Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8997
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8997, 408 aa
1>>>pF1KB8997 408 - 408 aa - 408 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6695+/-0.000748; mu= 15.3242+/- 0.045
mean_var=70.8872+/-14.021, 0's: 0 Z-trim(109.2): 40 B-trim: 3 in 1/48
Lambda= 0.152332
statistics sampled from 10708 (10748) to 10708 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 ( 408) 2799 624.0 7.5e-179
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 1546 348.7 5.7e-96
CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 ( 402) 569 134.0 2.5e-31
CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 ( 402) 566 133.3 4e-31
CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 ( 431) 524 124.1 2.5e-28
CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 507 120.4 3.5e-27
CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 ( 513) 487 116.0 8.3e-26
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 477 113.8 3.4e-25
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 475 113.3 5e-25
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 471 112.4 8.4e-25
CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 ( 364) 460 110.0 3.8e-24
CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2 ( 424) 411 99.3 7.5e-21
CCDS3588.1 BMP3 gene_id:651|Hs108|chr4 ( 472) 409 98.8 1.1e-20
CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10 ( 429) 389 94.4 2.2e-19
CCDS73117.1 GDF10 gene_id:2662|Hs108|chr10 ( 478) 386 93.8 3.7e-19
CCDS7304.1 NODAL gene_id:4838|Hs108|chr10 ( 347) 379 92.2 8.2e-19
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 361 88.3 1.5e-17
CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19 ( 372) 345 84.7 1.6e-16
CCDS14334.1 BMP15 gene_id:9210|Hs108|chrX ( 392) 343 84.3 2.2e-16
CCDS2132.1 INHBB gene_id:3625|Hs108|chr2 ( 407) 328 81.0 2.2e-15
CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 ( 350) 321 79.4 5.7e-15
CCDS75299.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 366) 295 73.7 3.1e-13
CCDS8938.1 INHBC gene_id:3626|Hs108|chr12 ( 352) 294 73.5 3.5e-13
CCDS4162.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 454) 295 73.8 3.7e-13
CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 ( 375) 274 69.1 7.8e-12
CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 ( 407) 270 68.3 1.5e-11
>>CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 (408 aa)
initn: 2799 init1: 2799 opt: 2799 Z-score: 3324.4 bits: 624.0 E(32554): 7.5e-179
Smith-Waterman score: 2799; 99.8% identity (100.0% similar) in 408 aa overlap (1-408:1-408)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MIPGNRMLMVVLLCQVLLGGASHASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFEAT
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CCDS97 MIPGNRMLMVVLLCQVLLGGASHASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFEAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LLQMFGLRRRPQPSKSAVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPASRANTVRSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LLQMFGLRRRPQPSKSAVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPASRANTVRSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HHEEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEAISSAELRLFREQVDQGPDWERGFHRINI
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 HHEEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEVISSAELRLFREQVDQGPDWERGFHRINI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYGLAIEVTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 YEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYGLAIEVTH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFGHDGRGHALTRRRRAKRSPKHHSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFGHDGRGHALTRRRRAKRSPKHHSQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ARKKNKNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ARKKNKNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB8 VNSVNSSIPKACCVPTELSAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGCGCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VNSVNSSIPKACCVPTELSAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGCGCR
370 380 390 400
>>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 (396 aa)
initn: 947 init1: 687 opt: 1546 Z-score: 1836.4 bits: 348.7 E(32554): 5.7e-96
Smith-Waterman score: 1648; 62.8% identity (82.0% similar) in 411 aa overlap (1-408:1-396)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MIPGNRMLMVVLLCQVLLGGASHASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQ-SHELLRDFEA
:. :.: :...:: ::::::: :.:.:: :..: : ..:: :.: : :.: .::
CCDS13 MVAGTRCLLALLLPQVLLGGA--AGLVPELGRRKFAAA---SSGRPSSQPSDEVLSEFEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 TLLQMFGLRRRPQPSKSAVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYP-ERPASRANTVR
::.::::..:: ::..::.: :: :::: .:: : : . .. :: ::::::::
CCDS13 RLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSG-----QPGSPAPDHRLERAASRANTVR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SFHHEEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEAISSAELRLFREQVDQGPDWERGFH-R
:::::: ::..: :: ... ::.::::::: .: :.::::..::::.... . .:: :
CCDS13 SFHHEESLEELPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 INIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYGLAIE
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CCDS13 INIYEIIKP-ATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVE
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTHLHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFGHDGRGHALTRRRRAKRSPKHH
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CCDS13 VAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPL--HKREKRQAKHK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 SQRARKKNKNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIV
:: : :. .:.:: ::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS13 -QRKRLKS-SCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB8 QTLVNSVNSSIPKACCVPTELSAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGCGCR
:::::::::.::::::::::::::::::::: .::::::::.:::::::::
CCDS13 QTLVNSVNSKIPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
350 360 370 380 390
>>CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 605 init1: 285 opt: 569 Z-score: 675.9 bits: 134.0 E(32554): 2.5e-31
Smith-Waterman score: 639; 31.6% identity (59.8% similar) in 430 aa overlap (3-407:5-401)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MIPGNRMLMVVLLCQVLLGGASHASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFE
:: :. . :: :::.. .: : : . :: : .. :: .
