FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3615, 340 aa 1>>>pF1KE3615 340 - 340 aa - 340 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6734+/-0.00129; mu= 8.9296+/- 0.075 mean_var=129.9873+/-28.332, 0's: 0 Z-trim(104.1): 194 B-trim: 26 in 2/50 Lambda= 0.112493 statistics sampled from 7484 (7709) to 7484 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16 Scan time: 1.910 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8564.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 ( 340) 2314 387.5 8.4e-108 CCDS73427.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 ( 339) 2289 383.5 1.4e-106 CCDS34.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 ( 340) 2019 339.6 2.2e-93 CCDS5703.1 GNB2 gene_id:2783|Hs108|chr7 ( 340) 1962 330.4 1.3e-90 CCDS3230.1 GNB4 gene_id:59345|Hs108|chr3 ( 340) 1952 328.8 4.1e-90 CCDS72685.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 ( 240) 1461 249.0 3e-66 CCDS45261.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 ( 353) 1234 212.2 5e-55 CCDS10149.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 ( 395) 1234 212.3 5.4e-55 CCDS34324.1 RACK1 gene_id:10399|Hs108|chr5 ( 317) 407 78.0 1.2e-14 CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2 ( 415) 404 77.6 2e-14 CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9 ( 334) 395 76.1 4.7e-14 CCDS59142.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9 ( 521) 393 75.9 8.2e-14 CCDS6791.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9 ( 522) 393 75.9 8.2e-14 CCDS3012.1 WDR5B gene_id:54554|Hs108|chr3 ( 330) 379 73.5 2.8e-13 CCDS43876.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9 ( 314) 372 72.3 5.9e-13 CCDS75898.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9 ( 315) 372 72.3 5.9e-13 CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4 ( 627) 353 69.5 8.4e-12 CCDS7547.1 TAF5 gene_id:6877|Hs108|chr10 ( 800) 353 69.6 1e-11 >>CCDS8564.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 (340 aa) initn: 2314 init1: 2314 opt: 2314 Z-score: 2048.9 bits: 387.5 E(32554): 8.4e-108 Smith-Waterman score: 2314; 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CCDS34 FATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDAL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN :..:.:.:.:::::::::::: :::::::::::::::::: CCDS34 KADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN 310 320 330 340 >>CCDS5703.1 GNB2 gene_id:2783|Hs108|chr7 (340 aa) initn: 1962 init1: 1962 opt: 1962 Z-score: 1740.2 bits: 330.4 E(32554): 1.3e-90 Smith-Waterman score: 1962; 80.6% identity (94.4% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYA :.:.::::::::::..:: ::::::.: ::.....::. :::.::::::::::::::::: CCDS57 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 MHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNM :::.:::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. CCDS57 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 CSIYNLKSREGNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTTCALWDIETGQQKTVF ::::.::.:::::.::::: .::::::::::::::.:.:::::::::::::::::: . : CCDS57 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 VGHTGDCMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEA .::.:: :::...:: :.::::::: ::::::.. ::::: ::::::::. ::::: : CCDS57 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 ICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICSITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSM . ::::::.::::::::::::. .::..:::.::::::: :::::.:::::::::.::.: CCDS57 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN :..:.:.:.:::::::::::: :::::::::::::::::: CCDS57 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN 310 320 330 340 >>CCDS3230.1 GNB4 gene_id:59345|Hs108|chr3 (340 aa) initn: 1952 init1: 1952 opt: 1952 Z-score: 1731.4 bits: 328.8 E(32554): 4.1e-90 Smith-Waterman score: 1952; 79.4% identity (95.0% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYA :.:.::::::::::..:: :::::: :.::....:... :::.::::::::::::::::: CCDS32 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 MHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNM :::. ::.::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::. CCDS32 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 CSIYNLKSREGNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTTCALWDIETGQQKTVF :::::::.:::::.::::: .:::::::::::::..:::::::::::::::::.:: :.: CCDS32 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 VGHTGDCMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEA .::.:: :::..:::. :.:::::::.::::.:.: :::.:::: :::::. ::::: : CCDS32 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 ICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICSITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSM . ::::::.::::::::::::. .::..:::.::::::: :::::.::::::::::::.. CCDS32 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN :..:.:.:.:::::::::::: ::::::::::::::.::: CCDS32 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN 310 320 330 340 >>CCDS72685.