Result of FASTA (omim) for pFN21AB5787
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5787, 829 aa
  1>>>pF1KB5787 829 - 829 aa - 829 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8383+/-0.00036; mu= 18.2021+/- 0.023
 mean_var=87.7068+/-17.643, 0's: 0 Z-trim(114.1): 411  B-trim: 48 in 1/59
 Lambda= 0.136949
 statistics sampled from 23365 (23788) to 23365 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.279), width:  16
 Scan time: 13.290

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001784 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3  ( 829) 5560 1109.2       0
NP_001304125 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin ( 774) 5184 1034.9       0
XP_011521102 (OMIM: 114021,225280,601553) PREDICTE ( 808) 5106 1019.5       0
NP_001304124 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin ( 784) 5098 1017.9       0
NP_004351 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19209 ( 882) 3045 612.4 2.9e-174
XP_011521790 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 637) 2556 515.6 2.7e-145
XP_011521791 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 637) 2556 515.6 2.7e-145
NP_001304114 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 366) 1519 310.6 8.2e-84
XP_011524090 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2  ( 821) 1495 306.1 4.2e-82
XP_016881003 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2  ( 848) 1495 306.1 4.3e-82
NP_001295105 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 2 [ ( 875) 1495 306.1 4.4e-82
NP_001783 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 1 prep ( 906) 1495 306.1 4.5e-82
NP_001239268 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 3 [ ( 842) 1469 301.0 1.5e-80
NP_001239267 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 2 [ ( 879) 1469 301.0 1.6e-80
NP_001785 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 1 prep ( 916) 1469 301.0 1.6e-80
NP_004924 (OMIM: 114019,612580) cadherin-15 prepro ( 814) 1249 257.5 1.8e-67
NP_077741 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 839) 1234 254.5 1.4e-66
NP_001932 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 896) 1234 254.5 1.5e-66
NP_001248 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 1 pre ( 713) 1210 249.7 3.3e-65
NP_001207417 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 2  ( 760) 1210 249.8 3.5e-65
XP_011521106 (OMIM: 601364) PREDICTED: cadherin-13 ( 612) 1208 249.3 3.9e-65
NP_004940 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isof ( 847) 1201 248.0 1.3e-64
NP_077740 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isof ( 901) 1201 248.0 1.4e-64
NP_004939 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 840) 1176 243.1   4e-63
NP_077739 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 894) 1176 243.1 4.2e-63
XP_005258263 (OMIM: 125645,610476) PREDICTED: desm ( 758) 1133 234.5 1.3e-60
NP_001207418 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 3  ( 674) 1124 232.7 4.2e-60
NP_001304113 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 821) 1050 218.2 1.2e-55
NP_001304115 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 227) 1041 216.0 1.5e-55
NP_001207419 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 4  ( 459) 1001 208.3 6.3e-53
NP_001934 (OMIM: 125671,610193,612877) desmoglein- (1118)  901 188.8 1.1e-46
NP_817123 (OMIM: 607892,607903) desmoglein-4 isofo (1040)  887 186.0 7.3e-46
NP_001127925 (OMIM: 607892,607903) desmoglein-4 is (1059)  887 186.0 7.4e-46
NP_001933 (OMIM: 125670,148700,615508) desmoglein- (1049)  814 171.6 1.6e-41
XP_016864430 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574)  784 165.5 6.1e-40
XP_016864429 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574)  784 165.5 6.1e-40
NP_001161139 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 2  ( 574)  784 165.5 6.1e-40
XP_016864428 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574)  784 165.5 6.1e-40
XP_016864427 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575)  784 165.5 6.1e-40
XP_011512232 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575)  784 165.5 6.1e-40
XP_016864424 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575)  784 165.5 6.1e-40
XP_016864425 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575)  784 165.5 6.1e-40
XP_016864426 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575)  784 165.5 6.1e-40
NP_001278886 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 3  ( 575)  784 165.5 6.1e-40
NP_001295321 (OMIM: 600023) cadherin-11 isoform 2  ( 693)  784 165.6 7.1e-40
XP_011524152 (OMIM: 169615) PREDICTED: desmoglein- ( 998)  779 164.7 1.9e-39
NP_001935 (OMIM: 169615) desmoglein-3 preproprotei ( 999)  779 164.7 1.9e-39
NP_001257957 (OMIM: 603016) cadherin-19 isoform 2  ( 490)  657 140.4 1.9e-32
XP_011524234 (OMIM: 603016) PREDICTED: cadherin-19 ( 445)  627 134.4 1.1e-30
XP_011512223 (OMIM: 603007) PREDICTED: cadherin-6  ( 790)  582 125.7 8.1e-28


