Result of FASTA (ccds) for pFN21AB8011
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8011, 414 aa
  1>>>pF1KB8011     414 - 414 aa - 414 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7430+/-0.000876; mu= 14.2162+/- 0.052
 mean_var=71.0516+/-14.139, 0's: 0 Z-trim(105.8): 121  B-trim: 4 in 1/50
 Lambda= 0.152155
 statistics sampled from 8583 (8713) to 8583 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.261), width:  16
 Scan time:  1.340

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS42196.1 WWOX gene_id:51741|Hs109|chr16         ( 414) 2794 622.8 1.9e-178
CCDS42197.1 WWOX gene_id:51741|Hs109|chr16         ( 189) 1171 266.3 1.7e-71
CCDS54320.1 RDH13 gene_id:112724|Hs109|chr19       ( 331)  612 143.7 2.5e-34
CCDS35195.1 DHRSX gene_id:207063|Hs109|chrX        ( 330)  555 131.2 1.4e-30
CCDS35195.1 DHRSX gene_id:207063|Hs109|chrY        ( 330)  555 131.2 1.4e-30
CCDS32104.1 RDH11 gene_id:51109|Hs109|chr14        ( 318)  539 127.7 1.6e-29
CCDS9787.1 RDH12 gene_id:145226|Hs109|chr14        ( 316)  538 127.5 1.8e-29
CCDS11246.2 DHRS13 gene_id:147015|Hs109|chr17      ( 377)  518 123.1 4.5e-28
CCDS1693.1 RDH14 gene_id:57665|Hs109|chr2          ( 336)  517 122.9 4.7e-28
CCDS42627.1 RDH13 gene_id:112724|Hs109|chr19       ( 260)  479 114.5 1.2e-25
CCDS58326.1 RDH11 gene_id:51109|Hs109|chr14        ( 248)  299 75.0 9.2e-14
CCDS58292.1 DHRS12 gene_id:79758|Hs109|chr13       ( 317)  275 69.8 4.4e-12


>>CCDS42196.1 WWOX gene_id:51741|Hs109|chr16              (414 aa)
 initn: 2794 init1: 2794 opt: 2794  Z-score: 3317.2  bits: 622.8 E(33420): 1.9e-178
Smith-Waterman score: 2794; 99.8% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (1-414:1-414)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAALRYAGLDDTDSEDELPPGWEERTTKDGWVYYANHTEEKTQWEHPKTGKRKRVAGDLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAALRYAGLDDTDSEDELPPGWEERTTKDGWVYYANHTEEKTQWEHPKTGKRKRVAGDLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 YGWEQETDENGQVFFVDHINKRTTYLDPRLAFTVDDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YGWEQETDENGQVFFVDHINKRTTYLDPRLAFTVDDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DFTGKVVVVTGANSGIGFETAKSFALHGAHVILACRNMARASEAVSRILEEWHKAKVETM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS42 DFTGKVVVVTGANSGIGFETAKSFALHGAHVILACRNMARASEAVSRILEEWHKAKVEAM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 TLDLALLRSVQHFAEAFKAKNVPLHVLVCNAATFALPWSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TLDLALLRSVQHFAEAFKAKNVPLHVLVCNAATFALPWSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 QLLQDVLCRSAPARVIVVSSESHRFTDINDSLGKLDFSRLSPTKNDYWAMLAYNRSKLCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QLLQDVLCRSAPARVIVVSSESHRFTDINDSLGKLDFSRLSPTKNDYWAMLAYNRSKLCN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 ILFSNELHRRLSPRGVTSNAVHPGNMMYSNIHRSWWVYTLLFTLARPFTKSMQQGAATTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ILFSNELHRRLSPRGVTSNAVHPGNMMYSNIHRSWWVYTLLFTLARPFTKSMQQGAATTV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410    
pF1KB8 YCAAVPELEGLGGMYFNNCCRCMPSPEAQSEETARTLWALSERLIQERLGSQSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YCAAVPELEGLGGMYFNNCCRCMPSPEAQSEETARTLWALSERLIQERLGSQSG
              370       380       390       400       410    

