Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4419
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4419, 432 aa
  1>>>pF1KE4419 432 - 432 aa - 432 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2577+/-0.00102; mu= 17.0103+/- 0.061
 mean_var=61.1233+/-12.413, 0's: 0 Z-trim(102.0): 36  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.164048
 statistics sampled from 6719 (6737) to 6719 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.207), width:  16
 Scan time:  2.210

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13233.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20           ( 432) 2890 693.0 1.5e-199
CCDS54457.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20           ( 404) 2706 649.5 1.8e-186
CCDS55620.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1        ( 483) 1489 361.5   1e-99
CCDS818.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1          ( 530) 1489 361.5 1.1e-99
CCDS47707.2 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7        ( 508) 1479 359.1 5.6e-99
CCDS47708.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7        ( 508) 1479 359.1 5.6e-99
CCDS47706.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7        ( 610) 1479 359.1 6.6e-99
CCDS5812.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7         ( 611) 1479 359.1 6.6e-99


>>CCDS13233.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20                (432 aa)
 initn: 2890 init1: 2890 opt: 2890  Z-score: 3696.2  bits: 693.0 E(32554): 1.5e-199
Smith-Waterman score: 2890; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMRERYSASKPLKGARIAGCLHMTVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMRERYSASKPLKGARIAGCLHMTVET
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 AVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 KDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTTGCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTTGCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 HFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRIILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRIILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 SFTNQVMAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SFTNQVMAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMS
              370       380       390       400       410       420

              430  
pF1KE4 CDGPFKPDHYRY
       ::::::::::::
CCDS13 CDGPFKPDHYRY
              430  

>>CCDS54457.1 AHCY gene_id:191|Hs108|chr20                (404 aa)
 initn: 2706 init1: 2706 opt: 2706  Z-score: 3461.3  bits: 649.5 E(32554): 1.8e-186
Smith-Waterman score: 2706; 100.0% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (29-432:1-404)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMRERYSASKPLKGARIAGCLHMTVET
                                   ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54                             MPGLMRMRERYSASKPLKGARIAGCLHMTVET
                                           10        20        30  

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 AVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAGIPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYF
             40        50        60        70        80        90  

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 KDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEETTTGVHNLYKMMANGILKVPAINV
            100       110       120       130       140       150  

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 NDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVAVVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVI
            160       170       180       190       200       210  

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTTGCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTTGCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIG
            220       230       240       250       260       270  

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 HFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRIILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRIILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSN
            280       290       300       310       320       330  

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 SFTNQVMAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SFTNQVMAQIELWTHPDKYPVGVHFLPKKLDEAVAEAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMS
            340       350       360       370       380       390  

              430  
pF1KE4 CDGPFKPDHYRY
       ::::::::::::
CCDS54 CDGPFKPDHYRY
            400    

>>CCDS55620.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1             (483 aa)
 initn: 1409 init1: 1409 opt: 1489  Z-score: 1903.5  bits: 361.5 E(32554): 1e-99
Smith-Waterman score: 1489; 50.8% identity (79.9% similar) in 427 aa overlap (7-432:58-483)

                                       10        20        30      
pF1KE4                         MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMR
                                     . : .:  : .::. ..:::..: .:. .:
CCDS55 YSSAASYTDSSDDEVSPREKQQTNSKGSSNFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQDMSALISLR
        30        40        50        60        70        80       

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE4 ERYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAG
       .: .. ::: ::.:.:: :.:..:::::::: .:::. .::.:::.:::...:::.:.::
CCDS55 KRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLIETLCALGAQCRWSACNIYSTQNEVAAALAEAG
        90       100       110       120       130       140       

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE4 IPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEE
       . :.:::::..... :::.. . .     :::::::::::. .. :::...  :::: ::
CCDS55 VAVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNMDGWQANMILDDGGDLTHWVYKKYPNVFKKIRGIVEE
       150       160       170       180       190       200       

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE4 TTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVA
       ..:::: ::..   : : :::.::::::::.:::::: ::::..::.::.::::..:: .
CCDS55 SVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDVMFGGKQV
       210       220       230       240       250       260       

