Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7200
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7200, 431 aa
1>>>pF1KB7200 431 - 431 aa - 431 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0820+/-0.000813; mu= 6.4249+/- 0.049
mean_var=185.7172+/-37.974, 0's: 0 Z-trim(114.6): 70 B-trim: 153 in 1/50
Lambda= 0.094113
statistics sampled from 15066 (15136) to 15066 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.792), E-opt: 0.2 (0.465), width: 16
Scan time: 3.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14323.1 FOXP3 gene_id:50943|Hs108|chrX ( 431) 3004 419.8 2.6e-117
CCDS48109.1 FOXP3 gene_id:50943|Hs108|chrX ( 396) 2274 320.6 1.7e-87
CCDS4856.1 FOXP4 gene_id:116113|Hs108|chr6 ( 667) 748 113.6 5.9e-25
CCDS58839.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 676) 544 85.9 1.3e-16
CCDS74963.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 577) 535 84.7 2.7e-16
CCDS58838.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 601) 535 84.7 2.7e-16
CCDS2914.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 677) 535 84.7 3e-16
CCDS58837.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 679) 535 84.7 3e-16
CCDS5760.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 ( 715) 514 81.9 2.3e-15
CCDS55154.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 ( 732) 514 81.9 2.3e-15
CCDS43635.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 ( 740) 514 81.9 2.3e-15
CCDS34448.1 FOXP4 gene_id:116113|Hs108|chr6 ( 678) 500 80.0 8.1e-15
CCDS34447.1 FOXP4 gene_id:116113|Hs108|chr6 ( 680) 500 80.0 8.1e-15
CCDS74964.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 ( 693) 476 76.7 7.9e-14
>>CCDS14323.1 FOXP3 gene_id:50943|Hs108|chrX (431 aa)
initn: 3004 init1: 3004 opt: 3004 Z-score: 2219.6 bits: 419.8 E(32554): 2.6e-117
Smith-Waterman score: 3004; 100.0% identity (100.0% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPNPRPGKPSAPSLALGPSPGASPSWRAAPKASDLLGARGPGGTFQGRDLRGGAHASSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPNPRPGKPSAPSLALGPSPGASPSWRAAPKASDLLGARGPGGTFQGRDLRGGAHASSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSGARLGPLPHLQALLQDRPHFMHQLSTVDAHARTPVLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSGARLGPLPHLQALLQDRPHFMHQLSTVDAHARTPVLQV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HPLESPAMISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGINVASLEWVSREPALLCTFPNPSAPRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HPLESPAMISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGINVASLEWVSREPALLCTFPNPSAPRKD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 STLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPEDFLKHCQADHLLDEKGRAQCLLQREMVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 STLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPEDFLKHCQADHLLDEKGRAQCLLQREMVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMALTKASSVASSDKGSCCIVAAGSQGPVVPAWSGPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMALTKASSVASSDKGSCCIVAAGSQGPVVPAWSGPRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 APDSLFAVRRHLWGSHGNSTFPEFLHNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APDSLFAVRRHLWGSHGNSTFPEFLHNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NEIYHWFTRMFAFFRNHPATWKNAIRHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NEIYHWFTRMFAFFRNHPATWKNAIRHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQR
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB7 PSRCSNPTPGP
:::::::::::
CCDS14 PSRCSNPTPGP
430
>>CCDS48109.1 FOXP3 gene_id:50943|Hs108|chrX (396 aa)
initn: 2270 init1: 2270 opt: 2274 Z-score: 1684.4 bits: 320.6 E(32554): 1.7e-87
Smith-Waterman score: 2678; 91.9% identity (91.9% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-396)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPNPRPGKPSAPSLALGPSPGASPSWRAAPKASDLLGARGPGGTFQGRDLRGGAHASSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MPNPRPGKPSAPSLALGPSPGASPSWRAAPKASDLLGARGPGGTFQGRDLRGGAHASSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSGARLGPLPHLQALLQDRPHFMHQLSTVDAHARTPVLQV
::::::::::: ::::::::::::::
CCDS48 LNPMPPSQLQL-----------------------------------STVDAHARTPVLQV
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HPLESPAMISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGINVASLEWVSREPALLCTFPNPSAPRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HPLESPAMISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGINVASLEWVSREPALLCTFPNPSAPRKD
