Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8314
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8314, 368 aa
1>>>pF1KB8314 368 - 368 aa - 368 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1642+/-0.00101; mu= 12.1023+/- 0.060
mean_var=100.8353+/-20.665, 0's: 0 Z-trim(106.6): 179 B-trim: 66 in 1/48
Lambda= 0.127723
statistics sampled from 8838 (9056) to 8838 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 2.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14721.1 BGN gene_id:633|Hs108|chrX ( 368) 2498 471.1 6.8e-133
CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 ( 359) 1281 246.8 2.2e-65
CCDS9040.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 ( 250) 718 143.0 2.7e-34
CCDS9041.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 ( 212) 581 117.7 9.6e-27
CCDS1438.1 PRELP gene_id:5549|Hs108|chr1 ( 382) 478 98.9 7.9e-21
CCDS56578.1 ECM2 gene_id:1842|Hs108|chr9 ( 643) 458 95.3 1.5e-19
CCDS6698.1 ECM2 gene_id:1842|Hs108|chr9 ( 699) 458 95.4 1.6e-19
CCDS55601.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 519) 431 90.3 4.1e-18
CCDS9037.1 KERA gene_id:11081|Hs108|chr12 ( 352) 425 89.1 6.4e-18
CCDS30976.1 FMOD gene_id:2331|Hs108|chr1 ( 376) 420 88.2 1.3e-17
CCDS54226.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 ( 510) 385 81.8 1.4e-15
CCDS12300.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 ( 512) 385 81.8 1.4e-15
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 385 82.0 2.3e-15
CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 642) 374 79.9 7e-15
CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 661) 374 79.9 7.1e-15
CCDS9042.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 ( 172) 363 77.4 1e-14
CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5 ( 516) 362 77.6 2.7e-14
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11 ( 640) 363 77.8 2.8e-14
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 362 77.8 4.4e-14
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 ( 713) 358 77.0 5.8e-14
CCDS9877.1 FLRT2 gene_id:23768|Hs108|chr14 ( 660) 356 76.6 7.1e-14
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 ( 653) 355 76.4 8e-14
CCDS1966.1 LRRTM1 gene_id:347730|Hs108|chr2 ( 522) 351 75.6 1.1e-13
CCDS47218.1 LRRC70 gene_id:100130733|Hs108|chr5 ( 622) 350 75.4 1.5e-13
CCDS7270.1 LRRTM3 gene_id:347731|Hs108|chr10 ( 581) 347 74.9 2e-13
CCDS8057.1 FLRT1 gene_id:23769|Hs108|chr11 ( 674) 345 74.5 2.9e-13
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 346 75.0 4.9e-13
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 346 75.0 4.9e-13
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 346 75.0 4.9e-13
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 334 72.6 1.5e-12
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 331 71.9 1.6e-12
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 331 71.9 1.7e-12
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 330 71.9 2.5e-12
CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 835) 327 71.3 3.5e-12
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 328 71.7 4.9e-12
CCDS54225.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 ( 421) 320 69.8 4.9e-12
CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20 ( 649) 318 69.6 9e-12
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 322 70.6 1.1e-11
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 322 70.6 1.1e-11
CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 ( 560) 299 66.0 9e-11
>>CCDS14721.1 BGN gene_id:633|Hs108|chrX (368 aa)
initn: 2498 init1: 2498 opt: 2498 Z-score: 2499.3 bits: 471.1 E(32554): 6.8e-133
Smith-Waterman score: 2498; 100.0% identity (100.0% similar) in 368 aa overlap (1-368:1-368)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MWPLWRLVSLLALSQALPFEQRGFWDFTLDDGPFMMNDEEASGADTSGVLDPDSVTPTYS
