Result of FASTA (omim) for
pFN21AB6653
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6653, 409 aa
1>>>pF1KB6653 409 - 409 aa - 409 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2080+/-0.000302; mu= 13.7165+/- 0.019
mean_var=91.6062+/-18.475, 0's: 0 Z-trim(118.9): 27 B-trim: 19 in 1/54
Lambda= 0.134002
statistics sampled from 32315 (32342) to 32315 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 9.330
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004304 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isoform 1 ( 409) 2761 543.5 3.5e-154
XP_011522160 (OMIM: 107941) PREDICTED: beta-arrest ( 440) 2711 533.8 3.1e-151
NP_001244259 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 421) 2449 483.2 5.2e-136
NP_945355 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isoform 2 ( 394) 2412 476.0 7e-134
NP_064647 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform B ( 410) 2176 430.4 3.9e-120
XP_011543337 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 441) 2154 426.2 8e-119
NP_004032 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform A ( 418) 2150 425.4 1.3e-118
XP_011543336 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 449) 2128 421.1 2.6e-117
NP_001244260 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 406) 2100 415.7 1e-115
XP_016873243 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 434) 2060 408.0 2.3e-113
XP_016873240 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 465) 2038 403.7 4.7e-112
XP_016873241 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 442) 2034 403.0 7.7e-112
XP_016873239 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 473) 2012 398.7 1.6e-110
XP_016873242 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrest ( 437) 2003 397.0 4.9e-110
NP_001244257 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 430) 1932 383.2 6.5e-106
NP_001244258 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 330) 1790 355.7 9.6e-98
NP_001316993 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isofor ( 217) 1429 285.8 6.9e-77
NP_004303 (OMIM: 301770) arrestin-C [Homo sapiens] ( 388) 1400 280.4 5.4e-75
XP_016860130 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 373) 1383 277.1 5.1e-74
XP_016860131 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 369) 1378 276.1 1e-73
NP_000532 (OMIM: 181031,258100,613758) S-arrestin ( 405) 1378 276.1 1.1e-73
XP_016885007 (OMIM: 301770) PREDICTED: arrestin-C ( 403) 1241 249.6 1e-65
XP_016880134 (OMIM: 107941) PREDICTED: beta-arrest ( 229) 1117 225.5 1e-58
XP_016860132 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 273) 1001 203.1 6.8e-52
XP_011509896 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 281) 909 185.4 1.6e-46
XP_011509895 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 305) 909 185.4 1.7e-46
XP_011509898 (OMIM: 181031,258100,613758) PREDICTE ( 271) 864 176.6 6.3e-44
>>NP_004304 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isoform 1 [Ho (409 aa)
initn: 2761 init1: 2761 opt: 2761 Z-score: 2888.9 bits: 543.5 E(85289): 3.5e-154
Smith-Waterman score: 2761; 100.0% identity (100.0% similar) in 409 aa overlap (1-409:1-409)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 AAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
370 380 390 400
>>XP_011522160 (OMIM: 107941) PREDICTED: beta-arrestin-2 (440 aa)
initn: 2711 init1: 2711 opt: 2711 Z-score: 2836.2 bits: 533.8 E(85289): 3.1e-151
Smith-Waterman score: 2711; 100.0% identity (100.0% similar) in 402 aa overlap (8-409:39-440)
10 20 30
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDP
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGRSQTRAQRRGSGGRTPGSLGTAIRGRTRRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 VDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTCAFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTCAFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRP
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 PTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 KSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 NVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITP
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVS
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 VELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLK
370 380 390 400 410 420
400
pF1KB6 GMKDDDYDDQLC
::::::::::::
XP_011 GMKDDDYDDQLC
430 440
>>NP_001244259 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isoform 5 (421 aa)
initn: 2461 init1: 2434 opt: 2449 Z-score: 2562.8 bits: 483.2 E(85289): 5.2e-136
Smith-Waterman score: 2727; 97.1% identity (97.1% similar) in 421 aa overlap (1-409:1-421)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 A------------APETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQL
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APTPTPPLPVPPAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQL
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 C
:
NP_001 C
>>NP_945355 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isoform 2 [Ho (394 aa)
initn: 2398 init1: 2398 opt: 2412 Z-score: 2524.5 bits: 476.0 E(85289): 7e-134
Smith-Waterman score: 2619; 96.3% identity (96.3% similar) in 409 aa overlap (1-409:1-394)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
NP_945 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPV---------------VFVTLTC
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_945 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_945 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_945 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_945 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_945 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400
pF1KB6 AAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_945 AAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
350 360 370 380 390
>>NP_064647 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform B [Ho (410 aa)
initn: 2093 init1: 1975 opt: 2176 Z-score: 2277.7 bits: 430.4 E(85289): 3.9e-120
Smith-Waterman score: 2176; 77.9% identity (93.4% similar) in 407 aa overlap (1-407:1-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
::.: :::::::.::: ::::::::::::::.: ::::::::::::.:::.:.:.:::::
NP_064 MGDK-GTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .: ::::.::..:::.::.:: : :
NP_064 AFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
: ::::::::::::::::::::::.:..::::..:::: ::::::::::::::.:::.::
NP_064 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
:::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..::::::::..:::::::.::::::
NP_064 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
:::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.::.:..:::::::::::::::::::
NP_064 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
:::::...::::.:.:::.:::.:::::::::::::.:::::.::::::... : :.
NP_064 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGDVAVELPFTLMHPKPKEE---P-PHR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400
pF1KB6 AAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
.::...::::::::.::: ::::::::::: :::::::: ...
