Result of FASTA (ccds) for pFN21AB6629
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6629, 415 aa
  1>>>pF1KB6629 415 - 415 aa - 415 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1314+/-0.0013; mu= -5.6100+/- 0.075
 mean_var=440.1472+/-102.600, 0's: 0 Z-trim(109.2): 182  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.061133
 statistics sampled from 10552 (10710) to 10552 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.329), width:  16
 Scan time:  3.040

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11805.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17        ( 415) 2777 259.9 3.3e-69
CCDS11806.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17        ( 409) 2676 250.9 1.6e-66
CCDS13970.1 CSNK1E gene_id:1454|Hs108|chr22        ( 416) 2309 218.6 8.9e-57
CCDS64291.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5        ( 325) 1573 153.5 2.7e-37
CCDS47303.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5        ( 337) 1573 153.6 2.7e-37
CCDS9363.1 CSNK1A1L gene_id:122011|Hs108|chr13     ( 337) 1510 148.0 1.3e-35
CCDS59491.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5        ( 424) 1223 122.8 6.1e-28
CCDS34218.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5        ( 423) 1212 121.8 1.2e-27
CCDS12077.1 CSNK1G2 gene_id:1455|Hs108|chr19       ( 415) 1208 121.5 1.5e-27
CCDS4135.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5         ( 447) 1203 121.1 2.1e-27
CCDS43355.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5        ( 455) 1203 121.1 2.2e-27
CCDS10192.2 CSNK1G1 gene_id:53944|Hs108|chr15      ( 422) 1190 119.9 4.6e-27
CCDS59492.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5        ( 348) 1084 110.4 2.7e-24
CCDS59493.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5        ( 311)  974 100.7 2.1e-21
CCDS47304.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5        ( 365)  848 89.7   5e-18
CCDS34455.1 TTBK1 gene_id:84630|Hs108|chr6         (1321)  626 70.8 8.8e-12


>>CCDS11805.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17             (415 aa)
 initn: 2777 init1: 2777 opt: 2777  Z-score: 1355.9  bits: 259.9 E(32554): 3.3e-69
Smith-Waterman score: 2777; 100.0% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 ADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTANTSPRPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTANTSPRPV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410     
pF1KB6 SGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQIPGRVASSGLQSVVHR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQIPGRVASSGLQSVVHR
              370       380       390       400       410     

>>CCDS11806.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17             (409 aa)
 initn: 2675 init1: 2675 opt: 2676  Z-score: 1307.8  bits: 250.9 E(32554): 1.6e-66
Smith-Waterman score: 2676; 99.5% identity (99.5% similar) in 403 aa overlap (1-401:1-403)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 ADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTANTSPRPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTANTSPRPV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390         400       410     
pF1KB6 SGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQ--IPGRVASSGLQSVVHR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  ::              
CCDS11 SGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQNSIPFEHHGK        
              370       380       390       400                 

>>CCDS13970.1 CSNK1E gene_id:1454|Hs108|chr22             (416 aa)
 initn: 2032 init1: 2032 opt: 2309  Z-score: 1132.8  bits: 218.6 E(32554): 8.9e-57
Smith-Waterman score: 2309; 85.0% identity (94.3% similar) in 406 aa overlap (1-399:1-406)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQ
       :::::::.::::::::::::::::::..::.:::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS13 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKFYKMMQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
       ::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 CKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGASRA
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: 
CCDS13 CKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKFGAARN
              250       260       270       280       290       300

              310         320            330       340       350   
pF1KB6 ADDAERERRD--REERLRHSRNPATRGLP-----STASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTA
        .:..::::.  ::::. . :. :::.::     .....:::.. : .  :: .  . ..
CCDS13 PEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTPASRIQPAG
              310       320       330       340       350       360

