Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9868
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9868, 450 aa
1>>>pF1KB9868 450 - 450 aa - 450 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7101+/-0.000998; mu= 6.3936+/- 0.060
mean_var=366.6446+/-86.204, 0's: 0 Z-trim(114.6): 180 B-trim: 1665 in 2/51
Lambda= 0.066981
statistics sampled from 14959 (15192) to 14959 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.77), E-opt: 0.2 (0.467), width: 16
Scan time: 3.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 3081 311.5 1.1e-84
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 1303 139.7 5.9e-33
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 1000 110.4 3.8e-24
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 756 86.8 4.7e-17
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 595 71.3 2.3e-12
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 550 66.9 4.5e-11
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 539 65.8 8.7e-11
>>CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 (465 aa)
initn: 3081 init1: 3081 opt: 3081 Z-score: 1633.7 bits: 311.5 E(32554): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 3081; 100.0% identity (100.0% similar) in 450 aa overlap (1-450:16-465)
10 20 30 40
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLML
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CCDS75 MFRQEQPLAEGSFAPMGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLML
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAW
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 CEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVIS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 FPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 RTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 RDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 AAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTLTAVGCSVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTLTAVGCSVPR
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450
pF1KB9 TLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV
430 440 450 460
>>CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 (462 aa)
initn: 1463 init1: 768 opt: 1303 Z-score: 705.2 bits: 139.7 E(32554): 5.9e-33
Smith-Waterman score: 1511; 54.9% identity (73.9% similar) in 459 aa overlap (8-447:16-458)
10 20 30 40
pF1KB9 MGSLQPDAG-NASWNGTEAPGGGARAT-----P----YSLQVTLTLVCLAGL
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CCDS47 MASPALAAALAVAAAAGPNASGAGERGSGGVANASGASWGPPRGQYSAGAVAGLAAVVGF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LMLLTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFG
:...:: :::::.:::.:::::.:::::::::::::::::::::.:::::::.:.:::::
CCDS47 LIVFTVVGNVLVVIAVLTSRALRAPQNLFLVSLASADILVATLVMPFSLANELMAYWYFG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 KAWCEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISA
..:: .::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::.:: :..::.:::
CCDS47 QVWCGVYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSVTQAVEYNLKRTPRRVKATIVAVWLISA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 VISFPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQI
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CCDS47 VISFPPLVSLYRQPDGA----AYPQCGLNDETWYILSSCIGSFFAPCLIMGLVYARIYRV
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 AKRRTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAP
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CCDS47 AKLRTRTLSEKRAP---VGPDGASPTTENGLGAAAGAGENGHCAPP-PADVE--PDESSA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 AGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGI
:. : :.... .: : . : :.: : . .. : :.:: :
CCDS47 AAERRRRRGALRRGG-----RRRAGAEGGAGGADGQG-AGPGAAESGALTASRSPGPGGR
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB9 GTPAAGPGEE----RVGAAKAS--RWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTL
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CCDS47 LSRASSRSVEFFLSRRRRARSSVCRRKVAQAREKRFTFVLAVVMGVFVLCWFPFFFSYSL
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 TAV---GCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV
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CCDS47 YGICREACQVPGPLFKFFFWIGYCNSSLNPVIYTVFNQDFRRSFKHILFRRRRRGFRQ
410 420 430 440 450 460
>>CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 (450 aa)
initn: 1240 init1: 739 opt: 1000 Z-score: 547.1 bits: 110.4 E(32554): 3.8e-24
