Result of FASTA (omim) for pFN21AB9974
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9974, 707 aa
  1>>>pF1KB9974 707 - 707 aa - 707 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7164+/-0.000477; mu= -8.7601+/- 0.030
 mean_var=397.5731+/-79.687, 0's: 0 Z-trim(121.0): 108  B-trim: 0 in 0/60
 Lambda= 0.064323
 statistics sampled from 36982 (37091) to 36982 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.435), width:  16
 Scan time: 12.990

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004985 (OMIM: 120361,613073) matrix metalloprot ( 707) 4999 478.5 3.7e-134
NP_004521 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV col ( 660) 1899 190.8 1.4e-47
NP_001121363 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV  ( 610) 1839 185.2 6.3e-46
NP_001289439 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV  ( 584) 1838 185.1 6.5e-46
NP_001289437 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV  ( 584) 1838 185.1 6.5e-46
NP_001289438 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV  ( 584) 1838 185.1 6.5e-46
NP_002413 (OMIM: 185250,614466) stromelysin-1 prep ( 477)  611 71.2 1.1e-11
NP_002418 (OMIM: 250400,600108,602111) collagenase ( 471)  606 70.7 1.4e-11
NP_002416 (OMIM: 185260) stromelysin-2 preproprote ( 476)  603 70.5 1.8e-11
NP_002412 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitia ( 469)  580 68.3 7.7e-11
NP_001139410 (OMIM: 120353,226600,606963) intersti ( 403)  536 64.2 1.2e-09
NP_004762 (OMIM: 604629,612529) matrix metalloprot ( 483)  521 62.9 3.5e-09
NP_002417 (OMIM: 601046) macrophage metalloelastas ( 470)  520 62.8 3.6e-09
NP_002414 (OMIM: 178990) matrilysin preproprotein  ( 267)  487 59.5   2e-08
NP_002415 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase is ( 467)  480 59.0 4.8e-08
XP_011541138 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil  ( 377)  477 58.7 4.9e-08
XP_011541137 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil  ( 444)  477 58.7 5.5e-08
NP_001291371 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase ( 444)  477 58.7 5.5e-08
NP_001291370 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase ( 444)  477 58.7 5.5e-08
XP_016873260 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil  ( 444)  477 58.7 5.5e-08
XP_011541136 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil  ( 476)  477 58.8 5.8e-08
XP_016874796 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 434)  384 50.1 2.2e-05
NP_068573 (OMIM: 605470) matrix metalloproteinase- ( 261)  375 49.1 2.6e-05
NP_057239 (OMIM: 602285) matrix metalloproteinase- ( 603)  384 50.2 2.8e-05
XP_011518521 (OMIM: 605470) PREDICTED: matrix meta ( 191)  367 48.2 3.5e-05
XP_011536658 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519)  376 49.4 4.1e-05
XP_011536657 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519)  376 49.4 4.1e-05
XP_011536659 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519)  376 49.4 4.1e-05
NP_002420 (OMIM: 601807,611543) matrix metalloprot ( 508)  366 48.5 7.7e-05
NP_005932 (OMIM: 602262) matrix metalloproteinase- ( 607)  354 47.4 0.00019
NP_004986 (OMIM: 277950,600754) matrix metalloprot ( 582)  349 47.0 0.00026
NP_005931 (OMIM: 185261) stromelysin-3 preproprote ( 488)  345 46.5 0.00029
XP_011526802 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 556)  333 45.5 0.00069
XP_016883086 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 591)  333 45.5 0.00072
XP_016883087 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 614)  333 45.5 0.00075
NP_006681 (OMIM: 604871) matrix metalloproteinase- ( 645)  333 45.5 0.00077
NP_002419 (OMIM: 602261) matrix metalloproteinase- ( 669)  326 44.9  0.0012


