Result of FASTA (ccds) for pFN21AB8986
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8986, 387 aa
  1>>>pF1KB8986 387 - 387 aa - 387 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5826+/-0.00126; mu= 15.0345+/- 0.074
 mean_var=136.3287+/-42.112, 0's: 0 Z-trim(102.8): 261  B-trim: 938 in 2/48
 Lambda= 0.109845
 statistics sampled from 6644 (7115) to 6644 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.219), width:  16
 Scan time:  2.520

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 387) 2538 414.8 6.8e-116
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 355) 2335 382.6 3.1e-106
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360)  941 161.6 9.9e-40
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  931 160.1 2.9e-39
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 360)  921 158.5 8.9e-39
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  920 158.3 9.9e-39
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 374)  912 157.1 2.5e-38
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355)  902 155.5 7.1e-38
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376)  902 155.5 7.4e-38
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352)  887 153.1 3.7e-37
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3           ( 384)  728 127.9 1.5e-29
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 352)  723 127.1 2.5e-29
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 356)  723 127.1 2.5e-29
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  698 123.2   4e-28
CCDS2736.1 XCR1 gene_id:2829|Hs108|chr3            ( 333)  688 121.5 1.1e-27
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3          ( 350)  682 120.6 2.2e-27
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 372)  657 116.7 3.6e-26
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 378)  657 116.7 3.6e-26
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  631 112.5 6.1e-25
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  630 112.4 6.8e-25
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  630 112.4 6.9e-25
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368)  617 110.3 2.9e-24
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415)  617 110.4 3.1e-24
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  615 110.0 3.5e-24
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3          ( 342)  589 105.8 5.9e-23
CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3          ( 356)  589 105.9 6.1e-23
CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3          ( 344)  586 105.4 8.3e-23
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  557 100.8 2.1e-21
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17         ( 362)  499 91.6 1.2e-18
CCDS5322.1 GPER1 gene_id:2852|Hs108|chr7           ( 375)  479 88.5 1.1e-17
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  457 85.0 1.2e-16
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3           ( 360)  447 83.4 3.6e-16
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14          ( 365)  439 82.1 8.9e-16
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1           ( 361)  436 81.6 1.2e-15
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16         ( 364)  430 80.7 2.4e-15
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12        ( 404)  427 80.3 3.5e-15
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  426 80.1 3.8e-15
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5             ( 425)  425 80.0 4.5e-15
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18         ( 349)  423 79.5   5e-15
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20         ( 370)  415 78.3 1.2e-14
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1            ( 372)  415 78.3 1.3e-14
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19          ( 350)  405 76.7 3.6e-14
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  404 76.6 4.3e-14
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1         ( 374)  401 76.1 5.8e-14
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  399 75.7 6.9e-14
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8          ( 328)  396 75.2 9.3e-14
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2           ( 367)  396 75.3   1e-13
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  396 75.3   1e-13
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19          ( 362)  389 74.2 2.1e-13
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14          ( 352)  386 73.7 2.9e-13


>>CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3              (387 aa)
 initn: 2538 init1: 2538 opt: 2538  Z-score: 2194.2  bits: 414.8 E(32554): 6.8e-116
Smith-Waterman score: 2538; 99.2% identity (99.7% similar) in 387 aa overlap (1-387:1-387)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MREPLEALKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVV
       :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MREPLEAFKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 FGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 HYLINEKGLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HYLINEKGLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKENECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKENECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YCYFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 YCYFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 KDLRLALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSE
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KDLRLALSVTETVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       
pF1KB8 SQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
              370       380       

>>CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3              (355 aa)
 initn: 2335 init1: 2335 opt: 2335  Z-score: 2020.7  bits: 382.6 E(32554): 3.1e-106
Smith-Waterman score: 2335; 99.4% identity (99.7% similar) in 355 aa overlap (33-387:1-355)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB8 EPLEALKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43                               MDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFG
                                             10        20        30

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB8 TVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHY
               40        50        60        70        80        90

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB8 LINEKGLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LINEKGLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTIS
              100       110       120       130       140       150

