Result of FASTA (omim) for pFN21AB9777
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9777, 788 aa
  1>>>pF1KB9777 788 - 788 aa - 788 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4751+/-0.000423; mu= 5.7067+/- 0.026
 mean_var=190.5640+/-38.862, 0's: 0 Z-trim(117.7): 238  B-trim: 366 in 2/49
 Lambda= 0.092908
 statistics sampled from 29610 (29851) to 29610 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.35), width:  16
 Scan time: 11.720

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001254500 (OMIM: 609871) TBC1 domain family mem ( 928) 1600 227.8 1.7e-58
NP_060891 (OMIM: 609871) TBC1 domain family member ( 917) 1424 204.2 2.1e-51
XP_016870388 (OMIM: 609871) PREDICTED: TBC1 domain ( 483) 1365 196.1 3.1e-49
NP_001254501 (OMIM: 609871) TBC1 domain family mem ( 468) 1344 193.2 2.1e-48
XP_011517145 (OMIM: 609871) PREDICTED: TBC1 domain ( 468) 1344 193.2 2.1e-48
XP_005261631 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 739)  682 104.6 1.6e-21
NP_056520 (OMIM: 610440) small G protein signaling ( 749)  682 104.6 1.6e-21
XP_005261630 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 756)  682 104.7 1.6e-21
XP_005261629 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 766)  682 104.7 1.6e-21
NP_001288778 (OMIM: 610440) small G protein signal ( 660)  651 100.5 2.6e-20
XP_016884266 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 672)  651 100.5 2.6e-20
XP_016884265 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 682)  651 100.5 2.6e-20
XP_016884264 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 686)  651 100.5 2.6e-20
XP_011528464 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 686)  651 100.5 2.6e-20
XP_005261632 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 699)  651 100.5 2.7e-20
XP_011528462 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 703)  651 100.5 2.7e-20
XP_011528461 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 703)  651 100.5 2.7e-20
XP_016884269 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 583)  535 84.9 1.1e-15
XP_011528463 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 600)  535 84.9 1.1e-15
XP_016884268 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 600)  535 84.9 1.1e-15
XP_006718602 (OMIM: 610831) PREDICTED: carabin iso ( 446)  447 73.0 3.2e-12
XP_006718603 (OMIM: 610831) PREDICTED: carabin iso ( 446)  447 73.0 3.2e-12
XP_006718601 (OMIM: 610831) PREDICTED: carabin iso ( 446)  447 73.0 3.2e-12
NP_940919 (OMIM: 610831) carabin isoform 1 [Homo s ( 446)  447 73.0 3.2e-12
NP_056342 (OMIM: 613620) TBC1 domain family member ( 808)  438 72.0 1.2e-11
XP_016884267 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 651)  425 70.2 3.3e-11
XP_011528460 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G pro ( 718)  425 70.2 3.6e-11
XP_011543304 (OMIM: 610831) PREDICTED: carabin iso ( 313)  412 68.2 6.2e-11
NP_114143 (OMIM: 610020) TBC1 domain family member ( 508)  411 68.2   1e-10
NP_001191169 (OMIM: 610020) TBC1 domain family mem ( 515)  411 68.2   1e-10
XP_016858483 (OMIM: 609238) PREDICTED: rab GTPase- ( 778)  385 64.9 1.6e-09
NP_055672 (OMIM: 609238) rab GTPase-activating pro ( 815)  385 64.9 1.6e-09
XP_011511972 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain ( 494)  380 64.0 1.7e-09
XP_006714064 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain ( 546)  380 64.1 1.9e-09
XP_006711756 (OMIM: 609238) PREDICTED: rab GTPase- ( 985)  385 64.9 1.9e-09
XP_005245738 (OMIM: 609238) PREDICTED: rab GTPase- (1014)  385 64.9 1.9e-09
XP_005245737 (OMIM: 609238) PREDICTED: rab GTPase- (1051)  385 64.9   2e-09
XP_011508525 (OMIM: 609238) PREDICTED: rab GTPase- (1051)  385 64.9   2e-09
XP_016863410 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1039)  380 64.3 3.1e-09
XP_005262706 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1146)  380 64.3 3.4e-09
NP_055988 (OMIM: 609850) TBC1 domain family member (1168)  380 64.3 3.4e-09
XP_016863409 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1181)  380 64.3 3.5e-09
XP_011511968 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1188)  380 64.3 3.5e-09
XP_011511967 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1201)  380 64.3 3.5e-09
XP_016863408 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1222)  380 64.3 3.6e-09
XP_016863407 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1228)  380 64.3 3.6e-09
XP_011511966 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1241)  380 64.3 3.6e-09
XP_011511965 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1242)  380 64.3 3.6e-09
XP_011511964 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1255)  380 64.3 3.6e-09
XP_005262704 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1262)  380 64.3 3.7e-09


