Result of FASTA (omim) for pFN21AB6290
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6290, 785 aa
  1>>>pF1KB6290 785 - 785 aa - 785 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7536+/-0.000533; mu= -2.8149+/- 0.033
 mean_var=585.8321+/-135.959, 0's: 0 Z-trim(119.1): 1147  B-trim: 1846 in 1/57
 Lambda= 0.052989
 statistics sampled from 31226 (32783) to 31226 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.384), width:  16
 Scan time: 13.570

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_612482 (OMIM: 189906) transcription factor Sp1  ( 785) 5133 408.6 5.3e-113
XP_011536998 (OMIM: 189906) PREDICTED: transcripti ( 778) 5083 404.8 7.5e-112
NP_003100 (OMIM: 189906) transcription factor Sp1  ( 778) 5083 404.8 7.5e-112
NP_001238754 (OMIM: 189906) transcription factor S ( 737) 4487 359.2 3.8e-98
NP_003102 (OMIM: 601804) transcription factor Sp3  ( 781) 1589 137.7 1.9e-31
NP_001166183 (OMIM: 601804) transcription factor S ( 778) 1564 135.7 7.2e-31
NP_001017371 (OMIM: 601804) transcription factor S ( 713) 1438 126.1 5.4e-28
NP_001313471 (OMIM: 600540) transcription factor S ( 767) 1117 101.6 1.4e-20
XP_005249885 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 767) 1117 101.6 1.4e-20
NP_003103 (OMIM: 600540) transcription factor Sp4  ( 784) 1117 101.6 1.4e-20
NP_001313472 (OMIM: 600540) transcription factor S ( 471) 1023 94.1 1.5e-18
XP_011513788 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 711)  904 85.2 1.1e-15
XP_005249886 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 706)  884 83.7   3e-15
XP_011523440 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 760)  850 81.1 1.9e-14
XP_011523439 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 768)  850 81.1 1.9e-14
XP_011523438 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 771)  850 81.1 1.9e-14
XP_011523442 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 717)  849 81.0 1.9e-14
XP_016880457 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660)  845 80.7 2.3e-14
XP_011523445 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660)  845 80.7 2.3e-14
XP_006722089 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660)  845 80.7 2.3e-14
XP_011523444 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660)  845 80.7 2.3e-14
XP_006722090 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660)  845 80.7 2.3e-14
XP_006722088 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660)  845 80.7 2.3e-14
XP_016880458 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660)  845 80.7 2.3e-14
XP_006722086 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 667)  845 80.7 2.3e-14
NP_003101 (OMIM: 601801) transcription factor Sp2  ( 613)  844 80.5 2.3e-14
XP_011523441 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 727)  845 80.7 2.4e-14
NP_001003845 (OMIM: 609391) transcription factor S ( 398)  693 68.7 5.4e-11
XP_005246599 (OMIM: 609391) PREDICTED: transcripti ( 442)  693 68.8 5.7e-11
XP_011509461 (OMIM: 609391) PREDICTED: transcripti ( 454)  693 68.8 5.8e-11
NP_945194 (OMIM: 608306) transcription factor Sp8  ( 490)  682 68.0 1.1e-10
NP_874359 (OMIM: 608306) transcription factor Sp8  ( 508)  682 68.0 1.1e-10
XP_016868046 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 661)  623 63.7   3e-09
XP_011513791 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 562)  611 62.7 5.1e-09
XP_011513789 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 572)  611 62.7 5.1e-09
XP_011536202 (OMIM: 606633,613849) PREDICTED: tran ( 413)  606 62.1 5.6e-09
NP_001287766 (OMIM: 606633,613849) transcription f ( 413)  606 62.1 5.6e-09
NP_690599 (OMIM: 606633,613849) transcription fact ( 431)  606 62.1 5.7e-09
NP_001166938 (OMIM: 606633,613849) transcription f ( 431)  606 62.1 5.7e-09
NP_954871 (OMIM: 608613) transcription factor Sp6  ( 376)  584 60.4 1.7e-08
NP_001245177 (OMIM: 608613) transcription factor S ( 376)  584 60.4 1.7e-08
XP_006722178 (OMIM: 608613) PREDICTED: transcripti ( 376)  584 60.4 1.7e-08
NP_057079 (OMIM: 605328,612001) Krueppel-like fact ( 288)  502 53.9 1.1e-06
NP_001171187 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like f ( 495)  488 53.2 3.2e-06
NP_001171189 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like f ( 495)  488 53.2 3.2e-06
NP_003588 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like fact ( 512)  488 53.2 3.3e-06
NP_001197 (OMIM: 602902) Krueppel-like factor 9 [H ( 244)  473 51.6 4.7e-06
NP_001027453 (OMIM: 601878) Krueppel-like factor 1 ( 469)  477 52.3 5.6e-06
NP_005646 (OMIM: 601878) Krueppel-like factor 10 i ( 480)  477 52.3 5.6e-06
NP_114124 (OMIM: 606139) Krueppel-like factor 16 [ ( 252)  442 49.3 2.5e-05


