Result of FASTA (ccds) for pFN21AB7323
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7323, 1954 aa
  1>>>pF1KB7323 1954 - 1954 aa - 1954 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3731+/-0.00101; mu= 13.2533+/- 0.062
 mean_var=224.6221+/-44.717, 0's: 0 Z-trim(112.4): 138  B-trim: 2 in 1/51
 Lambda= 0.085575
 statistics sampled from 13016 (13156) to 13016 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.404), width:  16
 Scan time:  5.800

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1             (1954) 13323 1659.4       0
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12           (1912) 5597 705.5  5e-202
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12          (1905) 5586 704.2 1.3e-201
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (1966) 5266 664.7  1e-189
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2000) 5266 664.7  1e-189
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2059) 5266 664.7 1.1e-189
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8          (2997) 1582 210.0 1.1e-52
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2881) 1576 209.3 1.9e-52
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2897) 1576 209.3 1.9e-52
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20         (2715) 1564 207.8   5e-52
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2302) 1532 203.7 6.8e-51
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2581) 1532 203.8 7.4e-51
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5           (1710) 1312 176.5 8.3e-43
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15          (1828) 1311 176.4 9.4e-43
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1058) 1183 160.3 3.6e-38
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4         (1052) 1160 157.5 2.6e-37
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1647) 1045 143.5 6.7e-33
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1572) 1040 142.8   1e-32
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1590) 1040 142.8   1e-32
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1613) 1028 141.4 2.8e-32
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1614) 1028 141.4 2.8e-32
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1616) 1010 139.2 1.3e-31
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1617) 1010 139.2 1.3e-31
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 797)  959 132.6 6.3e-30
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1            ( 897)  959 132.6 6.8e-30
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1514)  803 113.6 6.3e-24
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10          (1493)  766 109.0 1.5e-22
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1054)  690 99.5 7.6e-20
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1070)  690 99.5 7.7e-20
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 616)  684 98.5 8.7e-20
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 693)  684 98.6 9.5e-20
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 700)  630 91.9 9.7e-18
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 714)  630 91.9 9.8e-18
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 740)  630 91.9   1e-17
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10          ( 838)  630 92.0 1.1e-17
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 884)  630 92.0 1.1e-17
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16        (3230)  562 84.1 9.7e-15
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15        (1556)  545 81.7 2.5e-14


>>CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1                  (1954 aa)
 initn: 13323 init1: 13323 opt: 13323  Z-score: 8895.4  bits: 1659.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 13323; 100.0% identity (100.0% similar) in 1954 aa overlap (1-1954:1-1954)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MRGPVGTEEELPRLFAEEMENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKKKPKKLKENK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MRGPVGTEEELPRLFAEEMENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKKKPKKLKENK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 CKGKRKKKEGSNDELSENEEDLEEKSESEGSDYSPNKKKKKKLKDKKEKKAKRKKKDEDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CKGKRKKKEGSNDELSENEEDLEEKSESEGSDYSPNKKKKKKLKDKKEKKAKRKKKDEDE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DDNDDGCLKEPKSSGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFSQFLRPLIAKKNPKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DDNDDGCLKEPKSSGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFSQFLRPLIAKKNPKIP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 MSKMMTVLGAKWREFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVETVTISPPLAVSPPQVPQPVPIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MSKMMTVLGAKWREFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVETVTISPPLAVSPPQVPQPVPIR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 KAKTKEGKGPGVRKKIKGSKDGKKKGKGKKTAGLKFRFGGISNKRKKGSSSEEDEREESD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KAKTKEGKGPGVRKKIKGSKDGKKKGKGKKTAGLKFRFGGISNKRKKGSSSEEDEREESD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 FDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRRRKKKRIDDGDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRRRKKKRIDDGDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 CPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEPKDDDDEEEEGGCEEEEDDHMEFCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEPKDDDDEEEEGGCEEEEDDHMEFCR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 VCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 PAPFMVGLPGPDVEPSLPPPKPLEGIPEREFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PAPFMVGLPGPDVEPSLPPPKPLEGIPEREFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 NYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 NYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 SFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDDIDIPYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 SFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDDIDIPYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 KKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPWYIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPWYIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 TILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGPYLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGPYLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTY
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 TGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRMKKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRMKKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 WACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 WACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 LEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYY
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 KFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB7 KSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB7 EAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQN
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB7 KKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEEL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB7 FKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB7 AISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPDYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPDYW
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB7 EKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDED
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB7 EDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWG
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB7 MPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHV
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB7 LTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYSTPDLIPEGPEGKKSGEVISSDPNTPVPASPAHLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYSTPDLIPEGPEGKKSGEVISSDPNTPVPASPAHLLP
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB7 APLGLPDKMEAQLGYMDEKDPGAQKPRQPLEVQALPAALDRVESEDKHESPASKERAREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 APLGLPDKMEAQLGYMDEKDPGAQKPRQPLEVQALPAALDRVESEDKHESPASKERAREE
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB7 RPEETEKAPPSPEQLPREEVLPEKEKILDKLELSLIHSRGDSSELRPDDTKAEEKEPIET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RPEETEKAPPSPEQLPREEVLPEKEKILDKLELSLIHSRGDSSELRPDDTKAEEKEPIET
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KB7 QQNGDKEEDDEGKKEDKKGKFKFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWHRRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QQNGDKEEDDEGKKEDKKGKFKFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWHRRH
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KB7 DYWLLAGIVTHGYARWQDIQNDPRYMILNEPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLEQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DYWLLAGIVTHGYARWQDIQNDPRYMILNEPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLEQAL
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KB7 VIEEQLRRAAYLNMTQDPNHPAMALNARLAEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VIEEQLRRAAYLNMTQDPNHPAMALNARLAEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKV
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KB7 LNQLEELLSDMKADVTRLPSMLSRIPPVAARLQMSERSILSRLTNRAGDPTIQQGAFGSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LNQLEELLSDMKADVTRLPSMLSRIPPVAARLQMSERSILSRLTNRAGDPTIQQGAFGSS
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950    
pF1KB7 QMYSNNFGPNFRGPGPGGIVNYNQMPLGPYVTDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QMYSNNFGPNFRGPGPGGIVNYNQMPLGPYVTDI
             1930      1940      1950    

>>CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12                (1912 aa)
 initn: 7938 init1: 3248 opt: 5597  Z-score: 3740.5  bits: 705.5 E(32554): 5e-202
Smith-Waterman score: 9090; 70.7% identity (84.9% similar) in 1958 aa overlap (6-1916:14-1909)

                       10         20        30        40        50 
pF1KB7         MRGPVGTEEE-LPRLFAEEMENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKK
                    :.::: .  :. . .      .::.       .:.  .:  .: :::
CCDS85 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEED-----PEEDLSETETPKLKKKK
               10        20        30             40        50     

              60                     70        80        90        
pF1KB7 KPKKLKENKC-KGKRKKKE------------GSNDELSENEEDLEEKSESEGSDYSPNKK
       :::: .. :  :.::.:::            : . :. :.::..  .:.::::::.:.::
CCDS85 KPKKPRDPKIPKSKRQKKERMLLCRQLGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDYTPGKK
          60        70        80        90       100       110     

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB7 KKKKLKDKKEKKAKRKKKDEDEDDNDDGCLKEPKSSGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTL
       :::::  :::::.: :.:.:.:...::   ::::::.::. .::..:.:..::::::.::
CCDS85 KKKKLGPKKEKKSKSKRKEEEEEEDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTL
         120       130       140       150       160       170     

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB7 TNYKAFSQFLRPLIAKKNPKIPMSKMMTVLGAKWREFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVE
       :::::::::.::::: ::::: .:::: ::::::::::.::::::::.:..:::.:::: 
CCDS85 TNYKAFSQFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVA
         180       190       200       210       220       230     

      220        230       240       250       260         270     
pF1KB7 TV-TISPPLAVSPPQVPQPVPIRKAKTKEGKGPGVRKKIKGSK--DGKKKGKGKKTAGLK
       .: ..     :.::  :  ::::::::::::::..:.: :::      :: : ::.: ::
CCDS85 VVESMVTATEVAPPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLK
         240       250       260       270       280       290     

         280       290       300       310       320           330 
pF1KB7 FRFGGISNKRKKGSSSEEDEREESDFDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRR----RKKKR
       ...::...:::..:: ..:   :::::.:::.: :: :. :.. ...:...    .:::.
CCDS85 IKLGGFGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSV-SDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKK
         300       310       320       330        340       350    

                 340       350       360       370       380       
pF1KB7 IDDG----DGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHC
        ..     :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::..:::::::::::::
CCDS85 GEEEVTAVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHC
          360       370       380       390       400       410    

       390       400            410        420       430       440 
pF1KB7 EKEGIQWEPKDDDDEEEE-----GGCEEEEDDH-MEFCRVCKDGGELLCCDACPSSYHLH
       :::::::: :.:..: ::     ::  :::::: :::::::::::::::::.::::::.:
CCDS85 EKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIH
          420       430       440       450       460       470    

             450       460       470       480       490       500 
pF1KB7 CLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEPPAPFMVGLPGPDVEPSLPPPK
       :::::::::::::::::::::: ::::::.:: :.: .::.:  :  : ::..:. : ::
CCDS85 CLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRP-PDADPNTPSPK
          480       490       500       510       520        530   

