Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8984
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8984, 386 aa
1>>>pF1KB8984 386 - 386 aa - 386 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6262+/-0.000771; mu= 16.4151+/- 0.047
mean_var=120.0431+/-32.030, 0's: 0 Z-trim(111.1): 124 B-trim: 1356 in 2/49
Lambda= 0.117059
statistics sampled from 11916 (12127) to 11916 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 3.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12686.1 PTGIR gene_id:5739|Hs108|chr19 ( 386) 2622 453.8 1.2e-127
CCDS9708.1 PTGER2 gene_id:5732|Hs108|chr14 ( 358) 787 143.9 2.2e-34
CCDS61454.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 ( 296) 535 101.2 1.2e-21
CCDS9707.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 ( 359) 533 101.0 1.8e-21
CCDS3930.1 PTGER4 gene_id:5734|Hs108|chr5 ( 488) 499 95.4 1.2e-19
CCDS42467.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 343) 465 89.5 5e-18
CCDS54198.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 407) 465 89.6 5.6e-18
CCDS686.1 PTGFR gene_id:5737|Hs108|chr1 ( 359) 406 79.5 5.1e-15
CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 365) 372 73.8 2.8e-13
CCDS652.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 374) 372 73.8 2.8e-13
CCDS658.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 388) 372 73.8 2.9e-13
CCDS657.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 372 73.8 2.9e-13
CCDS656.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 372 73.8 2.9e-13
CCDS655.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 418) 372 73.9 3e-13
CCDS12309.1 PTGER1 gene_id:5731|Hs108|chr19 ( 402) 331 66.9 3.6e-11
>>CCDS12686.1 PTGIR gene_id:5739|Hs108|chr19 (386 aa)
initn: 2622 init1: 2622 opt: 2622 Z-score: 2405.3 bits: 453.8 E(32554): 1.2e-127
Smith-Waterman score: 2622; 100.0% identity (100.0% similar) in 386 aa overlap (1-386:1-386)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGILSARRPARPSAFAVLVTGLAATD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGILSARRPARPSAFAVLVTGLAATD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPALCDAFAFAMTFFGLASMLILFAMAVERCLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPALCDAFAFAMTFFGLASMLILFAMAVERCLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGLGQHQQYCPGSWCFLRMRWAQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGLGQHQQYCPGSWCFLRMRWAQPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GAAFSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQQKRHQGSLGPRPRTGEDEVDHLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GAAFSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQQKRHQGSLGPRPRTGEDEVDHLIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LALMTVVMAVCSLPLTIRCFTQAVAPDSSSEMGDLLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LALMTVVMAVCSLPLTIRCFTQAVAPDSSSEMGDLLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 QRLKLWVCCLCLGPAHGDSQTPLSQLASGRRDPRAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QRLKLWVCCLCLGPAHGDSQTPLSQLASGRRDPRAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPL
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB8 PPTQQSSGSAVGTSSKAEASVACSLC
::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PPTQQSSGSAVGTSSKAEASVACSLC
370 380
>>CCDS9708.1 PTGER2 gene_id:5732|Hs108|chr14 (358 aa)
initn: 783 init1: 346 opt: 787 Z-score: 730.8 bits: 143.9 E(32554): 2.2e-34
Smith-Waterman score: 848; 46.1% identity (69.6% similar) in 332 aa overlap (2-309:10-332)
10 20 30 40
pF1KB8 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGIL----------SARR
...:.. .. . .:: :..:: :::.:: .::..: :: :
CCDS97 MGNASNDSQSEDCETRQWLPPGESPAISSVMFSAGVLGNLIALALLARRWRGDVGCSAGR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 PARPSAFAVLVTGLAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPALCDAFAFAMTFF
. : : :::: :. :::::: ..::.:...::::..:..:: . : : ::::::::
CCDS97 RSSLSLFHVLVTELVFTDLLGTCLISPVVLASYARNQTLVALAPESRA-CTYFAFAMTFF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 GLASMLILFAMAVERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLA-LPAIYAFCVLFCALPLLGLGQH
.::.::.:::::.:: :...:::.: : : . :: ::.::: .:::.:::: ::.
