Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8598
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8598, 776 aa
1>>>pF1KB8598 776 - 776 aa - 776 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0567+/-0.0012; mu= 16.5049+/- 0.072
mean_var=76.8325+/-14.710, 0's: 0 Z-trim(102.1): 37 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.146319
statistics sampled from 6785 (6807) to 6785 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 3.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34772.1 CUL1 gene_id:8454|Hs108|chr7 ( 776) 5030 1072.1 0
CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 745) 1613 350.8 4.8e-96
CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 758) 1613 350.8 4.8e-96
CCDS55709.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 764) 1613 350.8 4.9e-96
CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 895) 874 194.8 5.1e-49
CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 900) 874 194.8 5.1e-49
CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 913) 874 194.8 5.2e-49
CCDS9533.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 659) 830 185.5 2.4e-46
CCDS73604.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 667) 830 185.5 2.5e-46
CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 759) 830 185.5 2.8e-46
CCDS58751.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 ( 702) 615 140.1 1.2e-32
CCDS2462.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 ( 768) 615 140.1 1.3e-32
CCDS31668.1 CUL5 gene_id:8065|Hs108|chr11 ( 780) 521 120.3 1.2e-26
>>CCDS34772.1 CUL1 gene_id:8454|Hs108|chr7 (776 aa)
initn: 5030 init1: 5030 opt: 5030 Z-score: 5735.9 bits: 1072.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5030; 99.9% identity (100.0% similar) in 776 aa overlap (1-776:1-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSTRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELYTHVYNYCTSVHQSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSSTRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELYTHVYNYCTSVHQSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 QARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKDGEDLMDESVLKFYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKDGEDLMDESVLKFYT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRRECDEGRKGIYEIYSLALVTWRDCLFRPLNKQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRRECDEGRKGIYEIYSLALVTWRDCLFRPLNKQVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGPTLTVYKESFESQFLADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGPTLTVYKESFESQFLADT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHESTQDELARKCEQVLIEKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHESTQDELARKCEQVLIEKHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLETHIHNQGLAAIEKCGEAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLETHIHNQGLAAIEKCGEAAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 NDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFINNNAVTKMAQSSSKSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFINNNAVTKMAQSSSKSPE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQKFYAKMLAKRLVHQNSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQKFYAKMLAKRLVHQNSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 SDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNEQFKKHLTNSEPLDLDFSIQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNEQFKKHLTNSEPLDLDFSIQVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 SSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLYQLSKGELVTNCFKNRYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLYQLSKGELVTNCFKNRYT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 LQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDENANVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDENANVDE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 VELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMKTEQKQEQETTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMKTEQKQEQETTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KB8 MRKVLRHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILIEKEYLERVDGEKDTYSYLA
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MRKVLKHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILIEKEYLERVDGEKDTYSYLA
730 740 750 760 770
>>CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (745 aa)
initn: 1549 init1: 680 opt: 1613 Z-score: 1837.9 bits: 350.8 E(32554): 4.8e-96
Smith-Waterman score: 1730; 37.1% identity (68.2% similar) in 779 aa overlap (15-776:8-745)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSSTRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELYTHVYNYCTSVHQSN
. .:. :. : . :. : . . .. . . .. .: :.. .
CCDS71 MSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYALCVAYPE--
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 QARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKDGEDLMDESVLKFYT
: .: .:: . : ::.:.. .: : . .:.:: .:
CCDS71 -------P---------------LGERLYTETKIFLENHVRHLHKRVLE-SEEQVLVMYH
60 70 80
130 140 150 160
pF1KB8 QQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRR----ECD--EGRKGI------YEIYSLALVTWR
. ::.: .. .. . ::: ..... : : : :. .:: ::: ::
CCDS71 RYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWR
90 100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 DCLFRPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGPTLTVY
. .::. . .:. :...:.:: : ..: ::..:.:.. . . : : :
CCDS71 KLMVEPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHV-----EQYKKKFPLKFY
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 KESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHESTQDELA
.: ::: ::..: ..: .:....::.. ..::.:. .:: .:. : . ::: :. ..
