Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5207
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5207, 529 aa
1>>>pF1KB5207 529 - 529 aa - 529 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0397+/-0.000398; mu= 15.0855+/- 0.025
mean_var=75.7814+/-14.525, 0's: 0 Z-trim(112.2): 14 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.147331
statistics sampled from 20974 (20987) to 20974 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 9.000
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001677 (OMIM: 102910) ATP synthase subunit beta ( 529) 3376 727.3 2.8e-209
NP_001244264 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synt ( 503) 377 89.8 2.1e-17
NP_001001935 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synt ( 503) 377 89.8 2.1e-17
NP_004037 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synthas ( 553) 377 89.8 2.3e-17
NP_001001937 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synt ( 553) 377 89.8 2.3e-17
XP_016881278 (OMIM: 164360,615228,616045) PREDICTE ( 586) 377 89.8 2.4e-17
NP_001684 (OMIM: 124480,606939,616455) V-type prot ( 511) 368 87.9 7.9e-17
NP_001683 (OMIM: 192132,267300) V-type proton ATPa ( 513) 361 86.4 2.2e-16
XP_011531209 (OMIM: 192132,267300) PREDICTED: V-ty ( 553) 357 85.6 4.3e-16
NP_001681 (OMIM: 607027) V-type proton ATPase cata ( 617) 337 81.3 9e-15
NP_001244263 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synt ( 531) 280 69.2 3.5e-11
>>NP_001677 (OMIM: 102910) ATP synthase subunit beta, mi (529 aa)
initn: 3376 init1: 3376 opt: 3376 Z-score: 3878.2 bits: 727.3 E(85289): 2.8e-209
Smith-Waterman score: 3376; 100.0% identity (100.0% similar) in 529 aa overlap (1-529:1-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAAT
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NP_001 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RGQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 REGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHMGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHMGK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB5 LVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHSS
490 500 510 520
>>NP_001244264 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synthase (503 aa)
initn: 277 init1: 214 opt: 377 Z-score: 433.5 bits: 89.8 E(85289): 2.1e-17
Smith-Waterman score: 394; 25.1% identity (56.3% similar) in 435 aa overlap (115-526:70-485)
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 ALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGR
:.. :.. :. : .:: . .::: : :::
NP_001 VQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGR
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 IMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIG
.....:. :: .::: .: . .:: .. .: . ::::.:: :.: ..: .
NP_001 VVDALGNAIDGKGPIGSKTRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQREL
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KB5 LFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVI
..: .::: . .. : : . . : : .....:.. .: ... ..
NP_001 IIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA---
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 NLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGS
:: . . .: . .. . . .: ...:::::. :. .:.. :.. . . :
NP_001 ---DAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYR
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 EVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAP
..: :: : :. .: . . . :: . . ::.:.. .: . : :.. :
NP_001 QMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIP
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 ATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDY
..... :. : . :: ::.. :.::. . . .. . . :..:. : .:
NP_001 TNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQY
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480
pF1KB5 KSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVP
. . .: .: : :. . .::. .. ..:.: :. ::: ...: : :
NP_001 REVA-AFAQFGSD-LDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDK
400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KB5 LKET-IKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKAD-KLAEEHSS
:. . : :.. . .:. : ..: : .:: :..:.
NP_001 LEPSKITKFENAF---LSHVVSQHQALLGTI-----RADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAG
450 460 470 480 490 500
NP_001 FEA
>>NP_001001935 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synthase (503 aa)
initn: 277 init1: 214 opt: 377 Z-score: 433.5 bits: 89.8 E(85289): 2.1e-17
Smith-Waterman score: 394; 25.1% identity (56.3% similar) in 435 aa overlap (115-526:70-485)
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 ALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGR
:.. :.. :. : .:: . .::: : :::
NP_001 VQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGR
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 IMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIG
.....:. :: .::: .: . .:: .. .: . ::::.:: :.: ..: .
NP_001 VVDALGNAIDGKGPIGSKTRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQREL
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KB5 LFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVI
..: .::: . .. : : . . : : .....:.. .: ... ..
NP_001 IIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA---
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 NLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGS
:: . . .: . .. . . .: ...:::::. :. .:.. :.. . . :
NP_001 ---DAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYR
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 EVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAP
..: :: : :. .: . . . :: . . ::.:.. .: . : :.. :
NP_001 QMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIP
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 ATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDY
..... :. : . :: ::.. :.::. . . .. . . :..:. : .:
NP_001 TNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQY
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480
pF1KB5 KSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVP
. . .: .: : :. . .::. .. ..:.: :. ::: ...: : :
NP_001 REVA-AFAQFGSD-LDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDK
400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KB5 LKET-IKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKAD-KLAEEHSS
:. . : :.. . .:. : ..: : .:: :..:.