>>NP_612482 (OMIM: 189906) transcription factor Sp1 isof  (785 aa)
 initn: 5133 init1: 5133 opt: 5133  Z-score: 2149.7  bits: 408.6 E(85289): 5.3e-113
Smith-Waterman score: 5133; 100.0% identity (100.0% similar) in 785 aa overlap (1-785:1-785)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 LALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 TVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 LANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 GIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 GIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB6 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB6 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
              730       740       750       760       770       780

            
pF1KB6 SGNGF
       :::::
NP_612 SGNGF
            

>>XP_011536998 (OMIM: 189906) PREDICTED: transcription f  (778 aa)
 initn: 5083 init1: 5083 opt: 5083  Z-score: 2129.1  bits: 404.8 E(85289): 7.5e-112
Smith-Waterman score: 5083; 100.0% identity (100.0% similar) in 778 aa overlap (8-785:1-778)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP
              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011        MDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP
                      10        20        30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTS
            60        70        80        90       100       110   

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQ
           120       130       140       150       160       170   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQG
           180       190       200       210       220       230   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 LANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
           240       250       260       270       280       290   

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
           300       310       320       330       340       350   

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
           360       370       380       390       400       410   

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB6 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
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pF1KB6 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
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pF1KB6 SGNGF
       :::::
XP_011 SGNGF
            

>>NP_003100 (OMIM: 189906) transcription factor Sp1 isof  (778 aa)
 initn: 5083 init1: 5083 opt: 5083  Z-score: 2129.1  bits: 404.8 E(85289): 7.5e-112
Smith-Waterman score: 5083; 100.0% identity (100.0% similar) in 778 aa overlap (8-785:1-778)

               10        20        30        40        50        60
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              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003        MDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP
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               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
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pF1KB6 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
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pF1KB6 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
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pF1KB6 GIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB6 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
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pF1KB6 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
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pF1KB6 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
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pF1KB6 SGNGF
       :::::
NP_003 SGNGF
            

>>NP_001238754 (OMIM: 189906) transcription factor Sp1 i  (737 aa)
 initn: 4478 init1: 4478 opt: 4487  Z-score: 1883.1  bits: 359.2 E(85289): 3.8e-98
Smith-Waterman score: 4720; 93.9% identity (93.9% similar) in 785 aa overlap (1-785:1-737)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::      
NP_001 MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQ------
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTS
                                                 ::::::::::::::::::
NP_001 ------------------------------------------GANGWQIISSSSGATPTS
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pF1KB6 KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQ
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pF1KB6 TVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQG
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pF1KB6 LANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
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pF1KB6 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
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pF1KB6 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
            320       330       340       350       360       370  

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pF1KB6 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
            380       390       400       410       420       430  

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pF1KB6 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
            440       450       460       470       480       490  

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pF1KB6 GIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTR
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pF1KB6 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
            560       570       580       590       600       610  

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pF1KB6 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
            620       630       640       650       660       670  

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pF1KB6 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
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pF1KB6 SGNGF
       :::::
NP_001 SGNGF
            

>>NP_003102 (OMIM: 601804) transcription factor Sp3 isof  (781 aa)
 initn: 1327 init1: 644 opt: 1589  Z-score: 685.5  bits: 137.7 E(85289): 1.9e-31
Smith-Waterman score: 1680; 40.2% identity (67.7% similar) in 829 aa overlap (10-783:11-777)

