Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6115
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6115, 620 aa
1>>>pF1KB6115 620 - 620 aa - 620 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7319+/-0.00105; mu= 22.4170+/- 0.063
mean_var=66.8087+/-13.482, 0's: 0 Z-trim(103.4): 35 B-trim: 32 in 1/48
Lambda= 0.156913
statistics sampled from 7363 (7397) to 7363 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 3.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 ( 620) 4179 955.6 0
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 617) 2850 654.7 1e-187
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 628) 2817 647.3 1.8e-185
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 512) 2264 522.0 7.5e-148
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 ( 630) 2065 477.0 3.2e-134
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 ( 614) 1769 410.0 4.6e-114
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 602) 1739 403.2 5.1e-112
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 620) 1722 399.4 7.4e-111
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 721) 1722 399.4 8.3e-111
CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 635) 1720 398.9 1e-110
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 ( 636) 1713 397.4 3.1e-110
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 632) 1686 391.2 2.1e-108
CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 520) 1383 322.6 8.2e-88
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 ( 599) 1296 302.9 7.8e-82
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11 ( 797) 1238 289.9 8.6e-78
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 510) 1215 284.5 2.3e-76
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 633) 1101 258.8 1.6e-68
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 652) 1101 258.8 1.6e-68
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 706) 1101 258.9 1.7e-68
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 555) 769 183.6 6e-46
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX ( 642) 635 153.3 9.1e-37
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 200) 601 145.2 7.9e-35
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 208) 570 138.2 1.1e-32
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 289) 491 120.4 3.3e-27
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 592) 460 113.7 7.2e-25
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 ( 628) 444 110.1 9.3e-24
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 ( 634) 435 108.0 3.8e-23
CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 623) 432 107.4 6e-23
CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 730) 432 107.4 6.8e-23
CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 ( 727) 414 103.3 1.1e-21
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19 ( 736) 325 83.2 1.3e-15
>>CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 (620 aa)
initn: 4179 init1: 4179 opt: 4179 Z-score: 5109.7 bits: 955.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4179; 100.0% identity (100.0% similar) in 620 aa overlap (1-620:1-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGPKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGPKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 ETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 TACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 TACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 DFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 DFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 DSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 DSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 GTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 VTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 VTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKD
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB6 RELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::::::::::::::::::::
CCDS38 RELVDRGEVRQFTLRHWLKV
610 620
>>CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 (617 aa)
initn: 2847 init1: 1978 opt: 2850 Z-score: 3483.7 bits: 654.7 E(32554): 1e-187
Smith-Waterman score: 2850; 67.0% identity (85.6% similar) in 619 aa overlap (11-620:6-617)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGP-------KEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQS
:. : : .. .:: : .::..:::.:::: : ::..
CCDS10 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQ----CLLAPRDG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPL
.:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:: ::..::::::
CCDS10 --DAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPL
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTT
:::::::::.:::::: ::::::..::::..::::.:::::.:::::::.:.:::::::
CCDS10 FYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGID
.::: :...::::::.: . :. :. . . . :::::..::::::::.: ::
CCDS10 NLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAI
:.: :.::: ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::..:::::::
CCDS10 DIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGAS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTS
.:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::::::..:.:
CCDS10 NGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 INSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVF
:: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.:: :. :::::
CCDS10 INCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 FIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYV
:.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.:::.:.:::::
CCDS10 FVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCF
.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.::::::::.::: :
CCDS10 LTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 LLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKL
:::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: : ::. :.:
CCDS10 LLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERL
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KB6 AYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::.:.::....:: . ..::: :.::: .
CCDS10 AYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
590 600 610
>>CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 (628 aa)
initn: 2814 init1: 1945 opt: 2817 Z-score: 3443.3 bits: 647.3 E(32554): 1.8e-185
Smith-Waterman score: 2817; 66.9% identity (85.7% similar) in 614 aa overlap (11-615:6-612)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGP-------KEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQS
:. : : .. .:: : .::..:::.:::: : ::..
CCDS54 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQ----CLLAPRDG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPL
.:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:: ::..::::::
CCDS54 --DAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPL
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTT
:::::::::.:::::: ::::::..::::..::::.:::::.:::::::.:.:::::::
CCDS54 FYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGID
.::: :...::::::.: . :. :. . . . :::::..::::::::.: ::
CCDS54 NLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAI
:.: :.::: ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::..:::::::
CCDS54 DIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGAS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTS
.:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::::::..:.:
CCDS54 NGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 INSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVF
:: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.:: :. :::::
CCDS54 INCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 FIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYV
:.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.:::.:.:::::
CCDS54 FVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCF
.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.::::::::.::: :
CCDS54 LTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 LLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKL
:::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: : ::. :.:
CCDS54 LLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERL
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KB6 AYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::.:.::....:: . ..::: ..
