Result of FASTA (omim) for
pFN21AA2033
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA2033, 746 aa
1>>>pF1KA2033 746 - 746 aa - 746 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3491+/-0.00129; mu= 7.0741+/- 0.079
mean_var=447.9136+/-87.447, 0's: 0 Z-trim(107.0): 2090 B-trim: 72 in 1/52
Lambda= 0.060601
statistics sampled from 12755 (15091) to 12755 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.441), E-opt: 0.2 (0.177), width: 16
Scan time: 9.010
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2434 230.0 3.9e-59
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2434 230.0 3.9e-59
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2434 230.1 4e-59
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2434 230.1 4e-59
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2434 230.1 4e-59
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2434 230.1 4e-59
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2434 230.1 4.1e-59
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2427 229.2 4.9e-59
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2427 229.2 4.9e-59
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2427 229.2 5.1e-59
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2427 229.2 5.1e-59
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2427 229.2 5.2e-59
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2421 228.7 7.3e-59
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2421 228.7 7.3e-59
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2421 228.7 7.3e-59
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2421 228.7 7.4e-59
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 2421 228.7 7.5e-59
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2371 224.6 1.9e-57
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2368 224.3 2.2e-57
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 2328 220.8 2.4e-56
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2328 220.8 2.4e-56
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2328 220.8 2.4e-56
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2328 220.8 2.4e-56
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 2328 220.8 2.4e-56
>>XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger pro (1092 aa)
initn: 2261 init1: 2261 opt: 2434 Z-score: 1182.6 bits: 230.0 E(85289): 3.9e-59
Smith-Waterman score: 2438; 47.5% identity (72.8% similar) in 779 aa overlap (2-744:231-1005)
10 20 30
pF1KA2 MAFSQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRT
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XP_006 GKAFSHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKE-CGKA
210 220 230 240 250
40 50 60 70 80
pF1KA2 LYRDVMLENYRNLVSLDISSKCTM--KEF--LSTAQGNREVFHAGTLQIHESHHNGDFCY
. . : :.. . . :: : : ::: .. ..::: .... .. :
XP_006 FSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHK-IIHAGE-KLYKCEECGKAFN
260 270 280 290 300 310
90 100 110 120
pF1KA2 QDVDKDIHDY---------------EFQWQED---ERNGH--EAPMTKIKKL------TG
.. . :: . :.:. . .. : : :. : :. ..
XP_006 RSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPF-KCKECGKAFIWSS
320 330 340 350 360 370
130 140 150 160 170
pF1KA2 STERYDQSHARNKPIK-DQLGSSFH--SHLPEMHIFQTEEKIDN--QVVKSIHDASLVST
. :. . :. .:: : .. :..:. : : . .:..: :: . . :..... ..
XP_006 TLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNK
380 390 400 410 420 430
180 190 200 210 220 230
pF1KA2 AQRISCRPKTHISNNHGNNFWNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQII
. : : : . .. :. : . : :: .. .: .: ..:.: :::::.:: : :.::
XP_006 HKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKII
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KA2 HLADK-YKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGE
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XP_006 HTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKRIHTGE
500 510 520 530 540 550
300 310 320 330 340 350
pF1KA2 KPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYK
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XP_006 KPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYK
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pF1KA2 CNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEEC
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420 430 440 450 460 470
pF1KA2 DKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDKAF
::. . :.. :..::: .. :::.::::.:::.:.:: :. ::::.::::.:: :::
XP_006 GKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCKECGKAF
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pF1KA2 RFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFSWKS
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XP_006 KHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDKAFIWSS
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pF1KA2 SLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFNQQLTLKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEI
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XP_006 TLTEHKRIHTREKTYKCEECGKAFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTT
800 810 820 830 840 850
600 610 620 630 640 650
pF1KA2 HQKIHTEQNPYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFRVKSNLEGHRRI
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XP_006 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHTRM
860 870 880 890 900 910
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pF1KA2 HTGEKPYKCNECGKTFSRKSYFVCHHRLHTGEKPYKCNECGKNFSQKSSLICHHRLHTGE
:::::::::.::::.:.:.: .. :. .:::::::::.:::: : ..:.: :.:.:: :
XP_006 HTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNGHKRIHTRE
