Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB0940
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0940, 390 aa
1>>>pF1KB0940 390 - 390 aa - 390 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4522+/-0.000832; mu= 13.3715+/- 0.051
mean_var=136.6964+/-28.460, 0's: 0 Z-trim(111.6): 65 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.109697
statistics sampled from 12454 (12519) to 12454 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.385), width: 16
Scan time: 3.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2 ( 390) 2740 444.8 6e-125
CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 394) 2377 387.4 1.2e-107
CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 381) 2284 372.7 3.2e-103
CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 470) 2250 367.4 1.5e-101
CCDS45217.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 401) 2074 339.5 3.3e-93
CCDS10044.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 477) 2074 339.5 3.7e-93
CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 388) 1981 324.7 8.7e-89
CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 306) 1879 308.5 5.3e-84
CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 375) 1648 272.0 6.2e-73
CCDS33064.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 421) 1191 199.7 4e-51
CCDS46132.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 358) 994 168.5 8.6e-42
CCDS13692.1 PKNOX1 gene_id:5316|Hs108|chr21 ( 436) 443 81.4 1.8e-15
CCDS41730.1 PKNOX2 gene_id:63876|Hs108|chr11 ( 472) 386 72.4 9.7e-13
CCDS68211.1 PKNOX1 gene_id:5316|Hs108|chr21 ( 319) 375 70.5 2.5e-12
>>CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2 (390 aa)
initn: 2740 init1: 2740 opt: 2740 Z-score: 2356.6 bits: 444.8 E(32554): 6e-125
Smith-Waterman score: 2740; 100.0% identity (100.0% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAQRYDDLPHYGGMDGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQYPHTAHTNAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAQRYDDLPHYGGMDGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQYPHTAHTNAMA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 PSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSESFNED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSESFNED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 IAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLKGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 MPIDLVIDDREGGSKSDSEDITRSANLTDQPSWNRDHDDTASTRSGGTPGPSSGGHTSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MPIDLVIDDREGGSKSDSEDITRSANLTDQPSWNRDHDDTASTRSGGTPGPSSGGHTSHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 GDNSSEQGDGLDNSVASPSTGDDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLTHPYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GDNSSEQGDGLDNSVASPSTGDDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLTHPYP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 SEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNPDGQPMGGFVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNPDGQPMGGFVM
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB0 DGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
370 380 390
>>CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (394 aa)
initn: 1443 init1: 1141 opt: 2377 Z-score: 2046.1 bits: 387.4 E(32554): 1.2e-107
Smith-Waterman score: 2377; 85.8% identity (94.9% similar) in 394 aa overlap (1-390:1-394)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQRYDDLPHYGGMDGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQY--PHTAHTNA
::::::.:::::::::::.:..::::::: : . ::::::::::::. :. :. : :.
CCDS45 MAQRYDELPHYGGMDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPNV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 MAPSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSESFN
: ::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS45 MPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSDSFN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 EDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 GKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDIT-RSANLTDQ-PSWNRDHDDTASTRSGGTPGPSSGGH
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CCDS45 GKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDATSTHSAGTPGPSSGGH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 TSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTGDDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
.:.:::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS45 ASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTGDDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNPDGQPMG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:::::
CCDS45 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSPEGQPMG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KB0 GFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
.::.::::::::: ::::::::::::.::::::
CCDS45 SFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
370 380 390
>>CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (381 aa)
initn: 1350 init1: 1141 opt: 2284 Z-score: 1966.7 bits: 372.7 E(32554): 3.2e-103
Smith-Waterman score: 2284; 85.6% identity (94.8% similar) in 381 aa overlap (14-390:1-381)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQRYDDLPHYGGMDGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQY--PHTAHTNA
:::::.:..::::::: : . ::::::::::::. :. :. : :.
CCDS42 MDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPNV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 MAPSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSESFN
: ::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS42 MPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSDSFN
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 EDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 GKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDIT-RSANLTDQ-PSWNRDHDDTASTRSGGTPGPSSGGH
::::::::::.:.:.:::: :... :.::.:. :: :::::..::.:.::::::::::
CCDS42 GKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDATSTHSAGTPGPSSGGH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 TSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTGDDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
.:.:::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS42 ASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTGDDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNPDGQPMG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:::::
CCDS42 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSPEGQPMG
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB0 GFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
.::.::::::::: ::::::::::::.::::::
CCDS42 SFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
350 360 370 380
>>CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (470 aa)
initn: 2273 init1: 1004 opt: 2250 Z-score: 1936.5 bits: 367.4 E(32554): 1.5e-101
Smith-Waterman score: 2250; 83.0% identity (92.6% similar) in 393 aa overlap (1-383:1-393)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQRYDDLPHYGGMDGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQY--PHTAHTNA
::::::.:::::::::::.:..::::::: : . ::::::::::::. :. :. : :.
CCDS10 MAQRYDELPHYGGMDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPNV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 MAPSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSESFN
: ::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS10 MPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSDSFN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 EDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 GKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDIT-RSANLTDQ-PSWNRDHDDTASTRSGGTPGPSSGGH
::::::::::.:.:.:::: :... :.::.:. :: :::::..::.:.::::::::::
CCDS10 GKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDATSTHSAGTPGPSSGGH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 TSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTGDDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
.:.:::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTGDDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNPDGQPMG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:::::
CCDS10 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSPEGQPMG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KB0 GFVMDGQQHMGIRA------PGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
.::.::::::::: :: . ..: :::
CCDS10 SFVLDGQQHMGIRPAGLQSMPGDYVSQGGPMGMSMAQPSYTPPQMTPHPTQLRHGPPMHS
370 380 390 400 410 420
CCDS10 YLPSHPHHPAMMMHGGPPTHPGMTMSAQSPTMLNSVDPNVGGQVMDIHAQ
430 440 450 460 470
>>CCDS45217.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (401 aa)
initn: 1548 init1: 947 opt: 2074 Z-score: 1786.8 bits: 339.5 E(32554): 3.3e-93
Smith-Waterman score: 2353; 84.3% identity (93.3% similar) in 401 aa overlap (1-390:1-401)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQRYDDLPHYGGMDGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQY--PHTAHTNA
::::::.:::::::::::.:..::::::: : . ::::::::::::. :. :. : :.
CCDS45 MAQRYDELPHYGGMDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPNV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 MAPSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSESFN
: ::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS45 MPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSDSFN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 EDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 GKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDIT-RSANLTDQ-PSWNRDHDDTASTRSGGTPGPSSGGH
::::::::::.:.:.:::: :... :.::.:. :: :::::..::.:.::::::::::
CCDS45 GKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDATSTHSAGTPGPSSGGH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 TSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTGDDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
.:.:::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS45 ASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTGDDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB0 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRA-------VSQGTPYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. :.
CCDS45 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAGFLLDPSVSQGAAYS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KB0 PDGQPMGGFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
:.:::::.::.::::::::: ::::::::::::.::::::
CCDS45 PEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
370 380 390 400
>>CCDS10044.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (477 aa)
initn: 1444 init1: 947 opt: 2074 Z-score: 1785.9 bits: 339.5 E(32554): 3.7e-93
Smith-Waterman score: 2226; 81.5% identity (91.0% similar) in 400 aa overlap (1-383:1-400)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQRYDDLPHYGGMDGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQY--PHTAHTNA
::::::.:::::::::::.:..::::::: : . ::::::::::::. :. :. : :.
CCDS10 MAQRYDELPHYGGMDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPNV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 MAPSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSESFN
: ::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS10 MPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSDSFN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 EDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 GKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDIT-RSANLTDQ-PSWNRDHDDTASTRSGGTPGPSSGGH
::::::::::.:.:.:::: :... :.::.:. :: :::::..::.:.::::::::::
CCDS10 GKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDATSTHSAGTPGPSSGGH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 TSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTGDDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
.:.:::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTGDDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB0 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRA-------VSQGTPYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. :.
CCDS10 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAGFLLDPSVSQGAAYS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KB0 PDGQPMGGFVMDGQQHMGIRA------PGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
:.:::::.::.::::::::: :: . ..: :::
CCDS10 PEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGLQSMPGDYVSQGGPMGMSMAQPSYTPPQMTPHPTQLR
370 380 390 400 410 420
CCDS10 HGPPMHSYLPSHPHHPAMMMHGGPPTHPGMTMSAQSPTMLNSVDPNVGGQVMDIHAQ
430 440 450 460 470
>>CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (388 aa)
initn: 1455 init1: 947 opt: 1981 Z-score: 1707.5 bits: 324.7 E(32554): 8.7e-89
Smith-Waterman score: 2260; 84.0% identity (93.0% similar) in 388 aa overlap (14-390:1-388)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQRYDDLPHYGGMDGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQY--PHTAHTNA
:::::.:..::::::: : . ::::::::::::. :. :. : :.