CCDS97 SLATMLMLFAMALERYLSIGHPYFY-QRRVSRSGGLAVLPVIYAVSLLFCSLPLLDYGQY
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 QQYCPGSWCFLRMRWAQPGGAAFSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQQKRHQ
:::::.:::.: : .:. :: :. ::..... :: :: :.: ::.:...: .
CCDS97 VQYCPGTWCFIRH-----GRTAYLQLYATLLLLLIVSVLACNFSVILNLIRMHRRSRRSR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KB8 -------GSLGPRPRT-GE-----DEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRCFTQAVAPDS
: :: : :: .:.:::::::.::...::::::.:: :. .:
CCDS97 CGPSLGSGRGGPGARRRGERVSMAEETDHLILLAIMTITFAVCSLPFTI--FAYMNETSS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SSEMGDLLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRLKLWVCCLCLGPAHGDSQTPLSQLAS
.: :: :.:: ..: :.::::: ..: :.. .. .::
CCDS97 RKEKWDLQALRFLSINSIIDPWVFAILRPPVLRLMRSVLCCRISLRTQDATQTSCSTQSD
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 GRRDPRAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGTSSKAEASVACSLC
CCDS97 ASKQADL
>>CCDS61454.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 (296 aa)
initn: 639 init1: 321 opt: 535 Z-score: 501.8 bits: 101.2 E(32554): 1.2e-21
Smith-Waterman score: 663; 43.8% identity (69.3% similar) in 274 aa overlap (5-255:8-281)
10 20 30 40
pF1KB8 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGILS-------ARRPARP--SA
:.: : :. . . . . ..: .:..:: ::::.:. .::: :: :.
CCDS61 MKSPFYRCQNTTSVEKGNSAVMGGVLFSTGLLGNLLALGLLARSGLGWCSRRPLRPLPSV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 FAVLVTGLAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARG-GPALCDAFAFAMTFFGLASM
: .:: ::..::::: .:::.:..:::.: :: :: . .::.:::: :.::::.:
CCDS61 FYMLVCGLTVTDLLGKCLLSPVVLAAYAQNRSLRVLAPALDNSLCQAFAFFMSFFGLSST
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LILFAMAVERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGLGQHQQYCPG
: :.:::.: :.:.::..: . : . :. :.. :: . :::::..:.:. :::::
CCDS61 LQLLAMALECWLSLGHPFFYRRHITLRLGALVAPVVSAFSLAFCALPFMGFGKFVQYCPG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 SWCFLRMRWAQPGGAA--FSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQQKRHQGSLG
.:::..: . . .. .:. :..:.:::: : ::: .. .: :.:. .:: :
CCDS61 TWCFIQMVHEEGSLSVLGYSVLYSSLMALLVLATVLCNLGAMRNLYAMHRRLQRHPRSCT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB8 -----PRPRTGE------DEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRCFTQAVAPDSSSEMGD
:: : .:.:::.:::::::....::::.
CCDS61 RDCAEPRADGREASPQPLEELDHLLLLALMTVLFTMCSLPVIAFVPGVPAKTPGSR
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRLKLWVCCLCLGPAHGDSQTPLSQLASGRRDPR
>>CCDS9707.1 PTGDR gene_id:5729|Hs108|chr14 (359 aa)
initn: 746 init1: 321 opt: 533 Z-score: 499.0 bits: 101.0 E(32554): 1.8e-21
Smith-Waterman score: 767; 42.8% identity (67.1% similar) in 325 aa overlap (5-301:8-332)
10 20 30 40
pF1KB8 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGILS-------ARRPARP--SA
:.: : :. . . . . ..: .:..:: ::::.:. .::: :: :.