>>NP_004985 (OMIM: 120361,613073) matrix metalloproteina  (707 aa)
 initn: 4999 init1: 4999 opt: 4999  Z-score: 2529.4  bits: 478.5 E(85289): 3.7e-134
Smith-Waterman score: 4999; 99.7% identity (99.9% similar) in 707 aa overlap (1-707:1-707)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 ITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 FDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 YSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQGQSYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_004 YSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTQDGNADGKPCQFPFIFQGQSYS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 ACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYST
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 CTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 PMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSER
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 PTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYW
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 RFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVLGPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEERLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVLGPRR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 LDKLGLGADVAQVTGALRSGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LDKLGLGADVAQVTGALRSGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       
pF1KB9 THDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 THDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
              670       680       690       700       

>>NP_004521 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV collage  (660 aa)
 initn: 2055 init1: 1226 opt: 1899  Z-score: 975.1  bits: 190.8 E(85289): 1.4e-47
Smith-Waterman score: 2132; 46.9% identity (68.3% similar) in 715 aa overlap (2-704:9-660)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB9        MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYR-Y
               .:  ::  .: .::: ..      : .. ::::.  . ::..:: .::   :
NP_004 MEALMARGALTGPLR-ALCLLGCLLSHAAAAPSPIIKFPGDVAPK-TDKELAVQYLNTFY
               10         20        30        40         50        

             60           70        80        90       100         
pF1KB9 GYTRVAEMRGESKSL---GPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQT
       :  .      :: .:     .:  .:: ..::.::.::. :...:: :::: ::.. .. 
NP_004 GCPK------ESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNF
       60              70        80        90       100       110  

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB9 FEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQ
       :    :: ...::: : .:. ::   ..:::::::: .:: :::: :.:... .:::.:.
NP_004 FPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMIN
            120       130       140       150       160       170  

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB9 FGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAA
       ::  ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: :: ...:::::  
NP_004 FGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEY
            180       190       200       210       220       230  

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB9 CHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQ
       :.:::.:.:. :..::  :::::. ::::: :.. : ..:::: : :.:  :::.:.::.
NP_004 CKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCK
            240       250       260       270       280       290  

     290       300       310       320       330       340         
pF1KB9 FPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVF
       ::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .::::  : ::: :::: :  :::
NP_004 FPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTV-GGNSEGAPCVF
            300       310       320       330       340        350 

     350       360       370       380       390       400         
pF1KB9 PFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGL
       ::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.:::::::::::::::::::::::.::
NP_004 PFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGL
             360       370       380       390       400       410 

     410       420       430       440       450       460         
pF1KB9 DHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCP
       .::. : ::: :.: .:..  : .::..::..:::  :. .                   
NP_004 EHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID-----------------LG
             420       430       440       450                     

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB9 TGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNI-FDAIAEIG
       :::        :: ::. :                         . :. .: ::.::.: 
NP_004 TGPT-------PTLGPVTP-------------------------EICKQDIVFDGIAQIR
                 460                                470       480  

      530       540       550       560       570       580        
pF1KB9 NQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVW
       .....:::   ::    : ..:.::.:.:  :: ::.:.:.:.: :  .:  ::.: . :
NP_004 GEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYW
            490       500        510       520       530       540 

      590          600       610        620       630        640   
pF1KB9 VYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFD-VKAQMVD
       .:. ::.:  : :. : .:::  :: .: .:.  :   :  .:.: ..::.. :: .: :
NP_004 IYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKM-D
              550       560       570       580       590          

           650         660       670       680       690       700 
pF1KB9 PRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDI
       :   . .   . ..:  ::.   .:   ..:: .  .: .. ..: :..: . : .  : 
NP_004 PGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-LKSV-KFGSIKSDW
     600       610       620       630       640         650       

             
pF1KB9 LQCPED
       : :   
NP_004 LGC   
       660   

>>NP_001121363 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV coll  (610 aa)
 initn: 2006 init1: 1226 opt: 1839  Z-score: 945.5  bits: 185.2 E(85289): 6.3e-46
Smith-Waterman score: 2072; 48.5% identity (70.0% similar) in 646 aa overlap (67-704:20-610)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB9 TNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRT
                                     :  .:  .:: ..::.::.::. :...:: 
NP_001            MQYLNTFYGCPKESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRK
                          10        20        30        40         

