Result of FASTA (ccds) for pFN21AB8152
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8152, 206 aa
  1>>>pF1KB8152 206 - 206 aa - 206 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0402+/-0.000964; mu= 10.1396+/- 0.058
 mean_var=87.1755+/-17.207, 0's: 0 Z-trim(106.4): 202  B-trim: 264 in 1/50
 Lambda= 0.137365
 statistics sampled from 8764 (8987) to 8764 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.276), width:  16
 Scan time:  1.370

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5460.1 RALA gene_id:5898|Hs108|chr7            ( 206) 1328 272.9   1e-73
CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2            ( 206) 1098 227.3 5.3e-60
CCDS8702.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12           ( 188)  652 138.9   2e-33
CCDS8703.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12           ( 189)  616 131.7 2.8e-31
CCDS7698.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11           ( 189)  609 130.3 7.3e-31
CCDS877.1 NRAS gene_id:4893|Hs108|chr1             ( 189)  609 130.3 7.3e-31
CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1            ( 184)  595 127.6 4.9e-30
CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11         ( 204)  588 126.2 1.4e-29
CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12          ( 184)  585 125.6 1.9e-29
CCDS7699.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11           ( 170)  554 119.4 1.3e-27
CCDS3100.1 MRAS gene_id:22808|Hs108|chr3           ( 208)  551 118.9 2.3e-27
CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18          ( 217)  547 118.1 4.1e-27
CCDS12774.1 RRAS gene_id:6237|Hs108|chr19          ( 218)  541 116.9 9.4e-27
CCDS1123.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1            ( 219)  539 116.5 1.2e-26
CCDS58037.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1           ( 236)  539 116.5 1.3e-26
CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3           ( 183)  533 115.3 2.4e-26
CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13          ( 183)  527 114.1 5.6e-26
CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX         ( 183)  521 112.9 1.3e-25
CCDS53603.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11        ( 169)  488 106.3 1.1e-23
CCDS58036.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1           ( 183)  464 101.6 3.2e-22
CCDS8673.1 RERG gene_id:85004|Hs108|chr12          ( 199)  443 97.5 6.1e-21
CCDS62431.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18          ( 153)  422 93.2 8.8e-20
CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19      ( 198)  390 87.0 8.9e-18
CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9         ( 199)  390 87.0 8.9e-18
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2          ( 205)  388 86.6 1.2e-17
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11        ( 201)  387 86.4 1.4e-17
CCDS6261.1 GEM gene_id:2669|Hs108|chr8             ( 296)  387 86.5 1.9e-17
CCDS5927.1 RHEB gene_id:6009|Hs108|chr7            ( 184)  382 85.4 2.5e-17
CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15        ( 207)  381 85.2 3.2e-17
CCDS58253.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12         ( 165)  374 83.7 6.9e-17
CCDS10824.1 RRAD gene_id:6236|Hs108|chr16          ( 308)  374 83.9 1.2e-16
CCDS58254.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12         ( 142)  364 81.7 2.4e-16
CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19         ( 207)  366 82.2 2.5e-16
CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3          ( 208)  366 82.2 2.5e-16
CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 216)  365 82.0   3e-16
CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3           ( 215)  363 81.6 3.9e-16
CCDS13181.1 REM1 gene_id:28954|Hs108|chr20         ( 298)  364 81.9 4.4e-16
CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5         ( 227)  362 81.4 4.6e-16
CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8           ( 212)  360 81.0 5.8e-16
CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 216)  360 81.0 5.9e-16
CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  359 80.8 6.5e-16
CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 249)  360 81.1 6.6e-16
CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14         ( 216)  358 80.6 7.7e-16
CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  356 80.2 9.8e-16
CCDS8778.1 RHEBL1 gene_id:121268|Hs108|chr12       ( 183)  355 80.0   1e-15
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1           ( 203)  355 80.0 1.1e-15
CCDS35246.1 ERAS gene_id:3266|Hs108|chrX           ( 233)  354 79.9 1.4e-15
CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12          ( 215)  351 79.2   2e-15
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12        ( 201)  348 78.6 2.9e-15
CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19        ( 218)  348 78.7 3.1e-15


>>CCDS5460.1 RALA gene_id:5898|Hs108|chr7                 (206 aa)
 initn: 1328 init1: 1328 opt: 1328  Z-score: 1437.0  bits: 272.9 E(32554): 1e-73
Smith-Waterman score: 1328; 100.0% identity (100.0% similar) in 206 aa overlap (1-206:1-206)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 PFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKM
              130       140       150       160       170       180

              190       200      
pF1KB8 EDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
              190       200      