CCDS71 QEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVI
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 RKCEQVLIEKHLEIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLETHIHNQG
..:.: .. ::...:.: .:.. .:..:.. :: :. .. :: .. . :..:::..:
CCDS71 HECQQRMVADHLQFLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEG
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 LAAIEKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFINNNAV
: : . . : : ..:..::.:: :. :. ...:.: :..::::: .:
CCDS71 LRATSNLTQE--NMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNY---
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 TKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQKFYAK
. .: :.:::::.:::.:::::.:. : :.:: :.. ..:::::.::::::::::.
CCDS71 -REPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYAR
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 MLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNEQFKKHLTNS
::::::.: : : :.: .::.:::::::.:.::::.::. :..:: :::..:.. . :.
CCDS71 MLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQ
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 EP---LDLDFSIQVLSSGSWPFQQ--SCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLY
. : ..:.: ::..:.::. : : :::.:.:::.: : : ::... ::::::::.
CCDS71 DTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLH
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 QLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQIL
: ::. : . . :. ...:.:::.:: .:. .. . ..: ::::.. :..... :
CCDS71 YLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSL
560 570 580 590 600 610
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 LKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMKTEQKQEQETTHKNI
: :.. ..:. ..: .. ..: .....:. . .:.. :. . ::.: :.. .
CCDS71 LDVKMINHDSEKEDIDA-----ESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQEMEQTRSAV
620 630 640 650 660 670
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 EEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLRHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILIEKEYLE
.::::. .::::::::: ::::::. :. ::..: .::.: . .:::::..::.:.:.:
CCDS71 DEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIE
680 690 700 710 720 730
770
pF1KB8 RVDGEKDTYSYLA
: .. : :::.:
CCDS71 RSQASADEYSYVA
740
>>CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (758 aa)
initn: 1549 init1: 680 opt: 1613 Z-score: 1837.7 bits: 350.8 E(32554): 4.8e-96
Smith-Waterman score: 1731; 36.9% identity (67.8% similar) in 792 aa overlap (2-776:11-758)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSSTRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELYTHVYN
. : : .: . . .:. :. : . :. : . . .. . . .. .:
CCDS73 MVPGKEFQHYTCTMSLKP---RVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 YCTSVHQSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKDGEDLM
:.. . : .: .:: . : ::.:.. .: : .
CCDS73 LCVAYPE----------P--------------LGERLYTETKIFLENHVRHLHKRVLE-S
60 70 80 90
120 130 140 150
pF1KB8 DESVLKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRR----ECD--EGRKGI------YEI
.:.:: .: . ::.: .. .. . ::: ..... : : : :. .::
CCDS73 EEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEI
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 YSLALVTWRDCLFRPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAF
::: :: . .::. . .:. :...:.:: : ..: ::..:.:.. . .
CCDS73 GELALDMWRKLMVEPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHV-----EQY
160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 AKGPTLTVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYL
: : :.: ::: ::..: ..: .:....::.. ..::.:. .:: .:. : . ::
CCDS73 KKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYL
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 HESTQDELARKCEQVLIEKHLEIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKL
: :. .. ..:.: .. ::...:.: .:.. .:..:.. :: :. .. :: .. .
CCDS73 HPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQE
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 LETHIHNQGLAAIEKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKAC
:..:::..:: : . . : : ..:..::.:: :. :. ...:.: :..:::::
CCDS73 LQNHIHDEGLRATSNLTQE--NMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKAL
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 GRFINNNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDK
.: . .: :.:::::.:::.:::::.:. : :.:: :.. ..:::::.::
CCDS73 TSVVNY----REPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDK
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 DVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNE
::::::::.::::::.: : : :.: .::.:::::::.:.::::.::. :..:: :::.
CCDS73 DVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNN
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 QFKKHLTNSEP---LDLDFSIQVLSSGSWPFQQ--SCTFALPSELERSYQRFTAFYASRH
.:.. . :.. : ..:.: ::..:.::. : : :::.:.:::.: : : ::...
CCDS73 KFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHF
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 SGRKLTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMD
::::::::. : ::. : . . :. ...:.:::.:: .:. .. . ..: ::::..
CCDS73 SGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEK
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 ILAQVLQILLKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMKTEQKQ
:..... :: :.. ..:. ..: .. ..: .....:. . .:.. :. . :
CCDS73 ELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDA-----ESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSMQKDTPQ
630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 EQETTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLRHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCID
:.: :.. ..::::. .::::::::: ::::::. :. ::..: .::.: . .:::::.