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pF1KA2 KPYKCNECGKTFSQKSNLTCHRRLHTGEKQV
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XP_006 KPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKHKIIHTGEKPYK
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>--
initn: 1253 init1: 657 opt: 673 Z-score: 350.6 bits: 76.1 E(85289): 8.7e-13
Smith-Waterman score: 673; 53.4% identity (75.6% similar) in 176 aa overlap (242-417:55-230)
220 230 240 250 260 270
pF1KA2 EKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQIIHLADKYKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYK
..: :.: . : : :::.. .:
XP_006 KGCKSVDECKVHKEGYNKLNQCLTTAQSKVFQCGKYLKVFYKFLNSNRHTIRHTGKKCFK
30 40 50 60 70 80
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pF1KA2 CNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNEC
:..: :.: : :. .. :: ::.::.:.::..: : :. ::::.:::::.::
XP_006 CKKCVKSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWSSTLTNHKEIHTEDKPYKCEEC
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pF1KA2 GKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTF
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XP_006 GKAFKQLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECGKAFLWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAF
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pF1KA2 SHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTS
::.:.:. :.:.:::::::::::: :
XP_006 SHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSS
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>>XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger pro (1092 aa)
initn: 2261 init1: 2261 opt: 2434 Z-score: 1182.6 bits: 230.0 E(85289): 3.9e-59
Smith-Waterman score: 2438; 47.5% identity (72.8% similar) in 779 aa overlap (2-744:231-1005)
10 20 30
pF1KA2 MAFSQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRT
:::.. . :. ... .:: . ..
XP_011 GKAFSHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKE-CGKA
210 220 230 240 250
40 50 60 70 80
pF1KA2 LYRDVMLENYRNLVSLDISSKCTM--KEF--LSTAQGNREVFHAGTLQIHESHHNGDFCY
. . : :.. . . :: : : ::: .. ..::: .... .. :
XP_011 FSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHK-IIHAGE-KLYKCEECGKAFN
260 270 280 290 300 310
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pF1KA2 QDVDKDIHDY---------------EFQWQED---ERNGH--EAPMTKIKKL------TG
.. . :: . :.:. . .. : : :. : :. ..
XP_011 RSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPF-KCKECGKAFIWSS
320 330 340 350 360 370
130 140 150 160 170
pF1KA2 STERYDQSHARNKPIK-DQLGSSFH--SHLPEMHIFQTEEKIDN--QVVKSIHDASLVST
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XP_011 TLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNK
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pF1KA2 AQRISCRPKTHISNNHGNNFWNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQII
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XP_011 HKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKII
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pF1KA2 HLADK-YKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGE
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XP_011 HTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKRIHTGE
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pF1KA2 KPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYK
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XP_011 CEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKPFKCKEC
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pF1KA2 DKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDKAF
::. . :.. :..::: .. :::.::::.:::.:.:: :. ::::.::::.:: :::
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pF1KA2 RFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFSWKS
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XP_011 KHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDKAFIWSS
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pF1KA2 SLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFNQQLTLKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEI
.:: :.:.:. :: :::.::::.:.: : :.:.:.::.:::::. ::.: .:.:
XP_011 TLTEHKRIHTREKTYKCEECGKAFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTT
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:. ::: ..::::.::::.: ..:.:: :. .:::::::::::: ::: .:.: : :.
XP_011 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHTRM
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:::::::::.::::.:.:.: .. :. .:::::::::.:::: : ..:.: :.:.:: :
XP_011 HTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNGHKRIHTRE
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:::::.::::.:::.:.:: :.:::::::
XP_011 KPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKHKIIHTGEKPYK
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..: :.: . : : :::.. .:
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:..: :.: : :. .. :: ::.::.:.::..: : :. ::::.:::::.::
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pF1KA2 CNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEEC
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::. . :.. :..::: .. :::.::::.:::.:.:: :. ::::.::::.:: :::
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. .: : .:. ::.::: :::.::::.:...: :: :. .:: :: : .::.:.: :.:
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pF1KA2 MAFSQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRT
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pF1KA2 YKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCN
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.. . :: . :.:. . .. : : :. : :. ..