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB9 PRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTF
       :::: ::.. .. :    :: ...::: : .:. ::   ..:::::::: .:: :::: :
NP_001 PRCGNPDVANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRF
      50        60        70        80        90       100         

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB9 TRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGV
       .:... .:::.:.::  ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: 
NP_001 SRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQ
     110       120       130       140       150       160         

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB9 VVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERL
       :: ...:::::  :.:::.:.:. :..::  :::::. ::::: :.. : ..:::: : :
NP_001 VVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEAL
     170       180       190       200       210       220         

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB9 YTRDGNADGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADST
       .:  :::.:.::.::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .::::  : ::
NP_001 FTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMST
     230       240       250       260       270       280         

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB9 VMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLF
       : :::: :  :::::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.:::::::::::::
NP_001 V-GGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLF
     290        300       310       320       330       340        

        400       410       420       430       440       450      
pF1KB9 LVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTT
       ::::::::::.::.::. : ::: :.: .:..  : .::..::..:::  :. .      
NP_001 LVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID------
      350       360       370       380       390       400        

        460       470       480       490       500       510      
pF1KB9 TTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDAC
                    :::        :: ::. :                         . :
NP_001 -----------LGTGPT-------PTLGPVTP-------------------------EIC
                              410                                  

        520        530       540       550       560       570     
pF1KB9 NVNI-FDAIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPL
       . .: ::.::.: .....:::   ::    : ..:.::.:.:  :: ::.:.:.:.: : 
NP_001 KQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQ
     420       430       440       450        460       470        

         580       590          600       610        620       630 
pF1KB9 SKKLFFFSGRQVWVYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRR
        .:  ::.: . :.:. ::.:  : :. : .:::  :: .: .:.  :   :  .:.: .
NP_001 EEKAVFFAGNEYWIYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDK
      480       490        500       510       520       530       

              640       650         660       670       680        
pF1KB9 LWRFD-VKAQMVDPRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSEL
       .::.. :: .: ::   . .   . ..:  ::.   .:   ..:: .  .: .. ..: :
NP_001 FWRYNEVKKKM-DPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-L
       540        550       560       570       580       590      

      690       700       
pF1KB9 NQVDQVGYVTYDILQCPED
       ..: . : .  : : :   
NP_001 KSV-KFGSIKSDWLGC   
          600       610   

>>NP_001289439 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV coll  (584 aa)
 initn: 2006 init1: 1226 opt: 1838  Z-score: 945.3  bits: 185.1 E(85289): 6.5e-46
Smith-Waterman score: 2071; 48.7% identity (70.3% similar) in 639 aa overlap (74-704:1-584)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB9 LAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPD
                                     .:: ..::.::.::. :...:: :::: ::
NP_001                               MQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPD
                                             10        20        30

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB9 LGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRD
       .. .. :    :: ...::: : .:. ::   ..:::::::: .:: :::: :.:... .
NP_001 VANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGE
               40        50        60        70        80        90

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB9 ADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFG
       :::.:.::  ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: :: ...:
NP_001 ADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYG
              100       110       120       130       140       150

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB9 NADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNA
       ::::  :.:::.:.:. :..::  :::::. ::::: :.. : ..:::: : :.:  :::
NP_001 NADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNA
              160       170       180       190       200       210

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB9 DGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSA
       .:.::.::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .::::  : ::: :::: 
NP_001 EGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTV-GGNSE
              220       230       240       250       260          

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB9 GELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEF
       :  :::::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.::::::::::::::::::::
NP_001 GAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEF
     270       280       290       300       310       320         

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB9 GHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTA
       :::.::.::. : ::: :.: .:..  : .::..::..:::  :. .             
NP_001 GHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID-------------
     330       340       350       360       370                   

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB9 PPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNI-FD
             :::        :: ::. :                         . :. .: ::
NP_001 ----LGTGPT-------PTLGPVTP-------------------------EICKQDIVFD
            380              390                                400

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB9 AIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFF
       .::.: .....:::   ::    : ..:.::.:.:  :: ::.:.:.:.: :  .:  ::
NP_001 GIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFF
              410       420        430       440       450         