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE4 VVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTT
       :: :::.:::::  ::...:: : ::::::: :::: :.:..:. ..:. .. .. .: :
CCDS55 VVCGYGEVGKGCCAALKALGAIVYITEIDPICALQACMDGFRVVKLNEVIRQVDVVITCT
       270       280       290       300       310       320       

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE4 GCIDIILGRHFEQMKDDAIVCNIGHFDVEIDVKWLNENAVEKVNIKPQVDRYRLKNGRRI
       :  ...  .:...::.. ::::.:: ..::::  :    .    .. :::.    .:.:.
CCDS55 GNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVTSLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRV
       330       340       350       360       370       380       

        340       350       360       370        380       390     
pF1KE4 ILLAEGRLVNLGCAMGHPSFVMSNSFTNQVMAQIELWTHPD-KYPVGVHFLPKKLDEAVA
       .:::::::.::.:.   :.::.: . :.:..: :::.. :. .:   :..::::.:: ::
CCDS55 VLLAEGRLLNLSCSTV-PTFVLSITATTQALALIELYNAPEGRYKQDVYLLPKKMDEYVA
       390       400        410       420       430       440      

         400       410       420       430  
pF1KE4 EAHLGKLNVKLTKLTEKQAQYLGMSCDGPFKPDHYRY
         :: .....::.::. ::.:::.. .:::::..:::
CCDS55 SLHLPSFDAHLTELTDDQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
        450       460       470       480   

>>CCDS818.1 AHCYL1 gene_id:10768|Hs108|chr1               (530 aa)
 initn: 1409 init1: 1409 opt: 1489  Z-score: 1902.9  bits: 361.5 E(32554): 1.1e-99
Smith-Waterman score: 1489; 50.8% identity (79.9% similar) in 427 aa overlap (7-432:105-530)

                                       10        20        30      
pF1KE4                         MSDKLPYKVADIGLAAWGRKALDIAENEMPGLMRMR
                                     . : .:  : .::. ..:::..: .:. .:
CCDS81 YSSAASYTDSSDDEVSPREKQQTNSKGSSNFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQDMSALISLR
           80        90       100       110       120       130    

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE4 ERYSASKPLKGARIAGCLHMTVETAVLIETLVTLGAEVQWSSCNIFSTQDHAAAAIAKAG
       .: .. ::: ::.:.:: :.:..:::::::: .:::. .::.:::.:::...:::.:.::
CCDS81 KRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLIETLCALGAQCRWSACNIYSTQNEVAAALAEAG
          140       150       160       170       180       190    

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE4 IPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEE
       . :.:::::..... :::.. . .     :::::::::::. .. :::...  :::: ::
CCDS81 VAVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNMDGWQANMILDDGGDLTHWVYKKYPNVFKKIRGIVEE
          200       210       220       230       240       250    

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE4 TTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVA
       ..:::: ::..   : : :::.::::::::.:::::: ::::..::.::.::::..:: .
CCDS81 SVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDVMFGGKQV
          260       270       280       290       300       310    

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE4 VVAGYGDVGKGCAQALRGFGARVIITEIDPINALQAAMEGYEVTTMDEACQEGNIFVTTT
       :: :::.:::::  ::...:: : ::::::: :::: :.:..:. ..:. .. .. .: :
CCDS81 VVCGYGEVGKGCCAALKALGAIVYITEIDPICALQACMDGFRVVKLNEVIRQVDVVITCT
          320       330       340       350       360       370    

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CCDS47 SLHLPTFDAHLTELTDEQAKYLGLNKNGPFKPNYYRY
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>>CCDS5812.1 AHCYL2 gene_id:23382|Hs108|chr7              (611 aa)
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pF1KE4 IPVYAWKGETDEEYLWCIEQTLYFKDGPLNMILDDGGDLTNLIHTKYPQLLPGIRGISEE
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CCDS58 FPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEE
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pF1KE4 TTTGVHNLYKMMANGILKVPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLIDGIKRATDVMIAGKVA
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CCDS58 SVTGVHRLYQLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQV
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