Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8471
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8471, 912 aa
1>>>pF1KB8471 912 - 912 aa - 912 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4737+/-0.000861; mu= 14.2169+/- 0.052
mean_var=184.6280+/-36.629, 0's: 0 Z-trim(113.8): 27 B-trim: 159 in 1/52
Lambda= 0.094390
statistics sampled from 14368 (14392) to 14368 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.442), width: 16
Scan time: 5.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33157.1 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 ( 912) 6390 883.0 0
CCDS1718.2 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 ( 723) 4928 683.8 3.1e-196
CCDS13205.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 853) 2711 381.9 2.7e-105
CCDS13206.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 833) 2391 338.4 3.4e-92
CCDS13204.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 845) 2391 338.4 3.5e-92
CCDS56184.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 694) 1788 256.2 1.6e-67
CCDS56183.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 728) 1788 256.2 1.6e-67
CCDS13207.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 770) 1788 256.2 1.7e-67
CCDS46232.1 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 ( 166) 1023 151.4 1.3e-36
CCDS46650.1 DNMT3L gene_id:29947|Hs108|chr21 ( 386) 650 101.0 4.7e-21
CCDS13705.1 DNMT3L gene_id:29947|Hs108|chr21 ( 387) 650 101.0 4.7e-21
>>CCDS33157.1 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 (912 aa)
initn: 6390 init1: 6390 opt: 6390 Z-score: 4711.2 bits: 883.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6390; 100.0% identity (100.0% similar) in 912 aa overlap (1-912:1-912)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPAMPSSGPGDTSSSAAEREEDRKDGEEQEEPRGKEERQEPSTTARKVGRPGRKRKHPPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MPAMPSSGPGDTSSSAAEREEDRKDGEEQEEPRGKEERQEPSTTARKVGRPGRKRKHPPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASELLPNGDLEKRSEPQPEEGSPAGGQKGGAPAEGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASELLPNGDLEKRSEPQPEEGSPAGGQKGGAPAEGEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMKMEGSRGRLRGGLGWESSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMKMEGSRGRLRGGLGWESSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EASPPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EASPPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 KQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 GLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 YEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTIC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 CGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRRED
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 WPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 IASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPAR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 KGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 DAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 KQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRH
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB8 LFAPLKEYFACV
::::::::::::
CCDS33 LFAPLKEYFACV
910
>>CCDS1718.2 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 (723 aa)
initn: 4928 init1: 4928 opt: 4928 Z-score: 3636.5 bits: 683.8 E(32554): 3.1e-196
Smith-Waterman score: 4928; 100.0% identity (100.0% similar) in 699 aa overlap (214-912:25-723)
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVEEAS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MGILERVVRRNGRVDRSLKDECDTAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVEEAS
10 20 30 40 50
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 PPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGF
60 70 80 90 100 110
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQP
120 130 140 150 160 170
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 MYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLE
180 190 200 210 220 230
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEV
240 250 260 270 280 290
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 RQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGG
300 310 320 330 340 350
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 REVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 REVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPS
360 370 380 390 400 410
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIAS
420 430 440 450 460 470
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGL
480 490 500 510 520 530
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 YEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 YEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAK
540 550 560 570 580 590
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 EVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQG
600 610 620 630 640 650
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 KDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 KDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFA
660 670 680 690 700 710
910
pF1KB8 PLKEYFACV
:::::::::
CCDS17 PLKEYFACV
720
>>CCDS13205.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 (853 aa)
initn: 2812 init1: 2281 opt: 2711 Z-score: 2004.0 bits: 381.9 E(32554): 2.7e-105
Smith-Waterman score: 2802; 51.0% identity (71.9% similar) in 861 aa overlap (80-911:12-852)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 RPGRKRKHPPVESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASE--LLPNGDLEKRSEPQPE--EG-
.:.:. : .: :: .: .: :.