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 STLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPEDFLKHCQADHLLDEKGRAQCLLQREMVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 STLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPEDFLKHCQADHLLDEKGRAQCLLQREMVQ
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMALTKASSVASSDKGSCCIVAAGSQGPVVPAWSGPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMALTKASSVASSDKGSCCIVAAGSQGPVVPAWSGPRE
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 APDSLFAVRRHLWGSHGNSTFPEFLHNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 APDSLFAVRRHLWGSHGNSTFPEFLHNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NEIYHWFTRMFAFFRNHPATWKNAIRHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NEIYHWFTRMFAFFRNHPATWKNAIRHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQR
330 340 350 360 370 380
430
pF1KB7 PSRCSNPTPGP
:::::::::::
CCDS48 PSRCSNPTPGP
390
>>CCDS4856.1 FOXP4 gene_id:116113|Hs108|chr6 (667 aa)
initn: 768 init1: 478 opt: 748 Z-score: 561.6 bits: 113.6 E(32554): 5.9e-25
Smith-Waterman score: 756; 39.9% identity (65.2% similar) in 371 aa overlap (69-428:195-543)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 RGPGGTFQGRDLRGGAHASSSSLNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSGARLGPLPHL-QALLQ
:.: :: . :. : ::: : ::.
CCDS48 KPQPKEALGNKQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLNLQRQGLVSLQPNQAS-GPLQTLPQAVCP
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 -DRPHFMHQLSTVDAHARTPVLQVHPLESPAMISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGINVA
: :.. . .. :. : : :. ..:: ::. . :. : : . : ..
CCDS48 TDLPQLWKGEGAPGQPAEDSVKQ----EG---LDLTG--TAATATSFAAPPKVSPPLSHH
230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 SLEWVSREPALLCTFPNPSAPRKDSTLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPEDFLK
.: . .:..: . :.::. .:.:: ..: ::::::: . :. .:.:
CCDS48 TLP--NGQPTVLTS-------RRDSSSHEETPGSHPLYGHGECKWPGCETLCEDLGQFIK
280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 HCQADHLLDEKGRAQCLLQREMVQSLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMA----LTKASSV
: ...: ::... ::: .: ..::.:: ::. :.:.:.::.::: . . ... .:
CCDS48 HLNTEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLAKESERLQAMMAHLHMRPSEPKPFSQPVTV
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320
pF1KB7 ASSDKGSCCIV--AAGSQGPVVPAWSGPREAPDSLFA---VRRHLWGSHGNSTFPEFLHN
...:. .: ... .::.: : . :: . .::. . . :. .:
CCDS48 SAADSFPDGLVHPPTSAAAPVTPL-RPPGLGSASLHGGGPARRRSSDKFCSPISSELAQN
390 400 410 420 430 440
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 MDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTLNEIYHWFTRMFAFFRNHPATWKNAIRH
...: ..:::::::.::: ::::.:..: ::::::.:::::::.:: . ::::::.::
CCDS48 HEFYKNADVRPPFTYASLIRQAILETPDRQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNTATWKNAVRH
450 460 470 480 490 500
390 400 410 420 430
pF1KB7 NLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQRPSRCSNPTPGP
::::::::::::. ::::::::: :..:.: :. ..::
CCDS48 NLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEREYQKRRP--PKMTGSPTLVKNMISGLSYGALNASYQ
510 520 530 540 550 560
CCDS48 AALAESSFPLLNSPGMLNPGSASSLLPLSHDDVGAPVEPLPSNGSSSPPRLSPPQYSHQV
570 580 590 600 610 620
>>CCDS58839.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 (676 aa)
initn: 763 init1: 499 opt: 544 Z-score: 411.8 bits: 85.9 E(32554): 1.3e-16
Smith-Waterman score: 780; 39.4% identity (63.0% similar) in 373 aa overlap (89-428:185-553)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SSLNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSGARLGPLPHLQALLQDRPHFMHQLSTVDAHARTPVL
: ..: : :.. ... . . . :.:
CCDS58 QLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPAL
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QVHPLESPAMISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGINVASLEWV-----SREPALLCTFPN
..:: . .:: : : .. : : .::. . : :. . :
CCDS58 PLQPL-AQGMIPTELQQLWKEVTSAHTAEETT-GNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIMN
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220
pF1KB7 PSA----------PRKDSTLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPEDFLKHCQADHL
: : :...: :.:: ..::::::::: : :. ..:::: ...:
CCDS58 PHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFQSFLKHLNSEHA
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270
pF1KB7 LDEKGRAQCLLQREMVQSLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMALTKAS----SVASSDKGS
::... ::: .: ..::.:: ::. .::.:.::..:: : . ::. ...:: :
CCDS58 LDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKAAPQPLNLVSSVTLS
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320
pF1KB7 CCIVAAGSQG----------PVVPAWSGPR----EAPDSLFAVRRHLWGSHGNSTFPEFL
:. :. :..:. .:: . .. .::. ... ..
