Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0006
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0006, 776 aa
1>>>pF1KA0006 776 - 776 aa - 776 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2805+/-0.00112; mu= 7.0920+/- 0.067
mean_var=208.0712+/-43.345, 0's: 0 Z-trim(109.6): 154 B-trim: 252 in 2/51
Lambda= 0.088914
statistics sampled from 10991 (11153) to 10991 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 2.030
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS14660.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs109|chrX ( 776) 5090 666.6 4.5e-191
CCDS78509.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs109|chrX ( 622) 4087 537.8 2e-152
CCDS32009.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 ( 782) 2022 273.0 1.3e-72
CCDS86360.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 ( 862) 2022 273.1 1.4e-72
CCDS45068.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 ( 803) 2006 271.0 5.6e-72
CCDS45069.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 ( 753) 2003 270.6 7e-72
CCDS86362.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 ( 625) 1867 253.0 1.1e-66
CCDS9521.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 ( 646) 1867 253.1 1.1e-66
CCDS86361.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 ( 705) 1867 253.1 1.2e-66
CCDS81781.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 ( 547) 1413 194.8 3.3e-49
>>CCDS14660.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs109|chrX (776 aa)
initn: 5090 init1: 5090 opt: 5090 Z-score: 3544.1 bits: 666.6 E(33420): 4.5e-191
Smith-Waterman score: 5090; 100.0% identity (100.0% similar) in 776 aa overlap (1-776:1-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNPEEQIVTWLISLGVLESPKKTICDPEEFLKSSLKNGVVLCKLINRLMPGSVEKFCLDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MNPEEQIVTWLISLGVLESPKKTICDPEEFLKSSLKNGVVLCKLINRLMPGSVEKFCLDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QTEADCINNINDFLKGCATLQVEIFDPDDLYSGVNFSKVLSTLLAVNKATEDQLSERPCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QTEADCINNINDFLKGCATLQVEIFDPDDLYSGVNFSKVLSTLLAVNKATEDQLSERPCG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 RSSSLSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RSSSLSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKAVKGFETAPLTKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKAVKGFETAPLTKN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 YYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQTLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQTLC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 QALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMENQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMENQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 ASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQCQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQCQD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVLIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVLIM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQEWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQEWL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EQLNRLIRGPASCSSLSKTSSSSCSAHSSFSSTGQPRGPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EQLNRLIRGPASCSSLSKTSSSSCSAHSSFSSTGQPRGPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RPSAALGYKERMSYILKESSKSPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RPSAALGYKERMSYILKESSKSPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQIL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 KVIEAYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KVIEAYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVYA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KA0 LKDEVRELKQENKRMKQCLEEELKSRRDLEKLVRRLLKQTDECIRGESSSKTSILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKDEVRELKQENKRMKQCLEEELKSRRDLEKLVRRLLKQTDECIRGESSSKTSILP
730 740 750 760 770
>>CCDS78509.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs109|chrX (622 aa)
initn: 4087 init1: 4087 opt: 4087 Z-score: 2850.1 bits: 537.8 E(33420): 2e-152
Smith-Waterman score: 4087; 100.0% identity (100.0% similar) in 622 aa overlap (155-776:1-622)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKG
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKAVKGFETAPLTKNYYTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKAVKGFETAPLTKNYYTV
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALE
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMENQGASSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMENQGASSP
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQCQDLRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQCQDLRKR
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVLIMLSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVLIMLSAS
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQEWLEQLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQEWLEQLN
340 350 360 370 380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RLIRGPASCSSLSKTSSSSCSAHSSFSSTGQPRGPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RLIRGPASCSSLSKTSSSSCSAHSSFSSTGQPRGPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSA
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ALGYKERMSYILKESSKSPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQILKVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ALGYKERMSYILKESSKSPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQILKVIE
460 470 480 490 500 510
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 AYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVYALKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVYALKDE
520 530 540 550 560 570
730 740 750 760 770
pF1KA0 VRELKQENKRMKQCLEEELKSRRDLEKLVRRLLKQTDECIRGESSSKTSILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VRELKQENKRMKQCLEEELKSRRDLEKLVRRLLKQTDECIRGESSSKTSILP
580 590 600 610 620
>>CCDS32009.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 (782 aa)
initn: 2796 init1: 1452 opt: 2022 Z-score: 1417.2 bits: 273.0 E(33420): 1.3e-72
Smith-Waterman score: 2770; 59.0% identity (81.6% similar) in 719 aa overlap (1-679:1-712)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNPEEQIVTWLISLGVLESPKKTICDPEEFLKSSLKNGVVLCKLINRLMPGSVEKFCLDP
:: :: :::::.::::::::::: ::: ::..:::.:::::.:..::.::..:: .:
CCDS32 MNSAEQTVTWLITLGVLESPKKTISDPEGFLQASLKDGVVLCRLLERLLPGTIEKVYPEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA0 QTEADCINNINDFLKGC-ATLQVEIFDPDDLYSGVNFSKVLSTLLAVNKATED--QLSER
..:..:..:: .::.:: :.:..: :: .:::.: ::.::::.:...::.: : :.