CCDS73 EMEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIE
680 690 700 710 720 730
760 770
pF1KB8 ILIEKEYLERVDGEKDTYSYLA
.::.:.:.:: .. : :::.:
CCDS73 VLIDKQYIERSQASADEYSYVA
740 750
>>CCDS55709.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (764 aa)
initn: 1549 init1: 680 opt: 1613 Z-score: 1837.7 bits: 350.8 E(32554): 4.9e-96
Smith-Waterman score: 1731; 36.9% identity (67.8% similar) in 792 aa overlap (2-776:17-764)
10 20 30 40
pF1KB8 MSSTRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMEL
. : : .: . . .:. :. : . :. : . . .. . .
CCDS55 MYRVTWSTFWLRFQHYTCTMSLKP---RVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDR
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 YTHVYNYCTSVHQSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLK
.. .: :.. . : .: .:: . : ::.:.. .: :
CCDS55 FSDIYALCVAYPE----------P--------------LGERLYTETKIFLENHVRHLHK
60 70 80 90
110 120 130 140 150
pF1KB8 DGEDLMDESVLKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRR----ECD--EGRKGI---
. .:.:: .: . ::.: .. .. . ::: ..... : : : :.
CCDS55 RVLE-SEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMN
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 ---YEIYSLALVTWRDCLFRPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGL
.:: ::: :: . .::. . .:. :...:.:: : ..: ::..:.:..
CCDS55 EPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHV--
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 NEDDAFAKGPTLTVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQR
. . : : :.: ::: ::..: ..: .:....::.. ..::.:. .:: .:.
CCDS55 ---EQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEI
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 RVQVYLHESTQDELARKCEQVLIEKHLEIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGL
: . ::: :. .. ..:.: .. ::...:.: .:.. .:..:.. :: :. .. ::
CCDS55 RCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGL
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 GELKKLLETHIHNQGLAAIEKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVA
.. . :..:::..:: : . . : : ..:..::.:: :. :. ...:.: :..
CCDS55 PHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQE--NMPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMS
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 ALDKACGRFINNNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVF
::::: .: . .: :.:::::.:::.:::::.:. : :.:: :.. ..::
CCDS55 ALDKALTSVVNY----REPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVF
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 KYIEDKDVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGV
:::.::::::::::.::::::.: : : :.: .::.:::::::.:.::::.::. :..:
CCDS55 KYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSV
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560
pF1KB8 SKDLNEQFKKHLTNSEP---LDLDFSIQVLSSGSWPFQQ--SCTFALPSELERSYQRFTA
: :::..:.. . :.. : ..:.: ::..:.::. : : :::.:.:::.: : :
CCDS55 SADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFEL
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 FYASRHSGRKLTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDS
::... ::::::::. : ::. : . . :. ...:.:::.:: .:. .. . ..: ::
CCDS55 FYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDS
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 TQIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPM
::.. :..... :: :.. ..:. ..: .. ..: .....:. . .:.. :
CCDS55 TQMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDIDA-----ESSFSLNMNFSSKRTKFKITTSM
630 640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 KTEQKQEQETTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLRHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPV
. . ::.: :.. ..::::. .::::::::: ::::::. :. ::..: .::.: . .
CCDS55 QKDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISM
680 690 700 710 720 730
750 760 770
pF1KB8 IKKCIDILIEKEYLERVDGEKDTYSYLA
:::::..::.:.:.:: .. : :::.:
CCDS55 IKKCIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA
740 750 760
>>CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (895 aa)
initn: 1030 init1: 366 opt: 874 Z-score: 993.5 bits: 194.8 E(32554): 5.1e-49
Smith-Waterman score: 1152; 31.7% identity (61.1% similar) in 769 aa overlap (18-776:196-895)
10 20 30 40
pF1KB8 MSSTRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELYT
:. :. :. ... . . :. : :::
CCDS43 SSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSI-KYNLEELYQ
170 180 190 200 210 220
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 HVYNYCTSVHQSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKD-
: : :. ..: :::.:... .... ...
CCDS43 AVENLCSYKISAN---------------------------LYKQLRQICEDHIKAQIHQF
230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 GEDLMDESV-LKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRRECDEGRKGIYEIYSLALV
:: .: . :: . :... . .. .: .:.: .: .. . . :....:
CCDS43 REDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQN-----SMLPSIWDMGLE
260 270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 TWRDCLF--RPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGP
.: .. . ..... ...: :::.:::::.:. :. .. :.. :
CCDS43 LFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSL------LSMLSD-------
320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 TLTVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHEST
: .:..:::..:: .:.:.:. :. ...:. : ::..... :: :: :. .:: ..:
CCDS43 -LQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTT
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 QDELARKCEQVLIEKHLE-IFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLET
: : :. :. .:: :.. ..:::: .. .::. .:.: ::.. :. . ::.