             510       520       530       540       550       560 
pF1KB7 PLEGIPEREFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDE
       :::: :::.::::: :.::::::::.::::::.  ::.:::::::::::::  :.: :::
CCDS85 PLEGRPERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFG-GDE
           540       550       560       570       580        590  

             570       580       590       600       610       620 
pF1KB7 DGKSEKRKNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQ
       . ::.::::::: .:.:::::::::::::::::::::::: :::: :::::::.::::::
CCDS85 E-KSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQ
             600       610       620       630       640       650 

             630       640       650       660       670       680 
pF1KB7 CTWEIDDIDIPYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVD
        .:: .:..:  :: .::.::.::::: ::. : : . :::  :::  : :.::.:: ::
CCDS85 ASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGR-PGKKLKK-VKLR--KLERPPETPTVD
             660       670       680        690          700       

             690       700       710       720       730       740 
pF1KB7 PTVKFDKQPWYIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYS
       ::::...:: :.:.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS85 PTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYS
       710       720       730       740       750       760       

             750       760       770       780       790       800 
pF1KB7 LYKEGHSKGPYLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNA
       ::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::.:::.::..::::::::::::
CCDS85 LYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNA
       770       780       790       800       810       820       

             810       820       830       840       850       860 
pF1KB7 IRSGKKVFRMKKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFR
       ::.:::. :::::...:::::::::::::::.::::::.::::.::::::::::::::::
CCDS85 IRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFR
       830       840       850       860       870       880       

             870       880       890       900       910       920 
pF1KB7 VLNSYKIDYKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLH
       :::.:....::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::
CCDS85 VLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLH
       890       900       910       920       930       940       

             930       940       950       960       970       980 
pF1KB7 DLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGGNQVS
       :.::::::::::::::::::.::::::::::: :::::::.::::::::::..:::::::
CCDS85 DMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVS
       950       960       970       980       990      1000       

             990      1000      1010      1020      1030      1040 
pF1KB7 LLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGH
       :::..:::::::::::::::::.::: .::: ::::.:...::::.:::::::.:.. ::
CCDS85 LLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGH
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

            1050      1060      1070      1080      1090      1100 
pF1KB7 RVLIFSQMTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTR
       ::::::::::::::::::::.::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::
CCDS85 RVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTR
      1070      1080      1090      1100      1110      1120       

            1110      1120      1130      1140      1150      1160 
pF1KB7 AGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 AGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQV
      1130      1140      1150      1160      1170      1180       

            1170      1180      1190      1200      1210      1220 
pF1KB7 AKRKMMLTHLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPD
       ::.::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::.                 
CCDS85 AKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDE-----------------
      1190      1200      1210      1220      1230                 

            1230      1240      1250      1260      1270      1280 
pF1KB7 VQSSKGGNLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNM
         .. ::               ::::. :::::::::: :: .::::::: :.:::::.:
CCDS85 --ATDGG---------------GDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGM
                              1240      1250      1260      1270   

            1290       1300       1310      1320      1330         
pF1KB7 NEYLSSFKVAQYVVREED-GVEE-VEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNL
       :::::::::::::::::. : :: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS85 NEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNL
          1280      1290      1300      1310      1320      1330   

    1340      1350      1360      1370      1380      1390         
pF1KB7 GKGKRIRKQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQ
       ::::::::::::::.::::..:::. :::::.::..::. ::::.:: :.   :: ::. 
CCDS85 GKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAP--RRPSRKG
          1340      1350      1360      1370      1380        1390 

    1400      1410      1420      1430      1440      1450         
pF1KB7 LKSDRDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGK
       :..:.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::...:::::::::
CCDS85 LRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGK
            1400      1410      1420      1430      1440      1450 

    1460      1470      1480      1490      1500      1510         
pF1KB7 SEKEFRAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEH
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS85 SEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEH
            1460      1470      1480      1490      1500      1510 

    1520      1530      1540      1550      1560                   
pF1KB7 VNGKYSTPDLIPEGPEGKKSGEVISSDPNTPVPASPAHLLP-APLGLP----------DK
       :::..: :.:  :  :.:: ..  : .:.::.:..:.   : .:  .:          ..
CCDS85 VNGRWSMPELA-EVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEENS
            1520       1530      1540      1550      1560      1570

     1570      1580      1590      1600         1610      1620     
pF1KB7 MEAQLGYMDEKDPGAQKPRQPLEVQALPAALDRVESEDKH---ESPASKERAREERPEET
       .. . .   ::.  .  :.  .:    ::      :::..   : : ..:..  :. :  
CCDS85 LKEEESIEGEKEVKSTAPETAIECTQAPAP----ASEDEKVVVEPPEGEEKV--EKAEVK
             1580      1590      1600          1610        1620    

        1630      1640      1650      1660      1670      1680     
pF1KB7 EKAPPSPEQLPREEVLPEKEKILDKLELSLIHSRGDSSELRPDDTKAEEKEPIETQQNGD
       :..    :  :.  .  . ::. .:  ..:     ...: . ..   :::. .  : ::.
CCDS85 ERTEEPMETEPKGAA--DVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEE---EEKKEVMLQ-NGE
         1630        1640      1650      1660         1670         

        1690      1700      1710      1720      1730      1740     
pF1KB7 KEEDDEGKKEDKKGKFKFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWHRRHDYWLL
         .: . .:. :. : .::::::::::::::.:::::::::. . : :.:::::::::::
CCDS85 TPKDLNDEKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLL
     1680      1690      1700      1710      1720      1730        

        1750      1760      1770      1780      1790      1800     
pF1KB7 AGIVTHGYARWQDIQNDPRYMILNEPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQ
       :::..::::::::::::::: :::::::.:...::.::.:::::::::::::::::::::
CCDS85 AGIINHGYARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQ
     1740      1750      1760      1770      1780      1790        

        1810      1820      1830      1840      1850      1860     
pF1KB7 LRRAAYLNMTQDPNHPAMALNARLAEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLE
       :::::::::..::.::.::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::::.:::
CCDS85 LRRAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLE
     1800      1810      1820      1830      1840      1850        

        1870      1880      1890      1900      1910      1920     
pF1KB7 ELLSDMKADVTRLPSMLSRIPPVAARLQMSERSILSRLTNRAGDPTIQQGAFGSSQMYSN
       ::::::::::::::. ..::::::.:::::::.:::::.::: .:: :: :         
CCDS85 ELLSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ      
     1860      1870      1880      1890      1900      1910        

        1930      1940      1950    
pF1KB7 NFGPNFRGPGPGGIVNYNQMPLGPYVTDI

>>CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12               (1905 aa)
 initn: 7944 init1: 3248 opt: 5586  Z-score: 3733.2  bits: 704.2 E(32554): 1.3e-201
Smith-Waterman score: 9104; 70.9% identity (85.2% similar) in 1951 aa overlap (6-1916:14-1902)

                       10         20        30        40        50 
pF1KB7         MRGPVGTEEE-LPRLFAEEMENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKK
                    :.::: .  :. . .      .::.       .:.  .:  .: :::
CCDS76 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEED-----PEEDLSETETPKLKKKK
               10        20        30             40        50     

              60              70        80        90       100     
pF1KB7 KPKKLKENKC-KGKRKKKE-----GSNDELSENEEDLEEKSESEGSDYSPNKKKKKKLKD
       :::: .. :  :.::.:::     : . :. :.::..  .:.::::::.:.:::::::  
CCDS76 KPKKPRDPKIPKSKRQKKELGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDYTPGKKKKKKLGP
          60        70        80        90       100       110     

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB7 KKEKKAKRKKKDEDEDDNDDGCLKEPKSSGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFS
       :::::.: :.:.:.:...::   ::::::.::. .::..:.:..::::::.:::::::::
CCDS76 KKEKKSKSKRKEEEEEEDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKAFS
         120       130       140       150       160       170     

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB7 QFLRPLIAKKNPKIPMSKMMTVLGAKWREFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVETV-TISP
       ::.::::: ::::: .:::: ::::::::::.::::::::.:..:::.:::: .: ..  
CCDS76 QFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESMVT
         180       190       200       210       220       230     

          230       240       250       260         270       280  
pF1KB7 PLAVSPPQVPQPVPIRKAKTKEGKGPGVRKKIKGSK--DGKKKGKGKKTAGLKFRFGGIS
          :.::  :  ::::::::::::::..:.: :::      :: : ::.: ::...::..
CCDS76 ATEVAPPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGGFG
         240       250       260       270       280       290     

            290       300       310       320           330        
pF1KB7 NKRKKGSSSEEDEREESDFDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRR----RKKKRIDDG---
       .:::..:: ..:   :::::.:::.: :: :. :.. ...:...    .:::. ..    
CCDS76 SKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSV-SDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKKGEEEVTA
         300       310       320        330       340       350    

          340       350       360       370       380       390    
pF1KB7 -DGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQW
        :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::..::::::::::::::::::::
CCDS76 VDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQW
          360       370       380       390       400       410    

