Result of FASTA (omim) for pFN21AB8402
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8402, 782 aa
  1>>>pF1KB8402 782 - 782 aa - 782 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0414+/-0.000585; mu= 15.0212+/- 0.036
 mean_var=325.7863+/-63.449, 0's: 0 Z-trim(118.0): 1940  B-trim: 113 in 1/54
 Lambda= 0.071057
 statistics sampled from 28282 (30564) to 28282 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.358), width:  16
 Scan time: 12.140

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 1495 168.7 1.3e-40
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 1495 168.8 1.3e-40
XP_016882750 (OMIM: 194555) PREDICTED: zinc finger ( 707) 1444 163.1 3.7e-39
NP_037530 (OMIM: 194555) zinc finger protein 224 [ ( 707) 1444 163.1 3.7e-39
NP_001308574 (OMIM: 194555) zinc finger protein 22 ( 707) 1444 163.1 3.7e-39
XP_005259469 (OMIM: 604749) PREDICTED: zinc finger ( 734) 1417 160.4 2.5e-38
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1416 160.3 2.8e-38
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1416 160.3 2.8e-38
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1416 160.3 2.8e-38
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1415 160.1 2.8e-38
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1415 160.1 2.8e-38
NP_004225 (OMIM: 604749) zinc finger protein 235 [ ( 738) 1412 159.9 3.6e-38
NP_700359 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 1412 159.9 3.7e-38
NP_001311073 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1412 159.9 3.7e-38
XP_016885306 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 779) 1412 159.9 3.7e-38
NP_009061 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 1412 159.9 3.7e-38
NP_001311069 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1412 159.9 3.7e-38
NP_001311079 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1412 159.9 3.7e-38
NP_001311076 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1412 159.9 3.7e-38
NP_001311071 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 1412 159.9 3.7e-38
NP_001311077 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 1412 159.9 3.7e-38
XP_016885305 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 1412 159.9 3.7e-38
XP_006724618 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 1412 159.9 3.7e-38
NP_001311082 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 1412 159.9 3.7e-38
NP_001311080 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 1412 159.9 3.7e-38
XP_016885302 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1412 160.0 3.8e-38
XP_016885303 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1412 160.0 3.8e-38
XP_016885301 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1412 160.0 3.8e-38
XP_016885304 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1412 160.0 3.8e-38
XP_006724613 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1412 160.0 3.8e-38
XP_016885300 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1412 160.0 3.8e-38
XP_016885299 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1412 160.0 3.8e-38
NP_001311083 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 813) 1412 160.0 3.8e-38
NP_001311084 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 821) 1412 160.0 3.8e-38
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 1409 159.7 4.9e-38
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 1409 159.8 5.1e-38
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 1409 159.8 5.1e-38
NP_001291966 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1401 158.7 7.5e-38
NP_001291967 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1401 158.7 7.5e-38
NP_001291968 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1401 158.7 7.5e-38
NP_001291964 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1401 158.7 7.5e-38
NP_001291965 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1401 158.7 7.5e-38
NP_001291969 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1401 158.7 7.5e-38
NP_008886 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B i ( 778) 1401 158.8 8.1e-38
NP_001291962 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 785) 1401 158.8 8.2e-38
NP_001311072 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1398 158.4 9.5e-38
NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1398 158.4 9.5e-38
NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1398 158.4 9.5e-38
NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1398 158.4 9.5e-38
NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1398 158.4 9.5e-38


>>XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger pro  (1168 aa)
 initn: 1001 init1: 1001 opt: 1495  Z-score: 850.4  bits: 168.7 E(85289): 1.3e-40
Smith-Waterman score: 1502; 34.5% identity (62.6% similar) in 588 aa overlap (192-763:318-892)

             170       180       190       200       210           
pF1KB8 KEGIPGPRNLDLPGLWDVPAWESTQHPWPVCGESCWENNHLVMHQRGHSKDRTRR-----
                                     ::..  . . :. :.  :. ..  .     
XP_016 EECGKAFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKVSTLITHKAIHAGEKPYKCKECG
       290       300       310       320       330       340       

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB8 -AWEKFNKRAETQMPWSSPRVQRHFRCGVCGKSFRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNADGEM
        :. ::.  .. ..  ..   .. ..:  :::...    :  :   :::. :..  .   
XP_016 KAFSKFSILTKHKVIHTG---EKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGK
       350       360          370       380       390       400    

         280       290       300       310       320        330    
pF1KB8 CFRHELTHPSHRLPQQGEKPAQCTPCGKRSLPVDSTQARRCQHSREGPASWRE-GRGAS-
        :       .:.. . :::: .:  :::     .. . ..  :. : : . .: :.: : 
XP_016 GFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECGKGFSM
          410       420       430       440       450       460    

                  340       350       360       370       380      
pF1KB8 -------SSVHSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDTEALQHGAEGPCSCSECGERSPMSARLAS
              . .:.:.::          ..  . .   :..: : .: :::.    :. :  
XP_016 FSILTKHKVIHNGEKP----------YKCEECDKATHAGEKPYKCEECGKAFNWSSNLME
          470       480                 490       500       510    

        390       400       410       420       430       440      
pF1KB8 PCRAHTGEKPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRV
         : ::::::..: .: : :    .:  :.  : ::.:..:..:::..  .  :. : ..
XP_016 HKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKI
          520       530       540       550       560       570    

        450       460       470       480       490       500      
pF1KB8 HSGEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGE
       :. :::..: .::. : : . :..:.:.:: :::..: ::: .:   : : .:.  :.::
XP_016 HTVEKPYKCEECGKAFNQSAILIKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFSKVSTLTTHKAIHAGE
          580       590       600       610       620       630    

        510       520       530       540       550       560      
pF1KB8 RPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFS
       .:..:.:::. : .   :  :  .:.::.:..: .: : :   .::  :.  :. :.:..
XP_016 KPYKCKECGKTFIKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYK
          640       650       660       670       680       690    

        570       580       590       600       610       620      
pF1KB8 CGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPEC
       : ::::.:. .:.: :: :.:.::.:..: ::..::   . : .:. .::::.:..: ::
XP_016 CEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSVLTKHKVIHTGEKPYKCEEC
          700       710       720       730       740       750    

        630       640       650        660       670       680     
pF1KB8 DKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSCE-CGKGFVKHSKLIEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSF
        : :. .. .. :. .:. : :..:: :::.: . . ::.: : :: :::..: .: :.:
XP_016 GKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKAFNRSAILIKHKRIHTDEKPYKCEECGKTF
          760       770       780       790       800       810    

         690       700       710       720       730       740     
pF1KB8 RLKAQLLSHQGLHTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQRIHRPERPFACGDCGKGFIYKS
          . : .:...:.::.:..: :: : : . . . .:. ::  :.:. : .:::.. . :
XP_016 SKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPS
          820       830       840       850       860       870    

         750       760       770       780                         
pF1KB8 KLAEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEADWS                       
        :. : ..::   :   :                                          
XP_016 TLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSK
          880       890       900       910       920       930    

