Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7289
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7289, 988 aa
1>>>pF1KB7289 988 - 988 aa - 988 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9288+/-0.000369; mu= 5.1319+/- 0.023
mean_var=176.4912+/-35.968, 0's: 0 Z-trim(119.3): 42 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.096541
statistics sampled from 33055 (33097) to 33055 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.388), width: 16
Scan time: 14.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000074 (OMIM: 118425,160800,255700) chloride ch ( 988) 6625 935.5 0
XP_016867229 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 838) 4679 664.5 6.7e-190
XP_016867228 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 846) 4646 659.9 1.6e-188
XP_011514084 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 570) 3777 538.8 3.2e-152
NP_004357 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ch ( 898) 2942 422.5 4.8e-117
NP_001164559 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 854) 2773 399.0 5.6e-110
XP_011510703 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 835) 2704 389.4 4.3e-107
NP_001164560 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 869) 2704 389.4 4.4e-107
XP_006713552 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 863) 2550 367.9 1.3e-100
NP_001164558 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 881) 1727 253.3 4.1e-66
XP_006713553 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 512) 1496 221.0 1.2e-56
NP_001244068 (OMIM: 602024,613090) chloride channe ( 644) 1316 196.0 5.4e-49
NP_004061 (OMIM: 602024,613090) chloride channel p ( 687) 1316 196.0 5.7e-49
NP_001036169 (OMIM: 602024,613090) chloride channe ( 686) 1315 195.9 6.2e-49
NP_000076 (OMIM: 602023,607364,613090) chloride ch ( 687) 1291 192.5 6.3e-48
NP_001159417 (OMIM: 602023,607364,613090) chloride ( 517) 1164 174.8 1e-42
NP_000075 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31046 ( 746) 705 110.9 2.5e-23
NP_001269092 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 766) 705 110.9 2.6e-23
NP_001121370 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 816) 705 111.0 2.7e-23
NP_001121371 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 816) 705 111.0 2.7e-23
XP_016884747 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 820) 705 111.0 2.7e-23
XP_016884746 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 820) 705 111.0 2.7e-23
NP_001243873 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exch ( 666) 702 110.5 3.1e-23
NP_001821 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exchang ( 760) 702 110.5 3.4e-23
NP_001230303 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 791) 675 106.8 4.8e-22
NP_001820 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange trans ( 818) 675 106.8 4.9e-22
XP_011529888 (OMIM: 600580) PREDICTED: H(+)/Cl(-) ( 831) 675 106.8 5e-22
XP_005262783 (OMIM: 600580) PREDICTED: H(+)/Cl(-) ( 839) 675 106.8 5.1e-22
NP_776297 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange trans ( 866) 675 106.8 5.2e-22
NP_001107803 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl( ( 781) 389 66.9 4.7e-10
XP_011520656 (OMIM: 166600,602727,611490) PREDICTE ( 747) 369 64.1 3.1e-09
NP_001278 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl(-) ( 805) 369 64.2 3.3e-09
NP_001277 (OMIM: 602726) chloride transport protei ( 869) 339 60.0 6.4e-08
NP_001243888 (OMIM: 602726) chloride transport pro ( 847) 317 56.9 5.2e-07
NP_001230301 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 791) 230 44.8 0.0022
>>NP_000074 (OMIM: 118425,160800,255700) chloride channe (988 aa)
initn: 6625 init1: 6625 opt: 6625 Z-score: 4994.0 bits: 935.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6625; 99.9% identity (99.9% similar) in 988 aa overlap (1-988:1-988)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEQSRSQQRGGEQSWWGSDPQYQYMPFEHCTSYGLPSENGGLQHRLRKDAGPRHNVHPTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MEQSRSQQRGGEQSWWGSDPQYQYMPFEHCTSYGLPSENGGLQHRLRKDAGPRHNVHPTQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IYGHHKEQFSDREQDIGMPKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQDCIHRLGQVVRRKLGEDGIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
NP_000 IYGHHKEQFSDREQDIGMPKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQDCIHRLGQVVRRKLGEDWIF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LVLLGLLMALVSWSMDYVSAKSLQAYKWSYAQMQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LVLLGLLMALVSWSMDYVSAKSLQAYKWSYAQMQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LISPQAVGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LISPQAVGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ICAAVLSKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ICAAVLSKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGICCGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGICCGL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGELMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGELMP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 REAISTLFDNNTWVKHAGDPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 REAISTLFDNNTWVKHAGDPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 CGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 STAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 STAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 YTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQAL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 LQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDEDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDEDLS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 GKSELPPSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLGRAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GKSELPPSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLGRAR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 PTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 FSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 PSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELELVESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELELVESP
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KB7 GLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
