Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5407
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5407, 494 aa
1>>>pF1KB5407 494 - 494 aa - 494 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5019+/-0.000367; mu= 17.3000+/- 0.023
mean_var=92.4142+/-18.208, 0's: 0 Z-trim(115.4): 295 B-trim: 271 in 1/48
Lambda= 0.133415
statistics sampled from 25454 (25851) to 25454 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 9.910
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated c ( 494) 3301 645.9 7.5e-185
XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 1243 250.0 2e-65
NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage- ( 858) 1243 250.0 2e-65
XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 1243 250.0 2e-65
NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated c ( 911) 1223 246.2 3e-64
NP_055194 (OMIM: 608164) potassium voltage-gated c ( 500) 918 187.3 9e-47
XP_016881193 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 509) 880 179.9 1.5e-44
NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated c ( 466) 874 178.8 3e-44
XP_016881194 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 874 178.8 3e-44
XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 874 178.8 3e-44
XP_011524222 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 874 178.8 3e-44
NP_758847 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 425) 837 171.6 3.9e-42
XP_006710694 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 510) 769 158.6 3.9e-38
XP_006710693 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 636) 769 158.7 4.6e-38
NP_751948 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 636) 769 158.7 4.6e-38
XP_006710692 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655) 769 158.7 4.7e-38
XP_016856733 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655) 769 158.7 4.7e-38
NP_004971 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 655) 769 158.7 4.7e-38
XP_005270908 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655) 769 158.7 4.7e-38
XP_016859548 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 766 158.0 5.7e-38
NP_001269357 (OMIM: 603888) potassium voltage-gate ( 491) 766 158.0 5.7e-38
XP_011531127 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 766 158.0 5.7e-38
NP_002243 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated c ( 491) 766 158.0 5.7e-38
NP_036413 (OMIM: 605410) potassium voltage-gated c ( 630) 764 157.7 8.9e-38
NP_065748 (OMIM: 602906) potassium voltage-gated c ( 477) 756 156.1 2.1e-37
NP_004970 (OMIM: 300281) potassium voltage-gated c ( 647) 755 156.0 3e-37
XP_011542212 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 647) 755 156.0 3e-37
XP_016869470 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666) 705 146.4 2.4e-34
XP_016869471 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666) 705 146.4 2.4e-34
XP_016884998 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 558) 682 141.9 4.6e-33
XP_016884997 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 558) 682 141.9 4.6e-33
NP_002223 (OMIM: 176263) potassium voltage-gated c ( 575) 649 135.5 3.9e-31
XP_011539699 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 642 134.1 8.8e-31
XP_011539701 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 642 134.1 8.8e-31
XP_016856702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 642 134.1 8.8e-31
XP_011539698 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 642 134.1 8.8e-31
XP_011539700 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 642 134.1 8.8e-31
XP_011539702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 642 134.1 8.8e-31
NP_004965 (OMIM: 176262,616366) potassium voltage- ( 499) 642 134.1 8.8e-31
NP_598004 (OMIM: 607604,610356) potassium voltage- ( 545) 633 132.4 3.1e-30
XP_006710695 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 375) 620 129.8 1.3e-29
XP_011539728 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 387) 615 128.8 2.7e-29
XP_011539729 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 369) 614 128.6 3e-29
XP_011539730 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 369) 614 128.6 3e-29
XP_011539727 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 407) 614 128.7 3.2e-29
XP_016856734 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 407) 614 128.7 3.2e-29
NP_001309728 (OMIM: 602905) potassium voltage-gate ( 526) 613 128.6 4.4e-29
NP_002242 (OMIM: 602905) potassium voltage-gated c ( 526) 613 128.6 4.4e-29
XP_016883335 (OMIM: 602905) PREDICTED: potassium v ( 527) 613 128.6 4.4e-29
NP_000208 (OMIM: 160120,176260) potassium voltage- ( 495) 612 128.4 4.8e-29
>>NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated chann (494 aa)
initn: 3301 init1: 3301 opt: 3301 Z-score: 3439.6 bits: 645.9 E(85289): 7.5e-185
Smith-Waterman score: 3301; 100.0% identity (100.0% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVWKFLEKPESSCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVWKFLEKPESSCP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 ARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETACIGWFTLEYLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETACIGWFTLEYLLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAVQALRIMRIARI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAVQALRIMRIARI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSHPETLFKSIPQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSHPETLFKSIPQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 FWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVRYYNKQRVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVRYYNKQRVLE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLSHSDTFIPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLSHSDTFIPLL
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB5 TEEKHHRTRLQSCK
::::::::::::::
NP_002 TEEKHHRTRLQSCK
490
>>XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: potassiu (858 aa)
initn: 1193 init1: 895 opt: 1243 Z-score: 1295.7 bits: 250.0 E(85289): 2e-65
Smith-Waterman score: 1243; 41.9% identity (74.7% similar) in 442 aa overlap (1-437:5-443)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDGSGERSL----PEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAEL
: : :: ::: . . . .. .::::. . . :.. :.:::..:
XP_006 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 INCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNE
.: . .:... .::::. :..::: : :: ... : :..:: . .: . :..:
XP_006 RDC--NTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 MDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVWKF
.:.: .: .:..::... .:.:.. ::. :... . . : . . . .: .: .