>>CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2                 (206 aa)
 initn: 1038 init1: 703 opt: 1098  Z-score: 1190.7  bits: 227.3 E(32554): 5.3e-60
Smith-Waterman score: 1098; 82.1% identity (95.2% similar) in 207 aa overlap (1-206:1-206)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
       ::::: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MAANKSKGQSSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB8 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVK-EDEN
       :::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :::.:::.::::::::: :...
CCDS21 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLLVFSITEHESFTATAEFREQILRVKAEEDK
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 VPFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARK
       .:.:.::::::::..::: ::::...::.:.:.::::::::::::::::::::::::..:
CCDS21 IPLLVVGNKSDLEERRQVPVEEARSKAEEWGVQYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRTKK
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200      
pF1KB8 MEDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
       : ..:.:::::. :.  : ..::::.:
CCDS21 MSENKDKNGKKSSKN-KKSFKERCCLL
              190        200      

>>CCDS8702.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12                (188 aa)
 initn: 682 init1: 497 opt: 652  Z-score: 713.6  bits: 138.9 E(32554): 2e-33
Smith-Waterman score: 652; 51.6% identity (82.3% similar) in 192 aa overlap (15-206:4-188)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
                     .:...::.:::::::::.:.. ..::..:.::  :::::.::.:::
CCDS87            MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGE
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENV
          .:::::::::.:.:.::.:.:.::::::::.:.. .::     .:::: :::..:.:
CCDS87 TCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHHYREQIKRVKDSEDV
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 PFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKM
       :..::::: :: . : :....:.. :..... ..::::::: .:: .:. :.::::  : 
CCDS87 PMVLVGNKCDLPS-RTVDTKQAQDLARSYGIPFIETSAKTRQGVDDAFYTLVREIR--KH
     110       120        130       140       150       160        

              190       200      
pF1KB8 EDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
       ...  :.::::.:    . . .: :.
CCDS87 KEKMSKDGKKKKK----KSKTKCVIM
        170           180        

>>CCDS8703.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12                (189 aa)
 initn: 573 init1: 497 opt: 616  Z-score: 675.0  bits: 131.7 E(32554): 2.8e-31
Smith-Waterman score: 616; 49.0% identity (80.7% similar) in 192 aa overlap (15-206:4-189)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
                     .:...::.:::::::::.:.. ..::..:.::  :::::.::.:::
CCDS87            MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGE
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENV
          .:::::::::.:.:.::.:.:.::::::::.:.. .::     .:::: :::..:.:
CCDS87 TCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHHYREQIKRVKDSEDV
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 PFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKM
       :..::::: :: . : :....:.. :..... ..:::::::  :. .:. :.::::  ..
CCDS87 PMVLVGNKCDLPS-RTVDTKQAQDLARSYGIPFIETSAKTRQRVEDAFYTLVREIRQYRL
     110       120        130       140       150       160        

              190       200      
pF1KB8 EDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
       .    : .:...     .:. .: :.
CCDS87 K----KISKEEKTPGCVKIK-KCIIM
          170       180          

>>CCDS7698.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11                (189 aa)
 initn: 572 init1: 492 opt: 609  Z-score: 667.5  bits: 130.3 E(32554): 7.3e-31
Smith-Waterman score: 609; 54.2% identity (84.9% similar) in 166 aa overlap (15-180:4-168)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
                     .:...::.:::::::::.:.. ..::..:.::  :::::.::.:::
CCDS76            MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGE
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENV
          .:::::::::.:.:.::.:.:.::::::::.:.. .::    ..:::: :::....:
CCDS76 TCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHQYREQIKRVKDSDDV
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 PFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKM
       :..::::: ::   : :  ..:.. :..... :.::::::: .:. .:. :.:::: .:.
CCDS76 PMVLVGNKCDLA-ARTVESRQAQDLARSYGIPYIETSAKTRQGVEDAFYTLVREIRQHKL
     110       120        130       140       150       160        

              190       200      
pF1KB8 EDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
                                 
CCDS76 RKLNPPDESGPGCMSCKCVLS     
      170       180              

>>CCDS877.1 NRAS gene_id:4893|Hs108|chr1                  (189 aa)
 initn: 579 init1: 481 opt: 609  Z-score: 667.5  bits: 130.3 E(32554): 7.3e-31
Smith-Waterman score: 609; 53.9% identity (85.6% similar) in 167 aa overlap (15-181:4-169)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
                     .:...::.:::::::::.:.. ..::..:.::  :::::.::.:::
CCDS87            MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGE
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENV
          .:::::::::.:.:.::.:.:.::::::::.:.. .:::    .:::: :::....:
CCDS87 TCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNSKSFADINLYREQIKRVKDSDDV
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 PFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKM
       :..::::: ::   : :....:.. :..... ..::::::: .:. .:. :.::::  .:
CCDS87 PMVLVGNKCDLPT-RTVDTKQAHELAKSYGIPFIETSAKTRQGVEDAFYTLVREIRQYRM
     110       120        130       140       150       160        