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. :. . :. .:: : .. :..:. : : . .:..: :: . . :..... ..
XP_011 TLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNK
440 450 460 470 480 490
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pF1KA2 AQRISCRPKTHISNNHGNNFWNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQII
. : : : . .. :. : . : :: .. .: .: ..:.: :::::.:: : :.::
XP_011 HKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKII
500 510 520 530 540 550
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pF1KA2 HLADK-YKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGE
: ..: :::. ::: : . .: :.: ::::.::::.::::.::..:.:. :.:.::::
XP_011 HTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKRIHTGE
560 570 580 590 600 610
300 310 320 330 340 350
pF1KA2 KPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYK
:::::.:: ::: .: : :.: :::::::::.:: :::.. : ::.:. .:.::: ::
XP_011 KPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYK
620 630 640 650 660 670
360 370 380 390 400 410
pF1KA2 CNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEEC
:.::::.:...:.:: :. .:::::::::.::::.:. .:::: :.:.:: :::.::.::
XP_011 CEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKPFKCKEC
680 690 700 710 720 730
420 430 440 450 460 470
pF1KA2 DKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDKAF
::. . :.. :..::: .. :::.::::.:::.:.:: :. ::::.::::.:: :::
XP_011 GKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCKECGKAF
740 750 760 770 780 790
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pF1KA2 RFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFSWKS
. .: : .:. ::.::: :::.::::.:...: :: :. .:: :: : .::.:.: :.:
XP_011 KHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDKAFIWSS
800 810 820 830 840 850
540 550 560 570 580 590
pF1KA2 SLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFNQQLTLKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEI
.:: :.:.:. :: :::.::::.:.: : :.:.:.::.:::::. ::.: .:.:
XP_011 TLTEHKRIHTREKTYKCEECGKAFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTT
860 870 880 890 900 910
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pF1KA2 HQKIHTEQNPYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFRVKSNLEGHRRI
:. ::: ..::::.::::.: ..:.:: :. .:::::::::::: ::: .:.: : :.
XP_011 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHTRM
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pF1KA2 HTGEKPYKCNECGKTFSRKSYFVCHHRLHTGEKPYKCNECGKNFSQKSSLICHHRLHTGE
:::::::::.::::.:.:.: .. :. .:::::::::.:::: : ..:.: :.:.:: :
XP_011 HTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNGHKRIHTRE
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pF1KA2 KPYKCNECGKTFSQKSNLTCHRRLHTGEKQV
:::::.::::.:::.:.:: :.:::::::
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>--
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pF1KA2 TEEKIDNQVVKSIHDASLVSTAQRISCRPKTHISNNHGNNFW-NSSLLTQKQEVHMRE--
: : . ..:: ..:. . :.: .:.
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220 230 240 250 260
pF1KA2 ----KSFQCNESGKAFNYSSLLRK-----HQIIHLADK--YKCDVCGKLFNQKRNLACHR
...: .. :. . .. .. .: . :.. ..: :.: . : :
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pF1KA2 RCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHT
:::.. .::..: :.: : :. .. :: ::.::.:.::..: : :. :::
XP_011 IRHTGKKCFKCKKCVKSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWSSTLTNHKEIHT
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XP_011 EDKPYKCEECGKAFKQLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECGKAFLWSSTLTRHKRIHTGEKP
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pF1KA2 YKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCN
:::.::::.:::.:.:. :.:.:::::::::::: :
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10 20 30
pF1KA2 MAFSQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRT
:::.. . :. ... .:: . ..
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. . : :.. . . :: : : ::: .. ..::: .... .. :
NP_001 FSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHK-IIHAGE-KLYKCEECGKAFN
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.. . :: . :.:. . .. : : :. : :. ..
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pF1KA2 STERYDQSHARNKPIK-DQLGSSFH--SHLPEMHIFQTEEKIDN--QVVKSIHDASLVST
. :. . :. .:: : .. :..:. : : . .:..: :: . . :..... ..
