Result of FASTA (omim) for
pFN21AB6555
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6555, 372 aa
1>>>pF1KB6555 372 - 372 aa - 372 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5170+/-0.000323; mu= 12.3676+/- 0.021
mean_var=108.1054+/-21.293, 0's: 0 Z-trim(118.1): 53 B-trim: 291 in 2/53
Lambda= 0.123353
statistics sampled from 30732 (30790) to 30732 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.361), width: 16
Scan time: 7.900
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060692 (OMIM: 608120) alpha-parvin [Homo sapien ( 412) 2390 435.7 9.3e-122
XP_005253072 (OMIM: 608120) PREDICTED: alpha-parvi ( 328) 2092 382.6 7.1e-106
NP_037459 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform b [Ho ( 364) 1777 326.5 5.8e-89
NP_001003828 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform a ( 397) 1614 297.6 3.3e-80
NP_001230314 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform c ( 327) 1610 296.8 4.7e-80
XP_005261653 (OMIM: 608121) PREDICTED: beta-parvin ( 312) 1541 284.5 2.2e-76
XP_016884281 (OMIM: 608121) PREDICTED: beta-parvin ( 341) 1174 219.2 1.1e-56
NP_001230315 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform d ( 289) 938 177.2 4.3e-44
XP_011528604 (OMIM: 608122) PREDICTED: gamma-parvi ( 398) 859 163.2 9.4e-40
NP_001131077 (OMIM: 608122) gamma-parvin [Homo sap ( 331) 850 161.5 2.5e-39
XP_005261759 (OMIM: 608122) PREDICTED: gamma-parvi ( 331) 850 161.5 2.5e-39
NP_071424 (OMIM: 608122) gamma-parvin [Homo sapien ( 331) 850 161.5 2.5e-39
XP_016884397 (OMIM: 608122) PREDICTED: gamma-parvi ( 317) 786 150.1 6.4e-36
XP_016884396 (OMIM: 608122) PREDICTED: gamma-parvi ( 317) 786 150.1 6.4e-36
>>NP_060692 (OMIM: 608120) alpha-parvin [Homo sapiens] (412 aa)
initn: 2390 init1: 2390 opt: 2390 Z-score: 2307.0 bits: 435.7 E(85289): 9.3e-122
Smith-Waterman score: 2390; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (1-372:41-412)
10 20 30
pF1KB6 MATSPQKSPSVPKSPTPKSPPSRKKDDSFL
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KPQPQSRRRPLRPPSASSASRPARGSLRRAMATSPQKSPSVPKSPTPKSPPSRKKDDSFL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 GKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRS
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 DPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSE
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 IAQKQKLQTVLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IAQKQKLQTVLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDH
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 VSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 VSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLIT
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 FVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFA
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370
pF1KB6 FELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
380 390 400 410
>>XP_005253072 (OMIM: 608120) PREDICTED: alpha-parvin is (328 aa)
initn: 2092 init1: 2092 opt: 2092 Z-score: 2021.8 bits: 382.6 E(85289): 7.1e-106
Smith-Waterman score: 2092; 100.0% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (46-372:2-328)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 TPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTML
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTML
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 EENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEK
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 LESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAKSLVAILHLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAKSLVAILHLLV
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 ALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFD
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 HAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFL
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 TPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
280 290 300 310 320
>>NP_037459 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform b [Homo s (364 aa)
initn: 1733 init1: 1733 opt: 1777 Z-score: 1718.2 bits: 326.5 E(85289): 5.8e-89
Smith-Waterman score: 1777; 75.1% identity (91.0% similar) in 365 aa overlap (10-372:3-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MATSPQKSPSVPKSPTPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLP
:.:.::::. : :::.::::::::::::...:.:::.::::: :::: :
NP_037 MSSAPRSPTPR-PRRMKKDESFLGKLGGTLARKRRAREVSDLQEEGKNAINSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLA
.:: .. ::::.::::: :::.::.:. :::..::.:::.:::::::: ::::::.:
NP_037 MSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB6 EDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWN
::::::::::::.::: . ::::::::::::.:::::::::: ... :. :: ...:.
