Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9850
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9850, 377 aa
1>>>pF1KB9850 377 - 377 aa - 377 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6488+/-0.00107; mu= 14.2368+/- 0.064
mean_var=137.2202+/-53.499, 0's: 0 Z-trim(103.8): 282 B-trim: 983 in 2/45
Lambda= 0.109488
statistics sampled from 7067 (7589) to 7067 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 2468 402.3 3.5e-112
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 1561 259.1 4.8e-69
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 1086 184.0 1.8e-46
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 1074 182.1 6.6e-46
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 666 117.7 1.7e-26
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 659 116.7 3.9e-26
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 639 113.6 3.8e-25
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 623 111.0 2.1e-24
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 566 102.0 1.1e-21
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 553 100.0 4.7e-21
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 539 97.8 2.1e-20
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 535 97.1 3.3e-20
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 523 95.2 1.2e-19
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 523 95.2 1.2e-19
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 523 95.3 1.2e-19
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 502 91.8 1e-18
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 497 91.1 2.1e-18
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 489 89.7 4.2e-18
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 489 89.8 4.8e-18
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 489 89.9 5e-18
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 489 89.9 5.1e-18
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 489 89.9 5.1e-18
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 485 89.3 8.4e-18
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 479 88.4 1.7e-17
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 471 86.9 3.4e-17
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 460 85.2 1.1e-16
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 437 81.6 1.5e-15
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 433 81.0 2.2e-15
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 432 80.7 2.2e-15
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 432 80.8 2.4e-15
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 427 80.2 5.2e-15
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 424 79.6 6.2e-15
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 420 79.0 9.8e-15
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 418 78.7 1.3e-14
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 405 76.6 5e-14
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 400 75.8 8.4e-14
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 398 75.5 1.1e-13
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 395 74.9 1.2e-13
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 379 72.3 7.1e-13
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 370 70.9 1.9e-12
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 369 70.9 2.6e-12
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 360 69.3 5.8e-12
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 344 66.8 3.3e-11
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 342 66.6 4.8e-11
>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 (377 aa)
initn: 2468 init1: 2468 opt: 2468 Z-score: 2127.5 bits: 402.3 E(32554): 3.5e-112
Smith-Waterman score: 2468; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 AQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 AQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 TAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSALERKRISAARERKAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSALERKRISAARERKAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 KILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFN
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB9 EEFRQAFQKIVPFRKAS
:::::::::::::::::
CCDS23 EEFRQAFQKIVPFRKAS
370
>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 (390 aa)
initn: 1535 init1: 931 opt: 1561 Z-score: 1353.0 bits: 259.1 E(32554): 4.8e-69
Smith-Waterman score: 1561; 62.4% identity (83.4% similar) in 380 aa overlap (3-377:12-390)
10 20 30 40
pF1KB9 MSPLNQSAEGLPQE--ASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVIT
: : .:: .: : : . . .. :. :...:..::
CCDS49 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LATVLSNAFVLTTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQI
:::.::::::..:. ::::::::::::.:::.::::::::::::: ::.: :..::.
CCDS49 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 LCDIWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICI
.::.::::::::::::::::::::::::::::::.::: .:: .::.:::.::..:: :
CCDS49 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 SIPPLFWRQAKAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRIL
:.::.:::::::.::.:.:.:::..: ::.::: ::::.:..::: :::::: ::.:::
CCDS49 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 NP-PSLYGKRFTTAHLITGSAGS--SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSAL
. :. :::.: :.::: : :: :. :.:: . . :.: :::.. :.::....:. :
CCDS49 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSES-GSPVYVNQVKVRVSDALL
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 ERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGY
:.:.. ::::::::: :::::::::.::::::..:::.:::.:.::.: :.:::::::::
CCDS49 EKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGY
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KB9 LNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
:::::::::::. ::.:.:::.:.. :. .:
CCDS49 LNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
360 370 380 390
>>CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 (366 aa)
initn: 1050 init1: 591 opt: 1086 Z-score: 947.8 bits: 184.0 E(32554): 1.8e-46
Smith-Waterman score: 1086; 50.4% identity (77.4% similar) in 345 aa overlap (38-374:23-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
:: ....:: ..: :. :..:...:..::
CCDS29 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
::: :::::: :::.::.::..::::.::.: . ..: .::..:::::: :::::: :::
CCDS29 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
:: .:::::: :::::.::...:: ::. ::.::: ::. ::.::::::. .... ..
