Result of FASTA (omim) for
pFN21AA0034
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0034, 1675 aa
1>>>pF1KA0034 1675 - 1675 aa - 1675 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6692+/-0.000538; mu= 23.1852+/- 0.034
mean_var=86.3192+/-17.944, 0's: 0 Z-trim(108.3): 41 B-trim: 484 in 1/49
Lambda= 0.138045
statistics sampled from 16323 (16347) to 16323 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 17.920
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004850 (OMIM: 118955) clathrin heavy chain 1 is (1675) 11076 2217.5 0
NP_001275582 (OMIM: 118955) clathrin heavy chain 1 (1679) 11054 2213.1 0
XP_005257069 (OMIM: 118955) PREDICTED: clathrin he (1682) 11052 2212.7 0
NP_009029 (OMIM: 601273) clathrin heavy chain 2 is (1640) 9404 1884.5 0
XP_016884442 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1632) 9336 1871.0 0
NP_001826 (OMIM: 601273) clathrin heavy chain 2 is (1583) 8587 1721.8 0
XP_016884445 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1546) 8364 1677.4 0
XP_016884443 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1602) 7850 1575.0 0
XP_016884446 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1165) 6640 1333.9 0
XP_016884444 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1568) 6636 1333.2 0
XP_011528703 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1037) 5986 1203.6 0
>>NP_004850 (OMIM: 118955) clathrin heavy chain 1 isofor (1675 aa)
initn: 11076 init1: 11076 opt: 11076 Z-score: 11914.1 bits: 2217.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11076; 100.0% identity (100.0% similar) in 1675 aa overlap (1-1675:1-1675)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
1630 1640 1650 1660 1670
>>NP_001275582 (OMIM: 118955) clathrin heavy chain 1 iso (1679 aa)
initn: 10537 init1: 10537 opt: 11054 Z-score: 11890.4 bits: 2213.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11054; 99.7% identity (99.8% similar) in 1679 aa overlap (1-1675:1-1679)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALK----AGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISL
::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKGIKESGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NTVALVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NTVALVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 VVGAMQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVGAMQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 PTGNQPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTGNQPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 RISGETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RISGETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 LAGAEELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAGAEELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQ
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 YFGILLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YFGILLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLAL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 SVYLRANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVYLRANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQML
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 VQDEEPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQDEEPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVA
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 DAILGNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAILGNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFG
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 SLSVEDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLSVEDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLG
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 SIVNFSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIVNFSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLII
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 VCDRFDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VCDRFDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVV
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 RGQFSTDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGQFSTDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRE
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 NPYYDSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPYYDSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELW
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 GSVLLESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSVLLESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNS
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 VFSEHRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFSEHRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VNTSAVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNTSAVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 YMEVVQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YMEVVQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 HIQQVGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HIQQVGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 CFACVDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CFACVDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGM
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 FTELAILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTELAILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAII
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA0 TMMNHPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TMMNHPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAV
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 NYFSKVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYFSKVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 QRLEKHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRLEKHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQW
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 FLQEEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLQEEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDAS
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 ESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
1630 1640 1650 1660 1670
>>XP_005257069 (OMIM: 118955) PREDICTED: clathrin heavy (1682 aa)
initn: 10635 init1: 10635 opt: 11052 Z-score: 11888.2 bits: 2212.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11052; 99.6% identity (99.6% similar) in 1682 aa overlap (1-1675:1-1682)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVD-------KL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
XP_005 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDAIKEKVDKL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 DASESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DASESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGY
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 SM
::
XP_005 SM
>>NP_009029 (OMIM: 601273) clathrin heavy chain 2 isofor (1640 aa)
initn: 9446 init1: 9404 opt: 9404 Z-score: 10114.6 bits: 1884.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9404; 85.0% identity (96.4% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1634)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
NP_009 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
NP_009 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
:::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.:::: ::::::.::::::::::::
NP_009 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
:::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
NP_009 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGKLHIIEVGQPAAGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
NP_009 QPFVKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQIGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
.::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
NP_009 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
:.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
NP_009 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
NP_009 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
:::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
NP_009 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
NP_009 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
NP_009 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
:::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
NP_009 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
NP_009 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
NP_009 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
:::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
NP_009 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
:: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
NP_009 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
:.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
NP_009 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
NP_009 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
::.:. :.:::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.:..:::.::::::::::::
NP_009 VQSASRSNNWEDLVKFLQMARKKGRESYIETELIFALAKTSRVSELEDFINGPNNAHIQQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
::::::.: ::.::::::.:::::.:::::::::::::::::..:::.::::::::::::
NP_009 VGDRCYEEGMYEAAKLLYSNVSNFARLASTLVHLGEYQAAVDNSRKASSTRTWKEVCFAC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
.::.:::.::.::::::.::::::::. :::::::::::: .::::::::::::::::::
NP_009 MDGQEFRFAQLCGLHIVIHADELEELMCYYQDRGYFEELILLLEAALGLERAHMGMFTEL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.
NP_009 AILYSKFKPQKMLEHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAVLTMMS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
:::.::::::::::::::::::: :::.::::..::::.::::.::::::::: .:..::
NP_009 HPTEAWKEGQFKDIITKVANVELCYRALQFYLDYKPLLINDLLLVLSPRLDHTWTVSFFS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
:. :::::::::::::.::::::::.::.:. :::::.::.:::::::::::::::.::
NP_009 KAGQLPLVKPYLRSVQSHNNKSVNEALNHLLTEEEDYQGLRASIDAYDNFDNISLAQQLE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
::.:.::: :::::.:::: : ::::::::: :::::::.:.::.:.:::..::::::.:
NP_009 KHQLMEFRCIAAYLYKGNNWWAQSVELCKKDHLYKDAMQHAAESRDAELAQKLLQWFLEE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
:::::.:::::::::::::.::: :::::..:.:::::::::.:::.::::::: ::::
NP_009 GKRECFAACLFTCYDLLRPDMVLELAWRHNLVDLAMPYFIQVMREYLSKVDKLDALESLR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
:.::..:: :.:.
NP_009 KQEEHVTEPAPLVFDFDGHE
1630 1640
>>XP_016884442 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin heavy (1632 aa)
initn: 9397 init1: 9261 opt: 9336 Z-score: 10041.4 bits: 1871.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9336; 84.6% identity (95.9% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1626)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
XP_016 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
XP_016 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
:::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.:::: ::::::.::::::::::::
XP_016 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
:::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
XP_016 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGKLHIIEVGQPAAGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
XP_016 QPFVKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQIGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
.::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
XP_016 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
:.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
XP_016 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
XP_016 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
:::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
XP_016 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
XP_016 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
:::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
XP_016 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
XP_016 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
:::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
XP_016 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
:: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
XP_016 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
:.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
XP_016 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
XP_016 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
::.:. :.:::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.:..:::.::::::::::::
XP_016 VQSASRSNNWEDLVKFLQMARKKGRESYIETELIFALAKTSRVSELEDFINGPNNAHIQQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
::::::.: ::.::::::.:::::.:::::::::::::::::..:::.::::::::::::
XP_016 VGDRCYEEGMYEAAKLLYSNVSNFARLASTLVHLGEYQAAVDNSRKASSTRTWKEVCFAC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
.::.:::.::.::::::.::::::::. :::::::::::: .::::::::::::::::::
XP_016 MDGQEFRFAQLCGLHIVIHADELEELMCYYQDRGYFEELILLLEAALGLERAHMGMFTEL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.
XP_016 AILYSKFKPQKMLEHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAVLTMMS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
:::.::::::::::::::::::: :::.::::..::::.::::.::::::::: .:..::
XP_016 HPTEAWKEGQFKDIITKVANVELCYRALQFYLDYKPLLINDLLLVLSPRLDHTWTVSFFS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
:. :::::::::::::.::::::::.::.:. :::::.::.:::::::::::::::.::
XP_016 KAGQLPLVKPYLRSVQSHNNKSVNEALNHLLTEEEDYQGLRASIDAYDNFDNISLAQQLE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
::.:.::: :::::.:::: : ::::::::: :::::::.:.::.:.:::..::::::.:
XP_016 KHQLMEFRCIAAYLYKGNNWWAQSVELCKKDHLYKDAMQHAAESRDAELAQKLLQWFLEE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
:::::.:::::::::::::.::: :::::..:.:::::::: ::::: ::::
XP_016 GKRECFAACLFTCYDLLRPDMVLELAWRHNLVDLAMPYFIQV--------DKLDALESLR
1570 1580 1590 1600 1610
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
:.::..:: :.:.
XP_016 KQEEHVTEPAPLVFDFDGHE
1620 1630
>>NP_001826 (OMIM: 601273) clathrin heavy chain 2 isofor (1583 aa)
initn: 9078 init1: 8554 opt: 8587 Z-score: 9235.4 bits: 1721.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8968; 82.1% identity (93.1% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1577)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
NP_001 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
NP_001 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
:::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.:::: ::::::.::::::::::::
NP_001 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
:::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
NP_001 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGKLHIIEVGQPAAGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
NP_001 QPFVKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQIGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
.::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
NP_001 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
:.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
NP_001 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
NP_001 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
:::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
NP_001 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
NP_001 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
NP_001 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
:::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
NP_001 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
NP_001 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
:::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
NP_001 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
:: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
NP_001 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
:.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
NP_001 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
NP_001 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
::.:. :.:::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.:..:::.::::::::::::
NP_001 VQSASRSNNWEDLVKFLQMARKKGRESYIETELIFALAKTSRVSELEDFINGPNNAHIQQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
::::::.: ::.::::::.:::::.:::::::::::::::::..:::.::::::::::::
NP_001 VGDRCYEEGMYEAAKLLYSNVSNFARLASTLVHLGEYQAAVDNSRKASSTRTWKEVCFAC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
.::.:::.::.::::::.::::::::. :::::::::::: .::::::::::::::::::
NP_001 MDGQEFRFAQLCGLHIVIHADELEELMCYYQDRGYFEELILLLEAALGLERAHMGMFTEL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.
NP_001 AILYSKFKPQKMLEHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAVLTMMS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
:::.::::::::::::::::::: :::.::::..::::.::::.::::::::: .:..::
NP_001 HPTEAWKEGQFKDIITKVANVELCYRALQFYLDYKPLLINDLLLVLSPRLDHTWTVSFFS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
:. :::::::::::::.::::::::.::.:. :::::
NP_001 KAGQLPLVKPYLRSVQSHNNKSVNEALNHLLTEEEDYQ----------------------
1450 1460 1470
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
::::.:.::.:.:::..::::::.:
NP_001 -----------------------------------DAMQHAAESRDAELAQKLLQWFLEE
1480 1490 1500
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
:::::.:::::::::::::.::: :::::..:.:::::::::.:::.::::::: ::::
NP_001 GKRECFAACLFTCYDLLRPDMVLELAWRHNLVDLAMPYFIQVMREYLSKVDKLDALESLR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
:.::..:: :.:.