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB8 LGVWAAAILVAAPQFMFTKQKENECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LGVWAAAILVAAPQFMFTKQKENECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYC
              160       170       180       190       200       210

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB8 YFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS43 YFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKD
              220       230       240       250       260       270

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB8 LRLALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQ
       ::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LRLALSVTETVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQ
              280       290       300       310       320       330

            370       380       
pF1KB8 RSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
              340       350     

>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3                 (360 aa)
 initn: 933 init1: 453 opt: 941  Z-score: 826.8  bits: 161.6 E(32554): 9.9e-40
Smith-Waterman score: 941; 42.3% identity (71.3% similar) in 352 aa overlap (38-382:13-355)

        10        20        30        40         50        60      
pF1KB8 LKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFE-YDDLAEACYIGDIVVFGTVFL
                                     ::.  :.  :... . :    : .:: .::
CCDS26                   MNPTDIADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFL
                                 10        20        30        40  

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB8 SIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINE
         .::..:..::.:: .::..: . :. .:.::.::::::.:::::: .:::: .:  ..
CCDS26 PPLYSLVFVFGLLGNSVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAADQ
             50        60        70        80        90       100  

        130       140       150       160       170       180      
pF1KB8 KGLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVW
         .  ..::. . ....::...:::. ..::::::::: :. :.  ::. .::  ::..:
CCDS26 WVFGLGLCKMISWMYLVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATW
            110       120       130       140       150       160  

        190           200       210       220       230       240  
pF1KB8 AAAILVAAPQFMF----TKQKENECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYC
       ..:.... : :.:    :..... :   :  . .  : :: ..: :.::...:: :: .:
CCDS26 SVAVFASLPGFLFSTCYTERNHTYCKTKYS-LNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFC
            170       180       190        200       210       220 

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pF1KB8 YFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKD
       :  ::.::  :::.:: ::.:.:. ::..:. :::::::..:::::   . . .: ... 
CCDS26 YSMIIRTLQHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCTFERY
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pF1KB8 LRLALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKC--LAVLCGRSVHVDFSSSE
       :  :...:: .:: ::::::.:: : :::::.:. .:.  :  : :::     ... :..
CCDS26 LDYAIQATETLAFVHCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSAD
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pF1KB8 SQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
       .         ::..:  : : :     
CCDS26 TP--------SSSYTQSTMDHDLHDAL
                     350       360

>>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 863 init1: 466 opt: 931  Z-score: 818.3  bits: 160.1 E(32554): 2.9e-39
Smith-Waterman score: 931; 39.7% identity (75.3% similar) in 348 aa overlap (31-372:3-350)

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pF1KB8 MREPLEALKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVV
                                     .:.:    .::. .  : ..  :    : .
CCDS26                             MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQT
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pF1KB8 FGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWT
        : ..:..:: ..:...:.:: ::...:.  :: .:.::.::::::::::::: ..:: :
CCDS26 NGKLLLAVFYCLLFVFSLLGNSLVILVLVVCKKLRSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQT
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pF1KB8 HYLINEKGLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVT
       .::...  . ..::: ...:..:::..:.::::..:.:::::.: :. ... ::.. :.:
CCDS26 YYLLDQWVFGTVMCKVVSGFYYIGFYSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTT
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pF1KB8 ISLGVWAAAILVAAPQFMFTK-QKENECLGDYPEVLQEI--WPVLRNVETNFLGFLLPLL
       . :.:: .::... : ..: .  .:.  :  :    :.   : .. : . :.::.:.:. 
CCDS26 LCLAVWLTAIMATIPLLVFYQVASEDGVLQCYSFYNQQTLKWKIFTNFKMNILGLLIPFT
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pF1KB8 IMSYCYFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSC
       :. .::..:.. :  :.::.:.:::.:.:.:::. .:::.:.:...:: .:. . .. .:
CCDS26 IFMFCYIKILHQLKRCQNHNKTKAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGC
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pF1KB8 DMRKDLRLALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGK-CLAVLC--GRSVHV
       .. ..:  :  :::...:.:::.::.::::.::::...: ... : :  ..   ::..  
CCDS26 SISQQLTYATHVTEIISFTHCCVNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPR
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pF1KB8 DFSSSESQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
       .   . :. ..:.:  ::               
CCDS26 ESCEKSSSCQQHSSRSSSVDYIL          
            340       350               