XP_006 LDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETACIG
::::.:: :...:..:...:..:.... ..:.:::: :: :. ...: : .::..::.
XP_006 LEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 WFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAVQA
:::.:::::..:::.: .: . .: .:.:::::.::.. ::. . .... ::...::
XP_006 WFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQI
240 250 260 270 280 290
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pF1KB5 LRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSHPE
.::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: . :... .
XP_006 FRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 TLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVR
: ::::: ::::: ::::::::::::::: :::. ... . ::..::::: :.::: .
XP_006 TKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 YYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLS
.:..:. : : :.. : .: . .:
XP_006 FYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDK
420 430 440 450 460 470
>>NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage-gate (858 aa)
initn: 1193 init1: 895 opt: 1243 Z-score: 1295.7 bits: 250.0 E(85289): 2e-65
Smith-Waterman score: 1243; 41.9% identity (74.7% similar) in 442 aa overlap (1-437:5-443)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDGSGERSL----PEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAEL
: : :: ::: . . . .. .::::. . . :.. :.:::..:
NP_004 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 INCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNE
.: . .:... .::::. :..::: : :: ... : :..:: . .: . :..:
NP_004 RDC--NTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 MDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVWKF
.:.: .: .:..::... .:.:.. ::. :... . . : . . . .: .: .
NP_004 LDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVETACIG
::::.:: :...:..:...:..:.... ..:.:::: :: :. ...: : .::..::.
NP_004 LEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 WFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAVQA
:::.:::::..:::.: .: . .: .:.:::::.::.. ::. . .... ::...::
NP_004 WFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQI
240 250 260 270 280 290
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pF1KB5 LRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSHPE
.::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: . :... .
NP_004 FRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 TLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVR
: ::::: ::::: ::::::::::::::: :::. ... . ::..::::: :.::: .
NP_004 TKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSE
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 YYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLS
.:..:. : : :.. : .: . .:
NP_004 FYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDK
420 430 440 450 460 470
>>XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: potassiu (858 aa)
initn: 1193 init1: 895 opt: 1243 Z-score: 1295.7 bits: 250.0 E(85289): 2e-65
Smith-Waterman score: 1243; 41.9% identity (74.7% similar) in 442 aa overlap (1-437:5-443)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDGSGERSL----PEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAEL
: : :: ::: . . . .. .::::. . . :.. :.:::..:
XP_011 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 INCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNE
.: . .:... .::::. :..::: : :: ... : :..:: . .: . :..:
XP_011 RDC--NTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQE
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pF1KB5 MDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKCVWKF
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XP_011 LDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLWDL
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XP_011 LEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVCIA
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pF1KB5 WFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQAVQA
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XP_011 WFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQI
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pF1KB5 LRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQSHPE
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XP_011 FRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 TLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVR
: ::::: ::::: ::::::::::::::: :::. ... . ::..::::: :.::: .
XP_011 TKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 YYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLS
.:..:. : : :.. : .: . .:
XP_011 FYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDK
420 430 440 450 460 470
>>NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated chann (911 aa)
initn: 1196 init1: 873 opt: 1223 Z-score: 1274.5 bits: 246.2 E(85289): 3e-64
Smith-Waterman score: 1223; 40.6% identity (73.9% similar) in 463 aa overlap (10-466:22-481)
10 20 30 40
pF1KB5 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETR
::: . . . . .. .::::. . . :.. :.::
NP_004 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 LAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPIC
:..: .: . ..... .::::. .. :..::: : :: ... : :..:: . .: .