CCDS43 MAARPGPLWLLGLTLCA--LGGGG-PGLRPPPGCPQ----------RRLGARER--RDVQ
10 20 30 40
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pF1KB8 ATLLQMFGLRRRPQPSKS-------AVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPA
.: ..:: ::.: : : .: :::. ..:...:. : .:
CCDS43 REILAVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDDDED-----GAPAEQR-L
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SRANTVRSFHHEEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEAISSAELRLFREQVDQGPDW
.::. : :: . . . : .: .: :.:..:: .::...::.:... : .
CCDS43 GRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYK--VPSIHLL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ERGFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPN
.: .: .....:.. .. . :. .:: . .. . : ..::. : : ... .
CCDS43 NRTLH-VSMFQVVQEQSNR-ESDLF--FLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLLKRHKD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB8 YGLAIEVTHLHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFGHDGRGHALT------
:: . : .:..:. : . . :. . .:..::: . . . :
CCDS43 LGLRLYV------ETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTPRAVRP
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330
pF1KB8 -RRRRAKRS---PKHHSQ-------RARKKNKNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQA
:::. :.: :. . :. . . :::: :::.:.:.:: ::..:: ::.:
CCDS43 LRRRQPKKSNELPQANRLPGIFDDVRGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQGYSA
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 FYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVN-SSIPKACCVPTELSAISMLYLDEYDKVV
.::.:.: ::: . .:.:::::.:.::. .. ...:::::.::.::: :.:: : ..:.
CCDS43 YYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMKPNAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNNVI
330 340 350 360 370 380
400
pF1KB8 LKNYQEMVVEGCGCR
:.....:::..:::
CCDS43 LRKHRNMVVKACGCH
390 400
>>CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 613 init1: 285 opt: 566 Z-score: 672.3 bits: 133.3 E(32554): 4e-31
Smith-Waterman score: 637; 31.6% identity (59.7% similar) in 434 aa overlap (2-407:4-401)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MIPGNRMLMVVLLCQVLLGGASHASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFE
.:: :. . :: :::.. .: : : . :: : .. :: .
CCDS44 MTALPGPLWLLGLALCA--LGGGG-PGLRPPPGCPQ----------RRLGARER--RDVQ
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 ATLLQMFGLRRRPQPSKS-------AVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPA
.: ..:: ::.: : : .: :::. ..:...:. . ::
CCDS44 REILAVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDDDEDGAPA------ERRL
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SRANTVRSFHHEEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEAISSAELRLFREQVDQGPDW
.::. : :: . . . : .: .: :.:..:: .::...::.:... : .
CCDS44 GRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYK--VPSIHLL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ERGFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPN
.: .: .....:.. .. . :. .:: . .. . : ..::. : : ... .
CCDS44 NRTLH-VSMFQVVQEQSNR-ESDLF--FLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLLKRHKD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB8 YGLAIEVTHLHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFGHDGRGHALT------
:: . : .:..:. : . . :. . .:..::: . . . :
CCDS44 LGLRLYV------ETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTPRAVRP
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330
pF1KB8 -RRRRAKRS---PKH----------HSQRARKKNKNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPG
:::. :.: :. :....: . :::: :::.:.:.:: ::..:: :
CCDS44 LRRRQPKKSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGR---QVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQG
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 YQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTLVN-SVNSSIPKACCVPTELSAISMLYLDEYD
:.:.::.:.: ::: . .:.:::::.:.::. . ...:::::.::.::: :.:: : .