                10        20        30        40        50         
pF1KB6  MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPS
                 :  :.. ...: ::  ::.:.: : . : ...  ... ......:..:::
NP_003 MTAPEKPVKQEEMAALDVDSG-GG--GGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAAQDTQPS
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NP_001                        MGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATG--DLASAQLG
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NP_001 GAPNRWEVLS----ATPTTIKDEAGNLVQIPSAATSS-------GQYVLPLQ-NLQNQQI
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NP_001 FSVAPGSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQE-SSQIQIIPGS
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NP_001 NQTLLASGTPSANIQNLIPQTGQ--VQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVP
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pF1KB6 VNSVSAATL--TPSSQAVT---------ISSSGSQESGSQPVTSGTTISSASLVSSQASS
       .:::.  .:  . :::..:         :... ...:...   .:  .:  ..  .....
NP_001 INSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSP-DINETNTDT
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       . :  ...: .  .: .. ::.. .:  .: :.:.::. .  : :::.   .  ...:..
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        ..:..  .   :. : :. ::   : :.:::   :.....::   :::.     :::..
NP_001 QNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQA---SGQN-----ISQQA
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       :::::::  :  : ..:.. :: :.:::.:::.:      :::::.::  :: :::.:.:
NP_001 LQNLQLQLNP--GTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQ
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        ..:::          .:..... .  :.....::   :.:::...... ..:::.:: .
NP_001 TLTLGQ----------VAAGGAFTSTPVSLSTGQL---PNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGE
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       .     :..:.:           .  : : .  . .: :     .  :::    : : : 
NP_001 N-----ADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEG----DQQHQE
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pF1KB6 GRRTRREACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERP
       :.: :: ::::: ::.. :::. . :::::::::: :::::::::::::::::::.::::
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pF1KB6 FMCTWSYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGP
       :.:.: :::::::::::::::.:::::::::.:::: :::::::::.:::::::::::  
NP_001 FVCNWMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKG--
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pF1KB6 GVALSVGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEG-IARLANSGINVMQVAD
        .  :  .:    .: ..   ::  ..:: .: . . ..   : .   :.:. ...  ..
NP_001 -IHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILAN-IQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTE
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NP_001 IPLQLVTVSGNETME
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NP_001 ALLAATCSKIGTPGENQATGQQQIIIDPSQGLVQLQNQPQQLELVTTQLA--GNAWQLVA
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       :::.:   :: .:.::.:   :    :  ..: : :.: ::..:. ..:    ::: :.:
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pF1KB6 SAATLTPS-SQAVTISSSGSQESGSQPVTSGT-TISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTT
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NP_001 SNSLQQVQIVGQPILQQIQIQQPQQQIIQAIPPQSFQLQSGQTI--QTIQQQPLQNVQLQ
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NP_001 AV-NPTQVLIRAPTLTPSGQISWQTVQVQNIQSLSNLQVQNAGLS--QQLTITPVSSSGG
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NP_001 TTLAQIAPVA-VAGAPITLNTAQLASVPNLQTVSVANLGAAGVQV---QGVPVTITSVAG
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pF1KB6 DHGAQLGLH---------GAGGDGIHDDTAGG-----------EEGENSPDAQPQAGRRT
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NP_001 QQQGQDGVKVQQATIAPVTVAVGGIANATIGAVSPDQLTQVHLQQGQQTSDQEVQPGKRL
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pF1KB6 RREACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCT
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pF1KB6 WSYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVAL
       : .::::::::::::::.:::::::.: :::: ::::::::::::.::::::::: :.::
NP_001 WMFCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKRFECPECSKRFMRSDHLSKHVKTHQNKKGG-GTAL
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pF1KB6 SVGTL-PLDSG--------------AGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLAN
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NP_001 AIVTSGELDSSVTEVLGSPRIVTVAAISQDSNPATPN--VSTNMEEF             
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XP_005                           MATEGGKTSEPENNNKKPKTS---GSQDSQPSPL
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XP_005 ALLAATCSKIGTPGENQATGQQQIIIDPSQGLVQLQNQPQQLELVTTQLA--GNAWQLVA
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pF1KB6 SAATLTPS-SQAVTISSSGSQESGSQPVTSGT-TISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTT
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XP_005 AAGGGTGQVGQPAATADSGTS-NGNQLVSTPTNTTTSASTMPESPSSST--TCTTTASTS
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