Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6653
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6653, 409 aa
1>>>pF1KB6653 409 - 409 aa - 409 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0410+/-0.000713; mu= 14.5012+/- 0.043
mean_var=85.0428+/-16.839, 0's: 0 Z-trim(111.5): 12 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.139077
statistics sampled from 12405 (12415) to 12405 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.727), E-opt: 0.2 (0.381), width: 16
Scan time: 2.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11050.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 409) 2761 563.4 1.4e-160
CCDS11051.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 394) 2412 493.3 1.6e-139
CCDS31640.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 ( 410) 2176 446.0 3e-125
CCDS44684.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 ( 418) 2150 440.8 1.1e-123
CCDS58505.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 406) 2100 430.7 1.2e-120
CCDS58504.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 430) 1932 397.0 1.7e-110
CCDS59276.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 330) 1790 368.5 5.2e-102
CCDS82039.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 ( 217) 1429 296.0 2.3e-80
CCDS14399.1 ARR3 gene_id:407|Hs108|chrX ( 388) 1400 290.3 2.2e-78
CCDS46545.1 SAG gene_id:6295|Hs108|chr2 ( 405) 1378 285.9 4.8e-77
>>CCDS11050.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (409 aa)
initn: 2761 init1: 2761 opt: 2761 Z-score: 2996.4 bits: 563.4 E(32554): 1.4e-160
Smith-Waterman score: 2761; 100.0% identity (100.0% similar) in 409 aa overlap (1-409:1-409)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 AAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
370 380 390 400
>>CCDS11051.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (394 aa)
initn: 2398 init1: 2398 opt: 2412 Z-score: 2618.2 bits: 493.3 E(32554): 1.6e-139
Smith-Waterman score: 2619; 96.3% identity (96.3% similar) in 409 aa overlap (1-409:1-394)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS11 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPV---------------VFVTLTC
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400
pF1KB6 AAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
350 360 370 380 390
>>CCDS31640.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 (410 aa)
initn: 2093 init1: 1975 opt: 2176 Z-score: 2362.0 bits: 446.0 E(32554): 3e-125
Smith-Waterman score: 2176; 77.9% identity (93.4% similar) in 407 aa overlap (1-407:1-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
::.: :::::::.::: ::::::::::::::.: ::::::::::::.:::.:.:.:::::
CCDS31 MGDK-GTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .: ::::.::..:::.::.:: : :
CCDS31 AFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
: ::::::::::::::::::::::.:..::::..:::: ::::::::::::::.:::.::
CCDS31 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
:::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..::::::::..:::::::.::::::
CCDS31 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
:::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.::.:..:::::::::::::::::::
CCDS31 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
:::::...::::.:.:::.:::.:::::::::::::.:::::.::::::... : :.
CCDS31 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGDVAVELPFTLMHPKPKEE---P-PHR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400
pF1KB6 AAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
.::...::::::::.::: ::::::::::: :::::::: ...
CCDS31 EVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGSPQLNNR
360 370 380 390 400 410
>>CCDS44684.1 ARRB1 gene_id:408|Hs108|chr11 (418 aa)
initn: 2079 init1: 1870 opt: 2150 Z-score: 2333.7 bits: 440.8 E(32554): 1.1e-123
Smith-Waterman score: 2150; 76.4% identity (91.6% similar) in 415 aa overlap (1-407:1-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
::.: :::::::.::: ::::::::::::::.: ::::::::::::.:::.:.:.:::::
CCDS44 MGDK-GTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::.::::::.:. :.:::.:. .: ::::.::..:::.::.:: : :
CCDS44 AFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
: ::::::::::::::::::::::.:..::::..:::: ::::::::::::::.:::.::
CCDS44 PPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
:::.:::::.:::::. ::::::::::.::::::..::::::::..:::::::.::::::
CCDS44 PQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
:::::.:::::::::. : :: :.::::::::::.::.:..:::::::::::::::::::
CCDS44 DICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG--------DVSVELPFVLMHPKPHDH
:::::...::::.:.:::.:::.::::::::::: ::.:::::.::::::...
