Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4576
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4576, 763 aa
  1>>>pF1KE4576 763 - 763 aa - 763 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0129+/-0.00103; mu= 15.9776+/- 0.061
 mean_var=66.1997+/-13.196, 0's: 0 Z-trim(103.4): 34  B-trim: 6 in 1/48
 Lambda= 0.157633
 statistics sampled from 7367 (7401) to 7367 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.227), width:  16
 Scan time:  2.060

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1721.1 HADHA gene_id:3030|Hs108|chr2           ( 763) 4923 1129.0       0
CCDS3678.1 HADH gene_id:3033|Hs108|chr4            ( 314)  552 134.9 1.9e-31
CCDS54694.1 EHHADH gene_id:1962|Hs108|chr3         ( 627)  484 119.5 1.7e-26
CCDS33901.1 EHHADH gene_id:1962|Hs108|chr3         ( 723)  484 119.5 1.9e-26
CCDS82943.1 HADH gene_id:3033|Hs108|chr4           ( 318)  464 114.9 2.1e-25
CCDS54790.1 HADH gene_id:3033|Hs108|chr4           ( 331)  441 109.6 8.1e-24
CCDS6689.1 AUH gene_id:549|Hs108|chr9              ( 339)  378 95.3 1.7e-19
CCDS55600.1 ECHDC2 gene_id:55268|Hs108|chr1        ( 292)  371 93.7 4.5e-19
CCDS7681.1 ECHS1 gene_id:1892|Hs108|chr10          ( 290)  333 85.1 1.8e-16
CCDS78409.1 AUH gene_id:549|Hs108|chr9             ( 310)  272 71.2 2.8e-12
CCDS10464.1 ECI1 gene_id:1632|Hs108|chr16          ( 302)  259 68.2 2.1e-11


>>CCDS1721.1 HADHA gene_id:3030|Hs108|chr2                (763 aa)
 initn: 4923 init1: 4923 opt: 4923  Z-score: 6043.5  bits: 1129.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4923; 100.0% identity (100.0% similar) in 763 aa overlap (1-763:1-763)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MVACRAIGILSRFSAFRILRSRGYICRNFTGSSALLTRTHINYGVKGDVAVVRINSPNSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MVACRAIGILSRFSAFRILRSRGYICRNFTGSSALLTRTHINYGVKGDVAVVRINSPNSK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 VNTLSKELHSEFSEVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAACKTLQEVTQLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VNTLSKELHSEFSEVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAACKTLQEVTQLS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 QEAQRIVEKLEKSTKPIVAAINGSCLGGGLEVAISCQYRIATKDRKTVLGTPEVLLGALP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 QEAQRIVEKLEKSTKPIVAAINGSCLGGGLEVAISCQYRIATKDRKTVLGTPEVLLGALP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 GAGGTQRLPKMVGVPAALDMMLTGRSIRADRAKKMGLVDQLVEPLGPGLKPPEERTIEYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GAGGTQRLPKMVGVPAALDMMLTGRSIRADRAKKMGLVDQLVEPLGPGLKPPEERTIEYL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 EEVAITFAKGLADKKISPKRDKGLVEKLTAYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVRKQTKGLYPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EEVAITFAKGLADKKISPKRDKGLVEKLTAYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVRKQTKGLYPA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 PLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLCESQKFGELVMTKESKALMGLYHGQVLCKKNKFGAPQKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLCESQKFGELVMTKESKALMGLYHGQVLCKKNKFGAPQKD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 VKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTILKDATLTALDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTILKDATLTALDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 ERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLSLKHRVLKEVEAVIPDHCIFASNTSALP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLSLKHRVLKEVEAVIPDHCIFASNTSALP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 ISEIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTSASAVAVGLKQGKVIIVVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ISEIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTSASAVAVGLKQGKVIIVVK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 DGPGFYTTRCLAPMMSEVIRILQEGVDPKKLDSLTTSFGFPVGAATLVDEVGVDVAKHVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 DGPGFYTTRCLAPMMSEVIRILQEGVDPKKLDSLTTSFGFPVGAATLVDEVGVDVAKHVA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 EDLGKVFGERFGGGNPELLTQMVSKGFLGRKSGKGFYIYQEGVKRKDLNSDMDSILASLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EDLGKVFGERFGGGNPELLTQMVSKGFLGRKSGKGFYIYQEGVKRKDLNSDMDSILASLK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 LPPKSEVSSDEDIQFRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LPPKSEVSSDEDIQFRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRF
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760   
pF1KE4 VDLYGAQKIVDRLKKYEAAYGKQFTPCQLLADHANSPNKKFYQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VDLYGAQKIVDRLKKYEAAYGKQFTPCQLLADHANSPNKKFYQ
              730       740       750       760   

