Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4439
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4439, 456 aa
1>>>pF1KE4439 456 - 456 aa - 456 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4132+/-0.000966; mu= 16.8912+/- 0.058
mean_var=61.7593+/-12.661, 0's: 0 Z-trim(104.3): 33 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.163201
statistics sampled from 7829 (7843) to 7829 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4908.1 SLC29A1 gene_id:2030|Hs108|chr6 ( 456) 2969 707.8 5.7e-204
CCDS7310.1 SLC29A3 gene_id:55315|Hs108|chr10 ( 475) 773 190.8 2.6e-48
CCDS8137.1 SLC29A2 gene_id:3177|Hs108|chr11 ( 456) 625 155.9 7.8e-38
CCDS73326.1 SLC29A2 gene_id:3177|Hs108|chr11 ( 361) 620 154.7 1.4e-37
CCDS5340.1 SLC29A4 gene_id:222962|Hs108|chr7 ( 530) 263 70.7 4e-12
>>CCDS4908.1 SLC29A1 gene_id:2030|Hs108|chr6 (456 aa)
initn: 2969 init1: 2969 opt: 2969 Z-score: 3775.4 bits: 707.8 E(32554): 5.7e-204
Smith-Waterman score: 2969; 100.0% identity (100.0% similar) in 456 aa overlap (1-456:1-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTTSHQPQDRYKAVWLIFFMLGLGTLLPWNFFMTATQYFTNRLDMSQNVSLVTAELSKDA
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CCDS49 MTTSHQPQDRYKAVWLIFFMLGLGTLLPWNFFMTATQYFTNRLDMSQNVSLVTAELSKDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 QASAAPAAPLPERNSLSAIFNNVMTLCAMLPLLLFTYLNSFLHQRIPQSVRILGSLVAIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QASAAPAAPLPERNSLSAIFNNVMTLCAMLPLLLFTYLNSFLHQRIPQSVRILGSLVAIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LVFLITAILVKVQLDALPFFVITMIKIVLINSFGAILQGSLFGLAGLLPASYTAPIMSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LVFLITAILVKVQLDALPFFVITMIKIVLINSFGAILQGSLFGLAGLLPASYTAPIMSGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLAGFFASVAMICAIASGSELSESAFGYFITACAVIILTIICYLGLPRLEFYRYYQQLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 GLAGFFASVAMICAIASGSELSESAFGYFITACAVIILTIICYLGLPRLEFYRYYQQLKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EGPGEQETKLDLISKGEEPRAGKEESGVSVSNSQPTNESHSIKAILKNISVLAFSVCFIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 EGPGEQETKLDLISKGEEPRAGKEESGVSVSNSQPTNESHSIKAILKNISVLAFSVCFIF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TITIGMFPAVTVEVKSSIAGSSTWERYFIPVSCFLTFNIFDWLGRSLTAVFMWPGKDSRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 TITIGMFPAVTVEVKSSIAGSSTWERYFIPVSCFLTFNIFDWLGRSLTAVFMWPGKDSRW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LPSLVLARLVFVPLLLLCNIKPRRYLTVVFEHDAWFIFFMAAFAFSNGYLASLCMCFGPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LPSLVLARLVFVPLLLLCNIKPRRYLTVVFEHDAWFIFFMAAFAFSNGYLASLCMCFGPK
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE4 KVKPAEAETAGAIMAFFLCLGLALGAVFSFLFRAIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KVKPAEAETAGAIMAFFLCLGLALGAVFSFLFRAIV
430 440 450
>>CCDS7310.1 SLC29A3 gene_id:55315|Hs108|chr10 (475 aa)
initn: 819 init1: 209 opt: 773 Z-score: 980.8 bits: 190.8 E(32554): 2.6e-48
Smith-Waterman score: 890; 33.0% identity (67.5% similar) in 458 aa overlap (5-456:44-475)
10 20 30
pF1KE4 MTTSHQPQDRYKAVWLIFFMLGLGTLLPWNFFMT
..:.::. ....::: ::.:.:::::::.:
CCDS73 NSTYRTTSSSLRADQEALLEKLLDRPPPGLQRPEDRFCGTYIIFFSLGIGSLLPWNFFIT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 ATQYFTNRLDMSQNVSLVTAELSKDAQASAAPAAPL-PERNSLSAIFNNVMTLCAMLPLL
: .:. .: . :..::. :: ... :.. ... . .: .