          400            410        420       430       440        
pF1KB7 EPKDDDDEEEE-----GGCEEEEDDH-MEFCRVCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLP
       : :.:..: ::     ::  :::::: :::::::::::::::::.::::::.::::::::
CCDS76 EAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLP
          420       430       440       450       460       470    

      450       460       470       480       490       500        
pF1KB7 EIPNGEWLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEPPAPFMVGLPGPDVEPSLPPPKPLEGIPE
       ::::::::::::::: ::::::.:: :.: .::.:  :  : ::..:. : :::::: ::
CCDS76 EIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRP-PDADPNTPSPKPLEGRPE
          480       490       500       510        520       530   

      510       520       530       540       550       560        
pF1KB7 REFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKR
       :.::::: :.::::::::.::::::.  ::.:::::::::::::  :.: :::. ::.::
CCDS76 RQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFG-GDEE-KSRKR
           540       550       560       570       580         590 

      570       580       590       600       610       620        
pF1KB7 KNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDD
       ::::: .:.:::::::::::::::::::::::: :::: :::::::.:::::: .:: .:
CCDS76 KNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQASWESED
             600       610       620       630       640       650 

      630       640       650       660       670       680        
pF1KB7 IDIPYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDK
       ..:  :: .::.::.::::: ::. : : . :::  :::  : :.::.:: ::::::...
CCDS76 VEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGR-PGKKLKK-VKLR--KLERPPETPTVDPTVKYER
             660       670        680          690       700       

      690       700       710       720       730       740        
pF1KB7 QPWYIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHS
       :: :.:.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS76 QPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHS
       710       720       730       740       750       760       

      750       760       770       780       790       800        
pF1KB7 KGPYLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKV
       :::.::::::::::::::::::::::.:::::.:::.::..::::::::::::::.:::.
CCDS76 KGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKA
       770       780       790       800       810       820       

      810       820       830       840       850       860        
pF1KB7 FRMKKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKI
        :::::...:::::::::::::::.::::::.::::.:::::::::::::::::::.:..
CCDS76 SRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSL
       830       840       850       860       870       880       

      870       880       890       900       910       920        
pF1KB7 DYKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHM
       ..::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.:::::
CCDS76 QHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHM
       890       900       910       920       930       940       

      930       940       950       960       970       980        
pF1KB7 LRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMD
       :::::::::::::.::::::::::: :::::::.::::::::::..::::::::::..::
CCDS76 LRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMD
       950       960       970       980       990      1000       

      990      1000      1010      1020      1030      1040        
pF1KB7 LKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQ
       :::::::::::::::.::: .::: ::::.:...::::.:::::::.:.. :::::::::
CCDS76 LKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQ
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

     1050      1060      1070      1080      1090      1100        
pF1KB7 MTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGIN
       :::::::::::::.::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGIN
      1070      1080      1090      1100      1110      1120       

     1110      1120      1130      1140      1150      1160        
pF1KB7 LATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMML
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS76 LATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMML
      1130      1140      1150      1160      1170      1180       

     1170      1180      1190      1200      1210      1220        
pF1KB7 THLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGG
       ::::::::::::.:::.::::::::::::::::::.                   .. ::
CCDS76 THLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDE-------------------ATDGG
      1190      1200      1210      1220                           

     1230      1240      1250      1260      1270      1280        
pF1KB7 NLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSF
                      ::::. :::::::::: :: .::::::: :.:::::.::::::::
CCDS76 ---------------GDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSF
                    1230      1240      1250      1260      1270   

     1290       1300       1310      1320      1330      1340      
pF1KB7 KVAQYVVREED-GVEE-VEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIR
       ::::::::::. : :: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIR
          1280      1290      1300      1310      1320      1330   

       1350      1360      1370      1380      1390      1400      
pF1KB7 KQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDK
       :::::::.::::..:::. :::::.::..::. ::::.:: :.   :: ::. :..:.::
CCDS76 KQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAP--RRPSRKGLRNDKDK
          1340      1350      1360      1370        1380      1390 

       1410      1420      1430      1440      1450      1460      
pF1KB7 PLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::...::::::::::::::.:
CCDS76 PLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA
            1400      1410      1420      1430      1440      1450 

       1470      1480      1490      1500      1510      1520      
pF1KB7 YVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYST
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::..: 
CCDS76 YVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSM
            1460      1470      1480      1490      1500      1510 

       1530      1540      1550      1560                 1570     
pF1KB7 PDLIPEGPEGKKSGEVISSDPNTPVPASPAHLLP-APLGLP----------DKMEAQLGY
       :.:  :  :.:: ..  : .:.::.:..:.   : .:  .:          .... . . 
CCDS76 PELA-EVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEENSLKEEESI
             1520      1530      1540      1550      1560      1570

        1580      1590      1600         1610      1620      1630  
pF1KB7 MDEKDPGAQKPRQPLEVQALPAALDRVESEDKH---ESPASKERAREERPEETEKAPPSP
         ::.  .  :.  .:    ::      :::..   : : ..:..  :. :  :..    
CCDS76 EGEKEVKSTAPETAIECTQAPAP----ASEDEKVVVEPPEGEEKV--EKAEVKERTEEPM
             1580      1590          1600      1610        1620    

           1640      1650      1660      1670      1680      1690  
pF1KB7 EQLPREEVLPEKEKILDKLELSLIHSRGDSSELRPDDTKAEEKEPIETQQNGDKEEDDEG
       :  :.  .  . ::. .:  ..:     ...: . ..   :::. .  : ::.  .: . 
CCDS76 ETEPKGAA--DVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEE---EEKKEVMLQ-NGETPKDLND
         1630        1640      1650         1660       1670        

           1700      1710      1720      1730      1740      1750  
pF1KB7 KKEDKKGKFKFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWHRRHDYWLLAGIVTHG
       .:. :. : .::::::::::::::.:::::::::. . : :.::::::::::::::..::
CCDS76 EKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAGIINHG
     1680      1690      1700      1710      1720      1730        

           1760      1770      1780      1790      1800      1810  
pF1KB7 YARWQDIQNDPRYMILNEPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYL
       ::::::::::::: :::::::.:...::.::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYL
     1740      1750      1760      1770      1780      1790        

           1820      1830      1840      1850      1860      1870  
pF1KB7 NMTQDPNHPAMALNARLAEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEELLSDMK
       ::..::.::.::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::
CCDS76 NMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEELLSDMK
     1800      1810      1820      1830      1840      1850        

           1880      1890      1900      1910      1920      1930  
pF1KB7 ADVTRLPSMLSRIPPVAARLQMSERSILSRLTNRAGDPTIQQGAFGSSQMYSNNFGPNFR
       :::::::. ..::::::.:::::::.:::::.::: .:: :: :                
CCDS76 ADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ             
     1860      1870      1880      1890      1900                  

           1940      1950    
pF1KB7 GPGPGGIVNYNQMPLGPYVTDI

>>CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17               (1966 aa)
 initn: 6811 init1: 3445 opt: 5266  Z-score: 3519.5  bits: 664.7 E(32554): 1e-189
Smith-Waterman score: 9053; 70.0% identity (84.1% similar) in 1957 aa overlap (49-1952:50-1926)

       20        30        40        50        60         70       
pF1KB7 MENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKKKPKKLKENK-CKGKRKKKEGSNDELSE
                                     .:. ::: ::::  : ...::. :..:.. 
CCDS32 ISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKPGKPRKRKKRDSEEEFGS
      20        30        40        50        60        70         

        80        90         100       110       120         130   
pF1KB7 NEEDLEEKSESEGSDYS--PNKKKKKKLKDKKEKKAKRKKKDEDEDDNDDGCLK--EPKS
       .... .::::: ::.:.  :..:...: ..:::::.::.:: :      ::  :  : ::
CCDS32 ERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKKGEG-----DGGQKQVEQKS
      80        90       100       110       120            130    

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB7 SGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFSQFLRPLIAKKNPKIPMSKMMTVLGAKWR
       :. :.  :::.::...::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 SATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWR
          140       150       160       170       180       190    

           200       210              220        230               
pF1KB7 EFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVET-------VTISPPLAVS-PPQVP-------QPVP
       :::::::::::.::.::::.:::. .       :. . :.: : :: .:       :: :
CCDS32 EFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPPALPPPPAADIQPPP
          200       210       220       230       240       250    

      240       250       260         270       280       290      
pF1KB7 IRKAKTKEGKGPGVRKKIKGSK--DGKKKGKGKKTAGLKFRFGGISNKRKKGSS------
       ::.:::::::::: ... :. .  ::.:: .::: : ::...: ...:::::.:      
CCDS32 IRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLGGKRKKGGSYVFQSD
          260       270       280       290       300       310    

               300       310       320         330                 
pF1KB7 -SEEDEREESDFDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRR--RKKKRI---------DDGDGY
        . : : ::::.::.:.:::: : .  .   : .. :  ::::..         .. :::
CCDS32 EGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVLGCPAVAGEEEVDGY
          320       330       340       350       360       370    

      340       350       360       370       380       390        
pF1KB7 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEPKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.::: :.
CCDS32 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPHCEKEGVQWEAKE
          380       390       400       410       420       430    

