERQAVDQ-IKSQEQLAAELAEYTAKIALLEEARRRKED--EVEEWQHRAKEAQDDLVK : :.. ..: . : :: ..:: . . : .:: . :.: :..: ..:::. . . CCDS13 EEEKRLMEQKVLEAEVLALKMAEESERRA--KEADQLKQDLQEAREAERRAKQKLLE-IA 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 TKEELHLVMTAPPPPPP--PVYEPVSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEK :: . : : :: : .. .. .. ...: . .:: : :.. CCDS13 TKPTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMK------RLSME------IEKE 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 RITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENKRTHNDIIHNENM-RQGRDKYKTLRQIRQGN .. ::....:.:: :..:. . ....: ::.:::: : : .:..:.... . CCDS13 KVEYMEKSKHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTIKKLTLQS 530 540 550 560 570 580 580 pF1KE1 TKQRIDEFEAL .:.:. :: : CCDS13 AKSRVAFFEEL 590 >>CCDS13862.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 (590 aa) initn: 1604 init1: 1302 opt: 1653 Z-score: 804.3 bits: 158.8 E(32554): 1.8e-38 Smith-Waterman score: 1653; 46.7% identity (73.9% similar) in 582 aa overlap (2-574:19-584) 10 20 30 40 pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVW :: ..::..:::::.:: . . ::.::: : .:.::::.: CCDS13 MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEMKWKGKDLFDLVCRTLGLRETW 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 YFGLHYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFF .:::.:. : .:::.:::: ..: ::.:. :.: ::::::.. :::.:.:::.::: CCDS13 FFGLQYT-IKDTVAWLKMDKKVLDHDVSKEEPVTFHFLAKFYPENAEEELVQEITQHLFF 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 LQVKEGILSDEIYCPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKL ::::. ::...::::::..:::.:::::::.:::. ::: :.:..:.:.:.::.. ... CCDS13 LQVKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLAQEELLPKRVINLYQM 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 TRDQWEDRIQVWHAEHRGMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDAL : ..::.:: .:.::::: .:.: .:::::::::::::.::: :.:::::.: :::::: CCDS13 TPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDAL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 GLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQL ::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : : . .::.:: :::: CCDS13 GLHIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFKFNSSKLRVNKLILQL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 CMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMRE :.:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:::.: ::. :: .:: .... :. CCDS13 CIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERR 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 KEELMLRLQDYEEKTKKAERELSEQIQRALQLEEERKR-AQEEAE-RLEADRMAALRAKE .. . .: ..:. . ..: ::: : ::. :: . : .:. : . CCDS13 LLQMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIKATAIRT 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KE1 ELERQAVDQ-IKSQEQLAAELAEYTAKIALLEEARRRKED--EVEEWQHRAKEAQDDLVK : :.. ..: . : :: ..:: . . : .:: . :.: :..: ..:::. . . CCDS13 EEEKRLMEQKVLEAEVLALKMAEESERRA--KEADQLKQDLQEAREAERRAKQKLLE-IA 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 TKEELHLVMTAPPPPPP--PVYEPVSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEK :: . : : :: : .. .. .. ...: . .:: : :.. CCDS13 TKPTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMK------RLSME------IEKE 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 RITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENKRTHNDIIHNENM-RQGRDKYKTLRQIR-QG .. ::....:.:: :..:. . ....: ::.:::: : : .:..:... . :: CCDS13 KVEYMEKSKHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTIKKPQAQG 530 540 550 560 570 580 580 pF1KE1 NTKQRIDEFEAL CCDS13 RRPICI 590 >>CCDS13863.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 (548 aa) initn: 1441 init1: 1253 opt: 1431 Z-score: 700.1 bits: 139.4 E(32554): 1.1e-32 Smith-Waterman score: 1431; 45.3% identity (73.3% similar) in 525 aa overlap (59-574:33-542) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 LFDQVVKTIGLREVWYFGLHYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPED .... .: ..: ::.:. :.: ::::::. CCDS13 GAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEVLDHDVSKEEPVTFHFLAKFYPEN 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE1 VAEELIQDITQKLFFLQVKEGILSDEIYCPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLS . :::.:.:::.:::::::. ::...::::::..:::.:::::::.:::. ::: :.:. CCDS13 AEEELVQEITQHLFFLQVKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLA 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 SERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEI .:.:.:.::.. ...: ..::.:: .:.::::: .:.: .:::::::::::::.::: : CCDS13 QEELLPKRVINLYQMTPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAI 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 KNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFV .:::::.: ::::::::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : CCDS13 RNKKGTELLLGVDALGLHIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFK 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 FYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKK : . .::.:: :::::.:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:::.: ::. CCDS13 FNSSKLRVNKLILQLCIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQ 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 RRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKKAERELSEQIQRALQLEEERKR-AQEEAE :: .:: .... :. .. . .: ..:. . ..: ::: : ::. :: CCDS13 MREEAERTRDELERRLLQMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAE 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 -RLEADRMAALRAKEELERQAVDQ-IKSQEQLAAELAEYTAKIALLEEARRRKED--EVE . : .:. : . : :.. ..: . : :: ..:: . . : .:: . :.: :.. CCDS13 AEQEMQRIKATAIRTEEEKRLMEQKVLEAEVLALKMAEESERRA--KEADQLKQDLQEAR 370 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KE1 EWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPP--PVYEPVSYHVQESLQDEGAEPTGYSA : ..:::. . . :: . : : :: : .. .. .. ...: . CCDS13 EAERRAKQKLLE-IATKPTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMK------ 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KE1 ELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENKRTHNDIIHNENM-RQ .:: : :.... ::....:.:: :..:. . ....: ::.:::: : CCDS13 RLSME------IEKEKVEYMEKSKHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRG 480 490 500 510 520 570 580 pF1KE1 GRDKYKTLRQIR-QGNTKQRIDEFEAL : .:..:... . :: CCDS13 GSSKHNTIKKPQAQGRRPICI 530 540 >>CCDS13865.