CCDS45 MDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPNV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 MAPSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSESFN
: ::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS45 MPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSDSFN
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 EDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 GKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDIT-RSANLTDQ-PSWNRDHDDTASTRSGGTPGPSSGGH
::::::::::.:.:.:::: :... :.::.:. :: :::::..::.:.::::::::::
CCDS45 GKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDATSTHSAGTPGPSSGGH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 TSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTGDDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
.:.:::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS45 ASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTGDDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB0 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRA-------VSQGTPYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. :.
CCDS45 HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAGFLLDPSVSQGAAYS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB0 PDGQPMGGFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
:.:::::.::.::::::::: ::::::::::::.::::::
CCDS45 PEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
350 360 370 380
>>CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (306 aa)
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Smith-Waterman score: 1879; 88.2% identity (97.1% similar) in 306 aa overlap (87-390:1-306)
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 NAMAPSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSES
.::.::::::::::::::::::::::::.:
CCDS45 MALVFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSDS
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 FNEDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISC
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISC
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 LKGKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDIT-RSANLTDQ-PSWNRDHDDTASTRSGGTPGPSSG
::::::::::::.:.:.:::: :... :.::.:. :: :::::..::.:.::::::::
CCDS45 LKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDATSTHSAGTPGPSSG
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 GHTSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTGDDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAWLFQH
::.:.:::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS45 GHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTGDDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQH
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 LTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNPDGQP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:::
CCDS45 LTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSPEGQP
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390
pF1KB0 MGGFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
::.::.::::::::: ::::::::::::.::::::
CCDS45 MGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
280 290 300
>>CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 (375 aa)
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Smith-Waterman score: 1706; 65.0% identity (83.5% similar) in 400 aa overlap (1-390:1-375)
10 20 30 40 50
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::.:::.:::: :. :: :... . :... :. .:: :. :. .
CCDS74 MARRYDELPHYPGIVDG---PAALASFPETV----PAVPGPYGP----HRPPQP-----L
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60 70 80 90 100 110
pF1KB0 APSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAG------GDVCS
:.. : :.:::.:: ::::::::::::.:::::::::.::. . :: :::::
CCDS74 PPGLDS---DGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCS
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120 130 140 150 160 170
pF1KB0 SESFNEDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRY
:.:::::::.::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS74 SDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 ISCLKGKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDITRSA-NLTDQPS-WNRDHDDTASTRSGGTPGP
:.::::::::::::.::.:: . : :: : .: :: . : :::.:..:.. : ::::
CCDS74 ITCLKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLG-TPGP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 SSGGHTSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTG-DDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAW
:::: .:.::::::.::::::.::::::.: .:.: :....:.:::::::::::::::::
CCDS74 SSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAW
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 LFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNP
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .::. ..:
CCDS74 LFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGAAFSP
290 300 310 320 330
360 370 380 390
pF1KB0 DGQPMGGFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
.:::.::.. . : :...: :: ..::....::.:::.
CCDS74 EGQPIGGYT-ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
340 350 360 370
>>CCDS33064.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 (421 aa)
initn: 1065 init1: 584 opt: 1191 Z-score: 1031.3 bits: 199.7 E(32554): 4e-51
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10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQRYDDLPHYGGM-DGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQYPHTAHTNAM
::.:::.:::: :. :: :... . :... :. .:: :. :. .
CCDS33 MARRYDELPHYPGIVDG---PAALASFPETV----PAVPGPYGP----HRPPQP-----L
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 APSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAG------GDVCS
:.. : :.:::.:: ::::::::::::.:::::::::.::. . :: :::::
CCDS33 PPGLDS---DGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 SESFNEDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRY
:.:::::::.::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS33 SDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 ISCLKGKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDITRSA-NLTDQPS-WNRDHDDTASTRSGGTPGP
:.::::::::::::.::.:: . : :: : .: :: . : :::.:..:.. : ::::
CCDS33 ITCLKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLG-TPGP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 SSGGHTSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTG-DDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAW
:::: .:.::::::.::::::.::::::.: .:.: :....:.:::::::::::::::::
CCDS33 SSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAW
230 240 250 260 270 280
300
pF1KB0 LFQHLT----------------------------------------------HPYPSEEQ
:::::. ::::::::
CCDS33 LFQHLSRRSEAPVLPDVCLGLGSPSPGPRWARPWGSDCGRPGRQSDSCWWLQHPYPSEEQ
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 KKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNPDGQPMGGFVMDGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .::. ..:.:::.::.. . :
CCDS33 KKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGAAFSPEGQPIGGYT-ETQP
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:...: :: . ::
CCDS33 HVAVRPPGSV-GMSLNLEGEWHYL
400 410 420
390 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 17:21:56 2016 done: Sat Nov 5 17:21:57 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]