Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9840
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9840, 356 aa
  1>>>pF1KB9840 356 - 356 aa - 356 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0600+/-0.000928; mu= 13.0372+/- 0.056
 mean_var=81.0118+/-16.423, 0's: 0 Z-trim(106.4): 43  B-trim: 231 in 1/51
 Lambda= 0.142495
 statistics sampled from 8914 (8954) to 8914 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.275), width:  16
 Scan time:  2.750

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1898.1 PCBP1 gene_id:5093|Hs108|chr2           ( 356) 2318 486.2 1.8e-137
CCDS44901.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12         ( 365) 1889 398.0 6.6e-111
CCDS8859.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12          ( 362) 1881 396.3 2.1e-110
CCDS55830.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12         ( 361) 1864 392.8 2.3e-109
CCDS44900.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12         ( 366) 1515 321.1 9.3e-88
CCDS44902.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12         ( 335) 1143 244.6   9e-65
CCDS44904.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12         ( 318) 1111 238.0 8.2e-63
CCDS44903.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12         ( 331) 1111 238.0 8.5e-63
CCDS42974.2 PCBP3 gene_id:54039|Hs108|chr21        ( 371) 1008 216.9 2.2e-56
CCDS46652.1 PCBP3 gene_id:54039|Hs108|chr21        ( 345)  918 198.4 7.7e-51
CCDS2839.1 PCBP4 gene_id:57060|Hs108|chr3          ( 403)  797 173.5 2.7e-43
CCDS2840.2 PCBP4 gene_id:57060|Hs108|chr3          ( 360)  552 123.1 3.6e-28


>>CCDS1898.1 PCBP1 gene_id:5093|Hs108|chr2                (356 aa)
 initn: 2318 init1: 2318 opt: 2318  Z-score: 2581.4  bits: 486.2 E(32554): 1.8e-137
Smith-Waterman score: 2318; 100.0% identity (100.0% similar) in 356 aa overlap (1-356:1-356)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGVPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGVPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 IPYQPMPASSPVICAGGQDRCSDAAGYPHATHDLEGPPLDAYSIQGQHTISPLDLAKLNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IPYQPMPASSPVICAGGQDRCSDAAGYPHATHDLEGPPLDAYSIQGQHTISPLDLAKLNQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 VARQQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTTHELTIPNNLIGCIIGRQGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VARQQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTTHELTIPNNLIGCIIGRQGA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350      
pF1KB9 NINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSEKGMGCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSEKGMGCS
              310       320       330       340       350      

>>CCDS44901.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12              (365 aa)
 initn: 1881 init1: 1052 opt: 1889  Z-score: 2104.6  bits: 398.0 E(32554): 6.6e-111
Smith-Waterman score: 1896; 82.8% identity (91.6% similar) in 367 aa overlap (1-356:1-365)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIIT
       ::.:: :.:::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS44 MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKI
       :.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS44 LAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGVPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::. :::::::.::::::::::   : :
CCDS44 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGV-T
              130       140       150       160       170          

              190       200          210             220       230 
pF1KB9 IPYQPMPASSPVICAGGQDRCS---DAAGYPHATH------DLEGPPLDAYSIQGQHTIS
       :::.: :.::::: :::::: :   :.:..::.:       :::::::.::.::::..: 
CCDS44 IPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIP
     180       190       200       210       220       230         

             240       250       260       270       280        290
pF1KB9 PLDLAKLNQVARQQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTT-HELTIPNNL
         ::.::.:.: ::::: : ::.:::.::.::::::::::. ::::.::: :::::::.:
CCDS44 QPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWG-LDASAQTTSHELTIPNDL
     240       250       260       270       280        290        

              300       310       320       330       340       350
pF1KB9 IGCIIGRQGANINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSE
       ::::::::::.:::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::.:::::
CCDS44 IGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSE
      300       310       320       330       340       350        

              
pF1KB9 KG-MGCS
        : :: :
CCDS44 TGGMGSS
      360     

>>CCDS8859.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12               (362 aa)
 initn: 1970 init1: 1017 opt: 1881  Z-score: 2095.8  bits: 396.3 E(32554): 2.1e-110
Smith-Waterman score: 1881; 81.7% identity (91.3% similar) in 367 aa overlap (1-356:1-362)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIIT
       ::.:: :.:::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS88 MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKI
       :.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS88 LAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGVPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::. :::::::.::::.    :.:  .:
CCDS88 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLES---PPKG--VT
              130       140       150       160          170       