CCDS97 MKSPFYRCQNTTSVEKGNSAVMGGVLFSTGLLGNLLALGLLARSGLGWCSRRPLRPLPSV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 FAVLVTGLAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARG-GPALCDAFAFAMTFFGLASM
: .:: ::..::::: .:::.:..:::.: :: :: . .::.:::: :.::::.:
CCDS97 FYMLVCGLTVTDLLGKCLLSPVVLAAYAQNRSLRVLAPALDNSLCQAFAFFMSFFGLSST
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LILFAMAVERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGLGQHQQYCPG
: :.:::.: :.:.::..: . : . :. :.. :: . :::::..:.:. :::::
CCDS97 LQLLAMALECWLSLGHPFFYRRHITLRLGALVAPVVSAFSLAFCALPFMGFGKFVQYCPG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 SWCFLRMRWAQPGGAA--FSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQQKRHQGSLG
.:::..: . . .. .:. :..:.:::: : ::: .. .: :.:. .:: :
CCDS97 TWCFIQMVHEEGSLSVLGYSVLYSSLMALLVLATVLCNLGAMRNLYAMHRRLQRHPRSCT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KB8 -----PRPRTGE------DEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRCFTQAVAP-----DSS
:: : .:.:::.:::::::....::::. : . : .:
CCDS97 RDCAEPRADGREASPQPLEELDHLLLLALMTVLFTMCSLPVIYRAYYGAFKDVKEKNRTS
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SEMGDLLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRLKLWVCCLCLGPAHGDSQTPLSQLASG
: :: :.:: . :.:::.::.::. ::.
CCDS97 EEAEDLRALRFLSVISIVDPWIFIIFRSPVFRIFFHKIFIRPLRYRSRCSNSTNMESSL
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 RRDPRAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGTSSKAEASVACSLC
>>CCDS3930.1 PTGER4 gene_id:5734|Hs108|chr5 (488 aa)
initn: 659 init1: 358 opt: 499 Z-score: 466.4 bits: 95.4 E(32554): 1.2e-19
Smith-Waterman score: 631; 36.7% identity (62.1% similar) in 335 aa overlap (17-311:20-349)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MADSCRNLTYVRGSVGPAT-STLMFVAGVVGNGLALGIL-SARRPARPSAFAVLVTG
:.: ..::. ::::: .:. .: ..:. . ..: .:: :
CCDS39 MSTPGVNSSASLSPDRLNSPVTIPAVMFIFGVVGNLVAIVVLCKSRKEQKETTFYTLVCG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPALCDAFAFAMTFFGLASMLILFAMAV
::.:::::: ..::.....: . : :: ::. .: . ::.:... :. ::.:
CCDS39 LAVTDLLGTLLVSPVTIATYMK-----GQWPGGQPLCEYSTFILLFFSLSGLSIICAMSV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 ERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGLGQHQQYCPGSWCFLRMR
:: ::..: :.:.. : : :.: :.:: ::::::: .:::. . : .:::.
CCDS39 ERYLAINHAYFYSHYVDKRLAGLTLFAVYASNVLFCALPNMGLGSSRLQYPDTWCFIDWT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 WAQPGGAAFSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQ---------QKRHQG---S
. ::.: :::. ..:. : ::: : .: ::.:: ...: . :
CCDS39 TNVTAHAAYSYMYAGFSSFLILATVLCNVLVCGALLRMHRQFMRRTSLGTEQHHAAAAAS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KB8 LGPR---------PRTGE------------DEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRCFT-
.. : :: .. :.. .::: ..:. .::.::..: :.