CCDS13 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAI
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 -SPA-GGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMK
.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
CCDS13 RTPEIRGRRSSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPV-MPKLFRETRTRS--
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 MEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIA
:. : :.. . : :.:: :: : .... :. : : ...: . :
CCDS13 -ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASA
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB8 GMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAG
: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
CCDS13 G---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 DDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSV
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
CCDS13 GDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSE
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 VCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKA
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .:.
CCDS13 VSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP----SSPGDS---
280 290 300 310 320
400 410 420 430 440
pF1KB8 VEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEP----PEEEKNPYK------------EVYTDMWVE
.: : :::.::: :::.:.: .::.: : .:. . : : .
CCDS13 LEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKPNNTQPVVNKSKVRRAGSRKLESRKYENKTRRRTA
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 PEAAA--YAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSL
..:. : : : : . : . : ...::... .: .. ..:: :.:::
CCDS13 DDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRK
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 NVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCV
: . :::: ::.::.:.. ::: :.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::
CCDS13 NPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCV
450 460 470 480 490 500
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 ECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPP
::...::: :.: : ..::.:::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. :
CCDS13 ECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAP
510 520 530 540 550 560
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 KVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGK
:.:: .:: .:.:::::::::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.
CCDS13 KLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGN
570 580 590 600 610 620
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 IMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHD
: ::.:::..:.:.:.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::.
CCDS13 IKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNY
630 640 650 660 670 680
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 ARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPG
.::::::::::::.::::::: :.:::::::::: ::::::: .::::::::::::::::
CCDS13 SRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPG
690 700 710 720 730 740
810 820 830 840 850 860
pF1KB8 MNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILW
::::. .. :::::::.:::..::::..::.::::.::::::::.: ::: :: :::.::
CCDS13 MNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKLKKVQTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLW
750 760 770 780 790 800
870 880 890 900 910
pF1KB8 CTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
:::.::.:::::::::::::.: :::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS13 CTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
810 820 830 840 850
>>CCDS13206.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 (833 aa)
initn: 2711 init1: 2281 opt: 2391 Z-score: 1768.6 bits: 338.4 E(32554): 3.4e-92
Smith-Waterman score: 2832; 51.6% identity (73.2% similar) in 843 aa overlap (80-911:12-832)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 RPGRKRKHPPVESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASE--LLPNGDLEKRSEPQPE--EG-
.:.:. : .: :: .: .: :.
CCDS13 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAI
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 -SPA-GGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMK
.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
CCDS13 RTPEIRGRRSSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPV-MPKLFRETRTRS--
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 MEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIA
:. : :.. . : :.:: :: : .... :. : : ...: . :
CCDS13 -ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASA
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB8 GMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAG
: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
CCDS13 G---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 DDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSV
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
CCDS13 GDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSE
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 VCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKA
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .:.
CCDS13 VSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP----SSPGDS---
280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 VEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPR
.: : :::.::: :::.:.: .::.: .. .: ... . .. : : : :
CCDS13 LEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKP--NNTQPENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTN
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 KSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCK
. : . : ...::... .: .. ..:: :.::: : . :::: ::.::.:.
CCDS13 CYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCR
390 400 410 420 430
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 NCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKE
. ::: :.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::::...::: :.: : .
CCDS13 DRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQ
440 450 460 470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 DPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLS
.::.:::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. ::.:: .:: .:.::::::
CCDS13 EPWSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLS
500 510 520 530 540 550
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 LFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEW
:::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.: ::.:::..:.:.:.::
CCDS13 LFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEW
560 570 580 590 600 610
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 GPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENV
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::. .::::::::::::.::::
CCDS13 GPFDLVIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENV
620 630 640 650 660 670
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 VAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQEC
::: :.:::::::::: ::::::: .::::::::::::::::::::. .. :::::::.:
CCDS13 VAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDC
680 690 700 710 720 730
820 830 840 850 860 870
pF1KB8 LEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVS
::..::::..::.::::.::::::::.: ::: :: :::.:::::.::.:::::::::::
CCDS13 LEYNRIAKLKKVQTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWCTELERIFGFPVHYTDVS
740 750 760 770 780 790
880 890 900 910
pF1KB8 NMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
::.: :::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS13 NMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
800 810 820 830
>>CCDS13204.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 (845 aa)
initn: 2711 init1: 2281 opt: 2391 Z-score: 1768.5 bits: 338.4 E(32554): 3.5e-92
Smith-Waterman score: 2832; 51.6% identity (73.2% similar) in 843 aa overlap (80-911:24-844)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 RPGRKRKHPPVESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASE--LLPNGDLEKRSEPQPE--EG-
.:.:. : .: :: .: .: :.
CCDS13 MEPSPEPPSLESMKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAI
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 -SPA-GGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMK
.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
CCDS13 RTPEIRGRRSSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPV-MPKLFRETRTRS--
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 MEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIA
:. : :.. . : :.:: :: : .... :. : : ...: . :
CCDS13 -ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASA
120 130 140 150 160
230 240 250 260 270
pF1KB8 GMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAG
: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
CCDS13 G---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGD
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 DDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSV
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
CCDS13 GDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSE
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 VCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKA
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .:.
CCDS13 VSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP----SSPGDS---
290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 VEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPR
.: : :::.::: :::.:.: .::.: .. .: ... . .. : : : :
CCDS13 LEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKP--NNTQPENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTN
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 KSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCK
. : . : ...::... .: .. ..:: :.::: : . :::: ::.::.:.
CCDS13 CYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCR
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 NCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKE
. ::: :.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::::...::: :.: : .
CCDS13 DRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQ
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 DPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLS
.::.:::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. ::.:: .:: .:.::::::
CCDS13 EPWSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLS
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 LFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEW
:::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.: ::.:::..:.:.:.::
CCDS13 LFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEW
580 590 600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 GPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENV
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::. .::::::::::::.::::
CCDS13 GPFDLVIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENV
640 650 660 670 680 690
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 VAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQEC
::: :.:::::::::: ::::::: .::::::::::::::::::::. .. :::::::.:
CCDS13 VAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDC
700 710 720 730 740 750
820 830 840 850 860 870
pF1KB8 LEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVS
::..::::..::.::::.::::::::.: ::: :: :::.:::::.::.:::::::::::
CCDS13 LEYNRIAKLKKVQTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWCTELERIFGFPVHYTDVS
760 770 780 790 800 810
880 890 900 910
pF1KB8 NMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
::.: :::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS13 NMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
820 830 840
>>CCDS56184.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 (694 aa)
initn: 2108 init1: 1678 opt: 1788 Z-score: 1325.8 bits: 256.2 E(32554): 1.6e-67
Smith-Waterman score: 2373; 48.3% identity (67.1% similar) in 778 aa overlap (134-911:24-693)
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 GSPAGGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMKM
:: :. . . . : . . : . .
CCDS56 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAIRTPEIRGRRSSS
10 20 30 40 50
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 EGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAG
. :. .. . :.. .:::.: : .:: : : . .:
CCDS56 RLSKREVSSLLSYTQSLRRRA----TASAGTP--------------WPSPPSSYL-TIDL
60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 MNAVEENQGPGESQKVEEASPPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPE
. .:...: .: .: : .. : . . . :. : .:.:: : :
CCDS56 TDDTEDTHGTPQS-----SSTPYARLAQDSQQGGMES-PQ-VEADSGD-------GDSSE
100 110 120 130 140
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 YEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEK
:.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.:::::::: : ..:
CCDS56 YQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSEVSADK
150 160 170 180 190 200
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 LMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVEVQN
:. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. . ..: :
CCDS56 LVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP-------SSPGDSLEDQL
210 220 230 240 250
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 KPMIEWALGGFQPSGPKGLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAE
:::.::: :::.:.: .::.: .. .: ... . .. : : : : .
