FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8971, 362 aa 1>>>pF1KB8971 362 - 362 aa - 362 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8418+/-0.000706; mu= 20.3921+/- 0.043 mean_var=99.3480+/-24.925, 0's: 0 Z-trim(111.3): 237 B-trim: 1411 in 2/49 Lambda= 0.128675 statistics sampled from 11957 (12278) to 11957 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16 Scan time: 3.270 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 2364 449.0 2.9e-126 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 735 146.6 3.2e-35 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 735 146.7 3.4e-35 CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 734 146.4 3.6e-35 CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 734 146.4 3.7e-35 CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 681 136.6 3.2e-32 CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 661 132.9 4.3e-31 CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 661 132.9 4.4e-31 CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 650 130.8 1.8e-30 CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 621 125.5 7.5e-29 CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 586 118.9 6.6e-27 CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 581 118.0 1.3e-26 CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 571 116.1 4.5e-26 CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 571 116.1 4.6e-26 CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 568 115.6 6.7e-26 CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 567 115.4 8e-26 CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 562 114.5 1.5e-25 CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 552 112.6 5.2e-25 CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 552 112.7 5.4e-25 CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 550 112.3 6.8e-25 CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 548 111.9 9.1e-25 CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 542 110.8 1.9e-24 CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 499 102.8 4.8e-22 CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 499 102.8 5.1e-22 CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 471 97.6 1.8e-20 CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 463 96.1 5e-20 CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 455 94.7 1.5e-19 CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 450 93.7 2.6e-19 CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 441 92.0 8e-19 CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 423 88.7 8.6e-18 CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 ( 358) 412 86.6 3.5e-17 CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 404 85.1 9.3e-17 CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 404 85.2 1e-16 CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 403 85.0 1.1e-16 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 399 84.2 1.9e-16 CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 399 84.3 2e-16 CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 ( 319) 396 83.6 2.6e-16 CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 392 82.9 4.7e-16 CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 390 82.6 6.1e-16 CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 388 82.2 7.8e-16 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 388 82.2 8.1e-16 CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 385 81.6 1.2e-15 CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 383 81.3 1.5e-15 CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 378 80.4 2.9e-15 CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 376 80.0 3.7e-15 CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 374 79.6 4.7e-15 CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 374 79.6 4.9e-15 CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 374 79.6 5e-15 CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 368 78.5 1.1e-14 CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 368 78.5 1.1e-14 >>CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 (362 aa) initn: 2364 init1: 2364 opt: 2364 Z-score: 2380.3 bits: 449.0 E(32554): 2.9e-126 Smith-Waterman score: 2364; 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CCDS14 RESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPN----QRGLQRQ 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 PRLSSC-SAPTETHSLSWDN : : :. .:: :. CCDS14 PSSSRRDSSWSETSEASYSGL 350 360 >>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa) initn: 616 init1: 345 opt: 735 Z-score: 745.3 bits: 146.7 E(32554): 3.4e-35 Smith-Waterman score: 735; 41.1% identity (65.4% similar) in 350 aa overlap (14-360:76-412) 10 20 30 40 pF1KB8 MGTEATEQVSWGHYSGDEEDAYSAEPLPELCYKADVQAFSRAF :. .: :. . : : : . :.::: CCDS48 PFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSP-P--CPQDFSLNFDRAF 50 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 QPSVSLTVAALGLAGNGLVLATHLAARRAARSPTSAHLLQLALADLLLALTLPFAAAGAL :.. . ::: ::: : :. : .::.: : :.. ::.::.:: ::.::::. :. : CCDS48 LPALYSLLFLLGLLGNGAVAAV-LLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAA 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 QGWSLGSATCRTISGLYSASFHAGFLFLACISADRYVAIARALPAGPRPSTPGRAHLVSV : .::. :.. ..:.. .:.:: :.::::: :::. :..: : . :.:. :. . CCDS48 VQWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLY-RRGPPARVTLTCL 170 180 190 200 210 220 170 180 190 200 210 220 pF1KB8 IVWLLSLLLALPALLF--SQDGQREGQRRCRLIFPEGLTQTVKGASAVAQVALGFALPLG :: : ::.::: ..: .. .: . .:. :: :. . : : :.. :: ::: CCDS48 AVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNFP----QVGRTALRVLQLVAGFLLPLL 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 VMVACYALLGRTLLAARGPERRRALRVVVALVAAFVVLQLPYSLALLLDTADLLAARERS ::. ::: . .::..:: .: ::.:.::..:.::.. :: :..:.: :.: :. CCDS48 VMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARN 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KB8 CPASKRKDVALLVTSGLALARCGLNPVLYAFLGLRFRQDLRRLLRGGSCPSGPQPRRGCP : .: ::: :::::. .: :::.::::.:..::. . :: .::. .:: CCDS48 CGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPN----QRGLQ 340 350 360 370 380 390 350 360 pF1KB8 RRPRLSSC-SAPTETHSLSWDN :.: : :. .:: :. CCDS48 RQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL 400 410 >>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (372 aa) initn: 589 init1: 505 opt: 734 Z-score: 744.8 bits: 146.4 E(32554): 3.6e-35 Smith-Waterman score: 734; 41.0% identity (67.8% similar) in 332 aa overlap (30-355:41-366) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MGTEATEQVSWGHYSGDEEDAYSAEPLPELCYKADVQAFSRAFQPSVSLTVAALGLAGN :: : ::. :. : : . . .:: :: CCDS77 VIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWFLPIMYSIICFVGLLGN 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 GLVLATHLAARRAARSPTSAHLLQLALADLLLALTLPFAAAGALQGWSLGSATCRTISGL :::. :.. .: .. :...::.::.::.:. ::::: : .: ..: .: :. : .. CCDS77 GLVVLTYIYFKRL-KTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAKSWVFGVHFCKLIFAI 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 YSASFHAGFLFLACISADRYVAIARALPAG-PRPSTPGRAHLVSVIVWLLSLLLALPALL :. :: .:.:.: ::: ::::::..:. : : . ..: : .:.:. .:..: :: CCDS77 YKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWILATVLSIPELL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 FSQDGQR---EGQRRCRLIFPEGLTQTVKGASAVAQVALGFALPLGVMVACYALLGRTLL .: : :: : :: :: : . . . :::...:: .:: .: :: .. :::: CCDS77 