      400           410       420       430       440       450    
pF1KB7 DDDE-EEEG---GCEEEEDDHMEFCRVCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLPEIPNGE
       ...: ::::   : .::::::::.:::::::::::::::: ::::.::::::::.:::::
CCDS32 EEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHIHCLNPPLPDIPNGE
          440       450       460       470       480       490    

          460       470       480       490          500       510 
pF1KB7 WLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEPPAPFMVGLPGP---DVEPSLPPPKPLEGIPEREF
       ::::::::: :::.::.:::::: :::    :..:.:   : .:..:::.::.:  ::::
CCDS32 WLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPP----VAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREF
          500       510       520           530       540       550

             520       530       540       550       560       570 
pF1KB7 FVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNK
       ::::.:::::::::.::::::..: :::::::::::::::::.:::::..::::.::: :
CCDS32 FVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVK
              560       570       580       590       600       610

             580       590       600       610       620       630 
pF1KB7 DPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDDIDI
       :: ::.:::..::.::::::: .:::.::: ::::. :::.::.:::::: ::: :...:
CCDS32 DPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNI
              620       630       640       650       660       670

             640       650       660       670       680       690 
pF1KB7 PYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPW
       : :.. ::.:: ::::..:::   :..  :: :.:. :    ::..:  :::::.. :: 
CCDS32 PEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGD---GPPSSPTNDPTVKYETQPR
              680       690       700          710       720       

             700       710       720       730       740       750 
pF1KB7 YIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGP
       .: .:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::
CCDS32 FITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGP
       730       740       750       760       770       780       

             760       770       780       790       800       810 
pF1KB7 YLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRM
       .::::::::::::::::.:::: ::::::::::.::..:::::::::::::..:::.:.:
CCDS32 FLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKM
       790       800       810       820       830       840       

             820       830       840       850       860       870 
pF1KB7 KKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYK
       :.:.:.::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS32 KREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHK
       850       860       870       880       890       900       

             880       890       900       910       920       930 
pF1KB7 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
       910       920       930       940       950       960       

             940       950       960       970       980       990 
pF1KB7 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMDLKK
       :::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS32 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKK
       970       980       990      1000      1010      1020       

            1000      1010      1020      1030      1040      1050 
pF1KB7 CCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTK
       ::::::::::::.:.: ::.:.:.:..:.:::::::::::::.::...::::::::::::
CCDS32 CCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTK
      1030      1040      1050      1060      1070      1080       

            1060      1070      1080      1090      1100      1110 
pF1KB7 MLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
       :::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
      1090      1100      1110      1120      1130      1140       

            1120      1130      1140      1150      1160      1170 
pF1KB7 ADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHL
       ::::::.::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHL
      1150      1160      1170      1180      1190      1200       

            1180      1190      1200      1210      1220      1230 
pF1KB7 VVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLA
       :::::::::.:::.::::::::::::::::::. ::                        
CCDS32 VVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEG------------------------
      1210      1220      1230      1240                           

            1240      1250      1260      1270      1280      1290 
pF1KB7 ASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVA
                    .::. :::::::::. ::..:::::::::.::..:::::::::::::
CCDS32 -------------ENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVA
                        1250      1260      1270      1280         

            1300      1310      1320      1330      1340      1350 
pF1KB7 QYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNY
       :::::::: .::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 QYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNY
    1290      1300      1310      1320      1330      1340         

            1360      1370      1380      1390      1400      1410 
pF1KB7 NDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDKPLPPL
       :::.::::       :::::::.:::.:::::.:::::   ::::.:::....:::::::
CCDS32 NDAAQEDQ-------DNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG---RRQSKRQLRNEKDKPLPPL
    1350             1360      1370      1380         1390         

            1420      1430      1440      1450      1460      1470 
pF1KB7 LARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRAYVSLF
       ::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::...:::::::::.::::.::::::
CCDS32 LARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLF
    1400      1410      1420      1430      1440      1450         

            1480      1490      1500      1510      1520      1530 
pF1KB7 MRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYSTPDLIP
       :::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::.::::::::.::..: :.:.:
CCDS32 MRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMP
    1460      1470      1480      1490      1500      1510         

            1540      1550      1560      1570      1580      1590 
pF1KB7 EGPEGKKSGEVISSDPNTPVPASPAHLLPAPLGLPDKMEAQLGYMDEKDPGAQKPRQPLE
       .    .:     ::  ..:. .::.    .  . :   .      .::  :    : :::
CCDS32 DPSADSKR----SSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGEGI---RTPLE
    1520          1530      1540      1550      1560         1570  

            1600      1610      1620      1630      1640      1650 
pF1KB7 VQALPAALDRVESEDKHESPASKERAREERPEETEKAPPSPEQLPREEVLPEKEKILDKL
                . :.:...:.: .. :  :.   :::   :::     :.. :.:  . :  
CCDS32 ---------KEEAENQEEKPEKNSRIGEKM--ETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLED--
                    1580      1590        1600      1610           

            1660       1670      1680       1690      1700         
pF1KB7 ELSLIHSRGDSSE-LRPDDTKAEEKEPIETQQNGDKEED-DEGKKEDKKGKFKFMFNIAD
       :.  . .. .     : :  :.:. .  .  . : ..:  ..:..:.:  : .:::::::
CCDS32 EVPGVPGEMEPEPGYRGDREKSEDVKGDRELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIAD
    1620      1630      1640      1650      1660      1670         

    1710      1720      1730      1740      1750      1760         
pF1KB7 GGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWHRRHDYWLLAGIVTHGYARWQDIQNDPRYMILN
       :::::::::::::::::.::::. .::::::::::::::: :::::::::::: .. :.:
CCDS32 GGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHRRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIIN
    1680      1690      1700      1710      1720      1730         

    1770      1780      1790      1800      1810      1820         
pF1KB7 EPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNMTQDPNHPAMALNARL
       ::::.:..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::..:.: ::::::.::.
CCDS32 EPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMALHARF
    1740      1750      1760      1770      1780      1790         

    1830      1840      1850      1860      1870      1880         
pF1KB7 AEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEELLSDMKADVTRLPSMLSRIPPVA
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::.:
CCDS32 AEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIA
    1800      1810      1820      1830      1840      1850         

    1890      1900      1910          1920      1930      1940     
pF1KB7 ARLQMSERSILSRLTNRAGDP----TIQQGAFGSSQMYSNNFGPNFRGPGPGGIVNYNQM
       ::::::::::::::.... .:    .   : ...   :.  :.    :   .. .::.::
CCDS32 ARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYPPGPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQM
    1860      1870      1880      1890      1900      1910         

        1950                                          
pF1KB7 PLGPYVTDI                                      
       : : ..:                                        
CCDS32 PAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALVSDGLDRKEPRAGEVICIDD
    1920      1930      1940      1950      1960      

>>CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17               (2000 aa)
 initn: 6766 init1: 3445 opt: 5266  Z-score: 3519.4  bits: 664.7 E(32554): 1e-189
Smith-Waterman score: 9034; 69.1% identity (83.2% similar) in 1989 aa overlap (49-1952:50-1960)

       20        30        40        50        60         70       
pF1KB7 MENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKKKPKKLKENK-CKGKRKKKEGSNDELSE
                                     .:. ::: ::::  : ...::. :..:.. 
CCDS32 ISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKPGKPRKRKKRDSEEEFGS
      20        30        40        50        60        70         

        80        90         100       110       120         130   
pF1KB7 NEEDLEEKSESEGSDYS--PNKKKKKKLKDKKEKKAKRKKKDEDEDDNDDGCLK--EPKS
       .... .::::: ::.:.  :..:...: ..:::::.::.:: :      ::  :  : ::
CCDS32 ERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKKGEG-----DGGQKQVEQKS
      80        90       100       110       120            130    

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB7 SGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFSQFLRPLIAKKNPKIPMSKMMTVLGAKWR
       :. :.  :::.::...::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 SATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWR
          140       150       160       170       180       190    

           200       210              220        230               
pF1KB7 EFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVET-------VTISPPLAVS-PPQVP-------QPVP
       :::::::::::.::.::::.:::. .       :. . :.: : :: .:       :: :
CCDS32 EFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPPALPPPPAADIQPPP
          200       210       220       230       240       250    

      240       250       260         270       280       290      
pF1KB7 IRKAKTKEGKGPGVRKKIKGSK--DGKKKGKGKKTAGLKFRFGGISNKRKKGSS------
       ::.:::::::::: ... :. .  ::.:: .::: : ::...: ...:::::.:      
CCDS32 IRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLGGKRKKGGSYVFQSD
          260       270       280       290       300       310    

               300       310       320         330                 
pF1KB7 -SEEDEREESDFDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRR--RKKKRI---------DDGDGY
        . : : ::::.::.:.:::: : .  .   : .. :  ::::..         .. :::
CCDS32 EGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVLGCPAVAGEEEVDGY
          320       330       340       350       360       370    

      340       350       360       370       380       390        
pF1KB7 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEPKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.::: :.
CCDS32 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPHCEKEGVQWEAKE
          380       390       400       410       420       430    

      400           410       420       430       440       450    
pF1KB7 DDDE-EEEG---GCEEEEDDHMEFCRVCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLPEIPNGE
       ...: ::::   : .::::::::.:::::::::::::::: ::::.::::::::.:::::
CCDS32 EEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHIHCLNPPLPDIPNGE
          440       450       460       470       480       490    