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CCDS14 MWPLWRLVSLLALSQALPFEQRGFWDFTLDDGPFMMNDEEASGADTSGVLDPDSVTPTYS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 AMCPFGCHCHLRVVQCSDLGLKSVPKEISPDTTLLDLQNNDISELRKDDFKGLQHLYALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AMCPFGCHCHLRVVQCSDLGLKSVPKEISPDTTLLDLQNNDISELRKDDFKGLQHLYALV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LVNNKISKIHEKAFSPLRKLQKLYISKNHLVEIPPNLPSSLVELRIHDNRIRKVPKGVFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVNNKISKIHEKAFSPLRKLQKLYISKNHLVEIPPNLPSSLVELRIHDNRIRKVPKGVFS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GLRNMNCIEMGGNPLENSGFEPGAFDGLKLNYLRISEAKLTGIPKDLPETLNELHLDHNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLRNMNCIEMGGNPLENSGFEPGAFDGLKLNYLRISEAKLTGIPKDLPETLNELHLDHNK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IQAIELEDLLRYSKLYRLGLGHNQIRMIENGSLSFLPTLRELHLDNNKLARVPSGLPDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IQAIELEDLLRYSKLYRLGLGHNQIRMIENGSLSFLPTLRELHLDNNKLARVPSGLPDLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLQVVYLHSNNITKVGVNDFCPMGFGVKRAYYNGISLFNNPVPYWEVQPATFRCVTDRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLQVVYLHSNNITKVGVNDFCPMGFGVKRAYYNGISLFNNPVPYWEVQPATFRCVTDRLA
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IQFGNYKK
::::::::
CCDS14 IQFGNYKK
>>CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 (359 aa)
initn: 707 init1: 642 opt: 1281 Z-score: 1287.5 bits: 246.8 E(32554): 2.2e-65
Smith-Waterman score: 1326; 55.8% identity (78.7% similar) in 362 aa overlap (7-367:7-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MWPLWRLVSLLALSQALPFEQRGFWDFTLDDGPFMMNDEEASGADTSGVLDPDSVTPTYS
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CCDS90 MKATIILLLLAQVSWAGPFQQRGLFDFMLED--------EASGIGPE-VPDDRDFEPSLG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 AMCPFGCHCHLRVVQCSDLGLKSVPKEISPDTTLLDLQNNDISELRKDDFKGLQHLYALV
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CCDS90 PVCPFRCQCHLRVVQCSDLGLDKVPKDLPPDTTLLDLQNNKITEIKDGDFKNLKNLHALI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LVNNKISKIHEKAFSPLRKLQKLYISKNHLVEIPPNLPSSLVELRIHDNRIRKVPKGVFS
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CCDS90 LVNNKISKVSPGAFTPLVKLERLYLSKNQLKELPEKMPKTLQELRAHENEITKVRKVTFN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB8 GLRNMNCIEMGGNPLENSGFEPGAFDGLK-LNYLRISEAKLTGIPKDLPETLNELHLDHN
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CCDS90 GLNQMIVIELGTNPLKSSGIENGAFQGMKKLSYIRIADTNITSIPQGLPPSLTELHLDGN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KIQAIELEDLLRYSKLYRLGLGHNQIRMIENGSLSFLPTLRELHLDNNKLARVPSGLPDL
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CCDS90 KISRVDAASLKGLNNLAKLGLSFNSISAVDNGSLANTPHLRELHLDNNKLTRVPGGLAEH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 KLLQVVYLHSNNITKVGVNDFCPMGFGVKRAYYNGISLFNNPVPYWEVQPATFRCVTDRL
: .::::::.:::. :: .:::: : ..:.: :.:.:::.::: :::.::.::::: :
CCDS90 KYIQVVYLHNNNISVVGSSDFCPPGHNTKKASYSGVSLFSNPVQYWEIQPSTFRCVYVRS
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB8 AIQFGNYKK
:::.::::
CCDS90 AIQLGNYK
>>CCDS9040.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 (250 aa)
initn: 876 init1: 631 opt: 718 Z-score: 729.0 bits: 143.0 E(32554): 2.7e-34
Smith-Waterman score: 718; 56.6% identity (82.0% similar) in 189 aa overlap (182-367:62-250)
160 170 180 190 200
pF1KB8 EIPPNLPSSLVELRIHDNRIRKVPKGVFSGLRNMNC--IEMGGNPLENSGFEPGAFDGLK
:: ..: .:.: :::..::.: :::.:.:
CCDS90 EASGIGPEVPDDRDFEPSLGPVCPFRCQCHLRVVQCSDLELGTNPLKSSGIENGAFQGMK
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 -LNYLRISEAKLTGIPKDLPETLNELHLDHNKIQAIELEDLLRYSKLYRLGLGHNQIRMI
:.:.::.....:.::. :: .:.::::: :::. .. .: ..: .:::. :.: .