            590          600       610        620       630        
pF1KB9 SGRQVWVYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFD-V
       .: . :.:. ::.:  : :. : .:::  :: .: .:.  :   :  .:.: ..::.. :
NP_001 AGNEYWIYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEV
     460        470       480       490       500       510        

       640       650         660       670       680       690     
pF1KB9 KAQMVDPRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVG
       : .: ::   . .   . ..:  ::.   .:   ..:: .  .: .. ..: :..: . :
NP_001 KKKM-DPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-LKSV-KFG
      520        530       540       550       560        570      

         700       
pF1KB9 YVTYDILQCPED
        .  : : :   
NP_001 SIKSDWLGC   
         580       

>>NP_001289437 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV coll  (584 aa)
 initn: 2006 init1: 1226 opt: 1838  Z-score: 945.3  bits: 185.1 E(85289): 6.5e-46
Smith-Waterman score: 2071; 48.7% identity (70.3% similar) in 639 aa overlap (74-704:1-584)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB9 LAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPD
                                     .:: ..::.::.::. :...:: :::: ::
NP_001                               MQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPD
                                             10        20        30

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB9 LGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRD
       .. .. :    :: ...::: : .:. ::   ..:::::::: .:: :::: :.:... .
NP_001 VANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGE
               40        50        60        70        80        90

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB9 ADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFG
       :::.:.::  ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: :: ...:
NP_001 ADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYG
              100       110       120       130       140       150

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB9 NADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNA
       ::::  :.:::.:.:. :..::  :::::. ::::: :.. : ..:::: : :.:  :::
NP_001 NADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNA
              160       170       180       190       200       210

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB9 DGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSA
       .:.::.::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .::::  : ::: :::: 
NP_001 EGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTV-GGNSE
              220       230       240       250       260          

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB9 GELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEF
       :  :::::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.::::::::::::::::::::
NP_001 GAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEF
     270       280       290       300       310       320         

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB9 GHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTA
       :::.::.::. : ::: :.: .:..  : .::..::..:::  :. .             
NP_001 GHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID-------------
     330       340       350       360       370                   

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB9 PPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNI-FD
             :::        :: ::. :                         . :. .: ::
NP_001 ----LGTGPT-------PTLGPVTP-------------------------EICKQDIVFD
            380              390                                400

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB9 AIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFF
       .::.: .....:::   ::    : ..:.::.:.:  :: ::.:.:.:.: :  .:  ::
NP_001 GIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFF
              410       420        430       440       450         

            590          600       610        620       630        
pF1KB9 SGRQVWVYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFD-V
       .: . :.:. ::.:  : :. : .:::  :: .: .:.  :   :  .:.: ..::.. :
NP_001 AGNEYWIYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEV
     460        470       480       490       500       510        

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pF1KB9 KAQMVDPRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVG
       : .: ::   . .   . ..:  ::.   .:   ..:: .  .: .. ..: :..: . :
NP_001 KKKM-DPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-LKSV-KFG
      520        530       540       550       560        570      

         700       
pF1KB9 YVTYDILQCPED
        .  : : :   
NP_001 SIKSDWLGC   
         580       

>>NP_001289438 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV coll  (584 aa)
 initn: 2006 init1: 1226 opt: 1838  Z-score: 945.3  bits: 185.1 E(85289): 6.5e-46
Smith-Waterman score: 2071; 48.7% identity (70.3% similar) in 639 aa overlap (74-704:1-584)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB9 LAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPD
                                     .:: ..::.::.::. :...:: :::: ::
NP_001                               MQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPD
                                             10        20        30

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB9 LGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRD
       .. .. :    :: ...::: : .:. ::   ..:::::::: .:: :::: :.:... .
NP_001 VANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGE
               40        50        60        70        80        90

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB9 ADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFG
       :::.:.::  ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: :: ...:
NP_001 ADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYG
              100       110       120       130       140       150

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pF1KB9 NADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNA
       ::::  :.:::.:.:. :..::  :::::. ::::: :.. : ..:::: : :.:  :::
NP_001 NADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNA
              160       170       180       190       200       210