>--
 initn: 1470 init1: 862 opt: 862  Z-score: 499.7  bits: 103.8 E(85289): 4.3e-21
Smith-Waterman score: 938; 40.9% identity (72.6% similar) in 274 aa overlap (402-674:894-1167)

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB8 SECGERSPMSARLASPCRAHTGEKPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCG
                                     : : : .  .:  :.  : ::.:..:..::
XP_016 EECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECG
           870       880       890       900       910       920   

             440       450       460       470       480       490 
pF1KB8 KGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFR
       :.:.    ...: ..:.::: ..:  ::. ... . :  :...::.:::..  ::: .: 
XP_016 KAFSWLSVFSKHKKTHAGEKFYKCEACGKAYKSSSTLSYHKKIHTEEKPYKYEECGKGFS
           930       940       950       960       970       980   

             500       510       520       530       540       550 
pF1KB8 LESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGI
         :.:  :.. : ::.:..: :::..:. . .: :: ..:.:: :..: .::: :   . 
XP_016 TFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECDKAFSWPSS
           990      1000      1010      1020      1030      1040   

             560       570       580       590       600       610 
pF1KB8 LKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSH
       :  :. ::. :.:..: ::::.:.  :.::::  .:.::.:..: ::...:  ...:. :
XP_016 LTEHKATHAGEKPYKCEECGKAFSWPSRLTEHKATHAGEEPYKCEECGKAFNWSSNLMEH
          1050      1060      1070      1080      1090      1100   

             620       630       640       650        660       670
pF1KB8 QRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSCE-CGKGFVKHSKLIEHIRTH
       .:.::::.:..: :: : . . . .  :...:.:: :..:: :::.:   : . .: . :
XP_016 KRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKIH
          1110      1120      1130      1140      1150      1160   

              680       690       700       710       720       730
pF1KB8 TGEKPFQCPKCDKSFRLKAQLLSHQGLHTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQRIHRPER
       ::::                                                        
XP_016 TGEKL                                                       
                                                                   

>--
 initn: 1407 init1: 444 opt: 447  Z-score: 269.8  bits: 61.3 E(85289): 2.7e-08
Smith-Waterman score: 458; 36.6% identity (67.1% similar) in 164 aa overlap (434-597:154-317)

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB8 KRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFRCAKCGRNFR
                                     : :  . ..:   :.:.: ..: .  :.: 
XP_016 KVHKEGYNKLNQSLTTTQSKVFQRGKYANVFHKCSNSNRHKIRHTGKKHLQCKEYVRSFC
           130       140       150       160       170       180   

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB8 QRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCK
       . ..: .:.:..: :. ..: : : .:   : :  ..  : ::.:. :.:::..:..   
XP_016 MLSHLSQHKRIYTRENSYKCEEGGKAFNWSSTLTYYKSAHTGEKPYRCKECGKAFSKFSI
           190       200       210       220       230       240   

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB8 LREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEH
       : .:  .:.::. ..: .: : :  ..::  :.  :. :.: .: ::::.:.. : :: :
XP_016 LTKHKVIHTGEKSYKCEECGKAFNQSAILTKHKIIHTGEKPNKCEECGKAFSKVSTLTTH
           250       260       270       280       290       300   

           590       600       610       620       630       640   
pF1KB8 LRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLH
         .:.::.:..: :                                              
XP_016 KAIHAGEKPYKCKECGKAFSKVSTLITHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIH
           310       320       330       340       350       360   

>>NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 isofo  (1280 aa)
 initn: 1001 init1: 1001 opt: 1495  Z-score: 850.0  bits: 168.8 E(85289): 1.3e-40
Smith-Waterman score: 1502; 34.5% identity (62.6% similar) in 588 aa overlap (192-763:318-892)

             170       180       190       200       210           
pF1KB8 KEGIPGPRNLDLPGLWDVPAWESTQHPWPVCGESCWENNHLVMHQRGHSKDRTRR-----
                                     ::..  . . :. :.  :. ..  .     
NP_009 EECGKAFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKVSTLITHKAIHAGEKPYKCKECG
       290       300       310       320       330       340       

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB8 -AWEKFNKRAETQMPWSSPRVQRHFRCGVCGKSFRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNADGEM
        :. ::.  .. ..  ..   .. ..:  :::...    :  :   :::. :..  .   
NP_009 KAFSKFSILTKHKVIHTG---EKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGK
       350       360          370       380       390       400    

         280       290       300       310       320        330    
pF1KB8 CFRHELTHPSHRLPQQGEKPAQCTPCGKRSLPVDSTQARRCQHSREGPASWRE-GRGAS-
        :       .:.. . :::: .:  :::     .. . ..  :. : : . .: :.: : 
NP_009 GFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECGKGFSM
          410       420       430       440       450       460    

                  340       350       360       370       380      
pF1KB8 -------SSVHSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDTEALQHGAEGPCSCSECGERSPMSARLAS
              . .:.:.::          ..  . .   :..: : .: :::.    :. :  
NP_009 FSILTKHKVIHNGEKP----------YKCEECDKATHAGEKPYKCEECGKAFNWSSNLME
          470       480                 490       500       510    

        390       400       410       420       430       440      
pF1KB8 PCRAHTGEKPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRV
         : ::::::..: .: : :    .:  :.  : ::.:..:..:::..  .  :. : ..
NP_009 HKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKI
          520       530       540       550       560       570    

        450       460       470       480       490       500      
pF1KB8 HSGEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGE
       :. :::..: .::. : : . :..:.:.:: :::..: ::: .:   : : .:.  :.::
NP_009 HTVEKPYKCEECGKAFNQSAILIKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFSKVSTLTTHKAIHAGE
          580       590       600       610       620       630    

        510       520       530       540       550       560      
pF1KB8 RPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFS
       .:..:.:::. : .   :  :  .:.::.:..: .: : :   .::  :.  :. :.:..
NP_009 KPYKCKECGKTFIKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYK
          640       650       660       670       680       690    

        570       580       590       600       610       620      
pF1KB8 CGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPEC
       : ::::.:. .:.: :: :.:.::.:..: ::..::   . : .:. .::::.:..: ::
NP_009 CEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSVLTKHKVIHTGEKPYKCEEC
          700       710       720       730       740       750    

        630       640       650        660       670       680     
pF1KB8 DKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSCE-CGKGFVKHSKLIEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSF
        : :. .. .. :. .:. : :..:: :::.: . . ::.: : :: :::..: .: :.:
NP_009 GKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKAFNRSAILIKHKRIHTDEKPYKCEECGKTF
          760       770       780       790       800       810    

         690       700       710       720       730       740     
pF1KB8 RLKAQLLSHQGLHTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQRIHRPERPFACGDCGKGFIYKS
          . : .:...:.::.:..: :: : : . . . .:. ::  :.:. : .:::.. . :
NP_009 SKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPS
          820       830       840       850       860       870    

         750       760       770       780                         
pF1KB8 KLAEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEADWS                       
        :. : ..::   :   :                                          
NP_009 TLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSK
          880       890       900       910       920       930    