>>CCDS3678.1 HADH gene_id:3033|Hs108|chr4                 (314 aa)
 initn: 380 init1: 252 opt: 552  Z-score: 677.9  bits: 134.9 E(32554): 1.9e-31
Smith-Waterman score: 552; 33.9% identity (66.4% similar) in 289 aa overlap (361-640:27-314)

              340       350       360       370       380       390
pF1KE4 VMTKESKALMGLYHGQVLCKKNKFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTILK
                                     :::....:.::::::::::..  :  ..: 
CCDS36     MAFVTRQFMRSVSSSSTASASAKKIIVKHVTVIGGGLMGAGIAQVAAATGHTVVLV
                   10        20        30        40        50      

              400       410       420            430        440    
pF1KE4 DATLTALDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIF-----SNLTGQLDYQGF-EKADMV
       : :   : .... . ..:   .:::   ...  . :     :... . :  .  ...:.:
CCDS36 DQTEDILAKSKKGIEESLRKVAKKKFAENLKAGDEFVEKTLSTIATSTDAASVVHSTDLV
         60        70        80        90       100       110      

          450       460       470       480       490       500    
pF1KE4 IEAVFEDLSLKHRVLKEVEAVIPDHCIFASNTSALPISEIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVD
       .::. :.:..:....:...    .: :::::::.: :. :: .. : ..  :.:.:.:: 
CCDS36 VEAIVENLKVKNELFKRLDKFAAEHTIFASNTSSLQITSIANATTRQDRFAGLHFFNPVP
        120       130       140       150       160       170      

          510       520       530       540       550       560    
pF1KE4 KMQLLEIITTEKTSKDTSASAVAVGLKQGKVIIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVIRILQE
        :.:.:.: :  ::. :  : :  .   ::  .  :: ::: ..: :.:.. :.::. ..
CCDS36 VMKLVEVIKTPMTSQKTFESLVDFSKALGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYER
        180       190       200       210       220       230      

          570          580       590       600       610       620 
pF1KE4 GVDPKKLD---SLTTSFGFPVGAATLVDEVGVDVAKHVAEDLGKVFGERFGGGNPELLTQ
       : : .: :   ..  . :.:.:   :.: ::.:..: ...   .. .:         :..
CCDS36 G-DASKEDIDTAMKLGAGYPMGPFELLDYVGLDTTKFIVDGWHEMDAENPLHQPSPSLNK
         240       250       260       270       280       290     

             630       640       650       660       670       680 
pF1KE4 MVSKGFLGRKSGKGFYIYQEGVKRKDLNSDMDSILASLKLPPKSEVSSDEDIQFRLVTRF
       .:... .:.:.:.::: :.                                         
CCDS36 LVAENKFGKKTGEGFYKYK                                         
         300       310                                             

>>CCDS54694.1 EHHADH gene_id:1962|Hs108|chr3              (627 aa)
 initn: 783 init1: 385 opt: 484  Z-score: 589.2  bits: 119.5 E(32554): 1.7e-26
Smith-Waterman score: 902; 30.3% identity (61.1% similar) in 647 aa overlap (146-761:3-616)

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE4 VTQLSQEAQRIVEKLEKSTKPIVAAINGSCLGGGLEVAISCQYRIATKDRKTVLGTPEVL
                                     .:::::.:..:.::::  . .  .: ::: 
CCDS54                             MAFGGGLELALGCHYRIAHAEAQ--VGLPEVT
                                           10        20          30

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE4 LGALPGAGGTQRLPKMVGVPAALDMMLTGRSIRADRAKKMGLVDQLVEPLGPGLKPPEER
       :: :::: ::: ::...:::::::.. .:: : ::.: :.:..:..:.       : :: 
CCDS54 LGLLPGARGTQLLPRLTGVPAALDLITSGRRILADEALKLGILDKVVNS-----DPVEE-
               40        50        60        70             80     