CCDS32 RSESECLSNIREFLRGCGASLRLETFDANDLYQGQNFNKVLSSLVTLNKVTADIGLGSDS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 PCGRSSSLSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNED
:.: :: . .. . :. . : . .: : ....::.:...::.:.:.:::.:::::
CCDS32 VCARPSSHRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNED
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 ELSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKA------VKG
::: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:.::.:.:::. ::
CCDS32 ELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FETAPLTKNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEE
:.:. ..:.::.:::::::.::.::.::::..: :::::::....::..... :.::.::
CCDS32 FDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 VCTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDE
.:.::: : :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:..::.:::::::::::::.::.:
CCDS32 ICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 LEQFMENQGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAF
: .:::..::::::::.:::.::::::::.:: :::.:::::::: : :.::: :...::
CCDS32 LGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 KTLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYL
:.: .:::..::::.::::::.: :. :::.:::.:::: .::::..: .. :::.::::
CCDS32 KNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 MLFSNVLIMLSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCN
.:: :::.::::::::::::::::.: .: ..:.:.. :.. .:::.:. .:::.: ::
CCDS32 LLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCN
490 500 510 520 530 540
540 550 560
pF1KA0 NNQDFQEWLEQLNRLIR----G--------------------PASCSSLSKTSSSSCSAH
:.::.:::.:.:.. . : :.: . :: . . . :
CCDS32 NQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYH
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 S--SFSSTGQPR-----GPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSAALGYKERMSYILKESS
. : : :. ::::::. :::::::::::::::::::: ::: .:
CCDS32 TLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLS-------
610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 KSPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSANFQQGHGSST
::::::::.: ::: :::::.::.. ::::::::::::::::::::::::. .: .:.
CCDS32 KSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTW
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 RKDSIPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVYALKDEVRELKQENKRMKQCLE
CCDS32 QGTDLMHNHVLADDDQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRKS
720 730 740 750 760 770
>>CCDS86360.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 (862 aa)
initn: 3179 init1: 1452 opt: 2022 Z-score: 1416.6 bits: 273.1 E(33420): 1.4e-72
Smith-Waterman score: 2899; 56.2% identity (76.6% similar) in 824 aa overlap (1-725:1-817)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNPEEQIVTWLISLGVLESPKKTICDPEEFLKSSLKNGVVLCKLINRLMPGSVEKFCLDP
:: :: :::::.::::::::::: ::: ::..:::.:::::.:..::.::..:: .:
CCDS86 MNSAEQTVTWLITLGVLESPKKTISDPEGFLQASLKDGVVLCRLLERLLPGTIEKVYPEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA0 QTEADCINNINDFLKGC-ATLQVEIFDPDDLYSGVNFSKVLSTLLAVNKATED--QLSER
..:..:..:: .::.:: :.:..: :: .:::.: ::.::::.:...::.: : :.