>>CCDS42197.1 WWOX gene_id:51741|Hs109|chr16              (189 aa)
 initn: 1171 init1: 1171 opt: 1171  Z-score: 1397.1  bits: 266.3 E(33420): 1.7e-71
Smith-Waterman score: 1171; 100.0% identity (100.0% similar) in 172 aa overlap (1-172:1-172)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAALRYAGLDDTDSEDELPPGWEERTTKDGWVYYANHTEEKTQWEHPKTGKRKRVAGDLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAALRYAGLDDTDSEDELPPGWEERTTKDGWVYYANHTEEKTQWEHPKTGKRKRVAGDLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 YGWEQETDENGQVFFVDHINKRTTYLDPRLAFTVDDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YGWEQETDENGQVFFVDHINKRTTYLDPRLAFTVDDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DFTGKVVVVTGANSGIGFETAKSFALHGAHVILACRNMARASEAVSRILEEWHKAKVETM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
CCDS42 DFTGKVVVVTGANSGIGFETAKSFALHGAHVILACRNMARASEAVSRILEEWKTKYHPPP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 TLDLALLRSVQHFAEAFKAKNVPLHVLVCNAATFALPWSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLV
                                                                   
CCDS42 EKCRIKIFH                                                   
                                                                   

>>CCDS54320.1 RDH13 gene_id:112724|Hs109|chr19            (331 aa)
 initn: 633 init1: 357 opt: 612  Z-score: 730.1  bits: 143.7 E(33420): 2.5e-34
Smith-Waterman score: 612; 40.6% identity (66.0% similar) in 288 aa overlap (124-405:38-317)

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB8 VDDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGRDFTGKVVVVTGANSGIGFETAKSFALHGAHVIL
                                     ::.:.:::::.::: .::  .: .:...::
CCDS54 LSALGTVAGAAVLLKDYVTGGACPSKATIPGKTVIVTGANTGIGKQTALELARRGGNIIL
        10        20        30        40        50        60       

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB8 ACRNMARASEAVSRILEEWHKAKVETMTLDLALLRSVQHFAEAFKAKNVPLHVLVCNAAT
       :::.: .   :.. :  :  . .:..  :::: :.:...::  .  ..  . .:. ::..
CCDS54 ACRDMEKCEAAAKDIRGETLNHHVNARHLDLASLKSIREFAAKIIEEEERVDILINNAGV
        70        80        90       100       110       120       

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB8 FALP-WSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLVQLLQDVLCRSAPARVIVVSSESHRFTDINDSL
       .  : :. :.::.:  : ::::::: :..:: : :  :::.:.: .:: .:         
CCDS54 MRCPHWT-TEDGFEMQFGVNHLGHFLLTNLLLDKLKASAPSRIINLSSLAH-------VA
       130        140       150       160       170                

            280       290       300       310       320            
pF1KB8 GKLDFSRLSPTKNDYWAMLAYNRSKLCNILFSNELHRRLSPRGVTSNAVHPGNMM-----
       :..::. :.     : .  :: .:::  .::..:: :::.  ::: ::.:::        
CCDS54 GHIDFDDLNWQTRKYNTKAAYCQSKLAIVLFTKELSRRLQGSGVTVNALHPGVARTELGR
     180       190       200       210       220       230         

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB8 YSNIHRSWWVYTLLFTLARPFTKSMQQGAATTVYCAAVPELEGLGGMYFNNCCRCMPSPE
       ...:: : .  : :  .   ..:: . .:  ..: :.. ::  ..: ::..  .  :.::
CCDS54 HTGIHGSTFSSTTLGPIFWLLVKSPELAAQPSTYLAVAEELADVSGKYFDGLKQKAPAPE
     240       250       260       270       280       290         

       390       400       410         
pF1KB8 AQSEETARTLWALSERLIQERLGSQSG     
       :..::.:: ::: : ::.              
CCDS54 AEDEEVARRLWAESARLVGLEAPSVREQPLPR
     300       310       320       330 

>>CCDS35195.1 DHRSX gene_id:207063|Hs109|chrX             (330 aa)
 initn: 558 init1: 350 opt: 555  Z-score: 662.5  bits: 131.2 E(33420): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 555; 37.8% identity (67.1% similar) in 286 aa overlap (125-401:44-319)

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB8 DDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGRDFTGKVVVVTGANSGIGFETAKSFALHGAHVILA
                                     .:..:::...:::. ::: .:  : :::.:
CCDS35 YAVGAAVILAQLLRRCRGGFLEPVFPPRPDRVAIVTGGTDGIGYSTAKHLARLGMHVIIA
            20        30        40        50        60        70   

