Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1035
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1035, 428 aa
1>>>pF1KE1035 428 - 428 aa - 428 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7739+/-0.000986; mu= 15.0393+/- 0.059
mean_var=70.3444+/-14.296, 0's: 0 Z-trim(103.7): 72 B-trim: 5 in 2/49
Lambda= 0.152918
statistics sampled from 7446 (7518) to 7446 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 2817 630.9 7.3e-181
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 2594 581.7 4.7e-166
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 888 205.3 9e-53
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 884 204.4 1.7e-52
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 874 202.2 7.6e-52
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 838 194.3 2.2e-49
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 782 182.0 1.8e-45
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 732 170.9 2.3e-42
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 724 169.1 8.1e-42
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 716 167.4 2.7e-41
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 688 161.3 3.1e-39
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 676 158.5 9.9e-39
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 673 157.9 2e-38
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 660 155.0 1.1e-37
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 644 151.5 1.6e-36
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 644 151.5 1.6e-36
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 644 151.5 1.7e-36
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 646 152.1 2.4e-36
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 646 152.1 2.4e-36
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 640 150.6 3.9e-36
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 634 149.3 7.2e-36
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 600 141.7 1.1e-33
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 588 139.2 1.1e-32
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 578 137.0 7.3e-32
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 570 135.3 2.3e-31
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 570 135.3 2.3e-31
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 566 134.4 3.7e-31
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 566 134.4 3.7e-31
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 565 134.1 3.7e-31
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 546 129.9 6.7e-30
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 546 129.9 6.7e-30
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 532 126.8 5.8e-29
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 526 125.5 1.5e-28
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 526 125.6 1.9e-28
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 522 124.6 2.7e-28
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 522 124.6 2.8e-28
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 519 123.9 4.1e-28
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 518 123.7 5.2e-28
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 478 114.9 2.1e-25
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 478 114.9 2.4e-25
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 478 114.9 2.5e-25
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 478 114.9 2.5e-25
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 443 107.2 5.3e-23
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 443 107.2 5.7e-23
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 415 101.0 3.9e-21
CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 409 99.7 7.1e-21
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 405 98.9 2e-20
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 346 85.8 1.3e-16
CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 547) 335 83.3 6.2e-16
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 298 75.2 1.9e-13
>>CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 (428 aa)
initn: 2817 init1: 2817 opt: 2817 Z-score: 3360.5 bits: 630.9 E(32554): 7.3e-181
Smith-Waterman score: 2817; 100.0% identity (100.0% similar) in 428 aa overlap (1-428:1-428)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDI
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SSYIEQTR
::::::::
CCDS46 SSYIEQTR
>>CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 (427 aa)
initn: 2585 init1: 2519 opt: 2594 Z-score: 3094.6 bits: 581.7 E(32554): 4.7e-166
Smith-Waterman score: 2594; 90.0% identity (97.7% similar) in 428 aa overlap (1-428:1-427)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
:::.::.:.:::: :.: : : ... :: :::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAEQDVENDLLDY-DEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.:::::
CCDS12 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALA
:::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::.
CCDS12 HTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCR
::.:..::..:::.::::::::::::::::::::::.:::::: :::::::::.::::::
CCDS12 RNRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRC
::::::::.::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS12 KFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRC
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAF
.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS12 MALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVF
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::
CCDS12 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDI
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 SSYIEQTR
:.::::.:
CCDS12 STYIEQSR
420
>>CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 (407 aa)
initn: 798 init1: 411 opt: 888 Z-score: 1060.9 bits: 205.3 E(32554): 9e-53
Smith-Waterman score: 888; 38.9% identity (73.0% similar) in 370 aa overlap (47-415:35-400)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 EVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI
: :. :: :::.: :::.:: .:.. :
CCDS32 SADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERF
: :.::. ::.:: ::::.:... ::::: ....::. ::::: ::.: .
CCDS32 IPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILAL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 SKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILD
. :: .. . .:: ..... . :. . ::::::::::.. . . :. : :: :.::
CCDS32 GDYM-GATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLD
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETK
: :.:: . .. .. :::. ::...:::. .. : .:::.::..:.: : .
CCDS32 EADEMLSR-GFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE-E
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 LTLHGLQQYYVKLKDNE-KNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAI
:::.:..:.:.... .: : : :: ..: ..:.:::... .. :.. . ..: .
CCDS32 LTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVS
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 AIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRV
:.: : :.:: ...:.. . :.:..:.:..::.:...:....:::.: . ..:.::.