CCDS44 LASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB6 IPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
: :. .::...::::::::.::: ::::::::::: :::::::: ...
CCDS44 ---P-PHREVPENETPVDTNLIELDTN---DDDIVFEDFARQRLKGMKDDKEEEEDGTGS
360 370 380 390 400 410
CCDS44 PQLNNR
>>CCDS58505.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (406 aa)
initn: 2322 init1: 2071 opt: 2100 Z-score: 2279.6 bits: 430.7 E(32554): 1.2e-120
Smith-Waterman score: 2585; 93.6% identity (93.6% similar) in 421 aa overlap (1-409:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS58 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPV---------------VFVTLTC
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIPLPRPQS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400
pF1KB6 A------------APETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQL
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 APTPTPPLPVPPAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQL
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 C
:
CCDS58 C
>>CCDS58504.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (430 aa)
initn: 1932 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2097.1 bits: 397.0 E(32554): 1.7e-110
Smith-Waterman score: 2709; 95.1% identity (95.1% similar) in 430 aa overlap (1-409:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFT-
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KB6 --------------------IPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RMPLPSEGQGAGAGTVSGVGIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 HKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 HVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 SDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SDNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 LPFVLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPFVLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGM
370 380 390 400 410 420
400
pF1KB6 KDDDYDDQLC
::::::::::
CCDS58 KDDDYDDQLC
430
>>CCDS59276.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (330 aa)
initn: 1790 init1: 1790 opt: 1790 Z-score: 1944.8 bits: 368.5 E(32554): 5.2e-102
Smith-Waterman score: 1790; 100.0% identity (100.0% similar) in 262 aa overlap (1-262:1-262)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHAHPFFFTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDTN
::::::::::::::::::::::
CCDS59 DICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQREGGCQQGGAGNPGVLQGQGEAGGVSRRGCLCGAAFCS
250 260 270 280 290 300
>>CCDS82039.1 ARRB2 gene_id:409|Hs108|chr17 (217 aa)
initn: 1429 init1: 1429 opt: 1429 Z-score: 1556.1 bits: 296.0 E(32554): 2.3e-80
Smith-Waterman score: 1429; 100.0% identity (100.0% similar) in 217 aa overlap (193-409:1-217)
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 NSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVT
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 NNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NNSTKTVKKIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDN
40 50 60 70 80 90
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 REKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 REKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPF
100 110 120 130 140 150
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 VLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VLMHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDD
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 DYDDQLC
:::::::
CCDS82 DYDDQLC
>>CCDS14399.1 ARR3 gene_id:407|Hs108|chrX (388 aa)
initn: 1001 init1: 927 opt: 1400 Z-score: 1520.9 bits: 290.3 E(32554): 2.2e-78
Smith-Waterman score: 1400; 58.5% identity (81.8% similar) in 352 aa overlap (7-349:2-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTC
..::::.: : ::..::::::::::.: :.:.::::::::.::: ::.:: :::
CCDS14 MSKVFKKTSSNGKLSIYLGKRDFVDHVDTVEPIDGVVLVDPEYLKCRKLFVMLTC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 AFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPP-TRLQDRLLRKLGQHAHPFFFT
::::::.::.:.::.:::::.. : :. : . :. : : ::.:::.:::..:.:: .
CCDS14 AFRYGRDDLEVIGLTFRKDLYVQTLQVVPAESSSPQGPLTVLQERLLHKLGDNAYPFTLQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 IPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKP
. ::::::::::::::.:: ::.:::...:::.. :: ::. ::::.::::::: .