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE4 TIEYLEEVAITFAKGLADKKISPKRDKGLVEKLTAYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVRKQTK
               :: ::. ..:. .  .:   : .:     ...: . .......  :.:.:  
CCDS54 --------AIRFAQRVSDQPLESRR---LCNK---PIQSLPNM-DSIFSEALLKMRRQHP
                   90       100             110        120         

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE4 GLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLCESQKFGELVMTKESKALMGLYHGQVLCKKNKFG
       :   :    . .:.....   ..:   : . :  :... ...::.  . ..   : ::..
CCDS54 GCL-AQEACVRAVQAAVQYPYEVGIKKEEELFLYLLQSGQARALQYAFFAER--KANKWS
     130        140       150       160       170       180        

                  360       370       380       390       400      
pF1KE4 APQ---------KDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTILKDATLTALDRGQQQVFK
       .:.         . :. ....: : :: ::.   .   . .:  :.  . :  ..... .
CCDS54 TPSGASWKTASARPVSSVGVVGLGTMGRGIVISFARARIPVIAVDSDKNQLATANKMITS
        190       200       210       220       230       240      

        410       420       430       440       450       460      
pF1KE4 GLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLSLKHRVLKEVEAVI
        :. ...:   ..   ..    ::...   :   .:.:::::::..:::..:. :. :: 
CCDS54 VLEKEASKMQQSGHPWSGPKPRLTSSVKELG--GVDLVIEAVFEEMSLKKQVFAELSAVC
        250       260       270         280       290       300    

        470       480       490       500       510       520      
pF1KE4 PDHCIFASNTSALPISEIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTSASAV
         . .. .::::: ..:::. . ::. ::: :.:::.  :.:::.: .. .:  : :...
CCDS54 KPEAFLCTNTSALDVDEIASSTDRPHLVIGTHFFSPAHVMKLLEVIPSQYSSPTTIATVM
          310       320       330       340       350       360    

        530       540       550       560       570       580      
pF1KE4 AVGLKQGKVIIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVIRILQEGVDPKKLDSLTTSFGFPVGAAT
        .. :  :. .:: .  ::  .: : :.....  .:.::  :...:..   ::: .:   
CCDS54 NLSKKIKKIGVVVGNCFGFVGNRMLNPYYNQAYFLLEEGSKPEEVDQVLEEFGFKMGPFR
          370       380       390       400       410       420    

        590       600       610                   620       630    
pF1KE4 LVDEVGVDVAKHVAEDLGKVFGERFGG------GN------PELLTQMVSKGFLGRKSGK
       . : .:.::. .  .  : .    . :      ::      :..: ..   : .:.:.::
CCDS54 VSDLAGLDVGWKSRKGQGLTGPTLLPGTPARKRGNRRYCPIPDVLCEL---GRFGQKTGK
          430       440       450       460       470          480 

          640            650       660       670       680         
pF1KE4 GFYIYQEG---VKRKD--LNSDMDSILASLKLPPKSEVSSDEDIQFRLVTRFVNEAVMCL
       :.: :..    ... :  :.. ..    . .. :.. .:.:: .. : .  ..:::   :
CCDS54 GWYQYDKPLGRIHKPDPWLSKFLSRYRKTHHIEPRT-ISQDEILE-RCLYSLINEAFRIL
             490       500       510        520        530         

     690       700       710       720       730         740       
pF1KE4 QEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYGAQKIVDRLKKY--EAAYGKQFTPC
        ::: :.: . :.  . : :.:   :::. ...  :   ....:.::  .     :. : 
CCDS54 GEGIAASPEHIDVVYLHGYGWPRHKGGPMFYASTVGLPTVLEKLQKYYRQNPDIPQLEPS
     540       550       560       570       580       590         

       750          760            
pF1KE4 QLL---ADHANSPNKKFYQ         
       . :   :...: : :..           
CCDS54 DYLKKLASQGNPPLKEWQSLAGSPSSKL
     600       610       620       

>>CCDS33901.1 EHHADH gene_id:1962|Hs108|chr3              (723 aa)
 initn: 847 init1: 385 opt: 484  Z-score: 588.1  bits: 119.5 E(32554): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 1028; 30.2% identity (61.2% similar) in 744 aa overlap (49-761:11-712)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE4 LRSRGYICRNFTGSSALLTRTHINYGVKGDVAVVRINSPNSKVNTLSKELHSEFSEVMNE
                                     .:..:. .:   ::..:  :  ...: ...
CCDS33                     MAEYTRLHNALALIRLRNP--PVNAISTTLLRDIKEGLQK
                                   10          20        30        