>>CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3              (360 aa)
 initn: 619 init1: 597 opt: 921  Z-score: 809.6  bits: 158.5 E(32554): 8.9e-39
Smith-Waterman score: 921; 47.2% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (38-342:18-322)

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pF1KB8 LKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLS
                                     : ::  :.::  :  :.  :.  .:. .: 
CCDS46              MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAP-CHKFDVKQIGAQLLP
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pF1KB8 IFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEK
        .::..: .:.:::.:::. : : :: : .:::::::::.:::::. :::.:.:   :: 
CCDS46 PLYSLVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEW
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pF1KB8 GLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWA
        . :::::. :... ::.::.:::: ...:::::::: :. ... :::  ::. :. .: 
CCDS46 VFGNAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWL
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pF1KB8 AAILVAAPQFMFTK-QKENECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRI
       .:.....: ..::: :::.      :  . . :  ....  :.::..::::::  ::  :
CCDS46 VAVFASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGP-YFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGI
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pF1KB8 IQTLFSCKNHKKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRL
       ..::. :.:.::  .:...:. ..::.:::::::::.:.:.:.. .  . .:.  ..:  
CCDS46 LKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQ
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pF1KB8 ALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSR
       : .::: ....:::.::.::::.::::::::  .. :                       
CCDS46 ATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTS
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pF1KB8 HGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
                             
CCDS46 TNTPSTGEQEVSAGL       
         350       360       

>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 892 init1: 451 opt: 920  Z-score: 808.8  bits: 158.3 E(32554): 9.9e-39
Smith-Waterman score: 920; 44.9% identity (76.0% similar) in 312 aa overlap (41-346:13-322)

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pF1KB8 ADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFY
                                     : .:.: : :  :   .  .::. .:  .:
CCDS27                   METPNTTEDYDTTTEFDYGD-ATPCQKVNERAFGAQLLPPLY
                                 10        20         30        40 

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pF1KB8 SVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHY-LINEKGL
       :..:.::::::.:::..:.. :. :..:.:::::::.:::::. :::::  : : ..  .
CCDS27 SLVFVIGLVGNILVVLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVF
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pF1KB8 HNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAA
        .::::. ..:.. :... :::: ...:::::::: :. ..  :::  ::  :. .:: :
CCDS27 GDAMCKILSGFYYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALA
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pF1KB8 ILVAAPQFMFTKQK----ENECLGDYP-EVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYF
       ::.. : ..:.: .    .. :   .: : :.: : ... .. :..:..::::.:  :: 
CCDS27 ILASMPGLYFSKTQWEFTHHTCSLHFPHESLRE-WKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYT
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pF1KB8 RIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLR
        ::. :.   :.::.::..::....:.:::::::::. :.. ... . :   :.. . : 
CCDS27 GIIKILLRRPNEKKSKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLD
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pF1KB8 LALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRS
       ::..:::..:..:::.::.::::.::.::.:: .:. . .::                  
CCDS27 LAVQVTEVIAYTHCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVS
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pF1KB8 RHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
                              
CCDS27 STSPSTGEHELSAGF        
              350             

>>CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3              (374 aa)
 initn: 857 init1: 597 opt: 912  Z-score: 801.7  bits: 157.1 E(32554): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 912; 46.8% identity (75.0% similar) in 308 aa overlap (38-343:18-322)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB8 LKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLS
                                     : ::  :.::  :  :.  :.  .:. .: 
CCDS43              MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAP-CHKFDVKQIGAQLLP
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pF1KB8 IFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEK
        .::..: .:.:::.:::. : : :: : .:::::::::.:::::. :::.:.:   :: 
CCDS43 PLYSLVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEW
         50        60        70        80        90       100      