>>NP_001784 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 isof  (829 aa)
 initn: 5560 init1: 5560 opt: 5560  Z-score: 5935.5  bits: 1109.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5560; 100.0% identity (100.0% similar) in 829 aa overlap (1-829:1-829)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 YELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTAT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 DEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 TDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 AWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 PTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 DPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLID
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 VNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820         
pF1KB5 DYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
              790       800       810       820         

>>NP_001304125 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 i  (774 aa)
 initn: 5184 init1: 5184 opt: 5184  Z-score: 5534.4  bits: 1034.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5184; 100.0% identity (100.0% similar) in 774 aa overlap (56-829:1-774)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB5 PCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCPGQEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                               MGCPGQEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERR
                                             10        20        30

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB5 SLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSI
               40        50        60        70        80        90

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB5 TGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIV
              100       110       120       130       140       150

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB5 TDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDP
              160       170       180       190       200       210

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB5 HDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNA
              220       230       240       250       260       270

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPES
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDRED
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVLGAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQD
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       ::::::::::::::::::::::::
NP_001 YDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
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>>XP_011521102 (OMIM: 114021,225280,601553) PREDICTED: c  (808 aa)
 initn: 5171 init1: 5100 opt: 5106  Z-score: 5450.9  bits: 1019.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5106; 97.8% identity (98.3% similar) in 782 aa overlap (1-782:1-778)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGD
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pF1KB5 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
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pF1KB5 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
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pF1KB5 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :    .    ::..  :. 
XP_011 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIEVLLLCRS----PPWQEALAT
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pF1KB5 DYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
        :                                               
XP_011 GYSLDPAWPVPPFPPTTPGKTKTQPFHKYMST                 
        780       790       800                         

>>NP_001304124 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 i  (784 aa)
 initn: 5098 init1: 5098 opt: 5098  Z-score: 5442.5  bits: 1017.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5098; 100.0% identity (100.0% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-760)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCPG
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pF1KB5 QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENG
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pF1KB5 KGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAK
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pF1KB5 YELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTAT
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pF1KB5 DEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQA
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pF1KB5 TDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSP
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pF1KB5 AWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL
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pF1KB5 PTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILR
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pF1KB5 DPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLID
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pF1KB5 VNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGD
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pF1KB5 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
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pF1KB5 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
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pF1KB5 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                    
NP_001 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIEGRGERGSQRGNGGLQLARGR
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pF1KB5 DYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
                                                        