CCDS73 AKEYWMFKL-----------------RNSSSPATGEDPEGSDILNYFESYLAVASTVPSM
80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 LFTYLNSFLHQRIPQSVRILGSLVAILLVFLITAILVKVQLDALP--FFVITMIKIVLIN
: : .: .:. .:.:.::..:: .:.. . ::::. .. ::..:.. .:...
CCDS73 LCLVANFLLVNRVAVHIRVLASLTVILAIFMVITALVKVDTSSWTRGFFAVTIVCMVILS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 SFGAILQGSLFGLAGLLPASYTAPIMSGQGLAGFFASVAMICAIASGSELSESAFGYFIT
. ......:..:..: .: . ..:: ...: ..:: . .:..:.. .::...:.:
CCDS73 GASTVFSSSIYGMTGSFPMRNSQALISGGAMGGTVSAVASLVDLAASSDVRNSALAFFLT
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 ACAVIILTIICYLGLPRLEFYRYYQQLKLEGPGEQETKLDLISKGEEPRAGKEESGVSVS
: . ..: . :: : :::. :::.. : . . .::: :. ::.
CCDS73 ATVFLVLCMGLYLLLSRLEYARYYMRPVLAAH---------VFSGEEELPQDSLSAPSVA
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE4 NSQPTNESHSIKAILKNISVLAFSVCFIFTITIGMFPAVTVEVKSSIAGS-STWE-RYFI
. ... .. :::. . :.: : ..: :: ..::. ....: :: : : ..::
CCDS73 SRFIDSHTPPLRPILKKTASLGFCVTYVFFITSLIYPAICTNIESLNKGSGSLWTTKFFI
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 PVSCFLTFNIFDWLGRSLTAVFMWPGKDSRWLPSLVLARLVFVPLLLLCNIKPRRYL-TV
:.. :: .:. : ::.::: .. :: .:. ::..:: : ..::..::: .:: .: ::
CCDS73 PLTTFLLYNFADLCGRQLTAWIQVPGPNSKALPGFVLLRTCLIPLFVLCNYQPRVHLKTV
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VFEHDAWFIFFMAAFAFSNGYLASLCMCFGPKKVKPAEAETAGAIMAFFLCLGLALGAVF
::. :.. .. . ...:::::..: . .::: : ::..:..:.:..::::.::..
CCDS73 VFQSDVYPALLSSLLGLSNGYLSTLALLYGPKIVPRELAEATGVVMSFYVCLGLTLGSAC
410 420 430 440 450 460
450
pF1KE4 SFLFRAIV
: :. ..
CCDS73 STLLVHLI
470
>>CCDS8137.1 SLC29A2 gene_id:3177|Hs108|chr11 (456 aa)
initn: 1238 init1: 616 opt: 625 Z-score: 792.7 bits: 155.9 E(32554): 7.8e-38
Smith-Waterman score: 1358; 47.1% identity (73.0% similar) in 471 aa overlap (1-456:1-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTTSHQPQDRYKAVWLIFFMLGLGTLLPWNFFMTATQYFTNRLDMSQNVSLVTAELSKDA
:. . :.: :. : . ::.::::::::::::.:: :: :: . : ::..