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pF1KB8 GLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWA
        . :::::. :... ::.::.:::: ...:::::::: :. ... :::  ::. :. .: 
CCDS43 VFGNAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWL
        110       120       130       140       150       160      

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pF1KB8 AAILVAAPQFMFTK-QKENECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRI
       .:.....: ..::: :::.      :  . . :  ....  :.::..::::::  ::  :
CCDS43 VAVFASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGP-YFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGI
        170       180       190        200       210       220     

        250        260       270       280       290       300     
pF1KB8 IQTLFSCKNHKKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRL
       ..::. :.:.::  .:...:. ..::.:::::::::.:.:.:.. .  . .:.  ..:  
CCDS43 LKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQ
         230       240       250       260       270       280     

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pF1KB8 ALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSR
       : .::: ....:::.::.::::.:::::  :.:.   :                      
CCDS43 ATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRS-LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVK
         290       300       310        320       330       340    

         370       380               
pF1KB8 HGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL        
                                     
CCDS43 VTTQGLLDGRGKGKSIGRAPEASLQDKEGA
          350       360       370    

>>CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 901 init1: 457 opt: 902  Z-score: 793.4  bits: 155.5 E(32554): 7.1e-38
Smith-Waterman score: 902; 41.9% identity (72.6% similar) in 332 aa overlap (46-372:17-345)

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                                     :::..  :  .:  .. . :.  .::..:.
CCDS27               MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFT
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       .::.::..::. : . .. . .:.:::::::.:::::..::::: ::. ... .  ..::
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       :. ..:.  :... :::: ...:::::::: :. ..  :::  ::  :. .:. :.:.: 
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       :.:.: . .:    . : . :::     :  ..... ... ..::::.:. ::  ::.::
CCDS27 PEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTL
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       . : ..:: :::.::.... :::.::::::. :.: . .   :  .:.  : : :.. ::
CCDS27 LRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVT
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       :..:.::::.::.::::.::.::.:: :.. . : .  ::  .. :  :: .  : .:: 
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CCDS27 PSTAEPELSIVF     
           350          

>>CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3                (376 aa)
 initn: 901 init1: 457 opt: 902  Z-score: 793.2  bits: 155.5 E(32554): 7.4e-38
Smith-Waterman score: 902; 41.9% identity (72.6% similar) in 332 aa overlap (46-372:38-366)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB8 RKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFA
                                     :::..  :  .:  .. . :.  .::..:.
CCDS54 LLRAHKPGSSRRSEMTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFT
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pF1KB8 IGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLH-NAMC
       .::.::..::. : . .. . .:.:::::::.:::::..::::: ::. ... .  ..::
CCDS54 VGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMC
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pF1KB8 KFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAA
       :. ..:.  :... :::: ...:::::::: :. ..  :::  ::  :. .:. :.:.: 
CCDS54 KLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAAL
       130       140       150       160       170       180       

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pF1KB8 PQFMFTKQKE----NECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTL
       :.:.: . .:    . : . :::     :  ..... ... ..::::.:. ::  ::.::
CCDS54 PEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTL
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       . : ..:: :::.::.... :::.::::::. :.: . .   :  .:.  : : :.. ::
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       :..:.::::.::.::::.::.::.:: :.. . : .  ::  .. :  :: .  : .:: 
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        :               
CCDS54 PSTAEPELSIVF     
          370           

>>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3                 (352 aa)
 initn: 742 init1: 465 opt: 887  Z-score: 780.6  bits: 153.1 E(32554): 3.7e-37
Smith-Waterman score: 887; 42.9% identity (76.7% similar) in 301 aa overlap (50-345:17-317)

      20        30        40        50        60        70         
pF1KB8 LASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFAIGLV
                                     .: :   ..  ... .:  .::..: .:.:
CCDS27               MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFV
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CCDS27 GNMLVILILINCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGNTMCQLLTG
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CCDS27 LYFIGFFSGIFFIILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGIIF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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