970 980
>>XP_016867229 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTED: c (838 aa)
initn: 4672 init1: 4672 opt: 4679 Z-score: 3530.3 bits: 664.5 E(85289): 6.7e-190
Smith-Waterman score: 4679; 98.3% identity (98.3% similar) in 721 aa overlap (270-988:118-838)
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SICAAVLSKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLG--GVLFSIEVTSTYF
:: : : : :::::::::::::
XP_016 GCWLWNPRNEDNTSWGCPEGIPHNESLCGQGCRPDCGPGQWHPRGERGVLFSIEVTSTYF
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 AVRNYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVRNYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGIC
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 CGLLGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGLLGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGE
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LMPREAISTLFDNNTWVKHAGDPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LMPREAISTLFDNNTWVKHAGDPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTM
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 PIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVS
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 HTVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HTVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQ
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 LSKYTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSKYTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSEL
450 460 470 480 490 500
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pF1KB7 QALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDE
510 520 530 540 550 560
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pF1KB7 DLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLG
570 580 590 600 610 620
780 790 800 810 820 830
pF1KB7 RARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHKT
630 640 650 660 670 680
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 HTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKST
690 700 710 720 730 740
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 GAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELELV
750 760 770 780 790 800
960 970 980
pF1KB7 ESPGLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESPGLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
810 820 830
>>XP_016867228 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTED: c (846 aa)
initn: 3782 init1: 3782 opt: 4646 Z-score: 3505.4 bits: 659.9 E(85289): 1.6e-188
Smith-Waterman score: 4653; 97.3% identity (97.3% similar) in 729 aa overlap (270-988:118-846)
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SICAAVLSKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLG--GVLFSIEVTSTYF
:: : : : :::::::::::::
XP_016 GCWLWNPRNEDNTSWGCPEGIPHNESLCGQGCRPDCGPGQWHPRGERGVLFSIEVTSTYF
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 AVRNYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVRNYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGIC
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 CGLLGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGLLGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGE
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460
pF1KB7 --------LMPREAISTLFDNNTWVKHAGDPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSCWWGHMLMPREAISTLFDNNTWVKHAGDPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFW
270 280 290 300 310 320
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 MSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGA
330 340 350 360 370 380
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 AALTGAVSHTVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AALTGAVSHTVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPY
390 400 410 420 430 440
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 LPDLGWNQLSKYTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPDLGWNQLSKYTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILL
450 460 470 480 490 500
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 GSVERSELQALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSVERSELQALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFA
510 520 530 540 550 560
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 FVDEDEDEDLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FVDEDEDEDLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQ
570 580 590 600 610 620
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 SLLHCLLGRARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLLHCLLGRARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLV
630 640 650 660 670 680
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 EQTTLHKTHTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EQTTLHKTHTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGHTKSGVQLRPPLASFRN
690 700 710 720 730 740
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 TTSTRKSTGAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTSTRKSTGAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEG
750 760 770 780 790 800
950 960 970 980
pF1KB7 ELEELELVESPGLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELEELELVESPGLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
810 820 830 840
>>XP_011514084 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTED: c (570 aa)
initn: 3777 init1: 3777 opt: 3777 Z-score: 2853.9 bits: 538.8 E(85289): 3.2e-152
Smith-Waterman score: 3777; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (419-988:1-570)
390 400 410 420 430 440
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::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPREAISTLFDNNTWVKHAGDPESLGQSAV
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pF1KB7 WIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPD
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510 520 530 540 550 560
pF1KB7 GILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSKYTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDG
220 230 240 250 260 270
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDEDLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEEPNGPL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGHKQQPEAPEPAGQRPSIFQSLLHCLLGRARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQE
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pF1KB7 QLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHKTHTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQK
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pF1KB7 AIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AIEGHTKSGVQLRPPLASFRNTTSTRKSTGAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPE
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pF1KB7 TPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELELVESPGLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELELVESPGLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
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>>NP_004357 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride channe (898 aa)
initn: 2883 init1: 1513 opt: 2942 Z-score: 2222.3 bits: 422.5 E(85289): 4.8e-117
Smith-Waterman score: 2942; 55.9% identity (77.8% similar) in 835 aa overlap (97-920:70-888)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EQFSDREQDIGMPKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQDCIHRLGQVVRRKLGEDGIFLVLLGL
..:. : : . . ..::: ::::::::
NP_004 RIRLGGPEPWKGPPSSRAAPELLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGL
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pF1KB7 LMALVSWSMDYVSAKSLQAYKWSYAQMQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCHLISPQA
::::::: :::. : ::: .: .. :. ::.:.:::.:.::: ::: : ....:::
NP_004 LMALVSWVMDYAIAACLQAQQWMSRGLNTSILLQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQA
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pF1KB7 VGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIASICAAVL
::::::::::::::::::::::.:.:.:::..:: .::::.:.:::::::::::.:::.:
NP_004 VGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALL
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pF1KB7 SKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVRNYWRGF
:::.:.: :.::. ...:...:::::::::..:.::::::::::::.::::::::::
NP_004 SKFLSLFGGIYENESRNTEMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGF
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 FAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGICCGLLGAVFV
::::::::.::::::::.: ::::::.: ::.::::::.::::::.::: :. ::.::
NP_004 FAATFSAFIFRVLAVWNRDEETITALFKTRFRLDFPFDLQELPAFAVIGIASGFGGALFV
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 YLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGELMPREAIST
::.:... .::.:....:: ..:::.:..::..:...:::::.::::::.: .:.. :
NP_004 YLNRKIVQVMRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQKETLVT
340 350 360 370 380 390
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pF1KB7 LFDNNTWVKHAG----DPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIPCG
:::: :::... .: : .:. : ::.:: . . .:..:::::: .:::.:.:::
NP_004 LFDNRTWVRQGLVEELEPPSTSQA--WNPPRANVFLTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCG
400 410 420 430 440 450
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pF1KB7 GFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTVST
.::::::.:::::::::: :: ::::: :. :.:.::::::.:::::.:::.:::::
NP_004 AFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTYRIVPGGYAVVGAAALAGAVTHTVST
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pF1KB7 AVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSKYT
::: ::::::::::::.:.:::::: ::::::::::::::..:::::::.:::.. ..:
NP_004 AVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRIKKLPYLPELGWGRHQQYR
520 530 540 550 560 570
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pF1KB7 IFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQ
. ::::::::: :. : :. .:: :. : . : ::.: .:::::::.:::.. :::
NP_004 VRVEDIMVRDVPHVALSCTFRDLRLALHRTKGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLG
580 590 600 610 620 630
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pF1KB7 RHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDEDLS--
.: : :: . :: : . : . . :: :: : : . :: .
NP_004 AQLSPARRRQHMQER-RATQTSPLSDQ-----EG----PPTPEASVCFQVNTEDSAFPAA
640 650 660 670 680
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pF1KB7 -GKSELP--PSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRP-SIFQSLLHCLL
:... : :.: ::.: :. : :.: . .. .. : . ..: :
NP_004 RGETHKPLKPALKRGPSVTRNLG-ESPTGSAESAGIALRSLFCGSPPPEAASEKLESCEK
690 700 710 720 730 740
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pF1KB7 GRARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHK
. . .. . ..:. :: .:::::: ::..::..:: :..: :: .::::::.:.:::
NP_004 RKLKRVRISLASDA-DLEGEMSPEEILEWEEQQLDEPVNFSDCKIDPAPFQLVERTSLHK
750 760 770 780 790 800
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pF1KB7 THTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGH-TKSGVQLRPPLASFRNTTSTRK
:::.:::::. :::::.:.: :...:.::.::::: : .::..::::::::..... .
NP_004 THTIFSLLGVDHAYVTSIGRLIGIVTLKELRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSS
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pF1KB7 STGAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELE
.: . : :. :..: : :
NP_004 DTETTEVHAL-WG-PHSRHGLPREGSPSDSDDKCQ
870 880 890
>>NP_001164559 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride cha (854 aa)
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Smith-Waterman score: 2773; 55.8% identity (78.2% similar) in 788 aa overlap (144-920:73-844)
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LGEDGIFLVLLGLLMALVSWSMDYVSAKSLQAYKWSYAQMQPSLPLQFLVWVTFPLVLIL
.: .: .. :. ::.:.:::.:.:::
NP_001 LGGPEPWKGPPSSRAAPELLEYGRSRCARCRAQQWMSRGLNTSILLQYLAWVTYPVVLIT
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pF1KB7 FSALFCHLISPQAVGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEG
::: : ....:::::::::::::::::::::::::.:.:.:::..:: .::::.:.::::
NP_001 FSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEG
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pF1KB7 PFVHIASICAAVLSKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVT
:::::::.:::.::::.:.: :.::. ...:...:::::::::..:.::::::::::
NP_001 PFVHIASMCAALLSKFLSLFGGIYENESRNTEMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVT
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pF1KB7 STYFAVRNYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAA
::.::::::::::::::::::.::::::::.: ::::::.: ::.::::::.::::::.