CCDS58 KSASEASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSDIA
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 HNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTLNEIYHWFTRMFAFFRNHPATWKNAI
.:....: ..:::::::.::: ::::.:::: ::::::.:::::::.:: . ::::::.
CCDS58 QNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNAV
460 470 480 490 500 510
390 400 410 420 430
pF1KB7 RHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQRPSRCSNPTPGP
::::::::::::::. :::::::::.::.:.: :. : .::.
CCDS58 RHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKIS--GNPSLIKNMQSSHAYCTPLNA
520 530 540 550 560 570
CCDS58 ALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGNLASAIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAVH
580 590 600 610 620 630
>>CCDS74963.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 (577 aa)
initn: 762 init1: 498 opt: 535 Z-score: 406.1 bits: 84.7 E(32554): 2.7e-16
Smith-Waterman score: 771; 39.3% identity (63.1% similar) in 374 aa overlap (89-428:85-454)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SSLNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSGARLGPLPHLQALLQDRPHFMHQLSTVDAHARTPVL
: ..: : :.. ... . . . :.:
CCDS74 QLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QVHPLESPAMISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGINVASLEWV-----SREPALLCTFPN
..:: . .:: : : .. : : .::. . : :. . :
CCDS74 PLQPL-AQGMIPTELQQLWKEVTSAHTAEETT-GNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIMN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 PSA----------PRKDSTLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPEDFLKHCQADHL
: : :...: :.:: ..::::::::: : :. ..:::: ...:
CCDS74 PHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFQSFLKHLNSEHA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB7 LDEKGRAQCLLQREMVQSLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMALTKAS----SVASSDKGS
::... ::: .: ..::.:: ::. .::.:.::..:: : . ::. ...:: :
CCDS74 LDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKAAPQPLNLVSSVTLS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KB7 CCIVAAGSQG----------PVVPAWSGPR----EAPDSLFAVRRHLWGSHGNS-TFPEF
:. :. :..:. .:: . .. .::. ... . ..
CCDS74 KSASEASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSADI
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 LHNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTLNEIYHWFTRMFAFFRNHPATWKNA
.:....: ..:::::::.::: ::::.:::: ::::::.:::::::.:: . ::::::
CCDS74 AQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNA
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KB7 IRHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQRPSRCSNPTPGP
.::::::::::::::. :::::::::.::.:.: :. : .::.