CCDS29 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRD-DE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILN-PPSLYGKRFTTAHLIT
:... ..: ::::: :::::: .:..::: .:::::.. . : .:. ......
CCDS29 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB9 GSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN-HVKIKLADSALE------RKRISAARERKA
:. .: :...: .: : : : . : .. : .. :..::..:::::
CCDS29 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVF
. ::.:::::.:::::::: ::. .: :.: : . .:..:::::::::::.:::.:
CCDS29 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB9 NEEFRQAFQKIVPFRKAS
::.:..::::.: :
CCDS29 NEDFKKAFQKLVRCRC
360
>>CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 (365 aa)
initn: 1056 init1: 591 opt: 1074 Z-score: 937.6 bits: 182.1 E(32554): 6.6e-46
Smith-Waterman score: 1074; 49.0% identity (72.8% similar) in 367 aa overlap (23-375:8-363)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL
::.: : :.:. :. . ..: ::: :.: : :.
CCDS50 MNITNCTTEASMAIRPKTITE-KMLICMTLVVITTLTTLLNLAVI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT
.: :.::: :::::: :::.:::::..::::.:: : . :..: .::..::: :.:
CCDS50 MAIGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB9 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWR-QA
::: :::::::::::::::::.:.::...::: .:: :: ::.::: ::.:::::: .
CCDS50 CCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRF
. . :.: .. ... :::::: :::::: .:..::: :::.::. ::: ::
CCDS50 RLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAK-------SLYQKRG
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB9 TTAHLITGSAGS----SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPL-----FFNHVKIKLADSAL----
.. :: . :. : . :.:.... . . :...: : ..: :. :
CCDS50 SSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVS-DFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 ERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGY
::..::..:::::..:::.::::::. :::::. :.. . . . . ::.:::::
CCDS50 ERQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYT--VSSEVADFLTWLGY
280 290 300 310 320 330
350 360 370
pF1KB9 LNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
.::::::..:: :::.:. ::.:.. :.
CCDS50 VNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
340 350 360
>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 (367 aa)
initn: 629 init1: 178 opt: 666 Z-score: 589.3 bits: 117.7 E(32554): 1.7e-26
Smith-Waterman score: 666; 35.7% identity (65.8% similar) in 339 aa overlap (42-371:33-365)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 PQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTRKLHT
:. .. :: :..:..: ..: : :.:
CCDS33 SLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERALQT
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB9 PANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITH-TWNFGQILCDIWLSSDITCCTASILHLC
.:::. :::..::::. :::: . .: .:::..: ::.... :. ::::::.::
CCDS33 TTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILNLC
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180
pF1KB9 VIALDRYWAITDALEYSK---RRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
.:..::: :.. ..:.. . . ..: ::. ::.... .: : :: .. .. .
CCDS33 AISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTV--
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIY----RAARNRILNPPSLYGKRFTTAH
: . :. ...:::. .::.: . ...:.::: . :.:::. . . .
CCDS33 CSI--SNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGF
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 -LITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSALERKRISAARERKATKI
: : . :. .. . :.: : .. .: :. . ::.:::..
CCDS33 PQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGF-QERGGELKREEKTRNSLMPLREKKATQM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEE
..:.:::::.::::::.. .. :. .: . : :.. :::::.:: .::.:::.:: :
CCDS33 VAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQ-TCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIE
300 310 320 330 340 350
370
pF1KB9 FRQAFQKIVPFRKAS
::.:: ::.
CCDS33 FRKAFLKILSC
360
>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 (422 aa)
initn: 968 init1: 637 opt: 659 Z-score: 582.6 bits: 116.7 E(32554): 3.9e-26
Smith-Waterman score: 919; 40.6% identity (70.1% similar) in 374 aa overlap (38-363:36-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
.. ...:... . .::.:: :...: : :
CCDS34 PGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALER
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70 80 90 100 110 120
pF1KB9 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
.:.. :::::::::.:::.::.::.:.. : . . :..::. ::.... :. :::.:::
CCDS34 SLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLF-WRQAKAQEEMS
:::.::::::::::: ..: ..:: .::..:...: :.. :::::.. :: . . . .