CCDS86 RSESECLSNIREFLRGCGASLRLETFDANDLYQGQNFNKVLSSLVTLNKVTADIGLGSDS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 PCGRSSSLSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNED
:.: :: . .. . :. . : . .: : ....::.:...::.:.:.:::.:::::
CCDS86 VCARPSSHRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNED
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 ELSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKA------VKG
::: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:.::.:.:::. ::
CCDS86 ELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FETAPLTKNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEE
:.:. ..:.::.:::::::.::.::.::::..: :::::::....::..... :.::.::
CCDS86 FDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 VCTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDE
.:.::: : :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:..::.:::::::::::::.::.:
CCDS86 ICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 LEQFMENQGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAF
: .:::..::::::::.:::.::::::::.:: :::.:::::::: : :.::: :...::
CCDS86 LGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 KTLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYL
:.: .:::..::::.::::::.: :. :::.:::.:::: .::::..: .. :::.::::
CCDS86 KNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 MLFSNVLIMLSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCN
.:: :::.::::::::::::::::.: .: ..:.:.. :.. .:::.:. .:::.: ::
CCDS86 LLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCN
490 500 510 520 530 540
540 550 560
pF1KA0 NNQDFQEWLEQLNRLIR----G--------------------PASCSSLSKTSSSSCSAH
:.::.:::.:.:.. . : :.: . :: . . . :
CCDS86 NQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYH
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 S--SFSSTGQPR-----GPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSAALGYKERMSYILKESS
. : : :. ::::::. :::::::::::::::::::: ::: .:
CCDS86 TLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLS-------
610 620 630 640 650
630 640 650 660 670
pF1KA0 KSPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSANFQQ------
::::::::.: ::: :::::.::.. ::::::::::::::::::::::::. .:
CCDS86 KSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTW
660 670 680 690 700 710
680
pF1KA0 -----------------------------------------------------GHGSSTR
: : .:
CCDS86 QGTDLMHNHVLADDDQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRSR
720 730 740 750 760 770
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 KDSIPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVYALKDEVRELKQENKRMKQCLEE
:.: ::::::::::.:.:::.:::::..::::::::::::::::
CCDS86 KESAPQVLLPEEEKIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELRQDNKKMKKSLEE
780 790 800 810 820 830
750 760 770
pF1KA0 ELKSRRDLEKLVRRLLKQTDECIRGESSSKTSILP
CCDS86 EQRARKDLEKLVRKVLKNMNDPAWDETNL
840 850 860
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNPEEQIVTWLISLGVLESPKKTICDPEEFLKSSLKNGVVLCKLINRLMPGSVEKFCLDP
:: :: :::::.::::::::::: ::: ::..:::.:::::.:..::.::..:: .:
CCDS45 MNSAEQTVTWLITLGVLESPKKTISDPEGFLQASLKDGVVLCRLLERLLPGTIEKVYPEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90
pF1KA0 QTEADCINNINDFLKGC-ATLQVEI---------------------FDPDDLYSGVNFSK
..:..:..:: .::.:: :.:..:. :: .:::.: ::.:
CCDS45 RSESECLSNIREFLRGCGASLRLELLFPPSQPPQHLVTTILLSASTFDANDLYQGQNFNK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 VLSTLLAVNKATED--QLSERPCGRSSSLSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMT
:::.:...::.: : :. :.: :: . .. . :. . : . .: : ....::
CCDS45 VLSSLVTLNKVTADIGLGSDSVCARPSSHRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 ENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVRE
.:...::.:.:.:::.:::::::: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVRE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 IKSSERPLSPKA------VKGFETAPLTKNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRP
.:.::.:.:::. :::.:. ..:.::.:::::::.::.::.::::..: :::::
CCDS45 VKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRP
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 LQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSM
::....::..... :.::.::.:.::: : :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:..
CCDS45 LQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 YLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMENQGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQEL
::.:::::::::::::.::.:: .:::..::::::::.:::.::::::::.:: :::.::
CCDS45 YLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKEL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 ERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNV
:::::: : :.::: :...:::.: .:::..::::.::::::.: :. :::.:::.::::
CCDS45 ERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNV
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 IFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVLIMLSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIE
.::::..: .. :::.::::.:: :::.::::::::::::::::.: .: ..:.:.. :
CCDS45 TYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSE
490 500 510 520 530 540
520 530 540
pF1KA0 GNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQEWLEQLNRLIR----G-----------------
.. .:::.:. .:::.: :::.::.:::.:.:.. . :
CCDS45 NHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSH
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590
pF1KA0 ---PASCSSLSKTSSSSCSAHS--SFSSTGQPR-----GPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPP
:.: . :: . . . :. : : :. ::::::. :::::::::::::
CCDS45 PVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPP
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 LRPSAALGYKERMSYILKESSKSPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQI
::::::: ::: .: ::::::::.: ::: :::::.::.. :::::::::::::
CCDS45 LRPSAALCYKEDLS-------KSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQI
670 680 690 700 710
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 LKVIEAYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVY
:::::::::::. .: .:.
CCDS45 LKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADDDQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSED
720 730 740 750 760 770
>>CCDS45069.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 (753 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNPEEQIVTWLISLGVLESPKKTICDPEEFLKSSLKNGVVLCKLINRLMPGSVEKFCLDP
:: :: :::::.::::::::::: ::: ::..:::.:::::.:..::.::..::
CCDS45 MNSAEQTVTWLITLGVLESPKKTISDPEGFLQASLKDGVVLCRLLERLLPGTIEK-----
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA0 QTEADCINNINDFLKGCATLQVEIFDPDDLYSGVNFSKVLSTLLAVNKATED--QLSERP
:: .:::.: ::.::::.:...::.: : :.
