Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6290
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6290, 785 aa
1>>>pF1KB6290 785 - 785 aa - 785 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5744+/-0.00118; mu= -3.0393+/- 0.069
mean_var=426.2795+/-94.545, 0's: 0 Z-trim(111.5): 730 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.062119
statistics sampled from 11637 (12462) to 11637 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.383), width: 16
Scan time: 3.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 ( 785) 5133 475.4 1.5e-133
CCDS44898.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 ( 778) 5083 470.9 3.4e-132
CCDS2254.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2 ( 781) 1589 157.8 6.2e-38
CCDS46452.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2 ( 713) 1438 144.2 7e-34
CCDS5373.1 SP4 gene_id:6671|Hs108|chr7 ( 784) 1117 115.5 3.4e-25
CCDS11521.2 SP2 gene_id:6668|Hs108|chr17 ( 613) 844 90.9 6.7e-18
CCDS33322.1 SP5 gene_id:389058|Hs108|chr2 ( 398) 693 77.2 6e-14
CCDS5372.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 ( 490) 682 76.3 1.4e-13
CCDS43555.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 ( 508) 682 76.3 1.4e-13
CCDS46453.1 SP9 gene_id:100131390|Hs108|chr2 ( 484) 626 71.3 4.3e-12
CCDS73475.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 ( 413) 606 69.4 1.4e-11
CCDS44897.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 ( 431) 606 69.4 1.4e-11
CCDS11520.1 SP6 gene_id:80320|Hs108|chr17 ( 376) 584 67.4 5e-11
>>CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 (785 aa)
initn: 5133 init1: 5133 opt: 5133 Z-score: 2511.0 bits: 475.4 E(32554): 1.5e-133
Smith-Waterman score: 5133; 100.0% identity (100.0% similar) in 785 aa overlap (1-785:1-785)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP
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CCDS88 MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS88 LALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 GIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 SGNGF
:::::
CCDS88 SGNGF
>>CCDS44898.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 (778 aa)
initn: 5083 init1: 5083 opt: 5083 Z-score: 2486.8 bits: 470.9 E(32554): 3.4e-132
Smith-Waterman score: 5083; 100.0% identity (100.0% similar) in 778 aa overlap (8-785:1-778)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 GIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTR
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 REACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTW
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALS
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINI
720 730 740 750 760 770
pF1KB6 SGNGF
:::::
CCDS44 SGNGF
>>CCDS2254.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2 (781 aa)
initn: 1327 init1: 644 opt: 1589 Z-score: 794.5 bits: 157.8 E(32554): 6.2e-38
Smith-Waterman score: 1680; 40.2% identity (67.7% similar) in 829 aa overlap (10-783:11-777)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPS
: :.. ...: :: ::.:.: : . : ... ... ......:..:::
CCDS22 MTAPEKPVKQEEMAALDVDSG-GG--GGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAAQDTQPS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PLALLAATCSRIESPN-----ENSNNSQG-PSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSS
::::::::::.: :. :.. . : :. .:.:: ::...::. . : :...:
CCDS22 PLALLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATG--DLASAQLGGAPNRWEVLS--
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB6 SGATPTS-KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPG------
::::. :...:. .. ... :: ::::. ::::::... ::
CCDS22 --ATPTTIKDEAGNLVQIPSAATSS-------GQYVLPLQ-NLQNQQIFSVAPGSDSSNG
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 VMPNIQYQVIPQFQTVDGQQLQFAATGAQ----VQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGG
.. ..:::::::.:..::::.:.. ::.. ..:. :.:::::::.:: .... ..
CCDS22 TVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQE-SSQIQIIPGSNQTLLASGTPSA
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB6 NIIAAMPNLLQQAVPLQGLA--NNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATL--T
:: .:. : : .::.: .. . :::: :.:::..: ::::..:.:::. .: .
CCDS22 NIQNLIPQTGQ--VQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLS
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KB6 PSSQAVT---------ISSSGSQESGSQPVTSGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYST
:::..: :... ...:... .: .: .. ...... : ...: .
CCDS22 GSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSP-DINETNTDTDLFVPTSSSSQL
290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 TTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSGLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGE
.: .. ::.. .:. : :.:.::. . : :::. . ...:.. ..:.. .