       80        90       100       110       120       130        
pF1KE4 IWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAACKTLQEVTQLSQEAQRIVEKLEKSTKPIV
          .  :. :..: .  : : :::::  ..: .:.      .    ..:...... ::.:
CCDS33 AVIDHTIK-AIVICGAEGKFSAGADIRGFSAPRTF------GLTLGHVVDEIQRNEKPVV
       40         50        60        70              80        90 

      140       150       160       170       180       190        
pF1KE4 AAINGSCLGGGLEVAISCQYRIATKDRKTVLGTPEVLLGALPGAGGTQRLPKMVGVPAAL
       :::.:  .:::::.:..:.::::  . .  .: ::: :: :::: ::: ::...::::::
CCDS33 AAIQGMAFGGGLELALGCHYRIAHAEAQ--VGLPEVTLGLLPGARGTQLLPRLTGVPAAL
             100       110         120       130       140         

      200       210       220       230       240       250        
pF1KE4 DMMLTGRSIRADRAKKMGLVDQLVEPLGPGLKPPEERTIEYLEEVAITFAKGLADKKISP
       :.. .:: : ::.: :.:..:..:.       : ::         :: ::. ..:. .  
CCDS33 DLITSGRRILADEALKLGILDKVVNS-----DPVEE---------AIRFAQRVSDQPLES
     150       160       170            180                190     

      260       270       280       290       300       310        
pF1KE4 KRDKGLVEKLTAYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVRKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDA
       .:   : .:     ...: . .......  :.:.:  :   :    . .:.....   ..
CCDS33 RR---LCNK---PIQSLPNM-DSIFSEALLKMRRQHPGCL-AQEACVRAVQAAVQYPYEV
            200           210       220        230       240       

      320       330       340       350                360         
pF1KE4 GYLCESQKFGELVMTKESKALMGLYHGQVLCKKNKFGAPQ---------KDVKHLAILGA
       :   : . :  :... ...::.  . ..   : ::...:.         . :. ....: 
CCDS33 GIKKEEELFLYLLQSGQARALQYAFFAER--KANKWSTPSGASWKTASARPVSSVGVVGL
       250       260       270         280       290       300     

     370       380       390       400       410       420         
pF1KE4 GLMGAGIAQVSVDKGLKTILKDATLTALDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNL
       : :: ::.   .   . .:  :.  . :  ..... . :. ...:   ..   ..    :
CCDS33 GTMGRGIVISFARARIPVIAVDSDKNQLATANKMITSVLEKEASKMQQSGHPWSGPKPRL
         310       320       330       340       350       360     

     430       440       450       460       470       480         
pF1KE4 TGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLSLKHRVLKEVEAVIPDHCIFASNTSALPISEIAAVSK
       :...   :   .:.:::::::..:::..:. :. ::   . .. .::::: ..:::. . 
CCDS33 TSSVKELG--GVDLVIEAVFEEMSLKKQVFAELSAVCKPEAFLCTNTSALDVDEIASSTD
         370         380       390       400       410       420   

     490       500       510       520       530       540         
pF1KE4 RPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKDTSASAVAVGLKQGKVIIVVKDGPGFYTTR
       ::. ::: :.:::.  :.:::.: .. .:  : :... .. :  :. .:: .  ::  .:
CCDS33 RPHLVIGTHFFSPAHVMKLLEVIPSQYSSPTTIATVMNLSKKIKKIGVVVGNCFGFVGNR
           430       440       450       460       470       480   

     550       560       570       580       590       600         
pF1KE4 CLAPMMSEVIRILQEGVDPKKLDSLTTSFGFPVGAATLVDEVGVDVAKHVAEDLGKVFGE
        : :.....  .:.::  :...:..   ::: .:   . : .:.::. .  .  : .   
CCDS33 MLNPYYNQAYFLLEEGSKPEEVDQVLEEFGFKMGPFRVSDLAGLDVGWKSRKGQGLTGPT
           490       500       510       520       530       540   