CCDS74 VRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKIS--GNPSLIKNMQSSHAYCTPLN
420 430 440 450 460 470
CCDS74 AALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGNLASAIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAV
480 490 500 510 520 530
>>CCDS58838.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 (601 aa)
initn: 762 init1: 498 opt: 535 Z-score: 405.9 bits: 84.7 E(32554): 2.7e-16
Smith-Waterman score: 776; 38.3% identity (61.9% similar) in 399 aa overlap (65-428:84-478)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LLGARGPGGTFQGRDLRGGAHASSSSLNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSG-ARLGPLPHLQ
: . . :.: .:: . : : ..:
CCDS58 AQQQQQQALQVARQLLLQQQQQQQVSGLKSPKRNDKQPALQQQQVATQQLAFQQQLLQMQ
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ALLQDRPHFMHQLSTVDAHARTPVLQVHPLESPAMISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGI
: :.. ... . . . :.: ..:: . .:: : : .. :
CCDS58 QLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPL-AQGMIPTELQQLWKEVTSAHTAEETT-GN
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190
pF1KB7 NVASLEWV-----SREPALLCTFPNPSA----------PRKDSTLSAVPQSSYPLLANGV
: .::. . : :. . :: : :...: :.:: ..::
CCDS58 NHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIMNPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGV
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 CKWPGCEKVFEEPEDFLKHCQADHLLDEKGRAQCLLQREMVQSLEQQLVLEKEKLSAMQA
::::::: : :. ..:::: ...: ::... ::: .: ..::.:: ::. .::.:.::..
CCDS58 CKWPGCEAVCEDFQSFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMT
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300
pF1KB7 HLAGKMALTKAS----SVASSDKGSCCIVAAGSQG----------PVVPAWSGPR----E
:: : . ::. ...:: : :. :. :..:. .::
CCDS58 HLHVKSTEPKAAPQPLNLVSSVTLSKSASEASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVITTT
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350
pF1KB7 APDSLFAVRRHLWGSHGNS-TFPEFLHNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRT
. .. .::. ... . .. .:....: ..:::::::.::: ::::.:::: :
CCDS58 SMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSADIAQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLT
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 LNEIYHWFTRMFAFFRNHPATWKNAIRHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQ
:::::.:::::::.:: . ::::::.::::::::::::::. :::::::::.::.:.: :
CCDS58 LNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQ
420 430 440 450 460 470
420 430
pF1KB7 RPSRCSNPTPGP
. : .::.
CCDS58 KIS--GNPSLIKNMQSSHAYCTPLNAALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGNLASAIREE
480 490 500 510 520
>>CCDS2914.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 (677 aa)
initn: 762 init1: 498 opt: 535 Z-score: 405.2 bits: 84.7 E(32554): 3e-16
Smith-Waterman score: 771; 39.3% identity (63.1% similar) in 374 aa overlap (89-428:185-554)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SSLNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSGARLGPLPHLQALLQDRPHFMHQLSTVDAHARTPVL
: ..: : :.. ... . . . :.:
CCDS29 QLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPAL
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QVHPLESPAMISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGINVASLEWV-----SREPALLCTFPN
..:: . .:: : : .. : : .::. . : :. . :
CCDS29 PLQPL-AQGMIPTELQQLWKEVTSAHTAEETT-GNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIMN
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220
pF1KB7 PSA----------PRKDSTLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPEDFLKHCQADHL
: : :...: :.:: ..::::::::: : :. ..:::: ...:
CCDS29 PHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFQSFLKHLNSEHA
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270
pF1KB7 LDEKGRAQCLLQREMVQSLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMALTKAS----SVASSDKGS
::... ::: .: ..::.:: ::. .::.:.::..:: : . ::. ...:: :
CCDS29 LDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKAAPQPLNLVSSVTLS
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320
pF1KB7 CCIVAAGSQG----------PVVPAWSGPR----EAPDSLFAVRRHLWGSHGNS-TFPEF
:. :. :..:. .:: . .. .::. ... . ..
CCDS29 KSASEASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSADI
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 LHNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTLNEIYHWFTRMFAFFRNHPATWKNA
.:....: ..:::::::.::: ::::.:::: ::::::.:::::::.:: . ::::::
CCDS29 AQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNA
460 470 480 490 500 510
390 400 410 420 430
pF1KB7 IRHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQRPSRCSNPTPGP
.::::::::::::::. :::::::::.::.:.: :. : .::.
