Result of FASTA (omim) for
pFN21AB6345
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6345, 265 aa
1>>>pF1KB6345 265 - 265 aa - 265 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6812+/-0.000357; mu= 18.2513+/- 0.022
mean_var=62.3258+/-13.006, 0's: 0 Z-trim(113.3): 42 B-trim: 1240 in 1/54
Lambda= 0.162458
statistics sampled from 22517 (22559) to 22517 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 6.890
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001642 (OMIM: 600442) aquaporin-5 [Homo sapiens ( 265) 1702 407.4 1.4e-113
XP_005268895 (OMIM: 600442) PREDICTED: aquaporin-5 ( 222) 1304 314.0 1.5e-85
NP_000477 (OMIM: 107777,125800) aquaporin-2 [Homo ( 271) 1158 279.9 3.5e-75
NP_001643 (OMIM: 601383) aquaporin-6 [Homo sapiens ( 282) 954 232.1 8.8e-61
NP_036196 (OMIM: 154050,615274) lens fiber major i ( 263) 942 229.2 5.9e-60
NP_004019 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M23 [ ( 301) 796 195.1 1.3e-49
XP_011524244 (OMIM: 600308) PREDICTED: aquaporin-4 ( 316) 796 195.1 1.3e-49
NP_001641 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 [H ( 323) 796 195.1 1.4e-49
NP_001304313 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 ( 352) 796 195.1 1.5e-49
NP_932766 (OMIM: 107776,110450) aquaporin-1 isofor ( 269) 751 184.5 1.8e-46
NP_001316801 (OMIM: 107776,110450) aquaporin-1 iso ( 323) 747 183.6 3.9e-46
NP_001304316 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform de ( 296) 576 143.5 4.3e-34
XP_016874795 (OMIM: 154050,615274) PREDICTED: lens ( 144) 459 115.8 4.4e-26
XP_011536656 (OMIM: 154050,615274) PREDICTED: lens ( 168) 459 115.9 5e-26
NP_001160 (OMIM: 603750) aquaporin-8 [Homo sapiens ( 261) 448 113.4 4.2e-25
XP_011544124 (OMIM: 603750) PREDICTED: aquaporin-8 ( 262) 448 113.4 4.2e-25
NP_001307564 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 2 ( 193) 217 59.2 6.6e-09
NP_066190 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 1 [Ho ( 295) 217 59.3 9.1e-09
NP_001305073 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 iso ( 237) 214 58.6 1.3e-08
XP_011544125 (OMIM: 603750) PREDICTED: aquaporin-8 ( 148) 210 57.5 1.7e-08
NP_004916 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 isofor ( 292) 212 58.2 2e-08
XP_016870191 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 166 47.3 3.2e-05
XP_016870192 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 166 47.3 3.2e-05
XP_016870194 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 166 47.3 3.2e-05
XP_016870190 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 166 47.3 3.2e-05
XP_016870193 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 166 47.3 3.2e-05
NP_001307565 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 3 ( 230) 164 46.8 4.1e-05
NP_001305086 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 256) 163 46.6 5.3e-05
NP_001305087 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 257) 163 46.6 5.3e-05
XP_016870189 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 341) 163 46.7 6.5e-05
NP_001161 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 isofor ( 342) 163 46.7 6.6e-05
XP_005251510 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 342) 163 46.7 6.6e-05
XP_011516168 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 342) 163 46.7 6.6e-05
NP_536354 (OMIM: 606578) aquaporin-10 [Homo sapien ( 301) 145 42.5 0.0011
XP_011508406 (OMIM: 606578) PREDICTED: aquaporin-1 ( 302) 133 39.7 0.0078
>>NP_001642 (OMIM: 600442) aquaporin-5 [Homo sapiens] (265 aa)
initn: 1702 init1: 1702 opt: 1702 Z-score: 2160.1 bits: 407.4 E(85289): 1.4e-113
Smith-Waterman score: 1702; 100.0% identity (100.0% similar) in 265 aa overlap (1-265:1-265)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
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NP_001 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KB6 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
:::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
250 260