>--
 initn: 926 init1: 926 opt: 968  Z-score: 558.1  bits: 114.8 E(85289): 2.4e-24
Smith-Waterman score: 1227; 39.8% identity (69.0% similar) in 384 aa overlap (373-755:893-1276)

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB8 GSRLPQEGNSHQEGDTEALQHGAEGPCSCSECGERSPMSARLASPCRAHTGEKPFQCAHC
                                     :::.   : . :..    ::::::..: .:
NP_009 CEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEEC
            870       880       890       900       910       920  

            410       420       430       440       450       460  
pF1KB8 TKRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFRCAKCGRNF
        : :    ... :...:.::. ..:. :::.. ..  :. : ..:. :::..  .::..:
NP_009 GKAFSWLSVFSKHKKTHAGEKFYKCEACGKAYKSSSTLSYHKKIHTEEKPYKYEECGKGF
            930       940       950       960       970       980  

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB8 RQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQC
          . : .:. .:: :::..: ::: .:   : :  :.  : :: :..: :: ..:.   
NP_009 STFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECDKAFSWPS
            990      1000      1010      1020      1030      1040  

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB8 KLREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTE
       .: ::  .:.::.:..: .: : :   . :  :. ::. :.:..: ::::.:. .:.: :
NP_009 SLTEHKATHAGEKPYKCEECGKAFSWPSRLTEHKATHAGEEPYKCEECGKAFNWSSNLME
           1050      1060      1070      1080      1090      1100  

            590       600       610       620       630       640  
pF1KB8 HLRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLL
       : :.:.::.:..: ::..::   . : .:. .::::.:..: :: : :. .. .. :. .
NP_009 HKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKI
           1110      1120      1130      1140      1150      1160  

            650        660       670       680       690       700 
pF1KB8 HSGEMPFSCE-CGKGFVKHSKLIEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSFRLKAQLLSHQGLHTGE
       :. : :..:: ::::::  : : .:   ::::: ..: .: :...  . :  :. .::::
NP_009 HTVEKPYKCEECGKGFVMFSILAKHKVIHTGEKLYKCEECGKAYKWPSTLRYHKKIHTGE
           1170      1180      1190      1200      1210      1220  

             710       720       730       740       750       760 
pF1KB8 RPFHCPECDKNFWERGHMLRHQRIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKLAEHIRVHTKSCPAP
       .:..: :: : :   . . .:. ::  :.:. : .:::.: . : ...: ..::      
NP_009 KPYKCEECGKAFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKIHTGEKL  
           1230      1240      1250      1260      1270      1280  

             770       780  
pF1KB8 NELDIKKRLSQLFAMIEADWS

>--
 initn: 1407 init1: 444 opt: 447  Z-score: 269.4  bits: 61.4 E(85289): 2.9e-08
Smith-Waterman score: 458; 36.6% identity (67.1% similar) in 164 aa overlap (434-597:154-317)

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB8 KRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFRCAKCGRNFR
                                     : :  . ..:   :.:.: ..: .  :.: 
NP_009 KVHKEGYNKLNQSLTTTQSKVFQRGKYANVFHKCSNSNRHKIRHTGKKHLQCKEYVRSFC
           130       140       150       160       170       180   

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB8 QRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCK
       . ..: .:.:..: :. ..: : : .:   : :  ..  : ::.:. :.:::..:..   
NP_009 MLSHLSQHKRIYTRENSYKCEEGGKAFNWSSTLTYYKSAHTGEKPYRCKECGKAFSKFSI
           190       200       210       220       230       240   

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB8 LREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEH
       : .:  .:.::. ..: .: : :  ..::  :.  :. :.: .: ::::.:.. : :: :
NP_009 LTKHKVIHTGEKSYKCEECGKAFNQSAILTKHKIIHTGEKPNKCEECGKAFSKVSTLTTH
           250       260       270       280       290       300   

           590       600       610       620       630       640   
pF1KB8 LRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLH
         .:.::.:..: :                                              
NP_009 KAIHAGEKPYKCKECGKAFSKVSTLITHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIH
           310       320       330       340       350       360   

>>XP_016882750 (OMIM: 194555) PREDICTED: zinc finger pro  (707 aa)
 initn: 1973 init1: 1044 opt: 1444  Z-score: 824.1  bits: 163.1 E(85289): 3.7e-39
Smith-Waterman score: 1444; 42.6% identity (66.9% similar) in 486 aa overlap (279-759:115-595)

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB8 FRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNADGEMCFRHELTHPSHRLPQQGEKPAQCTPCGKRSLPV
                                     ..:   : .. ..:. : : :  :   : :
XP_016 EMETVSEAGTHQEWSFQQIWEKIASDLTRSQDLMINSSQFSKEGDFPCQ-TEAG---LSV
           90       100       110       120       130           140

      310       320        330       340       350       360       
pF1KB8 DSTQARRCQHSREGPA-SWREGRGASSSVHSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDTEALQ---HG
         :. .  : .   :. :        ...:::.:  .   . :..    ..  ..   : 
XP_016 IHTRQKSSQGNGYKPSFSDVSHFDFHQQLHSGEKSHT-CDECGKNFCYISALRIHQRVHM
              150       160       170        180       190         

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB8 AEGPCSCSECGERSPMSARLASPCRAHTGEKPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERP
       .:   .:. ::..  .:..: .  :.:::::::.:..: : :  :  :.::.. : ::.:
XP_016 GEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGEKPFKCVECGKGFSRRSALNVHHKLHTGEKP
     200       210       220       230       240       250         

          430       440       450       460       470       480    
pF1KB8 FSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCP
       ..:..:::.: .. .: :: :.:.:::::.:  ::..:  :..: ::. .:: ::::.: 
XP_016 YNCEECGKAFIHDSQLQEHQRIHTGEKPFKCDICGKSFCGRSRLNRHSMVHTAEKPFRCD
     260       270       280       290       300       310         

          490       500       510       520       530       540    
pF1KB8 ECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDK
        :  ::: .: : .::. : ::.:..: :::.::  .  :  :  ::.::.:..: .: :
XP_016 TCDKSFRQRSALNSHRMIHTGEKPYKCEECGKGFICRRDLYTHHMVHTGEKPYNCKECGK
     320       330       340       350       360       370         

          550       560       570       580       590       600    
pF1KB8 RFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRL
        ::  . :  ::..:: :.::.: ::::::  .:.   : : ::::.:..: ::..... 
XP_016 SFRWASCLLKHQRVHSGEKPFKCEECGKGFYTNSQCYSHQRSHSGEKPYKCVECGKGYKR
     380       390       400       410       420       430         

          610       620       630       640       650        660   
pF1KB8 KGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSCE-CGKGFVKHSKL
       . .:  :::.::::. ..: :: : .     .  :. ::::: ::.:: ::: :...:.:
XP_016 RLDLDFHQRVHTGEKLYNCKECGKSFSRAPCLLKHERLHSGEKPFQCEECGKRFTQNSHL
     440       450       460       470       480       490         