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pF1KB9 DGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSA
       .:.::.::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .::::  : ::: :::: 
NP_001 EGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTV-GGNSE
              220       230       240       250       260          

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pF1KB9 GELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEF
       :  :::::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.::::::::::::::::::::
NP_001 GAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEF
     270       280       290       300       310       320         

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pF1KB9 GHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTA
       :::.::.::. : ::: :.: .:..  : .::..::..:::  :. .             
NP_001 GHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID-------------
     330       340       350       360       370                   

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB9 PPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNI-FD
             :::        :: ::. :                         . :. .: ::
NP_001 ----LGTGPT-------PTLGPVTP-------------------------EICKQDIVFD
            380              390                                400

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB9 AIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFF
       .::.: .....:::   ::    : ..:.::.:.:  :: ::.:.:.:.: :  .:  ::
NP_001 GIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFF
              410       420        430       440       450         

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pF1KB9 SGRQVWVYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFD-V
       .: . :.:. ::.:  : :. : .:::  :: .: .:.  :   :  .:.: ..::.. :
NP_001 AGNEYWIYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEV
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pF1KB9 KAQMVDPRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVG
       : .: ::   . .   . ..:  ::.   .:   ..:: .  .: .. ..: :..: . :
NP_001 KKKM-DPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-LKSV-KFG
      520        530       540       550       560        570      

         700       
pF1KB9 YVTYDILQCPED
        .  : : :   
NP_001 SIKSDWLGC   
         580       

>>NP_002413 (OMIM: 185250,614466) stromelysin-1 prepropr  (477 aa)
 initn: 992 init1: 582 opt: 611  Z-score: 331.1  bits: 71.2 E(85289): 1.1e-11
Smith-Waterman score: 673; 28.3% identity (45.5% similar) in 693 aa overlap (8-689:6-459)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
              .:.:: .. : : :         . :  : . :. .:...::  : :    ..
NP_002   MKSLPILLLLCVAVCSAYP---------LDGAARGEDTSMNLVQKYLENY-YDLKKDV
                 10                 20        30        40         

                 70           80        90       100       110     
pF1KB9 RG--ESKSLGPA---LLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLK
       .   . :. ::.   .  .:: :.:  ::.::: ::..:: :::::::.:.:.:: :  :
NP_002 KQFVRRKDSGPVVKKIREMQKFLGLEVTGKLDSDTLEVMRKPRCGVPDVGHFRTFPGIPK
       50        60        70        80        90       100        

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB9 WHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEH
       :.. ..:: : ::. :::. ..:.:  .:. .:  ::::::.:.:  .:::.:.:.: ::
NP_002 WRKTHLTYRIVNYTPDLPKDAVDSAVEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVREH
      110       120       130       140       150       160        

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB9 GDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFI
       :: :::::  ..::::. :::::.::::::::: :.                        
NP_002 GDFYPFDGPGNVLAHAYAPGPGINGDAHFDDDEQWT------------------------
      170       180       190       200                            

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB9 FEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQ
                                                                   
NP_002 ------------------------------------------------------------
                                                                   

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB9 GQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLG
                                             :.:                   
NP_002 -------------------------------------KDTT-------------------
                                                                   

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB9 KEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVP
                                           : .::::::::.::.::: ::.  
NP_002 ------------------------------------GTNLFLVAAHEIGHSLGLFHSANT
                                          210       220       230  

         420        430         440       450       460       470  
pF1KB9 EALMYPMYR-FTEGPP--LHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGP
       ::::::.:. .:.     : .::.:::. ::::       :: .    : .:  . :: :
NP_002 EALMYPLYHSLTDLTRFRLSQDDINGIQSLYGP-------PPDS----PETP--LVPTEP
            240       250       260                  270           

            480       490       500       510       520       530  
pF1KB9 PTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLY
                      ::   :  : .  :. .                :::.. . ... 
NP_002 V--------------PPE--PGTPANCDPALS----------------FDAVSTLRGEIL
     280                       290                       300       