NP_001 TLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNK
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pF1KA2 AQRISCRPKTHISNNHGNNFWNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQII
. : : : . .. :. : . : :: .. .: .: ..:.: :::::.:: : :.::
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pF1KA2 HLADK-YKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGE
: ..: :::. ::: : . .: :.: ::::.::::.::::.::..:.:. :.:.::::
NP_001 HTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAKHKRIHTGE
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pF1KA2 KPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYK
:::::.:: ::: .: : :.: :::::::::.:: :::.. : ::.:. .:.::: ::
NP_001 KPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYK
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pF1KA2 CNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEEC
:.::::.:...:.:: :. .:::::::::.::::.:. .:::: :.:.:: :::.::.::
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pF1KA2 DKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDKAF
::. . :.. :..::: .. :::.::::.:::.:.:: :. ::::.::::.:: :::
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pF1KA2 RFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFSWKS
. .: : .:. ::.::: :::.::::.:...: :: :. .:: :: : .::.:.: :.:
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pF1KA2 SLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFNQQLTLKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEI
.:: :.:.:. :: :::.::::.:.: : :.:.:.::.:::::. ::.: .:.:
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pF1KA2 HQKIHTEQNPYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFRVKSNLEGHRRI
:. ::: ..::::.::::.: ..:.:: :. .:::::::::::: ::: .:.: : :.
NP_001 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHTRM
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pF1KA2 HTGEKPYKCNECGKTFSRKSYFVCHHRLHTGEKPYKCNECGKNFSQKSSLICHHRLHTGE
:::::::::.::::.:.:.: .. :. .:::::::::.:::: : ..:.: :.:.:: :
NP_001 HTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNGHKRIHTRE
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pF1KA2 KPYKCNECGKTFSQKSNLTCHRRLHTGEKQV
:::::.::::.:::.:.:: :.:::::::
NP_001 KPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKHKIIHTGEKPYK
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>--
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pF1KA2 MAFSQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLDISSKCTM
.. .::::::::::::: :::.::: ::..:::.:::::::::. : : :
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pF1KA2 KEFLSTAQGNREVFHAGTLQIHESHHNGDFCYQDVDKDIHDYEFQWQEDERNGHEAPMTK
: :: : :. . : . :
NP_001 ------------------------HFPQDF---------------WPEQ---SMEDSFQK
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pF1KA2 IKKLTGSTERYDQSHARNKPIKDQLGSSFHSHLPEMHIFQTEEKIDNQVVKSIHDASLVS
. ..:.. .: .. . ::. .
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pF1KA2 TAQRISCRPKTHISNNHGNNFWNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSL-LRKHQ
: :.: ..: : :. : : ...: :::.. :.: :. : .:
NP_001 ------C--KVH---KEGYNKLNQCLTTAQSKV------FQCGKYLKVF-YKFLNSNRHT
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pF1KA2 IIHLADK-YKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHT
: : . : .:: : : : . . . :. . :. ::.:: ::: .:.:: :...::
NP_001 IRHTGKKCFKCKKCVKSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWSSTLTNHKEIHT
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pF1KA2 GEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKP
.:::::::: :::. : : :.:: ..:: :::.::::.: .: ::::.:.::::::
NP_001 EDKPYKCEECGKAFKQLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECGKAFLWSSTLTRHKRIHTGEKP
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pF1KA2 YKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCE
:::.::::.:::.:.:. :.:.:::::::::.::::
NP_001 YKCEECGKAFSHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCK
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pF1KA2 ECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDK
NP_001 ECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGK
330 340 350 360 370 380
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Smith-Waterman score: 2438; 47.5% identity (72.8% similar) in 779 aa overlap (2-744:330-1104)
10 20 30
pF1KA2 MAFSQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRT
:::.. . :. ... .:: . ..
NP_003 GKAFSHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKE-CGKA
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pF1KA2 LYRDVMLENYRNLVSLDISSKCTM--KEF--LSTAQGNREVFHAGTLQIHESHHNGDFCY
. . : :.. . . :: : : ::: .. ..::: .... .. :
NP_003 FSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHK-IIHAGE-KLYKCEECGKAFN
360 370 380 390 400 410
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pF1KA2 QDVDKDIHDY---------------EFQWQED---ERNGH--EAPMTKIKKL------TG
.. . :: . :.:. . .. : : :. : :. ..