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 (507 aa) initn: 1277 init1: 1089 opt: 1266 Z-score: 622.8 bits: 125.0 E(32554): 2.3e-28 Smith-Waterman score: 1266; 42.5% identity (70.9% similar) in 508 aa overlap (76-574:9-501) 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 GLHYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQ ..:. . :. . ... .. : . CCDS13 MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCE 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 VKEGILSDEIYCPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTR ::. ::...::::::..:::.:::::::.:::. ::: :.:..:.:.:.::.. ...: CCDS13 VKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLAQEELLPKRVINLYQMTP 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 DQWEDRIQVWHAEHRGMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGL ..::.:: .:.::::: .:.: .:::::::::::::.::: :.:::::.: :::::::: CCDS13 EMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDALGL 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 NIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCM .::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : : . .::.:: :::::. CCDS13 HIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFKFNSSKLRVNKLILQLCI 160 170 180 190 200 210 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 GNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKE :::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:::.: ::. :: .:: .... :. CCDS13 GNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERRLL 220 230 240 250 260 270 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 ELMLRLQDYEEKTKKAERELSEQIQRALQLEEERKR-AQEEAE-RLEADRMAALRAKEEL .. . .: ..:. . ..: ::: : ::. :: . : .:. : . : CCDS13 QMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIKATAIRTEE 280 290 300 310 320 330 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 ERQAVDQ-IKSQEQLAAELAEYTAKIALLEEARRRKED--EVEEWQHRAKEAQDDLVKTK :.. ..: . : :: ..:: . . : .:: . :.: :..: ..:::. . . :: CCDS13 EKRLMEQKVLEAEVLALKMAEESERRA--KEADQLKQDLQEAREAERRAKQKLLE-IATK 340 350 360 370 380 390 470 480 490 500 510 pF1KE1 EELHLVMTAPPPPPP--PVYEPVSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRI . : : :: : .. .. .. ...: . .:: : :.... CCDS13 PTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMK------RLSME------IEKEKV 400 410 420 430 440 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 TEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENKRTHNDIIHNENM-RQGRDKYKTLRQIR-QGNT ::....:.:: :..:. . ....: ::.:::: : : .:..:... . :: CCDS13 EYMEKSKHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTIKKPQAQGRR 450 460 470 480 490 500 580 pF1KE1 KQRIDEFEAL CCDS13 PICI >>CCDS13864.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 (549 aa) initn: 1391 init1: 1089 opt: 1262 Z-score: 620.5 bits: 124.7 E(32554): 3e-28 Smith-Waterman score: 1396; 42.4% identity (67.9% similar) in 582 aa overlap (2-574:19-543) 10 20 30 40 pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVW :: ..::..:::::.:: . . ::.::: : .:.::::.: CCDS13 MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEMKWKGKDLFDLVCRTLGLRETW 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 YFGLHYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFF .:::.:. : .:::.::::. : CCDS13 FFGLQYT-IKDTVAWLKMDKKVKKQ----------------------------------- 70 80 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 LQVKEGILSDEIYCPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKL ::...::::::..:::.:::::::.:::. ::: :.:..:.:.:.::.. ... CCDS13 ------ILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLAQEELLPKRVINLYQM 90 100 110 120 130 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 TRDQWEDRIQVWHAEHRGMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDAL : ..::.:: .:.::::: .:.: .:::::::::::::.::: :.:::::.: :::::: CCDS13 TPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDAL 140 150 160 170 180 190 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 GLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQL ::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : : . .::.:: :::: CCDS13 GLHIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFKFNSSKLRVNKLILQL 200 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 CMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMRE :.:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:::.: ::. :: .:: .... :. CCDS13 CIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERR 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 KEELMLRLQDYEEKTKKAERELSEQIQRALQLEEERKR-AQEEAE-RLEADRMAALRAKE .. . .: ..:. . ..: ::: : ::. :: . : .:. : . CCDS13 LLQMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIKATAIRT 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 pF1KE1 ELERQAVDQ-IKSQEQLAAELAEYTAKIALLEEARRRKED--EVEEWQHRAKEAQDDLVK : :.. ..: . : :: ..:: . . : .:: . :.: :..: ..:::. . . CCDS13 EEEKRLMEQKVLEAEVLALKMAEESERRA--KEADQLKQDLQEAREAERRAKQKLLE-IA 380 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 TKEELHLVMTAPPPPPP--PVYEPVSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEK :: . : : :: : .. .. .. ...: . .:: : :.. 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