CCDS43 QKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGV---QVLLQ-
420 430 440 450 460 470
350 360 370 380 390
pF1KB8 HIHNQGLAAIEKCGEAALNDP---KMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKAC
: . :. : . . .: : .:: .:: . : . .. : .. :. :. .:
CCDS43 ----QWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAF
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 GRFINNNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDK
::: . .: ::.:.: :: :. ..:. . ::: :...:..:..: :
CCDS43 ETFIN--------KRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGK
540 550 560 570 580
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 DVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNE
:::. :: : :::::. .::: ::: ::.::::. :: .::::. ::.:. .:::.
CCDS43 DVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMI
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 QFKKHLTNSE-PLDLDFSIQVLSSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRK
:::... :.. : ........:. : :: :: :. . . : .:: ..:::::
CCDS43 QFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRK
650 660 670 680 690 700
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 LTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQ
: : :.. : .. ... ::.: :: .::..: . ...... ..: :. : .
CCDS43 LQWQSTLGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRR
710 720 730 740 750 760
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 VLQILLKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNIN-VPMKTEQKQEQE
.:: : .: :: .: . ..: : .: .:.: .:..:: . :: : .::
CCDS43 TLQSLACGKARVLA-KNPKGKDIE-DGDKFI-CNDDFKHKLFRIKINQIQMK-ETVEEQA
770 780 790 800 810
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 TTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLRHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILI
.: . . .::. :.:::::::::::.: :. :..:: .::. :: .:: :. ::
CCDS43 STTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKP--ADLKKRIESLI
820 830 840 850 860 870
760 770
pF1KB8 EKEYLERVDGEKDTYSYLA
...:.:: . . :.:.:
CCDS43 DRDYMERDKENPNQYNYIA
880 890
>>CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (900 aa)
initn: 1030 init1: 366 opt: 874 Z-score: 993.5 bits: 194.8 E(32554): 5.1e-49
Smith-Waterman score: 1152; 31.7% identity (61.1% similar) in 769 aa overlap (18-776:201-900)
10 20 30 40
pF1KB8 MSSTRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELYT
:. :. :. ... . . :. : :::
CCDS83 SSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSI-KYNLEELYQ
180 190 200 210 220
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 HVYNYCTSVHQSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKD-
: : :. ..: :::.:... .... ...
CCDS83 AVENLCSYKISAN---------------------------LYKQLRQICEDHIKAQIHQF
230 240 250 260
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 GEDLMDESV-LKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRRECDEGRKGIYEIYSLALV
:: .: . :: . :... . .. .: .:.: .: .. . . :....:
CCDS83 REDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQN-----SMLPSIWDMGLE
270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 TWRDCLF--RPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGP
.: .. . ..... ...: :::.:::::.:. :. .. :.. :
CCDS83 LFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSL------LSMLSD-------
320 330 340 350 360
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 TLTVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHEST
: .:..:::..:: .:.:.:. :. ...:. : ::..... :: :: :. .:: ..:
CCDS83 -LQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTT
370 380 390 400 410 420
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 QDELARKCEQVLIEKHLE-IFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLET
: : :. :. .:: :.. ..:::: .. .::. .:.: ::.. :. . ::.
CCDS83 QKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGV---QVLLQ-
430 440 450 460 470
350 360 370 380 390
pF1KB8 HIHNQGLAAIEKCGEAALNDP---KMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKAC
: . :. : . . .: : .:: .:: . : . .. : .. :. :. .:
CCDS83 ----QWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAF
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 GRFINNNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDK
::: . .: ::.:.: :: :. ..:. . ::: :...:..:..: :
CCDS83 ETFIN--------KRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGK
540 550 560 570 580
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 DVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNE
:::. :: : :::::. .::: ::: ::.::::. :: .::::. ::.:. .:::.
CCDS83 DVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMI
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 QFKKHLTNSE-PLDLDFSIQVLSSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRK
:::... :.. : ........:. : :: :: :. . . : .:: ..:::::
CCDS83 QFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRK
650 660 670 680 690 700
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 LTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQ
: : :.. : .. ... ::.: :: .::..: . ...... ..: :. : .