     610                   620       630       640            650  
pF1KE4 RFGG------GN------PELLTQMVSKGFLGRKSGKGFYIYQEG---VKRKD--LNSDM
        . :      ::      :..: ..   : .:.:.:::.: :..    ... :  :.. .
CCDS33 LLPGTPARKRGNRRYCPIPDVLCEL---GRFGQKTGKGWYQYDKPLGRIHKPDPWLSKFL
           550       560          570       580       590       600

            660       670       680       690       700       710  
pF1KE4 DSILASLKLPPKSEVSSDEDIQFRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPP
       .    . .. :.. .:.:: :  : .  ..:::   : ::: :.: . :.  . : :.: 
CCDS33 SRYRKTHHIEPRT-ISQDE-ILERCLYSLINEAFRILGEGIAASPEHIDVVYLHGYGWPR
              610         620       630       640       650        

            720       730         740       750          760       
pF1KE4 CLGGPFRFVDLYGAQKIVDRLKKY--EAAYGKQFTPCQLL---ADHANSPNKKFYQ    
         :::. ...  :   ....:.::  .     :. : . :   :...: : :..      
CCDS33 HKGGPMFYASTVGLPTVLEKLQKYYRQNPDIPQLEPSDYLKKLASQGNPPLKEWQSLAGS
      660       670       680       690       700       710        

CCDS33 PSSKL
      720   

>>CCDS82943.1 HADH gene_id:3033|Hs108|chr4                (318 aa)
 initn: 309 init1: 252 opt: 464  Z-score: 569.6  bits: 114.9 E(32554): 2.1e-25
Smith-Waterman score: 464; 31.2% identity (64.1% similar) in 276 aa overlap (374-640:44-318)

           350       360       370       380       390       400   
pF1KE4 HGQVLCKKNKFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTILKDATLTALDRGQQQ
                                     : . .:..  :  ..: : :   : .... 
CCDS82 LGVCWRKEHDPAEMLRVGRAELGGWKPSWEAIVKEVAAATGHTVVLVDQTEDILAKSKKG
            20        30        40        50        60        70   

           410       420            430        440       450       
pF1KE4 VFKGLNDKVKKKALTSFERDSIF-----SNLTGQLDYQGF-EKADMVIEAVFEDLSLKHR
       . ..:   .:::   ...  . :     :... . :  .  ...:.:.::. :.:..:..
CCDS82 IEESLRKVAKKKFAENLKAGDEFVEKTLSTIATSTDAASVVHSTDLVVEAIVENLKVKNE
            80        90       100       110       120       130   

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE4 VLKEVEAVIPDHCIFASNTSALPISEIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKT
       ..:...    .: :::::::.: :. :: .. : ..  :.:.:.::  :.:.:.: :  :
CCDS82 LFKRLDKFAAEHTIFASNTSSLQITSIANATTRQDRFAGLHFFNPVPVMKLVEVIKTPMT
           140       150       160       170       180       190   

       520       530       540       550       560       570       
pF1KE4 SKDTSASAVAVGLKQGKVIIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVIRILQEGVDPKKLD---SL
       :. :  : :  .   ::  .  :: ::: ..: :.:.. :.::. ..: : .: :   ..
CCDS82 SQKTFESLVDFSKALGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYERG-DASKEDIDTAM
           200       210       220       230       240        250  

          580       590       600       610       620       630    
pF1KE4 TTSFGFPVGAATLVDEVGVDVAKHVAEDLGKVFGERFGGGNPELLTQMVSKGFLGRKSGK
         . :.:.:   :.: ::.:..: ...   .. .:         :...:... .:.:.:.
CCDS82 KLGAGYPMGPFELLDYVGLDTTKFIVDGWHEMDAENPLHQPSPSLNKLVAENKFGKKTGE
            260       270       280       290       300       310  

          640       650       660       670       680       690    
pF1KE4 GFYIYQEGVKRKDLNSDMDSILASLKLPPKSEVSSDEDIQFRLVTRFVNEAVMCLQEGIL
       ::: :.                                                      
CCDS82 GFYKYK                                                      
                                                                   

>>CCDS54790.1 HADH gene_id:3033|Hs108|chr4                (331 aa)
 initn: 372 init1: 244 opt: 441  Z-score: 541.0  bits: 109.6 E(32554): 8.1e-24
Smith-Waterman score: 513; 32.1% identity (63.3% similar) in 305 aa overlap (361-640:27-331)