CCDS56 KPMLEWAHGGFKPTGIEGLKP--NNTQPENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNG
260 270 280 290 300 310
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 KPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLE
: . : ...::... .: .. ..:: :.::: : . :::: ::.::.:.. :::
CCDS56 KDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLE
320 330 340 350 360
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 CAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNC
:.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::::...::: :.: : ..::.:
CCDS56 LFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSC
370 380 390 400 410 420
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 YMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGI
::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. ::.:: .:: .:.:::::::::::
CCDS56 YMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGI
430 440 450 460 470 480
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 ATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDL
::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.: ::.:::..:.:.:.:::::::
CCDS56 ATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDL
490 500 510 520 530 540
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 VIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGV
::::::::::: ::::::::::::::::::::.::. .::::::::::::.::::::: :
CCDS56 VIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKV
550 560 570 580 590 600
770 780 790 800 810 820
pF1KB8 SDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGR
.:::::::::: ::::::: .:::::::::::::::::::
CCDS56 GDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNR--------------------
610 620 630 640
830 840 850 860 870 880
pF1KB8 IAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRL
.:::::::::::::.:
CCDS56 -------------------------------------------IFGFPVHYTDVSNMGRG
650 660
890 900 910
pF1KB8 ARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
:::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS56 ARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
670 680 690
>>CCDS56183.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 (728 aa)
initn: 2108 init1: 1678 opt: 1788 Z-score: 1325.5 bits: 256.2 E(32554): 1.6e-67
Smith-Waterman score: 2371; 53.2% identity (71.5% similar) in 664 aa overlap (250-911:139-727)
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 VIAGMNAVEENQGPGESQKVEEASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKA
: . ..: .: . : .. . .: ..
CCDS56 TASAGTPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSG
110 120 130 140 150 160
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFS
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
CCDS56 DGDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFS
170 180 190 200 210 220
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 VVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAK
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .
CCDS56 EVSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP-------SSPGD
230 240 250 260 270 280
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 AVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKP
..: : :::.::: :::.:.: .::.: .. .: ... . .. : : : :
CCDS56 SLEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKP--NNTQPENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKT
290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 RKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNC
. : . : ...::... .: .. ..:: :.::: : . :::: ::.::.:
CCDS56 NCYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTC
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 KNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIK
.. ::: :.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::::...::: :.: :
CCDS56 RDRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKL
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 EDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVL
..::.:::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. ::.:: .:: .:.:::::
CCDS56 QEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVL
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 SLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQE
::::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.: ::.:::..:.:.:.:
CCDS56 SLFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEE
520 530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 WGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFEN
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::. .::::::::::::.:::
CCDS56 WGPFDLVIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFEN
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 VVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQE
:::: :.:::::::::: ::::::: .:::::::::::::::::::
CCDS56 VVAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNR--------------
640 650 660 670 680
820 830 840 850 860 870
pF1KB8 CLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDV
.::::::::::
CCDS56 -------------------------------------------------IFGFPVHYTDV
690
880 890 900 910
pF1KB8 SNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
:::.: :::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS56 SNMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
700 710 720
>>CCDS13207.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 (770 aa)
initn: 2108 init1: 1678 opt: 1788 Z-score: 1325.2 bits: 256.2 E(32554): 1.7e-67
Smith-Waterman score: 2383; 46.3% identity (66.3% similar) in 843 aa overlap (80-911:12-769)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 RPGRKRKHPPVESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASE--LLPNGDLEKRSEPQPE--EG-
.:.:. : .: :: .: .: :.
CCDS13 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAI
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 -SPA-GGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMK
.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
CCDS13 RTPEIRGRRSSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPV-MPKLFRETRTRS--
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 MEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIA
:. : :.. . : :.:: :: : .... :. : : ...: . :
CCDS13 -ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASA
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB8 GMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAG
: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
CCDS13 G---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 DDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSV
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
CCDS13 GDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSE
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 VCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKA
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .:.
CCDS13 VSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP----SSPGDS---
280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 VEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPR
.: : :::.::: :::.:.: .::.: .. .: ... . .. : : : :
CCDS13 LEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKP--NNTQPENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTN
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 KSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCK
. : . : ...::... .: .. ..:: :.::: : . :::: ::.::.:.
CCDS13 CYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCR
390 400 410 420 430
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 NCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKE
. ::: :.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::::...::: :.: : .