NP_003 RSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPF-KCKECGKAFIWSS
420 430 440 450 460 470
130 140 150 160 170
pF1KA2 STERYDQSHARNKPIK-DQLGSSFH--SHLPEMHIFQTEEKIDN--QVVKSIHDASLVST
. :. . :. .:: : .. :..:. : : . .:..: :: . . :..... ..
NP_003 TLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNK
480 490 500 510 520 530
180 190 200 210 220 230
pF1KA2 AQRISCRPKTHISNNHGNNFWNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQII
. : : : . .. :. : . : :: .. .: .: ..:.: :::::.:: : :.::
NP_003 HKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKII
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240 250 260 270 280 290
pF1KA2 HLADK-YKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGE
: ..: :::. ::: : . .: :.: ::::.::::.::::.::..:.:. :.:.::::
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pF1KA2 KPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYK
:::::.:: ::: .: : :.: :::::::::.:: :::.. : ::.:. .:.::: ::
NP_003 KPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYK
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pF1KA2 CNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEEC
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NP_003 CEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKPFKCKEC
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pF1KA2 DKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDKAF
::. . :.. :..::: .. :::.::::.:::.:.:: :. ::::.::::.:: :::
NP_003 GKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCKECGKAF
780 790 800 810 820 830
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pF1KA2 RFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFSWKS
. .: : .:. ::.::: :::.::::.:...: :: :. .:: :: : .::.:.: :.:
NP_003 KHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDKAFIWSS
840 850 860 870 880 890
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pF1KA2 SLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFNQQLTLKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEI
.:: :.:.:. :: :::.::::.:.: : :.:.:.::.:::::. ::.: .:.:
NP_003 TLTEHKRIHTREKTYKCEECGKAFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTT
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pF1KA2 HQKIHTEQNPYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFRVKSNLEGHRRI
:. ::: ..::::.::::.: ..:.:: :. .:::::::::::: ::: .:.: : :.
NP_003 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHTRM
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pF1KA2 HTGEKPYKCNECGKTFSRKSYFVCHHRLHTGEKPYKCNECGKNFSQKSSLICHHRLHTGE
:::::::::.::::.:.:.: .. :. .:::::::::.:::: : ..:.: :.:.:: :
NP_003 HTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNGHKRIHTRE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
720 730 740
pF1KA2 KPYKCNECGKTFSQKSNLTCHRRLHTGEKQV
:::::.::::.:::.:.:: :.:::::::
NP_003 KPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKHKIIHTGEKPYK
1080 1090 1100 1110 1120 1130
>--
initn: 657 init1: 657 opt: 676 Z-score: 351.6 bits: 76.4 E(85289): 7.6e-13
Smith-Waterman score: 793; 41.2% identity (61.4% similar) in 391 aa overlap (2-389:7-329)
10 20 30 40 50
pF1KA2 MAFSQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLDIS-SKCT
.. .::::::::::::: :::.::: ::..:::.:::::::::. : :. ::
NP_003 MPGTPGSLEMGLLTFRDVAIEFSPEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLAFLGIALSKPD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA2 MKEFLSTAQGNREVFHAGTLQIHESHHNGDFCYQDVDKDIHDYEFQWQEDERNGHEAPMT
. .: :: .: .. .. :: ::. :
NP_003 LITYL--EQG-KEPWN---MKQHEM----------VDE-------------------P--
70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KA2 KIKKLTGSTERYDQSHARNKPIKDQLGSSFHSHLPEMHIFQTEEKIDNQVVKSIHDASLV
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NP_003 -----TGICPHFPQDFWPEQSMED----SFQKVL-----LRKYEKCGHENLQLRKGCKSV
90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KA2 STAQRISCRPKTHISNNHGNNFWNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSL-LRKH
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NP_003 DE-----C--KVH---KEGYNKLNQCLTTAQSKV------FQCGKYLKVF-YKFLNSNRH
130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KA2 QIIHLADK-YKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLH
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NP_003 TIRHTGKKCFKCKKCVKSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWSSTLTNHKEIH
180 190 200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KA2 TGEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEK
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NP_003 TEDKPYKCEECGKAFKQLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECGKAFLWSSTLTRHKRIHTGEK
240 250 260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KA2 PYKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKC
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NP_003 PYKCEECGKAFSHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKC
300 310 320 330 340 350
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pF1KA2 EECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECD
NP_003 KECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECG
360 370 380 390 400 410
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pF1KA2 KDIHDYEFQWQEDERNGHEAPMTKIKKLTGSTERYDQSHARNKPIK-DQLGSSFH--SHL