           670       680       690       700       710       720   
pF1KB8 IEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSFRLKAQLLSHQGLHTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQ
         : :.::::::..: :: :..  : .:  :: .::::::..: :: :.:   . .:.::
XP_016 HSHQRVHTGEKPYKCEKCGKGYNSKFNLDMHQKVHTGERPYNCKECGKSFGWASCLLKHQ
     500       510       520       530       540       550         

           730       740       750       760       770       780   
pF1KB8 RIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKLAEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEADWS 
       :.:  :.:: : .::: :  .:.:  : ::::   :                        
XP_016 RLHSGEKPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSWSSTRLTHQRRHS
     560       570       580       590       600       610         

XP_016 RETPLKCEQHGKNIVQNSFSKVQEKVHSVEKPYKCEDCGKGYNRRLNLDMHQRVHMGEKT
     620       630       640       650       660       670         

>--
 initn: 727 init1: 317 opt: 334  Z-score: 209.1  bits: 49.4 E(85289): 6.6e-05
Smith-Waterman score: 334; 38.4% identity (69.6% similar) in 112 aa overlap (509-620:596-707)

      480       490       500       510       520       530        
pF1KB8 KPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQ
                                     ..:.:::.::. .     : : :: : :..
XP_016 KPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSWSSTRLTHQRRHSRETPLK
         570       580       590       600       610       620     

      540       550       560       570       580       590        
pF1KB8 CLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPEC
       : .  : .  ... :.....:: :.:..: .::::..:. .:  : ::: ::. ..: ::
XP_016 CEQHGKNIVQNSFSKVQEKVHSVEKPYKCEDCGKGYNRRLNLDMHQRVHMGEKTWKCREC
         630       640       650       660       670       680     

      600       610       620       630       640       650        
pF1KB8 NRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSCECGKGFV
       .  :   ..:  :: .:.::.:                                      
XP_016 DMCFSQASSLRLHQNVHVGEKP                                      
         690       700                                             

>>NP_037530 (OMIM: 194555) zinc finger protein 224 [Homo  (707 aa)
 initn: 1973 init1: 1044 opt: 1444  Z-score: 824.1  bits: 163.1 E(85289): 3.7e-39
Smith-Waterman score: 1444; 42.6% identity (66.9% similar) in 486 aa overlap (279-759:115-595)

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB8 FRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNADGEMCFRHELTHPSHRLPQQGEKPAQCTPCGKRSLPV
                                     ..:   : .. ..:. : : :  :   : :
NP_037 EMETVSEAGTHQEWSFQQIWEKIASDLTRSQDLMINSSQFSKEGDFPCQ-TEAG---LSV
           90       100       110       120       130           140

      310       320        330       340       350       360       
pF1KB8 DSTQARRCQHSREGPA-SWREGRGASSSVHSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDTEALQ---HG
         :. .  : .   :. :        ...:::.:  .   . :..    ..  ..   : 
NP_037 IHTRQKSSQGNGYKPSFSDVSHFDFHQQLHSGEKSHT-CDECGKNFCYISALRIHQRVHM
              150       160       170        180       190         

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB8 AEGPCSCSECGERSPMSARLASPCRAHTGEKPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERP
       .:   .:. ::..  .:..: .  :.:::::::.:..: : :  :  :.::.. : ::.:
NP_037 GEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGEKPFKCVECGKGFSRRSALNVHHKLHTGEKP
     200       210       220       230       240       250         

          430       440       450       460       470       480    
pF1KB8 FSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCP
       ..:..:::.: .. .: :: :.:.:::::.:  ::..:  :..: ::. .:: ::::.: 
NP_037 YNCEECGKAFIHDSQLQEHQRIHTGEKPFKCDICGKSFCGRSRLNRHSMVHTAEKPFRCD
     260       270       280       290       300       310         

          490       500       510       520       530       540    
pF1KB8 ECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDK
        :  ::: .: : .::. : ::.:..: :::.::  .  :  :  ::.::.:..: .: :
NP_037 TCDKSFRQRSALNSHRMIHTGEKPYKCEECGKGFICRRDLYTHHMVHTGEKPYNCKECGK
     320       330       340       350       360       370         

          550       560       570       580       590       600    
pF1KB8 RFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRL
        ::  . :  ::..:: :.::.: ::::::  .:.   : : ::::.:..: ::..... 
NP_037 SFRWASCLLKHQRVHSGEKPFKCEECGKGFYTNSQCYSHQRSHSGEKPYKCVECGKGYKR
     380       390       400       410       420       430         

          610       620       630       640       650        660   
pF1KB8 KGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSCE-CGKGFVKHSKL
       . .:  :::.::::. ..: :: : .     .  :. ::::: ::.:: ::: :...:.:
NP_037 RLDLDFHQRVHTGEKLYNCKECGKSFSRAPCLLKHERLHSGEKPFQCEECGKRFTQNSHL
     440       450       460       470       480       490         

           670       680       690       700       710       720   
pF1KB8 IEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSFRLKAQLLSHQGLHTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQ
         : :.::::::..: :: :..  : .:  :: .::::::..: :: :.:   . .:.::
NP_037 HSHQRVHTGEKPYKCEKCGKGYNSKFNLDMHQKVHTGERPYNCKECGKSFGWASCLLKHQ
     500       510       520       530       540       550         

           730       740       750       760       770       780   
pF1KB8 RIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKLAEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEADWS 
       :.:  :.:: : .::: :  .:.:  : ::::   :                        
NP_037 RLHSGEKPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSWSSTRLTHQRRHS
     560       570       580       590       600       610         

NP_037 RETPLKCEQHGKNIVQNSFSKVQEKVHSVEKPYKCEDCGKGYNRRLNLDMHQRVHMGEKT
     620       630       640       650       660       670         

>--
 initn: 727 init1: 317 opt: 334  Z-score: 209.1  bits: 49.4 E(85289): 6.6e-05
Smith-Waterman score: 334; 38.4% identity (69.6% similar) in 112 aa overlap (509-620:596-707)

      480       490       500       510       520       530        
pF1KB8 KPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQ
                                     ..:.:::.::. .     : : :: : :..
NP_037 KPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSWSSTRLTHQRRHSRETPLK
         570       580       590       600       610       620     

      540       550       560       570       580       590        
pF1KB8 CLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPEC
       : .  : .  ... :.....:: :.:..: .::::..:. .:  : ::: ::. ..: ::
NP_037 CEQHGKNIVQNSFSKVQEKVHSVEKPYKCEDCGKGYNRRLNLDMHQRVHMGEKTWKCREC
         630       640       650       660       670       680     

      600       610       620       630       640       650        
pF1KB8 NRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSCECGKGFV
       .  :   ..:  :: .:.::.:                                      
NP_037 DMCFSQASSLRLHQNVHVGEKP                                      
         690       700                                             