>>NP_001254500 (OMIM: 609871) TBC1 domain family member   (928 aa)
 initn: 1645 init1: 609 opt: 1600  Z-score: 1171.1  bits: 227.8 E(85289): 1.7e-58
Smith-Waterman score: 1754; 40.9% identity (69.4% similar) in 784 aa overlap (1-773:130-860)

                                             10        20        30
pF1KB9                               MTYWLQELQQKRWEYCNSLDMVKWDSRTSP
                                     : ::::.::.::::. ::           :
NP_001 FDCKADAEEGIFEIKTPSRVITLKAATKQAMLYWLQQLQMKRWEFHNS----------PP
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pF1KB9 TPGDFPKGLVARDNTDLIYPHPNASAEKARNVLAVETVPGELVGEQAANQPAPGHPNSIN
       .:   : . .: ..  :     .  ::  . .  :.: :: :::  :: :: :.  :   
NP_001 APPATPDAALAGNGPVLHLELGQEEAELEEFLCPVKTPPG-LVGVAAALQPFPALQN---
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pF1KB9 FYSLKQWGNELKNSMSSFRPGRGHNDSRRTVFYTNEEWELLDPTPKDLEESIVQEEKKKL
         :::. :.:..:.: ..   ::..... :           .:  .:  .:   : ... 
NP_001 -ISLKHLGTEIQNTMHNI---RGNKQAQGTGH---------EPPGEDSPQS--GEPQREE
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pF1KB9 TPEGNKGVTGSGFPFDFGRNPYKGKRPLKDIIGSYK-NRHSSGDPS-SEGTSGSGSVSIR
        : .. . : .  : :   .:  . .:   :  . : .:...  :  :::      ..  
NP_001 QPLASDASTPGREPED---SPKPAPKPSLTISFAQKAKRQNNTFPFFSEG------ITRN
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pF1KB9 KPASEMQLQVQSQQEELEQLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCEGVPKDT
       . :.:   .: . .... .: :.:.::::::..:.......: .:  .:. :  .  :: 
NP_001 RTAQE---KVAALEQQVLMLTKELKSQKELVKILHKALEAAQQEKRASSAYLAAAEDKDR
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pF1KB9 LELLHQKDDQILGLTSQLERFSLEKESLQQEVRTLKSKVGELNEQLGMLMETIQAKDEVI
       :::...:  ::  :  ..: .  :.::: . .   ...: ::.... .::.  .::..::
NP_001 LELVRHKVRQIAELGRRVEALEQERESLAHTASLREQQVQELQQHVQLLMDKNHAKQQVI
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pF1KB9 IKLSEG--EGNGPPPTVAPSSPSVVPVARD----QLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEIL
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NP_001 CKLSEKVTQDFTHPPDQSPLRPDA--ANRDFLSQQGKIEHLKDDMEAYRTQNCFLNSEIH
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pF1KB9 ELSALRRNAERRERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQL
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pF1KB9 LEDALQVESQEQPEQAF-VKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE-KLVAKVRALDLKTLYLT
       ...::: :. :   ... ..:  .:.:: ::: :::. . :. ::.::..::. .. .: 
NP_001 VQEALQWEAGEASSDSIELSP--ISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLL
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pF1KB9 ENQEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDN
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NP_001 GLEAVDRPLR-ERWAALG---DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLV--HLRVQHLH
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pF1KB9 TEPGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRN
       : :: .: ::...  ...::..:::::: ::.:::::..::::   .::: :::::::.:
NP_001 T-PGCYQELLSRGQAREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQN
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pF1KB9 PDIGYCQGLNRLVAVALLYLEQED-AFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDL
       : ::::::::::.:.::: ::.:. ::::::.:::..:: ::: .:: .:::::::..::
NP_001 PTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDL
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NP_001 AIFKYNEKEILRLQNGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHR
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>>NP_060891 (OMIM: 609871) TBC1 domain family member 2A   (917 aa)
 initn: 1578 init1: 432 opt: 1424  Z-score: 1043.7  bits: 204.2 E(85289): 2.1e-51
Smith-Waterman score: 1663; 39.9% identity (68.0% similar) in 784 aa overlap (1-773:130-849)