              190       200          210             220       230 
pF1KB9 IPYQPMPASSPVICAGGQDRCS---DAAGYPHATH------DLEGPPLDAYSIQGQHTIS
       :::.: :.::::: :::::: :   :.:..::.:       :::::::.::.::::..: 
CCDS88 IPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIP
         180       190       200       210       220       230     

             240       250       260       270       280        290
pF1KB9 PLDLAKLNQVARQQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTT-HELTIPNNL
         ::.::.:.: ::::: : ::.:::.::.:::::::::::.::::.::: :::::::.:
CCDS88 QPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDL
         240       250       260       270       280       290     

              300       310       320       330       340       350
pF1KB9 IGCIIGRQGANINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSE
       ::::::::::.:::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::.:::::
CCDS88 IGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSE
         300       310       320       330       340       350     

              
pF1KB9 KG-MGCS
        : :: :
CCDS88 TGGMGSS
         360  

>>CCDS55830.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12              (361 aa)
 initn: 1846 init1: 1017 opt: 1864  Z-score: 2076.9  bits: 392.8 E(32554): 2.3e-109
Smith-Waterman score: 1864; 81.5% identity (91.0% similar) in 367 aa overlap (1-356:1-361)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIIT
       ::.:: :.:::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS55 MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKI
       :.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS55 LAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGVPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::. :::::::.::::.    :.:  .:
CCDS55 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLES---PPKG--VT
              130       140       150       160          170       

              190       200          210             220       230 
pF1KB9 IPYQPMPASSPVICAGGQDRCS---DAAGYPHATH------DLEGPPLDAYSIQGQHTIS
       :::.: :.::::: :::::: :   :.:..::.:       :::::::.::.::::..: 
CCDS55 IPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIP
         180       190       200       210       220       230     

             240       250       260       270       280        290
pF1KB9 PLDLAKLNQVARQQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTT-HELTIPNNL
         ::.::.:.: ::::: : ::.:::.::.::::::::::. ::::.::: :::::::.:
CCDS55 QPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWG-LDASAQTTSHELTIPNDL
         240       250       260       270        280       290    

              300       310       320       330       340       350
pF1KB9 IGCIIGRQGANINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSE
       ::::::::::.:::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::.:::::
CCDS55 IGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSE
          300       310       320       330       340       350    

              
pF1KB9 KG-MGCS
        : :: :
CCDS55 TGGMGSS
          360 

>>CCDS44900.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12              (366 aa)
 initn: 1895 init1: 1052 opt: 1515  Z-score: 1689.0  bits: 321.1 E(32554): 9.3e-88
Smith-Waterman score: 1913; 83.1% identity (91.8% similar) in 367 aa overlap (1-356:1-366)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIIT
       ::.:: :.:::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS44 MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKI
       :.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS44 LAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGVPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::. :::::::.::::::::::   : :
CCDS44 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGV-T
              130       140       150       160       170          

              190       200          210             220       230 
pF1KB9 IPYQPMPASSPVICAGGQDRCS---DAAGYPHATH------DLEGPPLDAYSIQGQHTIS
       :::.: :.::::: :::::: :   :.:..::.:       :::::::.::.::::..: 
CCDS44 IPYRPKPSSSPVIFAGGQDRYSTGSDSASFPHTTPSMCLNPDLEGPPLEAYTIQGQYAIP
     180       190       200       210       220       230         

             240       250       260       270       280        290
pF1KB9 PLDLAKLNQVARQQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTT-HELTIPNNL
         ::.::.:.: ::::: : ::.:::.::.:::::::::::.::::.::: :::::::.:
CCDS44 QPDLTKLHQLAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDL
     240       250       260       270       280       290         

              300       310       320       330       340       350
pF1KB9 IGCIIGRQGANINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSE
       ::::::::::.:::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::.:::::
CCDS44 IGCIIGRQGAKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSE
     300       310       320       330       340       350         

              
pF1KB9 KG-MGCS
        : :: :
CCDS44 TGGMGSS
     360      

>>CCDS44902.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12              (335 aa)
 initn: 1823 init1: 1052 opt: 1143  Z-score: 1276.3  bits: 244.6 E(32554): 9e-65
Smith-Waterman score: 1785; 81.0% identity (88.5% similar) in 358 aa overlap (1-356:1-335)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIIT
       ::.:: :.:::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS44 MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKI
       :.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS44 LAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGVPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::. :::::::.::::::::::   : :
CCDS44 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLETLSQSPPKGV-T
              130       140       150       160       170          

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 IPYQPMPASSPVICAGGQDRCSDAAGYPHATHDLEGPPLDAYSIQGQHTISPLDLAKLNQ
       :::.: :.::::: ::::                      ::.::::..:   ::.::.:
CCDS44 IPYRPKPSSSPVIFAGGQ----------------------AYTIQGQYAIPQPDLTKLHQ
     180       190                             200       210       