CCDS81 MARGDAPRDSYHLVGISFFILGLGTLLPWNFFITAIPYFQARLAGAGNS---TARI----
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 QASAAPAAPLPERNSLSAIFNNVMTLCAMLPLLLFTYLNSFLHQRIPQSVRILGSLVAIL
:. ..: : ::: .:: ..::::::: :::::.: .:..:::::::.:::
CCDS81 -LSTNHTGPEDAFN-----FNNWVTLLSQLPLLLFTLLNSFLYQCVPETVRILGSLLAIL
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LVFLITAILVKVQLDALPFFVITMIKIVLINSFGAILQGSLFGLAGLLPASYTAPIMSGQ
:.: .:: ::::... ::: ::: .. .::::.:.::::::: : .:..:.. ..:::
CCDS81 LLFALTAALVKVDMSPGPFFSITMASVCFINSFSAVLQGSLFGQLGTMPSTYSTLFLSGQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLAGFFASVAMICAIASGSELSESAFGYFITACAVIILTIICYLGLPRLEFYRYYQQLKL
::::.::..::. ..::: . ::.::::: :. :...:.:::.::.:.: ::: :
CCDS81 GLAGIFAALAMLLSMASGVDAETSALGYFITPCVGILMSIVCYLSLPHLKFARYYLANKS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280
pF1KE4 EGPGEQE--TKLDLISKGEE--PRAGKEESGVSVS---NSQPTNESH--------SIKAI
:: :: .:... :. : .. .. ..... ...: .: :. ..
CCDS81 SQAQAQELETKAELLQSDENGIP-SSPQKVALTLDLDLEKEPESEPDEPQKPGKPSVFTV
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LKNISVLAFSVCFIFTITIGMFPAVTVEVKSSIAGSSTWERYFIPVSCFLTFNIFDWLGR
...: . :. . ..::.:...:::.:. : :: .. . : ..: :. ::: :::.:::::
CCDS81 FQKIWLTALCLVLVFTVTLSVFPAITAMVTSS-TSPGKWSQFFNPICCFLLFNIMDWLGR
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 SLTAVFMWPGKDSRWLPSLVLARLVFVPLLLLCNIKPRRYLTVVFEHDAWFIFFMAAFAF
:::. :.:: .::: :: :: :..::::..::.. : : ..: .::.:: :: ::
CCDS81 SLTSYFLWPDEDSRLLPLLVCLRFLFVPLFMLCHVPQRSRLPILFPQDAYFITFMLLFAV
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KE4 SNGYLASLCMCFGPKKVKPAEAETAGAIMAFFLCLGLALGAVFSFLFRAIV
:::::.:: ::..:..: : : :.:::.:.::: :::. :: .::::.:..
CCDS81 SNGYLVSLTMCLAPRQVLPHEREVAGALMTFFLALGLSCGASLSFLFKALL
410 420 430 440 450
>>CCDS73326.1 SLC29A2 gene_id:3177|Hs108|chr11 (361 aa)
initn: 775 init1: 616 opt: 620 Z-score: 788.0 bits: 154.7 E(32554): 1.4e-37
Smith-Waterman score: 756; 50.6% identity (72.5% similar) in 255 aa overlap (1-253:1-242)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTTSHQPQDRYKAVWLIFFMLGLGTLLPWNFFMTATQYFTNRLDMSQNVSLVTAELSKDA
:. . :.: :. : . ::.::::::::::::.:: :: :: . : ::..
CCDS73 MARGDAPRDSYHLVGISFFILGLGTLLPWNFFITAIPYFQARLAGAGN---STARI----
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 QASAAPAAPLPERNSLSAIFNNVMTLCAMLPLLLFTYLNSFLHQRIPQSVRILGSLVAIL
:. ..: : ::: .:: ..::::::: :::::.: .:..:::::::.:::
CCDS73 -LSTNHTGPEDAFN-----FNNWVTLLSQLPLLLFTLLNSFLYQCVPETVRILGSLLAIL
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LVFLITAILVKVQLDALPFFVITMIKIVLINSFGAILQGSLFGLAGLLPASYTAPIMSGQ
:.: .:: ::::... ::: ::: .. .::::.:.::::::: : .:..:.. ..:::
CCDS73 LLFALTAALVKVDMSPGPFFSITMASVCFINSFSAVLQGSLFGQLGTMPSTYSTLFLSGQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLAGFFASVAMICAIASGSELSESAFGYFITACAVIILTIICYLGLPRLEFYRYYQQLKL
::::.::..::. ..::: . ::.::::: :. :...:.:::.::.:.: ::: :
CCDS73 GLAGIFAALAMLLSMASGVDAETSALGYFITPCVGILMSIVCYLSLPHLKFARYYLANKS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE4 EGPGEQE--TKLDLISKGEEPRAGKEESGVSVSNSQPTNESHSIKAILKNISVLAFSVCF
:: :: .:.
