Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8810
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8810, 361 aa
1>>>pF1KB8810 361 - 361 aa - 361 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4817+/-0.00109; mu= 14.8712+/- 0.065
mean_var=98.8206+/-29.535, 0's: 0 Z-trim(102.8): 300 B-trim: 913 in 2/48
Lambda= 0.129018
statistics sampled from 6555 (7128) to 6555 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 2.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 2407 459.3 2.4e-129
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 595 122.0 7.7e-28
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 595 122.0 7.8e-28
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 578 118.8 7.3e-27
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 536 111.0 1.7e-24
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 530 109.9 3.4e-24
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 531 110.1 3.5e-24
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 525 108.9 6.4e-24
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 524 108.8 7.6e-24
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 524 108.8 7.9e-24
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 524 108.8 8.1e-24
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 524 108.8 8.1e-24
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 523 108.6 8.7e-24
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 523 108.6 8.7e-24
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 ( 342) 522 108.4 9.5e-24
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 515 107.1 2.5e-23
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 513 106.7 3.1e-23
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 509 106.0 5.3e-23
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 507 105.6 6.8e-23
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 505 105.2 8.3e-23
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 498 104.0 2.4e-22
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 496 103.5 2.7e-22
CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3 ( 354) 496 103.6 2.8e-22
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 496 103.6 3e-22
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 496 103.6 3e-22
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 495 103.4 3.4e-22
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 495 103.4 3.4e-22
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 495 103.4 3.5e-22
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 496 103.7 3.5e-22
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 495 103.4 3.6e-22
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 495 103.4 3.6e-22
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 495 103.5 3.7e-22
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 491 102.6 5.5e-22
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 491 102.7 5.8e-22
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 489 102.3 7e-22
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 484 101.3 1.3e-21
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 484 101.3 1.4e-21
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 482 101.0 1.7e-21
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 482 101.0 1.8e-21
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 481 100.8 2e-21
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 479 100.4 2.6e-21
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 473 99.3 5.2e-21
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 470 98.7 8e-21
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 470 98.7 8.3e-21
CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3 ( 338) 469 98.5 8.8e-21
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 459 96.7 3.4e-20
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 457 96.3 4.1e-20
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 455 95.9 5.4e-20
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 454 95.8 6.6e-20
CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3 ( 319) 450 94.9 9.8e-20
>>CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 (361 aa)
initn: 2407 init1: 2407 opt: 2407 Z-score: 2435.7 bits: 459.3 E(32554): 2.4e-129
Smith-Waterman score: 2407; 100.0% identity (100.0% similar) in 361 aa overlap (1-361:1-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 CMEYPNFEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSGVNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 CMEYPNFEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSGVNK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMNFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMNFN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 CCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKSSNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 CCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKSSNG
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 K
:
CCDS94 K
>>CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX (337 aa)
initn: 518 init1: 360 opt: 595 Z-score: 613.3 bits: 122.0 E(32554): 7.7e-28
Smith-Waterman score: 595; 29.3% identity (67.5% similar) in 311 aa overlap (38-346:30-334)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 NFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNRKKINSTT
::.. ..:. :: ..: :.... .: ..
CCDS14 MDETGNLTVSSATCHDTIDDFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTYHKKSAFQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCLSI
.: ::...:.: . .:: :..::. : .:: :::... ..:.: : .. ::: .:.
CCDS14 VYMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCSIFFMTAMSF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERITCMEYPNF
: ::.: :.. .. ..:. ::. .::.:. . :.:. .:.: . :.: :.
CCDS14 FRCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAKPQKDEKNNTKCFEPPQD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EETKSLPWIL-LGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSGVNKKALNTI
..::. .: . :.:...:..::..::..: :.. . .. :. .:::.. :
CCDS14 NQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLKKSMKKNLSS----HKKAIGMI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMNFNCCMDPF
... ..:.. : :::. :. .. .. :.. .: :. .:. : :::.::.
CCDS14 MVVTAAFLVSFMPYHIQRTIHL--HFLHNETKPCDSVLRMQKSVVITLSLAASNCCFDPL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IYFFACKGYKRKVMRMLKRQVS-VSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKSSNGK
.:::. ...... . :...: :. :.. :...:.
CCDS14 LYFFSGGNFRKRLSTFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
300 310 320 330
>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 (344 aa)
initn: 539 init1: 300 opt: 595 Z-score: 613.2 bits: 122.0 E(32554): 7.8e-28
Smith-Waterman score: 595; 31.3% identity (66.3% similar) in 297 aa overlap (19-310:5-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
:. . . : .. .:.::..::..: .:. ...