              250       260       270       280        290         
pF1KB9 VARQQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTT-HELTIPNNLIGCIIGRQG
       .: ::::: : ::.:::.::.:::::::::::.::::.::: :::::::.::::::::::
CCDS44 LAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQG
       220       230       240       250       260       270       

     300       310       320       330       340       350       
pF1KB9 ANINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSEKG-MGCS
       :.:::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::.::::: : :: :
CCDS44 AKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS
       280       290       300       310       320       330     

>>CCDS44904.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12              (318 aa)
 initn: 1746 init1: 1017 opt: 1111  Z-score: 1241.1  bits: 238.0 E(32554): 8.2e-63
Smith-Waterman score: 1629; 76.3% identity (84.4% similar) in 358 aa overlap (1-356:1-318)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIIT
       ::.:: :.:::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS44 MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKI
       :.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS44 LAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGVPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::. :::::::.::::.    :.:  .:
CCDS44 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLES---PPKG--VT
              130       140       150       160          170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 IPYQPMPASSPVICAGGQDRCSDAAGYPHATHDLEGPPLDAYSIQGQHTISPLDLAKLNQ
       :::.: :.::::: ::::                      ::.::::..:   ::.::.:
CCDS44 IPYRPKPSSSPVIFAGGQ----------------------AYTIQGQYAIPQPDLTKLHQ
         180       190                             200       210   

              250       260       270       280        290         
pF1KB9 VARQQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTT-HELTIPNNLIGCIIGRQG
       .: ::::: : ::.:::.             :.::::.::: :::::::.::::::::::
CCDS44 LAMQQSHFPMTHGNTGFS-------------AGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQG
           220       230                    240       250       260

     300       310       320       330       340       350       
pF1KB9 ANINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSEKG-MGCS
       :.:::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::.::::: : :: :
CCDS44 AKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS
              270       280       290       300       310        

>>CCDS44903.1 PCBP2 gene_id:5094|Hs108|chr12              (331 aa)
 initn: 1788 init1: 1017 opt: 1111  Z-score: 1240.9  bits: 238.0 E(32554): 8.5e-63
Smith-Waterman score: 1753; 79.6% identity (88.0% similar) in 358 aa overlap (1-356:1-331)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIIT
       ::.:: :.:::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS44 MDTGVIEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIGKKGESVKKMREESGARINISEGNCPERIIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKI
       :.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS44 LAGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGCKI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGVPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::. :::::::.::::.    :.:  .:
CCDS44 KEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAGIPQSIIECVKQICVVMLES---PPKG--VT
              130       140       150       160          170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 IPYQPMPASSPVICAGGQDRCSDAAGYPHATHDLEGPPLDAYSIQGQHTISPLDLAKLNQ
       :::.: :.::::: ::::                      ::.::::..:   ::.::.:
CCDS44 IPYRPKPSSSPVIFAGGQ----------------------AYTIQGQYAIPQPDLTKLHQ
         180       190                             200       210   

              250       260       270       280        290         
pF1KB9 VARQQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVKGYWASLDASTQTT-HELTIPNNLIGCIIGRQG
       .: ::::: : ::.:::.::.:::::::::::.::::.::: :::::::.::::::::::
CCDS44 LAMQQSHFPMTHGNTGFSGIESSSPEVKGYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGRQG
           220       230       240       250       260       270   

     300       310       320       330       340       350       
pF1KB9 ANINEIRQMSGAQIKIANPVEGSSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSEKG-MGCS
       :.:::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::.::::: : :: :
CCDS44 AKINEIRQMSGAQIKIANPVEGSTDRQVTITGSAASISLAQYLINVRLSSETGGMGSS
           280       290       300       310       320       330 

>>CCDS42974.2 PCBP3 gene_id:54039|Hs108|chr21             (371 aa)
 initn: 1400 init1: 913 opt: 1008  Z-score: 1125.7  bits: 216.9 E(32554): 2.2e-56
Smith-Waterman score: 1421; 66.5% identity (81.0% similar) in 364 aa overlap (1-354:33-369)

                                             10        20        30
pF1KB9                               MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIG
                                     :.. :.:.::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGDAFWAPSVLPHSTLSTLSHHPQPQFGRRMESKVSEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIG
             10        20        30        40        50        60  

               40        50        60        70        80        90
pF1KB9 KKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIITLTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNS
       ::::.::..:::::::::::::::::::.:.::::.:::::::::  :.:::: .::.::
CCDS42 KKGETVKKMREESGARINISEGNCPERIVTITGPTDAIFKAFAMIAYKFEEDIINSMSNS
             70        80        90       100       110       120  