          460       470       480       490          500       510 
pF1KB7 WLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEPPAPFMVGLPGP---DVEPSLPPPKPLEGIPEREF
       ::::::::: :::.::.:::::: :::    :..:.:   : .:..:::.::.:  ::::
CCDS32 WLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPP----VAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREF
          500       510       520           530       540       550

             520       530       540       550       560       570 
pF1KB7 FVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNK
       ::::.:::::::::.::::::..: :::::::::::::::::.:::::..::::.::: :
CCDS32 FVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVK
              560       570       580       590       600       610

             580       590       600       610       620       630 
pF1KB7 DPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDDIDI
       :: ::.:::..::.::::::: .:::.::: ::::. :::.::.:::::: ::: :...:
CCDS32 DPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNI
              620       630       640       650       660       670

             640       650       660       670       680       690 
pF1KB7 PYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPW
       : :.. ::.:: ::::..:::   :..  :: :.:. :    ::..:  :::::.. :: 
CCDS32 PEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGD---GPPSSPTNDPTVKYETQPR
              680       690       700          710       720       

             700       710       720       730       740       750 
pF1KB7 YIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGP
       .: .:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::
CCDS32 FITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGP
       730       740       750       760       770       780       

             760       770       780       790       800       810 
pF1KB7 YLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRM
       .::::::::::::::::.:::: ::::::::::.::..:::::::::::::..:::.:.:
CCDS32 FLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKM
       790       800       810       820       830       840       

             820       830       840       850       860       870 
pF1KB7 KKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYK
       :.:.:.::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS32 KREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHK
       850       860       870       880       890       900       

             880       890       900       910       920       930 
pF1KB7 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
       910       920       930       940       950       960       

             940       950       960       970       980       990 
pF1KB7 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMDLKK
       :::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS32 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKK
       970       980       990      1000      1010      1020       

            1000      1010      1020      1030      1040      1050 
pF1KB7 CCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTK
       ::::::::::::.:.: ::.:.:.:..:.:::::::::::::.::...::::::::::::
CCDS32 CCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTK
      1030      1040      1050      1060      1070      1080       

            1060      1070      1080      1090      1100      1110 
pF1KB7 MLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
       :::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
      1090      1100      1110      1120      1130      1140       

            1120      1130      1140      1150      1160      1170 
pF1KB7 ADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHL
       ::::::.::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHL
      1150      1160      1170      1180      1190      1200       

            1180      1190      1200      1210      1220      1230 
pF1KB7 VVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLA
       :::::::::.:::.::::::::::::::::::. ::                        
CCDS32 VVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEG------------------------
      1210      1220      1230      1240                           

            1240      1250      1260      1270      1280      1290 
pF1KB7 ASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVA
                    .::. :::::::::. ::..:::::::::.::..:::::::::::::
CCDS32 -------------ENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVA
                        1250      1260      1270      1280         

            1300      1310      1320      1330      1340      1350 
pF1KB7 QYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNY
       :::::::: .::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 QYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNY
    1290      1300      1310      1320      1330      1340         

            1360      1370      1380      1390      1400      1410 
pF1KB7 NDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDKPLPPL
       :::.::::       :::::::.:::.:::::.:::::   ::::.:::....:::::::
CCDS32 NDAAQEDQ-------DNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG---RRQSKRQLRNEKDKPLPPL
    1350             1360      1370      1380         1390         

            1420      1430      1440      1450      1460      1470 
pF1KB7 LARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRAYVSLF
       ::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::...:::::::::.::::.::::::
CCDS32 LARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLF
    1400      1410      1420      1430      1440      1450         

            1480      1490      1500      1510      1520      1530 
pF1KB7 MRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYSTPDLIP
       :::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::.::::::::.::..: :.:.:
CCDS32 MRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMP
    1460      1470      1480      1490      1500      1510         

            1540      1550      1560      1570      1580      1590 
pF1KB7 EGPEGKKSGEVISSDPNTPVPASPAHLLPAPLGLPDKMEAQLGYMDEKDPGAQKPRQPLE
       .    .:     ::  ..:. .::.    .  . :   .      .::  :    : :::
CCDS32 DPSADSKR----SSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGEGI---RTPLE
    1520          1530      1540      1550      1560         1570  

            1600      1610      1620      1630                     
pF1KB7 VQALPAALDRVESEDKHESPASKERAREERPEETEKAPPSP---EQL-PRE---------
                . :.:...:.: .. :  :.   :..   :.:   :.: ::.         
CCDS32 ---------KEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDEVPG
                    1580      1590      1600      1610      1620   

        1640      1650      1660      1670      1680               
pF1KB7 ---EVLPEKEKILDKLELSLIHSRGDSSELRPDDTKAEEKEPIETQQNGD--KEED----
          :. ::     :. . .   . :. .: .: : . ....:    ..::  :.::    
CCDS32 VPGEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERP--EGETGDLGKREDVKGD
          1630      1640      1650      1660        1670      1680 

            1690          1700      1710      1720      1730       
pF1KB7 --------DE----GKKEDKKGKFKFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWH
               ::    :..:.:  : .::::::::::::::::::::::::.::::. .:::
CCDS32 RELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWH
            1690      1700      1710      1720      1730      1740 

      1740      1750      1760      1770      1780      1790       
pF1KB7 RRHDYWLLAGIVTHGYARWQDIQNDPRYMILNEPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLE
       :::::::::::: :::::::::::: .. :.:::::.:..:::.::::::::::::::::
CCDS32 RRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLE
            1750      1760      1770      1780      1790      1800 

      1800      1810      1820      1830      1840      1850       
pF1KB7 QALVIEEQLRRAAYLNMTQDPNHPAMALNARLAEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVL
       ::::::::::::::::..:.: ::::::.::.::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVL
            1810      1820      1830      1840      1850      1860 

      1860      1870      1880      1890      1900      1910       
pF1KB7 HKVLNQLEELLSDMKADVTRLPSMLSRIPPVAARLQMSERSILSRLTNRAGDP----TIQ
       ::::::::::::::::::::::. ::::::.:::::::::::::::.... .:    .  
CCDS32 HKVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYP
            1870      1880      1890      1900      1910      1920 

          1920      1930      1940      1950                       
pF1KB7 QGAFGSSQMYSNNFGPNFRGPGPGGIVNYNQMPLGPYVTDI                   
        : ...   :.  :.    :   .. .::.::: : ..:                     
CCDS32 PGPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALV
            1930      1940      1950      1960      1970      1980 

CCDS32 SDGLDRKEPRAGEVICIDD
            1990      2000

>>CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17               (2059 aa)
 initn: 6766 init1: 3445 opt: 5266  Z-score: 3519.2  bits: 664.7 E(32554): 1.1e-189
Smith-Waterman score: 9034; 69.1% identity (83.2% similar) in 1989 aa overlap (49-1952:109-2019)

       20        30        40        50        60         70       
pF1KB7 MENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKKKPKKLKENK-CKGKRKKKEGSNDELSE
                                     .:. ::: ::::  : ...::. :..:.. 
CCDS32 PPPPLPPPPPPPPPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKPGKPRKRKKRDSEEEFGS
       80        90       100       110       120       130        

        80        90         100       110       120         130   
pF1KB7 NEEDLEEKSESEGSDYS--PNKKKKKKLKDKKEKKAKRKKKDEDEDDNDDGCLK--EPKS
       .... .::::: ::.:.  :..:...: ..:::::.::.:: :      ::  :  : ::
CCDS32 ERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKKGEG-----DGGQKQVEQKS
      140       150       160       170       180            190   

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB7 SGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFSQFLRPLIAKKNPKIPMSKMMTVLGAKWR
       :. :.  :::.::...::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 SATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWR
           200       210       220       230       240       250   

           200       210              220        230               
pF1KB7 EFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVET-------VTISPPLAVS-PPQVP-------QPVP
       :::::::::::.::.::::.:::. .       :. . :.: : :: .:       :: :
CCDS32 EFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPPALPPPPAADIQPPP
           260       270       280       290       300       310   

      240       250       260         270       280       290      
pF1KB7 IRKAKTKEGKGPGVRKKIKGSK--DGKKKGKGKKTAGLKFRFGGISNKRKKGSS------
       ::.:::::::::: ... :. .  ::.:: .::: : ::...: ...:::::.:      
CCDS32 IRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLGGKRKKGGSYVFQSD
           320       330       340       350       360       370   

               300       310       320         330                 
pF1KB7 -SEEDEREESDFDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRR--RKKKRI---------DDGDGY
        . : : ::::.::.:.:::: : .  .   : .. :  ::::..         .. :::
CCDS32 EGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVLGCPAVAGEEEVDGY
           380       390       400       410       420       430   

      340       350       360       370       380       390        
pF1KB7 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEPKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.::: :.
CCDS32 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPHCEKEGVQWEAKE
           440       450       460       470       480       490   

      400           410       420       430       440       450    
pF1KB7 DDDE-EEEG---GCEEEEDDHMEFCRVCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLPEIPNGE
       ...: ::::   : .::::::::.:::::::::::::::: ::::.::::::::.:::::
CCDS32 EEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHIHCLNPPLPDIPNGE
           500       510       520       530       540       550   