CCDS94 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
: : :: : ::..::.::. .:: :: :.. .: .:: ::.:....:: : :...
CCDS94 KVRNETTTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTR-NWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSIL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERIT
:.::.:.:::.:.:.:.. . .. ..:: :: ::. :.. . : .. ...... .
CCDS94 FLTCISVDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQGNNAS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB8 CMEYPNFEET--KS-LPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLT-EKS
. :: :. :. : :.. ..:. .:::. . : :.. : . :.: .:
CCDS94 EACFENFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTK-----PVTLSRS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GVNK-KALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVC
.:: :.:. :.. ...: .::.::.. .: . . .: ..:..:: . . .:.:
CCDS94 KINKTKVLKMIFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSL--VRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLC
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 LMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHS
. :::.::..:.:
CCDS94 IAVSNCCFDPIVYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIF
280 290 300 310 320 330
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
initn: 541 init1: 224 opt: 578 Z-score: 595.7 bits: 118.8 E(32554): 7.3e-27
Smith-Waterman score: 578; 30.6% identity (64.8% similar) in 330 aa overlap (38-355:46-368)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 NFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNRKKINSTT
::.:::.::. : ..: :. : . :.
CCDS14 SSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVSLFVFCFRMKMRSETA
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCLSI
.. :::..::.::. .:: .: .: .. : .::.::.:.. .: : :... :.::.:.
CCDS14 IFITNLAVSDLLFVCTLPFKI-FYNFNRHWPFGDTLCKISGTAFLTNIYGSMLFLTCISV
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERITCMEYPNF
:::.:.:.:.: :. ... :: :::::.. . . .. . ::.: .
CCDS14 DRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTTNVNNATTTCFEGFSK
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EETKS-LPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSGVNKKALNTI
. :. : : . .:...:::. . : : . .:: .. . :.::: . .
CCDS14 RVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVV----LRTLRKPATLSQIGTNKKKVLKM
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ILI-IVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMNFNCCMDP
: . ..:::.::.::. ... . . .: . . .: .. .: .:.:: ..:::.::
CCDS14 ITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYAL--VRSQAITNCFLERFAKIMYPITLCLATLNCCFDP
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 FIYFFACKGYKRKV-----MRM---LKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTET--QMMIHS
:::.:. ...... .:: .: .. .. . .. . :: : . :.. ..:..:
CCDS14 FIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQTTNNGGELMLES
310 320 330 340 350 360
360
pF1KB8 KSSNGK
CCDS14 TF
370
>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 (373 aa)
initn: 458 init1: 303 opt: 536 Z-score: 553.4 bits: 111.0 E(32554): 1.7e-24
Smith-Waterman score: 536; 29.0% identity (63.7% similar) in 314 aa overlap (34-341:54-356)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 QMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNRKKI
.: : ::::::..:: .:. ..: . :
CCDS31 SWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSVAIWMFVFHMKPW
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMT
.. ..: ::...:.:.. .::. : :: :: .:::.:.. ..:..: :... :.:
CCDS31 SGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIFHVNLYGSILFLT
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 CLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCI--FVWILVFAQTLPLLI-NPMSKQEAERIT
:.: :. .::.::. .. :... ...:: .::..: . :.:. . . .. . ::
CCDS31 CISAHRYSGVVYPLK--SLGRLKKKNAICISVLVWLIVVVAISPILFYSGTGVRKNKTIT
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230
pF1KB8 CMEYPNFEETKSLPWILLGAC--FIGYVLPLIIILICYSQICCKL-FRTAKQNPLTEKSG
:.. . : .: ... . : . .::..:: ::. : : .. ..:: .::
CCDS31 CYDTTSDEYLRS--YFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLIVRALIYKDLDNSPLRRKS-
210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLM
. .:....::.. . :.:: ... .: :.. :. . . : :
CCDS31 -----IYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAMCAFNDRVYATYQVTRGLA
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 NFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKS
..: :.::..::.: ..:.. : :..: . ..: :.
CCDS31 SLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRAT-RKASRRSEANLQSKSEDMTLNILPEFKQNGDTS
320 330 340 350 360 370
360
pF1KB8 SNGK
CCDS31 L
>>CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 (346 aa)
initn: 504 init1: 374 opt: 530 Z-score: 547.8 bits: 109.9 E(32554): 3.4e-24
Smith-Waterman score: 589; 32.1% identity (65.1% similar) in 315 aa overlap (12-325:19-322)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLAL
:..: ..:. . .. : .:. : ..:. :..:: :..