CCDS54 AYGITPENEHHLVAQRDIRQFQMKTRQGRRRATNSCQISC
590 600 610 620
>>CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 (512 aa)
initn: 2260 init1: 1978 opt: 2264 Z-score: 2767.9 bits: 522.0 E(32554): 7.5e-148
Smith-Waterman score: 2264; 66.8% identity (86.7% similar) in 488 aa overlap (135-620:27-512)
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 FMVIAGMPLFYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWAL
:: :::..::::.:::::.:::::::.:
CCDS58 MGVQWWSHTQGEVAVGLGLGDSYLTPCPC-PGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSL
10 20 30 40 50
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 HYLFSSFTTELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVL
.::::::: .::: :...::::::.: . :. :. . . . :::::..:::::
CCDS58 YYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVL
60 70 80 90 100 110
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 HLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLL
:::.: :: :.: :.::: ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::.
CCDS58 HLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLV
120 130 140 150 160 170
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 RGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNC
.::::::: .:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::
CCDS58 HGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNC
180 190 200 210 220 230
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 YRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLP
::::..:.::: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.::
CCDS58 YRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLS
240 250 260 270 280 290
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 LSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLF
:. ::::::.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.::
CCDS58 GSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALF
300 310 320 330 340 350
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 CVTNGGIYVFTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRL
:.:.:::::.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.:::::
CCDS58 CITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRL
360 370 380 390 400 410
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 CWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCS
:::.::: ::::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: :
CCDS58 CWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLS
420 430 440 450 460 470
590 600 610 620
pF1KB6 LPGSFREKLAYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::. :.:::.:.::....:: . ..::: :.::: .
CCDS58 TQGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
480 490 500 510
>>CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 (630 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 SVGLMSSVVAPAKEPNAVGPKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKK
.... :..::. . .. .:::::::
CCDS11 VVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLV----AELHQGERETWGKK
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNRE
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CCDS11 VDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRN
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GAAGVW-KICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWN
: ..: :::::.::.:... .:..:.. .::.:.::::.::.:::: .::: :.::::
CCDS11 GCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWN
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLV
. ::.. :. . .:.:: :.. : ::..:.:.:..::: :::. :..
CCDS11 TGNCTNYFSEDNITWT-----LHSTSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIM
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRL
:.....:::.::::::::::::.:::.::..:..::.::.::::: :. ::. .. .:
CCDS11 LIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKL
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 CEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVF
:..::::::.:. :::: :::::.::.:::::.::::.::.::. .: .::: ::::.:
CCDS11 LETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIF
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SFLGYMAQKHSVPIGDVAKD-GPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAM
. :::::. .. ...:::: ::.:.:: : ::::..: :. .:..::.::.:::.::..
CCDS11 TVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTF
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 GGMESVITGLIDEF-QLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAAGTS
.:.:.:::...::: .. ..:: :.: .:.. :. :: .: :: :: ::...:.: .
CCDS11 AGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYATGPA
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 ILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTF
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CCDS11 VLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMS-
510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 RPPHYG--AYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKDR
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CCDS11 -PPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPETPT
560 570 580 590 600 610
610 620
pF1KB6 ELVDRGEVRQFTLRHWLKV
: . :..:
CCDS11 E-IPCGDIRLNAV
620 630
>>CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 (614 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KB6 PKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWR
...:: : .:..:.::: : . :.::::
CCDS85 DGKVAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWR
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pF1KB6 FPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNREGAAGVW-KICPILKGVGFT
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CCDS85 FPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGLA
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pF1KB6 VILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGL
..: :.. .: .:.:::: :::::::.:::: ::: ::. .:.: ...: . .
CCDS85 SVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTPF
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 NDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGK
.. :.:. :..:: :: . . :: ::: ::.:. ::.:. :. :: .:::::..::
CCDS85 ENF--TSPVMEFWERRVLGI--TSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGK
190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 VVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGV
::..:::.::..:. ::.:::::::: .:: ::. :..:: . .::.::.::. ::...
CCDS85 VVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAI
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 GFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAK
: : :..::::. ::::.: :. .:: ::: .::::::.::.:.:...:::..::.
CCDS85 CQGCLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAE
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 DGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRH
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CCDS85 SGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRK
360 370 380 390 400 410
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pF1KB6 ---RELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA-GTSILFGVLIEAIGVAWFYG
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CCDS85 SGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYG
420 430 440 450 460 470
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pF1KB6 VGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYG-AYIFPDWANA
. .: :.:..: : :: .. : ...: . : . . :. . : .:. .:..: :. .
CCDS85 ADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYS
480 490 500 510 520 530
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pF1KB6 LGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLK
.:: .: :::. ::.... . . : ::..: :.:.
CCDS85 IGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFG
540 550 560 570 580 590
620
pF1KB6 V
CCDS85 PSPTREGLIAGEKETHL
600 610
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Smith-Waterman score: 1739; 44.9% identity (76.1% similar) in 548 aa overlap (59-600:31-573)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 VELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPY
.: :..:..:.::: : . :.:::::::
CCDS85 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 LCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNREGAAGVW-KICPILKGVGFTVIL
::::::::::..:::.:. :.:.: .: ::::.. .:.. .: :::::..:.:.. .
CCDS85 LCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGYASQM
70 80 90 100 110 120
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pF1KB6 ISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDT
: . .. .: ...:::: ::::::: .::: : . ::. .: . . ..:. .: ...