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB8 CRNMARASEAVSRILEEWHKAKVETMTLDLALLRSVQHFAEAFKAKNVPLHVLVCNAATF
         : ..:...::.: ::  . ::: .  ::: . :...:.. :: :..:::::. ::...
CCDS35 GNNDSKAKQVVSKIKEETLNDKVEFLYCDLASMTSIRQFVQKFKMKKIPLHVLINNAGVM
            80        90       100       110       120       130   

          220       230       240       250           260          
pF1KB8 ALPWSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLVQLLQDVLCRS-AP---ARVIVVSSESHRFTDIN-
        .:   :.::.:  : .:.:::: :..:: :.: .: .:   :::..::: .:  ...: 
CCDS35 MVPQRKTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGHSARVVTVSSATHYVAELNM
           140       150       160       170       180       190   

     270       280       290       300       310         320       
pF1KB8 DSLGKLDFSRLSPTKNDYWAMLAYNRSKLCNILFSNELHRRLSPRG--VTSNAVHPGNMM
       :.:          ..  :    :: .:::  .::. .:.: :. .:  ::.:.: :: ..
CCDS35 DDL---------QSSACYSPHAAYAQSKLALVLFTYHLQRLLAAEGSHVTANVVDPG-VV
                    200       210       220       230       240    

       330        340        350       360       370       380     
pF1KB8 YSNIHRS-WWVYTLLFTL-ARPFTKSMQQGAATTVYCAAVPELEGLGGMYFNNCCRCMPS
        .....  .:.  :   : .  . :. ..:: :..: :..:::::.:: :. :  .    
CCDS35 NTDVYKHVFWATRLAKKLLGWLLFKTPDEGAWTSIYAAVTPELEGVGGHYLYNEKETKSL
           250       260       270       280       290       300   

         390       400       410    
pF1KB8 PEAQSEETARTLWALSERLIQERLGSQSG
         . ...  . ::. :             
CCDS35 HVTYNQKLQQQLWSKSCEMTGVLDVTL  
           310       320       330  

>>CCDS35195.1 DHRSX gene_id:207063|Hs109|chrY             (330 aa)
 initn: 558 init1: 350 opt: 555  Z-score: 662.5  bits: 131.2 E(33420): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 555; 37.8% identity (67.1% similar) in 286 aa overlap (125-401:44-319)

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB8 DDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGRDFTGKVVVVTGANSGIGFETAKSFALHGAHVILA
                                     .:..:::...:::. ::: .:  : :::.:
CCDS35 YAVGAAVILAQLLRRCRGGFLEPVFPPRPDRVAIVTGGTDGIGYSTAKHLARLGMHVIIA
            20        30        40        50        60        70   

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB8 CRNMARASEAVSRILEEWHKAKVETMTLDLALLRSVQHFAEAFKAKNVPLHVLVCNAATF
         : ..:...::.: ::  . ::: .  ::: . :...:.. :: :..:::::. ::...
CCDS35 GNNDSKAKQVVSKIKEETLNDKVEFLYCDLASMTSIRQFVQKFKMKKIPLHVLINNAGVM
            80        90       100       110       120       130   

          220       230       240       250           260          
pF1KB8 ALPWSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLVQLLQDVLCRS-AP---ARVIVVSSESHRFTDIN-
        .:   :.::.:  : .:.:::: :..:: :.: .: .:   :::..::: .:  ...: 
CCDS35 MVPQRKTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGHSARVVTVSSATHYVAELNM
           140       150       160       170       180       190   

     270       280       290       300       310         320       
pF1KB8 DSLGKLDFSRLSPTKNDYWAMLAYNRSKLCNILFSNELHRRLSPRG--VTSNAVHPGNMM
       :.:          ..  :    :: .:::  .::. .:.: :. .:  ::.:.: :: ..
CCDS35 DDL---------QSSACYSPHAAYAQSKLALVLFTYHLQRLLAAEGSHVTANVVDPG-VV
                    200       210       220       230       240    

       330        340        350       360       370       380     
pF1KB8 YSNIHRS-WWVYTLLFTL-ARPFTKSMQQGAATTVYCAAVPELEGLGGMYFNNCCRCMPS
        .....  .:.  :   : .  . :. ..:: :..: :..:::::.:: :. :  .    
CCDS35 NTDVYKHVFWATRLAKKLLGWLLFKTPDEGAWTSIYAAVTPELEGVGGHYLYNEKETKSL
           250       260       270       280       290       300   