CCDS90 KLSYIRIADTNITSIPQGLPPSLTELHLDGNKISRVDAASLKGLNNLAKLGLSFNSISAV
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 ENGSLSFLPTLRELHLDNNKLARVPSGLPDLKLLQVVYLHSNNITKVGVNDFCPMGFGVK
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CCDS90 DNGSLANTPHLRELHLDNNKLTRVPGGLAEHKYIQVVYLHNNNISVVGSSDFCPPGHNTK
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360
pF1KB8 RAYYNGISLFNNPVPYWEVQPATFRCVTDRLAIQFGNYKK
.: :.:.:::.::: :::.::.::::: : :::.::::
CCDS90 KASYSGVSLFSNPVQYWEIQPSTFRCVYVRSAIQLGNYK
220 230 240 250
>>CCDS9041.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 (212 aa)
initn: 631 init1: 571 opt: 581 Z-score: 593.6 bits: 117.7 E(32554): 9.6e-27
Smith-Waterman score: 581; 48.2% identity (72.3% similar) in 195 aa overlap (176-367:22-212)
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 SKNHLVEIPPNLPSSLVELRIHDNRIRKVPKGVFSGLRNMNCIEMGGNPLENSGFEP--G
.:.:. . . . .: . .. ::: :
CCDS90 MKATIILLLLAQVSWAGPFQQRGLFDFMLEDEASGIGPEVPDDRDFEPSLG
10 20 30 40 50
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 AFDGLKLN-YLRISEAKLTGIPKDLPETLNELHLDHNKIQAIELEDLLRYSKLYRLGLGH
.. . .::. . . : :: .:.::::: :::. .. .: ..: .:::.
CCDS90 PVCPFRCQCHLRVVQCSDLG----LPPSLTELHLDGNKISRVDAASLKGLNNLAKLGLSF
60 70 80 90 100
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 NQIRMIENGSLSFLPTLRELHLDNNKLARVPSGLPDLKLLQVVYLHSNNITKVGVNDFCP
:.: ..::::. : :::::::::::.:::.:: . : .::::::.:::. :: .::::
CCDS90 NSISAVDNGSLANTPHLRELHLDNNKLTRVPGGLAEHKYIQVVYLHNNNISVVGSSDFCP
110 120 130 140 150 160
330 340 350 360
pF1KB8 MGFGVKRAYYNGISLFNNPVPYWEVQPATFRCVTDRLAIQFGNYKK
: ..:.: :.:.:::.::: :::.::.::::: : :::.::::
CCDS90 PGHNTKKASYSGVSLFSNPVQYWEIQPSTFRCVYVRSAIQLGNYK
170 180 190 200 210
>>CCDS1438.1 PRELP gene_id:5549|Hs108|chr1 (382 aa)
initn: 305 init1: 269 opt: 478 Z-score: 487.4 bits: 98.9 E(32554): 7.9e-21
Smith-Waterman score: 478; 33.2% identity (61.4% similar) in 295 aa overlap (34-322:46-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 LWRLVSLLALSQALPFEQRGFWDFTLDDGPFMMNDEEASGADTSGVLDPDSVTPTYSAMC
: . :: : .: : : :. :
CCDS14 SVAQGQPTRRPRPGTGPGRRPRPRPRPTPSFPQPDEPAEPTDLPPPLPPG--PPSIFPDC
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PFGCHC---HLRVVQCSDLGLKSVPKEISPDTTLLDLQNNDISELRKDDFKGLQHLYALV
: :.: .. :.. .:..:: : : : :::: :.:: ..:.. : .