            540       550       560       570       580       590  
pF1KB9 LFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVWVYTG
       .::: ..:: :  :  .:.   ::.. ::.::  .:...:   .  .:.:.: : :.  :
NP_002 IFKDRHFWRKSL-RKLEPEL-HLISSFWPSLPSGVDAAYEVTSKDLVFIFKGNQFWAIRG
       310        320        330       340       350       360     

              600       610       620        630       640         
pF1KB9 ASVLG--PRRLDKLGLGADVAQVTGALRSG-RGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASE
         : .  :: .  ::.   : .. .:. .  ..:  .:   . :::: : . ..:   ..
NP_002 NEVRAGYPRGIHTLGFPPTVRKIDAAISDKEKNKTYFFVEDKYWRFDEKRNSMEPGFPKQ
         370       380       390       400       410       420     

     650       660       670       680       690       700       
pF1KB9 VDRMFPGVPLDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
       . . :::.      ::.  : ..:    ...  ::. :..                  
NP_002 IAEDFPGIDSKIDAVFE--EFGFF----YFFTGSSQLEFDPNAKKVTHTLKSNSWLNC
         430       440             450       460       470       

>>NP_002418 (OMIM: 250400,600108,602111) collagenase 3 p  (471 aa)
 initn: 1063 init1: 568 opt: 606  Z-score: 328.6  bits: 70.7 E(85289): 1.4e-11
Smith-Waterman score: 696; 28.8% identity (45.5% similar) in 674 aa overlap (41-704:35-471)

               20        30        40        50         60         
pF1KB9 LLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGY-TRVAEMRGES--KSL
                                     : :.::.::  : . : .: .  :.  .:.
NP_002 VLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLAGILKENAASSM
           10        20        30        40        50        60    

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB9 GPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQN
          :  .:. ..:  ::.::. :: .:. :::::::.:....:   ::: . :.:: : :
NP_002 TERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTYRIVN
           70        80        90       100       110       120    

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB9 YSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGL
       :. :. .. .. :: .:: .:: ::::.:::...  :::.:.::. :::: ::::: .::
NP_002 YTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDGPSGL
          130       140       150       160       170       180    

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB9 LAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRSYSACTTD
       :::::::::.  ::::::::: :                                     
NP_002 LAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETW-------------------------------------
          190       200                                            

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB9 GRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGR
                                                                   
NP_002 ------------------------------------------------------------
                                                                   

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB9 SDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRG
                                                                   
NP_002 ------------------------------------------------------------
                                                                   

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB9 DGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTE
              :.:.            .::.:::::::::::.::::::. : :::.:.: .: 
NP_002 -------TSSS------------KGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYT-
              210                   220       230       240        

       430          440        450       460       470       480   
pF1KB9 GPP---LHKDDVNGIRHLYGPRPE-PEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSERPTA
       :     :  :::.::. ::::  : :.:. : :        :  :        ::     
NP_002 GKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKT--------PDKC-------DPS-----
       250       260       270       280                           

           490       500       510       520       530       540   
pF1KB9 GPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYWRFS
                                ::          .:::. . .. ..:::  .::. 
NP_002 -------------------------LS----------LDAITSLRGETMIFKDRFFWRLH
                                          290       300       310  

           550       560       570       580       590         600 
pF1KB9 EGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVL-G-PRRL
         . .     ::  . :: :: ..:...:.:    .:.: ::. :. .: ..: : :...
NP_002 PQQVDAEL--FLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGYDILEGYPKKI
            320         330       340       350       360       370

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pF1KB9 DKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLD
       ..:::  .: ....:..    :: ::::: ..::.:   ...:      ... :::.   
NP_002 SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLIEEDFPGIGDK
              380       390       400       410       420       430

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pF1KB9 THDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
       .  :..     :: .  . .. :  :  :.. .: . . .:: :   
NP_002 VDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWS--NRIVRV-MPANSILWC   
              440       450         460        470    