              340       350       360       370       380       390
pF1KE4 VMTKESKALMGLYHGQVLCKKNKFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTILK
                                     :::....:.::::::::::..  :  ..: 
CCDS54     MAFVTRQFMRSVSSSSTASASAKKIIVKHVTVIGGGLMGAGIAQVAAATGHTVVLV
                   10        20        30        40        50      

              400       410       420            430        440    
pF1KE4 DATLTALDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIF-----SNLTGQLDYQGF-EKADMV
       : :   : .... . ..:   .:::   ...  . :     :... . :  .  ...:.:
CCDS54 DQTEDILAKSKKGIEESLRKVAKKKFAENLKAGDEFVEKTLSTIATSTDAASVVHSTDLV
         60        70        80        90       100       110      

          450       460       470       480       490       500    
pF1KE4 IEAVFEDLSLKHRVLKEVEAVIPDHCIFASNTSALPISEIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVD
       .::. :.:..:....:...    .: :::::::.: :. :: .. : ..  :.:.:.:: 
CCDS54 VEAIVENLKVKNELFKRLDKFAAEHTIFASNTSSLQITSIANATTRQDRFAGLHFFNPVP
        120       130       140       150       160       170      

          510       520       530       540       550       560    
pF1KE4 KMQLLEIITTEKTSKDTSASAVAVGLKQGKVIIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVIRILQE
        :.:.:.: :  ::. :  : :  .   ::  .  :: ::: ..: :.:.. :.::. ..
CCDS54 VMKLVEVIKTPMTSQKTFESLVDFSKALGKHPVSCKDTPGFIVNRLLVPYLMEAIRLYER
        180       190       200       210       220       230      

                          570          580       590       600     
pF1KE4 ----------GV------DPKKLD---SLTTSFGFPVGAATLVDEVGVDVAKHVAEDLGK
                 :.      : .: :   ..  . :.:.:   :.: ::.:..: ...   .
CCDS54 DFQTCGDSNSGLGFSLKGDASKEDIDTAMKLGAGYPMGPFELLDYVGLDTTKFIVDGWHE
        240       250       260       270       280       290      

         610       620       630       640       650       660     
pF1KE4 VFGERFGGGNPELLTQMVSKGFLGRKSGKGFYIYQEGVKRKDLNSDMDSILASLKLPPKS
       . .:         :...:... .:.:.:.::: :.                         
CCDS54 MDAENPLHQPSPSLNKLVAENKFGKKTGEGFYKYK                         
        300       310       320       330                          

         670       680       690       700       710       720     
pF1KE4 EVSSDEDIQFRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLGGPFRFVDLYG

>>CCDS6689.1 AUH gene_id:549|Hs108|chr9                   (339 aa)
 initn: 356 init1: 133 opt: 378  Z-score: 463.4  bits: 95.3 E(32554): 1.7e-19
Smith-Waterman score: 378; 30.4% identity (63.8% similar) in 260 aa overlap (22-276:65-317)

                        10        20        30        40        50 
pF1KE4          MVACRAIGILSRFSAFRILRSRGYICRNFTGSSALLTRTHINYGVKGDVAV
                                     :::   ..   . : .: :..   .: ..:
CCDS66 RLPGSLAGRRAGPAIWAQGWVPAAGGPAPKRGY-SSEMKTEDELRVR-HLEEENRG-IVV
           40        50        60         70        80          90 

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 VRINSPNSKVNTLSKELHSEFSEVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAACK
       . ::   .: :.:::.: . .:.... . .. ..:. .. :  :: : ::::..  :  .
CCDS66 LGINRAYGK-NSLSKNLIKMLSKAVDALKSDKKVRTIIIRSEVPGIFCAGADLKERAKMS
             100        110       120       130       140       150

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE4 TLQEVTQLSQEAQRIVEKLEKSTKPIVAAINGSCLGGGLEVAISCQYRIATKDRKTVLGT
       . .::  . .. . ... . .   : .:::.:  ::::::.:..:. :.:... :  .: 
CCDS66 S-SEVGPFVSKIRAVINDIANLPVPTIAAIDGLALGGGLELALACDIRVAASSAK--MGL
               160       170       180       190       200         