CCDS44 YSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMMPDAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSN
330 340 350 360 370 380
400
pF1KB8 KVVLKNYQEMVVEGCGCR
.:.:.....:::..:::
CCDS44 NVILRKHRNMVVKACGCH
390 400
>>CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 (431 aa)
initn: 669 init1: 273 opt: 524 Z-score: 622.0 bits: 124.1 E(32554): 2.5e-28
Smith-Waterman score: 669; 33.3% identity (60.0% similar) in 402 aa overlap (46-407:47-430)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 VLLGGASHASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFEATLLQMFGLRRRPQP--
:: . .:. :. .:...:: .::.:
CCDS13 LWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQRE----ILSILGLPHRPRPHL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110
pF1KB8 -SKSAVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPA-----------------SRAN
.: : .: ::: .. :: . :. :: . . . :.
CCDS13 QGKHNSAPMFMLDLYNAMA-VEEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLASLQDSHFLTDAD
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 TVRSFHH--EEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEAISSAELRLFREQVDQGPDWER
: :: . :. : . .. ::: .::.:::.::...::.:.... . . : :
CCDS13 MVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRF--DLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNET
140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 GFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYG
::..:.:.. : . . :::.: . . : .::.. . .:. . . : :
CCDS13 --FRISVYQVLQ---EHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB8 LAIEVTHLHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFGHDGRGH------ALTRR
: . : : . :.: ::.. .:..:.: . . : . ...
CCDS13 LQLSVETLDGQSINPKLAGLIGRHGPQNK------QPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQ
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB8 RRAKRSPKHHSQRA-RKKN----------KNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFY
: .:: ..:.: : : . :..: :::.: :.::.:::.:: :: :.:
CCDS13 RSQNRSKTPKNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 CHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNS-SIPKACCVPTELSAISMLYLDEYDKVVLK
:.:.: ::: ...:.::::::::::. .: ..:: ::.::.:.:::.::.:. ..:.::
CCDS13 CEGECAFPLNSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILK
360 370 380 390 400 410
400
pF1KB8 NYQEMVVEGCGCR
.:..:::..:::
CCDS13 KYRNMVVRACGCH
420 430
>>CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 (454 aa)
initn: 627 init1: 274 opt: 507 Z-score: 601.4 bits: 120.4 E(32554): 3.5e-27
Smith-Waterman score: 624; 30.4% identity (60.5% similar) in 425 aa overlap (46-407:41-453)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 VLLGGASHASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFEATLLQMFGLRRRPQP--
: ..:: :... .:...:: .::.:
CCDS49 IVGFLWSCWVLVGYAKGGLGDNHVHSSFIYRRLRNHER-REIQREILSILGLPHRPRPFS
20 30 40 50 60
80 90 100 110
pF1KB8 --SKSAVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQ----IHSTGLE--------YPERPASRANTVR-
.... : .: ::: ...::. :. .... : :: : . ..
CCDS49 PGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYPASPNGYPRRIQL
70 80 90 100 110 120
120 130 140
pF1KB8 --------------SFHHEEHLEN-------IPGTSENSAF--------RFLFNLSSIPE
:.: . :.. . . ... : .: :.:..::.
CCDS49 SRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKEFRFDLTQIPH
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 NEAISSAELRLFREQVDQGPDWERGFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNV
.::...::.:..... .. .: .:.::...: : . ::::: ..
CCDS49 GEAVTAAEFRIYKDRSNN--RFENETIKISIYQIIK---EYTNRDADLFLLDTRKAQALD
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
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. : .::.. . .:. . : : :: . . .: .:. . .. . : . . .
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::.: :.::.:::.:: :: :::: :.: ::: :.:.::::::::::. . . .:: :
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380 390 400
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. .. : : .:::. .:. . .:: :: .. . ::.: :::.:.
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CCDS45 LNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
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: : .:: . ...: : . . . . : .. .:..: : .
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CCDS34 KLTPISILYIDAGNNVVYKQYEDMVVESCGCR
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CCDS13 IWKLFRNFKNSAQLCLELEAWERGRAVDLRGLGFDRAARQVHEK-ALFLVFGRTKKRDLF
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CCDS13 FNEIKARSGQDDKTVYEYLFSQRRKRRAPLA-TRQGKRPSKNLKARCSRKALHVNFKDMG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]