>>NP_002416 (OMIM: 185260) stromelysin-2 preproprotein [  (476 aa)
 initn: 980 init1: 564 opt: 603  Z-score: 327.1  bits: 70.5 E(85289): 1.8e-11
Smith-Waterman score: 657; 28.6% identity (43.8% similar) in 676 aa overlap (9-673:7-448)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
               :::: :  : : :         . :  . . ....::..:: .: :.   ..
NP_002   MMHLAFLVLLCLPVCSAYP---------LSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKY-YNLEKDV
                 10                 20        30        40         

                   70        80        90       100       110      
pF1KB9 ----RGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKW
           : .:. .   .  .:: :.:  ::.::. ::..:: :::::::.:.:..: :  ::
NP_002 KQFRRKDSNLIVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKW
       50        60        70        80        90       100        

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pF1KB9 HHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHG
       .. ..:: : ::. :::: ..:.:. .:. .:  ::::::.:.:  .:::.:.:.: :::
NP_002 RKTHLTYRIVNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHG
      110       120       130       140       150       160        

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB9 DGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIF
       : : :::    ::::.:::::. :: :::::: :                          
NP_002 DFYSFDGPGHSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKW--------------------------
      170       180       190       200                            

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 EGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQG
                                                :.:..              
NP_002 -----------------------------------------TEDAS--------------
                                                                   

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB9 QSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGK
                                                                   
NP_002 ------------------------------------------------------------
                                                                   

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB9 EYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPE
                                          : .::::::::.::.::: ::.  :
NP_002 -----------------------------------GTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTE
                                          210       220       230  

        420        430         440       450       460       470   
pF1KB9 ALMYPMYR-FTEGPP--LHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPP
       :::::.:  :::     : .::::::. ::::       ::..:  .: .:    :.:  
NP_002 ALMYPLYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGP-------PPASTE-EPLVPTKSVPSG--
            240       250       260              270        280    

           480       490       500       510       520       530   
pF1KB9 TVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYL
           :: :                            .  : : .   ::::. . ..  .
NP_002 ----SEMP----------------------------AKCDPALS---FDAISTLRGEYLF
                                            290          300       

           540       550        560       570       580       590  
pF1KB9 FKDGKYWRFSEGRGSRPQGPF-LIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVWVYTG
       :::  .:: :.     :.  : ::.  ::.::  ::...:      .:.:.: . :.  :
NP_002 FKDRYFWRRSHWN---PEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKGNEFWAIRG
       310       320          330       340       350       360    

              600       610       620        630       640         
pF1KB9 ASVLG--PRRLDKLGLGADVAQVTGALRSG-RGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASE
         : .  :: .  ::.   . .. .:. .  . :  .:.. . :::: ..: ..      
NP_002 NEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQSMEQGFPRL
          370       380       390       400       410       420    

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pF1KB9 VDRMFPGVPLDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
       .   ::::   .  :.:     ::                                  
NP_002 IADDFPGVEPKVDAVLQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWLHC      
          430       440       450       460       470            

>>NP_002412 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitial co  (469 aa)
 initn: 904 init1: 527 opt: 580  Z-score: 315.6  bits: 68.3 E(85289): 7.7e-11
Smith-Waterman score: 580; 48.6% identity (71.9% similar) in 185 aa overlap (31-211:20-204)

               10        20        30        40        50          
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRY----GYTR
                                     ::. :.:.  : .:...:: .:    .  :
NP_002            MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGR
                          10        20        30        40         

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB9 VAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKW
        .: : .:  .   :  .:. ..:  ::. :. :::.:. :::::::...:   ::. .:
NP_002 QVEKRRNSGPVVEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRW
      50        60        70        80        90       100         

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB9 HHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHG
       .. ..:: :.::. ::::: .: :. .:: ::: :::::::.:   .:::.:.:  ..: 
NP_002 EQTHLTYRIENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHR
     110       120       130       140       150       160         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB9 DGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIF
       :. ::::  : ::::: ::::: ::::::.:: :.                         
NP_002 DNSPFDGPGGNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHS
     170       180       190       200       210       220         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 EGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQG
                                                                   
NP_002 TDIGALMYPSYTFSGDVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPKACDSKLTFDAITT
     230       240       250       260       270       280         




707 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 15:02:53 2016 done: Sat Nov  5 15:02:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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