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNNSRNCTIENFKREFFPIVYLIIFFWGVLGNGLSI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VVIVQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYI
:..: :: .:.... ::.:::.:: ..:: : :: : .: .:: ::: . .:.
CCDS94 YVFLQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMSYSLYV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 NTYAGVNFMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSK
: :... :.: ::. ::.:.:::.: .. :. : .: ..:::..:... .:.. :.
CCDS94 NMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIRSAWILCGIIWILIMASSI-MLLDSGSE
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QEAERITCMEYPNFEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLT
:.. .:.: :. . .: . : .: .::.. . ::: : :... . : .
CCDS94 QNGSVTSCLEL-NLYKIAKLQTMNYIALVVGCLLPFFTLSICYLLIIRVLLKV--EVPES
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 EKSGVNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIK-KLRFSNFLECSQRHSFQISLHF
..:::.:::. ...: ::: :::. :. :. . :..: .. .: .
CCDS94 GLRVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRTVHLTTWKVGL-----CKDR--LHKALVI
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TVCLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMM
:. : : :..:..:.:: ...: .. :..
CCDS94 TLALAAANACFNPLLYYFAGENFKDRLKSALRKGHPQKAKTKCVFPVSVWLRKETRV
290 300 310 320 330 340
360
pF1KB8 IHSKSSNGK
>>CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 (425 aa)
initn: 488 init1: 356 opt: 531 Z-score: 547.7 bits: 110.1 E(32554): 3.5e-24
Smith-Waterman score: 531; 30.2% identity (61.9% similar) in 341 aa overlap (20-355:91-418)
10 20 30 40
pF1KB8 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGN
: . : : . .: :. ::...: :
CCDS40 KNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLN
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 LLALVVIVQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITAL
..:.::.. . : . ...: .:. .:.::...:: .:.:: : ::..:. :::...
CCDS40 IMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTA
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 VFYINTYAGVNFMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIN
.:: : ::.. .:: .:::::.:::.:.. . . . .:. .:. .: :..: ..:::..
CCDS40 AFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPLLLK
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 PMSKQEA--ERITCMEYPN---FEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLF
.. : . :: . : .: . . ..: : . .:::: .:: .: :
CCDS40 EQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEGYYAYYFSAFSAVF--FFVPLIISTVCYVSIIRCLS
250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 RTAKQNPLTEKSGVNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRH
.: : ..:: .:: .. .:..:: : .: .: : .: . . : .
CCDS40 SSAVANR-SKKS----RALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAH------YSFLSHTSTTE
300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 SFQISLHFTVCLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSR
. .. . ::. ...::.::.::..: . .: :. .: . : . :: .:. :.
CCDS40 AAYFAYLLCVCVSSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASK
350 360 370 380 390 400
350 360
pF1KB8 EMTETQMMIHSKSSNGK
: .. . .:
CCDS40 MDTCSSNLNNSIYKKLLT
410 420
>>CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX (333 aa)
initn: 361 init1: 139 opt: 525 Z-score: 543.0 bits: 108.9 E(32554): 6.4e-24
Smith-Waterman score: 525; 28.5% identity (62.9% similar) in 340 aa overlap (5-337:1-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
: :.: . :.:.. :. ... . :..... ::.::.::: :.
CCDS14 MPANYT--CTRPDGDNTDFR------YFIYAVTYTVILVPGLIGNILALWVFYGYM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
:. . .... ::.:.:.: . .:: :: :: .. :: .: .:: . . :.: ::..
CCDS14 KETKRAVIFMINLAIADLLQVLSLPLRIFYY-LNHDWPFGPGLCMFCFYLKYVNMYASIY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB8 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILV-FAQTLPLLINPMSKQEAERI
:..:.:. :: ...:.:.. :. .. . : :... .: .: :. . ..:
CCDS14 FLVCISVRRFWFLMYPFRFHDCKQ-KYDLYISIAGWLIICLACVLFPLLRTSDDTSGNRT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TC-MEYP--NFEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKS
: .. : : . ..:. . .: .::.: ::.:.: : . .: . :...
CCDS14 KCFVDLPTRNVNLAQSVVMMTIGE-LIGFVTPLLIVLYCTWKTVLSL---QDKYPMAQDL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GVNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAI-IQHMIKKLRFSNFLE-CSQRHSFQISLHFTV
: ..:::. :. ::..::.::: .. .. ..: :: .. : :. . : ..
