Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9843
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9843, 366 aa
1>>>pF1KB9843 366 - 366 aa - 366 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4195+/-0.00112; mu= 15.5987+/- 0.067
mean_var=119.2336+/-39.583, 0's: 0 Z-trim(103.2): 270 B-trim: 947 in 2/48
Lambda= 0.117456
statistics sampled from 6888 (7286) to 6888 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 2.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 2385 416.1 2.4e-116
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 1320 235.6 5.1e-62
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 1139 205.0 9e-53
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 1086 196.0 4.5e-50
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 656 123.1 3.8e-28
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 646 121.5 1.3e-27
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 571 108.9 9.7e-24
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 566 108.0 1.7e-23
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 517 99.7 5.2e-21
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 517 99.7 5.3e-21
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 517 99.7 5.5e-21
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 501 97.0 3.8e-20
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 477 92.8 5e-19
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 468 91.4 1.7e-18
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 466 91.1 2.2e-18
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 462 90.2 2.8e-18
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 462 90.3 3.3e-18
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 462 90.4 3.4e-18
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 462 90.4 3.5e-18
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 462 90.4 3.5e-18
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 436 85.9 7.2e-17
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 428 84.6 1.9e-16
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 424 83.9 3.1e-16
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 423 83.9 3.8e-16
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 423 83.9 3.9e-16
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 416 82.4 6.5e-16
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 416 82.5 6.9e-16
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 404 80.5 3.1e-15
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 403 80.4 3.4e-15
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 401 80.1 4.9e-15
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 400 79.8 4.9e-15
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 399 79.6 5.3e-15
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 398 79.6 6.5e-15
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 396 79.2 8.2e-15
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 391 78.3 1.4e-14
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 379 76.3 6e-14
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 372 75.0 1.1e-13
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 371 74.9 1.4e-13
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 366 74.0 2.3e-13
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 366 74.0 2.4e-13
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 366 74.0 2.4e-13
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 366 74.0 2.4e-13
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 366 74.0 2.5e-13
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 366 74.1 2.6e-13
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 362 73.3 3.6e-13
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 348 70.9 1.9e-12
CCDS11887.1 HRH4 gene_id:59340|Hs108|chr18 ( 390) 319 66.0 6.1e-11
>>CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 (366 aa)
initn: 2385 init1: 2385 opt: 2385 Z-score: 2202.3 bits: 416.1 E(32554): 2.4e-116
Smith-Waterman score: 2385; 100.0% identity (100.0% similar) in 366 aa overlap (1-366:1-366)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHHPANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHHPANY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSAIALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSAIALD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRDDECIIKHDHIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRDDECIIKHDHIV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 STIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLLESGEKSTKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 STIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLLESGEKSTKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 VSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKAATTLGLILG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 VSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKAATTLGLILG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 AFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 AFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQK
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LVRCRC
::::::
CCDS29 LVRCRC
>>CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 (365 aa)
initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1227.0 bits: 235.6 E(32554): 5.1e-62
Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (10-365:5-362)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH
: :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::.
CCDS50 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA
:::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: .
CCDS50 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII
:::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: :
CCDS50 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES
.:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: .
CCDS50 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
. : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.::::::
CCDS50 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN
: ::::::::.. :::::.:::.:.. . .: :...::.::::.:::::::.:: ::
CCDS50 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN
290 300 310 320 330 340
360
pF1KB9 EDFKKAFQKLVRCRC
:::: ::.::.:::
CCDS50 EDFKLAFKKLIRCREHT
350 360
>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 (390 aa)
initn: 1109 init1: 617 opt: 1139 Z-score: 1060.9 bits: 205.0 E(32554): 9e-53
Smith-Waterman score: 1139; 48.2% identity (75.6% similar) in 365 aa overlap (5-366:32-388)
10 20 30
pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLA
: : .. .. .. .: :.:. . :. ..
CCDS49 EEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSIS-LPWKVLLVMLLALIT
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 LMTTTINSLVIAAIIVTRKLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQV
: :: :..:::.. ::::: :::::: ::::::.::..::::.: .: : : .:::
CCDS49 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 VCDIWLSVDITCCTCSILHLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFI
:::.::: :::::: ::::: .:::::: ::::::::. :::::.:..::..::..:. :
CCDS49 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 SMPPLFWRHQGTSRD-DECIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYH
:.::.:::. . .. .::... :::. :.::: ::::.: :.. :: .:: :..