CCDS34 HLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPD
130 140 150 160 170 180
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pF1KB9 DCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNP---------------
: .. .. .:::::: :::::: .:...:::::.:::: :: .
CCDS34 ACTISKDH-GYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270
pF1KB9 -PSLYGKRFTTAHL--------ITGSAGSSLCSLNSSLHEGHS---------HSAGS---
:. :. .... . ..::..::. :.....: . : .:.
CCDS34 SPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCA-NGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGNSKE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KB9 --PLFFNHVKIKLADSALERK---------RISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFV
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CCDS34 HLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFI
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320 330 340 350 360 370
pF1KB9 VSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
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CCDS34 VALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
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::. .: . : ........:.: : .
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:..:...: : .:.: .: .: :::..::....::.:.. . .. :..:...:..:
CCDS75 NVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVVWGRWEYGSFFCELWT
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: :. : :::: ::::::::: :::. ..:.. : ..: .. ::::: .:. :..
CCDS75 SVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVCTVWAISALVSFLPIL
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: .:...: ..: : ... .:.: :. .::.: .. ..: :..: :....
CCDS75 MHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQKQV
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230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LNPPSLYGKRFTTAHLITGSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADS-ALE
. : .:: . : . : . : . :.. . ::.. : .
CCDS75 KKIDSCE-RRFLGGPARPPSPSPSPVPAPAP-PPGPPRPAAAA-----ATAPLANGRAGK
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CCDS75 RRPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHRE--LVPDRLFVFFNWLG
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350 360 370
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: :: .::::: . .::.::: ..
CCDS75 YANSAFNPIIYCR-SPDFRKAFQGLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPG
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CCDS14 AISLDRYVAIRNPIEHSRFNSRTKAIMKIAIVWAISIGVSVPIPVIGLRDEEKVFVNNTT
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:..: .... .. ::.:: ....: : . : . : :.:. :
CCDS14 CVLNDP--NFVLIGSFVAFFIPLTIMVITYCLTIYVLRRQALM--LLHGHTEEPPGLSLD
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250 260 270 280 290 300
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CCDS14 FL--KCCKRNTAEEE----NSANPNQDQNARRRKKKERRPRGTMQAINNERKASKVLGIV
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CCDS14 FFVFLIMWCPFFITNILSVLCEKSCNQKLMEKLLNVFVWIGYVCSGINPLVYTLFNKIYR
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370
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.::
CCDS14 RAFSNYLRCNYKVEKKPPVRQIPRVAATALSGRELNVNIYRHTNEPVIEKASDNEPGIEM
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CCDS24 ATNYFLMSLAVADLLVGLFVMPIALLTIMFEAMWPLPLVLCPAWLFLDVLFSTASIMHLC
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CCDS24 AISVDRYIAIKKPIQANQYNSRATAFIKITVVWLISIGIAIPVPIKGIETDVDNPNNITC
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... ... . .... .::. : ...:. : .: ... . : : .:.. .
CCDS24 VLTKERFGDFMLFGSLAAFFTPLAIMIVTYFLTIHALQKKAYLVKNKPPQRLTWLTVSTV
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. . . .. .: .. . : ... .. ... ... . . :..:.:.::
CCDS24 FQRDETPCSSPEKVAMLDGSRKDKALPNSGDETLMRRTSTIGKKSVQTISNEQRASKVLG
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CCDS24 IVFFLFLLMWCPFFITNITLVLC-DSCNQTTLQMLLEIFVWIGYVSSGVNPLVYTLFNKT
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::.:: . .
CCDS24 FRDAFGRYITCNYRATKSVKTLRKRSSKIYFRNPMAENSKFFKKHGIRNGINPAMYQSPM
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CCDS34 MLPPGSNGTAYPGQFALYQQLAQGNAVGGSAGAPP--LGPSQVVTACLLTLLIIWTLLGN
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CCDS34 VLVCAAIVRSRHLRANMTNVFIVSLAVSDLFVALLVMPWKAVAEVAGYWPFGA-FCDVWV
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CCDS34 LNWHRDQAASWGGLDLPNNLANWTPWEEDFWEPDVNAENCDSSLNRTYAISSSLISFYIP
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CCDS34 AP-----------DTSL---RASIKKETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCMVPFCSG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]