NP_004 LGKLRDC--NTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALS
70 80 90 100 110
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pF1KB5 FKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKC
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NP_004 FGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
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.: .::::.:: :...:..:.:.:..:.... ..:.:::: : :. .. : .::.
NP_004 LWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEA
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 ACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQ
.::.:::.:::::..::::: .: . .:..:.:::::.::.. ::. . .... ::..
NP_004 VCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRR
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pF1KB5 AVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQ
.:: .::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: . :.
NP_004 VVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEK
300 310 320 330 340 350
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pF1KB5 SHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIIN
.. : : ::: ::::: ::::::::::::::: :::. ... . ::..::::: :.:
NP_004 DEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVN
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 NFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGG----EGKTGGSRS-DLDNLPPEPAGKEAP
:: ..:..:. : : :.. : .: . .:. . : . .:: .: .. : ::. :
NP_004 NFSEFYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESAN
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KB5 SCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
. .:
NP_004 TKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSA
480 490 500 510 520 530
>>NP_055194 (OMIM: 608164) potassium voltage-gated chann (500 aa)
initn: 914 init1: 428 opt: 918 Z-score: 960.7 bits: 187.3 E(85289): 9e-47
Smith-Waterman score: 918; 37.5% identity (67.2% similar) in 424 aa overlap (27-435:43-457)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCL
::::: : :: . :: .:.:::..: .
NP_055 LDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
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pF1KB5 A-----GGYDTIFS---LCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPIC
: :. .. : :::: .: :..:::. .::. :.. : :..:. . .: .
NP_055 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
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pF1KB5 FKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRR--C--
: .:...: .: .:.::... .:.:: : . :. . .: . . :
NP_055 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYF-RRKELSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
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170 180 190 200 210 220
pF1KB5 -QKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLE
.. .:..:::: :: ::. .:.:.....:: . : . . ::. :: . ::
NP_055 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSA-ELSWLDLQ-------LLE
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230 240 250 260 270 280
pF1KB5 NVETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARM--ME
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NP_055 ILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQTTQE
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290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSAL
: :: . ::.::..: :..::.:::.::..: ... . ..:.::::..:.::: .::..
NP_055 LENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTV
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pF1KB5 GYTMEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALP
: ::: :.: : :.: ..::: .::::::::: : :: ::. : . .: :....:::
NP_055 EYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALP
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pF1KB5 IHPIINNFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEA
: : . : : .. :.:.... : .:...
NP_055 IAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLK
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470 480 490
pF1KB5 PSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
NP_055 GRERASTRSSGGDDFWF
490 500
>>XP_016881193 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta (509 aa)
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10 20 30
pF1KB5 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIE-IVVNVGG
: . : : : : ..... . ...::::
XP_016 AGLSCVFTGSLKENTLYLHRARSRAGAPRSGPALRMEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGG
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40 50 60 70 80 90
pF1KB5 VRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIE
: : :.. : .:: .: : :.: .. .::::: .. ::.:::.: ::. ..
XP_016 CRVRLAWAALARCPLARLERLRAC--RGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVA
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pF1KB5 VYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDD
. :.... .: : . :..:. .: .: :. :: .: ...:: : ::
XP_016 LLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAE-ARAGPTERGA
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KB5 LGVDA----AEGRWRRCQKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPEL
: : .:: .: .. . ...:.:. ... : .: .. :..: .:..:.:..
XP_016 QGSPARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDI
190 200 210 220 230 240
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pF1KB5 QVLDAEGN-RVEHPTLENVETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPF
.. . .:. . .: .::.:..::..:.::: ... .: : . .::.:.::.:::
XP_016 RAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPF
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270 280 290 300 310 320
pF1KB5 YVSLTLTHL----GARMMELTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFK
:::: : :....: ... ... :: .:. ...::::: ::..: ...: .
XP_016 YVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGL--VLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAR
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pF1KB5 ELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQS-HPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTT
:.::::..: :.. .:. : . :. . :.:.: :.:::.:.::::::::. :..
XP_016 EFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSL
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pF1KB5 LGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFVRYYNK-QRVLETAAKHELELME--LNSSSGG
:.. : :.: :.. .:.:. :...: : :.. .. . ::. : :.: .:...