CCDS45 -----------------------TFDANDLYQGQNFNKVLSSLVTLNKVTADIGLGSDSV
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 CGRSSSLSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDE
:.: :: . .. . :. . : . .: : ....::.:...::.:.:.:::.::::::
CCDS45 CARPSSHRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDE
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LSVCKGDIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKA------VKGF
:: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:.::.:.:::. :::
CCDS45 LSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGF
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 ETAPLTKNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEV
.:. ..:.::.:::::::.::.::.::::..: :::::::....::..... :.::.::.
CCDS45 DTTAINKSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 CTFQQTLCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDEL
:.::: : :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:..::.:::::::::::::.::.::
CCDS45 CSFQQMLVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEEL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 EQFMENQGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFK
.:::..::::::::.:::.::::::::.:: :::.:::::::: : :.::: :...:::
CCDS45 GEFMETKGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFK
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 TLMGQCQDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLM
.: .:::..::::.::::::.: :. :::.:::.:::: .::::..: .. :::.::::.
CCDS45 NLSAQCQEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLL
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 LFSNVLIMLSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNN
:: :::.::::::::::::::::.: .: ..:.:.. :.. .:::.:. .:::.: :::
CCDS45 LFPNVLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNN
460 470 480 490 500 510
540 550 560
pF1KA0 NQDFQEWLEQLNRLIR----G--------------------PASCSSLSKTSSSSCSAHS
.::.:::.:.:.. . : :.: . :: . . . :.
CCDS45 QQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHT
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 --SFSSTGQPR-----GPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSAALGYKERMSYILKESSK
: : :. ::::::. :::::::::::::::::::: ::: .: :
CCDS45 LPHPSHHGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLS-------K
580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 SPKTMKKFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSANFQQGHGSSTR
:::::::.: ::: :::::.::.. ::::::::::::::::::::::::. .: .:.
CCDS45 SPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQ
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 KDSIPQVLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVYALKDEVRELKQENKRMKQCLEE
CCDS45 GTDLMHNHVLADDDQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRKSC
690 700 710 720 730 740
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130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKG
::.:...::.:.:.:::.:::::::: ::
CCDS86 MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
10 20 30
190 200 210 220 230
pF1KA0 DIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKA------VKGFETAPLT
:.:.::::::::::::::::::::::::::::.:.::.:.:::. :::.:. ..
CCDS86 DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 KNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQT
:.::.:::::::.::.::.::::..: :::::::....::..... :.::.::.:.:::
CCDS86 KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMEN
: :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:..::.:::::::::::::.::.:: .:::.
CCDS86 LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 QGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQC
.::::::::.:::.::::::::.:: :::.:::::::: : :.::: :...:::.: .::
CCDS86 KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 QDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVL
:..::::.::::::.: :. :::.:::.:::: .::::..: .. :::.::::.:: :::
CCDS86 QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 IMLSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQE
.::::::::::::::::.: .: ..:.:.. :.. .:::.:. .:::.: :::.::.::
CCDS86 LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
340 350 360 370 380 390
540 550 560 570
pF1KA0 WLEQLNRLIR----G--------------------PASCSSLSKTSSSSCSAHS--SFSS
:.:.:.. . : :.: . :: . . . :. :
CCDS86 WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620
pF1KA0 TGQPR-----GPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSAALGYKERMSYILKESSKSPKTMK
: :. ::::::. :::::::::::::::::::: ::: .: :::::::
CCDS86 HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLS-------KSPKTMK
460 470 480 490 500
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 KFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQ
:.: ::: :::::.::.. ::::::::::::::::::::::::. .: .:.
CCDS86 KLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQGTDLMH
510 520 530 540 550 560
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 VLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVYALKDEVRELKQENKRMKQCLEEELKSRR
CCDS86 NHVLADDDQPSLDSLGRRSSLSRLEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYRMGSTSRKSCCSYISH
570 580 590 600 610 620
>>CCDS9521.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 (646 aa)
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Smith-Waterman score: 2669; 62.9% identity (84.3% similar) in 645 aa overlap (155-762:1-638)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKG
::.:...::.:.:.:::.:::::::: ::
CCDS95 MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
10 20 30
190 200 210 220 230
pF1KA0 DIIYVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREIKSSERPLSPKA------VKGFETAPLT
:.:.::::::::::::::::::::::::::::.:.::.:.:::. :::.:. ..