CCDS39 VASRGHPAASPALPRLSDFRRRRSFRRIAGAEIQMVILLIATSLVVLICSIPLVVRVFVN
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KB8 QAVAPDSSSEMG---DLLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRLKLWVCCL-CLGPAHG
: :. :.. :: :.:. . :::::::..::.::.:... . :: :
CCDS39 QLYQPSLEREVSKNPDLQAIRIASVNPILDPWIYILLRKTVLSKAIEKIKCLFCRIGGSR
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 DSQTPLSQLASGRRDPRAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGTSSKA
CCDS39 RERSGQHCSDSQRTSSAMSGHSRSFISRELKEISSTSQTLLPDLSLPDLSENGLGGRNLL
360 370 380 390 400 410
>>CCDS42467.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 (343 aa)
initn: 424 init1: 195 opt: 465 Z-score: 437.1 bits: 89.5 E(32554): 5e-18
Smith-Waterman score: 465; 33.6% identity (62.2% similar) in 304 aa overlap (17-304:28-320)
10 20 30 40
pF1KB8 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGILSARRPARP---
: .. . :.:...: :::..:.. : .
CCDS42 MWPNGSSLGPCFRPTNITLEERRLIASPWFAASFCVVGLASNLLALSVLAGARQGGSHTR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 SAFAVLVTGLAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPA--LCDAFAFAMTFFGL
:.: ... ::. ::.:: ... .. :. ....:. :. :: .. .: ::::
CCDS42 SSFLTFLCGLVLTDFLGL-LVTGTIVVS--QHAALFEWHAVDPGCRLCRFMGVVMIFFGL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 ASMLILFAMAVERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGLGQHQQY
. .:. ::: :: :....:. . . : : .. ..: . . :::::.:..
CCDS42 SPLLLGAAMASERYLGITRPFSRPAVASQRRAWATVGLVWAAALALGLLPLLGVGRYTVQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 CPGSWCFLRMRWAQPGGAAFSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQQKRHQGSL
::::::: . :. : .::.: .. : .: :. :: : . .::..:. :. :
CCDS42 YPGSWCFLTLG-AESGDVAFGLLFSMLGGLSVGLSFLLNTVSVATLCHVYHGQEAAQ---
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB8 GPRPRTGEDEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRCFTQAV--APDSSSEMGDL-------
::: ..::. . : . :: .:: ::: . ..:.: : . : :.:
CCDS42 -QRPR--DSEVEMMAQLLGIMVVASVCWLPLLV-FIAQTVLRNPPAMSPAGQLSRTTEKE
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 --LAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRLKLWVCCLCLGPAHGDSQTPLSQLASGRRDP
. .: ..: ::::::.::::.::..::.
CCDS42 LLIYLRVATWNQILDPWVYILFRRAVLRRLQPRLSTRPRSLSLQPQLTQRSGLQ
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380
pF1KB8 RAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGTSSKAEASVACSLC
>>CCDS54198.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 (407 aa)
initn: 424 init1: 195 opt: 465 Z-score: 436.3 bits: 89.6 E(32554): 5.6e-18
Smith-Waterman score: 465; 33.6% identity (62.2% similar) in 304 aa overlap (17-304:28-320)
10 20 30 40
pF1KB8 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGILSARRPARP---
: .. . :.:...: :::..:.. : .
CCDS54 MWPNGSSLGPCFRPTNITLEERRLIASPWFAASFCVVGLASNLLALSVLAGARQGGSHTR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 SAFAVLVTGLAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPA--LCDAFAFAMTFFGL
:.: ... ::. ::.:: ... .. :. ....:. :. :: .. .: ::::
CCDS54 SSFLTFLCGLVLTDFLGL-LVTGTIVVS--QHAALFEWHAVDPGCRLCRFMGVVMIFFGL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 ASMLILFAMAVERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGLGQHQQY
. .:. ::: :: :....:. . . : : .. ..: . . :::::.:..