XP_016 PGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATAT
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440 450 460 470 480 490
pF1KB5 EGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
: .. : :
XP_016 EDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR
490 500
>>NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated chann (466 aa)
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10 20 30 40 50
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: : : ..... . ...:::: : : :.. : .:: .: : :
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10 20 30 40 50
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:. :: .: ...:: : :: : : .:: .: .. . ...:
NP_036 EARLERCCLRRLRRREEEAAE-ARAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNP
120 130 140 150 160 170
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.:. ... : .: .. :..: .:..:.:.... . .:. . .: .::.:..::.
NP_036 HSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFS
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 LEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL----GARMMELTNVQQAVQ
.:.::: ... .: : . .::.:.::.::::::: : :....: ... ...
NP_036 FEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGL--VLR
240 250 260 270 280
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pF1KB5 ALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQS-H
:: .:. ...::::: ::..: ...: .:.::::..: :.. .:. : . :.
NP_036 LLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELG
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pF1KB5 PETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNF
. :.:.: :.:::.:.::::::::. :.. :.. : :.: :.. .:.:. :...:
NP_036 ARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTF
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pF1KB5 VRYYNK-QRVLETAAKHELELME--LNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSS
: :.. .. . ::. : :.: .:... : .. : :
NP_036 SRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR
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pF1KB5 RLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
>>XP_016881194 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta (466 aa)
initn: 709 init1: 250 opt: 874 Z-score: 915.3 bits: 178.8 E(85289): 3e-44
Smith-Waterman score: 875; 32.5% identity (65.9% similar) in 452 aa overlap (10-447:3-449)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIE-IVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGG
: : : ..... . ...:::: : : :.. : .:: .: : :
XP_016 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACR--G
10 20 30 40 50
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pF1KB5 YDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVD
.: .. .::::: .. ::.:::.: ::. .. . :.... .: : . :..:. .: .:
XP_016 HDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGID
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pF1KB5 LKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDA----AEGRWRRCQKCVWKFLEKP
:. :: .: ...:: : :: : : .:: .: .. . ...:
XP_016 EARLERCCLRRLRRREEEAAE-ARAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNP
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.:. ... : .: .. :..: .:..:.:.... . .:. . .: .::.:..::.
XP_016 HSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFS
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pF1KB5 LEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL----GARMMELTNVQQAVQ
.:.::: ... .: : . .::.:.::.::::::: : :....: ... ...
XP_016 FEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGL--VLR
240 250 260 270 280
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pF1KB5 ALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQS-H
:: .:. ...::::: ::..: ...: .:.::::..: :.. .:. : . :.
XP_016 LLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELG
290 300 310 320 330 340
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pF1KB5 PETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNF
. :.:.: :.:::.:.::::::::. :.. :.. : :.: :.. .:.:. :...:
XP_016 ARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTF
350 360 370 380 390 400
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pF1KB5 VRYYNK-QRVLETAAKHELELME--LNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSS
: :.. .. . ::. : :.: .:... : .. : :
XP_016 SRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR
410 420 430 440 450 460
470 480 490
pF1KB5 RLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
>>XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium volta (466 aa)
initn: 709 init1: 250 opt: 874 Z-score: 915.3 bits: 178.8 E(85289): 3e-44
Smith-Waterman score: 875; 32.5% identity (65.9% similar) in 452 aa overlap (10-447:3-449)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIE-IVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGG
: : : ..... . ...:::: : : :.. : .:: .: : :
XP_011 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACR--G
10 20 30 40 50
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pF1KB5 YDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVD
.: .. .::::: .. ::.:::.: ::. .. . :.... .: : . :..:. .: .:
XP_011 HDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGID
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pF1KB5 LKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDA----AEGRWRRCQKCVWKFLEKP
:. :: .: ...:: : :: : : .:: .: .. . ...:
XP_011 EARLERCCLRRLRRREEEAAE-ARAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNP
120 130 140 150 160 170
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.:. ... : .: .. :..: .:..:.:.... . .:. . .: .::.:..::.
XP_011 HSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFS
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pF1KB5 LEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL----GARMMELTNVQQAVQ
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XP_011 FEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGL--VLR
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pF1KB5 ALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQS-H
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