NP_001 TRRS                                             
                                                        

>>NP_004351 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,192090,60  (882 aa)
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pF1KB5   MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKV-FMG
                          :: :   :::.  :     :. .   . : :..::.: :  
NP_004 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWL-CQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFED
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pF1KB5 CPG-QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNP------------------------
       : : :. : :: :.  : : .  ..  .: :. .::                        
NP_004 CTGRQRTAYFSLDTR-FKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNT
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pF1KB5 --------------------LKIFP-SKRILRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQL
                           :  :: :.  :::.:::::. ::: ::: :::::. : :.
NP_004 VGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQI
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pF1KB5 KSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSEN
       :::::.. :.:::::: :::.:: ::: .:.::::: ...:::::.:: : ::.:::: :
NP_004 KSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSN
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pF1KB5 GASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNG
       : .:::::.: : ::::::.::.:::..:.:::.::.:::::::.::::: :: . :::.
NP_004 GNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNA
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pF1KB5 VVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTT
       ..::.: ::.:. :   ::::.:.::.:::...:::::. : :::..::.:..:.: .::
NP_004 AIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTT
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pF1KB5 AVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGG
       :.::. . :.::: :.:.:  :...:::: ..  .  : ::: ::::.:::.:.: :.. 
NP_004 ATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILN-
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pF1KB5 DDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHV
       ::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.: ::: .:: ..: :::::..: :
NP_004 DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDV
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pF1KB5 EDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQKISYRILRDPAGWLAMDP
        ::::::.:::: : :::.: . .:. .  :::..::   .:::.::: :: :.:: ..:
NP_004 LDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINP
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pF1KB5 DSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEP
       :.: ... . ::::: . :.:. : ....: ::::: .:::::::: : ::::..:.:::
NP_004 DTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEP
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pF1KB5 RQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKF
       : : .:...:  ::.:: : :: :.:::: :.::  ..  :: . :.   ....:. :  
NP_004 RTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMA
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pF1KB5 LKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETC--PGPWKGGFILP----VLGAV
       :.   : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .:    : ..:. .:    .::..
NP_004 LEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGI
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pF1KB5 LALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLE
       ::::.:.:.:::..:..  .::::: :::::::::.:: ::::::::::.:..::::::.
NP_004 LALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLD
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pF1KB5 ARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYE
       :::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: ::::::.:::::::::.:::::::
NP_004 ARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYE
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pF1KB5 GSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
       ::::.:::::::.:: ::.:::::::::::.:::::::::::::::
NP_004 GSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
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>>XP_011521790 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,192090  (637 aa)
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                                     :.: : ::::::.::.:::..:.:::.::.
XP_011                               MEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGA
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pF1KB5 LPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDR
       :::::::.::::: :: . :::...::.: ::.:. :   ::::.:.::.:::...::::
XP_011 LPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDR
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pF1KB5 EKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQR
       :. : :::..::.:..:.: .:::.::. . :.::: :.:.:  :...:::: ..  .  
XP_011 ESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITT
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pF1KB5 LTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYV
       : ::: ::::.:::.:.: :.. ::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.:
XP_011 LKVTDADAPNTPAWEAVYTILN-DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHV
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pF1KB5 EVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPD
        ::: .:: ..: :::::..: : ::::::.:::: : :::.: . .:. .  :::..::
XP_011 AVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPD
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pF1KB5 K-ENQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPP
          .:::.::: :: :.:: ..::.: ... . ::::: . :.:. : ....: ::::: 
XP_011 TFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPV
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pF1KB5 TTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDS
       .:::::::: : ::::..:.:::: : .:...:  ::.:: : :: :.:::: :.::  .
XP_011 ATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGA
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pF1KB5 DIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVET
       .  :: . :.   ....:. :  :.   : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .
XP_011 SANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGV
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pF1KB5 C--PGPWKGGFILP----VLGAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFY
       :    : ..:. .:    .::..::::.:.:.:::..:..  .::::: :::::::::.:
XP_011 CRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYY
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pF1KB5 YGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIE
       : ::::::::::.:..::::::.:::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: :
XP_011 YDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDE
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pF1KB5 NLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLA
       :::::.:::::::::.:::::::::::.:::::::.:: ::.:::::::::::.::::::
XP_011 NLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLA
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pF1KB5 DMYGGGEDD
       :::::::::
XP_011 DMYGGGEDD
      630       

>>XP_011521791 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,192090  (637 aa)
 initn: 1826 init1: 1118 opt: 2556  Z-score: 2729.5  bits: 515.6 E(85289): 2.7e-145
Smith-Waterman score: 2556; 59.2% identity (82.8% similar) in 639 aa overlap (199-829:1-637)

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB5 LNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGV
                                     :.: : ::::::.::.:::..:.:::.::.
XP_011                               MEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGA
                                             10        20        30

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pF1KB5 LPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDR
       :::::::.::::: :: . :::...::.: ::.:. :   ::::.:.::.:::...::::
XP_011 LPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDR
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pF1KB5 EKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQR
       :. : :::..::.:..:.: .:::.::. . :.::: :.:.:  :...:::: ..  .  
XP_011 ESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITT
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pF1KB5 LTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYV
       : ::: ::::.:::.:.: :.. ::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.:
XP_011 LKVTDADAPNTPAWEAVYTILN-DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHV
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pF1KB5 EVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPD
        ::: .:: ..: :::::..: : ::::::.:::: : :::.: . .:. .  :::..::
XP_011 AVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPD
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pF1KB5 K-ENQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPP
          .:::.::: :: :.:: ..::.: ... . ::::: . :.:. : ....: ::::: 
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pF1KB5 TTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDS
       .:::::::: : ::::..:.:::: : .:...:  ::.:: : :: :.:::: :.::  .
XP_011 ATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGA
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pF1KB5 DIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVET
       .  :: . :.   ....:. :  :.   : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .
XP_011 SANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGV
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pF1KB5 C--PGPWKGGFILP----VLGAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFY
       :    : ..:. .:    .::..::::.:.:.:::..:..  .::::: :::::::::.:
XP_011 CRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYY
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pF1KB5 YGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIE
       : ::::::::::.:..::::::.:::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: :
XP_011 YDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDE
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pF1KB5 NLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLA
       :::::.:::::::::.:::::::::::.:::::::.:: ::.:::::::::::.::::::
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pF1KB5 DMYGGGEDD
       :::::::::
XP_011 DMYGGGEDD
      630       

>>NP_001304114 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,192090  (366 aa)
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Smith-Waterman score: 1519; 60.8% identity (83.0% similar) in 365 aa overlap (472-829:3-366)