NP_001 LEPSKITKFENAF---LSHVVSQHQALLGTI-----RADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAG
450 460 470 480 490 500
NP_001 FEA
>>NP_004037 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synthase su (553 aa)
initn: 277 init1: 214 opt: 377 Z-score: 432.9 bits: 89.8 E(85289): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 397; 24.1% identity (55.2% similar) in 560 aa overlap (7-526:5-535)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAA-PTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAA
::::: . . :: : :. : : .. .:.. :... :.:.:
NP_004 MLSVRVAAAVVRALPRR---------AGLVSRNALGSSFIAARNFHASNTHLQKTGTA
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB5 TGRIVA---VIGAVVDVQFDE---------GLPPILNALEVQGRE----TRLVLEVAQHL
. ..:: ..:...: :. . . .::..: . . .. .:
NP_004 EMSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNL
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQ
..: .... :.. :.. :. : .:: . .::: : :::.....:. :: .::: .:
NP_004 EPDNVGVVVF-GNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKT
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN
. .:: .. .: . ::::.:: :.: ..: . ..: .::: . .. : :
NP_004 RRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIIN
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB5 VAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEP
. . : : .....:.. .: ... .. :: . . .: . ..
NP_004 QKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA------DAMKYTIVVSATASDA
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 PGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTL
. . .: ...:::::. :. .:.. :.. . . : ..: :: : :. .: .
NP_004 APLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDV
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 ATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAE
. . :: . . ::.:.. .: . : :.. :..... :. : .
NP_004 FYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFY
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 LGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDYKSLQDIIAILGMDELSEED
:: ::.. :.::. . . .. . . :..:. : .:. . .: .: : :.
NP_004 KGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVA-AFAQFGSD-LDAAT
410 420 430 440 450
460 470 480 490 500
pF1KB5 KLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVPLKET-IKGFQQILAGEYDH
. .::. .. ..:.: :. ::: ...: : : :. . : :.. . .:
NP_004 QQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAF---LSH
460 470 480 490 500 510
510 520
pF1KB5 LPEQAFYMVGPIEEAVAKAD-KLAEEHSS
. : ..: : .:: :..:.
NP_004 VVSQHQALLGTI-----RADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAGFEA
520 530 540 550
>>NP_001001937 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synthase (553 aa)
initn: 277 init1: 214 opt: 377 Z-score: 432.9 bits: 89.8 E(85289): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 397; 24.1% identity (55.2% similar) in 560 aa overlap (7-526:5-535)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAA-PTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAA
::::: . . :: : :. : : .. .:.. :... :.:.:
NP_001 MLSVRVAAAVVRALPRR---------AGLVSRNALGSSFIAARNFHASNTHLQKTGTA
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB5 TGRIVA---VIGAVVDVQFDE---------GLPPILNALEVQGRE----TRLVLEVAQHL
. ..:: ..:...: :. . . .::..: . . .. .:
NP_001 EMSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNL
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQ
..: .... :.. :.. :. : .:: . .::: : :::.....:. :: .::: .:
NP_001 EPDNVGVVVF-GNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKT
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN
. .:: .. .: . ::::.:: :.: ..: . ..: .::: . .. : :
NP_001 RRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIIN
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB5 VAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEP
. . : : .....:.. .: ... .. :: . . .: . ..
NP_001 QKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA------DAMKYTIVVSATASDA
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 PGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTL
. . .: ...:::::. :. .:.. :.. . . : ..: :: : :. .: .
NP_001 APLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDV
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 ATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAE
. . :: . . ::.:.. .: . : :.. :..... :. : .
NP_001 FYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFY
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 LGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDYKSLQDIIAILGMDELSEED
:: ::.. :.::. . . .. . . :..:. : .:. . .: .: : :.
NP_001 KGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVA-AFAQFGSD-LDAAT
410 420 430 440 450
460 470 480 490 500
pF1KB5 KLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVPLKET-IKGFQQILAGEYDH
. .::. .. ..:.: :. ::: ...: : : :. . : :.. . .:
NP_001 QQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAF---LSH
460 470 480 490 500 510
510 520
pF1KB5 LPEQAFYMVGPIEEAVAKAD-KLAEEHSS
. : ..: : .:: :..:.