YS-DLQRSSSEQAMRCSLI-TEHVEAFI--TIQVAQMVIGFLVPLLAMSFCYLVIIRTLL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 AARGPERRRALRVVVALVAAFVVLQLPYSLALLLDTADLLAARERSCPASKRKDVALLVT ::. :: .:..:..:.:..:.:.::::. ..: .:. . .: ::. ..: :: CCDS77 QARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCELSKQLNIAYDVT 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 SGLALARCGLNPVLYAFLGLRFRQDLRRLLRGGSCPSGPQPRR--GCPRRPRLSSCSAPT .:: .:: .:: ::::.:..::.:: .:.. .: : : :. .: :. : :: :. . CCDS77 YSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSC-RHIRRSSMSVEA 310 320 330 340 350 360 360 pF1KB8 ETHSLSWDN :: CCDS77 ETTTTFSP 370 >>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (378 aa) initn: 589 init1: 505 opt: 734 Z-score: 744.7 bits: 146.4 E(32554): 3.7e-35 Smith-Waterman score: 734; 41.0% identity (67.8% similar) in 332 aa overlap (30-355:47-372) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MGTEATEQVSWGHYSGDEEDAYSAEPLPELCYKADVQAFSRAFQPSVSLTVAALGLAGN :: : ::. :. : : . . .:: :: CCDS11 VIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWFLPIMYSIICFVGLLGN 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 GLVLATHLAARRAARSPTSAHLLQLALADLLLALTLPFAAAGALQGWSLGSATCRTISGL :::. :.. .: .. :...::.::.::.:. ::::: : .: ..: .: :. : .. CCDS11 GLVVLTYIYFKRL-KTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAKSWVFGVHFCKLIFAI 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 YSASFHAGFLFLACISADRYVAIARALPAG-PRPSTPGRAHLVSVIVWLLSLLLALPALL :. :: .:.:.: ::: ::::::..:. : : . ..: : .:.:. .:..: :: CCDS11 YKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWILATVLSIPELL 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 FSQDGQR---EGQRRCRLIFPEGLTQTVKGASAVAQVALGFALPLGVMVACYALLGRTLL .: : :: : :: :: : . . . :::...:: .:: .: :: .. :::: CCDS11 YS-DLQRSSSEQAMRCSLI-TEHVEAFI--TIQVAQMVIGFLVPLLAMSFCYLVIIRTLL 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 AARGPERRRALRVVVALVAAFVVLQLPYSLALLLDTADLLAARERSCPASKRKDVALLVT ::. :: .:..:..:.:..:.:.::::. ..: .:. . .: ::. ..: :: CCDS11 QARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCELSKQLNIAYDVT 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 SGLALARCGLNPVLYAFLGLRFRQDLRRLLRGGSCPSGPQPRR--GCPRRPRLSSCSAPT .:: .:: .:: ::::.:..::.:: .:.. .: : : :. .: :. : :: :. . CCDS11 YSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSC-RHIRRSSMSVEA 320 330 340 350 360 370 360 pF1KB8 ETHSLSWDN :: CCDS11 ETTTTFSP >>CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 (350 aa) initn: 656 init1: 301 opt: 681 Z-score: 691.9 bits: 136.6 E(32554): 3.2e-32 Smith-Waterman score: 681; 33.1% identity (64.0% similar) in 356 aa overlap (1-355:1-338) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MGTEATEQVSWGHYSGDEEDAYSAEPLPELCYKADVQAFSRAFQPSVSLTVAALGLAGNG :. : ...... . .. . .:. .: : ::. :...: : : ..:::::. CCDS30 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGNS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 LVLATHLAARRAARSPTSAHLLQLALADLLLALTLPFAAAGALQGWSLGSATCRTISGLY .:.: . : . :. :....:.::.::::: .:::: :..:..:: ::. :. :.:: CCDS30 MVVAIY-AYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALY 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB8 SASFHAGFLFLACISADRYVAIARALPAGPRPSTPGRAH-LVSVIVWLLSLLLALPALLF . .: .:. :::::: :::::.... : : :. .. ::. ..::..: :.: CCDS30 TLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKV----PSQSGVGKPCWIICFCVWMAAILLSIPQLVF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 SQDGQREGQRRCRLIFPEGLTQTVKGASAVAQVALGFALPLGVMVACYALLGRTLLAARG .. . :: :::. : ..:. . .. .::..:. .: .:: . .:::. . CCDS30 YTVND---NARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 PERRRALRVVVALVAAFVVLQLPYSLALLLDTADLLAARERSCPASKRKDVALLVTSGLA . : :.:....: .:.: ::::... . . :.. . :: ::: :.:. :: ..: CCDS30 IKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 LARCGLNPVLYAFLGLRFRQDLRRLLRGGSCPSGPQPRRGCPRRPRLSSCSAPTETHSLS : . :::.::.:.: :.. . .. . . : :: : : : .. CCDS30 LFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAK----------KYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPT 300 310 320 330 340 360 pF1KB8 WDN CCDS30 EPTSTFSI 350 >>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (357 aa) initn: 508 init1: 308 opt: 661 Z-score: 671.8 bits: 132.9 E(32554): 4.3e-31 Smith-Waterman score: 661; 34.5% identity (64.6% similar) in 328 aa overlap (31-357:26-352) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MGTEATEQVSWGHYSGDEEDAYSAEPLPELCYKADVQAFSRAFQPSVSLTVAALGLAGNG : : .:. :. : : . : .: ::. CCDS27 MADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFIVGALGNS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 LVLATHLAARRAARSPTSAHLLQLALADLLLALTLPFAAAGALQGWSLGSATCRTISGLY ::. .. :. .. :. ::.::.::::. .:::: : .: . :.. . :......: CCDS27 LVILVYWYCTRV-KTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCKVVNSMY 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB8 SASFHAGFLFLACISADRYVAIARALPAGP-RPSTPGRAHLVSVIVWLLSLLLALPALLF . .:.. :.. :::.:::.:::.:. : : . ...: .:.:. : .: .:. CCDS27 KMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALCIPEILY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 SQDGQREGQRRCRLIFPEGLTQTVKGASAVAQVALGFALPLGVMVACYALLGRTLLAARG :: .. : : ...: . .:.: . .: ::: ::. ::. ::... .::. :. CCDS27 SQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 PERRRALRVVVALVAAFVVLQLPYSLALLLDTADLLAARERSCPASKRKDVALLVTSGLA ...::.:.......::. :.::. ::..: : : .: .: :. . ::. .: CCDS27 SSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQVTQTIA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 LARCGLNPVLYAFLGLRFRQDLRRLLRGGSCPSGPQPRRGCPRRPRLSSCSAPTETHSLS . . ::::::.:.: :::.:: . :.. .: : : :. :. : :: : CCDS27 FFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLLETTSGA 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 WDN CCDS27 LSL >>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (369 aa) initn: 508 init1: 308 opt: 661 Z-score: 671.6 bits: 132.9 E(32554): 4.4e-31 Smith-Waterman score: 661; 34.5% identity (64.6% similar) in 328 aa overlap (31-357:38-364) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MGTEATEQVSWGHYSGDEEDAYSAEPLPELCYKADVQAFSRAFQPSVSLTVAALGLAGNG : : .:. :. : : . : .: ::. CCDS27 SPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFIVGALGNS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 LVLATHLAARRAARSPTSAHLLQLALADLLLALTLPFAAAGALQGWSLGSATCRTISGLY ::. .. :. .. :. ::.::.::::. .:::: : .: . :.. . :......: CCDS27 LVILVYWYCTRV-KTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCKVVNSMY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 SASFHAGFLFLACISADRYVAIARALPAGP-RPSTPGRAHLVSVIVWLLSLLLALPALLF . .:.. :.. :::.:::.:::.:. : : . ...: .:.:. : .: .:. CCDS27 KMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALCIPEILY 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 SQDGQREGQRRCRLIFPEGLTQTVKGASAVAQVALGFALPLGVMVACYALLGRTLLAARG :: .. : : ...: . .:.: . .: ::: ::. ::. ::... .::. :. CCDS27 SQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 PERRRALRVVVALVAAFVVLQLPYSLALLLDTADLLAARERSCPASKRKDVALLVTSGLA ...::.:.......::. :.::. ::..: : : .: .: :. . ::. .: CCDS27 SSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQVTQTIA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 LARCGLNPVLYAFLGLRFRQDLRRLLRGGSCPSGPQPRRGCPRRPRLSSCSAPTETHSLS . . ::::::.:.: :::.:: . :.. .: : : :. :. : :: : CCDS27 FFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLLETTSGA 310 320 330 340 350 360 360 pF1KB8 WDN CCDS27 LSL >>CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 (374 aa) initn: 497 init1: 223 opt: 650 Z-score: 660.5 bits: 130.8 E(32554): 1.8e-30 Smith-Waterman score: 650; 35.5% identity (69.6% similar) in 313 aa overlap (22-330:27-336) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MGTEATEQVSWGHYSGDEEDAYSAEPLPELCYKADVQAFSRAFQPSVSLTVAALG ::.. :: .:. ::: : : . . ..: CCDS52 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVFG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 LAGNGLVLATHLAARRAARSPTSAHLLQLALADLLLALTLPF-AAAGALQGWSLGSATCR : :: ::. : .: . ::: :...::..:.::.:..::::: :.. : .: ...:::. CCDS52 LLGNILVVIT-FAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVFSNATCK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 TISGLYSASFHAGFLFLACISADRYVAIARALPAGP-RPSTPGRAHLVSVIVWLLSLLLA ..:.:. .:. :.:.:.::: :::.::..: . : : :.... ..:: ::.... CCDS52 LLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIIS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 LPALLFSQDGQREGQRRCRLIFPEGLTQTVKGASAVAQVAL--GFALPLGVMVACYALLG ...:.: . .:. :. . . ... .. . . : :: .:: :. ::... CCDS52 SSTFVFNQKYNTQGSDVCEPKY-QTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMIFCYTFIV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 RTLLAARGPERRRALRVVVALVAAFVVLQLPYSLALLLDTADLLAARERSCPASKRKDVA .::. :.. .:..:.::..:.: .:.. :.:....::. .:.: . .::: . : . CCDS52 KTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTAANL-GKMNRSCQSEKLIGYT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 LLVTSGLALARCGLNPVLYAFLGLRFRQDLRRLLRGGSCPSGPQPRRGCPRRPRLSSCSA :: ::. .: ::::::::.: .::. . ..:. : CCDS52 KTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAGRYSENIS 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 PTETHSLSWDN CCDS52 RQTSETADNDNASSFTM 360 370 >>CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 (372 aa) initn: 569 init1: 238 opt: 621 Z-score: 631.4 bits: 125.5 E(32554): 7.5e-29 Smith-Waterman score: 621; 36.0% identity (61.3% similar) in 372 aa overlap (1-359:9-370) 10 20 30 40 pF1KB8 MGTEATEQVSWGHYSGDEEDAYSAEPLPE--LCYKAD---VQAFSRAFQPSV : : :.. : :. : :. : : :: .. . .:. .: : . CCDS84 MNYPLTLEMDLENLEDLFW---ELDRLDNYNDTSLVENHLCPATEGPLMASFKAVFVPVA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 SLTVAALGLAGNGLVLATHLAARRAARSPTSAHLLQLALADLLLALTLPFAAAGALQGWS . ::. :: :::. : .: .:: : . :..::.:::::.. ::::.: . :: CCDS84 YSLIFLLGVIGNVLVLVI-LERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSVGWV 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 LGSATCRTISGLYSASFHAGFLFLACISADRYVAIARALPAGPRPSTPGRAHLVSVIVWL ::. :.:. .:....:. . :.::::..:::.::..:. : : :.. .:: CCDS84 LGTFLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAY-RHRRLLSIHITCGTIWL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB8 LSLLLALPALLF---SQDGQREGQRRCRLIFPEGLTQTVKGASA--VAQVALGFALPLGV ...::::: .:: :: . .. :: . :. ..: .. . .:: :: ::. : CCDS84 VGFLLALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFS-QENQAETHAWFTSRFLYHVA-GFLLPMLV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 MVACYA-LLGRTLLAARGPERRRALRVVVALVAAFVVLQLPYSLALLLDTADLLAARERS : ::. .. : : : :.:..:.::.. ... : . :: ....::: : : . . CCDS84 MGWCYVGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVDNT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB8 CPASKRKDVALLVTSGLALARCGLNPVLYAFLGLRFRQDLRRLLRGGSCPSGPQPRRGCP : . ::. . :.::.: :::.::.: :..::.:: ::: .: .:: : CCDS84 CKLNGSLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGC-TGPASL--CQ 300 310 320 330 340 350 350 360 pF1KB8 RRP--RLSSCSAPTETHSLSWDN : : :: : .. ::. CCDS84 LFPSWRRSSLSESENATSLTTF 360 370 362 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 03:54:49 2016 done: Mon Nov 7 03:54:50 2016 Total Scan time: 3.270 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]