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pF1KB9                               MTYWLQELQQKRWEYCNSLDMVKWDSRTSP
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pF1KB9 TPGDFPKGLVARDNTDLIYPHPNASAEKARNVLAVETVPGELVGEQAANQPAPGHPNSIN
       .:   : . .: ..  :     .  ::  . .  :.: :: :::  :: :: :.  :   
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pF1KB9 FYSLKQWGNELKNSMSSFRPGRGHNDSRRTVFYTNEEWELLDPTPKDLEESIVQEEKKKL
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        : .. . : .  : :   .:  . .:   :  . : .:...  :  :::      ..  
NP_060 QPLASDASTPGREPED---SPKPAPKPSLTISFAQKAKRQNNTFPFFSEG------ITRN
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      210       220       230       240       250       260        
pF1KB9 KPASEMQLQVQSQQEELEQLKKDLSSQKELVRLLQQTVRSSQYDKYFTSSRLCEGVPKDT
       . :.:   .: . .... .: :.:.::::::..:.......: .:  .:. :  .  :: 
NP_060 RTAQE---KVAALEQQVLMLTKELKSQKELVKILHKALEAAQQEKRASSAYLAAAEDKDR
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      270       280       290       300       310       320        
pF1KB9 LELLHQKDDQILGLTSQLERFSLEKESLQQEVRTLKSKVGELNEQLGMLMETIQAKDEVI
       :::...:  ::  :  ..: .  :.::: . .   ...: ::.... .::.  .::..::
NP_060 LELVRHKVRQIAELGRRVEALEQERESLAHTASLREQQVQELQQHVQLLMDKNHAKQQVI
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pF1KB9 IKLSEG--EGNGPPPTVAPSSPSVVPVARD----QLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEIL
        ::::   .    ::  .:  :..  . ::    : ....:::....:.::: :::.:: 
NP_060 CKLSEKVTQDFTHPPDQSPLRPDA--ANRDFLSQQGKIEHLKDDMEAYRTQNCFLNSEIH
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pF1KB9 ELSALRRNAERRERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQL
       ... . :.. ..:. :..: . :.:. ::.:::::  :....  . ... .   :.. ::
NP_060 QVTKIWRKVAEKEKALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEAL-GDEASECSELLRQL
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pF1KB9 LEDALQVESQEQPEQAF-VKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE-KLVAKVRALDLKTLYLT
       ...::: :. :   ... ..:  .:.:: ::: :::. . :. ::.::..::. .. .: 
NP_060 VQEALQWEAGEASSDSIELSP--ISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLL
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pF1KB9 ENQEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDN
         . :.  .. : . :     ... : :::.:.:::.:.::: .::.: :  : :  . .
NP_060 GLEAVDRPLR-ERWAALG---DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLV--HLRVQHLH
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pF1KB9 TEPGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRN
       : :: .: ::...  ...::..:::::: ::.:::::..::::   .::: :::::::.:
NP_060 T-PGCYQELLSRGQAREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQN
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pF1KB9 PDIGYCQGLNRLVAVALLYLEQED-AFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDL
       : ::::::::::.:.::: ::.:. ::::::.:::..:: ::: .:: .:::::::..::
NP_060 PTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDL
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pF1KB9 MSEKLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFAL
       .::::::: .:. :..:: .:.:::::::::.::..:.::...::.::::: :       
NP_060 LSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTK-------
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pF1KB9 ALFKYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS           
           :.:.:::.::... :..:::.::.:: ..:                          
NP_060 ----YNEKEILRLQNGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHR
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NP_060 ERLEAELRELEQLKAEYLERRASRRRAVSEGCASEDEVEGEA
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>>XP_016870388 (OMIM: 609871) PREDICTED: TBC1 domain fam  (483 aa)
 initn: 1344 init1: 609 opt: 1365  Z-score: 1004.9  bits: 196.1 E(85289): 3.1e-49
Smith-Waterman score: 1365; 50.7% identity (80.7% similar) in 414 aa overlap (363-773:12-415)