NP_001 KQEEHVTEPAPLVFDFDGHE
1570 1580
>>XP_016884445 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin heavy (1546 aa)
initn: 8894 init1: 8364 opt: 8364 Z-score: 8995.6 bits: 1677.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8704; 80.4% identity (91.1% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1540)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
XP_016 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
XP_016 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
:::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.:::: ::::::.::::::::::::
XP_016 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
:::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
XP_016 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGKLHIIEVGQPAAGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
XP_016 QPFVKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQIGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
.::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
XP_016 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
:.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
XP_016 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
XP_016 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
:::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
XP_016 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
XP_016 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
:::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
XP_016 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
XP_016 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
:::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
XP_016 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
:: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
XP_016 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
:.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
XP_016 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
XP_016 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
::.:. :.:::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.:..:::.::::::::::::
XP_016 VQSASRSNNWEDLVKFLQMARKKGRESYIETELIFALAKTSRVSELEDFINGPNNAHIQQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
::::::.: ::.::::::.:::::.:::::::::::::::::..:::.::::::::::::
XP_016 VGDRCYEEGMYEAAKLLYSNVSNFARLASTLVHLGEYQAAVDNSRKASSTRTWKEVCFAC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
.::.:::.::.::::::.::::::::. :::::::::::: .::::::::::::::::::
XP_016 MDGQEFRFAQLCGLHIVIHADELEELMCYYQDRGYFEELILLLEAALGLERAHMGMFTEL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.
XP_016 AILYSKFKPQKMLEHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAVLTMMS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
:::.::::::::::::::::::: :::.::::..::::.::::.::::::::: .:..::
XP_016 HPTEAWKEGQFKDIITKVANVELCYRALQFYLDYKPLLINDLLLVLSPRLDHTWTVSFFS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
:
XP_016 K-----------------------------------------------------------
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
::::.:.::.:.:::..::::::.:
XP_016 -----------------------------------DAMQHAAESRDAELAQKLLQWFLEE
1450 1460
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
:::::.:::::::::::::.::: :::::..:.:::::::::.:::.::::::: ::::
XP_016 GKRECFAACLFTCYDLLRPDMVLELAWRHNLVDLAMPYFIQVMREYLSKVDKLDALESLR
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
:.::..:: :.:.
XP_016 KQEEHVTEPAPLVFDFDGHE
1530 1540
>>XP_016884443 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin heavy (1602 aa)
initn: 9187 init1: 7837 opt: 7850 Z-score: 8442.1 bits: 1575.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9083; 82.9% identity (94.2% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1596)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
XP_016 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
XP_016 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
:::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.:::: ::::::.::::::::::::
XP_016 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
:::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::
XP_016 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGK-------------
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
:. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
XP_016 -------------------------IGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
.::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
XP_016 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
:.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
XP_016 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
XP_016 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
:::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
XP_016 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
XP_016 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
:::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
XP_016 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
XP_016 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
:::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
XP_016 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
:: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
XP_016 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
870 880 890 900 910 920
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
:.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
930 940 950 960 970 980
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
XP_016 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
990 1000 1010 1020 1030 1040
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
XP_016 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
::.:. :.:::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.:..:::.::::::::::::
XP_016 VQSASRSNNWEDLVKFLQMARKKGRESYIETELIFALAKTSRVSELEDFINGPNNAHIQQ
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
::::::.: ::.::::::.:::::.:::::::::::::::::..:::.::::::::::::
XP_016 VGDRCYEEGMYEAAKLLYSNVSNFARLASTLVHLGEYQAAVDNSRKASSTRTWKEVCFAC
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
.::.:::.::.::::::.::::::::. :::::::::::: .::::::::::::::::::
XP_016 MDGQEFRFAQLCGLHIVIHADELEELMCYYQDRGYFEELILLLEAALGLERAHMGMFTEL
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.
XP_016 AILYSKFKPQKMLEHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAVLTMMS
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
:::.::::::::::::::::::: :::.::::..::::.::::.::::::::: .:..::
XP_016 HPTEAWKEGQFKDIITKVANVELCYRALQFYLDYKPLLINDLLLVLSPRLDHTWTVSFFS
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
:. :::::::::::::.::::::::.::.:. :::::.::.:::::::::::::::.::
XP_016 KAGQLPLVKPYLRSVQSHNNKSVNEALNHLLTEEEDYQGLRASIDAYDNFDNISLAQQLE
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
::.:.::: :::::.:::: : ::::::::: :::::::.:.::.:.:::..::::::.:
XP_016 KHQLMEFRCIAAYLYKGNNWWAQSVELCKKDHLYKDAMQHAAESRDAELAQKLLQWFLEE
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
:::::.:::::::::::::.::: :::::..:.:::::::::.:::.::::::: ::::
XP_016 GKRECFAACLFTCYDLLRPDMVLELAWRHNLVDLAMPYFIQVMREYLSKVDKLDALESLR
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
:.::..:: :.:.