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pF1KB5 PPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTL
                                     :::.::: :: :.:: ..::.: ... . :
NP_001                             MEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAEL
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pF1KB5 DREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQSPV
       :::: . :.:. : ....: ::::: .:::::::: : ::::..:.:::: : .:...: 
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pF1KB5 RQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKFLKQDTYDVHLS
        ::.:: : :: :.:::: :.::  ..  :: . :.   ....:. :  :.   : ..:.
NP_001 PQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLK
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pF1KB5 LSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETC--PGPWKGGFILP----VLGAVLALLFLLLVLL
       : :. ::.:.:.....::::.: . .:    : ..:. .:    .::..::::.:.:.::
NP_001 LMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLL
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pF1KB5 LLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVLRNDV
       :..:..  .::::: :::::::::.:: ::::::::::.:..::::::.:::::. ::::
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pF1KB5 APTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYEGSGSDAASLSS
       :::.. .: : ::::::::::::: ::::::.:::::::::.:::::::::::.::::::
NP_001 APTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSS
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pF1KB5 LTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
       :.:: ::.:::::::::::.:::::::::::::::
NP_001 LNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
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>>XP_011524090 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 isof  (821 aa)
 initn: 1750 init1: 547 opt: 1495  Z-score: 1595.0  bits: 306.1 E(85289): 4.2e-82
Smith-Waterman score: 2195; 46.2% identity (71.6% similar) in 786 aa overlap (79-828:45-821)

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pF1KB5 RHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKE
       :.:::::. ::..:::..:::::.: ...:..:.. .. ::.::::::.:: :.: ..  
XP_011 RQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPI
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pF1KB5 TGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGS
       .: : ..::::::.::...: .:::. :: .::.:..: : : :.::..:.: .... :.
XP_011 SGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGT
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pF1KB5 VLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVIS
       : ::  ::: :: ::: : ::   . ::.. : : :: :. :   ::::.  :: : ...
XP_011 VPEGSKPGTYVMTVTAIDADDP-NALNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVA
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pF1KB5 SGLDREKVPEYTLTIQATDMDGD---GSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPEN
       .::::::: .::: ::::::.:.   : ..::.::. . :.::: : :  . . ..::::
XP_011 AGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPEN
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pF1KB5 AVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEA
        :   :  ::::: : :..::: :.: : :::   .:.: : :.::.:..:. : .:::.
XP_011 RVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFET
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pF1KB5 KNQHTLYVEVTNEAPF---VLKLPTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGE
       . . .: : . :..:.   . . : ::::. : : :::: : :.:  :... .::. .: 
XP_011 NRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGT
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pF1KB5 PVCVYTAEDPDKENQK-ISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEV
        . ..::.:::.  :. : :  : :::.:: .:: .::.:....::::. . :.::::..
XP_011 MLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPN-VKNNIYNA
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pF1KB5 MVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNIT--DKDLSP
         :: ::: :: .::::: . :.:.::..:   :..   : ..:  . .:::  : :..:
XP_011 TFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETC-ETPDPNSINITALDYDIDP
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pF1KB5 HTSPFQAQLTDDSDIY---WTAEVNEEGDTVVLSLK-KFLKQDTYDVHLSLSDHGN--KE
       ...::  .:  .       ::  .  .:: . :.:: :::.   :.: . ..: ::  : 
XP_011 NAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTI-TRLNGDFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKS
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pF1KB5 QLTVIRATVCDCHGH-----VETCPGPWKG-GFILPVLGAVLALLFLLLVLLLLVR---K
       .....:. ::.: ..     :.   :   : : :. .:  .. ::.:.:.... ..   :
XP_011 NISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDK
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pF1KB5 KRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVL-----RNDV
       .:. :. :. ::::.:::.. : ::::::::::::..::..   ..:...      : : 
XP_011 ERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDE
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pF1KB5 APTIIPTPMYRPRPA--NPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYEGSGSDAASL
        : :   :.:  : :  .: .::.:: :.::::..::::::::.::::::::::: :.::
XP_011 RP-IHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSL
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pF1KB5 SSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
       :::.::.:  .:::::::.:: ::::::::::::.: 
XP_011 SSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGDD 
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>>XP_016881003 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 isof  (848 aa)
 initn: 1360 init1: 547 opt: 1495  Z-score: 1594.8  bits: 306.1 E(85289): 4.3e-82
Smith-Waterman score: 1822; 43.0% identity (69.5% similar) in 718 aa overlap (79-760:130-838)

       50        60        70        80        90          100     
pF1KB5 QALGKVFMGCPGQEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFP---SKRI--LR
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