         390       400       410    
pF1KB8 PEAQSEETARTLWALSERLIQERLGSQSG
         . ...  . ::. :             
CCDS35 HVTYNQKLQQQLWSKSCEMTGVLDVTL  
           310       320       330  

>>CCDS32104.1 RDH11 gene_id:51109|Hs109|chr14             (318 aa)
 initn: 656 init1: 390 opt: 539  Z-score: 643.8  bits: 127.7 E(33420): 1.6e-29
Smith-Waterman score: 661; 42.4% identity (67.4% similar) in 288 aa overlap (124-405:41-313)

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB8 VDDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGRDFTGKVVVVTGANSGIGFETAKSFALHGAHVIL
                                     ::::::::::.::: :::: .: .::.: :
CCDS32 LLLPFLLYMAAPQIRKMLSSGVCTSTVQLPGKVVVVTGANTGIGKETAKELAQRGARVYL
               20        30        40        50        60        70

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB8 ACRNMARASEAVSRILEEWHKAKVETMTLDLALLRSVQHFAEAFKAKNVPLHVLVCNAAT
       :::.. ..  ....:     . .: .  :::.  .:.. ::..: :..  ::::. ::..
CCDS32 ACRDVEKGELVAKEIQTTTGNQQVLVRKLDLSDTKSIRAFAKGFLAEEKHLHVLINNAGV
               80        90       100       110       120       130

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB8 FALPWSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLVQLLQDVLCRSAPARVIVVSSESHRFTDINDSLG
       .  :.: : ::.:  . ::::::: :..:: . : .:::.:.. ::: .:.       ::
CCDS32 MMCPYSKTADGFEMHIGVNHLGHFLLTHLLLEKLKESAPSRIVNVSSLAHH-------LG
              140       150       160       170       180          

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB8 KLDFSRLSPTKNDYWAMLAYNRSKLCNILFSNELHRRLSPRGVTSNAVHPGNMMYSNIHR
       .. :  :.  :  : : ::: .::: ::::..:: :::.  :::. .::::...   ...
CCDS32 RIHFHNLQGEKF-YNAGLAYCHSKLANILFTQELARRLKGSGVTTYSVHPGTVQSELVRH
           190        200       210       220       230       240  

                 340       350       360       370       380       
pF1KB8 S------WWVYTLLFTLARPFTKSMQQGAATTVYCAAVPELEGLGGMYFNNCCRCMPSPE
       :      ::....       : :. :::: :...:: .  :: :.: .:..:     : .
CCDS32 SSFMRWMWWLFSF-------FIKTPQQGAQTSLHCALTEGLEILSGNHFSDCHVAWVSAQ
            250              260       270       280       290     

       390       400       410    
pF1KB8 AQSEETARTLWALSERLIQERLGSQSG
       :..:  :: :: .:  :.         
CCDS32 ARNETIARRLWDVSCDLLGLPID    
         300       310            

>>CCDS9787.1 RDH12 gene_id:145226|Hs109|chr14             (316 aa)
 initn: 694 init1: 408 opt: 538  Z-score: 642.7  bits: 127.5 E(33420): 1.8e-29
Smith-Waterman score: 712; 41.6% identity (68.8% similar) in 308 aa overlap (101-408:20-314)

               80        90       100       110       120       130
pF1KB8 GQVFFVDHINKRTTYLDPRLAFTVDDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGRDFTGKVVVVT
                                     :. :. . :..   ..    .. :::::.:
CCDS97            MLVTLGLLTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNV----QLPGKVVVIT
                          10        20        30            40     

              140       150       160       170       180       190
pF1KB8 GANSGIGFETAKSFALHGAHVILACRNMARASEAVSRILEEWHKAKVETMTLDLALLRSV
       :::.::: :::. .: .::.: .:::.. ..  :.:.:  . ....: .  :::.  .:.
CCDS97 GANTGIGKETARELASRGARVYIACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKSI
          50        60        70        80        90       100     