>>NP_001308574 (OMIM: 194555) zinc finger protein 224 [H  (707 aa)
 initn: 1973 init1: 1044 opt: 1444  Z-score: 824.1  bits: 163.1 E(85289): 3.7e-39
Smith-Waterman score: 1444; 42.6% identity (66.9% similar) in 486 aa overlap (279-759:115-595)

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB8 FRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNADGEMCFRHELTHPSHRLPQQGEKPAQCTPCGKRSLPV
                                     ..:   : .. ..:. : : :  :   : :
NP_001 EMETVSEAGTHQEWSFQQIWEKIASDLTRSQDLMINSSQFSKEGDFPCQ-TEAG---LSV
           90       100       110       120       130           140

      310       320        330       340       350       360       
pF1KB8 DSTQARRCQHSREGPA-SWREGRGASSSVHSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDTEALQ---HG
         :. .  : .   :. :        ...:::.:  .   . :..    ..  ..   : 
NP_001 IHTRQKSSQGNGYKPSFSDVSHFDFHQQLHSGEKSHT-CDECGKNFCYISALRIHQRVHM
              150       160       170        180       190         

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB8 AEGPCSCSECGERSPMSARLASPCRAHTGEKPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERP
       .:   .:. ::..  .:..: .  :.:::::::.:..: : :  :  :.::.. : ::.:
NP_001 GEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGEKPFKCVECGKGFSRRSALNVHHKLHTGEKP
     200       210       220       230       240       250         

          430       440       450       460       470       480    
pF1KB8 FSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCP
       ..:..:::.: .. .: :: :.:.:::::.:  ::..:  :..: ::. .:: ::::.: 
NP_001 YNCEECGKAFIHDSQLQEHQRIHTGEKPFKCDICGKSFCGRSRLNRHSMVHTAEKPFRCD
     260       270       280       290       300       310         

          490       500       510       520       530       540    
pF1KB8 ECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDK
        :  ::: .: : .::. : ::.:..: :::.::  .  :  :  ::.::.:..: .: :
NP_001 TCDKSFRQRSALNSHRMIHTGEKPYKCEECGKGFICRRDLYTHHMVHTGEKPYNCKECGK
     320       330       340       350       360       370         

          550       560       570       580       590       600    
pF1KB8 RFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRL
        ::  . :  ::..:: :.::.: ::::::  .:.   : : ::::.:..: ::..... 
NP_001 SFRWASCLLKHQRVHSGEKPFKCEECGKGFYTNSQCYSHQRSHSGEKPYKCVECGKGYKR
     380       390       400       410       420       430         

          610       620       630       640       650        660   
pF1KB8 KGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSCE-CGKGFVKHSKL
       . .:  :::.::::. ..: :: : .     .  :. ::::: ::.:: ::: :...:.:
NP_001 RLDLDFHQRVHTGEKLYNCKECGKSFSRAPCLLKHERLHSGEKPFQCEECGKRFTQNSHL
     440       450       460       470       480       490         

           670       680       690       700       710       720   
pF1KB8 IEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSFRLKAQLLSHQGLHTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQ
         : :.::::::..: :: :..  : .:  :: .::::::..: :: :.:   . .:.::
NP_001 HSHQRVHTGEKPYKCEKCGKGYNSKFNLDMHQKVHTGERPYNCKECGKSFGWASCLLKHQ
     500       510       520       530       540       550         

           730       740       750       760       770       780   
pF1KB8 RIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKLAEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEADWS 
       :.:  :.:: : .::: :  .:.:  : ::::   :                        
NP_001 RLHSGEKPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSWSSTRLTHQRRHS
     560       570       580       590       600       610         

NP_001 RETPLKCEQHGKNIVQNSFSKVQEKVHSVEKPYKCEDCGKGYNRRLNLDMHQRVHMGEKT
     620       630       640       650       660       670         

>--
 initn: 727 init1: 317 opt: 334  Z-score: 209.1  bits: 49.4 E(85289): 6.6e-05
Smith-Waterman score: 334; 38.4% identity (69.6% similar) in 112 aa overlap (509-620:596-707)

      480       490       500       510       520       530        
pF1KB8 KPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQ
                                     ..:.:::.::. .     : : :: : :..
NP_001 KPFKCEECGKRFTQNSQLHSHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSWSSTRLTHQRRHSRETPLK
         570       580       590       600       610       620     

      540       550       560       570       580       590        
pF1KB8 CLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPEC
       : .  : .  ... :.....:: :.:..: .::::..:. .:  : ::: ::. ..: ::
NP_001 CEQHGKNIVQNSFSKVQEKVHSVEKPYKCEDCGKGYNRRLNLDMHQRVHMGEKTWKCREC
         630       640       650       660       670       680     

      600       610       620       630       640       650        
pF1KB8 NRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSCECGKGFV
       .  :   ..:  :: .:.::.:                                      
NP_001 DMCFSQASSLRLHQNVHVGEKP                                      
         690       700                                             

>>XP_005259469 (OMIM: 604749) PREDICTED: zinc finger pro  (734 aa)
 initn: 1987 init1: 1058 opt: 1417  Z-score: 809.0  bits: 160.4 E(85289): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 1534; 32.9% identity (60.5% similar) in 765 aa overlap (9-755:8-730)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAEPPRLPLTFEDVAIYFSEQEWQDLEAWQKELYKHVMRSNYETLVSLDDGLPKPELISW
               .::.:::. :.:.:   :.. :..::. ::  :...:::.     ::..:: 
XP_005  MTKFQEAVTFKDVAVAFTEEELGLLDSAQRKLYRDVMLENFRNLVSVGHQSFKPDMISQ
                10        20        30        40        50         

               70        80              90       100       110    
pF1KB8 IEHGGEPFRKWRESQKSGNIICSSVDMH------FDPGFEEQLFWGSQQAMNSGKTKSH-
       .:.  . . :  ..:..       . .:      :. :  :   :  .. . :  ..:. 
XP_005 LEREEKLWMKELQTQRGDRNQNEMATLHKAGLRCFSLG--ELSCWQIKRHIASKLARSQD
      60        70        80        90         100       110       

           120       130       140       150         160       170 
pF1KB8 FQLDPESQCSFGSFVSFRPDQGITLGSPQRHDARAPPPLACGP--SESTLKEGIPGPRNL
        ... :.. :  .: . . :.   .:. .  .: .      .   ..:.. :.   : . 
XP_005 SMINIEGKSS--QFPKHH-DSPCQVGAGESIQASVDDNCLVNHIGDHSSIIENQEFPTG-
       120         130        140       150       160       170    

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB8 DLPGLWDVPAWESTQHPWPVCGESCWENNHLVMHQRGHSKDRTRRAWEKFNKRAETQMPW
        .:. :.    . ::.    : ..  .:.  ..       :     .  .... . ..  
XP_005 KVPNSWSKIYLNETQNYQRSCKQTQMKNKLCIFAPY---VD----IFSCISHHHDDNIVH
           180       190       200          210           220      