CCDS29 VRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKIS--GNPSLIKNMQSSHAYCTPLN
520 530 540 550 560 570
CCDS29 AALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGNLASAIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAV
580 590 600 610 620 630
>>CCDS58837.1 FOXP1 gene_id:27086|Hs108|chr3 (679 aa)
initn: 762 init1: 498 opt: 535 Z-score: 405.2 bits: 84.7 E(32554): 3e-16
Smith-Waterman score: 771; 39.3% identity (63.1% similar) in 374 aa overlap (89-428:187-556)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SSLNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSGARLGPLPHLQALLQDRPHFMHQLSTVDAHARTPVL
: ..: : :.. ... . . . :.:
CCDS58 QLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPAL
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QVHPLESPAMISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGINVASLEWV-----SREPALLCTFPN
..:: . .:: : : .. : : .::. . : :. . :
CCDS58 PLQPL-AQGMIPTELQQLWKEVTSAHTAEETT-GNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIMN
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220
pF1KB7 PSA----------PRKDSTLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPEDFLKHCQADHL
: : :...: :.:: ..::::::::: : :. ..:::: ...:
CCDS58 PHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFQSFLKHLNSEHA
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270
pF1KB7 LDEKGRAQCLLQREMVQSLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMALTKAS----SVASSDKGS
::... ::: .: ..::.:: ::. .::.:.::..:: : . ::. ...:: :
CCDS58 LDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKAAPQPLNLVSSVTLS
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320
pF1KB7 CCIVAAGSQG----------PVVPAWSGPR----EAPDSLFAVRRHLWGSHGNS-TFPEF
:. :. :..:. .:: . .. .::. ... . ..
CCDS58 KSASEASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSADI
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 LHNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTLNEIYHWFTRMFAFFRNHPATWKNA
.:....: ..:::::::.::: ::::.:::: ::::::.:::::::.:: . ::::::
CCDS58 AQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTRMFAYFRRNAATWKNA
460 470 480 490 500 510
390 400 410 420 430
pF1KB7 IRHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQRPSRCSNPTPGP
.::::::::::::::. :::::::::.::.:.: :. : .::.
CCDS58 VRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKIS--GNPSLIKNMQSSHAYCTPLN
520 530 540 550 560 570
CCDS58 AALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGNLASAIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAV
580 590 600 610 620 630
>>CCDS5760.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 (715 aa)
initn: 759 init1: 474 opt: 514 Z-score: 389.4 bits: 81.9 E(32554): 2.3e-15
Smith-Waterman score: 744; 39.2% identity (64.0% similar) in 383 aa overlap (69-428:234-593)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 RGPGGTFQGRDLRGGAHASSSSLNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSGARLGPLPHL-QALLQ
:.: :. . :. : : :. : :: :.
CCDS57 QQQQQQLAAQQLVFQQQLLQMQQLQQQQHLLSLQRQGLISIPPGQAAL-PVQSLPQAGLS
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 DRPHFMHQLSTVDAHARTPVLQVHPLESPAM----ISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGI
: ..:: : :: .:. .. ..:: .... . : .. . :: :
CCDS57 --PAEIQQL-------WKEVTGVHSMEDNGIKHGGLDLTTNNSSSTTSSNTSKAS-PP-I
270 280 290 300 310
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 NVASLEWVSREPALLCTFPNPSAPRKDSTLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPED
. :. :. . ..: . :.::. .:. : ..:::::::::.. :. .
CCDS57 THHSI--VNGQSSVL-------SARRDSSSHEETGASHTLYGHGVCKWPGCESICEDFGQ
320 330 340 350 360
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FLKHCQADHLLDEKGRAQCLLQREMVQSLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMALTKAS---
:::: . .: ::... ::: .: ..::.:: :: :.:.:.::..:: . . : :
CCDS57 FLKHLNNEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLSKERERLQAMMTHLHMRPSEPKPSPKP
370 380 390 400 410 420
280 290 300 310
pF1KB7 -SVASSDKGSCCIVAAGSQG----------PVVPAWSGPRE-APDSLF---AVRRHLWGS
...:: : .. .. :. ::.: .:: .: :. :.::. .