CCDS22 PVTIDSTGILQQNTN--SLTTSSGQVHS--SDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVV
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 QNQQTQQ-QQILIQPQLVQG--GQALQALQAAPLSGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNS
:. : :. :: : :.::: :.....:: :::. :::..::::::: :
CCDS22 QHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQA---SGQN-----ISQQALQNLQLQLNP--
400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 GPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQ------LQNLQVQNPQAQTITLAPMQGVSLGQTSSSNT
: ..:.. :: :.:::.:::.: :::::.:: :: :::.:.: ..:::
CCDS22 GTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQ------
450 460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 TLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTSGIQVHPIQGLPLAIANAPGD
.:..... . :.....:: :.:::...... ..:::.:: .. :..:.:
CCDS22 ----VAAGGAFTSTPVSLSTGQL---PNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGEN-----ADSPAD
500 510 520 530 540
570 580 590 600
pF1KB6 --------HGAQLGLHGAGGDGIHDDT-----AGGEEGENSPDAQPQAGRRTRREACTCP
. : : . . .: : . ::: : : : :.: :: :::::
CCDS22 IRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEG----DQQHQEGKRLRRVACTCP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 YCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTWSYCGKRF
::.. :::. . :::::::::: :::::::::::::::::::.:::::.:.: ::::::
CCDS22 NCKEGGGRGT-NLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGKRF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 TRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALSVGTLPLD
:::::::::.:::::::::.:::: :::::::::.::::::::::: . : .:
CCDS22 TRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKG---IHSSSTVLASV
670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 SGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEG-IARLANSGINVMQVAD--LQSINISGNG
.: .. :: ..:: .: . . .. : . :.:. ... .. :: ...:::
CCDS22 EAARDDTLITAGGTTLILAN-IQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNE
720 730 740 750 760 770
pF1KB6 F
CCDS22 TME
780
>>CCDS46452.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2 (713 aa)
initn: 1163 init1: 644 opt: 1438 Z-score: 721.8 bits: 144.2 E(32554): 7e-34
Smith-Waterman score: 1538; 40.1% identity (67.3% similar) in 761 aa overlap (72-783:8-709)
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 STGSSSSTGGGGQESQPSPLALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLS
.. .: . . .:. .:.:: ::...::.
CCDS46 MGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATG--DLASAQLG
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 QGANGWQIISSSSGATPTS-KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQV
. : :...: ::::. :...:. .. ... :: ::::. ::::::.
CCDS46 GAPNRWEVLS----ATPTTIKDEAGNLVQIPSAATSS-------GQYVLPLQ-NLQNQQI
40 50 60 70 80
170 180 190 200 210
pF1KB6 LTGLPG------VMPNIQYQVIPQFQTVDGQQLQFAATGAQ----VQQDGSGQIQIIPGA
.. :: .. ..:::::::.:..::::.:.. ::.. ..:. :.:::::::.
CCDS46 FSVAPGSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQE-SSQIQIIPGS
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260
pF1KB6 NQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQGLA--NNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLP
:: .... ..:: .:. : : .::.: .. . :::: :.:::..: ::::..:
CCDS46 NQTLLASGTPSANIQNLIPQTGQ--VQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVP
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310
pF1KB6 VNSVSAATL--TPSSQAVT---------ISSSGSQESGSQPVTSGTTISSASLVSSQASS
.:::. .: . :::..: :... ...:... .: .: .. .....
CCDS46 INSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSP-DINETNTDT
210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 SSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSGLQGSDALNIQQNQTSG
. : ...: . .: .. ::.. .: .: :.:.::. . : :::. . ...:..
CCDS46 DLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNT--NSLTTSSGQVHS--SDLQGNYIQSPVSEETQA
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 GSLQAGQQKEGEQNQQTQQ-QQILIQPQLVQG--GQALQALQAAPLSGQTFTTQAISQET
..:.. . :. : :. :: : :.::: :.....:: :::. :::..
CCDS46 QNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQA---SGQN-----ISQQA
320 330 340 350 360
440 450 460 470 480
pF1KB6 LQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQ------LQNLQVQNPQAQTITLAPMQ
::::::: : : ..:.. :: :.:::.:::.: :::::.:: :: :::.:.:
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pF1KB6 GVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTSGIQVHPIQ
..::: .:..... . :.....:: :.:::...... ..:::.:: .
CCDS46 TLTLGQ----------VAAGGAFTSTPVSLSTGQL---PNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGE
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. :..:.: . : : . . .: : . ::: : : :
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:.: :: ::::: ::.. :::. . :::::::::: :::::::::::::::::::.::::
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:.:.: :::::::::::::::.:::::::::.:::: :::::::::.:::::::::::
CCDS46 FVCNWMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKG--
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. : .: .: .. :: ..:: .: . . .. : . :.:. ... ..