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB8 SSPRVQRHFRCGVCGKSFRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNADGEMCFRHELTHPSHRLPQQ
       .  .:. .   . :::.   :.  : . . :::.  ... . :  :    .   :.  . 
XP_005 KRDKVHSN---SDCGKD-TLKVSPLTQRSIHTGQKTYQGNECEEAFNDSSSLELHKQVHL
        230          240        250       260       270       280  

             300       310       320       330       340           
pF1KB8 GEKPAQCTPCGKRSLPVDSTQARRCQHSREGPASWREGRGASSSVHSGQKP------GSR
       :.:   :.                   ..:  .:.  :  ...::..:.:       :. 
XP_005 GKKSPACS-------------------THEKDTSYSSGIPVQQSVRTGKKRYWCHECGKG
            290                          300       310       320   

         350         360       370       380       390       400   
pF1KB8 LPQEGN--SHQEGDTEALQHGAEGPCSCSECGERSPMSARLASPCRAHTGEKPFQCAHCT
       . : .:  .::.       : .: : .: :::.   .:..: .    ::::::..:  : 
XP_005 FSQSSNLQTHQR------VHTGEKPYTCHECGKSFNQSSHLYAHLPIHTGEKPYRCDSCG
           330             340       350       360       370       

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB8 KRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHSGEKPFRCAKCGRNFR
       : :     :..: ..: ::.:..:. :::::... .:  : :.:.::::..:. ::. : 
XP_005 KGFSRSTDLNIHCRVHTGEKPYKCEVCGKGFTQRSHLQAHERIHTGEKPYKCGDCGKRFS
       380       390       400       410       420       430       

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB8 QRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERPFSCSECGRGFTHQCK
         ..:  :::.::.:::..: :::  : :   :..:.  : ::.:..: :::.::.   .
XP_005 CSSNLHTHQRVHTEEKPYKCDECGKCFSLSFNLHSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSSASS
       440       450       460       470       480       490       

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB8 LREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCGECGKGFTRQSKLTEH
       .. : :::.::.::.:  : : :  .. ..:::..:. :.:..:  ::: :. . .: .:
XP_005 FQSHQRVHTGEKPFRCNVCGKGFSQSSYFQAHQRVHTGEKPYKCEVCGKRFNWSLNLHNH
       500       510       520       530       540       550       

           590       600       610       620       630       640   
pF1KB8 LRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDKRYRVKADMKAHQLLH
        :::.::.:..: ::...:   ..: .:: .::::.::.:  :.::.   . ..::: .:
XP_005 QRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLQAHQSVHTGEKPFKCDACQKRFSQASHLQAHQRVH
       560       570       580       590       600       610       

           650        660       670       680       690       700  
pF1KB8 SGEMPFSCE-CGKGFVKHSKLIEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSFRLKAQLLSHQGLHTGER
       .:: :..:. :::.: ..:.:  :   :::::::.: .: : :  .: : .:: .::::.
XP_005 TGEKPYKCDTCGKAFSQRSNLQVHQIIHTGEKPFKCEECGKEFSWSAGLSAHQRVHTGEK
       620       630       640       650       660       670       

            710       720       730       740       750       760  
pF1KB8 PFHCPECDKNFWERGHMLRHQRIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKLAEHIRVHTKSCPAPN
       :. : .: :.: . .:.  :::.:  :::. :  : :::  .:.:  : ::::       
XP_005 PYTCQQCGKGFSQASHFHTHQRVHTGERPYICDVCCKGFSQRSHLIYHQRVHTGGNL   
       680       690       700       710       720       730       

            770       780  
pF1KB8 ELDIKKRLSQLFAMIEADWS

>>NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 is  (751 aa)
 initn: 1006 init1: 1006 opt: 1416  Z-score: 808.4  bits: 160.3 E(85289): 2.8e-38
Smith-Waterman score: 1646; 33.2% identity (60.7% similar) in 765 aa overlap (9-759:28-725)

                                  10        20        30        40 
pF1KB8                    MAEPPRLPLTFEDVAIYFSEQEWQDLEAWQKELYKHVMRSN
                                  .::.:: . :...::..:.  :..:.. :   :
NP_001 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
               10        20        30        40        50        60

              50        60        70        80        90       100 
pF1KB8 YETLVSLDDGLPKPELISWIEHGGEPFRKWRESQKSGNIICSSVDMHFDPGFEEQLFWGS
       :  :::.   . ::..:: .:.: ::   :        :.  :. .     .: .:    
NP_001 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEP---W--------IMEPSIPVGTCADWETRL----
               70        80                   90       100         

             110        120       130       140       150       160
pF1KB8 QQAMNSGKTK-SHFQLDPESQCSFGSFVSFRPDQGITLGSPQRHDARAPPPLACGPSEST
       ...... .   :. .:.::                . . . .: :. .   :     :..
NP_001 ENSVSAPEPDISEEELSPE----------------VIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGS
         110       120                       130       140         

                  170       180       190          200       210   
pF1KB8 LKEGIPG----PRNLDLPGLWDVPAWESTQHPWPVC---GESCWENNHLVMHQRGHSKDR
       :..   .    :... .     .:.::.     ::    :.:   ...:: .. .  .  
NP_001 LERQQANQQTLPKEIKVTEK-TIPSWEKG----PVNNEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETS
     150       160        170           180       190       200    

           220       230        240       250       260       270  
pF1KB8 TRRAWEKFNKRAETQMPWSSP-RVQRHFRCGVCGKSFRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNAD
       :.:. .. :         :.: . ..  .:. :::.:     :.::  .:::. :..  .
NP_001 TKRSIKQ-N---------SNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCNE
          210                 220       230       240       250    

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB8 GEMCFRHELTHPSHRLPQQGEKPAQCTPCGKRSLPVDSTQARRCQHSREGPASWREGRGA
        :  : .  .  .:.  . :.:: .:  :::  .              :::.  .. :  
NP_001 CEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFI--------------EGPSLTQHQR--
          260       270       280                     290          

            340       350       360           370       380        
pF1KB8 SSSVHSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDTEALQHG----AEGPCSCSECGERSPMSARLASPC
          .:.:.::  .  . :.. ..  :. .::     .: : .:.:::.   . ...    
NP_001 ---IHTGEKP-YKCDECGKAFSQ-RTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQ
         300        310        320       330       340       350   

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB8 RAHTGEKPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHS
       . :::::::.: .: : :     :  ::. : ::. ..: .:::.:     . .:  .:.
NP_001 KIHTGEKPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHT
           360       370       380       390       400       410   

      450       460       470       480       490       500        
pF1KB8 GEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERP
       ::::..: .::. : :...: .::. :: :::..: ::: ::   : :  :   : ::.:
NP_001 GEKPYECNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKP
           420       430       440       450       460       470   

      510       520       530       540       550       560        
pF1KB8 FSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCG
       ..:.:::..:..  .: .: :.:. :.::.: .: : :   . :. ::.::..:. . : 
NP_001 YKCNECGKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECK
           480       490       500       510       520       530   

      570       580       590       600       610       620        
pF1KB8 ECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDK
       ::::.: :.:.:..: :.:.::.:.:: ::...:   ..:..:...::::::..: :: .
NP_001 ECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGR
           540       550       560       570       580       590   