CCDS14 GEKQKALKMILTCAGVFLICFAPYHFSFPLDFLVK----SNEIKSCLARRVILIFHSVAL
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 CLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRM-LKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMI
:: ..: :.:: ::.:. . ..:.. :. :. .... .: :..
CCDS14 CLASLNSCLDPVIYYFSTNEFRRRLSRQDLHDSIQLHAKSFVSNHTASTMTPELC
280 290 300 310 320 330
360
pF1KB8 HSKSSNGK
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 487 init1: 371 opt: 524 Z-score: 541.6 bits: 108.8 E(32554): 7.6e-24
Smith-Waterman score: 524; 28.8% identity (62.1% similar) in 309 aa overlap (19-324:16-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDIQMANNFTPPSATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLHYSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNR
.:: ..:. ...: ::..:..:. :: :...::
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDWRIGDALCRITALVFYINTYAGVN
: . .... ::...:. : .:: .: :: . : .:. ::.:.. .: ::.:
CCDS31 KLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKR-IEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLIN-PMSKQEAER
..:::::::..:.:::.. ....: . :: .::..:.:. .:: .:. . :
CCDS31 LLTCLSIDRYLAIVHPMK-SRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ITCMEYPNFEETKSLPWIL-LGACFIGYVLPLIIILICYSQICCKLFRTAKQNPLTEKSG
:: . ....:: : : ..:...:..::: :. : : : . ...
CCDS31 ITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKAL---KKAYEIQKNKP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLM
: .. :. :.. : . . :... . .. .: . . .: . .. .:.:.
CCDS31 RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQL--GIIRDCRIADIVDTAMPITICIA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 NFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKSAPEENSREMTETQMMIHSKS
:: :..:..: : : .:: ...::
CCDS31 YFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKK
300 310 320 330 340 350
>>CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX (381 aa)
initn: 416 init1: 341 opt: 524 Z-score: 541.2 bits: 108.8 E(32554): 7.9e-24
Smith-Waterman score: 524; 25.6% identity (61.4% similar) in 352 aa overlap (11-359:33-378)
10 20 30
pF1KB8 MDIQMANNFTPP---SATPQGNDCDLYAHHSTARIVMPLH
:: ::::. . : . .. :.
CCDS14 SHTITMTTTSVSSWPYSSHRMRFITNHSDQPPQNFSATPNVTTCPM--DEKLLSTVLTTS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 YSLVFIIGLVGNLLALVVIVQNRKKINSTTLYSTNLVISDILFTTALPTRIAYYAMGFDW
::..::.:::::..:: :.. ..: :: .: :..:.:.:. :: :: :. :
CCDS14 YSVIFIVGLVGNIIALYVFLGIHRKRNSIQIYLLNVAIADLLLIFCLPFRIMYHINQNKW
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 RIGDALCRITALVFYINTYAGVNFMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWI
.: ::.... .::.: : .. .. .:.::.: . . .. : ... :: .::.
CCDS14 TLGVILCKVVGTLFYMNMYISIILLGFISLDRYIKINRSIQQRKAITTKQSIYVCCIVWM
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 LVFAQTLPLLINPMSKQEAERITCMEYPNFEETKSLPWILLGACFIGYVLPLIIILICYS
:... : ..: ..: . :..: . ...:. :. . . : ...:.. :
CCDS14 LALGGFLTMIILTLKKGGHNSTMCFHYRDKHNAKGEA-IFNFILVVMFWLIFLLIILSYI
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 QICCKLFRTAKQNPLTEKSGVNKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNF
.: .:.: .:. .:: . . ......:..::.:::. . .. ..: :.
CCDS14 KIGKNLLRISKRRSKFPNSGKYATTARNSFIVLIIFTICFVPYHAFRFIYISSQLNVSS-
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LECSQRHSFQISLHFTVCLMNFNCCMDPFIYFFACKGYKRKVMRMLKRQVSVSISSAVKS
: .. . . .. . : .:: :.:: .::. .. .. . ..: :. . : . ..
CCDS14 --CYWKEIVHKTNEIMLVLSSFNSCLDPVMYFLMSSNIRKIMCQLLFRRFQGEPSRSEST
300 310 320 330 340 350
340 350 360
pF1KB8 APEENSREMTETQMMIHSKSSNGK
. . . . .:.. .. .::.
CCDS14 SEFKPGYSLHDTSVAVKIQSSSKST
360 370 380
361 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:47:58 2016 done: Fri Nov 4 15:47:59 2016
Total Scan time: 2.450 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]