FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2705, 400 aa 1>>>pF1KE2705 400 - 400 aa - 400 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 63214209 residues in 88908 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5665+/-0.000506; mu= -3.4571+/- 0.031 mean_var=242.7688+/-49.413, 0's: 0 Z-trim(115.8): 152 B-trim: 321 in 2/53 Lambda= 0.082315 statistics sampled from 26849 (27002) to 26849 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16 Scan time: 9.960 The best scores are: opt bits E(88908) NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 2520 312.7 1e-84 NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 1638 208.0 3.8e-53 NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1592 202.6 1.8e-51 NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1573 200.3 8.5e-51 NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1562 199.0 2e-50 XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1543 196.7 9.5e-50 XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1543 196.7 9.9e-50 NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1523 194.3 5.1e-49 NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1522 194.2 5.2e-49 NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1424 182.7 2.1e-45 NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1420 182.1 2.6e-45 XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1422 182.4 2.7e-45 XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1322 170.5 8.3e-42 NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1322 170.5 8.7e-42 NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1309 168.9 2.3e-41 XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 1242 161.0 5.6e-39 NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 1242 161.0 5.6e-39 NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 1229 159.5 2.1e-38 NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 1219 158.2 3.7e-38 NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 1217 158.0 4.4e-38 XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 1216 157.9 4.7e-38 NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 1208 156.9 9.4e-38 NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 1207 156.8 9.9e-38 NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 1174 152.9 1.4e-36 NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 1174 152.9 1.4e-36 NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 1173 152.7 1.5e-36 NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1168 152.2 2.4e-36 XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 1157 150.9 5.7e-36 NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 1157 150.9 5.9e-36 NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 1156 150.8 6.8e-36 XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 1135 148.3 3.6e-35 XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 1122 146.7 1e-34 NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1113 145.6 2.2e-34 NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1113 145.6 2.2e-34 NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422) 1060 139.3 1.7e-32 NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 1052 138.4 3.3e-32 XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 1052 138.4 3.7e-32 NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 1027 135.5 2.9e-31 NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 1024 135.1 3.5e-31 NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 1000 132.2 2.5e-30 XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 700 96.5 9.2e-20 XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 700 96.5 9.2e-20 NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285) 700 96.5 9.2e-20 NP_001918 (OMIM: 125660,181400,601419,602067,60476 ( 470) 644 90.0 1.4e-17 NP_005373 (OMIM: 162250) neurofilament medium poly ( 916) 648 90.7 1.7e-17 XP_011523088 (OMIM: 602761) PREDICTED: keratin, ty ( 245) 631 88.2 2.4e-17 XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466) 634 88.8 3.1e-17 NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466) 634 88.8 3.1e-17 NP_001124491 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 431) 628 88.0 4.8e-17 NP_002046 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillary a ( 432) 628 88.0 4.8e-17 >>NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskeletal (400 aa) initn: 2520 init1: 2520 opt: 2520 Z-score: 1642.1 bits: 312.7 E(88908): 1e-84 Smith-Waterman score: 2520; 99.8% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. 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NP_000 SYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTATVDNANVL 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 LQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELA ::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: NP_000 LQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIESLKEELA 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 YLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFT :::::::::...:::::::.:.::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: NP_000 YLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWFF 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 SRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFG ..::::::::: ..: .: ..::...::::.:.:::::::::::::.::..: ::..:. NP_000 TKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYC 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 AQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYN :::.:: .:...: ::...: . :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. : NP_000 MQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAH-- 370 380 390 400 410 420 400 pF1KE2 NLSASKVL ::.:. NP_000 -LSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN 430 440 450 460 470 >>NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, type I (473 aa) initn: 1544 init1: 1544 opt: 1573 Z-score: 1033.3 bits: 200.3 E(88908): 8.5e-51 Smith-Waterman score: 1595; 60.8% identity (82.1% similar) in 429 aa overlap (7-397:6-434) 10 20 30 40 pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFGP---GVAFRAPSIHGGS---------- :: ...::. ::.:::: :.. : . :::: .::. NP_005 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSG 10 20 30 40 50 50 60 70 80 pF1KE2 ------GGRGVSVSSARFVSSSSSGGYGGG------------YGGVLTASDGLLAGNEKL :: : . ::. .:. .:::::: .:: ....::::.:.::. NP_005 GACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 TMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKIL :::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :. .::: :. ::.:::.::. NP_005 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 GATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEM .:::::.. .::::::::::::::::.: : :::..::::.::::::::::::::::::: NP_005 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 QIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQ ::::::::::::.::::::. .::::.::.:.::.:.:::.::..::..::.::: :::. NP_005 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 NRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALED ::.:::.:: :.:::::.:::...: .: ::::::.:::.::::::::::::::::.::. NP_005 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 TLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRS .: ::..:. ::..::.::...: ::...: . :.:.:::: :.:.:.:::::::::: NP_005 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR 360 370 380 390 400 410 390 400 pF1KE2 LLEGQEDHYNNLSASKVL ::::.. : .. .:: NP_005 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS 420 430 440 450 460 470 >>NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskeletal (456 aa) initn: 1500 init1: 1227 opt: 1562 Z-score: 1026.4 bits: 199.0 E(88908): 2e-50 Smith-Waterman score: 1622; 63.5% identity (85.4% similar) in 417 aa overlap (1-388:1-414) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLG--GGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSS ::. .. :.: .:.::: . :::. : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:. NP_002 MTT-TFLQTS-SSTFGGGSTRGGSLLAGGG-GFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 GGYGGG-------------------------YGGVLTASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA :::::: .:: . ..:: ::.::::.:::::::::: NP_002 GGYGGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLA 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGP-GPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI :::::::::: ::..:::::.:::::: : .: :::.:. ::..:::::...::.:::. NP_002 SYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRV 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL .:.:::::::::::: :.:.: :::..:::::::::::::::::::::::::::::.::: NP_002 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEEL 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 AYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWF ::::::::::.. . .:..:::.::.:.:::.::...:..:: :::.:::.::.:.:::: NP_002 AYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWF 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 TSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARF :.:::::.:::..::..: :..:.::::::.: :::::::::::::.::..::::: :. NP_002 FSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRY 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 GAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHY ..:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.::::::::::::::::. NP_002 ATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKM 360 370 380 390 400 410 400 pF1KE2 NNLSASKVL NP_002 AGIGIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI 420 430 440 450 >>XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, type I (437 aa) initn: 1484 init1: 730 opt: 1543 Z-score: 1014.5 bits: 196.7 E(88908): 9.5e-50 Smith-Waterman score: 1596; 62.6% identity (84.0% similar) in 420 aa overlap (5-388:4-421) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLG--GGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSS .. :.: .:.::: . :::. : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:. XP_016 MTTTFLQTS-SSTFGGGSTRGGSLLAGGG-GFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 GGYGGG-------------------------YGGVLTASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA :::::: .:: . ..:: ::.::::.:::::::::: XP_016 GGYGGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLA 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGP-GPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI :::::::::: ::..:::::.:::::: : .: :::.:. ::..:::::...::.:::. XP_016 SYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRV 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL .:.:::::::::::: :.:.: :::..:::::::::::::::::::::::::::::.::: XP_016 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEEL 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 pF1KE2 AYLKKNHEE-------EISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNR ::::::::: :.. . .:..:::.::.:.:::.::...:..:: :::.:::.:: XP_016 AYLKKNHEEWVPPILQEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNR 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 KDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTL .:.:::: :.:::::.:::..::..: :..:.::::::.: :::::::::::::.::..: XP_016 RDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSL 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 AETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLL :::: :...:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.::::::::::::: XP_016 AETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLL 360 370 380 390 400 410 390 400 pF1KE2 EGQEDHYNNLSASKVL :::. XP_016 EGQDAKMAGIAIREAYSFSL 420 430 >>XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, type I (463 aa) initn: 1484 init1: 730 opt: 1543 Z-score: 1014.1 bits: 196.7 E(88908): 9.9e-50 Smith-Waterman score: 1596; 62.6% identity (84.0% similar) in 420 aa overlap (5-388:4-421) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLG--GGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSS .. :.: .:.::: . :::. : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:. XP_011 MTTTFLQTS-SSTFGGGSTRGGSLLAGGG-GFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 GGYGGG-------------------------YGGVLTASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA :::::: .:: . ..:: ::.::::.:::::::::: XP_011 GGYGGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLA 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGP-GPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI :::::::::: ::..:::::.:::::: : .: :::.:. ::..:::::...::.:::. XP_011 SYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRV 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL .:.:::::::::::: :.:.: :::..:::::::::::::::::::::::::::::.::: XP_011 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEEL 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 pF1KE2 AYLKKNHEE-------EISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNR ::::::::: :.. . .:..:::.::.:.:::.::...:..:: :::.:::.:: XP_011 AYLKKNHEEWVPPILQEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNR 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 KDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTL .:.:::: :.:::::.:::..::..: :..:.::::::.: :::::::::::::.::..: XP_011 RDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSL 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 AETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLL :::: :...:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.::::::::::::: XP_011 AETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLL 360 370 380 390 400 410 390 400 pF1KE2 EGQEDHYNNLSASKVL :::. XP_011 EGQDAKMAGIAIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI 420 430 440 450 460 >>NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cytosk (458 aa) initn: 1494 init1: 1200 opt: 1523 Z-score: 1001.4 bits: 194.3 E(88908): 5.1e-49 Smith-Waterman score: 1539; 61.7% identity (82.3% similar) in 418 aa overlap (8-397:6-422) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPS---IHGGS-GGRGVSVSSARFVSSS :::..: ::.:::: ..: : . . : . ::: :: : .:: . : ... NP_705 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG-FGGGA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 SSG-------GYGGGYGGVLT---------------ASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLAS .:: : :::::: : : :: ::.::::.::::::::::: NP_705 GSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLAS 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 YLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPG-PSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIV ::.:::::: ::..::::::::. ::.:. : :::: :: ::..:::::: :::::.:.. NP_705 YLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVI 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 LQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELA :.:::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.:::: NP_705 LEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELA 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 YLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFT :.:::::::.. . .:: :::.::.:..:: ::...:..:: :::.:::.::.::: :: NP_705 YMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFH 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 SRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFG ... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :.. NP_705 AKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYA 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 AQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYN :: .::.:::.:::::...:.. : :::::. :.:::.::::::::::::::::. .. NP_705 LQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMI 360 370 380 390 400 410 400 pF1KE2 NLSASKVL .. .: NP_705 GFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP 420 430 440 450 >>NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cytosk (420 aa) initn: 1494 init1: 1200 opt: 1522 Z-score: 1001.3 bits: 194.2 E(88908): 5.2e-49 Smith-Waterman score: 1538; 62.8% identity (82.6% similar) in 409 aa overlap (8-388:6-413) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPS---IHGGS-GGRGVSVSSARFVSSS :::..: ::.:::: ..: : . . : . ::: :: : .:: . : ... NP_002 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG-FGGGA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 SSG-------GYGGGYGGVLT---------------ASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLAS .:: : :::::: : : :: ::.::::.::::::::::: NP_002 GSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLAS 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 YLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPG-PSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIV ::.:::::: ::..::::::::. ::.:. : :::: :: ::..:::::: :::::.:.. NP_002 YLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVI 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 LQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELA :.:::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.:::: NP_002 LEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELA 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 YLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFT :.:::::::.. . .:: :::.::.:..:: ::...:..:: :::.:::.::.::: :: NP_002 YMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFH 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 SRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFG ... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :.. NP_002 AKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYA 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 AQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYN :: .::.:::.:::::...:.. : :::::. :.:::.::::::::::::::::. NP_002 LQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKKR 360 370 380 390 400 410 400 pF1KE2 NLSASKVL NP_002 QPP 420 >>NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) keratin, (584 aa) initn: 1472 init1: 1088 opt: 1424 Z-score: 936.3 bits: 182.7 E(88908): 2.1e-45 Smith-Waterman score: 1440; 61.0% identity (83.2% similar) in 387 aa overlap (5-387:84-456) 10 20 30 pF1KE2 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAP :.: : ..::::: ::: :: : .: . NP_000 GGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGS--FGGG-SFGGG 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 SIHGGS-GGRGVSVSSARFVSSSSSGGYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLAS :. ::: :: : . .::.:::.:: . .. :::.::::.::::::::::: NP_000 SFGGGSFGGGGFG-----------GGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLAS 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 YLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG---PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSR ::::::::: .: ::: ::..::.:.: : ::::.:: ::.::...::. : .:. NP_000 YLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNAN 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 IVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEE :.:::::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::...:::::::.: :: NP_000 ILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEE 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 LAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAW :::::::::::.. ::. :.:.::...:::.::...:..:::::: .::::::::::: NP_000 LAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAW 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 FTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEAR :. ...::. :. .. ::.. .::.:.:::..:.:::::::::..: .:: .:::::.: NP_000 FNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGR 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 FGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDH . .::..::: ::..: :: ..::..: :: :::.:.::: :::.:: ::::::::. NP_000 YCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSS 400 410 420 430 440 450 400 pF1KE2 YNNLSASKVL NP_000 GGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSS 460 470 480 490 500 510 400 residues in 1 query sequences 63214209 residues in 88908 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Sep 21 11:31:06 2017 done: Thu Sep 21 11:31:08 2017 Total Scan time: 9.960 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]