NP_001 VVSQHQALLGTI-----RADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAGFEA
520 530 540 550
>>XP_016881278 (OMIM: 164360,615228,616045) PREDICTED: A (586 aa)
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Smith-Waterman score: 396; 24.0% identity (55.1% similar) in 546 aa overlap (7-513:5-526)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAA-PTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAA
::::: . . :: : :. : : .. .:.. :... :.:.:
XP_016 MLSVRVAAAVVRALPRR---------AGLVSRNALGSSFIAARNFHASNTHLQKTGTA
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB5 TGRIVA---VIGAVVDVQFDE---------GLPPILNALEVQGRE----TRLVLEVAQHL
. ..:: ..:...: :. . . .::..: . . .. .:
XP_016 EMSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNL
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 GESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQ
..: .... :.. :.. :. : .:: . .::: : :::.....:. :: .::: .:
XP_016 EPDNVGVVVF-GNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKT
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN
. .:: .. .: . ::::.:: :.: ..: . ..: .::: . .. : :
XP_016 RRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIIN
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
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. . : : .....:.. .: ... .. :: . . .: . ..
XP_016 QKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA------DAMKYTIVVSATASDA
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 PGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTL
. . .: ...:::::. :. .:.. :.. . . : ..: :: : :. .: .
XP_016 APLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDV
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 ATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAE
. . :: . . ::.:.. .: . : :.. :..... :. : .
XP_016 FYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFY
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pF1KB5 LGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDYKSLQDIIAILGMDELSEED
:: ::.. :.::. . . .. . . :..:. : .:. . .: .: : :.
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. .::. .. ..:.: :. ::: ...: : : :. . : :.. . .:
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460 470 480 490 500 510
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pF1KB5 LPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHSS
. : ..: :
XP_016 VVSQHQALLGTIRYECNCWHLFLKLCLRYEVKIIFKSVVRLVIKTFSRSELTTCFYFQIG
520 530 540 550 560 570
>>NP_001684 (OMIM: 124480,606939,616455) V-type proton A (511 aa)
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10 20 30 40 50
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: . .: .: . . : :. :.: .: . :. ...
NP_001 MALRAMRGIVNGAAPELPVPTGGPAVGAREQALAVSRNYLSQPRLTYKTVSGV
10 20 30 40 50
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pF1KB5 TGRIVAVIGAVVD-VQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEG
.: .: ..: :.: . . .: ... ::::. : ..: . ..:: :
NP_001 NGPLV-----ILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVS---GSKAVVQV-FEGTSG
60 70 80 90 100
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pF1KB5 LVRGQKVLD-SGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIK-TKQFAPIHAEAPEFMEM
. . . .: .. ::. . :::..: :.::: :::. ...: : .. . .
NP_001 IDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPID-RGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCR
110 120 130 140 150 160
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pF1KB5 SVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN---VAKAHG--GYS
.:.. :::...: . :.: :: .:..::. .. . .. . : :.. ::
NP_001 IYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYS
170 180 190 200 210 220
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pF1KB5 ------VFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALT
:::..: . . . .. :.: .. .: : . :.: : .
NP_001 EENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMD------NVCLFLNLANDPTIERIITPRL
230 240 250 260 270
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pF1KB5 GLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQER
.::.::.. : . ::... .. ...: :::: ..:. :. . ::..:. ::
NP_001 ALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYER
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 ITTT--KKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDS
. ..::::.. . .: ::.: : : : .. ..: . . ::: .. : :
NP_001 AGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPS
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 TSRIMDPNI----VGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARK
::.: : . ..: ::. . :..: . :..: . :. .: : . .:
NP_001 LSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQK
400 410 420 430 440 450
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pF1KB5 IQR-FLSQ-PFQVAEVF-TGHMG----KLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGP
..: :..: :.. :: : .: .. : :: .: . : .:.
NP_001 FERNFIAQGPYENRTVFETLDIGWQLLRIFP-KEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH
460 470 480 490 500 510
520
pF1KB5 IEEAVAKADKLAEEHSS
>>NP_001683 (OMIM: 192132,267300) V-type proton ATPase s (513 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPV-RDYAAQTSPSPKAGAA
:: .. : :: .. : :.: .. :..
NP_001 MAMEIDSRPGGLPGSSCNLGAAREHMQAVTRNYITH----PRVTYR
10 20 30 40
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pF1KB5 TGRIVAVIG--AVVD-VQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGT
: . .: : .:.: :.: . . .: ... ::::: : ... . ..::
NP_001 T--VCSVNGPLVVLDRVKFAQYAEIVHFTLPDGTQRSGQVLEVA---GTKAIVQV-FEGT
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pF1KB5 EGL-VRGQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPI-KTKQFAPIHAEAPEFM
:. .: .: .. ::. . :::..: :.::: .::. ...: :... .