CCDS83 LQWQSTLGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRR
710 720 730 740 750 760
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 VLQILLKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNIN-VPMKTEQKQEQE
.:: : .: :: .: . ..: : .: .:.: .:..:: . :: : .::
CCDS83 TLQSLACGKARVLA-KNPKGKDIE-DGDKFI-CNDDFKHKLFRIKINQIQMK-ETVEEQA
770 780 790 800 810 820
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 TTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLRHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILI
.: . . .::. :.:::::::::::.: :. :..:: .::. :: .:: :. ::
CCDS83 STTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKP--ADLKKRIESLI
830 840 850 860 870 880
760 770
pF1KB8 EKEYLERVDGEKDTYSYLA
...:.:: . . :.:.:
CCDS83 DRDYMERDKENPNQYNYIA
890 900
>>CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (913 aa)
initn: 1030 init1: 366 opt: 874 Z-score: 993.4 bits: 194.8 E(32554): 5.2e-49
Smith-Waterman score: 1152; 31.7% identity (61.1% similar) in 769 aa overlap (18-776:214-913)
10 20 30 40
pF1KB8 MSSTRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELYT
:. :. :. ... . . :. : :::
CCDS35 SSFANSKPGSAKKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSI-KYNLEELYQ
190 200 210 220 230 240
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 HVYNYCTSVHQSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKD-
: : :. ..: :::.:... .... ...
CCDS35 AVENLCSYKISAN---------------------------LYKQLRQICEDHIKAQIHQF
250 260 270
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 GEDLMDESV-LKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRRECDEGRKGIYEIYSLALV
:: .: . :: . :... . .. .: .:.: .: .. . . :....:
CCDS35 REDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQN-----SMLPSIWDMGLE
280 290 300 310 320 330
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 TWRDCLF--RPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGP
.: .. . ..... ...: :::.:::::.:. :. .. :.. :
CCDS35 LFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSL------LSMLSD-------
340 350 360 370
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 TLTVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHEST
: .:..:::..:: .:.:.:. :. ...:. : ::..... :: :: :. .:: ..:
CCDS35 -LQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTT
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 QDELARKCEQVLIEKHLE-IFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLET
: : :. :. .:: :.. ..:::: .. .::. .:.: ::.. :. . ::.
CCDS35 QKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGV---QVLLQ-
440 450 460 470 480 490
350 360 370 380 390
pF1KB8 HIHNQGLAAIEKCGEAALNDP---KMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKAC
: . :. : . . .: : .:: .:: . : . .. : .. :. :. .:
CCDS35 ----QWIEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAF
500 510 520 530 540
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 GRFINNNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDK
::: . .: ::.:.: :: :. ..:. . ::: :...:..:..: :
CCDS35 ETFIN--------KRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGK
550 560 570 580 590 600
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 DVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNE
:::. :: : :::::. .::: ::: ::.::::. :: .::::. ::.:. .:::.
CCDS35 DVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMI
610 620 630 640 650 660
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 QFKKHLTNSE-PLDLDFSIQVLSSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRK
:::... :.. : ........:. : :: :: :. . . : .:: ..:::::
CCDS35 QFKQYMQNQNVPGNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRK
670 680 690 700 710 720
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 LTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQ
: : :.. : .. ... ::.: :: .::..: . ...... ..: :. : .
CCDS35 LQWQSTLGHCVLKAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRR
730 740 750 760 770 780
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 VLQILLKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNIN-VPMKTEQKQEQE
.:: : .: :: .: . ..: : .: .:.: .:..:: . :: : .::
CCDS35 TLQSLACGKARVLA-KNPKGKDIE-DGDKFI-CNDDFKHKLFRIKINQIQMK-ETVEEQA
790 800 810 820 830
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 TTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLRHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILI
.: . . .::. :.:::::::::::.: :. :..:: .::. :: .:: :. ::
CCDS35 STTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKP--ADLKKRIESLI
840 850 860 870 880 890
760 770
pF1KB8 EKEYLERVDGEKDTYSYLA
...:.:: . . :.:.:
CCDS35 DRDYMERDKENPNQYNYIA
900 910
>>CCDS9533.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (659 aa)
initn: 1000 init1: 367 opt: 830 Z-score: 945.4 bits: 185.5 E(32554): 2.4e-46
Smith-Waterman score: 1123; 33.9% identity (63.1% similar) in 697 aa overlap (88-776:2-659)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 QSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYL-TNLLKDGEDLMDESV-
:::.:.. .... ...: :: .: .