          460       470       480       490          500       510 
pF1KB7 WLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEPPAPFMVGLPGP---DVEPSLPPPKPLEGIPEREF
       ::::::::: :::.::.:::::: :::    :..:.:   : .:..:::.::.:  ::::
CCDS32 WLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPP----VAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREF
           560       570       580           590       600         

             520       530       540       550       560       570 
pF1KB7 FVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNK
       ::::.:::::::::.::::::..: :::::::::::::::::.:::::..::::.::: :
CCDS32 FVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVK
     610       620       630       640       650       660         

             580       590       600       610       620       630 
pF1KB7 DPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDDIDI
       :: ::.:::..::.::::::: .:::.::: ::::. :::.::.:::::: ::: :...:
CCDS32 DPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNI
     670       680       690       700       710       720         

             640       650       660       670       680       690 
pF1KB7 PYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPW
       : :.. ::.:: ::::..:::   :..  :: :.:. :    ::..:  :::::.. :: 
CCDS32 PEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGD---GPPSSPTNDPTVKYETQPR
     730       740       750       760          770       780      

             700       710       720       730       740       750 
pF1KB7 YIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGP
       .: .:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::
CCDS32 FITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGP
        790       800       810       820       830       840      

             760       770       780       790       800       810 
pF1KB7 YLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRM
       .::::::::::::::::.:::: ::::::::::.::..:::::::::::::..:::.:.:
CCDS32 FLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKM
        850       860       870       880       890       900      

             820       830       840       850       860       870 
pF1KB7 KKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYK
       :.:.:.::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS32 KREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHK
        910       920       930       940       950       960      

             880       890       900       910       920       930 
pF1KB7 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
        970       980       990      1000      1010      1020      

             940       950       960       970       980       990 
pF1KB7 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMDLKK
       :::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS32 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKK
       1030      1040      1050      1060      1070      1080      

            1000      1010      1020      1030      1040      1050 
pF1KB7 CCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTK
       ::::::::::::.:.: ::.:.:.:..:.:::::::::::::.::...::::::::::::
CCDS32 CCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTK
       1090      1100      1110      1120      1130      1140      

            1060      1070      1080      1090      1100      1110 
pF1KB7 MLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
       :::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
       1150      1160      1170      1180      1190      1200      

            1120      1130      1140      1150      1160      1170 
pF1KB7 ADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHL
       ::::::.::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHL
       1210      1220      1230      1240      1250      1260      

            1180      1190      1200      1210      1220      1230 
pF1KB7 VVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLA
       :::::::::.:::.::::::::::::::::::. ::                        
CCDS32 VVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEG------------------------
       1270      1280      1290      1300                          

            1240      1250      1260      1270      1280      1290 
pF1KB7 ASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVA
                    .::. :::::::::. ::..:::::::::.::..:::::::::::::
CCDS32 -------------ENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVA
                         1310      1320      1330      1340        

            1300      1310      1320      1330      1340      1350 
pF1KB7 QYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNY
       :::::::: .::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 QYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNY
     1350      1360      1370      1380      1390      1400        

            1360      1370      1380      1390      1400      1410 
pF1KB7 NDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDKPLPPL
       :::.::::       :::::::.:::.:::::.:::::   ::::.:::....:::::::
CCDS32 NDAAQEDQ-------DNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG---RRQSKRQLRNEKDKPLPPL
     1410             1420      1430         1440      1450        

            1420      1430      1440      1450      1460      1470 
pF1KB7 LARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRAYVSLF
       ::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::...:::::::::.::::.::::::
CCDS32 LARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLF
     1460      1470      1480      1490      1500      1510        

            1480      1490      1500      1510      1520      1530 
pF1KB7 MRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYSTPDLIP
       :::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::.::::::::.::..: :.:.:
CCDS32 MRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMP
     1520      1530      1540      1550      1560      1570        

            1540      1550      1560      1570      1580      1590 
pF1KB7 EGPEGKKSGEVISSDPNTPVPASPAHLLPAPLGLPDKMEAQLGYMDEKDPGAQKPRQPLE
       .    .:     ::  ..:. .::.    .  . :   .      .::  :    : :::
CCDS32 DPSADSKR----SSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGEGI---RTPLE
     1580          1590      1600      1610      1620         1630 

            1600      1610      1620      1630                     
pF1KB7 VQALPAALDRVESEDKHESPASKERAREERPEETEKAPPSP---EQL-PRE---------
                . :.:...:.: .. :  :.   :..   :.:   :.: ::.         
CCDS32 ---------KEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDEVPG
                     1640      1650      1660      1670      1680  

        1640      1650      1660      1670      1680               
pF1KB7 ---EVLPEKEKILDKLELSLIHSRGDSSELRPDDTKAEEKEPIETQQNGD--KEED----
          :. ::     :. . .   . :. .: .: : . ....:    ..::  :.::    
CCDS32 VPGEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERP--EGETGDLGKREDVKGD
           1690      1700      1710      1720        1730      1740

            1690          1700      1710      1720      1730       
pF1KB7 --------DE----GKKEDKKGKFKFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWH
               ::    :..:.:  : .::::::::::::::::::::::::.::::. .:::
CCDS32 RELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWH
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

      1740      1750      1760      1770      1780      1790       
pF1KB7 RRHDYWLLAGIVTHGYARWQDIQNDPRYMILNEPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLE
       :::::::::::: :::::::::::: .. :.:::::.:..:::.::::::::::::::::
CCDS32 RRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLE
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

      1800      1810      1820      1830      1840      1850       
pF1KB7 QALVIEEQLRRAAYLNMTQDPNHPAMALNARLAEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVL
       ::::::::::::::::..:.: ::::::.::.::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVL
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

      1860      1870      1880      1890      1900      1910       
pF1KB7 HKVLNQLEELLSDMKADVTRLPSMLSRIPPVAARLQMSERSILSRLTNRAGDP----TIQ
       ::::::::::::::::::::::. ::::::.:::::::::::::::.... .:    .  
CCDS32 HKVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYP
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

          1920      1930      1940      1950                       
pF1KB7 QGAFGSSQMYSNNFGPNFRGPGPGGIVNYNQMPLGPYVTDI                   
        : ...   :.  :.    :   .. .::.::: : ..:                     
CCDS32 PGPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALV
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

CCDS32 SDGLDRKEPRAGEVICIDD
             2050         

>>CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8               (2997 aa)
 initn: 1671 init1: 605 opt: 1582  Z-score: 1059.1  bits: 210.0 E(32554): 1.1e-52
Smith-Waterman score: 1716; 36.6% identity (61.5% similar) in 1013 aa overlap (504-1496:819-1686)

           480       490       500       510       520       530   
pF1KB7 HWRWTEPPAPFMVGLPGPDVEPSLPPPKPLEGIPEREFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLEL
                                     : .  .::.::. ..:: ::.:..  .:: 
CCDS47 SEQQESVDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEK
      790       800       810       820       830       840        

           540       550       560       570       580       590   
pF1KB7 YHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMM
        . .. .  .:         :         :... .::  . ...:....    .:... 
CCDS47 DKRIQQK-IKR---------F---------KAKQGQNK--FLSEIEDELF----NPDYVE
      850                          860         870           880   

             600         610       620        630       640        
pF1KB7 IHRILN--HSFDKKGD--VHYLIKWKDLPYDQCTWEI-DDIDIPYYDNLKQAYWGHRELM
       . ::..  .: : .:.  .:::.:: .:::.. :::  .:::    .....       ::
CCDS47 VDRIMDFARSTDDRGEPVTHYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQAKIEEFEK-------LM
           890       900       910       920       930             

      650       660       670       680       690       700        
pF1KB7 LGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPWYIDSTGGTLHPYQLEGL
           .: :.           .. :.::    .:   : ...  : ..  . :. :::::.
CCDS47 ----SREPET----------ERVERPP----ADDWKKSESSREYKNN--NKLREYQLEGV
            940                     950       960         970      

      710       720       730       740       750       760        
pF1KB7 NWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGPYLVSAPLSTIINWEREF
       ::: :.: .  . :::::::::::.:.:.::: .: .:  .::.:: :::::: ::::::
CCDS47 NWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKG-IHGPFLVIAPLSTIPNWEREF
        980       990      1000      1010       1020      1030     

      770       780       790       800       810       820        
pF1KB7 EMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRMKKEVQIKFHVLLTSYEL
       . :. .. ::.: :.. :: .:.  :. :.:   :  :  .        :::...:..:.
CCDS47 RTWT-ELNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSY--------KFHAIITTFEM
         1040      1050      1060      1070              1080      

      830       840       850       860       870       880        
pF1KB7 ITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYKLLLTGTPLQNNLEELFH
       :  :   : .: : :.:.:::::::: . :... :. . ...:.:::::::::..:::: 
CCDS47 ILTDCPELRNIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFS
       1090      1100      1110      1120      1130      1140      

      890       900       910       920       930       940        
pF1KB7 LLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIV
       ::.:: : :: .   :..::.:.. :.:..::. .: : :::::: :: ::.  : : :.
CCDS47 LLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETII
       1150      1160      1170      1180      1190      1200      

