FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1530, 446 aa 1>>>pF1KE1530 446 - 446 aa - 446 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2195+/-0.00091; mu= 18.1521+/- 0.055 mean_var=67.6694+/-13.643, 0's: 0 Z-trim(105.9): 35 B-trim: 135 in 1/50 Lambda= 0.155911 statistics sampled from 8626 (8661) to 8626 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16 Scan time: 2.550 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11858.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 ( 446) 3006 685.2 3.4e-197 CCDS10988.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 ( 450) 2810 641.2 6.4e-184 CCDS12168.1 TUBB4A gene_id:10382|Hs108|chr19 ( 444) 2776 633.5 1.3e-181 CCDS4485.1 TUBB2B gene_id:347733|Hs108|chr6 ( 445) 2760 629.9 1.5e-180 CCDS7039.1 TUBB4B gene_id:10383|Hs108|chr9 ( 445) 2754 628.6 3.9e-180 CCDS4484.1 TUBB2A gene_id:7280|Hs108|chr6 ( 445) 2745 626.5 1.6e-179 CCDS4687.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 ( 444) 2741 625.6 3e-179 CCDS7051.1 TUBB8 gene_id:347688|Hs108|chr10 ( 444) 2614 597.1 1.2e-170 CCDS13475.1 TUBB1 gene_id:81027|Hs108|chr20 ( 451) 2414 552.1 4.2e-157 CCDS56012.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 ( 378) 2370 542.1 3.4e-154 CCDS78124.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 ( 372) 2328 532.7 2.4e-151 CCDS8782.1 TUBA1C gene_id:84790|Hs108|chr12 ( 449) 1281 297.2 2.2e-80 CCDS2438.1 TUBA4A gene_id:7277|Hs108|chr2 ( 448) 1280 297.0 2.5e-80 CCDS31792.1 TUBA1B gene_id:10376|Hs108|chr12 ( 451) 1274 295.7 6.5e-80 CCDS76556.1 TUBA1C gene_id:84790|Hs108|chr12 ( 519) 1274 295.7 7.3e-80 CCDS8781.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 451) 1266 293.9 2.3e-79 CCDS58227.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 451) 1266 293.9 2.3e-79 CCDS33290.1 TUBA3D gene_id:113457|Hs108|chr2 ( 450) 1256 291.6 1.1e-78 CCDS9284.1 TUBA3C gene_id:7278|Hs108|chr13 ( 450) 1256 291.6 1.1e-78 CCDS13751.1 TUBA8 gene_id:51807|Hs108|chr22 ( 449) 1235 286.9 2.8e-77 CCDS63131.1 TUBA4A gene_id:7277|Hs108|chr2 ( 433) 1228 285.3 8.2e-77 CCDS2158.1 TUBA3E gene_id:112714|Hs108|chr2 ( 450) 1227 285.1 9.8e-77 CCDS58226.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 416) 1157 269.3 5.1e-72 CCDS54495.1 TUBA8 gene_id:51807|Hs108|chr22 ( 383) 1091 254.5 1.4e-67 CCDS53491.1 TUBAL3 gene_id:79861|Hs108|chr10 ( 406) 1081 252.2 7e-67 CCDS7066.2 TUBAL3 gene_id:79861|Hs108|chr10 ( 446) 1081 252.3 7.5e-67 CCDS11433.1 TUBG1 gene_id:7283|Hs108|chr17 ( 451) 1003 234.7 1.4e-61 CCDS32658.1 TUBG2 gene_id:27175|Hs108|chr17 ( 451) 994 232.7 5.9e-61 CCDS77153.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 ( 104) 634 151.3 4.2e-37 CCDS5100.1 TUBE1 gene_id:51175|Hs108|chr6 ( 475) 517 125.4 1.2e-28 CCDS54154.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 396) 453 111.0 2.3e-24 CCDS11620.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 453) 453 111.0 2.5e-24 CCDS54152.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 351) 428 105.3 1e-22 CCDS54153.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 398) 428 105.3 1.1e-22 >>CCDS11858.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 (446 aa) initn: 3006 init1: 3006 opt: 3006 Z-score: 3653.8 bits: 685.2 E(32554): 3.4e-197 Smith-Waterman score: 3006; 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91.4% identity (97.1% similar) in 443 aa overlap (1-443:1-442) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV ::::::.::::::::::.::::::::::::::.: : ::: ::::::::::::... ::: CCDS70 MREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGKYV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV :::.:::::::::::::::::::.::::::.:::.:::::::::::::::::::.::::: CCDS70 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV ::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: CCDS70 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : CCDS70 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS70 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMM 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG ::::::::::::::.:::: ::::::::::: .:.:::::::::::::::.::::::::: CCDS70 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS :::..::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS70 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG ::::::::::.. : ::.: :: CCDS70 EYQQYQDATAEE-EGEFEEEAEEEVA 430 440 >>CCDS4484.1 TUBB2A gene_id:7280|Hs108|chr6 (445 aa) initn: 2725 init1: 2725 opt: 2745 Z-score: 3336.5 bits: 626.5 E(32554): 1.6e-179 Smith-Waterman score: 2745; 91.2% identity (97.1% similar) in 443 aa overlap (1-443:1-442) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV :::::::::::::::::.::::::::::::::.:.: ::: ::::::::::::....::: CCDS44 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV ::: :::::::::::::::::::.::::::.:::.:::::::::::::::::::.::::: CCDS44 PRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV ::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: CCDS44 RKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL :::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : CCDS44 EPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::: CCDS44 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMM 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG ::::::::::::::..::: ::::::::::: .:.:::::::::::::::.::::::::: CCDS44 AACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS :::..::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS44 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG ::::::::::.. : ::.:: : CCDS44 EYQQYQDATADEQGE-FEEEEGEDEA 430 440 >>CCDS4687.