CCDS95 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLF
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRRECDEGRKGIYEIYSLALVTWRDCLF--R
:: . :.:. . .. .: .:.: .: .. . :....: .: .. .
CCDS95 LKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNST-----LPSIWDMGLELFRTHIISDK
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 PLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGPTLTVYKESFE
..... ...: :::.::.::... :. .. ::. : : :::.:::
CCDS95 MVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSL------LGMLSD--------LQVYKDSFE
90 100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHESTQDELARKCEQ
.:: .:. .:. :. ...:. : ::.... :: :: :: .:: .::: : :.
CCDS95 LKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEK
140 150 160 170 180 190
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VLIEKHLE-IFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLETHIHNQGLAAI
:. .:: :.. ...::: .. ::..::.: ::.. : : . .:.. : : .
CCDS95 QLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIV
200 210 220 230 240 250
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 EKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFINNNAVTKMA
. .: : :: .:: . : . .. :... :: . .. :::
CCDS95 IN----PEKDKDM-VQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFIN--------
260 270 280 290
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 QSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQKFYAKMLAK
. .: ::.:.. :: :. ..:. . ::: ::...:..:..:. ::::. :: : :::
CCDS95 KRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAK
300 310 320 330 340 350
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 RLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNEQFKKHLTN-SEPL
::. .::: ::: ::.::::. :: .::::. ::.:. .:::. .::.:. : :.
CCDS95 RLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSG
360 370 380 390 400 410
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 DLDFSIQVLSSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLYQLSKGELV
.:.....:. : :: : :. . . : ::: ..:::::: : :... :
CCDS95 PIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLK
420 430 440 450 460 470
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 TNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQILLKSKLLVL
.. ... .:.: :: .::..: :... ... .: :. . : ..:: : .: ::
CCDS95 AEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVL
480 490 500 510 520 530
660 670 680 690 700
pF1KB8 EDENANVDEVELKPDTLIKLYLG-YKNKKLRVNIN-VPMKTEQKQEQETTHKNIEEDRKL
.. . ::: : .: . : .:.: .:..:: . :: : .:: .: . . .::.
CCDS95 I-KSPKGKEVE-DGDKFI--FNGEFKHKLFRIKINQIQMK-ETVEEQVSTTERVFQDRQY
540 550 560 570 580 590
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 LIQAAIVRIMKMRKVLRHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILIEKEYLERVDGEK
:.:::::::::::.: :. :..:. .::. :: .:: :. ::...:.:: .
CCDS95 QIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKP--GDLKKRIESLIDRDYMERDKDNP
600 610 620 630 640 650
770
pF1KB8 DTYSYLA
. : :.:
CCDS95 NQYHYVA
>>CCDS73604.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (667 aa)
initn: 1000 init1: 367 opt: 830 Z-score: 945.3 bits: 185.5 E(32554): 2.5e-46
Smith-Waterman score: 1114; 33.9% identity (62.1% similar) in 705 aa overlap (88-776:2-667)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 QSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYL-TNLLKDGEDLMDESV-
:::.:.. .... ...: :: .: .
CCDS73 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLF
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRRECDEGRKGIYEIYSLALVTWRDC---LF
:: . :.:. . .. .: .:.: .: .. . : .. .:: ::
CCDS73 LKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNST-----LPSICPVSYCLYRDMGLELF
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220
pF1KB8 RP-------LNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGPTL
: ..... ...: :::.::.::... :. .. ::. : :
CCDS73 RTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSL------LGMLSD--------L
90 100 110 120 130
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 TVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHESTQD
:::.::: .:: .:. .:. :. ...:. : ::.... :: :: :: .:: .:::
CCDS73 QVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQK
140 150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 ELARKCEQVLIEKHLE-IFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLETHI
: :. :. .:: :.. ...::: .. ::..::.: ::.. : : . .:
CCDS73 PLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYI
200 210 220 230 240 250
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 HNQGLAAIEKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFIN
.. : : . . .: : :: .:: . : . .. :... :: . .. :::
CCDS73 KTFGTAIVIN----PEKDKDM-VQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFIN
260 270 280 290 300
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 NNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQK
. .: ::.:.. :: :. ..:. . ::: ::...:..:..:. ::::.