NP_037 EDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 VDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNT
:::.:.:.:::::::::.:...::::::::.::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:
NP_037 VDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 EALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVL
: . :: ::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 EMMMGRFERDAFDTLFDHAPDKLSVVKKSLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTL
:::::: :::::: :.:::.::.::: ::::::::: ::::.::: ::::.:: ::::::
NP_037 LMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTL
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 RVLYNLFTKYRNVE
::::::::::.:::
NP_037 RVLYNLFTKYKNVE
360
>>NP_001003828 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform a [Hom (397 aa)
initn: 1613 init1: 1613 opt: 1614 Z-score: 1560.9 bits: 297.6 E(85289): 3.3e-80
Smith-Waterman score: 1614; 76.0% identity (91.2% similar) in 329 aa overlap (46-372:71-397)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 TPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTML
::.::::: :::: :.:: .. ::::.:
NP_001 SQALMASLAGSLLPGSDRSGVETSEYAQGGVSDLQEEGKNAINSPMSPALVDVHPEDTQL
50 60 70 80 90 100
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 EENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEK
:::: :::.::.:. :::..::.:::.:::::::: ::::::.: ::::::::::::.::
NP_001 EENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEK
110 120 130 140 150 160
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 LESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWNVDSVHAKSLVAILHL
: . ::::::::::::.:::::::::: ... :. :: ...:.:::.:.:.:::::::
NP_001 LAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHL
170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 LVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTL
::.:...::::::::.::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:: . :: ::::::::
NP_001 LVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTTEMMMGRFERDAFDTL
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 FDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSF
::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :
NP_001 FDHAPDKLSVVKKSLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHF
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 FLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
.:::.::.::: ::::::::: ::::.::: ::::.:: ::::::::::::::::.:::
NP_001 YLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE
340 350 360 370 380 390
>>NP_001230314 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform c [Hom (327 aa)
initn: 1609 init1: 1609 opt: 1610 Z-score: 1558.2 bits: 296.8 E(85289): 4.7e-80
Smith-Waterman score: 1610; 75.7% identity (91.2% similar) in 329 aa overlap (46-372:1-327)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 TPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTML
.:.::::: :::: :.:: .. ::::.:
NP_001 MSDLQEEGKNAINSPMSPALVDVHPEDTQL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 EENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEK
:::: :::.::.:. :::..::.:::.:::::::: ::::::.: ::::::::::::.::
NP_001 EENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEK
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 LESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWNVDSVHAKSLVAILHL
: . ::::::::::::.:::::::::: ... :. :: ...:.:::.:.:.:::::::
NP_001 LAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHL
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 LVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTL
::.:...::::::::.::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:: . :: ::::::::
NP_001 LVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTTEMMMGRFERDAFDTL
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 FDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSF
::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :
NP_001 FDHAPDKLSVVKKSLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHF
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 FLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
.:::.::.::: ::::::::: ::::.::: ::::.:: ::::::::::::::::.:::
NP_001 YLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE
270 280 290 300 310 320
>>XP_005261653 (OMIM: 608121) PREDICTED: beta-parvin iso (312 aa)
initn: 1540 init1: 1540 opt: 1541 Z-score: 1492.2 bits: 284.5 E(85289): 2.2e-76
Smith-Waterman score: 1541; 75.8% identity (91.4% similar) in 314 aa overlap (61-372:1-312)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 GKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRS
.:: .. ::::.::::: :::.::.:.
XP_005 MSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKE
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSE
:::..::.:::.:::::::: ::::::.: ::::::::::::.::: . :::::::::::
XP_005 DPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSE
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200
pF1KB6 IAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWNVDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLP
:.:::::::::: ... :. :: ...:.:::.:.:.:::::::::.:...::::::::
XP_005 IGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLP
100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 DHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTL
.::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:: . :: ::::::::::::::::.::::.:
XP_005 EHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTTEMMMGRFERDAFDTLFDHAPDKLSVVKKSL
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 ITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :.:::.::.::: :::
XP_005 ITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVS
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370
pF1KB6 FAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
:::::: ::::.::: ::::.:: ::::::::::::::::.:::
XP_005 FAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE
270 280 290 300 310
>>XP_016884281 (OMIM: 608121) PREDICTED: beta-parvin iso (341 aa)
initn: 1130 init1: 1130 opt: 1174 Z-score: 1138.6 bits: 219.2 E(85289): 1.1e-56
Smith-Waterman score: 1588; 69.0% identity (84.7% similar) in 365 aa overlap (10-372:3-341)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MATSPQKSPSVPKSPTPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLP
:.:.::::. : :::.::::::::::::...:.:::.::::: :::: :
XP_016 MSSAPRSPTPR-PRRMKKDESFLGKLGGTLARKRRAREVSDLQEEGKNAINSP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLA
.:: .. ::::.::::: :::.::.:. :::..::.:::.:::::::: ::::::.:
XP_016 MSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB6 EDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWN
::::::::::::.::: . ::::::::::::.:::::::::: ... :. :: ...:.
XP_016 EDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 VDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNT
:::.:.:.:::::::::.:...::::::::.::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:
XP_016 VDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 EALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVL
: . :: ::::::::::::::::.:::: :::::::::
XP_016 EMMMGRFERDAFDTLFDHAPDKLSVVKK-----------------------FADGVYLVL
240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTL
:::::: :::::: :.:::.::.::: ::::::::: ::::.::: ::::.:: ::::::
XP_016 LMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTL
270 280 290 300 310 320
360 370
pF1KB6 RVLYNLFTKYRNVE
::::::::::.:::
XP_016 RVLYNLFTKYKNVE
330 340
>>NP_001230315 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform d [Hom (289 aa)
initn: 937 init1: 937 opt: 938 Z-score: 912.7 bits: 177.2 E(85289): 4.3e-44
Smith-Waterman score: 1352; 68.8% identity (84.1% similar) in 314 aa overlap (61-372:1-289)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 GKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRS
.:: .. ::::.::::: :::.::.:.