             180       190       200       210       220           
pF1KE4 PEVLLGALPGAGGTQRLPKMVGVPAALDMMLTGRSIRADRAKKMGLVDQLVEPLGPG---
        :. :. .::.:::::::. .:.  : ......: . . .:: .::.....:    :   
CCDS66 VETKLAIIPGGGGTQRLPRAIGMSLAKELIFSARVLDGKEAKAVGLISHVLEQNQEGDAA
       210       220       230       240       250       260       

      230       240         250       260       270       280      
pF1KE4 LKPPEERTIEYLEE--VAITFAKGLADKKISPKRDKGLVEKLTAYAMTIPFVRQQVYKKV
        .   . . :.: .  ::.  ::   .. .      ::. . . ::.:::          
CCDS66 YRKALDLAREFLPQGPVAMRVAKLAINQGMEVDLVTGLAIEEACYAQTIPTKDRLEGLLA
       270       280       290       300       310       320       

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE4 EEKVRKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLCESQKFGELVMTKESKALMGLYHGQ
                                                                   
CCDS66 FKEKRPPRYKGE                                                
       330                                                         

>>CCDS55600.1 ECHDC2 gene_id:55268|Hs108|chr1             (292 aa)
 initn: 247 init1: 148 opt: 371  Z-score: 455.9  bits: 93.7 E(32554): 4.5e-19
Smith-Waterman score: 371; 29.7% identity (60.4% similar) in 273 aa overlap (9-276:4-270)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MVACRAIGILSRFSAFRILRSRGYICRNFTGSSALLTRTHINYGVKGDVAVVRINSPNSK
               .:  .  .: ::.::    . .:.: . .:.    :    .. . .: :...
CCDS55      MLRVLCLLRPWRPLRARGCASDGAAGGSEIQVRALA--GPDQGITEILMNRPSAR
                    10        20        30          40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 VNTLSKELHSEFSEVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAACKTLQEVTQLS
        :.:.. . ::. :.. ..  . :.:  .. :.  : : ::::..     .   ::  . 
CCDS55 -NALGNVFVSELLETLAQLREDRQVRVLLFRSGVKGVFCAGADLKEREQMSE-AEVGVFV
             60        70        80        90       100        110 

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 QEAQRIVEKLEKSTKPIVAAINGSCLGGGLEVAISCQYRIATKDRKTVLGTPEVLLGALP
       :. . ... .     : .::..:  ::::::.:..:. :.:...  .:.:  :.  : ::
CCDS55 QRLRGLMNDIAAFPAPTIAAMDGFALGGGLELALACDLRVAASS--AVMGLIETTRGLLP
             120       130       140       150         160         

              190       200       210       220       230          
pF1KE4 GAGGTQRLPKMVGVPAALDMMLTGRSIRADRAKKMGLVDQLVEPLGPGLKPPEE-RTI--
       :::::::::. .::  : ....::: . . .:. .:::.. :     :    .. :..  
CCDS55 GAGGTQRLPRCLGVALAKELIFTGRRLSGTEAHVLGLVNHAVAQNEEGDAAYQRARALAQ
     170       180       190       200       210       220         

       240         250       260       270       280       290     
pF1KE4 EYLEE--VAITFAKGLADKKISPKRDKGLVEKLTAYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVRKQTK
       : : .  .:. ..:   :.       .:.. .   ::..::                   
CCDS55 EILPQAPIAVRLGKVAIDRGTEVDIASGMAIEGMCYAQNIPTRDRLEGMAAFREKRTPKF
     230       240       250       260       270       280         

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE4 GLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLCESQKFGELVMTKESKALMGLYHGQVLCKKNKFG
                                                                   
CCDS55 VGK                                                         
     290                                                           

>>CCDS7681.1 ECHS1 gene_id:1892|Hs108|chr10               (290 aa)
 initn: 271 init1: 182 opt: 333  Z-score: 409.3  bits: 85.1 E(32554): 1.8e-16
Smith-Waterman score: 333; 34.2% identity (66.8% similar) in 184 aa overlap (44-225:42-218)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KE4 SAFRILRSRGYICRNFTGSSALLTRTHINYGVKGDVAVVRINSPNSKVNTLSKELHSEFS
                                     : .. :.....: :.. .:.:   : .:..
CCDS76 RGPLRPPVRCPAWRPFASGANFEYIIAEKRGKNNTVGLIQLNRPKA-LNALCDGLIDELN
              20        30        40        50         60        70