              200       210       220       230       240       250
pF1KB8 QHFAEAFKAKNVPLHVLVCNAATFALPWSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLVQLLQDVLCRS
       . :::.: :..  ::.:. ::...  :.: : ::.:: . ::::::: :. :: . :  :
CCDS97 RAFAEGFLAEEKQLHILINNAGVMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLERLKVS
         110       120       130       140       150       160     

              260       270       280       290       300       310
pF1KB8 APARVIVVSSESHRFTDINDSLGKLDFSRLSPTKNDYWAMLAYNRSKLCNILFSNELHRR
       :::::. ::: .:.       .::. :  :.  :  :   .:: .::: :.::. :: .:
CCDS97 APARVVNVSSVAHH-------IGKIPFHDLQSEKR-YSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKR
         170              180       190        200       210       

              320       330       340       350       360       370
pF1KB8 LSPRGVTSNAVHPGNMMYSNIHRSWWVYTLLFTLARPFTKSMQQGAATTVYCAAVPELEG
       :.  :::. ::::: .. :.. :   .  ::. :  ::.:. ..:: :...:: .  :: 
CCDS97 LQGTGVTTYAVHPG-VVRSELVRHSSLLCLLWRLFSPFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEP
       220       230        240       250       260       270      

              380       390       400       410    
pF1KB8 LGGMYFNNCCRCMPSPEAQSEETARTLWALSERLIQERLGSQSG
       :.: ::..: :   ::.:....::. :: .: .:.  :      
CCDS97 LSGKYFSDCKRTWVSPRARNNKTAERLWNVSCELLGIRWE    
        280       290       300       310          

>>CCDS11246.2 DHRS13 gene_id:147015|Hs109|chr17           (377 aa)
 initn: 563 init1: 216 opt: 518  Z-score: 617.7  bits: 123.1 E(33420): 4.5e-28
Smith-Waterman score: 547; 38.7% identity (61.7% similar) in 287 aa overlap (121-404:33-310)

              100       110       120       130       140       150
pF1KB8 AFTVDDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGRDFTGKVVVVTGANSGIGFETAKSFALHGAH
                                     .. :...::::::::::  ::  .: .::.
CCDS11 ALLLGAGLLLGAYVLVYYNLVKAPPCGGMGNLRGRTAVVTGANSGIGKMTALELARRGAR
             10        20        30        40        50        60  

              160       170       180       190       200       210
pF1KB8 VILACRNMARASEAVSRILEEWHKAKVETMTLDLALLRSVQHFAEAFKAKNVPLHVLVCN
       :.::::.. :.  :.  . .:  . .:  :.:::: : ::. :: :: ...  : .:. :
CCDS11 VVLACRSQERGEAAAFDLRQESGNNEVIFMALDLASLASVRAFATAFLSSEPRLDILIHN
             70        80        90       100       110       120  

              220       230       240       250       260       270
pF1KB8 AATFALPWSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLVQLLQDVLCRSAPARVIVVSSESHRFTDIND
       :.  .   . :.....  ..:::.: : :..::   :   ::.::.::.: .:       
CCDS11 AGISSC--GRTREAFNLLLRVNHIGPFLLTHLLLPCLKACAPSRVVVVASAAH-------
              130       140       150       160       170          

              280        290       300       310       320         
pF1KB8 SLGKLDFSRLS-PTKNDYWAMLAYNRSKLCNILFSNELHRRLSPRGVTSNAVHPG--NMM
         :.:::.::. :. .    . ::  .:: :.::. ::  .:   :::  :.:::  :  
CCDS11 CRGRLDFKRLDRPVVGWRQELRAYADTKLANVLFARELANQLEATGVTCYAAHPGPVNSE
           180       190       200       210       220       230   

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB8 YSNIHRSWWVYTLLFTLARPFTKSMQQGAATTVYCAAVPELEGLGGMYFNNCCRCMPSPE
           :   :.  ::  ::    .. . :: : .:::    .: :.: :: ::      : 
CCDS11 LFLRHVPGWLRPLLRPLAWLVLRAPRGGAQTPLYCALQEGIEPLSGRYFANCHVEEVPPA
           240       250       260       270       280       290   

       390       400       410                                     
pF1KB8 AQSEETARTLWALSERLIQERLGSQSG                                 
       :.....:. ::  :.::                                           
CCDS11 ARDDRAAHRLWEASKRLAGLGPGEDAEPDEDPQSEDSEAPSSLSTPHPEEPTVSQPYPSP
           300       310       320       330       340       350   