CCDS14 PRECYCPPDFPSALYCDSRNLRKVPV-IPPRIHYLYLQNNFITELPVESFQNATGLRWIN
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LVNNKISKIHEKAFSPLRKLQKLYISKNHLVEIPPNLPSSLVELRIHDNRIRKVPKGVFS
: ::.: :: .... : : ::. ::.: :.: :: .: .::. .:.: ..: ::::
CCDS14 LDNNRIRKIDQRVLEKLPGLVFLYMEKNQLEEVPSALPRNLEQLRLSQNHISRIPPGVFS
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230
pF1KB8 GLRNMNCIEMGGNPLENSGFEPGAFDGLK-LNYLRISEAKLTGIPKDLPETLNELHLDHN
:.:. ... : : .. :.: .: ::: : : ... : .: .: ....:.:: :
CCDS14 KLENLLLLDLQHNRLSDGVFKPDTFHGLKNLMQLNLAHNILRKMPPRVPTAIHQLYLDSN
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KIQAIELEDLLRYSKLYRLGLGHNQI--RMIENGSLSFLPTLRELHLDNNKLARVPSGLP
::..: . . .: . :..:.. : . ..:.. . .: :::..:... ::.
CCDS14 KIETIPNGYFKSFPNLAFIRLNYNKLTDRGLPKNSFN-ISNLLVLHLSHNRISSVPAINN
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DLKLLQVVYLHSNNITKVGVNDFCPMGFGVKRAYYNGISLFNNPVPYWEVQPATFRCVTD
:. : ::..:.: :.. ...::
CCDS14 RLEHL---YLNNNSIEKINGTQICPNDLVAFHDFSSDLENVPHLRYLRLDGNYLKPPIPL
320 330 340 350 360
>>CCDS56578.1 ECM2 gene_id:1842|Hs108|chr9 (643 aa)
initn: 404 init1: 190 opt: 458 Z-score: 464.3 bits: 95.3 E(32554): 1.5e-19
Smith-Waterman score: 458; 33.0% identity (63.5% similar) in 285 aa overlap (52-331:283-565)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 RGFWDFTLDDGPFMMNDEEASGADTSGVLDPDSVTPTYSAMCPFGCHCHLRVVQCSDLGL
: . : . : :: :...: . :
CCDS56 EEEEGEEGEEDEEDEEDPVRGDMFRMPSRSPLPAPPRGTLRLPSGCSLSYRTISCINAML
260 270 280 290 300 310
90 100 110 120 130
pF1KB8 KSVPKEISPDTTLLDLQNNDISELRKDDFKGLQHLYALVLVNNKI--SKIHEKAFSPLRK
..: .:. : :.: .:.:. . . :.:: .: : : .:.: : : :::. :.:
CCDS56 TQIPPLTAPQITSLELTGNSIASIPDEAFNGLPNLERLDLSKNNITSSGIGPKAFKLLKK
320 330 340 350 360 370
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 LQKLYISKNHLVEIPPNLPSSLVELRIHDNRIRKVPKGVFSGLRNMNCIEMGGNPLENSG
:..: .. :.:..:: .:::.: ::....: .. . . .: : .. .:. :: : ...
CCDS56 LMRLNMDGNNLIQIPSQLPSTLEELKVNENNLQAIDEESLSDLNQLVTLELEGNNLSEAN
380 390 400 410 420 430
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 FEPGAFDGLK-LNYLRISEAKLTGIPKDLPETLNELHLDHNKIQAIELEDLLRYSKLYRL
.: :: :: : :::... :. ::. :: ...::.:..:.:. : . . :. .
CCDS56 VNPLAFKPLKSLAYLRLGKNKFRIIPQGLPGSIEELYLENNQIEEITEICFNHTRKINVI
440 450 460 470 480 490
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 GLGHNQIRMIENGSLSFL--PTLRELHLDNNKLARVPSGLPDLKLLQVVYLHSNNITKVG
: .:.:. . . :... .:. . :. ::: .::: :: .::..: : .:.: ..