XP_016 KQEEHVTEPAPLVFDFDGHE
1590 1600
>>XP_016884446 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin heavy (1165 aa)
initn: 6670 init1: 6628 opt: 6640 Z-score: 7141.7 bits: 1333.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6640; 85.5% identity (96.3% similar) in 1155 aa overlap (1-1155:1-1154)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
XP_016 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
XP_016 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
:::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.:::: ::::::.::::::::::::
XP_016 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
:::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
XP_016 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGKLHIIEVGQPAAGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
XP_016 QPFVKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQIGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
.::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
XP_016 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
:.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
XP_016 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
XP_016 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
:::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
XP_016 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
XP_016 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
:::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
XP_016 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
XP_016 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
:::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
XP_016 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
:: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
XP_016 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
:.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
XP_016 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
XP_016 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
::.:. : .:. :..
XP_016 VQSASRS-SWRPLLRGGNVRGCQAAL
1150 1160
>>XP_016884444 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin heavy (1568 aa)
initn: 8787 init1: 6636 opt: 6636 Z-score: 7135.6 bits: 1333.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8651; 80.1% identity (91.0% similar) in 1635 aa overlap (1-1634:1-1562)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
XP_016 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
XP_016 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
:::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.:::: ::::::.::::::::::::
XP_016 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
:::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
XP_016 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGKLHIIEVGQPAAGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
XP_016 QPFVKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQIGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
.::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
XP_016 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
:.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
XP_016 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
XP_016 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
:::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
XP_016 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
XP_016 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
:::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
XP_016 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
XP_016 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
:::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
XP_016 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
:: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
XP_016 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
:.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
XP_016 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
XP_016 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
::.:. : : .:: : : :
XP_016 VQSAS-------------------RSSKLET------AVTRR------------------
1150
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTW-KEVCFA
.: ..: ... : : . : : ::::
XP_016 ---EC--------TRLPSCSIAMFLTLPAWL-------------------PPWFTSVCFA
1160 1170 1180
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 CVDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTE
:.::.:::.::.::::::.::::::::. :::::::::::: .:::::::::::::::::
XP_016 CMDGQEFRFAQLCGLHIVIHADELEELMCYYQDRGYFEELILLLEAALGLERAHMGMFTE
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 LAILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMM
::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::
XP_016 LAILYSKFKPQKMLEHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAVLTMM
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA0 NHPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYF
.:::.::::::::::::::::::: :::.::::..::::.::::.::::::::: .:..:
XP_016 SHPTEAWKEGQFKDIITKVANVELCYRALQFYLDYKPLLINDLLLVLSPRLDHTWTVSFF
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 SKVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRL
::. :::::::::::::.::::::::.::.:. :::::.::.:::::::::::::::.:
XP_016 SKAGQLPLVKPYLRSVQSHNNKSVNEALNHLLTEEEDYQGLRASIDAYDNFDNISLAQQL
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 EKHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQ
:::.:.::: :::::.:::: : ::::::::: :::::::.:.::.:.:::..::::::.
XP_016 EKHQLMEFRCIAAYLYKGNNWWAQSVELCKKDHLYKDAMQHAAESRDAELAQKLLQWFLE
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 EEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESL
: :::::.:::::::::::::.::: :::::..:.:::::::::.:::.::::::: :::
XP_016 EGKRECFAACLFTCYDLLRPDMVLELAWRHNLVDLAMPYFIQVMREYLSKVDKLDALESL
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 RKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
::.::..:: :.:.
XP_016 RKQEEHVTEPAPLVFDFDGHE
1550 1560
1675 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:44:49 2016 done: Sat Nov 5 20:44:52 2016
Total Scan time: 17.920 Total Display time: 1.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]