Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2418
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2418, 839 aa
1>>>pF1KE2418 839 - 839 aa - 839 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
65089639 residues in 91964 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1200+/-0.000426; mu= 11.4371+/- 0.026
mean_var=117.4843+/-23.218, 0's: 0 Z-trim(114.4): 72 B-trim: 443 in 1/52
Lambda= 0.118327
statistics sampled from 25141 (25213) to 25141 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 6.470
The best scores are: opt bits E(91964)
NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 5554 960.1 0
NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 5554 960.1 0
NP_542436 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 5554 960.1 0
NP_061197 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 5554 960.1 0
NP_001170902 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 837) 2306 405.6 5e-112
XP_016875263 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 2306 405.7 5.2e-112
XP_005253975 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 2306 405.7 5.2e-112
NP_067638 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 871) 2306 405.7 5.2e-112
XP_011536932 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 922) 2306 405.7 5.4e-112
XP_005256733 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 763) 2122 374.2 1.3e-102
NP_057197 (OMIM: 606676) transient receptor potent ( 764) 2121 374.0 1.5e-102
XP_006721604 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 733) 2111 372.3 4.7e-102
XP_011522224 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 719) 2027 358.0 9.6e-98
XP_011536936 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 793) 1977 349.5 3.9e-95
XP_016880219 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 679) 1878 332.5 4.1e-90
XP_006721606 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 680) 1877 332.4 4.7e-90
NP_001170899 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 824) 1856 328.8 6.6e-89
XP_011536933 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 875) 1856 328.8 6.9e-89
XP_011536937 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 695) 1675 297.9 1.1e-79
XP_005256735 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 548) 1480 264.5 9.8e-70
XP_016880221 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 585) 1476 263.9 1.7e-69
XP_011522225 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 531) 1474 263.5 1.9e-69
XP_016880220 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 629) 1475 263.7 2e-69
XP_005256734 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 630) 1474 263.6 2.2e-69
NP_659505 (OMIM: 607066,614594,616400) transient r ( 790) 1380 247.6 1.8e-64
NP_001245134 (OMIM: 607066,614594,616400) transien ( 791) 1380 247.6 1.8e-64
NP_001170904 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 764) 1274 229.5 5e-59
XP_011536935 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 815) 1274 229.5 5.3e-59
XP_011522227 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 334) 942 172.6 2.9e-42
NP_671737 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 811) 840 155.4 1.1e-36
XP_011536934 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 862) 840 155.4 1.1e-36
NP_062815 (OMIM: 606679) transient receptor potent ( 729) 517 100.2 3.8e-20
NP_061116 (OMIM: 606680) transient receptor potent ( 765) 499 97.2 3.4e-19
NP_003295 (OMIM: 602343) short transient receptor ( 759) 189 44.2 0.0028
XP_005247796 (OMIM: 602343) short transient recept ( 661) 188 44.0 0.0028
XP_005247795 (OMIM: 602343) short transient recept ( 695) 188 44.0 0.003
XP_016862610 (OMIM: 602343) short transient recept ( 732) 188 44.1 0.0031
NP_001238774 (OMIM: 602343) short transient recept ( 793) 188 44.1 0.0033
>>NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potential (839 aa)
initn: 5554 init1: 5554 opt: 5554 Z-score: 5129.4 bits: 960.1 E(91964): 0
Smith-Waterman score: 5554; 99.8% identity (99.9% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
NP_542 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE2 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
790 800 810 820 830
>>NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potential (839 aa)
initn: 5554 init1: 5554 opt: 5554 Z-score: 5129.4 bits: 960.1 E(91964): 0
Smith-Waterman score: 5554; 99.8% identity (99.9% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
NP_542 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE2 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
790 800 810 820 830
>>NP_542436 (OMIM: 602076) transient receptor potential (839 aa)
initn: 5554 init1: 5554 opt: 5554 Z-score: 5129.4 bits: 960.1 E(91964): 0
Smith-Waterman score: 5554; 99.8% identity (99.9% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
NP_542 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
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NP_542 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
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NP_542 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
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NP_061 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
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pF1KE2 KELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPG-F
.:..:. . : ::.:::::::::::: : ::: .::::.: :.: ::. : . : :
NP_001 REFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQP-KDEGGYF
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pF1KE2 YFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFV
::::::::::::::: ::..: .: . ::. .:: ::::::::: .:::: .:::::
NP_001 YFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFV
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pF1KE2 TSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHL
:.::. .:. :.: : .:: . :. :..:: .:: :::::.. .:..::. . . :::
NP_001 TKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHL
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pF1KE2 SRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTC-EKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQD
:::: .::::::.::::::: .::: :. ::::...:.: . :::.:: :::.:.::.:
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pF1KE2 KWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEILSVLGG
:: .: ::.: . : :.:::..:::.:..: ::. .. ::.:..::..... :
NP_001 KWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTG
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pF1KE2 VYFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFS
: ::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :.: :::.