CCDS56 VLRYNKIEENRIAPLAWINQENLESIDLSYNKLYHVPSYLPK-SLLHLVLL-GNQIERIP
500 510 520 530 540 550
320 330 340 350 360
pF1KB8 VNDFCPMGFGVKRAYYNGISLFNNPVPYWEVQPATFRCVTDRLAIQFGNYKK
: : :.. :
CCDS56 GYVFGHMEPGLEYLYLSFNKLADDGMDRVSFYGAYHSLRELFLDHNDLKSIPPGIQEMKA
560 570 580 590 600 610
>>CCDS6698.1 ECM2 gene_id:1842|Hs108|chr9 (699 aa)
initn: 406 init1: 190 opt: 458 Z-score: 463.8 bits: 95.4 E(32554): 1.6e-19
Smith-Waterman score: 458; 33.0% identity (63.5% similar) in 285 aa overlap (52-331:305-587)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 RGFWDFTLDDGPFMMNDEEASGADTSGVLDPDSVTPTYSAMCPFGCHCHLRVVQCSDLGL
: . : . : :: :...: . :
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pF1KB8 KSVPKEISPDTTLLDLQNNDISELRKDDFKGLQHLYALVLVNNKI--SKIHEKAFSPLRK
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CCDS66 TQIPPLTAPQITSLELTGNSIASIPDEAFNGLPNLERLDLSKNNITSSGIGPKAFKLLKK
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pF1KB8 LQKLYISKNHLVEIPPNLPSSLVELRIHDNRIRKVPKGVFSGLRNMNCIEMGGNPLENSG
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CCDS66 LMRLNMDGNNLIQIPSQLPSTLEELKVNENNLQAIDEESLSDLNQLVTLELEGNNLSEAN
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pF1KB8 FEPGAFDGLK-LNYLRISEAKLTGIPKDLPETLNELHLDHNKIQAIELEDLLRYSKLYRL
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CCDS66 VNPLAFKPLKSLAYLRLGKNKFRIIPQGLPGSIEELYLENNQIEEITEICFNHTRKINVI
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pF1KB8 GLGHNQIRMIENGSLSFL--PTLRELHLDNNKLARVPSGLPDLKLLQVVYLHSNNITKVG
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CCDS66 VLRYNKIEENRIAPLAWINQENLESIDLSYNKLYHVPSYLPK-SLLHLVLL-GNQIERIP
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: : :.. :
CCDS66 GYVFGHMEPGLEYLYLSFNKLADDGMDRVSFYGAYHSLRELFLDHNDLKSIPPGIQEMKA
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: .. :: :. :: .:. :
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60 70 80 90 100 110
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120 130 140 150 160 170
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CCDS55 ELYLQNNYLTDEGLDNETFWKLSSLEYLDLSSNNLSRVPAGLPRSLVLLHLEKNAIRSVD
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pF1KB8 KGVFSGLRNMNCIEMGGNPLENSGFEPGAFDGLK-LNYLRISEAKLTGIPKDLPETLNEL
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CCDS55 ANVLTPIRSLEYLLLHSNQLREQGIHPLAFQGLKRLHTVHLYNNALERVPSGLPRRVRTL
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240 250 260 270 280 290
pF1KB8 HLDHNKIQAIELEDLLRYSKLYRLGLGHNQIR--MIENGSLSFLPTLRELHLDNNKLARV
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CCDS55 MILHNQITGIGREDFATTYFLEELNLSYNRITSPQVHRDAFRKLRLLRSLDLSGNRLHTL
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300 310 320 330 340 350
pF1KB8 PSGLP-DLKLLQVVYLHSNNITKVGVNDFCPMGFGVKRAYYNGISLFNNPVPYWEVQPAT
: ::: ....:.:
CCDS55 PPGLPRNVHVLKVKRNELAALARGALVGMAQLRELYLTSNRLRSRALGPRAWVDLAHLQL
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pF1KB8 CSDLGLKSVPKEISPDTTLLDLQNNDISELRKDDFKGLQHLYALVLVNNKISK--IHEKA
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CCDS90 CENRGLKEIPA-IPSRIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGA
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CCDS90 LSQLKKLLFLFLEDNELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNN
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pF1KB8 PLENSGFEPGAFDGLKLNYLRISEAK--LTGIPKDLPETLNELHLDHNKIQAIELEDLLR
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CCDS90 KLVDNAFQRDTFKGLK-NLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNV
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:. : :.::.. : .: . .. .:.:..:.:..:: : : ..: :
CCDS90 IPKVAFLRLNHNKLSDEGLPSRGFDVSSILDLQLSHNQLTKVPRISAHL---QHLHLDHN
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CCDS90 KIKSVNVSVICPSPSMLPAERDSFSYGPHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
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CCDS30 MQWTSLLLLAGLFSLSQA-QYEDDPHWWFHYLRSQQSTYYDPYDPYPYETYEPYPYGVDE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]