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB6 NTSPRPVSGMERERKVSMRLHRGAPVNISSSDLTGRQDTSRMSTSQIPGRVASSGLQSVV
       ::::: .: ..::::::::::::::.:.:::::::::..::. .::              
CCDS13 NTSPRAISRVDRERKVSMRLHRGAPANVSSSDLTGRQEVSRIPASQTSVPFDHLGK    
              370       380       390       400       410          

         
pF1KB6 HR

>>CCDS64291.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5             (325 aa)
 initn: 1568 init1: 1568 opt: 1573  Z-score: 783.2  bits: 153.5 E(32554): 2.7e-37
Smith-Waterman score: 1573; 75.0% identity (91.0% similar) in 300 aa overlap (2-301:10-309)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB6         MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
                :. ::..:.: :::::::::::::. .:. :::::.:::  :..::::  :
CCDS64 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB6 SKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
       ::.::..::::::: ::: : : ::::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS64 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
               70        80        90       100       110       120

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB6 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
       ::::::.:.:::::::.::::::::.:.. : ...::::::::::: ::.:::::::.::
CCDS64 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
              130       140       150       160       170       180

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB6 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
       :::::::::::.:::::::::::.:::::::::::  ::::::::::::.::::.:::::
CCDS64 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
              190       200       210       220       230       240

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB6 MSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
       ::::.::::::.:.::: :::.::.:::.. ::: ::::::: ::.  . .:::.:::.:
CCDS64 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
              250       260       270       280       290       300

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB6 LKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHT
       ::  :.. :                                                   
CCDS64 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF                                   
              310       320                                        

>>CCDS47303.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5             (337 aa)
 initn: 1568 init1: 1568 opt: 1573  Z-score: 783.0  bits: 153.6 E(32554): 2.7e-37
Smith-Waterman score: 1573; 75.0% identity (91.0% similar) in 300 aa overlap (2-301:10-309)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB6         MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
                :. ::..:.: :::::::::::::. .:. :::::.:::  :..::::  :
CCDS47 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB6 SKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
       ::.::..::::::: ::: : : ::::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS47 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
               70        80        90       100       110       120

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB6 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
       ::::::.:.:::::::.::::::::.:.. : ...::::::::::: ::.:::::::.::
CCDS47 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB6 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
       :::::::::::.:::::::::::.:::::::::::  ::::::::::::.::::.:::::
CCDS47 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB6 MSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
       ::::.::::::.:.::: :::.::.:::.. ::: ::::::: ::.  . .:::.:::.:
CCDS47 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
              250       260       270       280       290       300

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pF1KB6 LKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHT
       ::  :.. :                                                   
CCDS47 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF                       
              310       320       330                              

>>CCDS9363.1 CSNK1A1L gene_id:122011|Hs108|chr13          (337 aa)
 initn: 1505 init1: 1505 opt: 1510  Z-score: 753.0  bits: 148.0 E(32554): 1.3e-35
Smith-Waterman score: 1510; 71.3% identity (88.7% similar) in 300 aa overlap (2-301:10-309)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB6         MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
                :: ::..:.: ::::::::::.:::   . ::.::.:::  :.:::::  :
CCDS93 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEDVAVKLESQKVKHPQLLYE
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB6 SKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
       ::.: ..::::::: ..: : : : ::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS93 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB6 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
       ::::::.:.:::.:::.:::::::: :.. : ...::::::::::: ::.:::::::.:.
CCDS93 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB6 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
       : ::.::::::.:::::::::::.::::::.::::  :::::::.: ::.::::.:::::
CCDS93 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLRAMTKKQKYEKISEKK
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB6 MSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
       ::::.::::::.:.::: :::.::.:::.. ::: ::::::: ::.  . .:::.:::.:
CCDS93 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
              250       260       270       280       290       300

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pF1KB6 LKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHT
       ::  :.. :                                                   
CCDS93 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN                       
              310       320       330                              

>>CCDS59491.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5             (424 aa)
 initn: 1206 init1: 667 opt: 1223  Z-score: 615.1  bits: 122.8 E(32554): 6.1e-28
Smith-Waterman score: 1223; 51.1% identity (77.6% similar) in 370 aa overlap (3-364:37-396)