NP_001 VLFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFA
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pF1KE2 LALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKN
:.::: : ::.:::.. : :..::.:....:: ::..::..:..:...:.:.:.. :
NP_001 LVLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCAN
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pF1KE2 DSLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFII
.. .:. .. :.:: :: ... . :.:::.::::::::. . . .::::
NP_001 MKVCNEDQTNCTVPTYPSCR--DS--ETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFII
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pF1KE2 LLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFR
::..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.:: .:::::
NP_001 LLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFR
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pF1KE2 SGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSR
::... :: . :: : :::::::::::. :: :.::::::::. : . .:: .:
NP_001 SGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YGFSHTVGR
730 740 750 760 770 780
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pF1KE2 VSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
. .:.. .:: . : . ....:.::
NP_001 LRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAP
790 800 810 820 830
NP_001 L
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XP_016 ADLDGLLPFLLTHKKRLTDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNM
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pF1KE2 KELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPG-F
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XP_016 REFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQP-KDEGGYF
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pF1KE2 YFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFV
::::::::::::::: ::..: .: . ::. .:: ::::::::: .:::: .:::::
XP_016 YFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFV
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pF1KE2 TSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHL
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XP_016 TKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHL
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pF1KE2 SRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTC-EKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQD
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XP_016 SRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVLEILVYNS-KIENRHEMLAVEPINELLRD
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pF1KE2 KWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEILSVLGG
:: .: ::.: . : :.:::..:::.:..: ::. .. ::.:..::..... :
XP_016 KWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTG
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pF1KE2 VYFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFS
: ::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :.: :::.
XP_016 VLFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFA
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pF1KE2 LALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKN
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XP_016 LVLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCAN
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pF1KE2 DSLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFII
.. .:. .. :.:: :: ... . :.:::.::::::::. . . .::::
XP_016 MKVCNEDQTNCTVPTYPSCR--DS--ETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFII
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pF1KE2 LLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFR
::..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.:: .:::::
XP_016 LLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFR
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pF1KE2 SGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSR
::... :: . :: : :::::::::::. :: :.::::::::. : . .:: .:
XP_016 SGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YGFSHTVGR
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790 800 810 820 830
pF1KE2 VSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
. .:.. .:: . : . ....:.::
XP_016 LRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAP
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XP_016 L
>>XP_005253975 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,184095 (871 aa)
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pF1KE2 GELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFEAVAQNNC
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XP_005 MDSLFDYGTYRHHSSDNKRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGST
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pF1KE2 QDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEIARQTDSL
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XP_005 ADLDGLLPFLLTHKKRLTDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNM
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190 200 210 220 230 240
pF1KE2 KELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPG-F
.:..:. . : ::.:::::::::::: : ::: .::::.: :.: ::. : . : :
XP_005 REFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQP-KDEGGYF
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250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFV
::::::::::::::: ::..: .: . ::. .:: ::::::::: .:::: .:::::
XP_005 YFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFV
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pF1KE2 TSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHL
:.::. .:. :.: : .:: . :. :..:: .:: :::::.. .:..::. . . :::
XP_005 TKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHL
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XP_005 SRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVLEILVYNS-KIENRHEMLAVEPINELLRD
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pF1KE2 KWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEILSVLGG
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XP_005 KWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]