>>XP_005268895 (OMIM: 600442) PREDICTED: aquaporin-5 iso (222 aa)
initn: 1304 init1: 1304 opt: 1304 Z-score: 1657.0 bits: 314.0 E(85289): 1.5e-85
Smith-Waterman score: 1304; 100.0% identity (100.0% similar) in 204 aa overlap (1-204:1-204)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
::::::::::::::::::::::::
XP_005 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWGLLLSLRGGDTRSVHPSL
190 200 210 220
>>NP_000477 (OMIM: 107777,125800) aquaporin-2 [Homo sapi (271 aa)
initn: 1170 init1: 892 opt: 1158 Z-score: 1470.8 bits: 279.9 E(85289): 3.5e-75
Smith-Waterman score: 1158; 66.0% identity (90.3% similar) in 259 aa overlap (4-262:3-259)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
:. :.:: .::::::::::.::::::::::.::.:::..::::.::::.::::.:::
NP_000 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVLQIAMAFGLGIGTLVQAL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
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NP_000 GHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
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NP_000 ALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
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NP_000 GCSMNPARSLAPAVVTGKFDD-HWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLK
180 190 200 210 220 230
250 260
pF1KB6 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
: ::: ::::.. .:....::
NP_000 GL-EPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
240 250 260 270
>>NP_001643 (OMIM: 601383) aquaporin-6 [Homo sapiens] (282 aa)
initn: 955 init1: 564 opt: 954 Z-score: 1212.2 bits: 232.1 E(85289): 8.8e-61
Smith-Waterman score: 954; 58.5% identity (88.1% similar) in 236 aa overlap (9-244:22-254)
10 20 30 40
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIAL
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NP_001 MDAVEPGGRGWASMLACRLWKAISRALFAEFLATGLYVFFGVGSVMRWPTALPSVLQIAI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 AFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYG
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NP_001 TFNLVTAMAVQVTWKASGAHANPAVTLAFLVGSHISLPRAVAYVAAQLVGATVGAALLYG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 VAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGL
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NP_001 VMPGDIRETLGINVVRNSVSTGQAVAVELLLTLQLVLCVFASTDSRQTS--GSPATMIGI
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 SVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFP
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NP_001 SVALGHLIGIHFTGCSMNPARSFGPAIIIGKFT-VHWVFWVGPLMGALLASLIYNFVLFP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KB6 NSLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
.. .:..:.::. :: :
NP_001 DTKTLAQRLAILTGTVEVGTGAGAGAEPLKKESQPGSGAVEMESV
240 250 260 270 280
>>NP_036196 (OMIM: 154050,615274) lens fiber major intri (263 aa)
initn: 949 init1: 744 opt: 942 Z-score: 1197.4 bits: 229.2 E(85289): 5.9e-60
Smith-Waterman score: 942; 54.0% identity (85.6% similar) in 263 aa overlap (4-265:3-261)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKW-PSALPTILQIALAFGLAIGTLAQA
:. :..: .:.::::.:::..:::::::.:.: :. : .::.:.:::::..::.:.
NP_036 MWELRSASFWRAIFAEFFATLFYVFFGLGSSLRWAPGPLH-VLQVAMAFGLALATLVQS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAV
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NP_036 VGHISGAHVNPAVTFAFLVGSQMSLLRAFCYMAAQLLGAVAGAAVLYSVTPPAVRGNLAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 NALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYF
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NP_036 NTLHPAVSVGQATTVEIFLTLQFVLCIFATYDERRNGQLGSVALAVGFSLALGHLFGMYY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAII
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NP_036 TGAGMNPARSFAPAILTGNFT-NHWVYWVGPIIGGGLGSLLYDFLLFPRLKSISERLSVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KB6 KGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
::. .:: . . : : . .::.:.