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 (444 aa) initn: 2741 init1: 2741 opt: 2741 Z-score: 3331.6 bits: 625.6 E(32554): 3e-179 Smith-Waterman score: 2741; 91.0% identity (96.6% similar) in 443 aa overlap (1-443:1-443) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV :::::::::::::::::.::::::::::::::.: : ::: :::.::.:::::... ::: CCDS46 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV ::: :::::::::::::::::::.::::::.:::.:::::::::::::::::::.::::: CCDS46 PRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV ::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: CCDS46 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : CCDS46 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::: CCDS46 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMM 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG ::::::::::::::.:::: ::::::::::: .:.:::::::::::::::.::::::::: CCDS46 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS :::: ::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS46 LKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG ::::::::::.. :. :. ::: CCDS46 EYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA 430 440 >>CCDS7051.1 TUBB8 gene_id:347688|Hs108|chr10 (444 aa) initn: 2610 init1: 2610 opt: 2614 Z-score: 3177.3 bits: 597.1 E(32554): 1.2e-170 Smith-Waterman score: 2614; 85.8% identity (94.8% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-443) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV ::::: : ::::::::.::::::::::.:: :: : ::: ::::::::::::.:. .:: CCDS70 MREIVLTQIGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVYYNEASGGRYV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV :::.:::::::::::::::::::.:::::::::: :::::::::::::::::...:.::: CCDS70 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFIFGQCGAGNNWAKGHYTEGAELMESVMDVV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV ::: : :::::::::::::::::::::::::.::::::.::::.::::..:::::::::: CCDS70 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLLSKIREEYPDRIINTFSILPSPKVSDTVV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL ::::::::::::.::.:::.::::::::::: .:::: :::::::::::::::::::: : CCDS70 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSKTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.::: CCDS70 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG ::::::::::::.:..::: : :.::::::. ::.::::::..:.:::::.::::::::: CCDS70 AACDPRHGRYLTAAAIFRGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWLPNNVKTAVCDIPPRG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS :::..:::::.:::::::::.::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS70 LKMSATFIGNNTAIQELFKRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG ::::::::::.. :: : :::. CCDS70 EYQQYQDATAEE-EEDEEYAEEEVA 430 440 >>CCDS13475.1 TUBB1 gene_id:81027|Hs108|chr20 (451 aa) initn: 2441 init1: 2411 opt: 2414 Z-score: 2934.0 bits: 552.1 E(32554): 4.2e-157 Smith-Waterman score: 2414; 78.4% identity (92.8% similar) in 445 aa overlap (1-443:1-445) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV :::::::: ::::::::.::::.:..::::: ::. : ::::::::.:::::. ..::: CCDS13 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV :::.:::::::::::.::. .: ::.::.:. :..:::::::::::::::::.. ::.:: CCDS13 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV :.: : ::::::::..:::::::::::::::..:::::.::::::.:::::::::::::: CCDS13 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL :::::.::.:::.::.: .:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::: CCDS13 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM ::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.: ::::::::::: : CCDS13 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG :::: :.::::::: .::: :: ::::.:.:..:..::: :::::::::::::::::::: CCDS13 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS :.::.:::::.:::::.:.:.::.:::::.::::.::.:.:::: :: :::.:..:::: CCDS13 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE1 EYQQYQDATA--NDGEEAFEDEEEEIDG ::::.::: : .. ::. :. : : CCDS13 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH 430 440 450 >>CCDS56012.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 (378 aa) initn: 2370 init1: 2370 opt: 2370 Z-score: 2881.7 bits: 542.1 E(32554): 3.4e-154 Smith-Waterman score: 2370; 93.8% identity (98.7% similar) in 371 aa overlap (73-443:1-371) 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 QLERINVYYNESSSQKYVPRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWA ::::::: ::.:::::::::::.::::::: CCDS56 MDSVRSGAFGHLFRPDNFIFGQSGAGNNWA 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 KGHYTEGAELVDAVLDVVRKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDR ::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.::: CCDS56 KGHYTEGAELVDSVLDVVRKECENCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKVREEYPDR 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 IMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTY :::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::: CCDS56 IMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSIHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLATPTY 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 GDLNHLVSATMSGVTTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: CCDS56 GDLNHLVSATMSGVTTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYR 160 170 180 190 200 210 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 ALTVPELTQQMFDARNMMAACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFV ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::: CCDS56 ALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVATVFRGRMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFV 220 230 240 250 260 270 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 EWIPNNVKVAVCDIPPRGLKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEG :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::: CCDS56 EWIPNNVKVAVCDIPPRGLKMSSTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEG 280 290 300 310 320 330 410 420 430 440 pF1KE1 MDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG ::::::::::::::::::::::::::::.. : .::.::: CCDS56 MDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEMYEDDEEESEAQGPK 340 350 360 370 446 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 02:37:44 2016 done: Mon Nov 7 02:37:45 2016 Total Scan time: 2.550 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]