CCDS73 --------KRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEA
310 320 330 340 350
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 FYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNEQFKKH
:: : :::::. .::: ::: ::.::::. :: .::::. ::.:. .:::. .::.:
CCDS73 FYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQH
360 370 380 390 400 410
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 LTN-SEPLDLDFSIQVLSSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLY
. : :. .:.....:. : :: : :. . . : ::: ..:::::: :
CCDS73 MQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQT
420 430 440 450 460 470
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 QLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQIL
:... : .. ... .:.: :: .::..: :... ... .: :. . : ..:: :
CCDS73 TLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSL
480 490 500 510 520 530
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 LKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLG-YKNKKLRVNIN-VPMKTEQKQEQETTHK
.: :: .. . ::: : .: . : .:.: .:..:: . :: : .:: .: .
CCDS73 ACGKARVLI-KSPKGKEVE-DGDKFI--FNGEFKHKLFRIKINQIQMK-ETVEEQVSTTE
540 550 560 570 580 590
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 NIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLRHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILIEKEY
. .::. :.:::::::::::.: :. :..:. .::. :: .:: :. ::...:
CCDS73 RVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKP--GDLKKRIESLIDRDY
600 610 620 630 640 650
770
pF1KB8 LERVDGEKDTYSYLA
.:: . . : :.:
CCDS73 MERDKDNPNQYHYVA
660
>>CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (759 aa)
initn: 1000 init1: 367 opt: 830 Z-score: 944.4 bits: 185.5 E(32554): 2.8e-46
Smith-Waterman score: 1123; 33.9% identity (63.1% similar) in 697 aa overlap (88-776:102-759)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 QSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYL-TNLLKDGEDLMDESV-
:::.:.. .... ...: :: .: .
CCDS41 AVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLF
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRRECDEGRKGIYEIYSLALVTWRDCLF--R
:: . :.:. . .. .: .:.: .: .. . :....: .: .. .
CCDS41 LKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNST-----LPSIWDMGLELFRTHIISDK
140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 PLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGPTLTVYKESFE
..... ...: :::.::.::... :. .. ::. : : :::.:::
CCDS41 MVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSL------LGMLSD--------LQVYKDSFE
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHESTQDELARKCEQ
.:: .:. .:. :. ...:. : ::.... :: :: :: .:: .::: : :.
CCDS41 LKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VLIEKHLE-IFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLETHIHNQGLAAI
:. .:: :.. ...::: .. ::..::.: ::.. : : . .:.. : : .
CCDS41 QLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 EKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFINNNAVTKMA
. .: : :: .:: . : . .. :... :: . .. :::
CCDS41 IN----PEKDKDM-VQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFIN--------
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 QSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQKFYAKMLAK
. .: ::.:.. :: :. ..:. . ::: ::...:..:..:. ::::. :: : :::
CCDS41 KRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAK
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 RLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNEQFKKHLTN-SEPL
::. .::: ::: ::.::::. :: .::::. ::.:. .:::. .::.:. : :.
CCDS41 RLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSG
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 DLDFSIQVLSSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLYQLSKGELV
.:.....:. : :: : :. . . : ::: ..:::::: : :... :
CCDS41 PIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 TNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQILLKSKLLVL
.. ... .:.: :: .::..: :... ... .: :. . : ..:: : .: ::
CCDS41 AEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVL
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700
pF1KB8 EDENANVDEVELKPDTLIKLYLG-YKNKKLRVNIN-VPMKTEQKQEQETTHKNIEEDRKL
.. . ::: : .: . : .:.: .:..:: . :: : .:: .: . . .::.
CCDS41 I-KSPKGKEVE-DGDKFI--FNGEFKHKLFRIKINQIQMK-ETVEEQVSTTERVFQDRQY
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 LIQAAIVRIMKMRKVLRHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILIEKEYLERVDGEK
:.:::::::::::.: :. :..:. .::. :: .:: :. ::...:.:: .
CCDS41 QIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKP--GDLKKRIESLIDRDYMERDKDNP
700 710 720 730 740 750
770
pF1KB8 DTYSYLA
. : :.:
CCDS41 NQYHYVA
776 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 22:14:19 2016 done: Sat Nov 5 22:14:20 2016
Total Scan time: 3.870 Total Display time: 0.260
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]