CCDS46 -IHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILAN-IQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTE
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780
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CCDS46 IPLQLVTVSGNETME
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:. ..:::::::.:::.:::.:. :... :: .::::.: : :: :.: :: ..
CCDS53 PS--GSVQYQVIPQLQTVEGQQIQINPTSSSSLQDLQGQIQLISAGNNQAILTAANRTAS
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:::.: :: .:.::.: : : ..: : :.: ::..:. ..: ::: :.:
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.:. : . .: .. ..::.. .:.: :.. : : .::: . . :::. : ... ::.
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CCDS53 LTSSDT-LVSSADTGQYASTSASSSERTIEESQ-TPAATESEAQSSSQLQPNGMQNAQDQ
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:: : ..::.::. :.::.::::.:.::.: ..: :.:. :. : ... .:::.
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:::. :: .: . .. .:.:.:::.:.:.:::.... ::..:.:: ::.:..:... :
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.. .: :.. .. :: . : :. ..:... : . : :.:
CCDS53 QQQGQDGVKVQQATIAPVTVAVGGIANATIGAVSPDQLTQVHLQQGQQTSDQEVQPGKRL
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:: ::.:: :...:::::..:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:.
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pF1KB6 WSYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVAL
: .::::::::::::::.:::::::.: :::: ::::::::::::.::::::::: :.::
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CCDS53 AIVTSGELDSSVTEVLGSPRIVTVAAISQDSNPATPN--VSTNMEEF
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770 780
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:: . .... ::..:. .:... : : :
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. ::. : :. ...:::.. :: :::...::: . : .. :
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. ::.:.::. :. . ::::. :.: ::. .:. . : . :
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. :: ::::: :::.: : ::. :::: :.::: :::.. ::: ::::.: :::::::.
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CCDS33 NKKLKVAEAGVKREDARDL
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CCDS53 --GSSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSL----TSSSAAAAAAAAAAAAS
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CCDS53 SSPFANDYSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHSQDGS--HQPVFISKVHTSVDGLQGI
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.. . . .. .. : .: .. :... : .: .. . .:: : .. ::
CCDS53 NSAAALPGSLHPAAGGLQTSLHS---PLGGYNSDYSG---LSHSAFSS--GASSHLLSPA
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CCDS53 GQ-----HLMDGFKPVLPGSYPD-SAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGG--SP--RSSARR
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CCDS53 YSGRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWHTGERP
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CCDS53 FVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSGGGGGG
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CCDS53 GSAGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
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pF1KB6 NQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQGLANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVN
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CCDS43 MATSLL-GEEPRLGSTPLAMLAA----TCN
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.... . .::: . . :: :. : .: ... :::: .: ::: ... : .
CCDS43 KIGSPSPSPSSLSDSSSSFGK---GFHPWKRSSSSSSASCNVVGSSLSSFGVSGASRNGG
30 40 50 60 70 80
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pF1KB6 TTTSNMGIM------------NFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSGLQGSDALN---------
.... . .:. .:: :... . : . ... .. :
CCDS43 SSSAAAAAAAAAAAAAALVSDSFSCGGSPGSSAFSLTSSSAAAAAAAAAAAASSSPFAND
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pF1KB6 ---IQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQ-ALQALQAA-PLSGQT
.: .:::: .: : .. ..:. . :: ... . ....::. : :..
CCDS43 YSVFQAPGVSGGSGGGGGGGGGGSSAHSQDGSH--QPVFISKVHTSVDGLQGIYPRVGMA
150 160 170 180 190 200
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pF1KB6 FTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQTITL
.. . : : : . . :: : :: . ..::::.. .
CCDS43 HPYESWFK-----------P-SHPGLGAAGEVGSAGASSWWDVGAGWIDVQNPNSAAALP
210 220 230 240
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pF1KB6 APMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTSGIQV
. .. .. : .: .. :... : .: .. . .:: : .. :: :
CCDS43 GSLHPAAGGLQTSLHS---PLGGYNSDYSG---LSHSAFSS--GASSHLLSPAGQ-----
250 260 270 280 290
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pF1KB6 HPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTRREAC
: ..:. .. .. : .: : ::::. . .. : :: . .: : . : .:
CCDS43 HLMDGFKPVLPGSYPD-SAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPLGG--SP--RSSARRYSGRATC
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