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 (240 aa) initn: 1461 init1: 1461 opt: 1461 Z-score: 1302.8 bits: 249.0 E(32554): 3e-66 Smith-Waterman score: 1461; 83.8% identity (96.2% similar) in 240 aa overlap (101-340:1-240) 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 VSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNMCSIYNLKSRE ::::::::::.::::::::.:::::::.:: CCDS72 MTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTRE 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 GNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTTCALWDIETGQQKTVFVGHTGDCMSL :::.:::::..::::::::::::::.:::::::::::::::::::: :.:.::::: ::: CCDS72 GNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSL 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 AVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEAICTGSDDASC ...:: ::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::.:. ::::::.: CCDS72 SLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATC 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 RLFDLRADQELICFSHESIICSITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSMKSERVGILSG :::::::::::. .::..:::.::::.:: :::::.::::::::::::..:..:.:.:.: CCDS72 RLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAG 160 170 180 190 200 210 320 330 340 pF1KE3 HDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN ::::::::::: :::::::::::::::::: CCDS72 HDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN 220 230 240 >>CCDS45261.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 (353 aa) initn: 1270 init1: 617 opt: 1234 Z-score: 1101.4 bits: 212.2 E(32554): 5e-55 Smith-Waterman score: 1234; 51.9% identity (76.2% similar) in 341 aa overlap (4-339:12-352) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLR . .:..:::.:: .. . : :: : ... .:..:. :.:::::. CCDS45 MATEGLHENETLASLKSEAESLKGKLEEERAKLHDVELHQVAERVEALGQFVMKTRRTLK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 GHLAKIYAMHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFV :: :. : : :.. .::.:::::.:::::.:::: ::. . .:::.::::::: . CCDS45 GHGNKVLCMDWCKDKRRIVSSSQDGKVIVWDSFTTNKEHAVTMPCTWVMACAYAPSGCAI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE3 ACGGLDNMCSIYNLK-SREGNVKVSRE-LSAHTGYLSCCRFLD-DNNIVTSSGDTTCALW ::::::: ::.: : ... :. .... .. ::.::: : : . : .:.:.::: ::::: CCDS45 ACGGLDNKCSVYPLTFDKNENMAAKKKSVAMHTNYLSACSFTNSDMQILTASGDGTCALW 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 DIETGQQKTVFVGHTGD--CMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHES :.:.:: : :: .: :..:: : : :.::.:: .: .::.: : : :.: ::: CCDS45 DVESGQLLQSFHGHGADVLCLDLAPSETGNTFVSGGCDKKAMVWDMRSGQCVQAFETHES 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 DINAICFFPNGEAICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICSITSVAFSLSGRLLFA :::.. ..:.:.:. .:::::.:::.:::::.:. .:.:::: . .:: :::::::::: CCDS45 DINSVRYYPSGDAFASGSDDATCRLYDLRADREVAIYSKESIIFGASSVDFSLSGRLLFA 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 GYDDFNCNVWDSMKSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN ::.:.. :::: .:. ::.:: ::.:::: : :. :: : .:::: :..: CCDS45 GYNDYTINVWDVLKGSRVSILFGHENRVSTLRVSPDGTAFCSGSWDHTLRVWA 310 320 330 340 350 >>CCDS10149.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 (395 aa) initn: 1270 init1: 617 opt: 1234 Z-score: 1100.7 bits: 212.3 E(32554): 5.4e-55 Smith-Waterman score: 1234; 51.9% identity (76.2% similar) in 341 aa overlap (4-339:54-394) 10 20 30 pF1KE3 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAEL . .:..:::.:: .. . : :: : .. CCDS10 RPVFKKSQQLSYCSTCAEIMATEGLHENETLASLKSEAESLKGKLEEERAKLHDVELHQV 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 VSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAI . .:..:. :.:::::.:: :. : : :.. .::.:::::.:::::.:::: ::. 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