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 TAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAG
        :.:.:::::::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::.::.:
CCDS42 PATSKPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGSKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAVTISG
            130       140       150       160       170       180  

              160       170       180       190       200       210
pF1KB9 VPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMTIPYQPMPASSPVICAGGQDRCSDAAGYPHA
       .:... .::::::.::::.    :.:   ::::.: :::.::: ::::            
CCDS42 TPDAIIQCVKQICVVMLES---PPKG--ATIPYRPKPASTPVIFAGGQ------------
            190       200            210       220                 

              220       230        240       250        260        
pF1KB9 THDLEGPPLDAYSIQGQHTIS-PLDLAKLNQVARQQSHFAMM-HGGTGFAGID---SSSP
                 ::.::::..:  : .:.::.:.: ::. :  . . . .: :      :: 
CCDS42 ----------AYTIQGQYAIPHPDQLTKLHQLAMQQTPFPPLGQTNPAFPGEKLPLHSSE
                   230       240       250       260       270     

            270        280       290       300       310       320 
pF1KB9 EVK---GYWASLDASTQ-TTHELTIPNNLIGCIIGRQGANINEIRQMSGAQIKIANPVEG
       :..   :  ..::::   .::::::::.::::::::::..:::::::::::::::: .::
CCDS42 EAQNLMGQSSGLDASPPASTHELTIPNDLIGCIIGRQGTKINEIRQMSGAQIKIANATEG
         280       290       300       310       320       330     

             330       340       350       
pF1KB9 SSGRQVTITGSAASISLAQYLINARLSSE-KGMGCS
       :: ::.::::. :.::::::::::::.::  :::  
CCDS42 SSERQITITGTPANISLAQYLINARLTSEVTGMGTL
         340       350       360       370 

>>CCDS46652.1 PCBP3 gene_id:54039|Hs108|chr21             (345 aa)
 initn: 1428 init1: 891 opt: 918  Z-score: 1026.2  bits: 198.4 E(32554): 7.7e-51
Smith-Waterman score: 1274; 62.0% identity (75.2% similar) in 363 aa overlap (1-354:33-343)

                                             10        20        30
pF1KB9                               MDAGVTESGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIG
                                     :.. :.:.::::::::::::::::::::::
CCDS46 EGDAFWAPSVLPHSTLSTLSHHPQPQFGRRMESKVSEGGLNVTLTIRLLMHGKEVGSIIG
             10        20        30        40        50        60  

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pF1KB9 KKGESVKRIREESGARINISEGNCPERIITLTGPTNAIFKAFAMIIDKLEEDINSSMTNS
       ::::.::..:::::::::::::::::::.:.::::.:::::::::  :.:::: .::.::
CCDS46 KKGETVKKMREESGARINISEGNCPERIVTITGPTDAIFKAFAMIAYKFEEDIINSMSNS
             70        80        90       100       110       120  

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pF1KB9 TAASRPPVTLRLVVPATQCGSLIGKGGCKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAITIAG
        :.:.:::::::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::.::.:
CCDS46 PATSKPPVTLRLVVPASQCGSLIGKGGSKIKEIRESTGAQVQVAGDMLPNSTERAVTISG
            130       140       150       160       170       180  

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pF1KB9 VPQSVTECVKQICLVMLETLSQSPQGRVMTIPYQPMPASSPVICAGGQDRCSDAAGYPHA
       .:... .::::::.::::                                          
CCDS46 TPDAIIQCVKQICVVMLE------------------------------------------
            190       200                                          

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pF1KB9 THDLEGPPLDAYSIQGQHTISPLDLAKLNQVARQQSHFAMM-HGGTGFAGID---SSSPE
                 ::.::::..:   ::.::.:.: ::. :  . . . .: :      :: :
CCDS46 ----------AYTIQGQYAIPHPDLTKLHQLAMQQTPFPPLGQTNPAFPGEKLPLHSSEE
                        210       220       230       240       250

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pF1KB9 VK---GYWASLDASTQ-TTHELTIPNNLIGCIIGRQGANINEIRQMSGAQIKIANPVEGS
       ..   :  ..::::   .::::::::.::::::::::..:::::::::::::::: .:::
CCDS46 AQNLMGQSSGLDASPPASTHELTIPNDLIGCIIGRQGTKINEIRQMSGAQIKIANATEGS
              260       270       280       290       300       310

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       : ::.::::. :.::::::::::::.::  :::  
CCDS46 SERQITITGTPANISLAQYLINARLTSEVTGMGTL
              320       330       340     




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