      630       640       650        660       670       680       
pF1KB8 RYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSC-ECGKGFVKHSKLIEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSFRL
        .  .  .  :. .:.:  :. : ::::.: . :.: .: .::: :::.:: ::.:.:  
NP_001 AFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQ
           600       610       620       630       640       650   

       690       700       710       720       730       740       
pF1KB8 KAQLLSHQGLHTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQRIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKL
       ...: .:: .::::.:..: :::: : .  :. .::  :  :.:. :..: : :  .. :
NP_001 SSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYL
           660       670       680       690       700       710   

       750       760       770       780     
pF1KB8 AEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEADWS   
        .: :.:.   :                          
NP_001 IQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
           720       730       740       750 

>>NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 isofo  (751 aa)
 initn: 1006 init1: 1006 opt: 1416  Z-score: 808.4  bits: 160.3 E(85289): 2.8e-38
Smith-Waterman score: 1646; 33.2% identity (60.7% similar) in 765 aa overlap (9-759:28-725)

                                  10        20        30        40 
pF1KB8                    MAEPPRLPLTFEDVAIYFSEQEWQDLEAWQKELYKHVMRSN
                                  .::.:: . :...::..:.  :..:.. :   :
NP_009 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
               10        20        30        40        50        60

              50        60        70        80        90       100 
pF1KB8 YETLVSLDDGLPKPELISWIEHGGEPFRKWRESQKSGNIICSSVDMHFDPGFEEQLFWGS
       :  :::.   . ::..:: .:.: ::   :        :.  :. .     .: .:    
NP_009 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEP---W--------IMEPSIPVGTCADWETRL----
               70        80                   90       100         

             110        120       130       140       150       160
pF1KB8 QQAMNSGKTK-SHFQLDPESQCSFGSFVSFRPDQGITLGSPQRHDARAPPPLACGPSEST
       ...... .   :. .:.::                . . . .: :. .   :     :..
NP_009 ENSVSAPEPDISEEELSPE----------------VIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGS
         110       120                       130       140         

                  170       180       190          200       210   
pF1KB8 LKEGIPG----PRNLDLPGLWDVPAWESTQHPWPVC---GESCWENNHLVMHQRGHSKDR
       :..   .    :... .     .:.::.     ::    :.:   ...:: .. .  .  
NP_009 LERQQANQQTLPKEIKVTEK-TIPSWEKG----PVNNEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETS
     150       160        170           180       190       200    

           220       230        240       250       260       270  
pF1KB8 TRRAWEKFNKRAETQMPWSSP-RVQRHFRCGVCGKSFRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNAD
       :.:. .. :         :.: . ..  .:. :::.:     :.::  .:::. :..  .
NP_009 TKRSIKQ-N---------SNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCNE
          210                 220       230       240       250    

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB8 GEMCFRHELTHPSHRLPQQGEKPAQCTPCGKRSLPVDSTQARRCQHSREGPASWREGRGA
        :  : .  .  .:.  . :.:: .:  :::  .              :::.  .. :  
NP_009 CEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFI--------------EGPSLTQHQR--
          260       270       280                     290          

            340       350       360           370       380        
pF1KB8 SSSVHSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDTEALQHG----AEGPCSCSECGERSPMSARLASPC
          .:.:.::  .  . :.. ..  :. .::     .: : .:.:::.   . ...    
NP_009 ---IHTGEKP-YKCDECGKAFSQ-RTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQ
         300        310        320       330       340       350   

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB8 RAHTGEKPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHS
       . :::::::.: .: : :     :  ::. : ::. ..: .:::.:     . .:  .:.
NP_009 KIHTGEKPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHT
           360       370       380       390       400       410   

      450       460       470       480       490       500        
pF1KB8 GEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERP
       ::::..: .::. : :...: .::. :: :::..: ::: ::   : :  :   : ::.:
NP_009 GEKPYECNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKP
           420       430       440       450       460       470   

      510       520       530       540       550       560        
pF1KB8 FSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCG
       ..:.:::..:..  .: .: :.:. :.::.: .: : :   . :. ::.::..:. . : 
NP_009 YKCNECGKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECK
           480       490       500       510       520       530   

      570       580       590       600       610       620        
pF1KB8 ECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDK
       ::::.: :.:.:..: :.:.::.:.:: ::...:   ..:..:...::::::..: :: .
NP_009 ECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGR
           540       550       560       570       580       590   

      630       640       650        660       670       680       
pF1KB8 RYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSC-ECGKGFVKHSKLIEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSFRL
        .  .  .  :. .:.:  :. : ::::.: . :.: .: .::: :::.:: ::.:.:  
NP_009 AFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQ
           600       610       620       630       640       650   

       690       700       710       720       730       740       
pF1KB8 KAQLLSHQGLHTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQRIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKL
       ...: .:: .::::.:..: :::: : .  :. .::  :  :.:. :..: : :  .. :
NP_009 SSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYL
           660       670       680       690       700       710   

       750       760       770       780     
pF1KB8 AEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEADWS   
        .: :.:.   :                          
NP_009 IQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
           720       730       740       750 

>>NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 is  (751 aa)
 initn: 1006 init1: 1006 opt: 1416  Z-score: 808.4  bits: 160.3 E(85289): 2.8e-38
Smith-Waterman score: 1646; 33.2% identity (60.7% similar) in 765 aa overlap (9-759:28-725)

                                  10        20        30        40 
pF1KB8                    MAEPPRLPLTFEDVAIYFSEQEWQDLEAWQKELYKHVMRSN
                                  .::.:: . :...::..:.  :..:.. :   :
NP_001 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
               10        20        30        40        50        60

              50        60        70        80        90       100 
pF1KB8 YETLVSLDDGLPKPELISWIEHGGEPFRKWRESQKSGNIICSSVDMHFDPGFEEQLFWGS
       :  :::.   . ::..:: .:.: ::   :        :.  :. .     .: .:    
NP_001 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEP---W--------IMEPSIPVGTCADWETRL----
               70        80                   90       100         

             110        120       130       140       150       160
pF1KB8 QQAMNSGKTK-SHFQLDPESQCSFGSFVSFRPDQGITLGSPQRHDARAPPPLACGPSEST
       ...... .   :. .:.::                . . . .: :. .   :     :..
NP_001 ENSVSAPEPDISEEELSPE----------------VIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGS
         110       120                       130       140         

                  170       180       190          200       210   
pF1KB8 LKEGIPG----PRNLDLPGLWDVPAWESTQHPWPVC---GESCWENNHLVMHQRGHSKDR
       :..   .    :... .     .:.::.     ::    :.:   ...:: .. .  .  
NP_001 LERQQANQQTLPKEIKVTEK-TIPSWEKG----PVNNEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETS
     150       160        170           180       190       200    