NP_064 EVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
360 370 380 390 400 410
>>XP_011543337 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrestin-1 (441 aa)
initn: 2082 init1: 1964 opt: 2154 Z-score: 2254.3 bits: 426.2 E(85289): 8e-119
Smith-Waterman score: 2154; 77.8% identity (93.5% similar) in 401 aa overlap (7-407:37-430)
10 20 30
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVD
.:::::.::: ::::::::::::::.: ::
XP_011 RERLRLHARRIQTLAFHPPQHPGAGCVALLSRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 PVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTCAFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPR
::::::::::.:::.:.:.:::::::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .
XP_011 PVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCAFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 PPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLE
: ::::.::..:::.::.:: : :: ::::::::::::::::::::::.:..::::..::
XP_011 PLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 EKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLN
:: ::::::::::::::.:::.:::::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..
XP_011 EKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPIS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 VNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTIT
::::::::..:::::::.:::::::::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.:
XP_011 VNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 PLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDV
:.:..::::::::::::::::::::::::...::::.:.:::.:::.:::::::::::::
XP_011 PFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGDV
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 SVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRL
.:::::.::::::... : :. .::...::::::::.::: ::::::::::: ::
XP_011 AVELPFTLMHPKPKEE---P-PHREVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVFEDFARQRL
370 380 390 400 410
400
pF1KB6 KGMKDDDYDDQLC
:::::: ...
XP_011 KGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
420 430 440
>>NP_004032 (OMIM: 107940) beta-arrestin-1 isoform A [Ho (418 aa)
initn: 2079 init1: 1870 opt: 2150 Z-score: 2250.4 bits: 425.4 E(85289): 1.3e-118
Smith-Waterman score: 2150; 76.4% identity (91.6% similar) in 415 aa overlap (1-407:1-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
::.: :::::::.::: ::::::::::::::.: ::::::::::::.:::.:.:.:::::
NP_004 MGDK-GTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .: ::::.::..:::.::.:: : :
NP_004 AFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
: ::::::::::::::::::::::.:..::::..:::: ::::::::::::::.:::.::
NP_004 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
:::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..::::::::..:::::::.::::::
NP_004 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
:::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.::.:..:::::::::::::::::::
NP_004 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG--------DVSVELPFVLMHPKPHDH
:::::...::::.:.:::.:::.::::::::::: ::.:::::.::::::...
NP_004 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB6 IPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
: :. .::...::::::::.::: ::::::::::: :::::::: ...
NP_004 ---P-PHREVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGS
360 370 380 390 400 410
NP_004 PQLNNR
>>XP_011543336 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrestin-1 (449 aa)
initn: 2068 init1: 1859 opt: 2128 Z-score: 2227.0 bits: 421.1 E(85289): 2.6e-117
Smith-Waterman score: 2128; 76.3% identity (91.7% similar) in 409 aa overlap (7-407:37-438)
10 20 30
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVD
.:::::.::: ::::::::::::::.: ::
XP_011 RERLRLHARRIQTLAFHPPQHPGAGCVALLSRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 PVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTCAFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPR
::::::::::.:::.:.:.:::::::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .
XP_011 PVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCAFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 PPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLE
: ::::.::..:::.::.:: : :: ::::::::::::::::::::::.:..::::..::
XP_011 PLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 EKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLN
:: ::::::::::::::.:::.:::::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..
XP_011 EKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPIS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 VNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTIT
::::::::..:::::::.:::::::::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.:
XP_011 VNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 PLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG--
:.:..::::::::::::::::::::::::...::::.:.:::.:::.:::::::::::
XP_011 PFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KB6 ------DVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVF
::.:::::.::::::... : :. .::...::::::::.::: ::::::
XP_011 GDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEE---P-PHREVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVF
370 380 390 400 410
390 400
pF1KB6 EDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
::::: :::::::: ...
XP_011 EDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
420 430 440
>>NP_001244260 (OMIM: 107941) beta-arrestin-2 isoform 6 (406 aa)
initn: 2322 init1: 2071 opt: 2100 Z-score: 2198.4 bits: 415.7 E(85289): 1e-115
Smith-Waterman score: 2585; 93.6% identity (93.6% similar) in 421 aa overlap (1-409:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
NP_001 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPV---------------VFVTLTC
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400
pF1KB6 A------------APETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQL
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APTPTPPLPVPPAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQL
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 C
:
NP_001 C
>>XP_016873243 (OMIM: 107940) PREDICTED: beta-arrestin-1 (434 aa)
initn: 2093 init1: 1975 opt: 2060 Z-score: 2156.1 bits: 408.0 E(85289): 2.3e-113
Smith-Waterman score: 2142; 74.1% identity (89.3% similar) in 428 aa overlap (1-407:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
::.: :::::::.::: ::::::::::::::.: ::::::::::::.:::.:.:.:::::
XP_016 MGDK-GTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .: ::::.::..:::.::.:: : :
XP_016 AFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
: ::::::::::::::::::::::.:..::::..:::: ::::::::::::::.:::.::
XP_016 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
:::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..::::::::..:::::::.::::::
XP_016 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
:::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.::.:..:::::::::::::::::::
XP_016 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
:::::...::::.:.:::.:::.:::::::::::::.:::::.::::::... : :.
XP_016 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGDVAVELPFTLMHPKPKEE---P-PHR
300 310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KB6 AAPETDVPVDTNLIEFDTNY---------------------ATDDDIVFEDFARLRLKGM
.::...::::::::.::: ..::::::::::: :::::
XP_016 EVPENETPVDTNLIELDTNQRPSSHRTVARGGGPGPTARTASSDDDIVFEDFARQRLKGM
360 370 380 390 400 410
400
pF1KB6 KDDDYDDQLC
::: ...
XP_016 KDDKEEEEDGTGSPQLNNR
420 430
409 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:39:47 2016 done: Sat Nov 5 11:39:49 2016
Total Scan time: 9.330 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]