      950       960       970         980       990      1000      
pF1KB7 RVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGG--NQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEA
       .:::...:::::. :: .::  : :::::  :  .::: ::.:.::::::::  . ..: 
CCDS47 EVELTNIQKKYYRAILEKNFTFL-SKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYL--INGAEE
       1210      1220       1230      1240      1250        1260   

       1010               1020      1030      1040      1050       
pF1KB7 PVLP---------NGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLE
        .:          . ... .......:::.:..:.: ::.  ::::::::::.. ::.::
CCDS47 KILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILE
          1270      1280      1290      1300      1310      1320   

      1060      1070      1080      1090      1100      1110       
pF1KB7 DFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVII
       :.:  . : :::::: . :.::: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::
CCDS47 DYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCII
          1330      1340      1350      1360      1370      1380   

      1120      1130      1140      1150      1160      1170       
pF1KB7 YDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGL
       .::::::.::.:: .: :::::.:.: :::..:: : :... . :. :. : . :    :
CCDS47 FDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAV----L
          1390      1400      1410      1420      1430             

      1180      1190      1200      1210      1220      1230       
pF1KB7 GSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKK
        : ::  .  .       :...: : ..: .. .:               : :       
CCDS47 QSMSGRENATN-------GVQQLSKKEIEDLLRKGAY-------------GALM------
    1440      1450             1460                   1470         

      1240      1250      1260      1270      1280      1290       
pF1KB7 HGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVRE
              :..: : :.  . :   :  :: :..  : ..: ..     :.:  :..:.  
CCDS47 -------DEED-EGSKFCEEDIDQI--LLRRTHTITIESEGKG-----STFAKASFVA--
                  1480      1490        1500           1510        

      1300      1310      1320      1330        1340      1350     
pF1KB7 EDGVEEVEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARN--LGKGKRIRKQVNYNDAS
        .:    .:  :. .   ::..:.:  ..   . .   .::  .    :.:::.   .: 
CCDS47 -SG----NRTDISLD---DPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAV
            1520         1530      1540      1550      1560        

        1360      1370      1380      1390      1400      1410     
pF1KB7 QEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDKPLPPLLARV
       .::.    :.:: .:           : ::.: ..  : :.. :  . :.. .     ::
CCDS47 KEDELM--EFSDLES-----------DSEEKPCAKPRRPQDKSQGYA-RSECF-----RV
     1570        1580                 1590      1600               

        1420      1430      1440      1450      1460        1470   
pF1KB7 GGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRA--YVSLFMR
         :. : :.. :    . .. ..  .  ::.   . . : .     .....   .. :. 
CCDS47 EKNLLVYGWG-RWTDILSHGRYKRQLTEQDV---ETICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIW
    1610       1620      1630         1640      1650      1660     

          1480      1490      1500      1510      1520      1530   
pF1KB7 HLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYSTPDLIPEG
        :  : ::: .: :  : . :::                                     
CCDS47 DLITPTADG-QTRAL-VNHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQPVVQDADWLASCNPDALFQ
        1670        1680      1690      1700      1710      1720   

>>CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16              (2881 aa)
 initn: 1550 init1: 609 opt: 1576  Z-score: 1055.3  bits: 209.3 E(32554): 1.9e-52
Smith-Waterman score: 1720; 42.3% identity (68.8% similar) in 725 aa overlap (506-1207:711-1371)

         480       490       500       510       520       530     
pF1KB7 RWTEPPAPFMVGLPGPDVEPSLPPPKPLEGIPEREFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYH
                                     :  .:::::. . :: :: :. : :: :  
CCDS45 VENPSEEDAAIVDKILSSRTVKKEISPGVMIDTEEFFVKYKNYSYLHCEWATEEQL-LKD
              690       700       710       720       730          

         540       550       560       570       580       590     
pF1KB7 TVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIH
         . .. .:         :            .. ..  ..: :::. .    .:... . 
CCDS45 KRIQQKIKR---------FKL----------RQAQRAHFFADMEEEPF----NPDYVEVD
     740                750                 760           770      

         600            610       620        630       640         
pF1KB7 RILNHSF--DKK-GD--VHYLIKWKDLPYDQCTWEI-DDIDIPYYDNLKQAYWGHRELML
       :.:. ::  ::  :.  ..::.:: .:::.. :::. .:.:.   ....:   . :    
CCDS45 RVLEVSFCEDKDTGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQ-LQASRP---
        780       790       800       810       820        830     

     650       660       670       680       690       700         
pF1KB7 GEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPWYIDSTGGTLHPYQLEGLN
         :::   ::            ..::.    .   :.:..  :  ..:. :. :::::::
CCDS45 --DTR---RL------------DRPPS----NIWKKIDQSRDY--KNGNQLREYQLEGLN
                             840           850         860         

     710       720       730       740       750       760         
pF1KB7 WLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGPYLVSAPLSTIINWEREFE
       :: :.: .  . :::::::::::.:.:.::: .   :  .::.:. :::::: ::::::.
CCDS45 WLLFNWYNRRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILLTG-IRGPFLIIAPLSTIANWEREFR
     870       880       890       900        910       920        

     770       780       790       800       810       820         
pF1KB7 MWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRMKKEVQIKFHVLLTSYELI
        :. :. ::.: :.  ::..:.. :. :.:.  :  . ..:        :....:..:.:
CCDS45 TWT-DINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYR--------FQAIITTFEMI
      930        940       950       960               970         

     830       840       850       860       870       880         
pF1KB7 TIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYKLLLTGTPLQNNLEELFHL
           . :..::: :...::::::::.. :... :. .....:.:::::::::..:::: :
CCDS45 LGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSL
     980       990      1000      1010      1020      1030         

     890       900       910       920       930       940         
pF1KB7 LNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVR
       :.:: : :: .   :..::.:.. :.:..::. .: : :::::: :: :..  : : :..
CCDS45 LHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIE
    1040      1050      1060      1070      1080      1090         

     950       960       970         980       990      1000       
pF1KB7 VELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGG--NQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAP
       :::...:::::. :: .::  : :::.:  :  .:.: ::.:.::::::::  . ..:  
CCDS45 VELTNIQKKYYRAILEKNFSFL-SKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYL--IKGAEEK
    1100      1110      1120       1130      1140        1150      

              1010       1020      1030      1040      1050        
pF1KB7 VL--------PNGS-YDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLED
       .:        : .: .  .....:.:::.:..:.: :..  ::.:::::::.. ::.:::
CCDS45 ILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED
       1160      1170      1180      1190      1200      1210      

     1060      1070      1080      1090      1100      1110        
pF1KB7 FLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIY
       .: .. : :::::: . :.::: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::.
CCDS45 YLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF
       1220      1230      1240      1250      1260      1270      

     1120      1130      1140      1150      1160      1170        
pF1KB7 DSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLG
       ::::::.::.:: .: ::::::: : .::.::: : :... . :. :. : . :..   :
CCDS45 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG
       1280      1290      1300      1310      1320      1330      

     1180           1190       1200      1210      1220      1230  
pF1KB7 SKSG-----SMTKQELDDILKFGTE-ELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAA
        .:.     ...:.:..:.:. :.   ..... ::                         
CCDS45 RESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEG
       1340      1350      1360      1370      1380      1390      

           1240      1250      1260      1270      1280      1290  
pF1KB7 SAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQ
                                                                   
CCDS45 RGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRP
       1400      1410      1420      1430      1440      1450      

>>CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16              (2897 aa)
 initn: 1550 init1: 609 opt: 1576  Z-score: 1055.2  bits: 209.3 E(32554): 1.9e-52
Smith-Waterman score: 1720; 42.3% identity (68.8% similar) in 725 aa overlap (506-1207:711-1371)

         480       490       500       510       520       530     
pF1KB7 RWTEPPAPFMVGLPGPDVEPSLPPPKPLEGIPEREFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYH
                                     :  .:::::. . :: :: :. : :: :  
CCDS76 VENPSEEDAAIVDKILSSRTVKKEISPGVMIDTEEFFVKYKNYSYLHCEWATEEQL-LKD
              690       700       710       720       730          

         540       550       560       570       580       590     
pF1KB7 TVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIH
         . .. .:         :            .. ..  ..: :::. .    .:... . 
CCDS76 KRIQQKIKR---------FKL----------RQAQRAHFFADMEEEPF----NPDYVEVD
     740                750                 760           770      

         600            610       620        630       640         
pF1KB7 RILNHSF--DKK-GD--VHYLIKWKDLPYDQCTWEI-DDIDIPYYDNLKQAYWGHRELML
       :.:. ::  ::  :.  ..::.:: .:::.. :::. .:.:.   ....:   . :    
CCDS76 RVLEVSFCEDKDTGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQ-LQASRP---
        780       790       800       810       820        830     

     650       660       670       680       690       700         
pF1KB7 GEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPWYIDSTGGTLHPYQLEGLN
         :::   ::            ..::.    .   :.:..  :  ..:. :. :::::::
CCDS76 --DTR---RL------------DRPPS----NIWKKIDQSRDY--KNGNQLREYQLEGLN
                             840           850         860         