                                           10        20        30  
pF1KB6                             MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAG
                                     : ::  .:.:.::: :.::.. :: .. ..
CCDS59 DKDKSDDRMARPSGRSGHNTRGTGSSSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLGKNLYTN
         10        20        30        40        50        60      

             40        50        60        70        80        90  
pF1KB6 EEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDL
       : :::::: .:.. ::::.: ..::.. .: ::: . . :  : ::.::.::::::::::
CCDS59 EYVAIKLEPMKSRAPQLHLEYRFYKQLGSGDGIPQVYYFGPCGKYNAMVLELLGPSLEDL
         70        80        90       100       110       120      

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pF1KB6 FNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGL--GKKGNLVYIIDF
       :..:.: :::::::..: :.:::.::.::::.:.:::::.:::.:   .:  ....::::
CCDS59 FDLCDRTFSLKTVLMIAIQLISRMEYVHSKNLIYRDVKPENFLIGRPGNKTQQVIHIIDF
        130       140       150       160       170       180      

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pF1KB6 GLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGS
       ::::.: : .:..::::::.:.::::::: ::::::: :::::::::.::...:::  ::
CCDS59 GLAKEYIDPETKKHIPYREHKSLTGTARYMSINTHLGKEQSRRDDLEALGHMFMYFLRGS
        190       200       210       220       230       240      

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pF1KB6 LPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLR
       :::::::: : ...:..:.. : .:::::::...: :.:::: . : : : .::::.:::
CCDS59 LPWQGLKADTLKERYQKIGDTKRATPIEVLCENFPEEMATYLRYVRRLDFFEKPDYDYLR
        250       260       270       280       290       300      

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pF1KB6 QLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKF----GASRA--ADDAERERRDREERLRHSRNPATR
       .:: .:: :.:. .:: .::   ..    :: .   : ...:: .........:.: .. 
CCDS59 KLFTDLFDRKGYMFDYEYDWIGKQLPTPVGAVQQDPALSSNREAHQHRDKMQQSKNQVV-
        310       320       330       340       350       360      

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pF1KB6 GLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTANTSPRPVSGMERERKVSMRLHRGAPVNISSS
          :...:      :.    : .  :..  :.:  :  :.                    
CCDS59 ---SSTNG------ELNTDDPTAGRSNAPITAPTEVEVMDETNCQKVLNMWCCCFFKRRK
            370             380       390       400       410      

          390       400       410     
pF1KB6 DLTGRQDTSRMSTSQIPGRVASSGLQSVVHR
                                      
CCDS59 RKTIQRHK                       
        420                           

>>CCDS34218.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5             (423 aa)
 initn: 1193 init1: 553 opt: 1212  Z-score: 609.8  bits: 121.8 E(32554): 1.2e-27
Smith-Waterman score: 1212; 51.1% identity (77.6% similar) in 370 aa overlap (3-364:37-395)

                                           10        20        30  
pF1KB6                             MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAG
                                     : ::  .:.:.::: :.::.. :: .. ..
CCDS34 DKDKSDDRMARPSGRSGHNTRGTGSSSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLGKNLYTN
         10        20        30        40        50        60      

             40        50        60        70        80        90  
pF1KB6 EEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDL
       : :::::: .:.. ::::.: ..::.. .: ::: . . :  : ::.::.::::::::::
CCDS34 EYVAIKLEPMKSRAPQLHLEYRFYKQLGSGDGIPQVYYFGPCGKYNAMVLELLGPSLEDL
         70        80        90       100       110       120      

            100       110       120       130         140       150
pF1KB6 FNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGL--GKKGNLVYIIDF
       :..:.: :::::::..: :.:::.::.::::.:.:::::.:::.:   .:  ....::::
CCDS34 FDLCDRTFSLKTVLMIAIQLISRMEYVHSKNLIYRDVKPENFLIGRPGNKTQQVIHIIDF
        130       140       150       160       170       180      

              160       170       180       190       200       210
pF1KB6 GLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGS
       ::::.: : .:..::::::.:.::::::: ::::::: :::::::::.::...:::  ::
CCDS34 GLAKEYIDPETKKHIPYREHKSLTGTARYMSINTHLGKEQSRRDDLEALGHMFMYFLRGS
        190       200       210       220       230       240      