NP_001 MSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKE
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSE
:::..::.:::.:::::::: ::::::.: ::::::::::::.::: . :::::::::::
NP_001 DPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSE
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200
pF1KB6 IAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWNVDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLP
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NP_001 IGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLP
100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 DHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTL
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NP_001 EHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTTEMMMGRFERDAFDTLFDHAPDKLSVVKK--
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 ITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVS
::::::::::::::: :::::: :.:::.::.::: :::
NP_001 ---------------------FADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVS
210 220 230 240
330 340 350 360 370
pF1KB6 FAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
:::::: ::::.::: ::::.:: ::::::::::::::::.:::
NP_001 FAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE
250 260 270 280
>>XP_011528604 (OMIM: 608122) PREDICTED: gamma-parvin is (398 aa)
initn: 885 init1: 427 opt: 859 Z-score: 834.7 bits: 163.2 E(85289): 9.4e-40
Smith-Waterman score: 859; 42.4% identity (76.1% similar) in 335 aa overlap (39-368:53-383)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 PSVPKSPTPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQE-EGMNAINL-PLSPIPF
..:.: : :.:: :.:. : : .:
XP_011 SNWTGAGGRAGSQPFVGDGTLGTPNFCWDHKEKRAAE-SQLQAWEAMEPEFLYDLLQLPK
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ELDPE-DTMLEENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYD
..: . : .. . .. :.::.:::..::.:::..::: .:. :.:.:..: ::..:
XP_011 GVEPPAEEELSKGGKKKYLPPTSRKDPKFEELQKVLMEWINATLLPEHIVVRSLEEDMFD
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAK
: .:..::..: . ::.. ... . .::.:: .::: .:..:.: . ::.:.:. :
XP_011 GLILHHLFQRLAALKLEAEDIALTATSQKHKLTVVLEAVNRSLQLEEWQAKWSVESIFNK
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRH
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XP_011 DLLSTLHLLVALAKRFQPDLSLPTNVQVEVITIESTKSGLKSEKLVEQLT---EYSTDKD
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 E--RDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLL
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XP_011 EPPKDVFDELFKLAPEKVNAVKEAIVNFVNQKLDRLGLSVQNLDTQFADGVILLLLIGQL
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYN
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XP_011 EGFFLHLKEFYLTPNSPAEMLHNVTLALELLKDEGLLSCPVSPEDIVNKDAKSTLRVLYG
320 330 340 350 360 370
370
pF1KB6 LFTKYRNVE
:: :.
XP_011 LFCKHTQKAHRDRTPHGAPN
380 390
>>NP_001131077 (OMIM: 608122) gamma-parvin [Homo sapiens (331 aa)
initn: 885 init1: 427 opt: 850 Z-score: 827.2 bits: 161.5 E(85289): 2.5e-39
Smith-Waterman score: 850; 43.5% identity (78.1% similar) in 301 aa overlap (70-368:19-316)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 RKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMK
: . : .. . .. :.::.:::..::.:
NP_001 MEPEFLYDLLQLPKGVEPPAEEELSKGGKKKYLPPTSRKDPKFEELQK
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 VLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQT
::..::: .:. :.:.:..: ::..:: .:..::..: . ::.. ... . .::.:: .
NP_001 VLMEWINATLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQRLAALKLEAEDIALTATSQKHKLTV
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 VLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQ
::: .:..:.: . ::.:.:. :.:.. :::::::.. :. . :: .:...:....
NP_001 VLEAVNRSLQLEEWQAKWSVESIFNKDLLSTLHLLVALAKRFQPDLSLPTNVQVEVITIE
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 KREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHE--RDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLN
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NP_001 STKSGLKSEKLVEQLT---EYSTDKDEPPKDVFDELFKLAPEKVNAVKEAIVNFVNQKLD
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 KLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDG
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NP_001 RLGLSVQNLDTQFADGVILLLLIGQLEGFFLHLKEFYLTPNSPAEMLHNVTLALELLKDE
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370
pF1KB6 GLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
:: . :::::: : ::::::::.:: :.
NP_001 GLLSCPVSPEDIVNKDAKSTLRVLYGLFCKHTQKAHRDRTPHGAPN
290 300 310 320 330
372 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 23:18:51 2016 done: Fri Nov 4 23:18:52 2016
Total Scan time: 7.900 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]