NP_001 STFFAVRNYWRGFFAATFSAFIFRVLAVWNRDEETITALFKTRFRLDFPFDLQELPAFAV
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 IGICCGLLGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQF
::: :. ::.::::.:... .::.:....:: ..:::.:..::..:...:::::.:::
NP_001 IGIASGFGGALFVYLNRKIVQVMRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQF
290 300 310 320 330 340
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pF1KB7 MAGELMPREAISTLFDNNTWVKHAG----DPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFW
:::.: .:.. ::::: :::... .: : .:. : ::.:: . . .:..::::
NP_001 MAGQLSQKETLVTLFDNRTWVRQGLVEELEPPSTSQA--WNPPRANVFLTLVIFILMKFW
350 360 370 380 390 400
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pF1KB7 MSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGA
:: .:::.:.:::.::::::.:::::::::: :: ::::: :. :.:.::::::.::
NP_001 MSALATTIPVPCGAFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTYRIVPGGYAVVGA
410 420 430 440 450 460
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pF1KB7 AALTGAVSHTVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPY
:::.:::.:::::::: ::::::::::::.:.:::::: ::::::::::::::..:::::
NP_001 AALAGAVTHTVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRIKKLPY
470 480 490 500 510 520
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pF1KB7 LPDLGWNQLSKYTIFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILL
::.:::.. ..: . ::::::::: :. : :. .:: :. : . : ::.: .:::::
NP_001 LPELGWGRHQQYRVRVEDIMVRDVPHVALSCTFRDLRLALHRTKGRMLALVESPESMILL
530 540 550 560 570 580
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pF1KB7 GSVERSELQALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFA
::.:::.. ::: .: : :: . :: : . : . . :: :: :
NP_001 GSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQER-RATQTSPLSDQ-----EG----PPTPEASVC
590 600 610 620 630
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pF1KB7 FVDEDEDEDLS---GKSELP--PSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQR
: . :: . :... : :.: ::.: :. : :.: . .. ..
NP_001 FQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLG-ESPTGSAESAGIALRSLFCGSPP
640 650 660 670 680
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pF1KB7 P-SIFQSLLHCLLGRARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQ
: . ..: : . . .. . ..:. :: .:::::: ::..::..:: :..: ::
NP_001 PEAASEKLESCEKRKLKRVRISLASDA-DLEGEMSPEEILEWEEQQLDEPVNFSDCKIDP
690 700 710 720 730 740
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pF1KB7 SPFQLVEQTTLHKTHTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGH-TKSGVQLRP
.::::::.:.::::::.:::::. :::::.:.: :...:.::.::::: : .::..::
NP_001 APFQLVERTSLHKTHTIFSLLGVDHAYVTSIGRLIGIVTLKELRKAIEGSVTAQGVKVRP
750 760 770 780 790 800
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pF1KB7 PLASFRNTTSTRKSTGAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSL
::::::..... ..: . : :. :..: : :
NP_001 PLASFRDSATSSSDTETTEVHAL-WG-PHSRHGLPREGSPSDSDDKCQ
810 820 830 840 850
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pF1KB7 APGKVEGELEELELVESPGLEEELADILQGPSLRSTDEEDEDELIL
>>XP_011510703 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTED: c (835 aa)
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Smith-Waterman score: 2704; 56.7% identity (78.0% similar) in 750 aa overlap (97-836:70-805)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EQFSDREQDIGMPKKTGSSSTVDSKDEDHYSKCQDCIHRLGQVVRRKLGEDGIFLVLLGL
..:. : : . . ..::: ::::::::
XP_011 RIRLGGPEPWKGPPSSRAAPELLEYGRSRCARCRVCSVRCHKFLVSRVGEDWIFLVLLGL
40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 LMALVSWSMDYVSAKSLQAYKWSYAQMQPSLPLQFLVWVTFPLVLILFSALFCHLISPQA
::::::: :::. : ::: .: .. :. ::.:.:::.:.::: ::: : ....:::
XP_011 LMALVSWVMDYAIAACLQAQQWMSRGLNTSILLQYLAWVTYPVVLITFSAGFTQILAPQA
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 VGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGKEGPFVHIASICAAVL
::::::::::::::::::::::.:.:.:::..:: .::::.:.:::::::::::.:::.:
XP_011 VGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSGMPLGKEGPFVHIASMCAALL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIEVTSTYFAVRNYWRGF
:::.:.: :.::. ...:...:::::::::..:.::::::::::::.::::::::::
XP_011 SKFLSLFGGIYENESRNTEMLAAACAVGVGCCFAAPIGGVLFSIEVTSTFFAVRNYWRGF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAFAAIGICCGLLGAVFV
::::::::.::::::::.: ::::::.: ::.::::::.::::::.::: :. ::.::
XP_011 FAATFSAFIFRVLAVWNRDEETITALFKTRFRLDFPFDLQELPAFAVIGIASGFGGALFV
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 YLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMGQFMAGELMPREAIST
::.:... .::.:....:: ..:::.:..::..:...:::::.::::::.: .:.. :
XP_011 YLNRKIVQVMRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTFPPGFGQFMAGQLSQKETLVT
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LFDNNTWVKHAG----DPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIPCG
:::: :::... .: : .:. : ::.:: . . .:..:::::: .:::.:.:::
XP_011 LFDNRTWVRQGLVEELEPPSTSQA--WNPPRANVFLTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 GFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTVST
.::::::.:::::::::: :: ::::: :. :.:.::::::.:::::.:::.:::::
XP_011 AFMPVFVIGAAFGRLVGESMAAWFPDGIHTDSSTYRIVPGGYAVVGAAALAGAVTHTVST
460 470 480 490 500 510
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pF1KB7 AVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQSLQPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSKYT
::: ::::::::::::.:.:::::: ::::::::::::::..:::::::.:::.. ..:
XP_011 AVIVFELTGQIAHILPVMIAVILANAVAQSLQPSLYDSIIRIKKLPYLPELGWGRHQQYR
520 530 540 550 560 570
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pF1KB7 IFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQ
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XP_006 VRVEDIMVRDVPHVALSCTFRDLRLALHRTKGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLG
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pF1KB7 SSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELELVESPG
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pF1KB7 LFDNNTWVKHAG----DPESLGQSAVWIHPRVNVVIIIFLFFVMKFWMSIVATTMPIPCG
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NP_001 LFDNRTWVRQGLVEELEPPSTSQA--WNPPRANVFLTLVIFILMKFWMSALATTIPVPCG
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pF1KB7 GFMPVFVLGAAFGRLVGEIMAMLFPDGILFDDIIYKILPGGYAVIGAAALTGAVSHTVST
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NP_001 AFMPVFVI-----------------DGIHTDSSTYRIVPGGYAVVGAAALAGAVTHTVST
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pF1KB7 IFVEDIMVRDVKFVSASYTYGELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQ
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NP_001 VRVEDIMVRDVPHVALSCTFRDLRLALHRTKGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLG
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pF1KB7 RHLCPERRLRAAQEMARKLSELPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDEDLS--
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NP_001 AQLSPARRRQHMQER-RATQTSPLSDQ-----EG----PPTPEASVCFQVNTEDSAFPAA
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pF1KB7 -GKSELP--PSLALHPSTTAPLSPEEPNGPLPGHKQQPEAPEPAGQRP-SIFQSLLHCLL
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NP_001 RGETHKPLKPALKRGPSVTRNLG-ESPTGSAESAGIALRSLFCGSPPPEAASEKLESCEK
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pF1KB7 GRARPTKKKTTQDSTDLVDNMSPEEIEAWEQEQLSQPVCFDSCCIDQSPFQLVEQTTLHK
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NP_001 RKLKRVRISLASDA-DLEGEMSPEEILEWEEQQLDEPVNFSDCKIDPAPFQLVERTSLHK
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pF1KB7 THTLFSLLGLHLAYVTSMGKLRGVLALEELQKAIEGH-TKSGVQLRPPLASFRNTTSTRK
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NP_001 THTIFSLLGVDHAYVTSIGRLIGIVTLKELRKAIEGSVTAQGVKVRPPLASFRDSATSSS
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pF1KB7 STGAPPSSAENWNLPEDRPGATGTGDVIAASPETPVPSPSPEPPLSLAPGKVEGELEELE
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NP_001 DTETTEVHAL-WG-PHSRHGLPREGSPSDSDDKCQ
850 860 870 880
988 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]