              190       200      
pF1KB8 EDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
       .                         
CCDS87 KKLNSSDDGTQGCMGLPCVVM     
      170       180              

>>CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1                 (184 aa)
 initn: 561 init1: 496 opt: 595  Z-score: 652.7  bits: 127.6 E(32554): 4.9e-30
Smith-Waterman score: 595; 52.0% identity (79.7% similar) in 177 aa overlap (15-190:4-179)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
                     .:....:::::::::::.::.   ::: :.::  :::::.: .: .
CCDS84            MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDCQ
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENV
       . ...:::::: :...:.:: :...:.::  :.::: . .:    :.::::::::. :.:
CCDS84 QCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTEDV
      50        60        70        80        90       100         

              130       140        150       160       170         
pF1KB8 PFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQW-NVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARK
       :..::::: ::::.: :. :...: :.:: :  ..:.:::.. ::...:.::.:.:  ::
CCDS84 PMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQIN-RK
     110       120       130       140       150       160         

     180       190       200      
pF1KB8 MEDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
           :.:  ::                
CCDS84 TPVEKKKPKKKSCLLL           
      170       180               

>>CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11              (204 aa)
 initn: 581 init1: 581 opt: 588  Z-score: 644.5  bits: 126.2 E(32554): 1.4e-29
Smith-Waterman score: 588; 47.4% identity (77.0% similar) in 196 aa overlap (1-193:1-196)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
       :::   .  ..   .....::.:::::::::.::. . :: ::.::  ::: :. :.: .
CCDS78 MAAAGWRDGSGQEKYRLVVVGGGGVGKSALTIQFIQSYFVTDYDPTIEDSYTKQCVIDDR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENV
        ...:::::::::...:.:..:.:.::::: :::.:.  ::     :..::::::. .. 
CCDS78 AARLDILDTAGQEEFGAMREQYMRTGEGFLLVFSVTDRGSFEEIYKFQRQILRVKDRDEF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 PFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKM
       :..:.:::.::. .:::. ::... :.: .:.:.:.::: : :::..: .:.: ::  . 
CCDS78 PMILIGNKADLDHQRQVTQEEGQQLARQLKVTYMEASAKIRMNVDQAFHELVRVIRKFQE
              130       140       150       160       170       180

                 190       200      
pF1KB8 ED---SKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
       ..   : : . :.: :             
CCDS78 QECPPSPEPTRKEKDKKGCHCVIF     
              190       200         

>>CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12               (184 aa)
 initn: 583 init1: 502 opt: 585  Z-score: 642.0  bits: 125.6 E(32554): 1.9e-29
Smith-Waterman score: 585; 50.3% identity (79.0% similar) in 181 aa overlap (15-194:4-179)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
                     .:....:::::::::::.::.   ::: :.::  :::::.: .:..
CCDS89            MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDSYRKQVEVDAQ
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENV
       . ...:::::: :...:.:: :...:.::  :.::: . .:    :.::::::::. ..:
CCDS89 QCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQILRVKDTDDV
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150        160       170         
pF1KB8 PFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWN-VNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARK
       :..::::: ::::.: :. :...: :.:::   ..:.:::.. ::...:.::.:.:  ::
CCDS89 PMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSAKSKINVNEIFYDLVRQIN-RK
     110       120       130       140       150       160         

     180       190       200      
pF1KB8 MEDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
               :: ..::            
CCDS89 TPVP----GKARKKSSCQLL       
      170           180           

>>CCDS7699.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11                (170 aa)
 initn: 554 init1: 492 opt: 554  Z-score: 609.3  bits: 119.4 E(32554): 1.3e-27
Smith-Waterman score: 554; 55.8% identity (85.7% similar) in 147 aa overlap (15-161:4-149)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAANKPKGQNSLALHKVIMVGSGGVGKSALTLQFMYDEFVEDYEPTKADSYRKKVVLDGE
                     .:...::.:::::::::.:.. ..::..:.::  :::::.::.:::
CCDS76            MTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGE
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 EVQIDILDTAGQEDYAAIRDNYFRSGEGFLCVFSITEMESFAATADFREQILRVKEDENV
          .:::::::::.:.:.::.:.:.::::::::.:.. .::    ..:::: :::....:
CCDS76 TCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHQYREQIKRVKDSDDV
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 PFLLVGNKSDLEDKRQVSVEEAKNRAEQWNVNYVETSAKTRANVDKVFFDLMREIRARKM
       :..::::: ::   : :  ..:.. :..... :.:::::::                   
CCDS76 PMVLVGNKCDLA-ARTVESRQAQDLARSYGIPYIETSAKTRQGSRSGSSSSSGTLWDPPG
     110       120        130       140       150       160        

              190       200      
pF1KB8 EDSKEKNGKKKRKSLAKRIRERCCIL
                                 
CCDS76 PM                        
      170                        




206 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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