CCDS49 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 KRQASRIAKEEVNGQVLLESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSD-PSTDFDKIHSTVRSLRSEF
:. .: .:. . .:.. .: ::.::.. ... . : :: . . .. . ..:
CCDS49 KQTPNRTGKRLTRAQLITDS-PGSTSSVTS---INSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVS-
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 KHEKSWRRQKISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNF
. ...:. ..:::::. :::.:::::..::::::. ::. .: : : . . .:
CCDS49 --DALLEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDF
300 310 320 330 340 350
340 350 360
pF1KB9 LAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCRC
..:::::::::::.:::. :::::.::.::.: .:
CCDS49 FTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
360 370 380 390
>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 (377 aa)
initn: 1050 init1: 591 opt: 1086 Z-score: 1012.5 bits: 196.0 E(32554): 4.5e-50
Smith-Waterman score: 1086; 50.4% identity (77.4% similar) in 345 aa overlap (23-365:38-374)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
:: ....:: ..: :. :..:...:..::
CCDS23 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
::: :::::: :::.::.::..::::.::.: . ..: .::..:::::: :::::: :::
CCDS23 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRD-DE
:: .:::::: :::::.::...:: ::. ::.::: ::. ::.::::::. .... ..
CCDS23 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
:... ..: ::::: :::::: .:..::: .:::::.. . : .:. ......
CCDS23 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILN-PPSLYGKRFTTAHLIT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
:. .: :...: .: : : : . : .. : .. :..::..:::::
CCDS23 GSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN-HVKIKLADSALE------RKRISAARERKA
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
. ::.:::::.:::::::: ::. .: :.: : . .:..:::::::::::.:::.:
CCDS23 TKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVF
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB9 NEDFKKAFQKLVRCRC
::.:..::::.: :
CCDS23 NEEFRQAFQKIVPFRKAS
360 370
>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 (367 aa)
initn: 582 init1: 303 opt: 656 Z-score: 618.8 bits: 123.1 E(32554): 3.8e-28
Smith-Waterman score: 656; 34.0% identity (66.0% similar) in 344 aa overlap (27-364:33-367)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH
.:. .: : . :.:: :.. : :.
CCDS33 SLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERALQT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVY--IVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHL
.:::. ::::.:.:::.::::. .:: .. : .... ::.....:. :: :::.:
CCDS33 TTNYLVVSLAVADLLVATLVMPW-VVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILNL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 SAIALDRYRAITDAVEYAR---KRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRDDE
::..::: :.. :.: . . . .....::: ::... .: : :: . :.
CCDS33 CAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFG-FNTTGDPTV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
: :.. .: :::. .::.:... ...: .:: . : .:: .: . . :. .
CCDS33 CSISNPDFV--IYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTR-QNSQCNS---V
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ESG-EKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERK
. : ..: : . ... : . : . .:.:.:.. :... ::.:
CCDS33 RPGFPQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEK-TRNSLMPLREKK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 AATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
:. ....::::..::::::. ... . :. :..: :. . .::::.:: .::.::: :
CCDS33 ATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTF
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB9 NEDFKKAFQKLVRCRC
: .:.::: :.. :
CCDS33 NIEFRKAFLKILSC
360
>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 (422 aa)
initn: 904 init1: 484 opt: 646 Z-score: 609.0 bits: 121.5 E(32554): 1.3e-27
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
....:: :. : . .. :. :.::: . :
CCDS34 PGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
.:.. ::::: ::::::..:.:::.:.. .: : ..: .:::.::.....:. ::: :::
CCDS34 SLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSIL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLF-WRH-QGTSRDD
:: ::::::: :::: ..:. ::::..:. .:...:.:. .::.::.. :: . : :
CCDS34 HLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB9 ECIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHK------------RQAS
: :..:: ::::::::::::: :.:.:: .:.:::. .: :...
CCDS34 ACTISKDHGY-TIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB9 RIA---KEEVNGQVLLESGEKSTK---------SVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR
: :. ::: ::: .. . .. .. ..... . . . ..: .
CCDS34 SPAPQPKKSVNG----ESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGN
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300
pF1KB9 S-----LRSE----------F--KHEKSWR-RQKISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLP
: : :: : :.:.. . ..:.. .::::.. :::.:.:.:..::::
CCDS34 SKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLP
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 FFVKELVVNVCDK-CKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCRC
::. ::. :.. :.. .. .. :::: :::.::.::. ::.::..::
CCDS34 FFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFC
370 380 390 400 410 420
CCDS34 RQ
>>CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 (481 aa)
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Smith-Waterman score: 571; 30.3% identity (65.0% similar) in 346 aa overlap (33-364:62-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 FLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTI--NSLVIAAIIVTRKLHHPANY
: .. :: :.::: :. . .::.. .::
CCDS24 SGLQTESIPEEMKQIVEEQGNKLHWAALLILMVIIPTIGGNTLVILAVSLEKKLQYATNY
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70 80 90 100 110
pF1KB9 LICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRES-WIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSAIAL
.. ::::.:.::...:::.... :. :. : . :.: :: .:. : ::.:: ::..
CCDS24 FLMSLAVADLLVGLFVMPIALLTIMFEAMWPLPLVLCPAWLFLDVLFSTASIMHLCAISV
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 DRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMP-PLFWRHQGTSRDDE----CII
::: :: .. . . : : ::.::.::. :..: :. . :. :. :..