CCDS54 SPLLLGAAMASERYLGITRPFSRPAVASQRRAWATVGLVWAAALALGLLPLLGVGRYTVQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 CPGSWCFLRMRWAQPGGAAFSLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRMYRQQKRHQGSL
::::::: . :. : .::.: .. : .: :. :: : . .::..:. :. :
CCDS54 YPGSWCFLTLG-AESGDVAFGLLFSMLGGLSVGLSFLLNTVSVATLCHVYHGQEAAQ---
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB8 GPRPRTGEDEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRCFTQAV--APDSSSEMGDL-------
::: ..::. . : . :: .:: ::: . ..:.: : . : :.:
CCDS54 -QRPR--DSEVEMMAQLLGIMVVASVCWLPLLV-FIAQTVLRNPPAMSPAGQLSRTTEKE
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 --LAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRLKLWVCCLCLGPAHGDSQTPLSQLASGRRDP
. .: ..: ::::::.::::.::..::.
CCDS54 LLIYLRVATWNQILDPWVYILFRRAVLRRLQPRLSTRPRRSLTLWPSLEYSGTISAHCNL
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380
pF1KB8 RAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGTSSKAEASVACSLC
CCDS54 RLPGSSDSRASASRAAGITGVSHCARPCMLFDPEFDLLAGVQLLPFEPPTGKALSRKD
350 360 370 380 390 400
>>CCDS686.1 PTGFR gene_id:5737|Hs108|chr1 (359 aa)
initn: 346 init1: 174 opt: 406 Z-score: 383.1 bits: 79.5 E(32554): 5.1e-15
Smith-Waterman score: 406; 30.4% identity (63.0% similar) in 303 aa overlap (20-309:33-323)
10 20 30 40
pF1KB8 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGILSAR----RPAR
:......:...:.::..:: :
CCDS68 MNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQRFRQKS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 PSAFAVLVTGLAATDLLGTSFLSP-AVFVAYARNSSLLGLARGGPALCDAFAFAMTFFGL
..: .:..::. ::..: . . :::: :: .. . . ... .::. :.. :.: ::
CCDS68 KASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFV-YASDKEWIRFDQSN-VLCSIFGICMVFSGL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 ASMLILFAMAVERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGLGQHQQY
.:. .::.:::.....: ... . ... : .. : :.. ::.:: ...
CCDS68 CPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILGHRDYKIQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 CPGSWCFLRMRWAQPGGAAFSL---AYAGLVALLVAAIFLCNGSVTLSLCRM-YRQQKRH
.::: . . : : .. ::.:: :. .:::. . ..: :. ...:...
CCDS68 ASRTWCFYNTEDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVS--LLCNAITGITLLRVKFKSQQHR
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB8 QGSLGPRPRTGEDEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRCFTQAVAPDSSSEMGD--LLAF
:: :. . :. . :::.: : .: :. . . .. . : : . :.:.
CCDS68 QG------RSHHLEMV-IQLLAIMCVS-CICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETTLFAL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 RFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRL-KLWV-CCLCLGPAHGDSQTPLSQLASGRRDPRAP
:. ..: ::::::.::.::::.. : :: ::
CCDS68 RMATWNQILDPWVYILLRKAVLKNLYKLASQCCGVHVISLHIWELSSIKNSLKVAAISES
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB8 SAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGTSSKAEASVACSLC
CCDS68 PVAEKSAST
>>CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (365 aa)
initn: 351 init1: 232 opt: 372 Z-score: 351.9 bits: 73.8 E(32554): 2.8e-13
Smith-Waterman score: 443; 32.2% identity (57.6% similar) in 323 aa overlap (13-306:48-363)
10 20 30 40
pF1KB8 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGILSA--
:::. : :...: :::.::. ..:
CCDS44 NHSYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALAMLLVSRSY
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90
pF1KB8 --RRPARPSAFAVLVTGLAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPALCDAFAFA
:. : ..: . . :: :::.: . .:.:.:.: .. . .: :: :...
