Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8550
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8550, 906 aa
1>>>pF1KB8550 906 - 906 aa - 906 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4555+/-0.00111; mu= 19.9822+/- 0.067
mean_var=64.2411+/-12.639, 0's: 0 Z-trim(102.2): 46 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.160018
statistics sampled from 6796 (6842) to 6796 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 6035 1402.8 0
CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 5976 1389.1 0
CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 5841 1358.0 0
CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 5782 1344.4 0
CCDS58989.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 837) 5567 1294.7 0
CCDS58986.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 826) 4982 1159.7 0
CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 4179 974.3 0
CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 4133 963.7 0
CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 884) 4082 951.9 0
CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 902) 4030 939.9 0
CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 836) 4028 939.4 0
CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 3917 913.8 0
CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 3872 903.4 0
CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 934) 2060 485.1 2.6e-136
CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 905) 2059 484.9 2.9e-136
CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1 ( 919) 2051 483.0 1.1e-135
CCDS55045.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 892) 1991 469.2 1.5e-131
CCDS5049.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 869) 1983 467.3 5.4e-131
CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 908) 1983 467.3 5.6e-131
CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 980) 1646 389.5 1.6e-107
CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 981) 1640 388.2 4.1e-107
CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 918) 1629 385.6 2.3e-106
CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11 ( 956) 1629 385.6 2.3e-106
CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 949) 1613 381.9 3e-105
CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 920) 1612 381.7 3.4e-105
CCDS41707.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 433) 1528 362.2 1.2e-99
CCDS31236.1 GRID1 gene_id:2894|Hs108|chr10 (1009) 647 158.9 4.3e-38
CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 ( 873) 645 158.4 5.2e-38
CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 (1233) 645 158.5 7e-38
CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12 (1484) 630 155.1 9.1e-37
CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19 (1336) 629 154.8 9.8e-37
CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1281) 624 153.7 2.1e-36
CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1464) 624 153.7 2.4e-36
CCDS68758.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 ( 912) 604 149.0 3.8e-35
CCDS3637.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 (1007) 604 149.0 4.2e-35
CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 885) 542 134.7 7.6e-31
CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 901) 542 134.7 7.7e-31
CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 906) 542 134.7 7.7e-31
CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 938) 542 134.7 8e-31
CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 943) 542 134.7 8e-31
CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9 (1115) 321 83.7 2.1e-15
CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19 (1043) 305 80.0 2.6e-14
>>CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (906 aa)
initn: 6035 init1: 6035 opt: 6035 Z-score: 7520.5 bits: 1402.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6035; 100.0% identity (100.0% similar) in 906 aa overlap (1-906:1-906)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKW
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790 800 810 820 830 840
pF1KB8 WYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 LGATGL
::::::
CCDS43 LGATGL
>>CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (906 aa)
initn: 5976 init1: 5976 opt: 5976 Z-score: 7446.9 bits: 1389.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5976; 99.1% identity (99.7% similar) in 906 aa overlap (1-906:1-906)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
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430 440 450 460 470 480
pF1KB8 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::.::
CCDS47 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDKLKSKW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 WYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
::::::::: . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 LGATGL
::::::
CCDS47 LGATGL
>>CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (916 aa)
initn: 5841 init1: 5841 opt: 5841 Z-score: 7278.3 bits: 1358.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5841; 99.7% identity (99.9% similar) in 881 aa overlap (26-906:36-916)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKL
.. :::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HLFQPLQLAGGLEWPWSNLLCFLTPVKLHPEVWGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 NILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 MDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 GVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 NEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTIL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 EDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWN
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGLLDK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSH
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900
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:::::::::::
CCDS58 SSGMPLGATGL
910
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.. :::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::
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::.::::::::::: . ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSH
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900
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:::::::::::
CCDS58 SSGMPLGATGL
910
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::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FCGALHVCFITPSFPVDTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RVDWKRPKYTSALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AMLVALIEFCYKSRSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVV
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:::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SHDFPKSMQSIPCMSHSSGMPLGATGL
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pF1KB8 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::: :
CCDS58 IVNISDSFEMTYR-C---------------------------------------------
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::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ----------------------------------LSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
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pF1KB8 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
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pF1KB8 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
350 360 370 380 390 400
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pF1KB8 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
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pF1KB8 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
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pF1KB8 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKW
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pF1KB8 WYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
710 720 730 740 750 760
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pF1KB8 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
770 780 790 800 810 820
pF1KB8 LGATGL
::::::
CCDS58 LGATGL
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPP-KLL
..:: ... . : . :.. :.:::::::: .::..::: .. :.. .:
CCDS43 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVS-SNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLT
10 20 30 40 50
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pF1KB8 PQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVD
:.:: .....:: .: ::::::.:::::::::....:: .:::::.::: :::::::.:
CCDS43 PHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTD
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 TSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVN
.. ::.:.::.:. ::.:.:..:.:.::.:.::.:::::.:: :::.::::.:::::.:
CCDS43 GTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ILTTT----EEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILAN
. . . .: :: :::::: :::: :..::: ...: :. :.: . :. :::::.::
CCDS43 VGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIAN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSAL
::: : :: :.. .::::.:::.:.: :.. .:....:.. . ... . ::::::
CCDS43 LGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSAL
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CCDS83 TPSFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEKAGQNG
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CCDS83 TGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQDVPTLGNDTAAIENRTV
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CCDS83 SLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIES
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CCDS83 SKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSE
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