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pF1KB9 EGEGNGPPPTVAPSSPSVVPVARDQLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEILELSALRRNAE
                                     :::....:.::: :::.:: ... . :.. 
XP_016                    MSAVCSEPRRALKDDMEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVA
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pF1KB9 RRERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQLLEDALQVESQ
       ..:. :..: . :.:. ::.:::::  :....  . ... .   :.. ::...::: :. 
XP_016 EKEKALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEAL-GDEASECSELLRQLVQEALQWEAG
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pF1KB9 EQPEQAF-VKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE-KLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVK
       :   ... ..:  .:.:: ::: :::. . :. ::.::..::. .. .:   . :.  ..
XP_016 EASSDSIELSP--ISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLR
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pF1KB9 WENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLL
        : . :     ... : :::.:.:::.:.::: .::.: :  : :  . .: :: .: ::
XP_016 -ERWAALG---DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLV--HLRVQHLHT-PGCYQELL
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pF1KB9 QKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLN
       ...  ...::..:::::: ::.:::::..::::   .::: :::::::.:: ::::::::
XP_016 SRGQAREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLN
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pF1KB9 RLVAVALLYLEQED-AFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHG
       ::.:.::: ::.:. ::::::.:::..:: ::: .:: .:::::::..::.::::::: .
XP_016 RLAAIALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMA
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pF1KB9 HFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEI
       :. :..:: .:.:::::::::.::..:.::...::.::::: ::.::.:::.:::.:.::
XP_016 HLGQHHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEI
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pF1KB9 LKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS                     
       :.::... :..:::.::.:: ..:                                    
XP_016 LRLQNGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELREL
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>>NP_001254501 (OMIM: 609871) TBC1 domain family member   (468 aa)
 initn: 1323 init1: 609 opt: 1344  Z-score: 989.9  bits: 193.2 E(85289): 2.1e-48
Smith-Waterman score: 1344; 50.5% identity (80.5% similar) in 410 aa overlap (367-773:1-400)

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NP_001                               MEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVAEKEK
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pF1KB9 DLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQLLEDALQVESQEQPE
        :..: . :.:. ::.:::::  :....  . ... .   :.. ::...::: :. :   
NP_001 ALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEAL-GDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASS
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pF1KB9 QAF-VKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE-KLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVKWENY
       ... ..:  .:.:: ::: :::. . :. ::.::..::. .. .:   . :.  .. : .
NP_001 DSIELSP--ISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLR-ERW
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pF1KB9 FASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLLQKAL
        :     ... : :::.:.:::.:.::: .::.: :  : :  . .: :: .: ::... 
NP_001 AALG---DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLV--HLRVQHLHT-PGCYQELLSRGQ
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pF1KB9 EKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVA
        ...::..:::::: ::.:::::..::::   .::: :::::::.:: ::::::::::.:
NP_001 AREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAA
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pF1KB9 VALLYLEQED-AFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGHFEQ
       .::: ::.:. ::::::.:::..:: ::: .:: .:::::::..::.::::::: .:. :
NP_001 IALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQ
              270       280       290       300       310       320

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pF1KB9 YKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEILKLQ
       ..:: .:.:::::::::.::..:.::...::.::::: ::.::.:::.:::.:.:::.::
NP_001 HHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQ
              330       340       350       360       370       380

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pF1KB9 DSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS                         
       ... :..:::.::.:: ..:                                        
NP_001 NGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK
              390       400       410       420       430       440

>>XP_011517145 (OMIM: 609871) PREDICTED: TBC1 domain fam  (468 aa)
 initn: 1323 init1: 609 opt: 1344  Z-score: 989.9  bits: 193.2 E(85289): 2.1e-48
Smith-Waterman score: 1344; 50.5% identity (80.5% similar) in 410 aa overlap (367-773:1-400)

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB9 NGPPPTVAPSSPSVVPVARDQLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEILELSALRRNAERRER
                                     ...:.::: :::.:: ... . :.. ..:.
XP_011                               MEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVAEKEK
                                             10        20        30

        400       410       420       430       440       450      
pF1KB9 DLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQLLEDALQVESQEQPE
        :..: . :.:. ::.:::::  :....  . ... .   :.. ::...::: :. :   
XP_011 ALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEAL-GDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASS
               40        50        60         70        80         