Smith-Waterman score: 1431; 54.1% identity (71.6% similar) in 451 aa overlap (27-443:6-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGNVLVIIAVFT
:::.:.: ... .:.:.:.:::.:::.::.:
CCDS56 MDHQDPYSVQATAAIAAAITFLILFTIFGNALVILAVLT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLALDVLFCTSS
::.:.:::::::::::.::::::::.::::::::..::::: ..:::.::::::::::::
CCDS56 SRSLRAPQNLFLVSLAAADILVATLIIPFSLANELLGYWYFRRTWCEVYLALDVLFCTSS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 IVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPPLISIEKKGGGGG
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CCDS56 IVHLCAISLDRYWAVSRALEYNSKRTPRRIKCIILTVWLIAAVISLPPLIY----KGDQG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB9 PQP-AEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVPPSRRGPDAV
::: ..:.:..:.. ::...: :::::::::::::::.::: :::: .:::: :
CCDS56 PQPRGRPQCKLNQEAWYILASSIGSFFAPCLIMILVYLRIYLIAKRS-----NRRGPRAK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 AAPPGGTER--RPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNG---APGEPAPA-GPRDTDALDL
..: : . ::. : :: . . ..:: . :: . :.:: . :
CCDS56 GGPGQGESKQPRPDHGGALASAKLPALASVASAREVNGHSKSTGEKEEGETPEDTGTRAL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KB9 EES------------------SSSDHAERPPGPRRPERG--PRGKGKARASQVKPGDSLP
: : :.::. .. :. :.. . :: .: . :
CCDS56 PPSWAALPNSGQGQKEGVCGASPEDEAEEEEEEEEEEEECEPQAVPVSPASACSPPLQQP
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380
pF1KB9 RRGPG--ATGIGTPAAGPGEERVGAAKASRWRGRQN--REKRFTFVLAVVIGVFVVCWFP
. : :: : : : ::: .. :: : . :::::::::::::::::.::::
CCDS56 Q-GSRVLATLRGQVLLGRG---VGAIGGQWWRRRAQLTREKRFTFVLAVVIGVFVLCWFP
340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 FFFTYTLTAV---GCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDR
:::.:.: :. :.::. ::.::::.::::::::::::::::.::::::..::::
CCDS56 FFFSYSLGAICPKHCKVPHGLFQFFFWIGYCNSSLNPVIYTIFNQDFRRAFRRILCRPWT
390 400 410 420 430 440
450
pF1KB9 KRIV
CCDS56 QTAW
450
>>CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 (443 aa)
initn: 730 init1: 360 opt: 756 Z-score: 419.7 bits: 86.8 E(32554): 4.7e-17
Smith-Waterman score: 796; 33.6% identity (60.4% similar) in 455 aa overlap (13-442:22-443)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGN
.::.. : : :. .:: ::. . ::::
CCDS83 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSD---GKADRPHYNYYATLLT-----LLIAVIVFGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLA
::: .:: .::.. : ..:::: ::.::::::.:. . ::.: : :.. :.:...
CCDS83 VLVCMAVSREKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGEWKFSRIHCDIFVT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTP-RRIKAIIITVWVISAVISFPPLI
:::..::.::..:::::.::: .... . :: . . ::. ..: :::.: .:: : :.
CCDS83 LDVMMCTASILNLCAISIDRYTAVAMPMLYNTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 SIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVP
.... . .: : . .:. : : ::..: .. .:::..:: . .:: .
CCDS83 GLNNAD--------QNECIIANPA-FVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRRRKRV
180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KB9 PSRRGPDA----VAAPPGGTERRP------------NGLGP-ERSAGPGGAEAEPLPTQL
..:. : . :: :. .: :: : .: .. .:. : ..
CCDS83 NTKRSSRAFRAHLRAPLKGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEM
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KB9 NGAPGEP-----APAGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKP
.. . : .: : . : : . : : .: .::.. ..: . . ...
CCDS83 LSSTSPPERTRYSPIPP-SHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIAKIFE
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 GDSLPRRGPGATGIGTPAAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWF
...: :. :.. :: . :..::. : .::.:.:::..::.
CCDS83 IQTMPN---------------GKTRTSLKTMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWL
350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 PFFFTYTLTA-VGCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDR
:::.:. :. :..: .:.. : :.:: ::..::.::: :: .::.:: ::: :
CCDS83 PFFITHILNIHCDCNIPPVLYSAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
390 400 410 420 430 440
450
pF1KB9 KRIV
>>CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 (460 aa)
initn: 384 init1: 384 opt: 595 Z-score: 335.5 bits: 71.3 E(32554): 2.3e-12
Smith-Waterman score: 595; 29.7% identity (59.4% similar) in 441 aa overlap (18-448:17-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGNVLVIIAVFT
::: : :. ::.. . .::: : :: ::.::.:. .