CCDS57 LNLVSSVTMSKNMLETSPQSLPQTPTTPTAPVTPITQGPSVITPASVPNVGAIRRRHSDK
430 440 450 460 470 480
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 HGNSTFPEFLHNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTLNEIYHWFTRMFAFFR
.. :. :....: ..::::::::::: ::.:. ..: :::::: :::: ::.::
CCDS57 YNIPMSSEIAPNYEFYKNADVRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFR
490 500 510 520 530 540
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 NHPATWKNAIRHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQRPSRCSNPTPGP
. ::::::.::::::::::::::. :::::::::.:..:.:::. . ..::
CCDS57 RNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRRSQKIT--GSPTLVKNIPT
550 560 570 580 590 600
CCDS57 SLGYGAALNASLQAALAESSLPLLSNPGLINNASSGLLQAVHEDLNGSLDHIDSNGNSSP
610 620 630 640 650 660
>>CCDS55154.1 FOXP2 gene_id:93986|Hs108|chr7 (732 aa)
initn: 793 init1: 474 opt: 514 Z-score: 389.3 bits: 81.9 E(32554): 2.3e-15
Smith-Waterman score: 744; 39.2% identity (64.0% similar) in 383 aa overlap (69-428:251-610)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 RGPGGTFQGRDLRGGAHASSSSLNPMPPSQLQLPTLPLVMVAPSGARLGPLPHL-QALLQ
:.: :. . :. : : :. : :: :.
CCDS55 QQQQQQLAAQQLVFQQQLLQMQQLQQQQHLLSLQRQGLISIPPGQAAL-PVQSLPQAGLS
230 240 250 260 270
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 DRPHFMHQLSTVDAHARTPVLQVHPLESPAM----ISLTPPTTATGVFSLKARPGLPPGI
: ..:: : :: .:. .. ..:: .... . : .. . :: :
CCDS55 --PAEIQQL-------WKEVTGVHSMEDNGIKHGGLDLTTNNSSSTTSSNTSKAS-PP-I
280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 NVASLEWVSREPALLCTFPNPSAPRKDSTLSAVPQSSYPLLANGVCKWPGCEKVFEEPED
. :. :. . ..: . :.::. .:. : ..:::::::::.. :. .
CCDS55 THHSI--VNGQSSVL-------SARRDSSSHEETGASHTLYGHGVCKWPGCESICEDFGQ
330 340 350 360 370
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FLKHCQADHLLDEKGRAQCLLQREMVQSLEQQLVLEKEKLSAMQAHLAGKMALTKAS---
:::: . .: ::... ::: .: ..::.:: :: :.:.:.::..:: . . : :
CCDS55 FLKHLNNEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLSKERERLQAMMTHLHMRPSEPKPSPKP
380 390 400 410 420 430
280 290 300 310
pF1KB7 -SVASSDKGSCCIVAAGSQG----------PVVPAWSGPRE-APDSLF---AVRRHLWGS
...:: : .. .. :. ::.: .:: .: :. :.::. .
CCDS55 LNLVSSVTMSKNMLETSPQSLPQTPTTPTAPVTPITQGPSVITPASVPNVGAIRRRHSDK
440 450 460 470 480 490
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 HGNSTFPEFLHNMDYFKFHNMRPPFTYATLIRWAILEAPEKQRTLNEIYHWFTRMFAFFR
.. :. :....: ..::::::::::: ::.:. ..: :::::: :::: ::.::
CCDS55 YNIPMSSEIAPNYEFYKNADVRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFR
500 510 520 530 540 550
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 NHPATWKNAIRHNLSLHKCFVRVESEKGAVWTVDELEFRKKRSQRPSRCSNPTPGP
. ::::::.::::::::::::::. :::::::::.:..:.:::. . ..::
CCDS55 RNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRRSQKIT--GSPTLVKNIPT
560 570 580 590 600 610
CCDS55 SLGYGAALNASLQAALAESSLPLLSNPGLINNASSGLLQAVHEDLNGSLDHIDSNGNSSP
620 630 640 650 660 670
431 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:54:04 2016 done: Fri Nov 4 05:54:04 2016
Total Scan time: 3.270 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]