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pF1KB9 QAF-VKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE-KLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVKWENY
       ... ..:  .:.:: ::: :::. . :. ::.::..::. .. .:   . :.  .. : .
XP_011 DSIELSP--ISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLR-ERW
      90         100       110       120       130       140       

          520       530       540       550       560       570    
pF1KB9 FASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLLQKAL
        :     ... : :::.:.:::.:.::: .::.: :  : :  . .: :: .: ::... 
XP_011 AALG---DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLV--HLRVQHLHT-PGCYQELLSRGQ
        150          160       170         180        190       200

          580       590       600       610       620       630    
pF1KB9 EKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVA
        ...::..:::::: ::.:::::..::::   .::: :::::::.:: ::::::::::.:
XP_011 AREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAA
              210       220       230       240       250       260

          640        650       660       670       680       690   
pF1KB9 VALLYLEQED-AFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGHFEQ
       .::: ::.:. ::::::.:::..:: ::: .:: .:::::::..::.::::::: .:. :
XP_011 IALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQ
              270       280       290       300       310       320

           700       710       720       730       740       750   
pF1KB9 YKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEILKLQ
       ..:: .:.:::::::::.::..:.::...::.::::: ::.::.:::.:::.:.:::.::
XP_011 HHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQ
              330       340       350       360       370       380

           760       770       780                                 
pF1KB9 DSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS                         
       ... :..:::.::.:: ..:                                        
XP_011 NGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK
              390       400       410       420       430       440

>>XP_005261631 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G protein  (739 aa)
 initn: 674 init1: 592 opt: 682  Z-score: 507.5  bits: 104.6 E(85289): 1.6e-21
Smith-Waterman score: 694; 36.1% identity (66.9% similar) in 360 aa overlap (425-772:6-347)

          400       410       420       430       440         450  
pF1KB9 ERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQ--LLEDALQVESQ
                                     ::.:.  .. :  .  :  : . . . :: 
XP_005                          MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESA
                                        10        20        30     

            460       470       480         490               500  
pF1KB9 EQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE--KLVAKVRALD-----LK---TLYLTEN
       ::::  :        :: .:::.  :. .:   .:.:.   ..     :.    : .:.:
XP_005 EQPE--FY-------YDEFGFRVYKEEGDEPGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHN
            40               50        60        70        80      

            510       520       530       540       550       560  
pF1KB9 QEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTE
       ..:.  . :.. .: .. :    : .:..:. :::::  : ..:   ..   .: : :.:
XP_005 HDVGD-LTWDK-IAVSLPR----SEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMR-LSGALQK-KRNSE
         90         100           110       120        130         

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pF1KB9 PGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPD
        . .. ..... . .. :.:::: :::::.:.:  ..   : :. .:: :: :..:  :.
XP_005 LS-YREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPE
      140        150       160       170       180       190       

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pF1KB9 IGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSE
       :::::: . ..:  ::.::.::::: . .:.: ..: .:.. :::: :.::::.: :. .
XP_005 IGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQ
       200       210       220       230       240       250       

            690       700       710       720       730       740  
pF1KB9 KLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALF
        ::::   .... .. .:::..:::..:.. :   .:..::: :.::: .:.:...:...
XP_005 YLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGML
       260       270       280       290       300       310       

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pF1KB9 KYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS              
       . ::::... ..: :::. :  .   . ::                              
XP_005 HLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYL
       320       330       340       350       360       370       

>>NP_056520 (OMIM: 610440) small G protein signaling mod  (749 aa)
 initn: 674 init1: 592 opt: 682  Z-score: 507.5  bits: 104.6 E(85289): 1.6e-21
Smith-Waterman score: 694; 36.1% identity (66.9% similar) in 360 aa overlap (425-772:6-347)

          400       410       420       430       440         450  
pF1KB9 ERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQ--LLEDALQVESQ
                                     ::.:.  .. :  .  :  : . . . :: 
NP_056                          MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESA
                                        10        20        30     

            460       470       480         490               500  
pF1KB9 EQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE--KLVAKVRALD-----LK---TLYLTEN
       ::::  :        :: .:::.  :. .:   .:.:.   ..     :.    : .:.:
NP_056 EQPE--FY-------YDEFGFRVYKEEGDEPGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHN
            40               50        60        70        80      