NP_001 SGIDARKTTCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPID-KGPVVMAEDFLDINGQPINPH
100 110 120 130 140 150
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pF1KB5 EMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNV-----AKAHGG
.:.. :::. .:.. :.: :: .:..::. .. . .. .. .::
NP_001 SRIYPEEMIQTGISPIDVMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLD
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 YS------VFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVA
: :::..: . . . .. ..:.. ..: : . :.: : .
NP_001 YHDDNFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEQNGTM------GNVCLFLNLANDPTIERIITP
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQ
.::.::.. : . ::... .. ...: :::: ..:. :. . ::..:.
NP_001 RLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIY
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 ERITTT--KKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPL
:: . . ::::.. . .: ::.: : : : .. ..: . . ::: .. :
NP_001 ERAGRVEGRGGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGFITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVL
330 340 350 360 370 380
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pF1KB5 DSTSRIMDPNI----VGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRA
: ::.: : . ..: ::. . :..: . :..: . :. :: : .
NP_001 PSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSEDLLYLEFL
390 400 410 420 430 440
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pF1KB5 RKIQR-FLSQ-PFQVAEVFTG-HMG-KLVPL--KETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVG
.:... :..: :.. :: . .: ::. . :: .: . : . :.
NP_001 QKFEKNFINQGPYENRSVFESLDLGWKLLRIFPKEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAP
450 460 470 480 490 500
520
pF1KB5 PIEEAVAKADKLAEEHSS
NP_001 DTAL
510
>>XP_011531209 (OMIM: 192132,267300) PREDICTED: V-type p (553 aa)
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pF1KB5 VIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGL-VRGQK
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XP_011 NISVSATWVFAQYAEIVHFTLPDGTQRSGQVLEVA---GTKAIVQV-FEGTSGIDARKTT
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pF1KB5 VLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPI-KTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQEIL
.: .. ::. . :::..: :.::: .::. ...: :... . .:..
XP_011 CEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPID-KGPVVMAEDFLDINGQPINPHSRIYPEEMI
150 160 170 180 190 200
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pF1KB5 VTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNV-----AKAHGGYS------V
:::. .:.. :.: :: .:..::. .. . .. .. .:: : :
XP_011 QTGISPIDVMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLDYHDDNFAIV
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEY
::..: . . . .. ..:... .: : . :.: : . .::.::.
XP_011 FAAMGVNMETARFFKSDFEQNGTMG------NVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEF
270 280 290 300 310
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pF1KB5 FRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTT--K
. : . ::... .. ...: :::: ..:. :. . ::..:. :: . .
XP_011 LAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGR
320 330 340 350 360 370
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::::.. . .: ::.: : : : .. ..: . . ::: .. : : ::.:
XP_011 GGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGFITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKS
380 390 400 410 420 430
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: . ..: ::. . :..: . :..: . :. :: : . .:... :..
XP_011 AIGEGMTRKDHGDVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSEDLLYLEFLQKFEKNFIN
440 450 460 470 480 490
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pF1KB5 Q-PFQVAEVFTG-HMG-KLVPL--KETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKA
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XP_011 QGPYENRSVFESLDLGWKLLRIFPKEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAPDTAL
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pF1KB5 DKLAEEHSS
>>NP_001681 (OMIM: 607027) V-type proton ATPase catalyti (617 aa)
initn: 147 init1: 147 opt: 337 Z-score: 386.1 bits: 81.3 E(85289): 9e-15
Smith-Waterman score: 395; 26.6% identity (59.4% similar) in 394 aa overlap (97-466:141-522)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVL
:.:..:. . . :. ... :.. . .:
NP_001 SQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPCKNLRVGSHITGGDIYGIVSENS--LIKHKIML
120 130 140 150 160
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pF1KB5 ---DSGAPIKI-PVGP-ETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQE
. :. : : : .: .... : . :. . : :.. : .. ...
NP_001 PPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEK--FTMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHP
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.: :: .:.: : : ..:: .. :. : ::::. . : . ... ...: :::
NP_001 LL-TGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKY---SNSDVIIYVGCGERGN
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pF1KB5 EGNDLYHEMIESGV-INLK--DATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEG
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NP_001 EMSEVLRDFPELTMEVDGKVESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDM-G
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NP_001 YHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPERE
350 360 370 380 390 400
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NP_001 GSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMR--
410 420 430 440 450
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pF1KB5 IVGSEHYD--------VARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQR-
. .:.:: . ...:::. ..: .:. ..: :.: ::.:. :. :.
NP_001 -ALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDD
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 FLSQPFQVAEVFTGHMGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADK
::.:
NP_001 FLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMIAFYDMARRAVETTAQSDNKITWSIIREHMGDIL
520 530 540 550 560 570
529 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Sat Nov 5 02:32:33 2016 done: Sat Nov 5 02:32:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]