CCDS14 MVTNLPCSVTLQPGPEDAGKPCGIDFEVKSFCAENPEETVSKRDYVRLVVRKVQFAPPEA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQY
:: :::.: :.::.: . :.:.: .:.:..:::::..::: ..: ..:..::::.:: :
CCDS14 GPGPSAQTIRRFLLSAQPLQLQAWMDREVHYHGEPISVNVSINNCTNKVIKKIKISVDQI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 ADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLALDGKLKHEDT
.:. :.: .: : : . :. .:.: . ...::.:. . .:::::::::::::::
CCDS14 TDVVLYSLDKYTKTVFIQEFTETVAANSSFSQSFAVTPILAASCQKRGLALDGKLKHEDT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 NLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGG--------DVSVELPFVLMHPKPHD
:::::::.. : .::.:::::::.:.:.:.:: :: ::.::::.::.::::
CCDS14 NLASSTIIRPGMDKELLGILVSYKVRVNLMVSCGGILGDLTASDVGVELPLVLIHPKPSH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB6 HIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDYDDQLC
CCDS14 EAASSEDIVIEEFTRKGEEESQKAVEAEGDEGS
360 370 380
>>CCDS46545.1 SAG gene_id:6295|Hs108|chr2 (405 aa)
initn: 1158 init1: 683 opt: 1378 Z-score: 1496.7 bits: 285.9 E(32554): 4.8e-77
Smith-Waterman score: 1380; 53.3% identity (77.9% similar) in 403 aa overlap (4-397:11-388)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MGEKPGTRVFKKSSPNCKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRK
.:. .::: : . ..:.:::.::..::...:.::::::::::: .: .:
CCDS46 MAASGKTSKSEPNHVIFKKISRDKSVTIYLGNRDYIDHVSQVQPVDGVVLVDPDLVKGKK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 VFVTLTCAFRYGREDLDVLGLSFRKDLFIATYQAFPPVPNPPRPPTRLQDRLLRKLGQHA
:.::::::::::.::.::.::.::.::... :..::: . ::.::. ::.:::...
CCDS46 VYVTLTCAFRYGQEDIDVIGLTFRRDLYFSRVQVYPPV-GAASTPTKLQESLLKKLGSNT
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 HPFFFTIPQNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDFEIRAFCAKSL---EEKSHKRNSVRLVIR
.::..:.:. ::::: :::.:.:.::.::::::..:: . : :.: :..::::.::
CCDS46 YPFLLTFPDYLPCSVMLQPAPQDSGKSCGVDFEVKAFATDSTDAEEDKIPKKSSVRLLIR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 KVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVK
::: :: . :::: ::.. .:.:::. ::: .::.::.:.::::. :.: ::::. ::::
CCDS46 KVQHAPLEMGPQPRAEAAWQFFMSDKPLHLAVSLNKEIYFHGEPIPVTVTVTNNTEKTVK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KIKVSVRQYADICLFSTAQYKCPVAQLEQDDQVSPSSTFCKVYTITPLLSDNREKRGLAL
:::. :.: :.. :.:. : :::. : ...: :.::. :. :. :::..:::.::.::
CCDS46 KIKAFVEQVANVVLYSSDYYVKPVAMEEAQEKVPPNSTLTKTLTLLPLLANNRERRGIAL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB6 DGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVS------RGGDVSVELPFVL
:::.::::::::::::.::: .. ::::::::..::::.:: ...:..:.:: :
CCDS46 DGKIKHEDTNLASSTIIKEGIDRTVLGILVSYQIKVKLTVSGFLGELTSSEVATEVPFRL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 MHPKPHDHIPLPRPQSAAPETDVPVDTNLIEFDTNYATDDDIVFEDFARLRLKGMKDDDY
:::.:.: : . :.:: :::.::: ::
CCDS46 MHPQPED-----------PAKESYQDANL-------------VFEEFARHNLKDAGEAEE
360 370 380 390
pF1KB6 DDQLC
CCDS46 GKRDKNDVDE
400
409 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:39:46 2016 done: Sat Nov 5 11:39:47 2016
Total Scan time: 2.900 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]