            510       520       530       540       550       560  
pF1KB9 QEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTE
       ..:.  . :.. .: .. :    : .:..:. :::::  : ..:   ..   .: : :.:
NP_056 HDVGD-LTWDK-IAVSLPR----SEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMR-LSGALQK-KRNSE
         90         100           110       120        130         

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pF1KB9 PGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPD
        . .. ..... . .. :.:::: :::::.:.:  ..   : :. .:: :: :..:  :.
NP_056 LS-YREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPE
      140        150       160       170       180       190       

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pF1KB9 IGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSE
       :::::: . ..:  ::.::.::::: . .:.: ..: .:.. :::: :.::::.: :. .
NP_056 IGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQ
       200       210       220       230       240       250       

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pF1KB9 KLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALF
        ::::   .... .. .:::..:::..:.. :   .:..::: :.::: .:.:...:...
NP_056 YLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGML
       260       270       280       290       300       310       

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pF1KB9 KYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS              
       . ::::... ..: :::. :  .   . ::                              
NP_056 HLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYL
       320       330       340       350       360       370       

>>XP_005261630 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G protein  (756 aa)
 initn: 674 init1: 592 opt: 682  Z-score: 507.4  bits: 104.7 E(85289): 1.6e-21
Smith-Waterman score: 694; 36.1% identity (66.9% similar) in 360 aa overlap (425-772:6-347)

          400       410       420       430       440         450  
pF1KB9 ERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQ--LLEDALQVESQ
                                     ::.:.  .. :  .  :  : . . . :: 
XP_005                          MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESA
                                        10        20        30     

            460       470       480         490               500  
pF1KB9 EQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE--KLVAKVRALD-----LK---TLYLTEN
       ::::  :        :: .:::.  :. .:   .:.:.   ..     :.    : .:.:
XP_005 EQPE--FY-------YDEFGFRVYKEEGDEPGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHN
            40               50        60        70        80      

            510       520       530       540       550       560  
pF1KB9 QEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTE
       ..:.  . :.. .: .. :    : .:..:. :::::  : ..:   ..   .: : :.:
XP_005 HDVGD-LTWDK-IAVSLPR----SEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMR-LSGALQK-KRNSE
         90         100           110       120        130         

            570       580       590       600       610       620  
pF1KB9 PGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPD
        . .. ..... . .. :.:::: :::::.:.:  ..   : :. .:: :: :..:  :.
XP_005 LS-YREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPE
      140        150       160       170       180       190       

            630       640       650       660       670       680  
pF1KB9 IGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSE
       :::::: . ..:  ::.::.::::: . .:.: ..: .:.. :::: :.::::.: :. .
XP_005 IGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQ
       200       210       220       230       240       250       

            690       700       710       720       730       740  
pF1KB9 KLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALF
        ::::   .... .. .:::..:::..:.. :   .:..::: :.::: .:.:...:...
XP_005 YLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGML
       260       270       280       290       300       310       

            750       760       770       780                      
pF1KB9 KYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS              
       . ::::... ..: :::. :  .   . ::                              
XP_005 HLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYL
       320       330       340       350       360       370       

>>XP_005261629 (OMIM: 610440) PREDICTED: small G protein  (766 aa)
 initn: 674 init1: 592 opt: 682  Z-score: 507.3  bits: 104.7 E(85289): 1.6e-21
Smith-Waterman score: 694; 36.1% identity (66.9% similar) in 360 aa overlap (425-772:6-347)

          400       410       420       430       440         450  
pF1KB9 ERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQ--LLEDALQVESQ
                                     ::.:.  .. :  .  :  : . . . :: 
XP_005                          MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESA
                                        10        20        30     

            460       470       480         490               500  
pF1KB9 EQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE--KLVAKVRALD-----LK---TLYLTEN
       ::::  :        :: .:::.  :. .:   .:.:.   ..     :.    : .:.:
XP_005 EQPE--FY-------YDEFGFRVYKEEGDEPGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHN
            40               50        60        70        80      

            510       520       530       540       550       560  
pF1KB9 QEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTE
       ..:.  . :.. .: .. :    : .:..:. :::::  : ..:   ..   .: : :.:
XP_005 HDVGD-LTWDK-IAVSLPR----SEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMR-LSGALQK-KRNSE
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       :::::: . ..:  ::.::.::::: . .:.: ..: .:.. :::: :.::::.: :. .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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