CCDS80 MNTSAPPAVSPNITVLAPGKG----PW--QVAFIGIT-TGLLSLATVTGNLLVLISFKV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLALDVLFCTSS
. ::. .: ::.::: ::....:. . . . .::.: .: :...:::: . ..:
CCDS80 NTELKTVNNYFLLSLACADLIIGTFSMNLYTTYLLMGHWALGTLACDLWLALDYVASNAS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 IVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPPLISIEKKGGGGG
...: ::.:::.:.:. . : :::::: .: .:..: :. : .. . :
CCDS80 VMNLLLISFDRYFSVTRPLSYRAKRTPRRAALMIGLAWLVSFVLWAPAILFWQYLVGERT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB9 PQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVPPSRRG---PD
.. .. .: .... ...:. : .: .: :::. .. :.: . .: :
CCDS80 VLAGQCYIQFLSQPIITFGTAMAAFYLPVTVMCTLYWRIYRETENRARELAALQGSETPG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 AVAAPPGGTER-RPNGLG-PERSAGPGGA-EAEPLPTQLNGAPGEPAPAGPRDTDALDLE
.. ...:: .:.. : :: . :: . : :.. . .. : ..:
CCDS80 KGGGSSSSSERSQPGAEGSPE--TPPGRCCRCCRAPRLLQAYSWKEE----EEEDEGSME
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLPRRGPGATGIGTPAAGPGEERV
.::. : :: . . : .:.: .: : : : : :: :..
CCDS80 SLTSSEGEE--PGSEVVIKMPMVDPEAQAPTKQPPRSSPNTVKRPTKKGRDRAGKGQKPR
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 GAAK-ASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTYTLTAVGCS--VPRTLFKFF
: . :.: .::. . .:.... .:.. : :. . ..:... :. ::.::...
CCDS80 GKEQLAKRKTFSLVKEKKAARTLSAILLAFILTWTPYNI-MVLVSTFCKDCVPETLWELG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450
pF1KB9 FWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKIL-CRGDRKRIV
.:. : ::..::. :.. :. :: .:. .: :: :..:
CCDS80 YWLCYVNSTINPMCYALCNKAFRDTFRLLLLCRWDKRRWRKIPKRPGSVHRTPSRQC
410 420 430 440 450 460
>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 (422 aa)
initn: 659 init1: 425 opt: 550 Z-score: 312.3 bits: 66.9 E(32554): 4.5e-11
Smith-Waterman score: 753; 34.1% identity (59.2% similar) in 461 aa overlap (1-447:1-422)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MGSLQPDAGNASWNGTEAP---GG---GARATPYSLQVTLTLVCLAGLLMLLTVFGNVLV
: :.: :: . .. :: :: : . : :: .: : : :.. .:.::. :
CCDS34 MDVLSPGQGNNT-TSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSL--LLGTLIFCAVLGNACV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 IIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMGYWYFGKAWCEIYLALDV
. :. :.:. : .. ::: .:..:..::.:.. .:.. : .:.. :....::::
CCDS34 VAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIIITVWVISAVISFPPLISIEK
: :::::.:::::.:::::.::. :.: :::::: :.: .:.:. .::.::... .
CCDS34 LCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIYQIAKRRTRVPPSRR
. :. : :. .. :.: : .:.:. : :.:...: ::.. :. : :
CCDS34 PEDRSDPDA----CTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIR------
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 GPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEPAPAGPRDTDALDLE
: .. . : . : : : : ... :: .: :. : .:
CCDS34 ----------KTVKKVEKTGADTRHG-----ASPAPQPKKSVNGE---SGSRNWR-LGVE
230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDS---LPRRGPGATGIGTPAAGPGE
:.. : : : .: : . . :.: :: :. .: :: : .
CCDS34 --SKAGGALCANGAVR--QGDDGAALEVIEVHRVGNSKEHLPL--PSEAG-PTPCAPASF
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KB9 ERVGAAKA-SRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFF---FTYTLTAVGCSVPRTL
:: . .: .. . ::.. . .:....:.:..::.::: .. . .: .: :
CCDS34 ERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLL
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450
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