           220       230        240       250       260       270  
pF1KB8 TRRAWEKFNKRAETQMPWSSP-RVQRHFRCGVCGKSFRRKLCLLRHLAAHTGRGPFRNAD
       :.:. .. :         :.: . ..  .:. :::.:     :.::  .:::. :..  .
NP_001 TKRSIKQ-N---------SNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCNE
          210                 220       230       240       250    

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB8 GEMCFRHELTHPSHRLPQQGEKPAQCTPCGKRSLPVDSTQARRCQHSREGPASWREGRGA
        :  : .  .  .:.  . :.:: .:  :::  .              :::.  .. :  
NP_001 CEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFI--------------EGPSLTQHQR--
          260       270       280                     290          

            340       350       360           370       380        
pF1KB8 SSSVHSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDTEALQHG----AEGPCSCSECGERSPMSARLASPC
          .:.:.::  .  . :.. ..  :. .::     .: : .:.:::.   . ...    
NP_001 ---IHTGEKP-YKCDECGKAFSQ-RTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQ
         300        310        320       330       340       350   

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB8 RAHTGEKPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKLTEHIRVHS
       . :::::::.: .: : :     :  ::. : ::. ..: .:::.:     . .:  .:.
NP_001 KIHTGEKPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHT
           360       370       380       390       400       410   

      450       460       470       480       490       500        
pF1KB8 GEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHRLRHGGERP
       ::::..: .::. : :...: .::. :: :::..: ::: ::   : :  :   : ::.:
NP_001 GEKPYECNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKP
           420       430       440       450       460       470   

      510       520       530       540       550       560        
pF1KB8 FSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHSKERPFSCG
       ..:.:::..:..  .: .: :.:. :.::.: .: : :   . :. ::.::..:. . : 
NP_001 YKCNECGKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECK
           480       490       500       510       520       530   

      570       580       590       600       610       620        
pF1KB8 ECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERPFQCPECDK
       ::::.: :.:.:..: :.:.::.:.:: ::...:   ..:..:...::::::..: :: .
NP_001 ECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGR
           540       550       560       570       580       590   

      630       640       650        660       670       680       
pF1KB8 RYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSC-ECGKGFVKHSKLIEHIRTHTGEKPFQCPKCDKSFRL
        .  .  .  :. .:.:  :. : ::::.: . :.: .: .::: :::.:: ::.:.:  
NP_001 AFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQ
           600       610       620       630       640       650   

       690       700       710       720       730       740       
pF1KB8 KAQLLSHQGLHTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQRIHRPERPFACGDCGKGFIYKSKL
       ...: .:: .::::.:..: :::: : .  :. .::  :  :.:. :..: : :  .. :
NP_001 SSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYL
           660       670       680       690       700       710   

       750       760       770       780     
pF1KB8 AEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEADWS   
        .: :.:.   :                          
NP_001 IQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
           720       730       740       750 

>>NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 is  (675 aa)
 initn: 1006 init1: 1006 opt: 1415  Z-score: 808.2  bits: 160.1 E(85289): 2.8e-38
Smith-Waterman score: 1542; 36.4% identity (63.7% similar) in 590 aa overlap (179-759:95-649)

      150       160       170       180       190          200     
pF1KB8 PPPLACGPSESTLKEGIPGPRNLDLPGLWDVPAWESTQHPWPVC---GESCWENNHLVMH
                                     .:.::.     ::    :.:   ...:: .
NP_001 LESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKG----PVNNEFGKSVNVSSNLVTQ
           70        80        90       100           110       120

         210       220       230        240       250       260    
pF1KB8 QRGHSKDRTRRAWEKFNKRAETQMPWSSP-RVQRHFRCGVCGKSFRRKLCLLRHLAAHTG
       . .  .  :.:. .. :         :.: . ..  .:. :::.:     :.::  .:::
NP_001 EPSPEETSTKRSIKQ-N---------SNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTG
              130                 140       150       160       170

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB8 RGPFRNADGEMCFRHELTHPSHRLPQQGEKPAQCTPCGKRSLPVDSTQARRCQHSREGPA
       . :..  . :  : .  .  .:.  . :.:: .:  :::  .              :::.
NP_001 EKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFI--------------EGPS
              180       190       200       210                    

          330       340       350       360           370       380
pF1KB8 SWREGRGASSSVHSGQKPGSRLPQEGNSHQEGDTEALQHG----AEGPCSCSECGERSPM
         .. :     .:.:.::  .  . :.. ..  :. .::     .: : .:.:::.   .
NP_001 LTQHQR-----IHTGEKP-YKCDECGKAFSQ-RTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQ
        220             230       240        250       260         

              390       400       410       420       430       440
pF1KB8 SARLASPCRAHTGEKPFQCAHCTKRFRLRRLLQVHQHAHGGERPFSCRKCGKGFAKQCKL
        ...    . :::::::.: .: : :     :  ::. : ::. ..: .:::.:     .
NP_001 RGHFMEHQKIHTGEKPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTF
     270       280       290       300       310       320         

              450       460       470       480       490       500
pF1KB8 TEHIRVHSGEKPFRCAKCGRNFRQRGQLLRHQRLHTDEKPFQCPECGLSFRLESMLRAHR
        .:  .:.::::..: .::. : :...: .::. :: :::..: ::: ::   : :  : 
NP_001 IRHHMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHL
     330       340       350       360       370       380         

              510       520       530       540       550       560
pF1KB8 LRHGGERPFSCSECGRGFTHQCKLREHLRVHSGERPFQCLKCDKRFRLKGILKAHQHTHS
         : ::.:..:.:::..:..  .: .: :.:. :.::.: .: : :   . :. ::.::.
NP_001 KIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHT
     390       400       410       420       430       440         

              570       580       590       600       610       620
pF1KB8 KERPFSCGECGKGFTRQSKLTEHLRVHSGERPFQCPECNRSFRLKGQLLSHQRLHTGERP
       .:. . : ::::.: :.:.:..: :.:.::.:.:: ::...:   ..:..:...::::::
NP_001 QEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERP
     450       460       470       480       490       500         

              630       640       650        660       670         
pF1KB8 FQCPECDKRYRVKADMKAHQLLHSGEMPFSC-ECGKGFVKHSKLIEHIRTHTGEKPFQCP
       ..: :: . .  .  .  :. .:.:  :. : ::::.: . :.: .: .::: :::.:: 
NP_001 YKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCN
     510       520       530       540       550       560         

     680       690       700       710       720       730         
pF1KB8 KCDKSFRLKAQLLSHQGLHTGERPFHCPECDKNFWERGHMLRHQRIHRPERPFACGDCGK
       ::.:.:  ...: .:: .::::.:..: :::: : .  :. .::  :  :.:. :..: :
NP_001 KCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRK
     570       580       590       600       610       620         

     740       750       760       770       780     
pF1KB8 GFIYKSKLAEHIRVHTKSCPAPNELDIKKRLSQLFAMIEADWS   
        :  .. : .: :.:.   :                          
NP_001 TFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
     630       640       650       660       670     




782 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 12:37:03 2016 done: Fri Nov  4 12:37:05 2016
 Total Scan time: 12.140 Total Display time:  0.220

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com