            80        90       100       110       120       130   
pF1KE4 EVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAACKTLQEVTQLSQEAQRIVEKLEKS
       ... . .  :   .:.....    : :::::. .   ..:.     :..  .  ..: . 
CCDS76 QAL-KTFEEDPAVGAIVLTGGDKAFAAGADIKEM---QNLSFQDCYSSKFLKHWDHLTQV
                80        90       100          110       120      

           140       150       160       170       180       190   
pF1KE4 TKPIVAAINGSCLGGGLEVAISCQYRIATKDRKTVLGTPEVLLGALPGAGGTQRLPKMVG
        ::..::.::  .::: :.:. :.  :    .:. .. ::.:.:..::::::::: . ::
CCDS76 KKPVIAAVNGYAFGGGCELAMMCD--IIYAGEKAQFAQPEILIGTIPGAGGTQRLTRAVG
        130       140       150         160       170       180    

           200       210       220         230       240       250 
pF1KE4 VPAALDMMLTGRSIRADRAKKMGLVDQL--VEPLGPGLKPPEERTIEYLEEVAITFAKGL
          :..:.:::  : :. ::. :::...  :: :                          
CCDS76 KSLAMEMVLTGDRISAQDAKQAGLVSKICPVETLVEEAIQCAEKIASNSKIVVAMAKESV
          190       200       210       220       230       240    

             260       270       280       290       300       310 
pF1KE4 ADKKISPKRDKGLVEKLTAYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVRKQTKGLYPAPLKIIDVVKTG
                                                                   
CCDS76 NAAFEMTLTEGSKLEKKLFYSTFATDDRKEGMTAFVEKRKANFKDQ              
          250       260       270       280       290              

>>CCDS78409.1 AUH gene_id:549|Hs108|chr9                  (310 aa)
 initn: 251 init1: 133 opt: 272  Z-score: 333.8  bits: 71.2 E(32554): 2.8e-12
Smith-Waterman score: 289; 28.5% identity (57.7% similar) in 260 aa overlap (22-276:65-288)

                        10        20        30        40        50 
pF1KE4          MVACRAIGILSRFSAFRILRSRGYICRNFTGSSALLTRTHINYGVKGDVAV
                                     :::   ..   . : .: :..   .: ..:
CCDS78 RLPGSLAGRRAGPAIWAQGWVPAAGGPAPKRGY-SSEMKTEDELRVR-HLEEENRG-IVV
           40        50        60         70        80          90 

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 VRINSPNSKVNTLSKELHSEFSEVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAACK
       . ::   .: :.:::.: . .:.... . .. ..:. .. :  :: : : :.. .     
CCDS78 LGINRAYGK-NSLSKNLIKMLSKAVDALKSDKKVRTIIIRSEVPGIFCA-ANLPV-----
             100        110       120       130        140         

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE4 TLQEVTQLSQEAQRIVEKLEKSTKPIVAAINGSCLGGGLEVAISCQYRIATKDRKTVLGT
                               : .:::.:  ::::::.:..:. :.:... :  .: 
CCDS78 ------------------------PTIAAIDGLALGGGLELALACDIRVAASSAK--MGL
                                  150       160       170          

             180       190       200       210       220           
pF1KE4 PEVLLGALPGAGGTQRLPKMVGVPAALDMMLTGRSIRADRAKKMGLVDQLVEPLGPG---
        :. :. .::.:::::::. .:.  : ......: . . .:: .::.....:    :   
CCDS78 VETKLAIIPGGGGTQRLPRAIGMSLAKELIFSARVLDGKEAKAVGLISHVLEQNQEGDAA
      180       190       200       210       220       230        

      230       240         250       260       270       280      
pF1KE4 LKPPEERTIEYLEE--VAITFAKGLADKKISPKRDKGLVEKLTAYAMTIPFVRQQVYKKV
        .   . . :.: .  ::.  ::   .. .      ::. . . ::.:::          
CCDS78 YRKALDLAREFLPQGPVAMRVAKLAINQGMEVDLVTGLAIEEACYAQTIPTKDRLEGLLA
      240       250       260       270       280       290        

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE4 EEKVRKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLCESQKFGELVMTKESKALMGLYHGQ
                                                                   
CCDS78 FKEKRPPRYKGE                                                
      300       310                                                




763 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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