CCDS13 DRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQ
440 450 460 470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 DPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLS
.::.:::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. ::.:: .:: .:.::::::
CCDS13 EPWSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLS
500 510 520 530 540 550
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 LFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEW
:::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.: ::.:::..:.:.:.::
CCDS13 LFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEW
560 570 580 590 600 610
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 GPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENV
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::. .::::::::::::.::::
CCDS13 GPFDLVIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENV
620 630 640 650 660 670
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 VAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQEC
::: :.:::::::::: ::::::: .:::::::::::::::::::
CCDS13 VAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNR---------------
680 690 700 710 720
820 830 840 850 860 870
pF1KB8 LEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVS
.:::::::::::
CCDS13 ------------------------------------------------IFGFPVHYTDVS
730
880 890 900 910
pF1KB8 NMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
::.: :::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS13 NMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
740 750 760 770
>>CCDS46232.1 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 (166 aa)
initn: 1057 init1: 1023 opt: 1023 Z-score: 770.7 bits: 151.4 E(32554): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 1023; 99.3% identity (100.0% similar) in 151 aa overlap (1-151:1-151)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPAMPSSGPGDTSSSAAEREEDRKDGEEQEEPRGKEERQEPSTTARKVGRPGRKRKHPPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MPAMPSSGPGDTSSSAAEREEDRKDGEEQEEPRGKEERQEPSTTARKVGRPGRKRKHPPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASELLPNGDLEKRSEPQPEEGSPAGGQKGGAPAEGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASELLPNGDLEKRSEPQPEEGSPAGGQKGGAPAEGEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMKMEGSRGRLRGGLGWESSL
::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS46 AAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGESSAPGAASSGPTSIP
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVE
>>CCDS46650.1 DNMT3L gene_id:29947|Hs108|chr21 (386 aa)
initn: 958 init1: 565 opt: 650 Z-score: 491.5 bits: 101.0 E(32554): 4.7e-21
Smith-Waterman score: 885; 40.8% identity (66.0% similar) in 341 aa overlap (476-815:35-345)
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 AAYAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLE
:. ..:::. . :::::::: ::::.: .
CCDS46 PALDPEAEPSMDVILVGSSELSSSVSPGTGRDLIAYEVKANQRNIEDICICCGSLQVHTQ
10 20 30 40 50 60
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 HPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDL
:::: ::.: ::. ::. . ::::::::::.:::.:. .:.::: .: ::.: ::::
CCDS46 HPLFEGGICAPCKDKFLDALFLYDDDGYQSYCSICCSGETLLICGNPDCTRCYCFECVDS
70 80 90 100 110 120
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 LVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPP
:::::.. . . : ::.: .. :::.::. : :.:. :. ....: .: ...
CCDS46 LVGPGTSGKVHAMSNWVCYLCLPSSRSGLLQRRRKWRSQLKAFY--DRESE-NPLEMFET
130 140 150 160 170 180
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 VPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVG
::. .:.:.::::::. : : .::. :.. :...: :
CCDS46 VPVWRRQPVRVLSLFEDIKKEL---TSLGFL----------ESGSDPGQLKH------VV
190 200 210 220
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 DVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKE
:: ....: ..:::::::: :..: : . . . .:.:.:::. ::::
CCDS46 DVTDTVRKDVEEWGPFDLVYGATP--------PLGHTCDRPPSWYLFQFHRLLQYARPKP
230 240 250 260 270
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 GDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPGM-NRP
:. :::::.: . .... : ::::: .:: : . .. . : :.:.:.. .:
CCDS46 GSPRPFFWMFVDNLVLNKEDLDVASRFLEMEPVTIPDVHGGSLQNAVRVWSNIPAIRSRH
280 290 300 310 320 330
810 820 830 840 850 860
pF1KB8 LASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEM
: . ...: :
CCDS46 WALVSEEELSLLAQNKQSSKLAAKWPTKLVKNCFLPLREYFKYFSTELTSSL
340 350 360 370 380
912 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 17:50:04 2016 done: Sat Nov 5 17:50:05 2016
Total Scan time: 5.020 Total Display time: 0.280
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]