NP_036 KGA-KPDVS-NGQPEVTGEPVELNTQAL
240 250 260
>>NP_004019 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M23 [Homo (301 aa)
initn: 806 init1: 555 opt: 796 Z-score: 1011.7 bits: 195.1 E(85289): 1.3e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:5-266)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSA---LPT-ILQIALAFGLAIG
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NP_004 MVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWGGTEKPLPVDMVLISLCFGLSIA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 TLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNAR
:..: .: .::::::::.:.:.. .::. .. ::.::: .::: :::::: :.: ..
NP_004 TMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIAAQCLGAIIGAGILYLVTPPSVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHL
:.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::.::. .:: ::.::.::..:::
NP_004 GGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDSKRTDVTGSIALAIGFSVAIGHL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB6 VGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPN------
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NP_004 FAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWE-NHWIYWVGPIIGAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRR
190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KB6 -SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
. ..:. . ::.: :: . : :
NP_004 FKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVHVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLS
240 250 260 270 280 290
>>XP_011524244 (OMIM: 600308) PREDICTED: aquaporin-4 iso (316 aa)
initn: 806 init1: 555 opt: 796 Z-score: 1011.4 bits: 195.1 E(85289): 1.3e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:20-281)
10 20 30 40
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSA---LP
: : . :: ::: ::::: ::::...:::...: .. ::
XP_011 MFEIKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWGGTEKPLP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 T-ILQIALAFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAI
. .. :.: :::.:.:..: .: .::::::::.:.:.. .::. .. ::.::: .:::
XP_011 VDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIAAQCLGAI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 AGAGILYGVAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVG
:::::: :.: .. :.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::.::. .:
XP_011 IGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDSKRTDVTG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 SPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAI
: ::.::.::..::: .: .:: ::::::::::::.:. . ::..:::::.:::::.
XP_011 SIALAIGFSVAIGHLFAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWE-NHWIYWVGPIIGAVLAGG
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB6 LYFYLLFPN-------SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
:: :.. :. . ..:. . ::.: :: . : :
XP_011 LYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVHVIDVDR
240 250 260 270 280 290
XP_011 GEEKKGKDQSGEVLSSV
300 310
>>NP_001641 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 [Homo (323 aa)
initn: 806 init1: 555 opt: 796 Z-score: 1011.3 bits: 195.1 E(85289): 1.4e-49
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10 20 30
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: : . :: ::: ::::: ::::...:::...:
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40 50 60 70 80 90
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.. ::. .. :.: :::.:.:..: .: .::::::::.:.:.. .::. .. ::.:
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:: .::: :::::: :.: .. :.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::
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:::::. :: :.. :. . ..:. . ::.: :: . : :
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>>NP_001304313 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1x [H (352 aa)
initn: 806 init1: 555 opt: 796 Z-score: 1010.8 bits: 195.1 E(85289): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:27-288)
10 20 30
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWP
: : . :: ::: ::::: ::::...:::...:
NP_001 MSDRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWG
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160 170 180 190 200 210
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.::. .:: ::.::.::..::: .: .:: ::::::::::::.:. . ::..:::::.
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300 310 320 330 340 350
>>NP_932766 (OMIM: 107776,110450) aquaporin-1 isoform 1 (269 aa)
initn: 742 init1: 524 opt: 751 Z-score: 955.4 bits: 184.5 E(85289): 1.8e-46
Smith-Waterman score: 751; 46.6% identity (77.2% similar) in 268 aa overlap (1-257:1-267)
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NP_932 MASEFKKKLFWRAVVAEFLATTLFVFISIGSALGFKYPVGNNQTAVQDNVKVSLAFGLSI
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NP_932 ATLAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISIFRALMYIIAQCVGAIVATAILSGITSSLT
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NP_932 GNSLGRNDLADGVNSGQGLGIEIIGTLQLVLCVLATTDRRRRDLGGSAPLAIGLSVALGH
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pF1KB6 ERVAI-IKGT---YEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
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NP_932 DRVKVWTSGQVEEYDLDADDINSRVEMKPK
240 250 260
265 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 22:46:49 2016 done: Fri Nov 4 22:46:50 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]