CCDS44 RRRESKRKKSFLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHIDPSG-RLCTFFGLT
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MTFFGLASMLILFAMAVERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGL
:: :::.:..: :::::: ::. :. ::. : .: .: ... . : ::.::.
CCDS44 MTVFGLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLLGVWLAVLAFALLPVLGV
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200
pF1KB8 GQHQQYCPGSWCFLRMRWAQPG-------GAAF---SLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTL
::. ::.:::. . : : : ..:. ::.:: :. : :: ..
CCDS44 GQYTVQWPGTWCFISTGRGGNGTSSSHNWGNLFFASAFAFLGLLALTVT--FSCNLATIK
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 SLCRMYRQQKRHQGSLGPRPR-TGEDEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRC----FTQA
.: : . . : . : : : .. :...: : ..:: :: : :.:.
CCDS44 ALVSRCRAKATASQSSAQWGRITTETAIQ---LMGIMCV-LSVCWSPLLIMMLKMIFNQT
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310
pF1KB8 VAPDSSSEMGD-------LLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRL---KLWVCCLCLG
. ... :.: :. ..: ::::::..:.:: ..... ..:
CCDS44 SVEHCKTHTEKQKECNFFLIAVRLASLNQILDPWVYLLLRKILLRKFCQEEFWGN
320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 PAHGDSQTPLSQLASGRRDPRAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGT
>>CCDS652.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (374 aa)
initn: 351 init1: 232 opt: 372 Z-score: 351.8 bits: 73.8 E(32554): 2.8e-13
Smith-Waterman score: 442; 32.5% identity (57.7% similar) in 317 aa overlap (13-303:48-357)
10 20 30 40
pF1KB8 MADSCRNLTYVRGSVGPATSTLMFVAGVVGNGLALGILSA--
:::. : :...: :::.::. ..:
CCDS65 NHSYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALAMLLVSRSY
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90
pF1KB8 --RRPARPSAFAVLVTGLAATDLLGTSFLSPAVFVAYARNSSLLGLARGGPALCDAFAFA
:. : ..: . . :: :::.: . .:.:.:.: .. . .: :: :...
CCDS65 RRRESKRKKSFLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHIDPSG-RLCTFFGLT
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MTFFGLASMLILFAMAVERCLALSHPYLYAQLDGPRCARLALPAIYAFCVLFCALPLLGL
:: :::.:..: :::::: ::. :. ::. : .: .: ... . : ::.::.
CCDS65 MTVFGLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLLGVWLAVLAFALLPVLGV
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200
pF1KB8 GQHQQYCPGSWCFLRMRWAQPG-------GAAF---SLAYAGLVALLVAAIFLCNGSVTL
::. ::.:::. . : : : ..:. ::.:: :. : :: ..
CCDS65 GQYTVQWPGTWCFISTGRGGNGTSSSHNWGNLFFASAFAFLGLLALTVT--FSCNLATIK
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 SLCRMYRQQKRHQGSLGPRPR-TGEDEVDHLILLALMTVVMAVCSLPLTIRC----FTQA
.: : . . : . : : : .. :...: : ..:: :: : :.:.
CCDS65 ALVSRCRAKATASQSSAQWGRITTETAIQ---LMGIMCV-LSVCWSPLLIMMLKMIFNQT
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310
pF1KB8 VAPDSSSEMGD-------LLAFRFYAFNPILDPWVFILFRKAVFQRLKLWVCCLCLGPAH
. ... :.: :. ..: ::::::..:.:: .....
CCDS65 SVEHCKTHTEKQKECNFFLIAVRLASLNQILDPWVYLLLRKILLRKFCQMRKRRLREQEE
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 GDSQTPLSQLASGRRDPRAPSAPVGKEGSCVPLSAWGEGQVEPLPPTQQSSGSAVGTSSK
CCDS65 FWGN
386 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 16:51:23 2016 done: Fri Nov 4 16:51:23 2016
Total Scan time: 3.210 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]