CCDS24 DRYIAIKKPIQANQYNSRATAFIKITVVWLISIGIAIPVPI--KGIETDVDNPNNITCVL
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180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KHDHIVS-TIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKT---LYHKRQASRIAKEEVNGQVL
.... . ......::. :::.... :. .: . : ... .:.. :. ..
CCDS24 TKERFGDFMLFGSLAAFFTPLAIMIVTYFLTIHALQKKAYLVKNKPPQRLTWLTVS--TV
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERK
.. : .: .:. : .: . . .. .: :. .:: : ::. :..
CCDS24 FQRDETPCSSPEKVAMLDGSRKDKALPNSGDETLMR--RTSTIGKKSV--QTISN--EQR
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340
pF1KB9 AATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKIS--EEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYT
:. .::... :.. : :::. .... .::.:. . . . ....:.::..: .:::.::
CCDS24 ASKVLGIVFFLFLLMWCPFFITNITLVLCDSCNQTTLQMLLEIFVWIGYVSSGVNPLVYT
330 340 350 360 370 380
350 360
pF1KB9 IFNEDFKKAFQKLVRCRC
.::. :. :: . . :
CCDS24 LFNKTFRDAFGRYITCNYRATKSVKTLRKRSSKIYFRNPMAENSKFFKKHGIRNGINPAM
390 400 410 420 430 440
>>CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 (477 aa)
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Smith-Waterman score: 566; 31.8% identity (60.5% similar) in 352 aa overlap (26-364:61-393)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLH
..: .. ..:. .. : :::.:: : .:.
CCDS75 RLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAGMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQ
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 HPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLS
.: .: ::: .:.....::.::. . .: : .:. :..: :::. : : :: :
CCDS75 TLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLC
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160
pF1KB9 AIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLF---WRHQGTS-----
.:::::: :::. .: : .: .. :: ::...:. :.. :: ..
CCDS75 VIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVCTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCY
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 RDDECIIKHDHIVSTIY---STFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEE
: .: : ... : :. .::.:: .. ..: ...: :. .:...: . :
CCDS75 NDPKCC---DFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQ-----KQVKKIDSCE
220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 VNGQVLLESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQ--K
. .: : : : : :. . .. . . . . .. .:. .
CCDS75 RR----FLGGPARPPSPSPSPV-----PAPAPPPGPPRPAAAAATAPLANGRAGKRRPSR
270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 ISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLI
. . ::.:: :::.:.:.:..::::::. . ::.. . . ... :. :::: :: .
CCDS75 LVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLAN-VVKAFHRELVPDRLFVFFNWLGYANSAF
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350 360
pF1KB9 NPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCRC
::.:: . ::.:::: :. :
CCDS75 NPIIYC-RSPDFRKAFQGLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPGAASDDD
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>>CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 (432 aa)
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pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
:.... :. ..:.: . : ::. .. ..
CCDS74 EVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVK
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPF-SIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSI
::..:.:::: :::..:. ::: :::: :.. .. .::.:. :......:. ::: ::
CCDS74 KLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASI
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LHLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRDDE
. : .:..::: .:: . : ... : . :: ::..:. :..:::: :... :
CCDS74 MTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKV
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
:.:..: . ::::: :::::....:..::.::.::. :.. . . : .. . :
CCDS74 CLISQD-FGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIAL
240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISG-TRERK
.. : : : : . : ::: :..:: ::.:
CCDS74 NGIVKLQKEVEECANLSRLL---------------------KHE----RKNISIFKREQK
290 300 310 320
300 310 320 330 340
pF1KB9 AATTLGLILGAFVICWLPFFV----KELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLI
::::::.:.:::..::::::. . .. .. .: .:: :::: ::::::.:
CCDS74 AATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFL-WLGYANSLINPFI
330 340 350 360 370 380
350 360
pF1KB9 YTIFNEDFKKAFQKLVRCRC
:..::.:.. ....:..:.
CCDS74 YAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVL
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pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
:.... :. ..:.: . : ::. .. ..
CCDS74 EVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVK
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60 70 80 90 100 110
pF1KB9 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPF-SIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSI
::..:.:::: :::..:. ::: :::: :.. .. .::.:. :......:. ::: ::
CCDS74 KLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASI
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 LHLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRDDE
. : .:..::: .:: . : ... : . :: ::..:. :..:::: :... :
CCDS74 MTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKV
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
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CCDS74 CLISQD-FGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIAL
240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISG-TRERK
.. : : : : . : ::: :..:: ::.:
CCDS74 NGIVKLQKEVEECANLSRLL---------------------KHE----RKNISIFKREQK
290 300 310 320
300 310 320 330 340
pF1KB9 AATTLGLILGAFVICWLPFFV----KELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLI
::::::.:.:::..::::::. . .. .. .: .:: :::: ::::::.:
CCDS74 AATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFL-WLGYANSLINPFI
330 340 350 360 370 380
350 360
pF1KB9 YTIFNEDFKKAFQKLVRCRC
:..::.:.. ....:..:.
CCDS74 YAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLQNADYCRKKGH
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366 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]