CCDS73 SQAQAQELETKAELLQSDLADSAVPCVGLHSHPVRLPRHHSHGDQLHQSWEVESVLQPHL
230 240 250 260 270 280
>>CCDS5340.1 SLC29A4 gene_id:222962|Hs108|chr7 (530 aa)
initn: 340 init1: 114 opt: 263 Z-score: 331.1 bits: 70.7 E(32554): 4e-12
Smith-Waterman score: 382; 24.9% identity (54.3% similar) in 486 aa overlap (7-450:63-503)
10 20 30
pF1KE4 MTTSHQPQDRYKAVWLIFFMLGLGTLLPWNFFMTAT
:.:::.:... ... :.: :::.: :.: .
CCDS53 LEEAAEAAQGQGLRARGVPAFTDTTLDEPVPDDRYHAIYFAMLLAGVGFLLPYNSFITDV
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 QYFTNRLDMSQNVSLVTAELSKDAQASAAPAAPLPERNSLSAIFNNVMTLCAMLPLLLFT
.:. .. :.. : .:. :.: .: : .
CCDS53 DYLHHKY----------------------PGT--------SIVFD--MSLTYILVALAAV
100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 YLNSFLHQRIPQSVRIL-GSLVAILLVFLITAILVKVQL-DALPFFVITMIKIVLINSFG
::. : .:. .:: : :.:. ...:. : .:: . ..:.. . . .::
CCDS53 LLNNVLVERLTLHTRITAGYLLALGPLLFISICDVWLQLFSRDQAYAINLAAVGTV-AFG
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 -AILQGSLFGLAGLLPASYTAPIMSGQGLAGFFASVAMICAIASGSELSESAFGYFITAC
.. :.:..: .:.:: :: .:.:.. :: . :.. : . . :.. .:...
CCDS53 CTVQQSSFYGYTGMLPKRYTQGVMTGESTAGVMISLSRILTKLLLPDERASTLIFFLVSV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250
pF1KE4 AVIILTIICYLGLPRLEFYRYYQQLKLEG----PGE-----QETKLDLISKG---EEP--
:. .: .. .: . : .: .: .. :: ... :... :.:
CCDS53 ALELLCFLLHLLVRRSRFVLFYTTRPRDSHRGRPGLGRGYGYRVHHDVVAGDVHFEHPAP
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290
pF1KE4 -----RAGKEESGVSVSNS----------QPTNESH--SIKAILKNISVLA-------FS
.. :. . :..: .: . ...:.: . :.: .:
CCDS53 ALAPNESPKDSPAHEVTGSGGAYMRFDVPRPRVQRSWPTFRALLLHRYVVARVIWADMLS
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 VCFIFTITIGMFPAVTVEVKSSIAGSSTWERYFIPVSCFLTFNIFDWLGRSLTAVFM-WP
. . ::. .::.. :.. : : : .:. . .::. :..:. :.:. . :
CCDS53 IAVTYFITLCLFPGLESEIRHCILG--EW----LPILIMAVFNLSDFVGKILAALPVDWR
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 GKDSRWLPSLVLARLVFVPLLLLCNIKPRRYLTVVFEHDAWFIFFMAAFAFSNGYLASLC
: .. : : :.::.::..:: . : . ...: :: .: ...::::..:.
CCDS53 G--THLLACSCL-RVVFIPLFILC-VYPSGM--PALRHPAWPCIFSLLMGISNGYFGSVP
420 430 440 450 460
420 430 440 450
pF1KE4 MCFGPKKVKPAEAETAGAIMAFFLCLGLALGAVFSFLFRAIV
: .. ::.: . : :: :. ::.::.. ..
CCDS53 MILAAGKVSPKQRELAGNTMTVSYMSGLTLGSAVAYCTYSLTRDAHGSCLHASTANGSIL
470 480 490 500 510 520
CCDS53 AGL
530
456 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:38:31 2016 done: Sun Nov 6 00:38:32 2016
Total Scan time: 3.060 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]