CCDS95 DVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKGFDTTAIN
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 KNYYTVVLQNILDTEKEYAKELQSLLVTYLRPLQSNNNLSTVEVTSLLGNFEEVCTFQQT
:.::.:::::::.::.::.::::..: :::::::....::..... :.::.::.:.:::
CCDS95 KSYYNVVLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKLSSANISYLMGNLEEICSFQQM
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LCQALEECSKFPENQHKVGGCLLSLMPHFKSMYLAYCANHPSAVNVLTQHSDELEQFMEN
: :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:..::.:::::::::::::.::.:: .:::.
CCDS95 LVQSLEECTKLPEAQQRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAVNVLTEHSEELGEFMET
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 QGASSPGILILTTNLSKPFMRLEKYVTLLQELERHMEDTHPDHQDILKAIVAFKTLMGQC
.::::::::.:::.::::::::.:: :::.:::::::: : :.::: :...:::.: .::
CCDS95 KGASSPGILVLTTGLSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHTDRQDIQKSMAAFKNLSAQC
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 QDLRKRKQLELQILSEPIQAWEGEDIKNLGNVIFMSQVMVQYGACEEKEERYLMLFSNVL
:..::::.::::::.: :. :::.:::.:::: .::::..: .. :::.::::.:: :::
CCDS95 QEVRKRKELELQILTEAIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQVLIQCAGSEEKNERYLLLFPNVL
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 IMLSASPRMSGFIYQGKIPIAGTVVTRLDEIEGNDCTFEITGNTVERIVVHCNNNQDFQE
.::::::::::::::::.: .: ..:.:.. :.. .:::.:. .:::.: :::.::.::
CCDS95 LMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRNAFEISGSMIERILVSCNNQQDLQE
340 350 360 370 380 390
540 550 560 570
pF1KA0 WLEQLNRLIR----G--------------------PASCSSLSKTSSSSCSAHS--SFSS
:.:.:.. . : :.: . :: . . . :. :
CCDS95 WVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSKHADSKPAPLTPAYHTLPHPSH
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620
pF1KA0 TGQPR-----GPLEPPQIIKPWSLSCLRPAPPLRPSAALGYKERMSYILKESSKSPKTMK
: :. ::::::. :::::::::::::::::::: ::: . ::::::::
CCDS95 HGTPHTTINWGPLEPPKTPKPWSLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDL-------SKSPKTMK
460 470 480 490 500
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 KFLHKRKTERKPSEEEYVIRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSANFQQGHGSSTRKDSIPQ
:.: ::: :::::.::.. ::::::::::::::::::::::::. .: .::.::.: ::
CCDS95 KLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSSSRKESAPQ
510 520 530 540 550 560
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 VLLPEEEKLIIEETRSNGQTIMEEKSLVDTVYALKDEVRELKQENKRMKQCLEEELKSRR
::::::::.:.:::.:::::..::::::::::::::::.::.:.::.::. :::: ..:.
CCDS95 VLLPEEEKIIVEETKSNGQTVIEEKSLVDTVYALKDEVQELRQDNKKMKKSLEEEQRARK
570 580 590 600 610 620
750 760 770
pF1KA0 DLEKLVRRLLKQTDECIRGESSSKTSILP
:::::::..::. ..
CCDS95 DLEKLVRKVLKNMNDPAWDETNL
630 640
>>CCDS86361.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs109|chr13 (705 aa)
initn: 2715 init1: 1452 opt: 1867 Z-score: 1310.3 bits: 253.1 E(33420): 1.2e-66
Smith-Waterman score: 2396; 57.7% identity (76.3% similar) in 667 aa overlap (155-725:1-660)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LSAANTSQTNPQGAVSSTVSGLQRQSKTVEMTENGSHQLIVKARFNFKQTNEDELSVCKG
::.:...::.:.:.:::.:::::::: ::
CCDS86 MTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKG
10 20 30
190 200 210 220 230
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: :.::::.:.:: :..::::.:.:::..:..::.:::::::::::::.::.:: .:::.
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:..::::.::::::.: :. :::.:::.:::: .::::..: .. :::.::::.:: :::
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: :. ::::::. :::::::::::::::::::: ::: .: :::::::
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: : .::.: :::
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:::::::.:.:::.:::::..::::::::::::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]