>>CCDS1693.1 RDH14 gene_id:57665|Hs109|chr2               (336 aa)
 initn: 666 init1: 259 opt: 517  Z-score: 617.3  bits: 122.9 E(33420): 4.7e-28
Smith-Waterman score: 632; 40.5% identity (65.9% similar) in 299 aa overlap (124-405:43-332)

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB8 VDDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGRDFTGKVVVVTGANSGIGFETAKSFALHGAHVIL
                                     ::.:..::::::.:  ::  .   ::.::.
CCDS16 LGGALWLAARRFVGPRVQRLRRGGDPGLMHGKTVLITGANSGLGRATAAELLRLGARVIM
             20        30        40        50        60        70  

           160       170                    180       190       200
pF1KB8 ACRNMARASEAVSRILEEWHKA-------------KVETMTLDLALLRSVQHFAEAFKAK
       .::. ::: ::.... .: ..:             .. .  :::: ::::. : . .  .
CCDS16 GCRDRARAEEAAGQLRRELRQAAECGPEPGVSGVGELIVRELDLASLRSVRAFCQEMLQE
             80        90       100       110       120       130  

              210       220       230       240       250       260
pF1KB8 NVPLHVLVCNAATFALPWSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLVQLLQDVLCRSAPARVIVVSS
       .  : ::. ::. :  :.  :.::.:  : ::::::: :..::  .:  :::.:..::::
CCDS16 EPRLDVLINNAGIFQCPYMKTEDGFEMQFGVNHLGHFLLTNLLLGLLKSSAPSRIVVVSS
            140       150       160       170       180       190  

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pF1KB8 ESHRFTDINDSLGKLDFSRLSPTKNDYWAMLAYNRSKLCNILFSNELHRRLSPRGVTSNA
       . ... :::       :. :. ....:   . :.:::: ::::. :: :::   .:: :.
CCDS16 KLYKYGDIN-------FDDLN-SEQSYNKSFCYSRSKLANILFTRELARRLEGTNVTVNV
            200               210       220       230       240    

              330       340           350       360       370      
pF1KB8 VHPGNMMYSNIHRSWWVYTL---LFTLAR-PFTKSMQQGAATTVYCAAVPELEGLGGMYF
       .::: .. .:. :   .  :   ::.:.   : :.  .:: :..: :. ::.::..: ::
CCDS16 LHPG-IVRTNLGRHIHIPLLVKPLFNLVSWAFFKTPVEGAQTSIYLASSPEVEGVSGRYF
           250       260       270       280       290       300   

        380       390       400       410    
pF1KB8 NNCCRCMPSPEAQSEETARTLWALSERLIQERLGSQSG
       ..: .    :.:..: .:: :: .:: ..         
CCDS16 GDCKEEELLPKAMDESVARKLWDISEVMVGLLK     
           310       320       330           

>>CCDS42627.1 RDH13 gene_id:112724|Hs109|chr19            (260 aa)
 initn: 494 init1: 218 opt: 479  Z-score: 574.0  bits: 114.5 E(33420): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 479; 38.2% identity (63.0% similar) in 254 aa overlap (158-405:1-246)

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB8 VVTGANSGIGFETAKSFALHGAHVILACRNMARASEAVSRILEEWHKAKVETMTLDLALL
                                     : .   :.. :  :  . .:..  :::: :
CCDS42                               MEKCEAAAKDIRGETLNHHVNARHLDLASL
                                             10        20        30

       190       200       210        220       230       240      
pF1KB8 RSVQHFAEAFKAKNVPLHVLVCNAATFALP-WSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLVQLLQDV
       .:...::  .  ..  . .:. ::...  : :. :.::.:  : ::::::: :..:: : 
CCDS42 KSIREFAAKIIEEEERVDILINNAGVMRCPHWT-TEDGFEMQFGVNHLGHFLLTNLLLDK
               40        50        60         70        80         

        250       260       270       280       290       300      
pF1KB8 LCRSAPARVIVVSSESHRFTDINDSLGKLDFSRLSPTKNDYWAMLAYNRSKLCNILFSNE
       :  :::.:.: .:: .:         :..::. :.     : .  :: .:::  .::..:
CCDS42 LKASAPSRIINLSSLAH-------VAGHIDFDDLNWQTRKYNTKAAYCQSKLAIVLFTKE
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