CCDS85 IVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQ--KTNGSLNGTSEN
130 140 150 160 170
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pF1KB6 FGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVW
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CCDS85 -ATSPVIEFWERRVLKI--SDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
180 190 200 210 220 230
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pF1KB6 ITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFG
.:::.::..:..::.:::::::: .::. :: .. :: . .::.::.::. ::... .:
CCDS85 FTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLG
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 VLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGP
: :..::::. :::::: :. .:: ::: .::..::.::.:.:...:::..::..::
CCDS85 CLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 GLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRH---
:: :: ::.:.. ::.: :: ::.:.. ::.:: . .::..:.:.: . . :.
CCDS85 GLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNR
360 370 380 390 400 410
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pF1KB6 RELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA-GTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQ
::.. : . ...::..:. .:.::.::: :.:..:: : .:: ...:.. ::: ::. .
CCDS85 REVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKR
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 FSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYGA-YIFPDWANALGW
: :.:..: : :: . :: ...: . . :.. . : :. : .: :..::::
CCDS85 FYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGW
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 VIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
..: :::. .: .. :.. .: : :::.. . : .:
CCDS85 LLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPATPRTSLLRL
540 550 560 570 580 590
CCDS85 TELESHC
600
>>CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (620 aa)
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Smith-Waterman score: 1722; 45.0% identity (74.8% similar) in 555 aa overlap (60-606:41-592)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 ELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYL
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CCDS33 KDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSSKIDFVLSVAGGFVGLGNVWRFPYL
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 CYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNREGAAGVW-KICPILKGVGF-TVIL
::::::::::.::..:. .:.:.:..:. .::.. ::. : ::::...:.:. .:..
CCDS33 CYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGITCWEKICPLFSGIGYASVVI
80 90 100 110 120 130
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pF1KB6 ISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDT
.:: .. .: ::.::: .:::.:: :::: :::.:::.:.: . ... ...:
CCDS33 VSL-LNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPHCMEDTMRKNKSVWITISST
140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 FGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVW
:.:. :..::.:: : : ::: : .:.:. ::.:: .. .: .::::...::::.
CCDS33 NFTSPVIEFWERNVLSL--SPGIDHPGSLKWDLALCLLLVWLVCFFCIWKGVRSTGKVVY
190 200 210 220 230 240
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pF1KB6 ITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFG
.:::.:...: .::.::.::::: ::. :: :. :: . .:::::.::. :: .. .:
CCDS33 FTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLG
250 260 270 280 290 300
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pF1KB6 VLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGP
.. ...::::. : ::: .. .:: ::: :::..::.::.:::...: :.:::..::
CCDS33 AMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGP
310 320 330 340 350 360
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pF1KB6 GLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRH---
:: :: ::.:.. .:: . :...:::::: ::.:: . .:. ::.:.: . . :.
CCDS33 GLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKGYR
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 RELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA-GTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQ
::.: :. ..::.: ::.::.::: :.:..:: :. .:. ...: . .::.:: .
CCDS33 REIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECFVIAWIYGGDN
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 FSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYG-AYIFPDWANALGW
. : :..: : ::. . . : ...: . . . :.: . : :. .:..:.:: .:::
CCDS33 LYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYVPLTYNKTYVYPNWAIGLGW
490 500 510 520 530 540
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pF1KB6 VIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAP-EKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
.: ::: ::. . ..:. : : .. : ..: : .: :.:
CCDS33 SLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPREPNRWAVEREGATPYNSRTVMNGA
550 560 570 580 590 600
CCDS33 LVKPTHIIVETMM
610 620
>>CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (721 aa)
initn: 1242 init1: 733 opt: 1722 Z-score: 2102.8 bits: 399.4 E(32554): 8.3e-111
Smith-Waterman score: 1722; 45.0% identity (74.8% similar) in 555 aa overlap (60-606:142-693)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 ELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYL
:: :..::::.::: : : :.::::::::
CCDS77 KDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSSKIDFVLSVAGGFVGLGNVWRFPYL
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 CYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNREGAAGVW-KICPILKGVGF-TVIL
::::::::::.::..:. .:.:.:..:. .::.. ::. : ::::...:.:. .:..
CCDS77 CYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGITCWEKICPLFSGIGYASVVI
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 ISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDT
.:: .. .: ::.::: .:::.:: :::: :::.:::.:.: . ... ...:
CCDS77 VSL-LNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPHCMEDTMRKNKSVWITISST
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 FGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVW
:.:. :..::.:: : : ::: : .:.:. ::.:: .. .: .::::...::::.
CCDS77 NFTSPVIEFWERNVLSL--SPGIDHPGSLKWDLALCLLLVWLVCFFCIWKGVRSTGKVVY
300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 ITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFG
.:::.:...: .::.::.::::: ::. :: :. :: . .:::::.::. :: .. .:
CCDS77 FTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLG
350 360 370 380 390 400
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pF1KB6 VLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGP
.. ...::::. : ::: .. .:: ::: :::..::.::.:::...: :.:::..::
CCDS77 AMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGP
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