CCDS32 ALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRI
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420
pF1KE1 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR
.:.:::: ::.::.::..: : .:: :.. ..... :.:
CCDS32 GRGGRFGRKGVAINFVTEE-DKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI
370 380 390 400
>>CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 (411 aa)
initn: 766 init1: 408 opt: 884 Z-score: 1056.1 bits: 204.4 E(32554): 1.7e-52
Smith-Waterman score: 884; 38.1% identity (73.0% similar) in 370 aa overlap (47-415:40-404)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 EVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI
: . :. .:::.: :::.:: .:.. :
CCDS11 SGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELAFQISKEYERF
: : : ::. :..:: ::::.: ...:: :. . ....:.. ::::: ::.: .
CCDS11 KQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLAL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 SKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLNLKHIKHFILD
. :: ::. . .:: .. .: . : . :.:.:::::.. . : .:: . :: ..::
CCDS11 GDYM-NVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYG-QHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLD
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETK
: :.::.. ..... ...:. : ::...:::: .:: . ::: ::..:.: . .
CCDS11 EADEMLNK-GFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRD-E
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 LTLHGLQQYYVKLKDNE-KNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCIALAQLLVEQNFPAI
:::.:..:..: .. .: : : :: :.: ..:.::: .. .. :.. . : :: .
CCDS11 LTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVS
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 AIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAFNYDMPEDSDTYLHRV
..: :::.:: : ...:.. :.:..:....::.:. .:.. .:::.:.. . :.::.
CCDS11 SMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRI
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420
pF1KE1 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR
.:.::.: ::.::.::... : .:: :... . ..:.:.:
CCDS11 GRSGRYGRKGVAINFVKND-DIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
370 380 390 400 410
>>CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 (406 aa)
initn: 780 init1: 405 opt: 874 Z-score: 1044.2 bits: 202.2 E(32554): 7.6e-52
Smith-Waterman score: 874; 37.1% identity (72.3% similar) in 394 aa overlap (23-415:13-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
: :: : : . ..... : .: : :. :. :::.:
CCDS11 MSASQDSRSRDNGPDGME-P-EGVIESNWNEIVDS-FDDMNLSESLLRGI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMC
:::.:: .:.. : : :.::. ::.:: ::::.:... :::.: ...::.
CCDS11 YAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLA
50 60 70 80 90 100
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CCDS11 PTRELAQQIQKVVMALGDYM-GASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDML
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CCDS11 NRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSR-GFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTK
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pF1KE1 KFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNE-KNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQR
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CCDS11 KFMRDPIRILVKKE-ELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRK
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CCDS11 VDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLV
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pF1KE1 FNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEID
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CCDS11 INYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEE-DKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVA
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420
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CCDS11 DLI
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40 50 60 70 80
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CCDS44 RAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMA
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:: ... : : . :.:..:::::: : .. .. :.. ..::: ::.: : :.
CCDS44 TTGGTNLRDDIMRLD-DTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQ-DF
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CCDS44 VQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEE--LTLKGVTQYYA
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270 280 290 300 310 320
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CCDS44 YVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRN
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330 340 350 360 370 380
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CCDS44 RVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLA
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390 400 410 420
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CCDS44 INLIT-YDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP
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CCDS84 RPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIA
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CCDS84 VQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKK-C-HIAVGSPGRIKQLIELDYLN
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CCDS84 PGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDP
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250 260 270 280 290
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CCDS84 TFVRLNS-SDPSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHS
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CCDS84 RAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNL
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CCDS84 VVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPI
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420
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:. .:.
CCDS84 P-SGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNN
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CCDS86 MDEADRILN-MDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAVSSK
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: .: : : .::. ..:: : ::.::.. .::.:: .:... :.:.: : :.::
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CCDS86 VGRTARAGRSGKAITFVT-QYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEAQRF
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. :: : ... . . : :.: . ..:.. ....::.::. .::.:.:.:.
CCDS10 KTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVS
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CCDS10 VVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKI
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420
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CCDS10 ERLDTDDLDEIEKIAN
470
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CCDS10 EEKEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKS--FEELRLKPQLLQGVY
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pF1KE1 DCGFEHPSEVQHECIPQAIL--GMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVM
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CCDS10 AMGFNRPSKIQENALPMMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVEPSDRYPQCLCL
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CCDS10 SPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQ----IVIGTPGTVLDW
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CCDS10 CSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKF
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pF1KE1 CRKFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKD-NEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSV
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CCDS10 AQKVVPDPNVIKLKREEE-TLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTR
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CCDS10 KTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVS
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CCDS10 VVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKI
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CCDS10 ERLDTDDLDEIEKIAN
470
428 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]