              220       230       240       250       260       270
pF1KB6 LPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLR
       :::::::: : ...:..:.. : .:::::::...: :.:::: . : : : .::::.:::
CCDS34 LPWQGLKADTLKERYQKIGDTKRATPIEVLCENFP-EMATYLRYVRRLDFFEKPDYDYLR
        250       260       270       280        290       300     

              280       290           300         310       320    
pF1KB6 QLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLKF----GASRA--ADDAERERRDREERLRHSRNPATR
       .:: .:: :.:. .:: .::   ..    :: .   : ...:: .........:.: .. 
CCDS34 KLFTDLFDRKGYMFDYEYDWIGKQLPTPVGAVQQDPALSSNREAHQHRDKMQQSKNQVV-
         310       320       330       340       350       360     

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB6 GLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHTANTSPRPVSGMERERKVSMRLHRGAPVNISSS
          :...:      :.    : .  :..  :.:  :  :.                    
CCDS34 ---SSTNG------ELNTDDPTAGRSNAPITAPTEVEVMDETNCQKVLNMWCCCFFKRRK
                   370       380       390       400       410     

          390       400       410     
pF1KB6 DLTGRQDTSRMSTSQIPGRVASSGLQSVVHR
                                      
CCDS34 RKTIQRHK                       
         420                          

>>CCDS12077.1 CSNK1G2 gene_id:1455|Hs108|chr19            (415 aa)
 initn: 1186 init1: 671 opt: 1208  Z-score: 608.0  bits: 121.5 E(32554): 1.5e-27
Smith-Waterman score: 1208; 49.2% identity (75.8% similar) in 380 aa overlap (3-375:40-415)

                                           10        20        30  
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                                     : ::  .:.:.::: :.::.. :: .. ..
CCDS12 GETEEGRRMSKAGGGRSSHGIRSSGTSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLGKNLYTN
      10        20        30        40        50        60         

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       : :::::: .:.. ::::.: ..::....  :.: . . :  : ::.::.::::::::::
CCDS12 EYVAIKLEPIKSRAPQLHLEYRFYKQLSATEGVPQVYYFGPCGKYNAMVLELLGPSLEDL
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       :..:.: :.:::::..: :.:.:.::.:.:..:.:::::.:::.:    :. . ..::::
CCDS12 FDLCDRTFTLKTVLMIAIQLITRMEYVHTKSLIYRDVKPENFLVGRPGTKRQHAIHIIDF
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       ::::.: : .:..::::::.:.::::::: ::::::: :::::::::.::...:::  ::
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       :::::::: : ...:..:.. : .:::::::...: :.:::: . : : : .::::.:::
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       .:: .:: :.:: .:: .::  . :    . .  :   . . :..   ::.: :   : :
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       : .:.: . . .:  .  :.: :.   .    .    ..:... :.. :.          
CCDS12 T-NGELNADDPTAGHSNAPITAPAEVEVADETKCCCFFKRRKRKSLQRHK          
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                                           10        20        30  
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CCDS41 DKDKSDDRMARPSGRSGHNTRGTGSSSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLGKNLYTN
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CCDS41 EYVAIKLEPMKSRAPQLHLEYRFYKQLGSGDGIPQVYYFGPCGKYNAMVLELLGPSLEDL
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CCDS41 FDLCDRTFSLKTVLMIAIQLISRMEYVHSKNLIYRDVKPENFLIGRPGNKTQQVIHIIDF
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       ::::.: : .:..::::::.:.::::::: ::::::: :::::::::.::...:::  ::
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CCDS41 LPWQGLKADTLKERYQKIGDTKRATPIEVLCENFP-EMATYLRYVRRLDFFEKPDYDYLR
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       .:: .:: :.:. .:: .::   ..    :: .   : ...:: .........:.:    
CCDS41 KLFTDLFDRKGYMFDYEYDWIGKQLPTPVGAVQQDPALSSNREAHQHRDKMQQSKNQSAD
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415 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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