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NP_001 GYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCKECGKSFCMLPHL
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pF1KA2 PEMHIFQTEEKIDN--QVVKSIHDASLVSTAQRISCRPKTHISNNHGNNF-WNSSLLTQK
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NP_001 AQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFNWSSRLTTHK
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KA2 QEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQIIHLADK-YKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCH
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NP_001 KN-YTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIH
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pF1KA2 TGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEK
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NP_001 PGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEK
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pF1KA2 PYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKC
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NP_001 FYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKLTHTGEKPYKC
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390 400 410 420 430 440
pF1KA2 NECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECG
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NP_001 EECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEKPYKCEECG
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KA2 KTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDKAFRFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFS
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NP_001 KAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYKCEECGKAFN
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KA2 RKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFSWKSSLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFNQQLT
. : :: :.:.::::: :::.::.:.:. .:.:: :...:.::: :::.::::.:.:. .
NP_001 HFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECGKAFTQSSN
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570 580 590 600 610 620
pF1KA2 LKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEIHQKIHTEQNPYKCNECGKTFSRTSSLTCH
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NP_001 LTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFKWSSTLTKH
550 560 570 580 590 600
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pF1KA2 RRLHTGEKPYKCEECDKAFRVKSNLEGHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYFVCHHRLH
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NP_001 KIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSNLIEHKKIH
610 620 630 640 650 660
690 700 710 720 730 740
pF1KA2 TGEKPYKCNECGKNFSQKSSLICHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSQKSNLTCHRRLHTGEK
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NP_001 TGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGEK
670 680 690 700 710 720
pF1KA2 QV
NP_001 LYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
730 740
>>NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 iso (744 aa)
initn: 4299 init1: 2255 opt: 2427 Z-score: 1180.8 bits: 229.2 E(85289): 4.9e-59
Smith-Waterman score: 2427; 53.5% identity (80.0% similar) in 630 aa overlap (122-744:95-723)
100 110 120 130 140
pF1KA2 KDIHDYEFQWQEDERNGHEAPMTKIKKLTGSTERYDQSHARNKPIK-DQLGSSFH--SHL
...:. ::...: .: . :.:: ::
NP_001 GYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCKECGKSFCMLPHL
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KA2 PEMHIFQTEEKIDN--QVVKSIHDASLVSTAQRISCRPKTHISNNHGNNF-WNSSLLTQK
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NP_001 AQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFNWSSRLTTHK
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KA2 QEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQIIHLADK-YKCDVCGKLFNQKRNLACHRRCH
.. . : : ..:.: ::::: ::.: :.::. ..: ::: :.: :::. ::. :.. :
NP_001 KN-YTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIH
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KA2 TGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFHFKSILERHRIIHTEEK
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NP_001 PGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEK
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pF1KA2 PYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKC
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NP_001 FYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKLTHTGEKPYKC
310 320 330 340 350 360
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pF1KA2 NECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECG
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NP_001 EECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAEKPYKCEECG
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KA2 KTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDKAFRFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFS
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NP_001 KAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYKCEECGKAFN
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KA2 RKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFSWKSSLTCHRRLHSGEKPYKCKECGKTFNQQLT
. : :: :.:.::::: :::.::.:.:. .:.:: :...:.::: :::.::::.:.:. .