     710       720       730       740       750       760         
pF1KB7 WLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGPYLVSAPLSTIINWEREFE
       :: :.: .  . :::::::::::.:.:.::: .   :  .::.:. :::::: ::::::.
CCDS76 WLLFNWYNRRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEILLTG-IRGPFLIIAPLSTIANWEREFR
     870       880       890       900        910       920        

     770       780       790       800       810       820         
pF1KB7 MWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRMKKEVQIKFHVLLTSYELI
        :. :. ::.: :.  ::..:.. :. :.:.  :  . ..:        :....:..:.:
CCDS76 TWT-DINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYR--------FQAIITTFEMI
      930        940       950       960               970         

     830       840       850       860       870       880         
pF1KB7 TIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYKLLLTGTPLQNNLEELFHL
           . :..::: :...::::::::.. :... :. .....:.:::::::::..:::: :
CCDS76 LGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSL
     980       990      1000      1010      1020      1030         

     890       900       910       920       930       940         
pF1KB7 LNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVR
       :.:: : :: .   :..::.:.. :.:..::. .: : :::::: :: :..  : : :..
CCDS76 LHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIE
    1040      1050      1060      1070      1080      1090         

     950       960       970         980       990      1000       
pF1KB7 VELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGG--NQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAP
       :::...:::::. :: .::  : :::.:  :  .:.: ::.:.::::::::  . ..:  
CCDS76 VELTNIQKKYYRAILEKNFSFL-SKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYL--IKGAEEK
    1100      1110      1120       1130      1140        1150      

              1010       1020      1030      1040      1050        
pF1KB7 VL--------PNGS-YDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLED
       .:        : .: .  .....:.:::.:..:.: :..  ::.:::::::.. ::.:::
CCDS76 ILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED
       1160      1170      1180      1190      1200      1210      

     1060      1070      1080      1090      1100      1110        
pF1KB7 FLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIY
       .: .. : :::::: . :.::: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::.
CCDS76 YLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF
       1220      1230      1240      1250      1260      1270      

     1120      1130      1140      1150      1160      1170        
pF1KB7 DSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLG
       ::::::.::.:: .: ::::::: : .::.::: : :... . :. :. : . :..   :
CCDS76 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG
       1280      1290      1300      1310      1320      1330      

     1180           1190       1200      1210      1220      1230  
pF1KB7 SKSG-----SMTKQELDDILKFGTE-ELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAA
        .:.     ...:.:..:.:. :.   ..... ::                         
CCDS76 RESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEG
       1340      1350      1360      1370      1380      1390      

           1240      1250      1260      1270      1280      1290  
pF1KB7 SAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQ
                                                                   
CCDS76 RGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRP
       1400      1410      1420      1430      1440      1450      

>>CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20              (2715 aa)
 initn: 1672 init1: 578 opt: 1564  Z-score: 1047.6  bits: 207.8 E(32554): 5e-52
Smith-Waterman score: 1702; 33.3% identity (59.1% similar) in 1158 aa overlap (473-1580:279-1282)

            450       460       470       480              490     
pF1KB7 LNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEPPAP-------FMVGLPGPDVEP
                                     : :.  :::         ....    .:.:
CCDS13 EDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHP
      250       260       270       280       290       300        

         500       510       520       530       540       550     
pF1KB7 SLPPPKPLEGIPEREFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFD
       .  ::  ::      :.::. ..:: ::.:.   .::    .  .  . .:         
CCDS13 G-EPPFDLE-----LFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRN---------
       310            320       330       340       350            

         560       570       580       590         600          610
pF1KB7 YGSGDEDGKSEKRKNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILN--HSFDKK-GD--VHY
               :. . :.   .... .: ..    .:... . :::.  :. : . :.  .::
CCDS13 --------KQAQMKH---IFTEPDEDLF----NPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHY
                   360          370           380       390        

              620        630       640       650       660         
pF1KB7 LIKWKDLPYDQCTWEID-DIDIPYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDD
       :.:: .:::.. :::.. :.:                         : .. :. ..:.  
CCDS13 LVKWCSLPYEESTWELEEDVD-------------------------PAKV-KEFESLQVL
      400       410                                420        430  

     670       680       690       700       710       720         
pF1KB7 KQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPWYIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGL
        . :  . :  :   :..:.  : .:.   :. :::::.::: :.: .  . ::::::::
CCDS13 PEIKHVERPASDSWQKLEKSREYKNSN--QLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGL
            440       450         460       470       480       490

     730       740       750       760       770       780         
pF1KB7 GKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGPYLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSV
       :::.:.:.::  .. .:  .::.:. :::::: ::::::. :. .. ...: :.. ::..
CCDS13 GKTIQSITFLSEIFLRG-IHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWT-EMNAIVYHGSQISRQM
              500        510       520       530        540        

     790       800       810       820       830       840         
pF1KB7 IRENEFSFEDNAIRSGKKVFRMKKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEA
       :.. :. ..:      . ::        ::::..:..:.:  :   : .:.:.:...:::
CCDS13 IQQYEMVYRDAQGNPLSGVF--------KFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEA
      550       560               570       580       590       600

     850       860       870       880       890       900         
pF1KB7 HRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFA
       ::::: . :... :. . ...:.:::::::::..:::: ::::: : .: .  .:::::.
CCDS13 HRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFG
              610       620       630       640       650       660

     910       920       930       940       950       960         
pF1KB7 DISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFE
       :.. :.:.:::...: : :::::: :: ::.  : : :..:::...:::::. :: .:: 
CCDS13 DLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFS
              670       680       690       700       710       720

     970         980       990      1000              1010         
pF1KB7 ALNSKGGG--NQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAPVL--------PNG-SYDGSS
        : .::..  :. .:.: ::.:.::::::::  . ..:  .:        :.. ... ..
CCDS13 FL-TKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYL--INGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQA
               730       740       750         760       770       

     1020      1030      1040      1050      1060      1070        
pF1KB7 LVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGL
       .....:::.:..:.: ::   ::.:::::::.. ::.:::.:  . : :::::: . :.:
CCDS13 MIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNL
       780       790       800       810       820       830       

     1080      1090      1100      1110      1120      1130        
pF1KB7 RQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIG
       :: :::::  : ...: ::: ::::::::::..::: ::.::::::.::.:: .: ::::
CCDS13 RQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIG
       840       850       860       870       880       890       

     1140      1150      1160      1170      1180      1190        
pF1KB7 QNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTE
       :.: : .::..:: : :... . :. :. : . :..  .. :.:.            :..
CCDS13 QSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQD-INRKGGTN-----------GVQ
       900       910       920       930        940                

     1200      1210      1220      1230      1240      1250        
pF1KB7 ELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYD
       .: : .:: .. .:               : :              :..: : :.  . :
CCDS13 QLSKMEVEDLLRKGAY-------------GALM-------------DEED-EGSKFCEED
         950       960                                  970        

     1260      1270      1280      1290      1300      1310        
pF1KB7 DAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPD
          :...:.:    :    .:. ..  :.:  :..:.   .:    .:  :. .   ::.
CCDS13 ---IDQILQRR---THTITIQSEGKG-STFAKASFVA---SG----NRTDISLD---DPN
         980          990       1000         1010             1020 

     1320       1330      1340       1350      1360      1370      
pF1KB7 YWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RIRKQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGS
       .:.:  .  . . . ..  ..:   . :.:::... .. .::     ::     :.:   
CCDS13 FWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEED-----ELM----EFS---
            1030      1040      1050      1060                     

       1380      1390      1400      1410      1420      1430      
pF1KB7 EDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAI
        . : : .:::       .::: :..   . :     ::  :. ..:.. : .  . .. 
CCDS13 -ELDSDSDERPT------RSRR-LNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWG-RWKDILTHGR
     1070      1080             1090      1100      1110       1120

       1440      1450      1460        1470      1480       1490   
pF1KB7 MRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRA--YVSLFMRHLCEPGADG-AETFADGVPRE
       ..: .  .:    . . : :     :....   .. :. .:  :  :: :.:. .   . 
CCDS13 FKWHLNEKDM---EMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQN---HS
             1130         1140      1150      1160      1170       

          1500      1510      1520       1530                      
pF1KB7 GLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYS-TPDLIPEGPEGKK--------------
       :::      : :  .  .  . :.. ..   . .:... .    ::              
CCDS13 GLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVR
         1180      1190      1200      1210      1220      1230    

          1540      1550      1560      1570       1580      1590  
pF1KB7 -----SGEVISSDPNTPVPASPAHLLPAPLGLPDKMEAQLGYMD-EKDPGAQKPRQPLEV
            ..:...   .    .:::. : .::   : ::  . . : : :            
CCDS13 MLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDWWDAEADKSLLIGVFKHGY
         1240      1250      1260      1270      1280      1290    

           1600      1610      1620      1630      1640      1650  
pF1KB7 QALPAALDRVESEDKHESPASKERAREERPEETEKAPPSPEQLPREEVLPEKEKILDKLE
                                                                   
CCDS13 ERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDIPERGNTDKEDNAEDKVDGLQK
         1300      1310      1320      1330      1340      1350    




1954 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 08:39:24 2016 done: Sat Nov  5 08:39:26 2016
 Total Scan time:  5.800 Total Display time:  1.180

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com