NP_001 HFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECGKAFTQSSN
490 500 510 520 530 540
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pF1KA2 LKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEIHQKIHTEQNPYKCNECGKTFSRTSSLTCH
: :...:.: .:::::. ::.. :.: :. ::::..::::.::::.:. .:.:: :
NP_001 LTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFKWSSTLTKH
550 560 570 580 590 600
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pF1KA2 RRLHTGEKPYKCEECDKAFRVKSNLEGHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYFVCHHRLH
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NP_001 KIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSNLIEHKKIH
610 620 630 640 650 660
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pF1KA2 TGEKPYKCNECGKNFSQKSSLICHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSQKSNLTCHRRLHTGEK
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NP_001 TGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGEK
670 680 690 700 710 720
pF1KA2 QV
NP_001 LYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
730 740
>>XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger pro (803 aa)
initn: 4299 init1: 2255 opt: 2427 Z-score: 1180.5 bits: 229.2 E(85289): 5.1e-59
Smith-Waterman score: 2524; 48.8% identity (73.7% similar) in 777 aa overlap (17-744:7-782)
10 20 30 40 50
pF1KA2 MAFSQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLDIS-SKCTMKEFL
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XP_016 MDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCL
10 20 30 40 50
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pF1KA2 STAQGNREVFHAGTL----QIHESHHNGDF----------------CYQDVD-KDIHDYE
. : .. . . :: . :: :.. . :..: .
XP_016 EQEKEPWEPMRRHEMVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKNVHLKK
60 70 80 90 100 110
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pF1KA2 FQWQEDE----RNGHEA-----PMTKIKKLT-----------GSTERYDQSHARNKPIK-
. . :: :.:... : :. : . ....:. ::...: .:
XP_016 DHKSVDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKC
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KA2 DQLGSSFH--SHLPEMHIFQTEEKIDN--QVVKSIHDASLVSTAQRISCRPKTHISNNHG
. :.:: :: . .:..:. .. . . :... :... .::. : . .. :
XP_016 KECGKSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECG
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KA2 NNF-WNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQIIHLADK-YKCDVCGKLF
. : :.: : :.:.. . : : ..:.: ::::: ::.: :.::. ..: ::: :.: :
XP_016 KVFNWSSRLTTHKKN-YTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAF
240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KA2 NQKRNLACHRRCHTGENPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFHFKS
::. ::. :.. : ::.::::.::::.:. :.:: :.:.::::::: :::: :::. :
XP_016 NQSSNLTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFS
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320 330 340 350 360 370
pF1KA2 ILERHRIIHTEEKPYKCNECGKTFRQKSILTRHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTC
: :. ::: :: :::.:::..: ..: ::.:...:: .:::::.::::.:. .:.::
XP_016 NLTTHKRIHTAEKFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTE
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KA2 HHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKI
:. :::::::::.::::.:. :.:: : :.:::::::::: : ::.. ::. :..:
XP_016 HKLTHTGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRI
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KA2 HTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRRHTGEQPYKCEECDKAFRFKSNLERHRRIHTGE
:: .. :::.::::.:::.:.:: :.. : ..::::::: :::...:.: .:. ::::
XP_016 HTAEKPYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGE
470 480 490 500 510 520
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pF1KA2 KPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHRLHTGEKAYKCNECSKTFSWKSSLTCHRRLHSGEKPYK
:::::.::::.:.. : :: :.:.::::: :::.::.:.:. .:.:: :...:.::: ::
XP_016 KPYKCEECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYK
530 540 550 560 570 580
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pF1KA2 CKECGKTFNQQLTLKRHRRLHSGENPYKCEDSDKAYSFKSNLEIHQKIHTEQNPYKCNEC
:.::::.:.:. .: :...:.: .:::::. ::.. :.: :. ::::..::::.::
XP_016 CEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEEC
590 600 610 620 630 640
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pF1KA2 GKTFSRTSSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFRVKSNLEGHRRIHTGEKPYKCNECGKTF
::.:. .:.:: :. .:::::::::::: :::...:.: :. ::::::::::..:::.:
XP_016 GKAFKWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAF
650 660 670 680 690 700
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pF1KA2 SRKSYFVCHHRLHTGEKPYKCNECGKNFSQKSSLICHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSQKS
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XP_016 NRSSNLIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYS
710 720 730 740 750 760
740
pF1KA2 NLTCHRRLHTGEKQV
::: : ..:::::
XP_016 NLTTHNKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK
770 780 790 800
746 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:24:56 2016 done: Sat Nov 5 01:24:57 2016
Total Scan time: 9.010 Total Display time: 0.280
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]